data_SMR-3543430a0d84f6bfbf1179a6b58d9b4d_1 _entry.id SMR-3543430a0d84f6bfbf1179a6b58d9b4d_1 _struct.entry_id SMR-3543430a0d84f6bfbf1179a6b58d9b4d_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q9Y3X0/ CCDC9_HUMAN, Coiled-coil domain-containing protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y3X0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' UNK 'L-peptide linking' UNKNOWN . . 'CCD local' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 69352.901 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CCDC9_HUMAN Q9Y3X0 1 ;MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRSVEKENVAVES EKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQPRGGGAGGRGRRGRGRGSPHL SGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERNQREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESER DRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQGRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQ RHRKPTGQWRREWDAEKTDGMFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSS RPQAKAAPRAYSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEE DEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEPQAPGTPSSPF SPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV ; 'Coiled-coil domain-containing protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 531 1 531 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CCDC9_HUMAN Q9Y3X0 . 1 531 9606 'Homo sapiens (Human)' 1999-11-01 DE6C474F3253C30C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRSVEKENVAVES EKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQPRGGGAGGRGRRGRGRGSPHL SGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERNQREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESER DRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQGRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQ RHRKPTGQWRREWDAEKTDGMFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSS RPQAKAAPRAYSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEE DEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEPQAPGTPSSPF SPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV ; ;MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRSVEKENVAVES EKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQPRGGGAGGRGRRGRGRGSPHL SGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERNQREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESER DRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQGRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQ RHRKPTGQWRREWDAEKTDGMFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSS RPQAKAAPRAYSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEE DEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEPQAPGTPSSPF SPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 THR . 1 5 LEU . 1 6 ASP . 1 7 LEU . 1 8 LYS . 1 9 SER . 1 10 LYS . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 LYS . 1 14 ASP . 1 15 ALA . 1 16 GLU . 1 17 LEU . 1 18 ASP . 1 19 LYS . 1 20 ARG . 1 21 ILE . 1 22 GLU . 1 23 ALA . 1 24 LEU . 1 25 ARG . 1 26 ARG . 1 27 LYS . 1 28 ASN . 1 29 GLU . 1 30 ALA . 1 31 LEU . 1 32 ILE . 1 33 ARG . 1 34 ARG . 1 35 TYR . 1 36 GLN . 1 37 GLU . 1 38 ILE . 1 39 GLU . 1 40 GLU . 1 41 ASP . 1 42 ARG . 1 43 LYS . 1 44 LYS . 1 45 ALA . 1 46 GLU . 1 47 LEU . 1 48 GLU . 1 49 GLY . 1 50 VAL . 1 51 ALA . 1 52 VAL . 1 53 THR . 1 54 ALA . 1 55 PRO . 1 56 ARG . 1 57 LYS . 1 58 GLY . 1 59 ARG . 1 60 SER . 1 61 VAL . 1 62 GLU . 1 63 LYS . 1 64 GLU . 1 65 ASN . 1 66 VAL . 1 67 ALA . 1 68 VAL . 1 69 GLU . 1 70 SER . 1 71 GLU . 1 72 LYS . 1 73 ASN . 1 74 LEU . 1 75 GLY . 1 76 PRO . 1 77 SER . 1 78 ARG . 1 79 ARG . 1 80 SER . 1 81 PRO . 1 82 GLY . 1 83 THR . 1 84 PRO . 1 85 ARG . 1 86 PRO . 1 87 PRO . 1 88 GLY . 1 89 ALA . 1 90 SER . 1 91 LYS . 1 92 GLY . 1 93 GLY . 1 94 ARG . 1 95 THR . 1 96 PRO . 1 97 PRO . 1 98 GLN . 1 99 GLN . 1 100 GLY . 1 101 GLY . 1 102 ARG . 1 103 ALA . 1 104 GLY . 1 105 MET . 1 106 GLY . 1 107 ARG . 1 108 ALA . 1 109 SER . 1 110 ARG . 1 111 SER . 1 112 TRP . 1 113 GLU . 1 114 GLY . 1 115 SER . 1 116 PRO . 1 117 GLY . 1 118 GLU . 1 119 GLN . 1 120 PRO . 1 121 ARG . 1 122 GLY . 1 123 GLY . 1 124 GLY . 1 125 ALA . 1 126 GLY . 1 127 GLY . 1 128 ARG . 1 129 GLY . 1 130 ARG . 1 131 ARG . 1 132 GLY . 1 133 ARG . 1 134 GLY . 1 135 ARG . 1 136 GLY . 1 137 SER . 1 138 PRO . 1 139 HIS . 1 140 LEU . 1 141 SER . 1 142 GLY . 1 143 ALA . 1 144 GLY . 1 145 ASP . 1 146 THR . 1 147 SER . 1 148 ILE . 1 149 SER . 1 150 ASP . 1 151 ARG . 1 152 LYS . 1 153 SER . 1 154 LYS . 1 155 GLU . 1 156 TRP . 1 157 GLU . 1 158 GLU . 1 159 ARG . 1 160 ARG . 1 161 ARG . 1 162 GLN . 1 163 ASN . 1 164 ILE . 1 165 GLU . 1 166 LYS . 1 167 MET . 1 168 ASN . 1 169 GLU . 1 170 GLU . 1 171 MET . 1 172 GLU . 1 173 LYS . 1 174 ILE . 1 175 ALA . 1 176 GLU . 1 177 TYR . 1 178 GLU . 1 179 ARG . 1 180 ASN . 1 181 GLN . 1 182 ARG . 1 183 GLU . 1 184 GLY . 1 185 VAL . 1 186 LEU . 1 187 GLU . 1 188 PRO . 1 189 ASN . 1 190 PRO . 1 191 VAL . 1 192 ARG . 1 193 ASN . 1 194 PHE . 1 195 LEU . 1 196 ASP . 1 197 ASP . 1 198 PRO . 1 199 ARG . 1 200 ARG . 1 201 ARG . 1 202 SER . 1 203 GLY . 1 204 PRO . 1 205 LEU . 1 206 GLU . 1 207 GLU . 1 208 SER . 1 209 GLU . 1 210 ARG . 1 211 ASP . 1 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'COILED-COIL PEPTIDE CC-DI {PDB ID=4dzm, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4dzm.2.B}' 'template structure' . 2 'COILED-COIL PEPTIDE CC-DI {PDB ID=4dzm, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4dzm.2.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 4dzm, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4dzm, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 (UNK)GEIAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQGYY XGEIAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQGYY 2 (UNK)GEIAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQGYY XGEIAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQGYY # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 30 2 2 4 30 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4dzm 2017-11-15 2 PDB . 4dzm 2017-11-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 531 2 2 B 1 531 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 531 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 531 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 67.000 29.630 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 67.000 29.630 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRSVEKENVAVESEKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQPRGGGAGGRGRRGRGRGSPHLSGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERNQREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESERDRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQGRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQRHRKPTGQWRREWDAEKTDGMFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSSRPQAKAAPRAYSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEEDEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEPQAPGTPSSPFSPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV 2 1 2 -------------IAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRSVEKENVAVESEKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQPRGGGAGGRGRRGRGRGSPHLSGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERNQREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESERDRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQGRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQRHRKPTGQWRREWDAEKTDGMFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSSRPQAKAAPRAYSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEEDEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEPQAPGTPSSPFSPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV 4 2 2 -------------IAALKQEIAALKKENAALKFEIAALKQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.420}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4dzm.2, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 14 14 ? A 13.912 2.649 -35.022 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 2 C CA . ASP 14 14 ? A 14.687 1.678 -34.141 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 3 C C . ASP 14 14 ? A 15.536 2.316 -33.100 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 4 O O . ASP 14 14 ? A 15.215 2.216 -31.925 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 5 C CB . ASP 14 14 ? A 15.514 0.704 -35.014 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 6 C CG . ASP 14 14 ? A 14.496 -0.009 -35.889 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 14 14 ? A 13.285 0.225 -35.642 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 14 14 ? A 14.898 -0.667 -36.860 1 1 A ASP 0.400 1 ATOM 9 N N . ALA 15 15 ? A 16.582 3.073 -33.496 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 10 C CA . ALA 15 15 ? A 17.493 3.699 -32.563 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 11 C C . ALA 15 15 ? A 16.805 4.533 -31.487 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 12 O O . ALA 15 15 ? A 17.175 4.457 -30.311 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 13 C CB . ALA 15 15 ? A 18.490 4.586 -33.342 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 14 N N . GLU 16 16 ? A 15.748 5.305 -31.806 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 15 C CA . GLU 16 16 ? A 14.934 5.984 -30.820 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 16 C C . GLU 16 16 ? A 14.321 5.063 -29.757 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 17 O O . GLU 16 16 ? A 14.411 5.330 -28.562 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 18 C CB . GLU 16 16 ? A 13.782 6.731 -31.533 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 19 C CG . GLU 16 16 ? A 12.889 7.511 -30.534 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 20 C CD . GLU 16 16 ? A 11.654 8.171 -31.128 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 21 O OE1 . GLU 16 16 ? A 11.515 8.191 -32.372 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 22 O OE2 . GLU 16 16 ? A 10.829 8.617 -30.274 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 23 N N . LEU 17 17 ? A 13.720 3.928 -30.169 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 24 C CA . LEU 17 17 ? A 13.151 2.927 -29.292 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 25 C C . LEU 17 17 ? A 14.190 2.240 -28.408 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 26 O O . LEU 17 17 ? A 13.995 2.152 -27.204 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 27 C CB . LEU 17 17 ? A 12.331 1.913 -30.121 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 28 C CG . LEU 17 17 ? A 11.147 2.548 -30.893 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 29 C CD1 . LEU 17 17 ? A 10.436 1.498 -31.761 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 30 C CD2 . LEU 17 17 ? A 10.113 3.194 -29.953 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 31 N N . ASP 18 18 ? A 15.360 1.841 -28.965 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 32 C CA . ASP 18 18 ? A 16.484 1.269 -28.234 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 33 C C . ASP 18 18 ? A 16.998 2.210 -27.143 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 34 O O . ASP 18 18 ? A 17.296 1.801 -26.020 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 35 C CB . ASP 18 18 ? A 17.622 0.907 -29.228 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 36 C CG . ASP 18 18 ? A 17.213 -0.241 -30.139 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 37 O OD1 . ASP 18 18 ? A 16.223 -0.944 -29.817 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 38 O OD2 . ASP 18 18 ? A 17.895 -0.405 -31.182 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 39 N N . LYS 19 19 ? A 17.039 3.532 -27.416 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 40 C CA . LYS 19 19 ? A 17.357 4.546 -26.419 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 41 C C . LYS 19 19 ? A 16.357 4.623 -25.275 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 42 O O . LYS 19 19 ? A 16.752 4.726 -24.113 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 43 C CB . LYS 19 19 ? A 17.510 5.950 -27.051 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 44 C CG . LYS 19 19 ? A 18.743 6.038 -27.956 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 45 C CD . LYS 19 19 ? A 18.792 7.348 -28.750 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 46 C CE . LYS 19 19 ? A 19.919 7.373 -29.785 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 47 N NZ . LYS 19 19 ? A 19.953 8.691 -30.456 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 48 N N . ARG 20 20 ? A 15.039 4.542 -25.563 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 49 C CA . ARG 20 20 ? A 13.992 4.454 -24.557 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 50 C C . ARG 20 20 ? A 14.092 3.195 -23.705 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 51 O O . ARG 20 20 ? A 13.957 3.260 -22.492 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 52 C CB . ARG 20 20 ? A 12.571 4.482 -25.178 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 53 C CG . ARG 20 20 ? A 12.236 5.777 -25.941 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 54 C CD . ARG 20 20 ? A 10.824 5.763 -26.538 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 55 N NE . ARG 20 20 ? A 10.637 7.031 -27.329 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 56 C CZ . ARG 20 20 ? A 10.238 8.213 -26.844 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 57 N NH1 . ARG 20 20 ? A 10.008 8.385 -25.545 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 58 N NH2 . ARG 20 20 ? A 10.086 9.223 -27.699 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 59 N N . ILE 21 21 ? A 14.361 2.023 -24.333 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 60 C CA . ILE 21 21 ? A 14.559 0.745 -23.654 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 61 C C . ILE 21 21 ? A 15.723 0.809 -22.699 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 62 O O . ILE 21 21 ? A 15.587 0.463 -21.527 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 63 C CB . ILE 21 21 ? A 14.765 -0.394 -24.663 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 64 C CG1 . ILE 21 21 ? A 13.429 -0.624 -25.406 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 65 C CG2 . ILE 21 21 ? A 15.269 -1.703 -23.991 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 66 C CD1 . ILE 21 21 ? A 13.509 -1.609 -26.580 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 67 N N . GLU 22 22 ? A 16.879 1.333 -23.156 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 68 C CA . GLU 22 22 ? A 18.028 1.509 -22.302 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 69 C C . GLU 22 22 ? A 17.742 2.506 -21.171 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 70 O O . GLU 22 22 ? A 18.039 2.230 -20.008 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 71 C CB . GLU 22 22 ? A 19.279 1.809 -23.157 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 72 C CG . GLU 22 22 ? A 20.606 1.747 -22.352 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 73 C CD . GLU 22 22 ? A 20.999 0.501 -21.566 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 74 O OE1 . GLU 22 22 ? A 21.938 0.663 -20.735 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 75 O OE2 . GLU 22 22 ? A 20.404 -0.583 -21.710 1 1 A GLU 0.790 1 ATOM 76 N N . ALA 23 23 ? A 17.058 3.645 -21.415 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 77 C CA . ALA 23 23 ? A 16.649 4.588 -20.388 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 78 C C . ALA 23 23 ? A 15.739 3.964 -19.324 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 79 O O . ALA 23 23 ? A 15.979 4.122 -18.123 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 80 C CB . ALA 23 23 ? A 15.972 5.810 -21.051 1 1 A ALA 0.840 1 ATOM 81 N N . LEU 24 24 ? A 14.723 3.168 -19.726 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 82 C CA . LEU 24 24 ? A 13.896 2.410 -18.803 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 83 C C . LEU 24 24 ? A 14.675 1.370 -18.019 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 84 O O . LEU 24 24 ? A 14.525 1.283 -16.814 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 85 C CB . LEU 24 24 ? A 12.686 1.730 -19.486 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 86 C CG . LEU 24 24 ? A 11.652 2.727 -20.047 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 87 C CD1 . LEU 24 24 ? A 10.576 1.961 -20.830 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 88 C CD2 . LEU 24 24 ? A 11.005 3.606 -18.955 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 89 N N . ARG 25 25 ? A 15.581 0.605 -18.677 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 90 C CA . ARG 25 25 ? A 16.457 -0.357 -18.026 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 91 C C . ARG 25 25 ? A 17.320 0.287 -16.949 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 92 O O . ARG 25 25 ? A 17.404 -0.225 -15.828 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 93 C CB . ARG 25 25 ? A 17.361 -1.079 -19.068 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 94 C CG . ARG 25 25 ? A 18.195 -2.245 -18.484 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 95 C CD . ARG 25 25 ? A 19.078 -2.971 -19.513 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 96 N NE . ARG 25 25 ? A 20.324 -2.180 -19.678 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 97 C CZ . ARG 25 25 ? A 21.437 -2.298 -18.959 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 98 N NH1 . ARG 25 25 ? A 21.502 -3.142 -17.923 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 99 N NH2 . ARG 25 25 ? A 22.468 -1.517 -19.218 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 100 N N . ARG 26 26 ? A 17.924 1.457 -17.198 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 101 C CA . ARG 26 26 ? A 18.685 2.179 -16.197 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 102 C C . ARG 26 26 ? A 17.885 2.637 -14.974 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 103 O O . ARG 26 26 ? A 18.335 2.499 -13.837 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 104 C CB . ARG 26 26 ? A 19.313 3.425 -16.843 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 105 C CG . ARG 26 26 ? A 20.430 3.119 -17.857 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 106 C CD . ARG 26 26 ? A 20.857 4.399 -18.570 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 107 N NE . ARG 26 26 ? A 21.585 4.029 -19.825 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 108 C CZ . ARG 26 26 ? A 21.913 4.921 -20.770 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 109 N NH1 . ARG 26 26 ? A 21.719 6.223 -20.586 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 110 N NH2 . ARG 26 26 ? A 22.420 4.510 -21.928 1 1 A ARG 0.730 1 ATOM 111 N N . LYS 27 27 ? A 16.660 3.176 -15.193 1 1 A LYS 0.740 1 ATOM 112 C CA . LYS 27 27 ? A 15.719 3.531 -14.142 1 1 A LYS 0.740 1 ATOM 113 C C . LYS 27 27 ? 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A 17.963 3.527 -10.301 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 142 N N . LEU 31 31 ? A 15.767 1.399 -9.202 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 143 C CA . LEU 31 31 ? A 14.683 0.991 -8.339 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 144 C C . LEU 31 31 ? A 14.933 -0.295 -7.562 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 145 O O . LEU 31 31 ? A 14.642 -0.364 -6.371 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 146 C CB . LEU 31 31 ? A 13.458 0.802 -9.234 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 147 C CG . LEU 31 31 ? A 12.876 2.113 -9.795 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 148 C CD1 . LEU 31 31 ? A 11.986 1.849 -11.017 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 149 C CD2 . LEU 31 31 ? A 12.090 2.878 -8.720 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 150 N N . ILE 32 32 ? A 15.526 -1.332 -8.208 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 151 C CA . ILE 32 32 ? A 16.006 -2.559 -7.566 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 152 C C . ILE 32 32 ? A 17.025 -2.204 -6.510 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 153 O O . ILE 32 32 ? A 16.956 -2.677 -5.379 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 154 C CB . ILE 32 32 ? A 16.664 -3.505 -8.586 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 155 C CG1 . ILE 32 32 ? A 15.586 -4.103 -9.524 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 156 C CG2 . ILE 32 32 ? A 17.516 -4.624 -7.912 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 157 C CD1 . ILE 32 32 ? A 16.172 -4.807 -10.759 1 1 A ILE 0.750 1 ATOM 158 N N . ARG 33 33 ? A 17.965 -1.298 -6.850 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 159 C CA . ARG 33 33 ? A 18.939 -0.777 -5.915 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 160 C C . ARG 33 33 ? A 18.349 0.009 -4.760 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 161 O O . ARG 33 33 ? A 18.706 -0.251 -3.618 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 162 C CB . ARG 33 33 ? A 20.012 0.081 -6.623 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 163 C CG . ARG 33 33 ? A 20.928 -0.799 -7.496 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 164 C CD . ARG 33 33 ? A 22.150 -0.100 -8.108 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 165 N NE . ARG 33 33 ? A 21.719 0.676 -9.328 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 166 C CZ . ARG 33 33 ? A 21.818 0.262 -10.601 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 167 N NH1 . ARG 33 33 ? A 22.202 -0.967 -10.933 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 168 N NH2 . ARG 33 33 ? A 21.446 1.057 -11.601 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 169 N N . ARG 34 34 ? 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A 20.082 -4.333 -2.142 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 198 C CD . GLN 36 36 ? A 19.619 -5.710 -1.674 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 199 O OE1 . GLN 36 36 ? A 18.834 -6.393 -2.349 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 200 N NE2 . GLN 36 36 ? A 20.110 -6.156 -0.504 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 201 N N . GLU 37 37 ? A 18.536 -1.110 -0.811 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 202 C CA . GLU 37 37 ? A 18.996 -0.209 0.246 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 203 C C . GLU 37 37 ? A 18.013 0.002 1.375 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 204 O O . GLU 37 37 ? A 18.390 0.094 2.538 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 205 C CB . GLU 37 37 ? A 19.263 1.216 -0.307 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 206 C CG . GLU 37 37 ? A 20.474 1.313 -1.259 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 207 C CD . GLU 37 37 ? A 20.616 2.687 -1.919 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 208 O OE1 . GLU 37 37 ? A 19.723 3.562 -1.746 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 209 O OE2 . GLU 37 37 ? A 21.625 2.860 -2.651 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 210 N N . ILE 38 38 ? A 16.724 0.144 1.042 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 211 C CA . ILE 38 38 ? A 15.642 0.273 1.996 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 212 C C . ILE 38 38 ? A 15.375 -0.991 2.816 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 213 O O . ILE 38 38 ? A 15.028 -0.902 3.994 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 214 C CB . ILE 38 38 ? A 14.380 0.683 1.260 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 215 C CG1 . ILE 38 38 ? A 14.457 2.070 0.586 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 216 C CG2 . ILE 38 38 ? A 13.181 0.743 2.210 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 217 C CD1 . ILE 38 38 ? A 14.843 3.233 1.508 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 218 N N . GLU 39 39 ? A 15.494 -2.194 2.211 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 219 C CA . GLU 39 39 ? A 15.320 -3.470 2.891 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 220 C C . GLU 39 39 ? A 16.480 -3.872 3.820 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 221 O O . GLU 39 39 ? A 16.286 -4.698 4.712 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 222 C CB . GLU 39 39 ? A 15.142 -4.600 1.841 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 223 C CG . GLU 39 39 ? A 13.805 -4.545 1.056 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 224 C CD . GLU 39 39 ? A 12.555 -4.754 1.902 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 225 O OE1 . GLU 39 39 ? A 12.473 -5.751 2.659 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 226 O OE2 . GLU 39 39 ? A 11.601 -3.966 1.680 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 227 N N . GLU 40 40 ? A 17.701 -3.319 3.618 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 228 C CA . GLU 40 40 ? A 18.859 -3.478 4.495 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 229 C C . GLU 40 40 ? A 18.810 -2.653 5.818 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 230 O O . GLU 40 40 ? A 17.923 -1.781 6.004 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 231 C CB . GLU 40 40 ? A 20.190 -3.119 3.751 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 232 C CG . GLU 40 40 ? A 20.591 -4.160 2.666 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 233 C CD . GLU 40 40 ? A 21.853 -3.898 1.837 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 234 O OE1 . GLU 40 40 ? A 22.754 -3.127 2.246 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 235 O OE2 . GLU 40 40 ? A 21.934 -4.555 0.760 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 236 O OXT . GLU 40 40 ? A 19.696 -2.914 6.683 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 237 N N . ASP 14 14 ? B 9.597 -2.649 -35.022 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 238 C CA . ASP 14 14 ? B 8.822 -1.678 -34.141 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 239 C C . ASP 14 14 ? B 7.973 -2.316 -33.100 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 240 O O . ASP 14 14 ? B 8.294 -2.216 -31.925 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 241 C CB . ASP 14 14 ? B 7.995 -0.704 -35.014 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 242 C CG . ASP 14 14 ? B 9.013 0.009 -35.889 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 243 O OD1 . ASP 14 14 ? B 10.224 -0.225 -35.642 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 244 O OD2 . ASP 14 14 ? B 8.611 0.667 -36.860 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 245 N N . ALA 15 15 ? B 6.927 -3.073 -33.496 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 246 C CA . ALA 15 15 ? B 6.016 -3.699 -32.563 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 247 C C . ALA 15 15 ? B 6.704 -4.533 -31.487 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 248 O O . ALA 15 15 ? B 6.334 -4.457 -30.311 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 249 C CB . ALA 15 15 ? B 5.019 -4.586 -33.342 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 250 N N . GLU 16 16 ? B 7.761 -5.305 -31.806 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 251 C CA . GLU 16 16 ? B 8.575 -5.984 -30.820 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 252 C C . GLU 16 16 ? B 9.188 -5.063 -29.757 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 253 O O . GLU 16 16 ? B 9.098 -5.330 -28.562 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 254 C CB . GLU 16 16 ? B 9.727 -6.731 -31.533 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 255 C CG . GLU 16 16 ? B 10.620 -7.511 -30.534 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 256 C CD . GLU 16 16 ? B 11.855 -8.171 -31.128 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 257 O OE1 . GLU 16 16 ? B 11.994 -8.191 -32.372 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 258 O OE2 . GLU 16 16 ? B 12.680 -8.617 -30.274 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 259 N N . LEU 17 17 ? B 9.789 -3.928 -30.169 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 260 C CA . LEU 17 17 ? B 10.358 -2.927 -29.292 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 261 C C . LEU 17 17 ? B 9.319 -2.240 -28.408 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 262 O O . LEU 17 17 ? B 9.514 -2.152 -27.204 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 263 C CB . LEU 17 17 ? B 11.178 -1.913 -30.121 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 264 C CG . LEU 17 17 ? B 12.362 -2.548 -30.893 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 265 C CD1 . LEU 17 17 ? B 13.073 -1.498 -31.761 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 266 C CD2 . LEU 17 17 ? B 13.396 -3.194 -29.953 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 267 N N . ASP 18 18 ? B 8.149 -1.841 -28.965 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 268 C CA . ASP 18 18 ? B 7.025 -1.269 -28.234 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 269 C C . ASP 18 18 ? B 6.511 -2.210 -27.143 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 270 O O . ASP 18 18 ? B 6.213 -1.801 -26.020 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 271 C CB . ASP 18 18 ? B 5.887 -0.907 -29.228 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 272 C CG . ASP 18 18 ? B 6.296 0.241 -30.139 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 273 O OD1 . ASP 18 18 ? B 7.286 0.944 -29.817 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 274 O OD2 . ASP 18 18 ? B 5.614 0.405 -31.182 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 275 N N . LYS 19 19 ? B 6.470 -3.532 -27.416 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 276 C CA . LYS 19 19 ? B 6.152 -4.546 -26.419 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 277 C C . LYS 19 19 ? B 7.152 -4.623 -25.275 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 278 O O . LYS 19 19 ? B 6.757 -4.726 -24.113 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 279 C CB . LYS 19 19 ? B 5.999 -5.950 -27.051 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 280 C CG . LYS 19 19 ? B 4.766 -6.038 -27.956 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 281 C CD . LYS 19 19 ? B 4.717 -7.348 -28.750 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 282 C CE . LYS 19 19 ? B 3.590 -7.373 -29.785 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 283 N NZ . LYS 19 19 ? B 3.556 -8.691 -30.456 1 1 B LYS 0.770 1 ATOM 284 N N . ARG 20 20 ? B 8.470 -4.542 -25.563 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 285 C CA . ARG 20 20 ? B 9.517 -4.454 -24.557 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 286 C C . ARG 20 20 ? B 9.417 -3.195 -23.705 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 287 O O . ARG 20 20 ? B 9.552 -3.260 -22.492 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 288 C CB . ARG 20 20 ? B 10.938 -4.482 -25.178 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 289 C CG . ARG 20 20 ? B 11.273 -5.777 -25.941 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 290 C CD . ARG 20 20 ? B 12.685 -5.763 -26.538 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 291 N NE . ARG 20 20 ? B 12.872 -7.031 -27.329 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 292 C CZ . ARG 20 20 ? B 13.271 -8.213 -26.844 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 293 N NH1 . ARG 20 20 ? B 13.501 -8.385 -25.545 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 294 N NH2 . ARG 20 20 ? B 13.423 -9.223 -27.699 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 295 N N . ILE 21 21 ? B 9.148 -2.023 -24.333 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 296 C CA . ILE 21 21 ? B 8.950 -0.745 -23.654 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 297 C C . ILE 21 21 ? B 7.786 -0.809 -22.699 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 298 O O . ILE 21 21 ? B 7.922 -0.463 -21.527 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 299 C CB . ILE 21 21 ? B 8.744 0.394 -24.663 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 300 C CG1 . ILE 21 21 ? B 10.080 0.624 -25.406 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 301 C CG2 . ILE 21 21 ? B 8.240 1.703 -23.991 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 302 C CD1 . ILE 21 21 ? B 10.000 1.609 -26.580 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 303 N N . GLU 22 22 ? B 6.630 -1.333 -23.156 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 304 C CA . GLU 22 22 ? B 5.481 -1.509 -22.302 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 305 C C . GLU 22 22 ? B 5.767 -2.506 -21.171 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 306 O O . GLU 22 22 ? B 5.470 -2.230 -20.008 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 307 C CB . GLU 22 22 ? B 4.230 -1.809 -23.157 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 308 C CG . GLU 22 22 ? B 2.903 -1.747 -22.352 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 309 C CD . GLU 22 22 ? B 2.510 -0.501 -21.566 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 310 O OE1 . GLU 22 22 ? B 1.571 -0.663 -20.735 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 311 O OE2 . GLU 22 22 ? B 3.105 0.583 -21.710 1 1 B GLU 0.780 1 ATOM 312 N N . ALA 23 23 ? B 6.451 -3.645 -21.415 1 1 B ALA 0.840 1 ATOM 313 C CA . ALA 23 23 ? B 6.860 -4.588 -20.388 1 1 B ALA 0.840 1 ATOM 314 C C . ALA 23 23 ? B 7.770 -3.964 -19.324 1 1 B ALA 0.840 1 ATOM 315 O O . ALA 23 23 ? B 7.530 -4.122 -18.123 1 1 B ALA 0.840 1 ATOM 316 C CB . ALA 23 23 ? B 7.537 -5.810 -21.051 1 1 B ALA 0.840 1 ATOM 317 N N . LEU 24 24 ? B 8.786 -3.168 -19.726 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 318 C CA . LEU 24 24 ? B 9.613 -2.410 -18.803 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 319 C C . LEU 24 24 ? B 8.834 -1.370 -18.019 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 320 O O . LEU 24 24 ? B 8.984 -1.283 -16.814 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 321 C CB . LEU 24 24 ? B 10.823 -1.730 -19.486 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 322 C CG . LEU 24 24 ? B 11.857 -2.727 -20.047 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 323 C CD1 . LEU 24 24 ? 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B 4.824 -2.179 -16.197 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 338 C C . ARG 26 26 ? B 5.624 -2.637 -14.974 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 339 O O . ARG 26 26 ? B 5.174 -2.499 -13.837 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 340 C CB . ARG 26 26 ? B 4.196 -3.425 -16.843 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 341 C CG . ARG 26 26 ? B 3.079 -3.119 -17.857 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 342 C CD . ARG 26 26 ? B 2.652 -4.399 -18.570 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 343 N NE . ARG 26 26 ? B 1.924 -4.029 -19.825 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 344 C CZ . ARG 26 26 ? B 1.596 -4.921 -20.770 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 345 N NH1 . ARG 26 26 ? B 1.790 -6.223 -20.586 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 346 N NH2 . ARG 26 26 ? B 1.089 -4.510 -21.928 1 1 B ARG 0.730 1 ATOM 347 N N . LYS 27 27 ? B 6.849 -3.176 -15.193 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 348 C CA . LYS 27 27 ? B 7.790 -3.531 -14.142 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 349 C C . LYS 27 27 ? B 8.205 -2.313 -13.319 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 350 O O . LYS 27 27 ? B 8.160 -2.324 -12.089 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 351 C CB . LYS 27 27 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.698 2 1 3 0.003 3 1 4 0.420 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 14 ASP 1 0.400 2 1 A 15 ALA 1 0.540 3 1 A 16 GLU 1 0.700 4 1 A 17 LEU 1 0.700 5 1 A 18 ASP 1 0.720 6 1 A 19 LYS 1 0.770 7 1 A 20 ARG 1 0.740 8 1 A 21 ILE 1 0.770 9 1 A 22 GLU 1 0.790 10 1 A 23 ALA 1 0.840 11 1 A 24 LEU 1 0.760 12 1 A 25 ARG 1 0.730 13 1 A 26 ARG 1 0.730 14 1 A 27 LYS 1 0.740 15 1 A 28 ASN 1 0.750 16 1 A 29 GLU 1 0.760 17 1 A 30 ALA 1 0.820 18 1 A 31 LEU 1 0.740 19 1 A 32 ILE 1 0.750 20 1 A 33 ARG 1 0.720 21 1 A 34 ARG 1 0.700 22 1 A 35 TYR 1 0.680 23 1 A 36 GLN 1 0.730 24 1 A 37 GLU 1 0.710 25 1 A 38 ILE 1 0.660 26 1 A 39 GLU 1 0.470 27 1 A 40 GLU 1 0.430 28 1 B 14 ASP 1 0.400 29 1 B 15 ALA 1 0.540 30 1 B 16 GLU 1 0.700 31 1 B 17 LEU 1 0.700 32 1 B 18 ASP 1 0.720 33 1 B 19 LYS 1 0.770 34 1 B 20 ARG 1 0.740 35 1 B 21 ILE 1 0.770 36 1 B 22 GLU 1 0.780 37 1 B 23 ALA 1 0.840 38 1 B 24 LEU 1 0.760 39 1 B 25 ARG 1 0.730 40 1 B 26 ARG 1 0.730 41 1 B 27 LYS 1 0.740 42 1 B 28 ASN 1 0.750 43 1 B 29 GLU 1 0.760 44 1 B 30 ALA 1 0.820 45 1 B 31 LEU 1 0.740 46 1 B 32 ILE 1 0.750 47 1 B 33 ARG 1 0.720 48 1 B 34 ARG 1 0.700 49 1 B 35 TYR 1 0.680 50 1 B 36 GLN 1 0.730 51 1 B 37 GLU 1 0.710 52 1 B 38 ILE 1 0.660 53 1 B 39 GLU 1 0.470 54 1 B 40 GLU 1 0.430 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #