data_SMR-5e05fb1a16ce34ec75c2d7159cdf89c6_3 _entry.id SMR-5e05fb1a16ce34ec75c2d7159cdf89c6_3 _struct.entry_id SMR-5e05fb1a16ce34ec75c2d7159cdf89c6_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P42226/ STAT6_HUMAN, Signal transducer and activator of transcription 6 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P42226' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 86636.312 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP STAT6_HUMAN P42226 1 ;MEQALAMLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGA AGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRAD MVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKC AVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCET LNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDL TKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSA KDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMP TMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSL PFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTK LLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW ; 'Signal transducer and activator of transcription 6' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 673 1 673 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . STAT6_HUMAN P42226 P42226-2 1 673 9606 'Homo sapiens (Human)' 1995-11-01 7A050ADF43A669BB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEQALAMLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGA AGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRAD MVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKC AVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCET LNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDL TKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSA KDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMP TMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSL PFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTK LLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW ; ;MEQALAMLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGA AGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRAD MVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKC AVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCET LNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDL TKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSA KDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMP TMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSL PFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTK LLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 GLN . 1 4 ALA . 1 5 LEU . 1 6 ALA . 1 7 MET . 1 8 LEU . 1 9 LEU . 1 10 GLN . 1 11 GLU . 1 12 THR . 1 13 THR . 1 14 GLY . 1 15 GLU . 1 16 LEU . 1 17 GLU . 1 18 ALA . 1 19 ALA . 1 20 LYS . 1 21 ALA . 1 22 LEU . 1 23 VAL . 1 24 LEU . 1 25 LYS . 1 26 ARG . 1 27 ILE . 1 28 GLN . 1 29 ILE . 1 30 TRP . 1 31 LYS . 1 32 ARG . 1 33 GLN . 1 34 GLN . 1 35 GLN . 1 36 LEU . 1 37 ALA . 1 38 GLY . 1 39 ASN . 1 40 GLY . 1 41 ALA . 1 42 PRO . 1 43 PHE . 1 44 GLU . 1 45 GLU . 1 46 SER . 1 47 LEU . 1 48 ALA . 1 49 PRO . 1 50 LEU . 1 51 GLN . 1 52 GLU . 1 53 ARG . 1 54 CYS . 1 55 GLU . 1 56 SER . 1 57 LEU . 1 58 VAL . 1 59 ASP . 1 60 ILE . 1 61 TYR . 1 62 SER . 1 63 GLN . 1 64 LEU . 1 65 GLN . 1 66 GLN . 1 67 GLU . 1 68 VAL . 1 69 GLY . 1 70 ALA . 1 71 ALA . 1 72 GLY . 1 73 GLY . 1 74 GLU . 1 75 LEU . 1 76 GLU . 1 77 PRO . 1 78 LYS . 1 79 THR . 1 80 ARG . 1 81 ALA . 1 82 SER . 1 83 LEU . 1 84 THR . 1 85 GLY . 1 86 ARG . 1 87 LEU . 1 88 ASP . 1 89 GLU . 1 90 VAL . 1 91 LEU . 1 92 ARG . 1 93 THR . 1 94 LEU . 1 95 VAL . 1 96 THR . 1 97 SER . 1 98 CYS . 1 99 PHE . 1 100 LEU . 1 101 VAL . 1 102 GLU . 1 103 LYS . 1 104 GLN . 1 105 PRO . 1 106 PRO . 1 107 GLN . 1 108 VAL . 1 109 LEU . 1 110 LYS . 1 111 THR . 1 112 GLN . 1 113 THR . 1 114 LYS . 1 115 PHE . 1 116 GLN . 1 117 ALA . 1 118 GLY . 1 119 VAL . 1 120 ARG . 1 121 PHE . 1 122 LEU . 1 123 LEU . 1 124 GLY . 1 125 LEU . 1 126 ARG . 1 127 PHE . 1 128 LEU . 1 129 GLY . 1 130 ALA . 1 131 PRO . 1 132 ALA . 1 133 LYS . 1 134 PRO . 1 135 PRO . 1 136 LEU . 1 137 VAL . 1 138 ARG . 1 139 ALA . 1 140 ASP . 1 141 MET . 1 142 VAL . 1 143 THR . 1 144 GLU . 1 145 LYS . 1 146 GLN . 1 147 ALA . 1 148 ARG . 1 149 GLU . 1 150 LEU . 1 151 SER . 1 152 VAL . 1 153 PRO . 1 154 GLN . 1 155 GLY . 1 156 PRO . 1 157 GLY . 1 158 ALA . 1 159 GLY . 1 160 ALA . 1 161 GLU . 1 162 SER . 1 163 THR . 1 164 GLY . 1 165 GLU . 1 166 ILE . 1 167 ILE . 1 168 ASN . 1 169 ASN . 1 170 THR . 1 171 VAL . 1 172 PRO . 1 173 LEU . 1 174 GLU . 1 175 ASN . 1 176 SER . 1 177 ILE . 1 178 PRO . 1 179 GLY . 1 180 ASN . 1 181 CYS . 1 182 CYS . 1 183 SER . 1 184 ALA . 1 185 LEU . 1 186 PHE . 1 187 LYS . 1 188 ASN . 1 189 LEU . 1 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A 1 616 ILE 616 616 ILE ILE B . A 1 617 PHE 617 617 PHE PHE B . A 1 618 PRO 618 618 PRO PRO B . A 1 619 PRO 619 619 PRO PRO B . A 1 620 LEU 620 620 LEU LEU B . A 1 621 LEU 621 621 LEU LEU B . A 1 622 PRO 622 622 PRO PRO B . A 1 623 PRO 623 623 PRO PRO B . A 1 624 THR 624 624 THR THR B . A 1 625 GLU 625 625 GLU GLU B . A 1 626 GLN 626 626 GLN GLN B . A 1 627 ASP 627 627 ASP ASP B . A 1 628 LEU 628 628 LEU LEU B . A 1 629 THR 629 629 THR THR B . A 1 630 LYS 630 630 LYS LYS B . A 1 631 LEU 631 631 LEU LEU B . A 1 632 LEU 632 632 LEU LEU B . A 1 633 LEU 633 633 LEU LEU B . A 1 634 GLU 634 634 GLU GLU B . A 1 635 GLY 635 635 GLY GLY B . A 1 636 GLN 636 636 GLN GLN B . A 1 637 GLY 637 637 GLY GLY B . A 1 638 GLU 638 638 GLU GLU B . A 1 639 SER 639 639 SER SER B . A 1 640 GLY 640 640 GLY GLY B . A 1 641 GLY 641 ? ? ? B . A 1 642 GLY 642 ? ? ? B . A 1 643 SER 643 ? ? ? B . A 1 644 LEU 644 ? ? ? B . A 1 645 GLY 645 ? ? ? B . A 1 646 ALA 646 ? ? ? B . A 1 647 GLN 647 ? ? ? B . A 1 648 PRO 648 ? ? ? B . A 1 649 LEU 649 ? ? ? B . A 1 650 LEU 650 ? ? ? B . A 1 651 GLN 651 ? ? ? B . A 1 652 PRO 652 ? ? ? B . A 1 653 SER 653 ? ? ? B . A 1 654 HIS 654 ? ? ? B . A 1 655 TYR 655 ? ? ? B . A 1 656 GLY 656 ? ? ? B . A 1 657 GLN 657 ? ? ? B . A 1 658 SER 658 ? ? ? B . A 1 659 GLY 659 ? ? ? B . A 1 660 ILE 660 ? ? ? B . A 1 661 SER 661 ? ? ? B . A 1 662 MET 662 ? ? ? B . A 1 663 SER 663 ? ? ? B . A 1 664 HIS 664 ? ? ? B . A 1 665 MET 665 ? ? ? B . A 1 666 ASP 666 ? ? ? B . A 1 667 LEU 667 ? ? ? B . A 1 668 ARG 668 ? ? ? B . A 1 669 ALA 669 ? ? ? B . A 1 670 ASN 670 ? ? ? B . A 1 671 PRO 671 ? ? ? B . A 1 672 SER 672 ? ? ? B . A 1 673 TRP 673 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Signal transducer and activator of transcription 6 {PDB ID=5nwm, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5nwm.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5nwm, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 32 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5nwm 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 673 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 673 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.9e-11 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEQALAMLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG--------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5nwm.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 609 609 ? A -19.667 -21.756 -4.288 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 2 C CA . GLY 609 609 ? A -20.106 -20.528 -3.533 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 3 C C . GLY 609 609 ? A -18.978 -19.528 -3.445 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 4 O O . GLY 609 609 ? A -17.865 -19.826 -3.868 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 5 N N . THR 610 610 ? A -19.225 -18.320 -2.914 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 6 C CA . THR 610 610 ? A -18.219 -17.274 -2.806 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 7 C C . THR 610 610 ? A -18.222 -16.859 -1.357 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 8 O O . THR 610 610 ? A -19.291 -16.606 -0.796 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 9 C CB . THR 610 610 ? A -18.466 -16.081 -3.755 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 10 O OG1 . THR 610 610 ? A -17.647 -14.949 -3.484 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 11 C CG2 . THR 610 610 ? A -19.917 -15.587 -3.761 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 12 N N . TRP 611 611 ? A -17.050 -16.844 -0.687 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 13 C CA . TRP 611 611 ? A -16.944 -16.378 0.687 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 14 C C . TRP 611 611 ? A -16.960 -14.859 0.706 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 15 O O . TRP 611 611 ? A -17.894 -14.219 1.180 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 16 C CB . TRP 611 611 ? A -15.647 -16.918 1.347 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 17 C CG . TRP 611 611 ? A -15.438 -18.386 1.119 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 18 C CD1 . TRP 611 611 ? A -14.532 -19.022 0.319 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 19 C CD2 . TRP 611 611 ? A -16.239 -19.441 1.700 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 20 N NE1 . TRP 611 611 ? A -14.710 -20.390 0.346 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 21 C CE2 . TRP 611 611 ? A -15.762 -20.641 1.209 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 22 C CE3 . TRP 611 611 ? A -17.293 -19.368 2.608 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 23 C CZ2 . TRP 611 611 ? A -16.322 -21.864 1.599 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 24 C CZ3 . TRP 611 611 ? A -17.870 -20.589 2.997 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 25 C CH2 . TRP 611 611 ? A -17.389 -21.806 2.512 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 26 N N . ILE 612 612 ? A -15.957 -14.247 0.050 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 27 C CA . ILE 612 612 ? A -15.721 -12.812 -0.095 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 28 C C . ILE 612 612 ? A -16.914 -11.983 -0.566 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 29 O O . ILE 612 612 ? A -16.977 -10.770 -0.311 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 30 C CB . ILE 612 612 ? A -14.565 -12.516 -1.042 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 31 C CG1 . ILE 612 612 ? A -14.700 -13.287 -2.372 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 32 C CG2 . ILE 612 612 ? A -13.200 -12.718 -0.357 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 33 C CD1 . ILE 612 612 ? A -14.506 -12.349 -3.564 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 34 N N . GLY 613 613 ? A -17.917 -12.605 -1.205 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 35 C CA . GLY 613 613 ? A -19.235 -12.046 -1.508 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 36 C C . GLY 613 613 ? A -19.993 -11.495 -0.318 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 37 O O . GLY 613 613 ? A -20.744 -10.532 -0.467 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 38 N N . GLU 614 614 ? A -19.789 -12.077 0.879 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 39 C CA . GLU 614 614 ? A -20.334 -11.531 2.123 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 40 C C . GLU 614 614 ? A -19.498 -11.849 3.392 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 41 O O . GLU 614 614 ? A -19.753 -11.296 4.476 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 42 C CB . GLU 614 614 ? A -21.831 -11.930 2.277 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 43 C CG . GLU 614 614 ? A -22.808 -10.732 2.079 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 44 C CD . GLU 614 614 ? A -23.879 -10.609 3.167 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 45 O OE1 . GLU 614 614 ? A -23.500 -10.282 4.322 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 46 O OE2 . GLU 614 614 ? A -25.080 -10.802 2.846 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 47 N N . ASP 615 615 ? A -18.393 -12.619 3.325 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 48 C CA . ASP 615 615 ? A -17.557 -13.041 4.462 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 49 C C . ASP 615 615 ? A -16.502 -11.989 4.822 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 50 O O . ASP 615 615 ? A -15.806 -12.076 5.841 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 51 C CB . ASP 615 615 ? A -16.850 -14.367 4.052 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 52 C CG . ASP 615 615 ? A -16.335 -15.271 5.177 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 53 O OD1 . ASP 615 615 ? A -16.681 -15.046 6.362 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 54 O OD2 . ASP 615 615 ? A -15.600 -16.228 4.803 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 55 N N . ILE 616 616 ? A -16.386 -10.891 4.044 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 56 C CA . ILE 616 616 ? A -15.461 -9.798 4.375 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 57 C C . ILE 616 616 ? A -16.184 -8.774 5.230 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 58 O O . ILE 616 616 ? A -15.608 -7.790 5.702 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 59 C CB . ILE 616 616 ? A -14.874 -9.060 3.174 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 60 C CG1 . ILE 616 616 ? A -14.614 -10.004 1.989 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 61 C CG2 . ILE 616 616 ? A -13.554 -8.370 3.604 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 62 C CD1 . ILE 616 616 ? A -14.042 -9.239 0.791 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 63 N N . PHE 617 617 ? A -17.491 -9.025 5.454 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 64 C CA . PHE 617 617 ? A -18.390 -8.221 6.252 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 65 C C . PHE 617 617 ? A -18.811 -6.959 5.475 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 66 O O . PHE 617 617 ? A -17.938 -6.167 5.118 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 67 C CB . PHE 617 617 ? A -17.814 -7.922 7.685 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 68 C CG . PHE 617 617 ? A -17.891 -9.102 8.634 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 69 C CD1 . PHE 617 617 ? A -17.217 -10.311 8.361 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 70 C CD2 . PHE 617 617 ? A -18.592 -9.000 9.852 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 71 C CE1 . PHE 617 617 ? A -17.333 -11.414 9.215 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 72 C CE2 . PHE 617 617 ? A -18.665 -10.089 10.732 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 73 C CZ . PHE 617 617 ? A -18.058 -11.302 10.402 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 74 N N . PRO 618 618 ? A -20.089 -6.651 5.180 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 75 C CA . PRO 618 618 ? A -20.459 -5.299 4.757 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 76 C C . PRO 618 618 ? A -20.090 -4.151 5.739 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 77 O O . PRO 618 618 ? A -19.891 -3.081 5.172 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 78 C CB . PRO 618 618 ? A -21.949 -5.395 4.388 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 79 C CG . PRO 618 618 ? A -22.465 -6.473 5.340 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 80 C CD . PRO 618 618 ? A -21.289 -7.454 5.493 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 81 N N . PRO 619 619 ? A -19.960 -4.158 7.092 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 82 C CA . PRO 619 619 ? A -19.591 -2.944 7.836 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 83 C C . PRO 619 619 ? A -18.140 -2.524 7.655 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 84 O O . PRO 619 619 ? A -17.861 -1.335 7.764 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 85 C CB . PRO 619 619 ? A -19.880 -3.289 9.306 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 86 C CG . PRO 619 619 ? A -19.710 -4.803 9.364 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 87 C CD . PRO 619 619 ? A -20.346 -5.236 8.022 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 88 N N . LEU 620 620 ? A -17.220 -3.481 7.441 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 89 C CA . LEU 620 620 ? A -15.792 -3.243 7.285 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 90 C C . LEU 620 620 ? A -15.097 -2.480 8.429 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 91 O O . LEU 620 620 ? A -14.743 -1.301 8.334 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 92 C CB . LEU 620 620 ? A -15.496 -2.688 5.878 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 93 C CG . LEU 620 620 ? A -14.029 -2.806 5.436 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 620 620 ? A -13.963 -3.427 4.034 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 620 620 ? A -13.317 -1.448 5.483 1 1 B LEU 0.460 1 ATOM 96 N N . LEU 621 621 ? A -14.884 -3.117 9.596 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 97 C CA . LEU 621 621 ? A -14.391 -2.399 10.760 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 98 C C . LEU 621 621 ? 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A -8.268 -2.423 13.655 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 113 C C . PRO 623 623 ? A -8.223 -1.297 14.677 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 114 O O . PRO 623 623 ? A -8.665 -0.174 14.408 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 115 C CB . PRO 623 623 ? A -6.843 -2.804 13.225 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 116 C CG . PRO 623 623 ? A -6.578 -1.908 12.019 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 117 C CD . PRO 623 623 ? A -7.925 -1.856 11.321 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 118 N N . THR 624 624 ? A -7.671 -1.575 15.870 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 119 C CA . THR 624 624 ? A -7.458 -0.573 16.914 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 120 C C . THR 624 624 ? A -6.135 0.157 16.725 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 121 O O . THR 624 624 ? A -6.080 1.335 16.411 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 122 C CB . THR 624 624 ? A -7.520 -1.167 18.322 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 123 O OG1 . THR 624 624 ? A -7.182 -2.566 18.321 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 124 C CG2 . THR 624 624 ? A -8.971 -1.042 18.800 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 125 N N . GLU 625 625 ? A -5.027 -0.593 16.826 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 126 C CA . GLU 625 625 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #