data_SMR-8b1d4d69cf4918eaa9d3987e5f3a5eea_2
_entry.id SMR-8b1d4d69cf4918eaa9d3987e5f3a5eea_2
_struct.entry_id SMR-8b1d4d69cf4918eaa9d3987e5f3a5eea_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q9QZS3/ NUMB_MOUSE, Protein numb homolog

Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9QZS3'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
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_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 81074.703 1 .
#
#
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_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP NUMB_MOUSE Q9QZS3 1
;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK
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DKTVVGPSVAPGNTAPSPSSPTSPTPDGTASSEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK
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ATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDNGGLASGNRHAEVPPGTCPVDPFEAQWAALESKSKQRTNPSPTNPF
SSDLQKTFEIEL
;
'Protein numb homolog'
#
#
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_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 642 1 642
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . NUMB_MOUSE Q9QZS3 Q9QZS3-2 1 642 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2000-05-01
2419437F0400E691
#
#
loop_
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_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no E
;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK
KAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTG
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DKTVVGPSVAPGNTAPSPSSPTSPTPDGTASSEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK
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SPVLQANGTDSASHVLTAKPANTALAHVAMPVRETNPWAHVPDAANKEIAAIHPGTEWGQSSGAASPGLF
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ATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDNGGLASGNRHAEVPPGTCPVDPFEAQWAALESKSKQRTNPSPTNPF
SSDLQKTFEIEL
;

;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGK
KAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTG
ERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQLQDAKKAET
DKTVVGPSVAPGNTAPSPSSPTSPTPDGTASSEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFK
RQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNTVPEVEGEAESISSLCSQITSAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTLVAPQ
SPVLQANGTDSASHVLTAKPANTALAHVAMPVRETNPWAHVPDAANKEIAAIHPGTEWGQSSGAASPGLF
QAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQVSAAPLQPVLQPPPPAAIAPPAPPFQGHAFLTSQPVPVGVVP
PLQPAFVPTQSYPVANGMPYPASNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQTTHPHQSPSLAKQQTFPQYETSS
ATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDNGGLASGNRHAEVPPGTCPVDPFEAQWAALESKSKQRTNPSPTNPF
SSDLQKTFEIEL
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ASN .
1 3 LYS .
1 4 LEU .
1 5 ARG .
1 6 GLN .
1 7 SER .
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1 9 ARG .
1 10 ARG .
1 11 LYS .
1 12 LYS .
1 13 ASP .
1 14 VAL .
1 15 TYR .
1 16 VAL .
1 17 PRO .
1 18 GLU .
1 19 ALA .
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1 22 PRO .
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1 26 GLN .
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1 32 VAL .
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1 49 VAL .
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1 53 ARG .
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1 87 VAL .
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1 159 GLN .
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1 197 GLU .
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1 215 VAL .
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#
#
loop_
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A 1 .
#
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loop_
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A 1 250 ILE 250 ? ? ? E .
A 1 251 PRO 251 ? ? ? E .
A 1 252 ARG 252 ? ? ? E .
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A 1 254 HIS 254 ? ? ? E .
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A 1 261 ALA 261 ? ? ? E .
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A 1 268 GLY 268 268 GLY GLY E .
A 1 269 PHE 269 269 PHE PHE E .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Peptide from Protein numb homolog {PDB ID=5yqg, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=5yqg.1.E}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 5yqg, label_asym_id=E'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 2 1 E
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1 LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL
#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 1 31
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5yqg 2024-10-23
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 642
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 642 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9.3e-12 100.000
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQLQDAKKAETDKTVVGPSVAPGNTAPSPSSPTSPTPDGTASSEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNTVPEVEGEAESISSLCSQITSAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTLVAPQSPVLQANGTDSASHVLTAKPANTALAHVAMPVRETNPWAHVPDAANKEIAAIHPGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQVSAAPLQPVLQPPPPAAIAPPAPPFQGHAFLTSQPVPVGVVPPLQPAFVPTQSYPVANGMPYPASNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQTTHPHQSPSLAKQQTFPQYETSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDNGGLASGNRHAEVPPGTCPVDPFEAQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL
2 1 2
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yqg.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . ARG 262 262 ? A -29.353 -26.056 -57.643 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 2 C CA . ARG 262 262 ? A -28.237 -26.607 -56.788 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 3 C C . ARG 262 262 ? A -27.434 -27.658 -57.548 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 4 O O . ARG 262 262 ? A -27.954 -28.735 -57.791 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 5 C CB . ARG 262 262 ? A -28.798 -27.213 -55.472 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 6 C CG . ARG 262 262 ? A -27.720 -27.695 -54.469 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 7 C CD . ARG 262 262 ? A -28.362 -28.257 -53.197 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 8 N NE . ARG 262 262 ? A -27.267 -28.709 -52.282 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 9 C CZ . ARG 262 262 ? A -27.507 -29.267 -51.087 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 10 N NH1 . ARG 262 262 ? A -28.750 -29.436 -50.647 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 11 N NH2 . ARG 262 262 ? A -26.497 -29.666 -50.319 1 1 E ARG 0.940 1
ATOM 12 N N . GLN 263 263 ? A -26.182 -27.407 -57.988 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 13 C CA . GLN 263 263 ? A -25.434 -26.161 -57.951 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 14 C C . GLN 263 263 ? A -26.210 -25.037 -58.654 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 15 O O . GLN 263 263 ? A -26.656 -25.206 -59.780 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 16 C CB . GLN 263 263 ? A -24.044 -26.379 -58.587 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 17 C CG . GLN 263 263 ? A -23.044 -25.272 -58.211 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 18 C CD . GLN 263 263 ? A -21.690 -25.540 -58.861 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 19 O OE1 . GLN 263 263 ? A -21.195 -26.671 -58.881 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 20 N NE2 . GLN 263 263 ? A -21.058 -24.486 -59.408 1 1 E GLN 0.950 1
ATOM 21 N N . GLY 264 264 ? A -26.519 -23.905 -57.962 1 1 E GLY 0.520 1
ATOM 22 C CA . GLY 264 264 ? A -27.357 -22.829 -58.520 1 1 E GLY 0.520 1
ATOM 23 C C . GLY 264 264 ? A -26.767 -22.142 -59.713 1 1 E GLY 0.520 1
ATOM 24 O O . GLY 264 264 ? A -27.427 -21.971 -60.729 1 1 E GLY 0.520 1
ATOM 25 N N . SER 265 265 ? A -25.490 -21.762 -59.615 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 26 C CA . SER 265 265 ? A -24.755 -21.189 -60.719 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 27 C C . SER 265 265 ? A -23.327 -21.662 -60.582 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 28 O O . SER 265 265 ? A -22.991 -22.333 -59.615 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 29 C CB . SER 265 265 ? A -24.814 -19.627 -60.763 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 30 O OG . SER 265 265 ? A -24.121 -18.987 -59.684 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 31 N N . PHE 266 266 ? A -22.431 -21.315 -61.535 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 32 C CA . PHE 266 266 ? A -21.004 -21.635 -61.502 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 33 C C . PHE 266 266 ? A -20.251 -21.059 -60.290 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 34 O O . PHE 266 266 ? A -19.079 -21.355 -60.067 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 35 C CB . PHE 266 266 ? A -20.282 -21.149 -62.804 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 36 C CG . PHE 266 266 ? A -20.246 -19.633 -62.918 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 37 C CD1 . PHE 266 266 ? A -21.248 -18.935 -63.611 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 38 C CD2 . PHE 266 266 ? A -19.227 -18.891 -62.288 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 39 C CE1 . PHE 266 266 ? A -21.228 -17.535 -63.682 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 40 C CE2 . PHE 266 266 ? A -19.216 -17.493 -62.335 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 41 C CZ . PHE 266 266 ? A -20.211 -16.814 -63.046 1 1 E PHE 0.570 1
ATOM 42 N N . ARG 267 267 ? A -20.896 -20.182 -59.490 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 43 C CA . ARG 267 267 ? A -20.323 -19.582 -58.307 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 44 C C . ARG 267 267 ? A -19.849 -20.614 -57.290 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 45 O O . ARG 267 267 ? A -20.615 -21.451 -56.828 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 46 C CB . ARG 267 267 ? A -21.360 -18.651 -57.629 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 47 C CG . ARG 267 267 ? A -20.765 -17.815 -56.475 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 48 C CD . ARG 267 267 ? A -21.782 -16.943 -55.728 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 49 N NE . ARG 267 267 ? A -22.302 -15.916 -56.702 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 50 C CZ . ARG 267 267 ? A -21.712 -14.746 -56.984 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 51 N NH1 . ARG 267 267 ? A -20.575 -14.382 -56.403 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 52 N NH2 . ARG 267 267 ? A -22.272 -13.916 -57.864 1 1 E ARG 0.480 1
ATOM 53 N N . GLY 268 268 ? A -18.550 -20.560 -56.919 1 1 E GLY 0.590 1
ATOM 54 C CA . GLY 268 268 ? A -17.946 -21.538 -56.020 1 1 E GLY 0.590 1
ATOM 55 C C . GLY 268 268 ? A -17.429 -22.787 -56.695 1 1 E GLY 0.590 1
ATOM 56 O O . GLY 268 268 ? A -16.974 -23.693 -56.011 1 1 E GLY 0.590 1
ATOM 57 N N . PHE 269 269 ? A -17.474 -22.871 -58.047 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 58 C CA . PHE 269 269 ? A -16.836 -23.942 -58.806 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 59 C C . PHE 269 269 ? A -15.291 -23.980 -58.795 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 60 O O . PHE 269 269 ? A -14.764 -25.048 -58.481 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 61 C CB . PHE 269 269 ? A -17.346 -23.896 -60.283 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 62 C CG . PHE 269 269 ? A -16.897 -25.079 -61.098 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 63 C CD1 . PHE 269 269 ? A -15.802 -24.982 -61.976 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 64 C CD2 . PHE 269 269 ? A -17.553 -26.309 -60.962 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 65 C CE1 . PHE 269 269 ? A -15.390 -26.091 -62.726 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 66 C CE2 . PHE 269 269 ? A -17.149 -27.419 -61.714 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 67 C CZ . PHE 269 269 ? A -16.072 -27.308 -62.603 1 1 E PHE 0.530 1
ATOM 68 N N . PRO 270 270 ? A -14.475 -22.954 -59.115 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 69 C CA . PRO 270 270 ? A -13.033 -23.019 -58.894 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 70 C C . PRO 270 270 ? A -12.692 -23.199 -57.428 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 71 O O . PRO 270 270 ? A -13.093 -22.388 -56.599 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 72 C CB . PRO 270 270 ? A -12.481 -21.714 -59.504 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 73 C CG . PRO 270 270 ? A -13.649 -20.719 -59.440 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 74 C CD . PRO 270 270 ? A -14.912 -21.589 -59.415 1 1 E PRO 0.500 1
ATOM 75 N N . ALA 271 271 ? A -11.923 -24.248 -57.096 1 1 E ALA 0.700 1
ATOM 76 C CA . ALA 271 271 ? A -11.609 -24.575 -55.738 1 1 E ALA 0.700 1
ATOM 77 C C . ALA 271 271 ? A -10.110 -24.536 -55.621 1 1 E ALA 0.700 1
ATOM 78 O O . ALA 271 271 ? A -9.387 -25.329 -56.218 1 1 E ALA 0.700 1
ATOM 79 C CB . ALA 271 271 ? A -12.142 -25.984 -55.413 1 1 E ALA 0.700 1
ATOM 80 N N . LEU 272 272 ? A -9.600 -23.573 -54.845 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 81 C CA . LEU 272 272 ? A -8.183 -23.425 -54.626 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 82 C C . LEU 272 272 ? A -7.696 -24.383 -53.552 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 83 O O . LEU 272 272 ? A -8.435 -25.137 -52.932 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 84 C CB . LEU 272 272 ? A -7.830 -21.969 -54.236 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 85 C CG . LEU 272 272 ? A -8.131 -20.926 -55.327 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 86 C CD1 . LEU 272 272 ? A -7.754 -19.525 -54.812 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 87 C CD2 . LEU 272 272 ? A -7.393 -21.249 -56.638 1 1 E LEU 0.620 1
ATOM 88 N N . SER 273 273 ? A -6.378 -24.320 -53.257 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 89 C CA . SER 273 273 ? A -5.777 -24.892 -52.053 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 90 C C . SER 273 273 ? A -6.139 -24.091 -50.794 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 91 O O . SER 273 273 ? A -5.348 -23.575 -50.053 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 92 C CB . SER 273 273 ? A -4.242 -25.056 -52.179 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 93 O OG . SER 273 273 ? A -3.989 -25.895 -53.307 1 1 E SER 0.670 1
ATOM 94 N N . GLN 274 274 ? A -7.482 -24.056 -50.609 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 95 C CA . GLN 274 274 ? A -8.332 -23.613 -49.531 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 96 C C . GLN 274 274 ? A -9.203 -24.812 -49.176 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 97 O O . GLN 274 274 ? A -9.973 -24.812 -48.225 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 98 C CB . GLN 274 274 ? A -9.232 -22.470 -50.085 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 99 C CG . GLN 274 274 ? A -8.447 -21.253 -50.638 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 100 C CD . GLN 274 274 ? A -7.701 -20.509 -49.542 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 101 O OE1 . GLN 274 274 ? A -8.236 -19.596 -48.904 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 102 N NE2 . GLN 274 274 ? A -6.429 -20.880 -49.295 1 1 E GLN 0.710 1
ATOM 103 N N . LYS 275 275 ? A -8.999 -25.902 -49.947 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 104 C CA . LYS 275 275 ? A -9.499 -27.235 -49.759 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 105 C C . LYS 275 275 ? A -8.721 -27.906 -48.649 1 1 E LYS 0.730 1
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ATOM 144 N N . LYS 280 280 ? A -6.016 -28.050 -41.205 1 1 E LYS 0.750 1
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ATOM 164 N N . GLN 282 282 ? A -4.676 -26.282 -35.292 1 1 E GLN 0.640 1
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ATOM 171 O OE1 . GLN 282 282 ? A -8.046 -22.529 -34.540 1 1 E GLN 0.640 1
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ATOM 187 N N . LEU 285 285 ? A -6.847 -22.678 -28.090 1 1 E LEU 0.480 1
ATOM 188 C CA . LEU 285 285 ? A -8.256 -22.912 -27.874 1 1 E LEU 0.480 1
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ATOM 190 O O . LEU 285 285 ? A -8.913 -21.336 -29.586 1 1 E LEU 0.480 1
ATOM 191 C CB . LEU 285 285 ? A -8.684 -22.309 -26.512 1 1 E LEU 0.480 1
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ATOM 193 C CD1 . LEU 285 285 ? A -10.159 -24.225 -25.642 1 1 E LEU 0.480 1
ATOM 194 C CD2 . LEU 285 285 ? A -10.546 -21.842 -24.868 1 1 E LEU 0.480 1
ATOM 195 N N . ARG 286 286 ? A -10.206 -23.159 -29.336 1 1 E ARG 1.000 1
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ATOM 206 N N . ILE 287 287 ? A -13.500 -21.905 -30.323 1 1 E ILE 0.270 1
ATOM 207 C CA . ILE 287 287 ? A -14.803 -21.542 -29.809 1 1 E ILE 0.270 1
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ATOM 211 C CG1 . ILE 287 287 ? A -13.899 -19.380 -28.853 1 1 E ILE 0.270 1
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ATOM 213 C CD1 . ILE 287 287 ? A -13.851 -17.846 -28.877 1 1 E ILE 0.270 1
ATOM 214 O OXT . ILE 287 287 ? A -16.978 -22.453 -30.377 1 1 E ILE 0.270 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
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1 1 2 0.645
2 1 3 0
#
#
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_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
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_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
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1 1 A 262 ARG 1 0.940
2 1 A 263 GLN 1 0.950
3 1 A 264 GLY 1 0.520
4 1 A 265 SER 1 0.610
5 1 A 266 PHE 1 0.570
6 1 A 267 ARG 1 0.480
7 1 A 268 GLY 1 0.590
8 1 A 269 PHE 1 0.530
9 1 A 270 PRO 1 0.500
10 1 A 271 ALA 1 0.700
11 1 A 272 LEU 1 0.620
12 1 A 273 SER 1 0.670
13 1 A 274 GLN 1 0.710
14 1 A 275 LYS 1 0.730
15 1 A 276 MET 1 0.710
16 1 A 277 SER 1 0.760
17 1 A 278 PRO 1 0.760
18 1 A 279 PHE 1 0.710
19 1 A 280 LYS 1 0.750
20 1 A 281 ARG 1 0.620
21 1 A 282 GLN 1 0.640
22 1 A 283 LEU 1 0.490
23 1 A 284 SER 1 0.470
24 1 A 285 LEU 1 0.480
25 1 A 286 ARG 1 1.000
26 1 A 287 ILE 1 0.270
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#