data_SMR-7918eea381b84a79e0ec8b260602b807_5 _entry.id SMR-7918eea381b84a79e0ec8b260602b807_5 _struct.entry_id SMR-7918eea381b84a79e0ec8b260602b807_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P10244/ MYBB_HUMAN, Myb-related protein B Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P10244' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 88133.021 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MYBB_HUMAN P10244 1 ;MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEENRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKV IELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKML PGRTDNAVKNHWNSTIKRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPT IKEEENSEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLLIPAV GSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQPSALVPSVTEYRLD GHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVALSPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKST PVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDN TPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPHLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRK SLALDIVDEDVKLMMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFT TPAPMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS ; 'Myb-related protein B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 676 1 676 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MYBB_HUMAN P10244 P10244-2 1 676 9606 'Homo sapiens (Human)' 1989-07-01 322D482BEFD9A724 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEENRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKV IELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKML PGRTDNAVKNHWNSTIKRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPT IKEEENSEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLLIPAV GSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQPSALVPSVTEYRLD GHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVALSPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKST PVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDN TPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPHLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRK SLALDIVDEDVKLMMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFT 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1 16 GLN . 1 17 ASP . 1 18 THR . 1 19 ASP . 1 20 SER . 1 21 ASP . 1 22 VAL . 1 23 PRO . 1 24 GLU . 1 25 GLN . 1 26 ARG . 1 27 ASP . 1 28 SER . 1 29 LYS . 1 30 CYS . 1 31 LYS . 1 32 VAL . 1 33 LYS . 1 34 TRP . 1 35 THR . 1 36 HIS . 1 37 GLU . 1 38 GLU . 1 39 ASN . 1 40 ARG . 1 41 THR . 1 42 ASP . 1 43 GLN . 1 44 GLN . 1 45 CYS . 1 46 GLN . 1 47 TYR . 1 48 ARG . 1 49 TRP . 1 50 LEU . 1 51 ARG . 1 52 VAL . 1 53 LEU . 1 54 ASN . 1 55 PRO . 1 56 ASP . 1 57 LEU . 1 58 VAL . 1 59 LYS . 1 60 GLY . 1 61 PRO . 1 62 TRP . 1 63 THR . 1 64 LYS . 1 65 GLU . 1 66 GLU . 1 67 ASP . 1 68 GLN . 1 69 LYS . 1 70 VAL . 1 71 ILE . 1 72 GLU . 1 73 LEU . 1 74 VAL . 1 75 LYS . 1 76 LYS . 1 77 TYR . 1 78 GLY . 1 79 THR . 1 80 LYS . 1 81 GLN . 1 82 TRP . 1 83 THR . 1 84 LEU . 1 85 ILE . 1 86 ALA . 1 87 LYS . 1 88 HIS . 1 89 LEU . 1 90 LYS . 1 91 GLY . 1 92 ARG . 1 93 LEU . 1 94 GLY . 1 95 LYS . 1 96 GLN . 1 97 CYS . 1 98 ARG . 1 99 GLU . 1 100 ARG . 1 101 TRP . 1 102 HIS . 1 103 ASN . 1 104 HIS . 1 105 LEU . 1 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A 1 618 LYS 618 ? ? ? B . A 1 619 ALA 619 ? ? ? B . A 1 620 ALA 620 ? ? ? B . A 1 621 VAL 621 ? ? ? B . A 1 622 ALA 622 ? ? ? B . A 1 623 GLN 623 ? ? ? B . A 1 624 LYS 624 ? ? ? B . A 1 625 PRO 625 ? ? ? B . A 1 626 ARG 626 ? ? ? B . A 1 627 SER 627 ? ? ? B . A 1 628 HIS 628 ? ? ? B . A 1 629 PHE 629 ? ? ? B . A 1 630 THR 630 ? ? ? B . A 1 631 THR 631 ? ? ? B . A 1 632 PRO 632 ? ? ? B . A 1 633 ALA 633 ? ? ? B . A 1 634 PRO 634 ? ? ? B . A 1 635 MET 635 ? ? ? B . A 1 636 SER 636 ? ? ? B . A 1 637 SER 637 637 SER SER B . A 1 638 ALA 638 638 ALA ALA B . A 1 639 TRP 639 639 TRP TRP B . A 1 640 LYS 640 640 LYS LYS B . A 1 641 THR 641 641 THR THR B . A 1 642 VAL 642 642 VAL VAL B . A 1 643 ALA 643 643 ALA ALA B . A 1 644 CYS 644 644 CYS CYS B . A 1 645 GLY 645 645 GLY GLY B . A 1 646 GLY 646 646 GLY GLY B . A 1 647 THR 647 647 THR THR B . A 1 648 ARG 648 648 ARG ARG B . A 1 649 ASP 649 649 ASP ASP B . A 1 650 GLN 650 650 GLN GLN B . A 1 651 LEU 651 651 LEU LEU B . A 1 652 PHE 652 652 PHE PHE B . A 1 653 MET 653 653 MET MET B . A 1 654 GLN 654 654 GLN GLN B . A 1 655 GLU 655 655 GLU GLU B . A 1 656 LYS 656 656 LYS LYS B . A 1 657 ALA 657 657 ALA ALA B . A 1 658 ARG 658 658 ARG ARG B . A 1 659 GLN 659 659 GLN GLN B . A 1 660 LEU 660 660 LEU LEU B . A 1 661 LEU 661 661 LEU LEU B . A 1 662 GLY 662 662 GLY GLY B . A 1 663 ARG 663 663 ARG ARG B . A 1 664 LEU 664 664 LEU LEU B . A 1 665 LYS 665 ? ? ? B . A 1 666 PRO 666 ? ? ? B . A 1 667 SER 667 ? ? ? B . A 1 668 HIS 668 ? ? ? B . A 1 669 THR 669 ? ? ? B . A 1 670 SER 670 ? ? ? B . A 1 671 ARG 671 ? ? ? B . A 1 672 THR 672 ? ? ? B . A 1 673 LEU 673 ? ? ? B . A 1 674 ILE 674 ? ? ? B . A 1 675 LEU 675 ? ? ? B . A 1 676 SER 676 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Myb-related protein B {PDB ID=6c48, label_asym_id=D, auth_asym_id=C, SMTL ID=6c48.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 6c48, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 APMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRL APMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 32 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6c48 2019-12-04 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 676 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 676 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 7.61e-14 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEENRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHWNSTIKRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPTIKEEENSEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLLIPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQPSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVALSPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPHLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKLMMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPAPMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------APMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRL------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6c48.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 637 637 ? A 16.422 17.928 36.094 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 2 C CA . SER 637 637 ? A 16.261 16.560 35.447 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 3 C C . SER 637 637 ? A 16.399 16.621 33.948 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 4 O O . SER 637 637 ? A 17.415 16.188 33.423 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 5 C CB . SER 637 637 ? A 14.952 15.884 35.937 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 6 O OG . SER 637 637 ? A 14.903 16.013 37.362 1 1 B SER 0.470 1 ATOM 7 N N . ALA 638 638 ? A 15.459 17.279 33.233 1 1 B ALA 0.530 1 ATOM 8 C CA . ALA 638 638 ? A 15.581 17.517 31.808 1 1 B ALA 0.530 1 ATOM 9 C C . ALA 638 638 ? A 16.237 18.866 31.508 1 1 B ALA 0.530 1 ATOM 10 O O . ALA 638 638 ? A 16.498 19.205 30.352 1 1 B ALA 0.530 1 ATOM 11 C CB . ALA 638 638 ? A 14.171 17.502 31.194 1 1 B ALA 0.530 1 ATOM 12 N N . TRP 639 639 ? A 16.617 19.663 32.529 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 13 C CA . TRP 639 639 ? A 17.456 20.847 32.373 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 14 C C . TRP 639 639 ? A 18.828 20.465 31.806 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 15 O O . TRP 639 639 ? A 19.434 21.175 31.004 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 16 C CB . TRP 639 639 ? A 17.534 21.608 33.737 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 17 C CG . TRP 639 639 ? A 18.442 22.837 33.771 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 18 C CD1 . TRP 639 639 ? A 18.145 24.144 33.497 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 19 C CD2 . TRP 639 639 ? A 19.860 22.788 34.015 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 20 N NE1 . TRP 639 639 ? A 19.288 24.912 33.551 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 21 C CE2 . TRP 639 639 ? A 20.357 24.100 33.855 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 22 C CE3 . TRP 639 639 ? A 20.717 21.733 34.310 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 23 C CZ2 . TRP 639 639 ? A 21.713 24.366 33.989 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 24 C CZ3 . TRP 639 639 ? A 22.090 21.995 34.414 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 25 C CH2 . TRP 639 639 ? A 22.582 23.299 34.268 1 1 B TRP 0.500 1 ATOM 26 N N . LYS 640 640 ? A 19.324 19.269 32.177 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 27 C CA . LYS 640 640 ? A 20.601 18.754 31.737 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 28 C C . LYS 640 640 ? A 20.590 18.285 30.304 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 29 O O . LYS 640 640 ? A 21.641 18.234 29.670 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 30 C CB . LYS 640 640 ? A 21.036 17.556 32.604 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 31 C CG . LYS 640 640 ? A 20.997 17.890 34.098 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 32 C CD . LYS 640 640 ? A 21.747 16.860 34.959 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 33 C CE . LYS 640 640 ? A 22.729 17.473 35.971 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 34 N NZ . LYS 640 640 ? A 22.050 18.479 36.818 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 35 N N . THR 641 641 ? A 19.403 17.970 29.743 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 36 C CA . THR 641 641 ? A 19.227 17.653 28.326 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 37 C C . THR 641 641 ? A 19.605 18.824 27.474 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 38 O O . THR 641 641 ? A 20.328 18.683 26.485 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 39 C CB . THR 641 641 ? A 17.771 17.319 27.980 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 40 O OG1 . THR 641 641 ? A 17.450 16.031 28.468 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 41 C CG2 . THR 641 641 ? A 17.406 17.358 26.479 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 42 N N . VAL 642 642 ? A 19.145 20.028 27.850 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 43 C CA . VAL 642 642 ? A 19.546 21.259 27.197 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 44 C C . VAL 642 642 ? A 20.990 21.628 27.481 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 45 O O . VAL 642 642 ? A 21.763 21.877 26.554 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 46 C CB . VAL 642 642 ? A 18.645 22.399 27.654 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 47 C CG1 . VAL 642 642 ? A 19.181 23.787 27.224 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 48 C CG2 . VAL 642 642 ? A 17.244 22.151 27.058 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 49 N N . ALA 643 643 ? A 21.401 21.639 28.769 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 50 C CA . ALA 643 643 ? A 22.712 22.093 29.206 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 51 C C . ALA 643 643 ? A 23.880 21.280 28.658 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 52 O O . ALA 643 643 ? A 24.955 21.821 28.376 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 53 C CB . ALA 643 643 ? A 22.775 22.141 30.752 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 54 N N . CYS 644 644 ? A 23.696 19.961 28.493 1 1 B CYS 0.630 1 ATOM 55 C CA . CYS 644 644 ? A 24.715 19.030 28.051 1 1 B CYS 0.630 1 ATOM 56 C C . CYS 644 644 ? A 24.438 18.488 26.651 1 1 B CYS 0.630 1 ATOM 57 O O . CYS 644 644 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #