data_SMR-66cf483a4e96267ae6daa0e1d6ff2477_1 _entry.id SMR-66cf483a4e96267ae6daa0e1d6ff2477_1 _struct.entry_id SMR-66cf483a4e96267ae6daa0e1d6ff2477_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q95QA6/ PAT12_CAEEL, Protein pat-12 Estimated model accuracy of this model is 0.026, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q95QA6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 88773.521 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PAT12_CAEEL Q95QA6 1 ;MTSHIATETSVNRWSTEPVVREEGRPPGPEDFPSTKQGREQDGNVIGITPNYKIGEQKPNSELNLGKTGS LPRGSGDYKMTYRQEDYKQTIIDPKVITNANMPYISTRIPDPRRNLAGDFPSEHSKSKIKLDPLEQRRFR SSESRPITTSNYLAESVDRHREMEASRLREYLKAKENEANQPWNKPGWPGPKKNDESLRELETMKQRIET LKRDANKGPVNAELDELSKRAEELRKRDGWSKYKLVESDIYKTDPDPMPANIKDQVRDLLESRNSVETTT TQRDHDKSGYVTDVSTATWNFSTVDYSPRSVVSMNGASHDILKDDKPRSIMKRNDLVRREQMLYPTVDTQ VVKSVVKKPTVTETVQRFEETRRTEEVERRVQRREKKERRSRHHSSSRHHSGWEGHTGGYQGHRSSSLSR GGHGGGGQETYYRQETTRRQQHNNYDDNFNRGIAHARYGSLSDSLRRGELQYVPNGEVRQSFYRDGSNGG QRMHKSYSTRDVFTGDGYDDRRSVSSFRRGSQQQVSPFVEFPPTLPRRGGGGDYRREEDAYFRPVSKSRS YADWDDAGRAGMGREVRRYDDDMSRLEAEFRDSLLMPMPAGNMNERDHRTEQLPGGYETFNKERHANSGR RSGRDGKPVDFNEATQEYNYKREQTLNDDRRRR ; 'Protein pat-12' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 663 1 663 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PAT12_CAEEL Q95QA6 . 1 663 6239 'Caenorhabditis elegans' 2001-12-01 416F3943DB9A7ACA # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MTSHIATETSVNRWSTEPVVREEGRPPGPEDFPSTKQGREQDGNVIGITPNYKIGEQKPNSELNLGKTGS LPRGSGDYKMTYRQEDYKQTIIDPKVITNANMPYISTRIPDPRRNLAGDFPSEHSKSKIKLDPLEQRRFR SSESRPITTSNYLAESVDRHREMEASRLREYLKAKENEANQPWNKPGWPGPKKNDESLRELETMKQRIET LKRDANKGPVNAELDELSKRAEELRKRDGWSKYKLVESDIYKTDPDPMPANIKDQVRDLLESRNSVETTT TQRDHDKSGYVTDVSTATWNFSTVDYSPRSVVSMNGASHDILKDDKPRSIMKRNDLVRREQMLYPTVDTQ VVKSVVKKPTVTETVQRFEETRRTEEVERRVQRREKKERRSRHHSSSRHHSGWEGHTGGYQGHRSSSLSR GGHGGGGQETYYRQETTRRQQHNNYDDNFNRGIAHARYGSLSDSLRRGELQYVPNGEVRQSFYRDGSNGG QRMHKSYSTRDVFTGDGYDDRRSVSSFRRGSQQQVSPFVEFPPTLPRRGGGGDYRREEDAYFRPVSKSRS YADWDDAGRAGMGREVRRYDDDMSRLEAEFRDSLLMPMPAGNMNERDHRTEQLPGGYETFNKERHANSGR RSGRDGKPVDFNEATQEYNYKREQTLNDDRRRR ; ;MTSHIATETSVNRWSTEPVVREEGRPPGPEDFPSTKQGREQDGNVIGITPNYKIGEQKPNSELNLGKTGS LPRGSGDYKMTYRQEDYKQTIIDPKVITNANMPYISTRIPDPRRNLAGDFPSEHSKSKIKLDPLEQRRFR SSESRPITTSNYLAESVDRHREMEASRLREYLKAKENEANQPWNKPGWPGPKKNDESLRELETMKQRIET LKRDANKGPVNAELDELSKRAEELRKRDGWSKYKLVESDIYKTDPDPMPANIKDQVRDLLESRNSVETTT TQRDHDKSGYVTDVSTATWNFSTVDYSPRSVVSMNGASHDILKDDKPRSIMKRNDLVRREQMLYPTVDTQ VVKSVVKKPTVTETVQRFEETRRTEEVERRVQRREKKERRSRHHSSSRHHSGWEGHTGGYQGHRSSSLSR GGHGGGGQETYYRQETTRRQQHNNYDDNFNRGIAHARYGSLSDSLRRGELQYVPNGEVRQSFYRDGSNGG QRMHKSYSTRDVFTGDGYDDRRSVSSFRRGSQQQVSPFVEFPPTLPRRGGGGDYRREEDAYFRPVSKSRS YADWDDAGRAGMGREVRRYDDDMSRLEAEFRDSLLMPMPAGNMNERDHRTEQLPGGYETFNKERHANSGR RSGRDGKPVDFNEATQEYNYKREQTLNDDRRRR ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 THR . 1 3 SER . 1 4 HIS . 1 5 ILE . 1 6 ALA . 1 7 THR . 1 8 GLU . 1 9 THR . 1 10 SER . 1 11 VAL . 1 12 ASN . 1 13 ARG . 1 14 TRP . 1 15 SER . 1 16 THR . 1 17 GLU . 1 18 PRO . 1 19 VAL . 1 20 VAL . 1 21 ARG . 1 22 GLU . 1 23 GLU . 1 24 GLY . 1 25 ARG . 1 26 PRO . 1 27 PRO . 1 28 GLY . 1 29 PRO . 1 30 GLU . 1 31 ASP . 1 32 PHE . 1 33 PRO . 1 34 SER . 1 35 THR . 1 36 LYS . 1 37 GLN . 1 38 GLY . 1 39 ARG . 1 40 GLU . 1 41 GLN . 1 42 ASP . 1 43 GLY . 1 44 ASN . 1 45 VAL . 1 46 ILE . 1 47 GLY . 1 48 ILE . 1 49 THR . 1 50 PRO . 1 51 ASN . 1 52 TYR . 1 53 LYS . 1 54 ILE . 1 55 GLY . 1 56 GLU . 1 57 GLN . 1 58 LYS . 1 59 PRO . 1 60 ASN . 1 61 SER . 1 62 GLU . 1 63 LEU . 1 64 ASN . 1 65 LEU . 1 66 GLY . 1 67 LYS . 1 68 THR . 1 69 GLY . 1 70 SER . 1 71 LEU . 1 72 PRO . 1 73 ARG . 1 74 GLY . 1 75 SER . 1 76 GLY . 1 77 ASP . 1 78 TYR . 1 79 LYS . 1 80 MET . 1 81 THR . 1 82 TYR . 1 83 ARG . 1 84 GLN . 1 85 GLU . 1 86 ASP . 1 87 TYR . 1 88 LYS . 1 89 GLN . 1 90 THR . 1 91 ILE . 1 92 ILE . 1 93 ASP . 1 94 PRO . 1 95 LYS . 1 96 VAL . 1 97 ILE . 1 98 THR . 1 99 ASN . 1 100 ALA . 1 101 ASN . 1 102 MET . 1 103 PRO . 1 104 TYR . 1 105 ILE . 1 106 SER . 1 107 THR . 1 108 ARG . 1 109 ILE . 1 110 PRO . 1 111 ASP . 1 112 PRO . 1 113 ARG . 1 114 ARG . 1 115 ASN . 1 116 LEU . 1 117 ALA . 1 118 GLY . 1 119 ASP . 1 120 PHE . 1 121 PRO . 1 122 SER . 1 123 GLU . 1 124 HIS . 1 125 SER . 1 126 LYS . 1 127 SER . 1 128 LYS . 1 129 ILE . 1 130 LYS . 1 131 LEU . 1 132 ASP . 1 133 PRO . 1 134 LEU . 1 135 GLU . 1 136 GLN . 1 137 ARG . 1 138 ARG . 1 139 PHE . 1 140 ARG . 1 141 SER . 1 142 SER . 1 143 GLU . 1 144 SER . 1 145 ARG . 1 146 PRO . 1 147 ILE . 1 148 THR . 1 149 THR . 1 150 SER . 1 151 ASN . 1 152 TYR . 1 153 LEU . 1 154 ALA . 1 155 GLU . 1 156 SER . 1 157 VAL . 1 158 ASP . 1 159 ARG . 1 160 HIS . 1 161 ARG . 1 162 GLU . 1 163 MET . 1 164 GLU . 1 165 ALA . 1 166 SER . 1 167 ARG . 1 168 LEU . 1 169 ARG . 1 170 GLU . 1 171 TYR . 1 172 LEU . 1 173 LYS . 1 174 ALA . 1 175 LYS . 1 176 GLU . 1 177 ASN . 1 178 GLU . 1 179 ALA . 1 180 ASN . 1 181 GLN . 1 182 PRO . 1 183 TRP . 1 184 ASN . 1 185 LYS . 1 186 PRO . 1 187 GLY . 1 188 TRP . 1 189 PRO . 1 190 GLY . 1 191 PRO . 1 192 LYS . 1 193 LYS . 1 194 ASN . 1 195 ASP . 1 196 GLU . 1 197 SER . 1 198 LEU . 1 199 ARG . 1 200 GLU . 1 201 LEU . 1 202 GLU . 1 203 THR . 1 204 MET . 1 205 LYS . 1 206 GLN . 1 207 ARG . 1 208 ILE . 1 209 GLU . 1 210 THR . 1 211 LEU . 1 212 LYS . 1 213 ARG . 1 214 ASP . 1 215 ALA . 1 216 ASN . 1 217 LYS . 1 218 GLY . 1 219 PRO . 1 220 VAL . 1 221 ASN . 1 222 ALA . 1 223 GLU . 1 224 LEU . 1 225 ASP . 1 226 GLU . 1 227 LEU . 1 228 SER . 1 229 LYS . 1 230 ARG . 1 231 ALA . 1 232 GLU . 1 233 GLU . 1 234 LEU . 1 235 ARG . 1 236 LYS . 1 237 ARG . 1 238 ASP . 1 239 GLY . 1 240 TRP . 1 241 SER . 1 242 LYS . 1 243 TYR . 1 244 LYS . 1 245 LEU . 1 246 VAL . 1 247 GLU . 1 248 SER . 1 249 ASP . 1 250 ILE . 1 251 TYR . 1 252 LYS . 1 253 THR . 1 254 ASP . 1 255 PRO . 1 256 ASP . 1 257 PRO . 1 258 MET . 1 259 PRO . 1 260 ALA . 1 261 ASN . 1 262 ILE . 1 263 LYS . 1 264 ASP . 1 265 GLN . 1 266 VAL . 1 267 ARG . 1 268 ASP . 1 269 LEU . 1 270 LEU . 1 271 GLU . 1 272 SER . 1 273 ARG . 1 274 ASN . 1 275 SER . 1 276 VAL . 1 277 GLU 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'peptide design 2L4HC2_24 {PDB ID=5j10, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5j10.1.A}' 'template structure' . 2 'peptide design 2L4HC2_24 {PDB ID=5j10, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5j10.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 5j10, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 5j10, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMGTDTDELLRLAKEQAELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKLKELVEDMERSMK EQLYIIKKQKS ; ;GSHMGTDTDELLRLAKEQAELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKLKELVEDMERSMK EQLYIIKKQKS ; 2 ;GSHMGTDTDELLRLAKEQAELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKLKELVEDMERSMK EQLYIIKKQKS ; ;GSHMGTDTDELLRLAKEQAELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKLKELVEDMERSMK EQLYIIKKQKS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 20 58 2 2 20 58 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5j10 2024-03-06 2 PDB . 5j10 2024-03-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 663 2 2 B 1 663 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 663 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 663 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 210.000 23.077 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 210.000 23.077 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTSHIATETSVNRWSTEPVVREEGRPPGPEDFPSTKQGREQDGNVIGITPNYKIGEQKPNSELNLGKTGSLPRGSGDYKMTYRQEDYKQTIIDPKVITNANMPYISTRIPDPRRNLAGDFPSEHSKSKIKLDPLEQRRFRSSESRPITTSNYLAESVDRHREMEASRLREYLKAKENEANQPWNKPGWPGPKKNDESLRELETMKQRIETLKRDANKGPVNAELDELSKRAEELRKRDGWSKYKLVESDIYKTDPDPMPANIKDQVRDLLESRNSVETTTTQRDHDKSGYVTDVSTATWNFSTVDYSPRSVVSMNGASHDILKDDKPRSIMKRNDLVRREQMLYPTVDTQVVKSVVKKPTVTETVQRFEETRRTEEVERRVQRREKKERRSRHHSSSRHHSGWEGHTGGYQGHRSSSLSRGGHGGGGQETYYRQETTRRQQHNNYDDNFNRGIAHARYGSLSDSLRRGELQYVPNGEVRQSFYRDGSNGGQRMHKSYSTRDVFTGDGYDDRRSVSSFRRGSQQQVSPFVEFPPTLPRRGGGGDYRREEDAYFRPVSKSRSYADWDDAGRAGMGREVRRYDDDMSRLEAEFRDSLLMPMPAGNMNERDHRTEQLPGGYETFNKERHANSGRRSGRDGKPVDFNEATQEYNYKREQTLNDDRRRR 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MTSHIATETSVNRWSTEPVVREEGRPPGPEDFPSTKQGREQDGNVIGITPNYKIGEQKPNSELNLGKTGSLPRGSGDYKMTYRQEDYKQTIIDPKVITNANMPYISTRIPDPRRNLAGDFPSEHSKSKIKLDPLEQRRFRSSESRPITTSNYLAESVDRHREMEASRLREYLKAKENEANQPWNKPGWPGPKKNDESLRELETMKQRIETLKRDANKGPVNAELDELSKRAEELRKRDGWSKYKLVESDIYKTDPDPMPANIKDQVRDLLESRNSVETTTTQRDHDKSGYVTDVSTATWNFSTVDYSPRSVVSMNGASHDILKDDKPRSIMKRNDLVRREQMLYPTVDTQVVKSVVKKPTVTETVQRFEETRRTEEVERRVQRREKKERRSRHHSSSRHHSGWEGHTGGYQGHRSSSLSRGGHGGGGQETYYRQETTRRQQHNNYDDNFNRGIAHARYGSLSDSLRRGELQYVPNGEVRQSFYRDGSNGGQRMHKSYSTRDVFTGDGYDDRRSVSSFRRGSQQQVSPFVEFPPTLPRRGGGGDYRREEDAYFRPVSKSRSYADWDDAGRAGMGREVRRYDDDMSRLEAEFRDSLLMPMPAGNMNERDHRTEQLPGGYETFNKERHANSGRRSGRDGKPVDFNEATQEYNYKREQTLNDDRRRR 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELLKEIKKLVEEIARLVKEIQEDPSDELLKTLAELVRKL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.147}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5j10.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 196 196 ? A 28.664 20.574 84.469 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 2 C CA . GLU 196 196 ? A 29.617 20.584 83.311 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 3 C C . GLU 196 196 ? A 28.919 20.601 81.952 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 4 O O . GLU 196 196 ? A 29.194 21.504 81.181 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 5 C CB . GLU 196 196 ? A 30.657 19.437 83.515 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 6 C CG . GLU 196 196 ? A 30.283 18.006 83.017 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 7 C CD . GLU 196 196 ? A 28.926 17.423 83.430 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 196 196 ? A 28.161 18.126 84.140 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 196 196 ? A 28.590 16.327 82.946 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 10 N N . SER 197 197 ? A 27.917 19.736 81.662 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 11 C CA . SER 197 197 ? A 27.090 19.766 80.449 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 12 C C . SER 197 197 ? A 26.435 21.103 80.216 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 13 O O . SER 197 197 ? A 26.501 21.663 79.136 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 14 C CB . SER 197 197 ? A 25.921 18.746 80.492 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 15 O OG . SER 197 197 ? A 26.464 17.434 80.495 1 1 A SER 0.380 1 ATOM 16 N N . LEU 198 198 ? A 25.825 21.716 81.254 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 17 C CA . LEU 198 198 ? A 25.289 23.068 81.133 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 18 C C . LEU 198 198 ? A 26.299 24.166 80.836 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 19 O O . LEU 198 198 ? A 26.013 25.067 80.065 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 20 C CB . LEU 198 198 ? A 24.381 23.511 82.308 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 21 C CG . LEU 198 198 ? A 22.855 23.416 82.056 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 22 C CD1 . LEU 198 198 ? A 22.133 24.251 83.123 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 23 C CD2 . LEU 198 198 ? A 22.376 23.961 80.698 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 24 N N . ARG 199 199 ? A 27.513 24.106 81.415 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 25 C CA . ARG 199 199 ? A 28.604 24.999 81.073 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 26 C C . ARG 199 199 ? A 29.040 24.867 79.614 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 27 O O . ARG 199 199 ? A 29.268 25.863 78.938 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 28 C CB . ARG 199 199 ? A 29.816 24.699 81.986 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 29 C CG . ARG 199 199 ? A 29.615 25.040 83.476 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 30 C CD . ARG 199 199 ? A 30.845 24.657 84.306 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 31 N NE . ARG 199 199 ? A 30.561 24.999 85.739 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 32 C CZ . ARG 199 199 ? A 31.359 24.651 86.759 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 33 N NH1 . ARG 199 199 ? A 32.440 23.904 86.562 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 34 N NH2 . ARG 199 199 ? A 31.108 25.084 87.992 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 35 N N . GLU 200 200 ? A 29.135 23.628 79.080 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 36 C CA . GLU 200 200 ? A 29.348 23.394 77.666 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 37 C C . GLU 200 200 ? A 28.211 23.924 76.794 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 38 O O . GLU 200 200 ? A 28.444 24.664 75.839 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 39 C CB . GLU 200 200 ? A 29.527 21.884 77.423 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 40 C CG . GLU 200 200 ? A 29.786 21.523 75.942 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 41 C CD . GLU 200 200 ? A 30.088 20.042 75.742 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 200 200 ? A 30.023 19.273 76.733 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 200 200 ? A 30.411 19.689 74.580 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 44 N N . LEU 201 201 ? A 26.938 23.636 77.162 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 45 C CA . LEU 201 201 ? A 25.755 24.125 76.471 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 46 C C . LEU 201 201 ? A 25.684 25.634 76.426 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 47 O O . LEU 201 201 ? A 25.410 26.191 75.368 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 48 C CB . LEU 201 201 ? A 24.431 23.615 77.116 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 49 C CG . LEU 201 201 ? A 24.171 22.102 76.925 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 50 C CD1 . LEU 201 201 ? A 22.963 21.580 77.714 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 51 C CD2 . LEU 201 201 ? A 23.958 21.740 75.455 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 52 N N . GLU 202 202 ? A 25.974 26.325 77.548 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 53 C CA . GLU 202 202 ? A 26.070 27.767 77.654 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 54 C C . GLU 202 202 ? A 27.092 28.317 76.676 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 55 O O . GLU 202 202 ? A 26.781 29.155 75.839 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 56 C CB . GLU 202 202 ? A 26.481 28.136 79.108 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 57 C CG . GLU 202 202 ? A 26.562 29.652 79.393 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 58 C CD . GLU 202 202 ? A 25.214 30.346 79.251 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 59 O OE1 . GLU 202 202 ? A 25.260 31.591 79.078 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 60 O OE2 . GLU 202 202 ? A 24.164 29.657 79.314 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 61 N N . THR 203 203 ? A 28.321 27.749 76.656 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 62 C CA . THR 203 203 ? A 29.371 28.135 75.713 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 63 C C . THR 203 203 ? A 28.924 27.997 74.267 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 64 O O . THR 203 203 ? A 29.119 28.887 73.443 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 65 C CB . THR 203 203 ? A 30.629 27.278 75.847 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 66 O OG1 . THR 203 203 ? A 31.215 27.410 77.124 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 67 C CG2 . THR 203 203 ? A 31.745 27.698 74.884 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 68 N N . MET 204 204 ? A 28.278 26.874 73.901 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 69 C CA . MET 204 204 ? A 27.723 26.671 72.577 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 70 C C . MET 204 204 ? A 26.605 27.618 72.189 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 71 O O . MET 204 204 ? A 26.573 28.083 71.053 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 72 C CB . MET 204 204 ? A 27.221 25.235 72.417 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 73 C CG . MET 204 204 ? A 28.356 24.206 72.477 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 74 S SD . MET 204 204 ? A 27.718 22.522 72.584 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 75 C CE . MET 204 204 ? A 27.077 22.454 70.889 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 76 N N . LYS 205 205 ? A 25.681 27.942 73.112 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 77 C CA . LYS 205 205 ? A 24.646 28.935 72.900 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 78 C C . LYS 205 205 ? A 25.210 30.315 72.620 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 79 O O . LYS 205 205 ? A 24.870 30.910 71.606 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 80 C CB . LYS 205 205 ? A 23.719 28.986 74.122 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 81 C CG . LYS 205 205 ? A 22.888 27.711 74.270 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 82 C CD . LYS 205 205 ? A 22.148 27.754 75.601 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 83 C CE . LYS 205 205 ? A 21.258 26.559 75.841 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 84 N NZ . LYS 205 205 ? A 20.393 26.893 76.963 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 85 N N . GLN 206 206 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.565 2 1 3 0.026 3 1 4 0.147 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 196 GLU 1 0.340 2 1 A 197 SER 1 0.380 3 1 A 198 LEU 1 0.550 4 1 A 199 ARG 1 0.520 5 1 A 200 GLU 1 0.610 6 1 A 201 LEU 1 0.590 7 1 A 202 GLU 1 0.630 8 1 A 203 THR 1 0.660 9 1 A 204 MET 1 0.620 10 1 A 205 LYS 1 0.630 11 1 A 206 GLN 1 0.630 12 1 A 207 ARG 1 0.590 13 1 A 208 ILE 1 0.630 14 1 A 209 GLU 1 0.620 15 1 A 210 THR 1 0.620 16 1 A 211 LEU 1 0.610 17 1 A 212 LYS 1 0.600 18 1 A 213 ARG 1 0.530 19 1 A 214 ASP 1 0.570 20 1 A 215 ALA 1 0.580 21 1 A 216 ASN 1 0.530 22 1 A 217 LYS 1 0.520 23 1 A 218 GLY 1 0.530 24 1 A 219 PRO 1 0.520 25 1 A 220 VAL 1 0.540 26 1 A 221 ASN 1 0.510 27 1 A 222 ALA 1 0.590 28 1 A 223 GLU 1 0.560 29 1 A 224 LEU 1 0.560 30 1 A 225 ASP 1 0.590 31 1 A 226 GLU 1 0.620 32 1 A 227 LEU 1 0.620 33 1 A 228 SER 1 0.640 34 1 A 229 LYS 1 0.610 35 1 A 230 ARG 1 0.580 36 1 A 231 ALA 1 0.650 37 1 A 232 GLU 1 0.590 38 1 A 233 GLU 1 0.480 39 1 A 234 LEU 1 0.450 40 1 B 196 GLU 1 0.300 41 1 B 197 SER 1 0.340 42 1 B 198 LEU 1 0.510 43 1 B 199 ARG 1 0.510 44 1 B 200 GLU 1 0.600 45 1 B 201 LEU 1 0.590 46 1 B 202 GLU 1 0.640 47 1 B 203 THR 1 0.650 48 1 B 204 MET 1 0.620 49 1 B 205 LYS 1 0.630 50 1 B 206 GLN 1 0.630 51 1 B 207 ARG 1 0.580 52 1 B 208 ILE 1 0.620 53 1 B 209 GLU 1 0.620 54 1 B 210 THR 1 0.610 55 1 B 211 LEU 1 0.610 56 1 B 212 LYS 1 0.600 57 1 B 213 ARG 1 0.530 58 1 B 214 ASP 1 0.560 59 1 B 215 ALA 1 0.580 60 1 B 216 ASN 1 0.530 61 1 B 217 LYS 1 0.520 62 1 B 218 GLY 1 0.520 63 1 B 219 PRO 1 0.520 64 1 B 220 VAL 1 0.530 65 1 B 221 ASN 1 0.500 66 1 B 222 ALA 1 0.580 67 1 B 223 GLU 1 0.550 68 1 B 224 LEU 1 0.560 69 1 B 225 ASP 1 0.590 70 1 B 226 GLU 1 0.620 71 1 B 227 LEU 1 0.610 72 1 B 228 SER 1 0.630 73 1 B 229 LYS 1 0.610 74 1 B 230 ARG 1 0.570 75 1 B 231 ALA 1 0.650 76 1 B 232 GLU 1 0.600 77 1 B 233 GLU 1 0.440 78 1 B 234 LEU 1 0.430 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #