data_SMR-3252c8eb7451fde86dc40ea34f86faab_2 _entry.id SMR-3252c8eb7451fde86dc40ea34f86faab_2 _struct.entry_id SMR-3252c8eb7451fde86dc40ea34f86faab_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P49757/ NUMB_HUMAN, Protein numb homolog Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P49757' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 81029.614 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NUMB_HUMAN P49757 1 ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK KAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTG ERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKAET DKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK RQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPMTKPVTVVAPQS PTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQSSGAASPGLFQA GHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTSQPVPVGVVPAL QPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQTFPHYEASSAT TSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQRTNPSPTNPFSS DLQKTFEIEL ; 'Protein numb homolog' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 640 1 640 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NUMB_HUMAN P49757 P49757-2 1 640 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-06-01 918C5B5DD5CD87B8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK KAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTG ERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKAET DKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK RQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPMTKPVTVVAPQS PTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQSSGAASPGLFQA GHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTSQPVPVGVVPAL QPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQTFPHYEASSAT TSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQRTNPSPTNPFSS DLQKTFEIEL ; ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK KAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTG ERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKAET DKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK RQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPMTKPVTVVAPQS PTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQSSGAASPGLFQA GHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTSQPVPVGVVPAL QPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQTFPHYEASSAT TSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQRTNPSPTNPFSS DLQKTFEIEL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 LYS . 1 4 LEU . 1 5 ARG . 1 6 GLN . 1 7 SER . 1 8 PHE . 1 9 ARG . 1 10 ARG . 1 11 LYS . 1 12 LYS . 1 13 ASP . 1 14 VAL . 1 15 TYR . 1 16 VAL . 1 17 PRO . 1 18 GLU . 1 19 ALA . 1 20 SER . 1 21 ARG . 1 22 PRO . 1 23 HIS . 1 24 GLN . 1 25 TRP . 1 26 GLN . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 29 GLU . 1 30 GLU . 1 31 GLY . 1 32 VAL . 1 33 ARG . 1 34 THR . 1 35 GLY . 1 36 LYS . 1 37 CYS . 1 38 SER . 1 39 PHE . 1 40 PRO . 1 41 VAL . 1 42 LYS . 1 43 TYR . 1 44 LEU . 1 45 GLY . 1 46 HIS . 1 47 VAL . 1 48 GLU . 1 49 VAL . 1 50 ASP . 1 51 GLU . 1 52 SER . 1 53 ARG . 1 54 GLY . 1 55 MET . 1 56 HIS . 1 57 ILE . 1 58 CYS . 1 59 GLU . 1 60 ASP . 1 61 ALA . 1 62 VAL . 1 63 LYS . 1 64 ARG . 1 65 LEU . 1 66 LYS . 1 67 ALA . 1 68 THR . 1 69 GLY . 1 70 LYS . 1 71 LYS . 1 72 ALA . 1 73 VAL . 1 74 LYS . 1 75 ALA . 1 76 VAL . 1 77 LEU . 1 78 TRP . 1 79 VAL . 1 80 SER . 1 81 ALA . 1 82 ASP . 1 83 GLY . 1 84 LEU . 1 85 ARG . 1 86 VAL . 1 87 VAL . 1 88 ASP . 1 89 GLU . 1 90 LYS . 1 91 THR . 1 92 LYS . 1 93 ASP . 1 94 LEU . 1 95 ILE . 1 96 VAL . 1 97 ASP . 1 98 GLN . 1 99 THR . 1 100 ILE . 1 101 GLU . 1 102 LYS . 1 103 VAL . 1 104 SER . 1 105 PHE . 1 106 CYS . 1 107 ALA . 1 108 PRO . 1 109 ASP . 1 110 ARG . 1 111 ASN . 1 112 PHE . 1 113 ASP . 1 114 ARG . 1 115 ALA . 1 116 PHE . 1 117 SER . 1 118 TYR . 1 119 ILE . 1 120 CYS . 1 121 ARG . 1 122 ASP . 1 123 GLY . 1 124 THR . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 ARG . 1 128 TRP . 1 129 ILE . 1 130 CYS . 1 131 HIS . 1 132 CYS . 1 133 PHE . 1 134 MET . 1 135 ALA . 1 136 VAL . 1 137 LYS . 1 138 ASP . 1 139 THR . 1 140 GLY . 1 141 GLU . 1 142 ARG . 1 143 LEU . 1 144 SER . 1 145 HIS . 1 146 ALA . 1 147 VAL . 1 148 GLY . 1 149 CYS . 1 150 ALA . 1 151 PHE . 1 152 ALA . 1 153 ALA . 1 154 CYS . 1 155 LEU . 1 156 GLU . 1 157 ARG . 1 158 LYS . 1 159 GLN . 1 160 LYS . 1 161 ARG . 1 162 GLU . 1 163 LYS . 1 164 GLU . 1 165 CYS . 1 166 GLY . 1 167 VAL . 1 168 THR . 1 169 ALA . 1 170 THR . 1 171 PHE . 1 172 ASP . 1 173 ALA . 1 174 SER . 1 175 ARG . 1 176 THR . 1 177 THR . 1 178 PHE . 1 179 THR . 1 180 ARG . 1 181 GLU . 1 182 GLY . 1 183 SER . 1 184 PHE . 1 185 ARG . 1 186 VAL . 1 187 THR . 1 188 THR . 1 189 ALA . 1 190 THR . 1 191 GLU . 1 192 GLN . 1 193 ALA . 1 194 GLU . 1 195 ARG . 1 196 GLU 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E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Peptide from Protein numb homolog {PDB ID=5yqg, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=5yqg.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5yqg, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 2 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 31 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5yqg 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 640 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 640 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.8e-12 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKAETDKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTSQPVPVGVVPALQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQTFPHYEASSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yqg.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 262 262 ? A -29.353 -26.056 -57.643 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 2 C CA . ARG 262 262 ? A -28.237 -26.607 -56.788 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 3 C C . ARG 262 262 ? A -27.434 -27.658 -57.548 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 4 O O . ARG 262 262 ? A -27.954 -28.735 -57.791 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 5 C CB . ARG 262 262 ? A -28.798 -27.213 -55.472 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 6 C CG . ARG 262 262 ? A -27.720 -27.695 -54.469 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 7 C CD . ARG 262 262 ? A -28.362 -28.257 -53.197 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 8 N NE . ARG 262 262 ? A -27.267 -28.709 -52.282 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 9 C CZ . ARG 262 262 ? A -27.507 -29.267 -51.087 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 262 262 ? A -28.750 -29.436 -50.647 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 262 262 ? A -26.497 -29.666 -50.319 1 1 E ARG 0.960 1 ATOM 12 N N . GLN 263 263 ? A -26.182 -27.407 -57.988 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 13 C CA . GLN 263 263 ? A -25.434 -26.161 -57.951 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 14 C C . GLN 263 263 ? A -26.210 -25.037 -58.654 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 15 O O . GLN 263 263 ? A -26.656 -25.206 -59.780 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 16 C CB . GLN 263 263 ? A -24.044 -26.379 -58.587 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 17 C CG . GLN 263 263 ? A -23.044 -25.272 -58.211 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 18 C CD . GLN 263 263 ? A -21.690 -25.540 -58.861 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 19 O OE1 . GLN 263 263 ? A -21.195 -26.671 -58.881 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 20 N NE2 . GLN 263 263 ? A -21.058 -24.486 -59.408 1 1 E GLN 0.960 1 ATOM 21 N N . GLY 264 264 ? A -26.519 -23.905 -57.962 1 1 E GLY 0.580 1 ATOM 22 C CA . GLY 264 264 ? A -27.357 -22.829 -58.520 1 1 E GLY 0.580 1 ATOM 23 C C . GLY 264 264 ? A -26.767 -22.142 -59.713 1 1 E GLY 0.580 1 ATOM 24 O O . GLY 264 264 ? A -27.427 -21.971 -60.729 1 1 E GLY 0.580 1 ATOM 25 N N . SER 265 265 ? A -25.490 -21.762 -59.615 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 26 C CA . SER 265 265 ? A -24.755 -21.189 -60.719 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 27 C C . SER 265 265 ? A -23.327 -21.662 -60.582 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 28 O O . SER 265 265 ? A -22.991 -22.333 -59.615 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 29 C CB . SER 265 265 ? A -24.814 -19.627 -60.763 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 30 O OG . SER 265 265 ? A -24.121 -18.987 -59.684 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 31 N N . PHE 266 266 ? A -22.431 -21.315 -61.535 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 32 C CA . PHE 266 266 ? A -21.004 -21.635 -61.502 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 33 C C . PHE 266 266 ? A -20.251 -21.059 -60.290 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 34 O O . PHE 266 266 ? A -19.079 -21.355 -60.067 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 35 C CB . PHE 266 266 ? A -20.282 -21.149 -62.804 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 36 C CG . PHE 266 266 ? A -20.246 -19.633 -62.918 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 37 C CD1 . PHE 266 266 ? A -21.248 -18.935 -63.611 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 38 C CD2 . PHE 266 266 ? A -19.227 -18.891 -62.288 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 39 C CE1 . PHE 266 266 ? A -21.228 -17.535 -63.682 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 40 C CE2 . PHE 266 266 ? A -19.216 -17.493 -62.335 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 41 C CZ . PHE 266 266 ? A -20.211 -16.814 -63.046 1 1 E PHE 0.640 1 ATOM 42 N N . ARG 267 267 ? A -20.896 -20.182 -59.490 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 43 C CA . ARG 267 267 ? A -20.323 -19.582 -58.307 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 44 C C . ARG 267 267 ? A -19.849 -20.614 -57.290 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 45 O O . ARG 267 267 ? A -20.615 -21.451 -56.828 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 46 C CB . ARG 267 267 ? A -21.360 -18.651 -57.629 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 47 C CG . ARG 267 267 ? A -20.765 -17.815 -56.475 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 48 C CD . ARG 267 267 ? A -21.782 -16.943 -55.728 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 49 N NE . ARG 267 267 ? A -22.302 -15.916 -56.702 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 50 C CZ . ARG 267 267 ? A -21.712 -14.746 -56.984 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 51 N NH1 . ARG 267 267 ? A -20.575 -14.382 -56.403 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 52 N NH2 . ARG 267 267 ? A -22.272 -13.916 -57.864 1 1 E ARG 0.560 1 ATOM 53 N N . GLY 268 268 ? A -18.550 -20.560 -56.919 1 1 E GLY 0.640 1 ATOM 54 C CA . GLY 268 268 ? A -17.946 -21.538 -56.020 1 1 E GLY 0.640 1 ATOM 55 C C . GLY 268 268 ? A -17.429 -22.787 -56.695 1 1 E GLY 0.640 1 ATOM 56 O O . GLY 268 268 ? A -16.974 -23.693 -56.011 1 1 E GLY 0.640 1 ATOM 57 N N . PHE 269 269 ? A -17.474 -22.871 -58.047 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 58 C CA . PHE 269 269 ? A -16.836 -23.942 -58.806 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 59 C C . PHE 269 269 ? A -15.291 -23.980 -58.795 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 60 O O . PHE 269 269 ? A -14.764 -25.048 -58.481 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 61 C CB . PHE 269 269 ? A -17.346 -23.896 -60.283 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 62 C CG . PHE 269 269 ? A -16.897 -25.079 -61.098 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 63 C CD1 . PHE 269 269 ? A -15.802 -24.982 -61.976 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 64 C CD2 . PHE 269 269 ? A -17.553 -26.309 -60.962 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 65 C CE1 . PHE 269 269 ? A -15.390 -26.091 -62.726 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 66 C CE2 . PHE 269 269 ? A -17.149 -27.419 -61.714 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 67 C CZ . PHE 269 269 ? A -16.072 -27.308 -62.603 1 1 E PHE 0.560 1 ATOM 68 N N . PRO 270 270 ? A -14.475 -22.954 -59.115 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 69 C CA . PRO 270 270 ? A -13.033 -23.019 -58.894 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 70 C C . PRO 270 270 ? A -12.692 -23.199 -57.428 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 71 O O . PRO 270 270 ? A -13.093 -22.388 -56.599 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 72 C CB . PRO 270 270 ? A -12.481 -21.714 -59.504 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 73 C CG . PRO 270 270 ? A -13.649 -20.719 -59.440 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 74 C CD . PRO 270 270 ? A -14.912 -21.589 -59.415 1 1 E PRO 0.530 1 ATOM 75 N N . ALA 271 271 ? A -11.923 -24.248 -57.096 1 1 E ALA 0.730 1 ATOM 76 C CA . ALA 271 271 ? A -11.609 -24.575 -55.738 1 1 E ALA 0.730 1 ATOM 77 C C . ALA 271 271 ? A -10.110 -24.536 -55.621 1 1 E ALA 0.730 1 ATOM 78 O O . ALA 271 271 ? A -9.387 -25.329 -56.218 1 1 E ALA 0.730 1 ATOM 79 C CB . ALA 271 271 ? A -12.142 -25.984 -55.413 1 1 E ALA 0.730 1 ATOM 80 N N . LEU 272 272 ? A -9.600 -23.573 -54.845 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 81 C CA . LEU 272 272 ? A -8.183 -23.425 -54.626 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 82 C C . LEU 272 272 ? A -7.696 -24.383 -53.552 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 83 O O . LEU 272 272 ? A -8.435 -25.137 -52.932 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 84 C CB . LEU 272 272 ? A -7.830 -21.969 -54.236 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 85 C CG . LEU 272 272 ? A -8.131 -20.926 -55.327 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 86 C CD1 . LEU 272 272 ? A -7.754 -19.525 -54.812 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 87 C CD2 . LEU 272 272 ? A -7.393 -21.249 -56.638 1 1 E LEU 0.660 1 ATOM 88 N N . SER 273 273 ? A -6.378 -24.320 -53.257 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 89 C CA . SER 273 273 ? A -5.777 -24.892 -52.053 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 90 C C . SER 273 273 ? A -6.139 -24.091 -50.794 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 91 O O . SER 273 273 ? A -5.348 -23.575 -50.053 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 92 C CB . SER 273 273 ? A -4.242 -25.056 -52.179 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 93 O OG . SER 273 273 ? 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LYS 275 275 ? A -9.264 -28.006 -51.082 1 1 E LYS 0.740 1 ATOM 108 C CG . LYS 275 275 ? A -9.886 -29.405 -51.086 1 1 E LYS 0.740 1 ATOM 109 C CD . LYS 275 275 ? A -9.758 -30.085 -52.456 1 1 E LYS 0.740 1 ATOM 110 C CE . LYS 275 275 ? A -10.416 -31.468 -52.471 1 1 E LYS 0.740 1 ATOM 111 N NZ . LYS 275 275 ? A -10.274 -32.087 -53.805 1 1 E LYS 0.740 1 ATOM 112 N N . MET 276 276 ? A -7.388 -27.681 -48.654 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 113 C CA . MET 276 276 ? A -6.436 -28.099 -47.643 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 114 C C . MET 276 276 ? A -6.341 -27.041 -46.549 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 115 O O . MET 276 276 ? A -5.294 -26.698 -46.007 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 116 C CB . MET 276 276 ? A -5.053 -28.411 -48.265 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 117 C CG . MET 276 276 ? A -5.138 -29.537 -49.319 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 118 S SD . MET 276 276 ? A -5.794 -31.117 -48.681 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 119 C CE . MET 276 276 ? A -4.380 -31.526 -47.614 1 1 E MET 0.710 1 ATOM 120 N N . SER 277 277 ? A -7.508 -26.469 -46.208 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 121 C CA . SER 277 277 ? A -7.679 -25.524 -45.115 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 122 C C . SER 277 277 ? A -8.321 -26.134 -43.889 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 123 O O . SER 277 277 ? A -7.739 -25.950 -42.825 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 124 C CB . SER 277 277 ? A -8.343 -24.170 -45.520 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 125 O OG . SER 277 277 ? A -8.049 -23.135 -44.580 1 1 E SER 0.760 1 ATOM 126 N N . PRO 278 278 ? A -9.402 -26.901 -43.899 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 127 C CA . PRO 278 278 ? A -10.021 -27.424 -42.678 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 128 C C . PRO 278 278 ? A -9.220 -28.552 -42.017 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 129 O O . PRO 278 278 ? A -9.622 -29.037 -40.967 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 130 C CB . PRO 278 278 ? A -11.425 -27.865 -43.148 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 131 C CG . PRO 278 278 ? A -11.654 -27.067 -44.437 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 132 C CD . PRO 278 278 ? A -10.269 -27.108 -45.051 1 1 E PRO 0.760 1 ATOM 133 N N . PHE 279 279 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #