data_SMR-aa11efda7c49202690301e6fcc0f46b5_2 _entry.id SMR-aa11efda7c49202690301e6fcc0f46b5_2 _struct.entry_id SMR-aa11efda7c49202690301e6fcc0f46b5_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P49757/ NUMB_HUMAN, Protein numb homolog Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P49757' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 82604.452 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NUMB_HUMAN P49757 1 ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKAERK FFKGFFGKTGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWI CHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIM KQMQDAKKAETDKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGF PALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPM TKPVTVVAPQSPTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQS SGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTS QPVPVGVVPALQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQ TFPHYEASSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQR TNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL ; 'Protein numb homolog' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 651 1 651 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NUMB_HUMAN P49757 . 1 651 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-06-01 5B590BE49A74FCF2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKAERK FFKGFFGKTGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWI CHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIM KQMQDAKKAETDKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGF PALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPM TKPVTVVAPQSPTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQS SGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTS QPVPVGVVPALQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQ TFPHYEASSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQR TNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL ; ;MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKAERK FFKGFFGKTGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWI CHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIM KQMQDAKKAETDKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGF PALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPM TKPVTVVAPQSPTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQS SGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTS QPVPVGVVPALQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQ TFPHYEASSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQR TNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 LYS . 1 4 LEU . 1 5 ARG . 1 6 GLN . 1 7 SER . 1 8 PHE . 1 9 ARG . 1 10 ARG . 1 11 LYS . 1 12 LYS . 1 13 ASP . 1 14 VAL . 1 15 TYR . 1 16 VAL . 1 17 PRO . 1 18 GLU . 1 19 ALA . 1 20 SER . 1 21 ARG . 1 22 PRO . 1 23 HIS . 1 24 GLN . 1 25 TRP . 1 26 GLN . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 29 GLU . 1 30 GLU . 1 31 GLY . 1 32 VAL . 1 33 ARG . 1 34 THR . 1 35 GLY . 1 36 LYS . 1 37 CYS . 1 38 SER . 1 39 PHE . 1 40 PRO . 1 41 VAL . 1 42 LYS . 1 43 TYR . 1 44 LEU . 1 45 GLY . 1 46 HIS . 1 47 VAL . 1 48 GLU . 1 49 VAL . 1 50 ASP . 1 51 GLU . 1 52 SER . 1 53 ARG . 1 54 GLY . 1 55 MET . 1 56 HIS . 1 57 ILE . 1 58 CYS . 1 59 GLU . 1 60 ASP . 1 61 ALA . 1 62 VAL . 1 63 LYS . 1 64 ARG . 1 65 LEU . 1 66 LYS . 1 67 ALA . 1 68 GLU . 1 69 ARG . 1 70 LYS . 1 71 PHE . 1 72 PHE . 1 73 LYS . 1 74 GLY . 1 75 PHE . 1 76 PHE . 1 77 GLY . 1 78 LYS . 1 79 THR . 1 80 GLY . 1 81 LYS . 1 82 LYS . 1 83 ALA . 1 84 VAL . 1 85 LYS . 1 86 ALA . 1 87 VAL . 1 88 LEU . 1 89 TRP . 1 90 VAL . 1 91 SER . 1 92 ALA . 1 93 ASP . 1 94 GLY . 1 95 LEU . 1 96 ARG . 1 97 VAL . 1 98 VAL . 1 99 ASP . 1 100 GLU . 1 101 LYS . 1 102 THR . 1 103 LYS . 1 104 ASP . 1 105 LEU . 1 106 ILE . 1 107 VAL . 1 108 ASP . 1 109 GLN . 1 110 THR . 1 111 ILE . 1 112 GLU . 1 113 LYS . 1 114 VAL . 1 115 SER . 1 116 PHE . 1 117 CYS . 1 118 ALA . 1 119 PRO . 1 120 ASP . 1 121 ARG . 1 122 ASN . 1 123 PHE . 1 124 ASP . 1 125 ARG . 1 126 ALA . 1 127 PHE . 1 128 SER . 1 129 TYR . 1 130 ILE . 1 131 CYS . 1 132 ARG . 1 133 ASP . 1 134 GLY . 1 135 THR . 1 136 THR . 1 137 ARG . 1 138 ARG . 1 139 TRP . 1 140 ILE . 1 141 CYS . 1 142 HIS . 1 143 CYS . 1 144 PHE . 1 145 MET . 1 146 ALA . 1 147 VAL . 1 148 LYS . 1 149 ASP . 1 150 THR . 1 151 GLY . 1 152 GLU . 1 153 ARG . 1 154 LEU . 1 155 SER . 1 156 HIS . 1 157 ALA . 1 158 VAL . 1 159 GLY . 1 160 CYS . 1 161 ALA . 1 162 PHE . 1 163 ALA . 1 164 ALA . 1 165 CYS . 1 166 LEU . 1 167 GLU . 1 168 ARG . 1 169 LYS . 1 170 GLN . 1 171 LYS . 1 172 ARG . 1 173 GLU . 1 174 LYS . 1 175 GLU . 1 176 CYS . 1 177 GLY . 1 178 VAL . 1 179 THR . 1 180 ALA . 1 181 THR . 1 182 PHE . 1 183 ASP . 1 184 ALA . 1 185 SER . 1 186 ARG . 1 187 THR . 1 188 THR . 1 189 PHE . 1 190 THR . 1 191 ARG . 1 192 GLU . 1 193 GLY . 1 194 SER . 1 195 PHE . 1 196 ARG . 1 197 VAL . 1 198 THR . 1 199 THR . 1 200 ALA . 1 201 THR . 1 202 GLU . 1 203 GLN . 1 204 ALA . 1 205 GLU . 1 206 ARG . 1 207 GLU . 1 208 GLU . 1 209 ILE . 1 210 MET . 1 211 LYS . 1 212 GLN . 1 213 MET . 1 214 GLN . 1 215 ASP . 1 216 ALA . 1 217 LYS . 1 218 LYS . 1 219 ALA . 1 220 GLU . 1 221 THR . 1 222 ASP . 1 223 LYS . 1 224 ILE . 1 225 VAL . 1 226 VAL . 1 227 GLY . 1 228 SER . 1 229 SER . 1 230 VAL . 1 231 ALA . 1 232 PRO . 1 233 GLY . 1 234 ASN . 1 235 THR . 1 236 ALA . 1 237 PRO . 1 238 SER . 1 239 PRO . 1 240 SER . 1 241 SER . 1 242 PRO . 1 243 THR . 1 244 SER . 1 245 PRO . 1 246 THR . 1 247 SER . 1 248 ASP . 1 249 ALA . 1 250 THR . 1 251 THR . 1 252 SER . 1 253 LEU . 1 254 GLU . 1 255 MET . 1 256 ASN . 1 257 ASN . 1 258 PRO . 1 259 HIS . 1 260 ALA . 1 261 ILE . 1 262 PRO . 1 263 ARG . 1 264 ARG . 1 265 HIS . 1 266 ALA . 1 267 PRO . 1 268 ILE . 1 269 GLU . 1 270 GLN . 1 271 LEU . 1 272 ALA . 1 273 ARG . 1 274 GLN . 1 275 GLY . 1 276 SER . 1 277 PHE . 1 278 ARG . 1 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A 1 650 GLU 650 ? ? ? E . A 1 651 LEU 651 ? ? ? E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Peptide from Protein numb homolog {PDB ID=5yqg, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=5yqg.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5yqg, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 2 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 31 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5yqg 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 651 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 651 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.6e-12 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKAERKFFKGFFGKTGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKAETDKIVVGSSVAPGNTAPSPSSPTSPTSDATTSLEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPTFQANGTDSAFHVLAKPAHTALAPVAMPVRETNPWAHAPDAANKEIAATCSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRAQQPQASAAPLQPVLQPPPPTAISQPASPFQGNAFLTSQPVPVGVVPALQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVRQQTFPHYEASSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGRLASADRHTEVPTGTCPVDPFEAQWAALENKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yqg.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 273 273 ? A -29.353 -26.056 -57.643 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 2 C CA . ARG 273 273 ? A -28.237 -26.607 -56.788 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 3 C C . ARG 273 273 ? A -27.434 -27.658 -57.548 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 4 O O . ARG 273 273 ? A -27.954 -28.735 -57.791 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 5 C CB . ARG 273 273 ? A -28.798 -27.213 -55.472 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 6 C CG . ARG 273 273 ? A -27.720 -27.695 -54.469 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 7 C CD . ARG 273 273 ? A -28.362 -28.257 -53.197 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 8 N NE . ARG 273 273 ? A -27.267 -28.709 -52.282 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 9 C CZ . ARG 273 273 ? A -27.507 -29.267 -51.087 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 273 273 ? A -28.750 -29.436 -50.647 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 273 273 ? A -26.497 -29.666 -50.319 1 1 E ARG 0.970 1 ATOM 12 N N . GLN 274 274 ? A -26.182 -27.407 -57.988 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 13 C CA . GLN 274 274 ? A -25.434 -26.161 -57.951 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 14 C C . GLN 274 274 ? A -26.210 -25.037 -58.654 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 15 O O . GLN 274 274 ? A -26.656 -25.206 -59.780 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 16 C CB . GLN 274 274 ? A -24.044 -26.379 -58.587 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 17 C CG . GLN 274 274 ? A -23.044 -25.272 -58.211 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 18 C CD . GLN 274 274 ? A -21.690 -25.540 -58.861 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 19 O OE1 . GLN 274 274 ? A -21.195 -26.671 -58.881 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 20 N NE2 . GLN 274 274 ? A -21.058 -24.486 -59.408 1 1 E GLN 0.990 1 ATOM 21 N N . GLY 275 275 ? A -26.519 -23.905 -57.962 1 1 E GLY 0.620 1 ATOM 22 C CA . GLY 275 275 ? A -27.357 -22.829 -58.520 1 1 E GLY 0.620 1 ATOM 23 C C . GLY 275 275 ? A -26.767 -22.142 -59.713 1 1 E GLY 0.620 1 ATOM 24 O O . GLY 275 275 ? A -27.427 -21.971 -60.729 1 1 E GLY 0.620 1 ATOM 25 N N . SER 276 276 ? A -25.490 -21.762 -59.615 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 26 C CA . SER 276 276 ? A -24.755 -21.189 -60.719 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 27 C C . SER 276 276 ? A -23.327 -21.662 -60.582 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 28 O O . SER 276 276 ? A -22.991 -22.333 -59.615 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 29 C CB . SER 276 276 ? A -24.814 -19.627 -60.763 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 30 O OG . SER 276 276 ? A -24.121 -18.987 -59.684 1 1 E SER 0.680 1 ATOM 31 N N . PHE 277 277 ? A -22.431 -21.315 -61.535 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 32 C CA . PHE 277 277 ? A -21.004 -21.635 -61.502 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 33 C C . PHE 277 277 ? A -20.251 -21.059 -60.290 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 34 O O . PHE 277 277 ? A -19.079 -21.355 -60.067 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 35 C CB . PHE 277 277 ? A -20.282 -21.149 -62.804 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 36 C CG . PHE 277 277 ? A -20.246 -19.633 -62.918 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 37 C CD1 . PHE 277 277 ? A -21.248 -18.935 -63.611 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 38 C CD2 . PHE 277 277 ? A -19.227 -18.891 -62.288 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 39 C CE1 . PHE 277 277 ? A -21.228 -17.535 -63.682 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 40 C CE2 . PHE 277 277 ? A -19.216 -17.493 -62.335 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 41 C CZ . PHE 277 277 ? A -20.211 -16.814 -63.046 1 1 E PHE 0.690 1 ATOM 42 N N . ARG 278 278 ? A -20.896 -20.182 -59.490 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 43 C CA . ARG 278 278 ? A -20.323 -19.582 -58.307 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 44 C C . ARG 278 278 ? A -19.849 -20.614 -57.290 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 45 O O . ARG 278 278 ? A -20.615 -21.451 -56.828 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 46 C CB . ARG 278 278 ? A -21.360 -18.651 -57.629 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 47 C CG . ARG 278 278 ? A -20.765 -17.815 -56.475 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 48 C CD . ARG 278 278 ? A -21.782 -16.943 -55.728 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 49 N NE . ARG 278 278 ? A -22.302 -15.916 -56.702 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 50 C CZ . ARG 278 278 ? A -21.712 -14.746 -56.984 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 51 N NH1 . ARG 278 278 ? A -20.575 -14.382 -56.403 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 52 N NH2 . ARG 278 278 ? A -22.272 -13.916 -57.864 1 1 E ARG 0.680 1 ATOM 53 N N . GLY 279 279 ? A -18.550 -20.560 -56.919 1 1 E GLY 0.800 1 ATOM 54 C CA . GLY 279 279 ? A -17.946 -21.538 -56.020 1 1 E GLY 0.800 1 ATOM 55 C C . GLY 279 279 ? A -17.429 -22.787 -56.695 1 1 E GLY 0.800 1 ATOM 56 O O . GLY 279 279 ? A -16.974 -23.693 -56.011 1 1 E GLY 0.800 1 ATOM 57 N N . PHE 280 280 ? A -17.474 -22.871 -58.047 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 58 C CA . PHE 280 280 ? A -16.836 -23.942 -58.806 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 59 C C . PHE 280 280 ? A -15.291 -23.980 -58.795 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 60 O O . PHE 280 280 ? A -14.764 -25.048 -58.481 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 61 C CB . PHE 280 280 ? A -17.346 -23.896 -60.283 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 62 C CG . PHE 280 280 ? A -16.897 -25.079 -61.098 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 63 C CD1 . PHE 280 280 ? A -15.802 -24.982 -61.976 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 64 C CD2 . PHE 280 280 ? A -17.553 -26.309 -60.962 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 65 C CE1 . PHE 280 280 ? A -15.390 -26.091 -62.726 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 66 C CE2 . PHE 280 280 ? A -17.149 -27.419 -61.714 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 67 C CZ . PHE 280 280 ? A -16.072 -27.308 -62.603 1 1 E PHE 0.730 1 ATOM 68 N N . PRO 281 281 ? A -14.475 -22.954 -59.115 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 69 C CA . PRO 281 281 ? A -13.033 -23.019 -58.894 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 70 C C . PRO 281 281 ? A -12.692 -23.199 -57.428 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 71 O O . PRO 281 281 ? A -13.093 -22.388 -56.599 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 72 C CB . PRO 281 281 ? A -12.481 -21.714 -59.504 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 73 C CG . PRO 281 281 ? A -13.649 -20.719 -59.440 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 74 C CD . PRO 281 281 ? A -14.912 -21.589 -59.415 1 1 E PRO 0.690 1 ATOM 75 N N . ALA 282 282 ? A -11.923 -24.248 -57.096 1 1 E ALA 0.750 1 ATOM 76 C CA . ALA 282 282 ? A -11.609 -24.575 -55.738 1 1 E ALA 0.750 1 ATOM 77 C C . ALA 282 282 ? A -10.110 -24.536 -55.621 1 1 E ALA 0.750 1 ATOM 78 O O . ALA 282 282 ? A -9.387 -25.329 -56.218 1 1 E ALA 0.750 1 ATOM 79 C CB . ALA 282 282 ? A -12.142 -25.984 -55.413 1 1 E ALA 0.750 1 ATOM 80 N N . LEU 283 283 ? A -9.600 -23.573 -54.845 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 81 C CA . LEU 283 283 ? A -8.183 -23.425 -54.626 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 82 C C . LEU 283 283 ? A -7.696 -24.383 -53.552 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 83 O O . LEU 283 283 ? A -8.435 -25.137 -52.932 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 84 C CB . LEU 283 283 ? A -7.830 -21.969 -54.236 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 85 C CG . LEU 283 283 ? A -8.131 -20.926 -55.327 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 86 C CD1 . LEU 283 283 ? A -7.754 -19.525 -54.812 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 87 C CD2 . LEU 283 283 ? A -7.393 -21.249 -56.638 1 1 E LEU 0.690 1 ATOM 88 N N . SER 284 284 ? A -6.378 -24.320 -53.257 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 89 C CA . SER 284 284 ? A -5.777 -24.892 -52.053 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 90 C C . SER 284 284 ? A -6.139 -24.091 -50.794 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 91 O O . SER 284 284 ? A -5.348 -23.575 -50.053 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 92 C CB . SER 284 284 ? A -4.242 -25.056 -52.179 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 93 O OG . SER 284 284 ? A -3.989 -25.895 -53.307 1 1 E SER 0.700 1 ATOM 94 N N . GLN 285 285 ? A -7.482 -24.056 -50.609 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 95 C CA . GLN 285 285 ? A -8.332 -23.613 -49.531 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 96 C C . GLN 285 285 ? A -9.203 -24.812 -49.176 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 97 O O . GLN 285 285 ? A -9.973 -24.812 -48.225 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 98 C CB . GLN 285 285 ? A -9.232 -22.470 -50.085 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 99 C CG . GLN 285 285 ? A -8.447 -21.253 -50.638 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 100 C CD . GLN 285 285 ? A -7.701 -20.509 -49.542 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 101 O OE1 . GLN 285 285 ? A -8.236 -19.596 -48.904 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 102 N NE2 . GLN 285 285 ? A -6.429 -20.880 -49.295 1 1 E GLN 0.700 1 ATOM 103 N N . LYS 286 286 ? A -8.999 -25.902 -49.947 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 104 C CA . LYS 286 286 ? A -9.499 -27.235 -49.759 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 105 C C . LYS 286 286 ? A -8.721 -27.906 -48.649 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 106 O O . LYS 286 286 ? A -9.266 -28.541 -47.755 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 107 C CB . 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A -5.132 -27.591 -38.916 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 147 O O . LYS 291 291 ? A -6.190 -27.647 -38.296 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 148 C CB . LYS 291 291 ? A -5.158 -25.799 -40.616 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 149 C CG . LYS 291 291 ? A -4.654 -25.310 -41.982 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 150 C CD . LYS 291 291 ? A -4.791 -23.779 -42.094 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 151 C CE . LYS 291 291 ? A -4.210 -23.164 -43.370 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 152 N NZ . LYS 291 291 ? A -5.056 -23.535 -44.515 1 1 E LYS 0.730 1 ATOM 153 N N . ARG 292 292 ? A -3.951 -27.708 -38.286 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 154 C CA . ARG 292 292 ? A -3.862 -27.922 -36.872 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 155 C C . ARG 292 292 ? A -3.716 -26.592 -36.173 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 156 O O . ARG 292 292 ? A -2.767 -25.844 -36.385 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 157 C CB . ARG 292 292 ? A -2.666 -28.834 -36.549 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 158 C CG . ARG 292 292 ? A -2.541 -29.185 -35.056 1 1 E ARG 0.660 1 ATOM 159 C CD . ARG 292 292 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.711 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 273 ARG 1 0.970 2 1 A 274 GLN 1 0.990 3 1 A 275 GLY 1 0.620 4 1 A 276 SER 1 0.680 5 1 A 277 PHE 1 0.690 6 1 A 278 ARG 1 0.680 7 1 A 279 GLY 1 0.800 8 1 A 280 PHE 1 0.730 9 1 A 281 PRO 1 0.690 10 1 A 282 ALA 1 0.750 11 1 A 283 LEU 1 0.690 12 1 A 284 SER 1 0.700 13 1 A 285 GLN 1 0.700 14 1 A 286 LYS 1 0.730 15 1 A 287 MET 1 0.700 16 1 A 288 SER 1 0.740 17 1 A 289 PRO 1 0.740 18 1 A 290 PHE 1 0.710 19 1 A 291 LYS 1 0.730 20 1 A 292 ARG 1 0.660 21 1 A 293 GLN 1 0.690 22 1 A 294 LEU 1 0.610 23 1 A 295 SER 1 0.600 24 1 A 296 LEU 1 0.570 25 1 A 297 ARG 1 1.000 26 1 A 298 ILE 1 0.320 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #