data_SMR-ea4db4316f086e74bcfaf6fdfb66559b_5 _entry.id SMR-ea4db4316f086e74bcfaf6fdfb66559b_5 _struct.entry_id SMR-ea4db4316f086e74bcfaf6fdfb66559b_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P10243/ MYBA_HUMAN, Myb-related protein A Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P10243' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 91510.313 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MYBA_HUMAN P10243 1 ;MAKRSRSEDEDDDLQYADHDYEVPQQKGLKKLWNRVKWTRDEDDKLKKLVEQHGTDDWTLIASHLQNRSD FQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSLIAKHLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKS SWTEEEDRIIYEAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNSIKNHWNSTMRRKVEQEGYLQDGIKSERSSSKLQHK PCAAMDHMQTQNQFYIPVQIPGYQYVSPEGNCIEHVQPTSAFIQQPFIDEDPDKEKKIKELEMLLMSAEN EVRRKRIPSQPGSFSSWSGSFLMDDNMSNTLNSLDEHTSEFYSMDENQPVSAQQNSPTKFLAVEANAVLS SLQTIPEFAETLELIESDPVAWSDVTSFDISDAAASPIKSTPVKLMRIQHNEGAMECQFNVSLVLEGKKN TCNGGNSEAVPLTSPNIAKFSTPPAILRKKRKMRVGHSPGSELRDGSLNDGGNMALKHTPLKTLPFSPSQ FFNTCPGNEQLNIENPSFTSTPICGQKALITTPLHKETTPKDQKENVGFRTPTIRRSILGTTPRTPTPFK NALAAQEKKYGPLKIVSQPLAFLEEDIREVLKEETGTDLFLKEEDEPAYKSCKQENTASGKKVRKSLVLD NWEKEESGTQLLTEDISDMQSNCEWETVVYGKTEDQLIMTEQARRYLSTYTATSSTSRALIL ; 'Myb-related protein A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 692 1 692 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MYBA_HUMAN P10243 P10243-2 1 692 9606 'Homo sapiens (Human)' 1995-11-01 6925E52F9A3FC52D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MAKRSRSEDEDDDLQYADHDYEVPQQKGLKKLWNRVKWTRDEDDKLKKLVEQHGTDDWTLIASHLQNRSD FQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSLIAKHLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKS SWTEEEDRIIYEAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNSIKNHWNSTMRRKVEQEGYLQDGIKSERSSSKLQHK PCAAMDHMQTQNQFYIPVQIPGYQYVSPEGNCIEHVQPTSAFIQQPFIDEDPDKEKKIKELEMLLMSAEN EVRRKRIPSQPGSFSSWSGSFLMDDNMSNTLNSLDEHTSEFYSMDENQPVSAQQNSPTKFLAVEANAVLS SLQTIPEFAETLELIESDPVAWSDVTSFDISDAAASPIKSTPVKLMRIQHNEGAMECQFNVSLVLEGKKN TCNGGNSEAVPLTSPNIAKFSTPPAILRKKRKMRVGHSPGSELRDGSLNDGGNMALKHTPLKTLPFSPSQ FFNTCPGNEQLNIENPSFTSTPICGQKALITTPLHKETTPKDQKENVGFRTPTIRRSILGTTPRTPTPFK NALAAQEKKYGPLKIVSQPLAFLEEDIREVLKEETGTDLFLKEEDEPAYKSCKQENTASGKKVRKSLVLD 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13 ASP . 1 14 LEU . 1 15 GLN . 1 16 TYR . 1 17 ALA . 1 18 ASP . 1 19 HIS . 1 20 ASP . 1 21 TYR . 1 22 GLU . 1 23 VAL . 1 24 PRO . 1 25 GLN . 1 26 GLN . 1 27 LYS . 1 28 GLY . 1 29 LEU . 1 30 LYS . 1 31 LYS . 1 32 LEU . 1 33 TRP . 1 34 ASN . 1 35 ARG . 1 36 VAL . 1 37 LYS . 1 38 TRP . 1 39 THR . 1 40 ARG . 1 41 ASP . 1 42 GLU . 1 43 ASP . 1 44 ASP . 1 45 LYS . 1 46 LEU . 1 47 LYS . 1 48 LYS . 1 49 LEU . 1 50 VAL . 1 51 GLU . 1 52 GLN . 1 53 HIS . 1 54 GLY . 1 55 THR . 1 56 ASP . 1 57 ASP . 1 58 TRP . 1 59 THR . 1 60 LEU . 1 61 ILE . 1 62 ALA . 1 63 SER . 1 64 HIS . 1 65 LEU . 1 66 GLN . 1 67 ASN . 1 68 ARG . 1 69 SER . 1 70 ASP . 1 71 PHE . 1 72 GLN . 1 73 CYS . 1 74 GLN . 1 75 HIS . 1 76 ARG . 1 77 TRP . 1 78 GLN . 1 79 LYS . 1 80 VAL . 1 81 LEU . 1 82 ASN . 1 83 PRO . 1 84 GLU . 1 85 LEU . 1 86 ILE . 1 87 LYS . 1 88 GLY . 1 89 PRO . 1 90 TRP . 1 91 THR . 1 92 LYS . 1 93 GLU . 1 94 GLU . 1 95 ASP . 1 96 GLN . 1 97 ARG . 1 98 VAL . 1 99 ILE . 1 100 GLU . 1 101 LEU . 1 102 VAL . 1 103 GLN 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A 1 611 SER 611 ? ? ? B . A 1 612 CYS 612 ? ? ? B . A 1 613 LYS 613 ? ? ? B . A 1 614 GLN 614 ? ? ? B . A 1 615 GLU 615 ? ? ? B . A 1 616 ASN 616 ? ? ? B . A 1 617 THR 617 ? ? ? B . A 1 618 ALA 618 ? ? ? B . A 1 619 SER 619 ? ? ? B . A 1 620 GLY 620 ? ? ? B . A 1 621 LYS 621 ? ? ? B . A 1 622 LYS 622 ? ? ? B . A 1 623 VAL 623 ? ? ? B . A 1 624 ARG 624 ? ? ? B . A 1 625 LYS 625 ? ? ? B . A 1 626 SER 626 ? ? ? B . A 1 627 LEU 627 ? ? ? B . A 1 628 VAL 628 ? ? ? B . A 1 629 LEU 629 ? ? ? B . A 1 630 ASP 630 ? ? ? B . A 1 631 ASN 631 ? ? ? B . A 1 632 TRP 632 ? ? ? B . A 1 633 GLU 633 ? ? ? B . A 1 634 LYS 634 ? ? ? B . A 1 635 GLU 635 ? ? ? B . A 1 636 GLU 636 ? ? ? B . A 1 637 SER 637 ? ? ? B . A 1 638 GLY 638 ? ? ? B . A 1 639 THR 639 ? ? ? B . A 1 640 GLN 640 ? ? ? B . A 1 641 LEU 641 ? ? ? B . A 1 642 LEU 642 ? ? ? B . A 1 643 THR 643 ? ? ? B . A 1 644 GLU 644 ? ? ? B . A 1 645 ASP 645 ? ? ? B . A 1 646 ILE 646 ? ? ? B . A 1 647 SER 647 ? ? ? B . A 1 648 ASP 648 ? ? ? B . A 1 649 MET 649 ? ? ? B . A 1 650 GLN 650 ? ? ? B . A 1 651 SER 651 ? ? ? B . A 1 652 ASN 652 ? ? ? B . A 1 653 CYS 653 ? ? ? B . A 1 654 GLU 654 ? ? ? B . A 1 655 TRP 655 ? ? ? B . A 1 656 GLU 656 ? ? ? B . A 1 657 THR 657 ? ? ? B . A 1 658 VAL 658 ? ? ? B . A 1 659 VAL 659 ? ? ? B . A 1 660 TYR 660 ? ? ? B . A 1 661 GLY 661 ? ? ? B . A 1 662 LYS 662 ? ? ? B . A 1 663 THR 663 ? ? ? B . A 1 664 GLU 664 ? ? ? B . A 1 665 ASP 665 ? ? ? B . A 1 666 GLN 666 ? ? ? B . A 1 667 LEU 667 ? ? ? B . A 1 668 ILE 668 ? ? ? B . A 1 669 MET 669 ? ? ? B . A 1 670 THR 670 ? ? ? B . A 1 671 GLU 671 ? ? ? B . A 1 672 GLN 672 ? ? ? B . A 1 673 ALA 673 ? ? ? B . A 1 674 ARG 674 ? ? ? B . A 1 675 ARG 675 ? ? ? B . A 1 676 TYR 676 ? ? ? B . A 1 677 LEU 677 ? ? ? B . A 1 678 SER 678 ? ? ? B . A 1 679 THR 679 ? ? ? B . A 1 680 TYR 680 ? ? ? B . A 1 681 THR 681 ? ? ? B . A 1 682 ALA 682 ? ? ? B . A 1 683 THR 683 ? ? ? B . A 1 684 SER 684 ? ? ? B . A 1 685 SER 685 ? ? ? B . A 1 686 THR 686 ? ? ? B . A 1 687 SER 687 ? ? ? B . A 1 688 ARG 688 ? ? ? B . A 1 689 ALA 689 ? ? ? B . A 1 690 LEU 690 ? ? ? B . A 1 691 ILE 691 ? ? ? B . A 1 692 LEU 692 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MLL/c-Myb chimera {PDB ID=5svh, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5svh.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5svh, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSSDDGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESKEKRIKELELLLMSTENELKGQQAL GSSDDGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESKEKRIKELELLLMSTENELKGQQAL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 22 57 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5svh 2023-10-04 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 692 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 692 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.6e-07 44.444 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAKRSRSEDEDDDLQYADHDYEVPQQKGLKKLWNRVKWTRDEDDKLKKLVEQHGTDDWTLIASHLQNRSDFQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSLIAKHLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKSSWTEEEDRIIYEAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNSIKNHWNSTMRRKVEQEGYLQDGIKSERSSSKLQHKPCAAMDHMQTQNQFYIPVQIPGYQYVSPEGNCIEHVQPTSAFIQQPFIDEDPDKEKKIKELEMLLMSAENEVRRKRIPSQPGSFSSWSGSFLMDDNMSNTLNSLDEHTSEFYSMDENQPVSAQQNSPTKFLAVEANAVLSSLQTIPEFAETLELIESDPVAWSDVTSFDISDAAASPIKSTPVKLMRIQHNEGAMECQFNVSLVLEGKKNTCNGGNSEAVPLTSPNIAKFSTPPAILRKKRKMRVGHSPGSELRDGSLNDGGNMALKHTPLKTLPFSPSQFFNTCPGNEQLNIENPSFTSTPICGQKALITTPLHKETTPKDQKENVGFRTPTIRRSILGTTPRTPTPFKNALAAQEKKYGPLKIVSQPLAFLEEDIREVLKEETGTDLFLKEEDEPAYKSCKQENTASGKKVRKSLVLDNWEKEESGTQLLTEDISDMQSNCEWETVVYGKTEDQLIMTEQARRYLSTYTATSSTSRALIL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSMQALGESPESKEKRIKELELLLMSTENELKGQQA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5svh.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PHE 252 252 ? A -14.046 -59.672 -5.671 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 2 C CA . PHE 252 252 ? A -13.676 -58.259 -5.289 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 3 C C . PHE 252 252 ? A -14.929 -57.449 -5.033 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 4 O O . PHE 252 252 ? A -15.904 -57.652 -5.752 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 5 C CB . PHE 252 252 ? A -12.880 -57.566 -6.429 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 6 C CG . PHE 252 252 ? A -11.522 -58.173 -6.581 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 7 C CD1 . PHE 252 252 ? A -10.511 -57.857 -5.662 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 8 C CD2 . PHE 252 252 ? A -11.240 -59.062 -7.629 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 9 C CE1 . PHE 252 252 ? A -9.238 -58.422 -5.785 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 10 C CE2 . PHE 252 252 ? A -9.967 -59.631 -7.751 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 11 C CZ . PHE 252 252 ? A -8.965 -59.308 -6.830 1 1 B PHE 0.730 1 ATOM 12 N N . ILE 253 253 ? A -14.951 -56.537 -4.038 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 13 C CA . ILE 253 253 ? A -16.111 -55.726 -3.661 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 14 C C . ILE 253 253 ? A -16.647 -54.790 -4.747 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 15 O O . ILE 253 253 ? A -17.844 -54.523 -4.811 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 16 C CB . ILE 253 253 ? A -15.831 -54.911 -2.392 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 17 C CG1 . ILE 253 253 ? A -14.692 -53.872 -2.569 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 18 C CG2 . ILE 253 253 ? A -15.585 -55.871 -1.206 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 19 C CD1 . ILE 253 253 ? A -14.565 -52.864 -1.421 1 1 B ILE 0.800 1 ATOM 20 N N . GLN 254 254 ? A -15.768 -54.268 -5.626 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 21 C CA . GLN 254 254 ? A -16.090 -53.297 -6.661 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 22 C C . GLN 254 254 ? A -16.646 -53.946 -7.921 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 23 O O . GLN 254 254 ? A -17.114 -53.267 -8.841 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 24 C CB . GLN 254 254 ? A -14.812 -52.509 -7.075 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 25 C CG . GLN 254 254 ? A -14.126 -51.673 -5.970 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 26 C CD . GLN 254 254 ? A -15.107 -50.602 -5.463 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 27 O OE1 . GLN 254 254 ? A -15.712 -49.888 -6.196 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 28 N NE2 . GLN 254 254 ? A -15.217 -50.531 -4.097 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 29 N N . GLN 255 255 ? A -16.604 -55.283 -8.025 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 30 C CA . GLN 255 255 ? A -17.121 -55.983 -9.177 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 31 C C . GLN 255 255 ? A -18.642 -56.114 -9.022 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 32 O O . GLN 255 255 ? A -19.079 -56.511 -7.947 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 33 C CB . GLN 255 255 ? A -16.496 -57.397 -9.287 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 34 C CG . GLN 255 255 ? A -16.900 -58.173 -10.562 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 35 C CD . GLN 255 255 ? A -16.625 -59.679 -10.472 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 36 O OE1 . GLN 255 255 ? A -17.498 -60.507 -10.503 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 37 N NE2 . GLN 255 255 ? A -15.311 -60.036 -10.382 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 38 N N . PRO 256 256 ? A -19.486 -55.812 -10.005 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 39 C CA . PRO 256 256 ? A -20.899 -56.137 -9.938 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 40 C C . PRO 256 256 ? A -21.151 -57.632 -10.048 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 41 O O . PRO 256 256 ? A -20.481 -58.314 -10.822 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 42 C CB . PRO 256 256 ? A -21.506 -55.372 -11.126 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 43 C CG . PRO 256 256 ? A -20.372 -55.260 -12.154 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 44 C CD . PRO 256 256 ? A -19.084 -55.374 -11.336 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 45 N N . PHE 257 257 ? A -22.126 -58.156 -9.283 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 46 C CA . PHE 257 257 ? A -22.434 -59.574 -9.259 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 47 C C . PHE 257 257 ? A -23.647 -59.883 -10.120 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 48 O O . PHE 257 257 ? A -23.867 -61.035 -10.533 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 49 C CB . PHE 257 257 ? A -22.753 -59.977 -7.796 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 50 C CG . PHE 257 257 ? A -21.544 -59.789 -6.921 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 51 C CD1 . PHE 257 257 ? A -20.464 -60.674 -7.034 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 52 C CD2 . PHE 257 257 ? A -21.460 -58.736 -5.994 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 53 C CE1 . PHE 257 257 ? A -19.332 -60.532 -6.223 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 54 C CE2 . PHE 257 257 ? A -20.325 -58.584 -5.187 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 55 C CZ . PHE 257 257 ? A -19.264 -59.489 -5.294 1 1 B PHE 0.530 1 ATOM 56 N N . ILE 258 258 ? A -24.466 -58.873 -10.431 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 57 C CA . ILE 258 258 ? A -25.699 -58.997 -11.177 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 58 C C . ILE 258 258 ? A -26.075 -57.587 -11.623 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 59 O O . ILE 258 258 ? A -25.461 -56.625 -11.181 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 60 C CB . ILE 258 258 ? A -26.800 -59.702 -10.366 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 61 C CG1 . ILE 258 258 ? A -27.998 -60.185 -11.229 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 62 C CG2 . ILE 258 258 ? A -27.199 -58.854 -9.136 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 63 C CD1 . ILE 258 258 ? A -28.879 -61.236 -10.540 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 64 N N . ASP 259 259 ? A -27.071 -57.471 -12.535 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 65 C CA . ASP 259 259 ? A -27.715 -56.255 -12.982 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 66 C C . ASP 259 259 ? A -29.177 -56.326 -12.543 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 67 O O . ASP 259 259 ? A -30.098 -56.480 -13.352 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 68 C CB . ASP 259 259 ? A -27.585 -56.167 -14.526 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 69 C CG . ASP 259 259 ? A -27.753 -54.754 -15.075 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 70 O OD1 . ASP 259 259 ? A -28.080 -54.643 -16.284 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 71 O OD2 . ASP 259 259 ? A -27.450 -53.788 -14.327 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 72 N N . GLU 260 260 ? A -29.450 -56.285 -11.227 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 73 C CA . GLU 260 260 ? A -30.766 -55.979 -10.703 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 74 C C . GLU 260 260 ? A -30.937 -54.491 -10.824 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 75 O O . GLU 260 260 ? A -29.892 -53.838 -10.842 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 76 C CB . GLU 260 260 ? A -30.915 -56.429 -9.238 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 77 C CG . GLU 260 260 ? A -30.854 -57.969 -9.119 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 78 C CD . GLU 260 260 ? A -30.978 -58.513 -7.696 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 79 O OE1 . GLU 260 260 ? A -31.006 -57.710 -6.731 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 80 O OE2 . GLU 260 260 ? A -31.028 -59.766 -7.581 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 81 N N . ASP 261 261 ? 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PRO 262 262 ? A -30.250 -51.016 -9.763 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 96 N N . ASP 263 263 ? A -31.909 -47.151 -8.947 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 97 C CA . ASP 263 263 ? A -31.552 -45.865 -9.509 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 98 C C . ASP 263 263 ? A -30.058 -45.596 -9.576 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 99 O O . ASP 263 263 ? A -29.251 -46.127 -8.805 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 100 C CB . ASP 263 263 ? A -32.213 -44.690 -8.754 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 101 C CG . ASP 263 263 ? A -33.725 -44.753 -8.877 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 102 O OD1 . ASP 263 263 ? A -34.225 -45.432 -9.805 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 103 O OD2 . ASP 263 263 ? A -34.382 -44.112 -8.023 1 1 B ASP 0.700 1 ATOM 104 N N . LYS 264 264 ? A -29.662 -44.688 -10.492 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 105 C CA . LYS 264 264 ? A -28.302 -44.199 -10.618 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 106 C C . LYS 264 264 ? A -27.750 -43.656 -9.302 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 107 O O . LYS 264 264 ? A -26.637 -43.994 -8.898 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 108 C CB . LYS 264 264 ? A -28.262 -43.078 -11.687 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 109 C CG . LYS 264 264 ? A -26.929 -42.318 -11.750 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 110 C CD . LYS 264 264 ? A -26.862 -41.300 -12.893 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 111 C CE . LYS 264 264 ? A -25.639 -40.392 -12.769 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 112 N NZ . LYS 264 264 ? A -25.650 -39.400 -13.861 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 113 N N . GLU 265 265 ? A -28.557 -42.856 -8.582 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 114 C CA . GLU 265 265 ? A -28.220 -42.282 -7.293 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 115 C C . GLU 265 265 ? A -28.001 -43.313 -6.207 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 116 O O . GLU 265 265 ? A -27.058 -43.215 -5.406 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 117 C CB . GLU 265 265 ? A -29.304 -41.253 -6.876 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 118 C CG . GLU 265 265 ? A -29.386 -40.025 -7.820 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 119 C CD . GLU 265 265 ? A -27.998 -39.451 -8.104 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 120 O OE1 . GLU 265 265 ? A -27.656 -39.323 -9.310 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 121 O OE2 . GLU 265 265 ? A -27.259 -39.194 -7.119 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 122 N N . LYS 266 266 ? A -28.825 -44.369 -6.153 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 123 C CA . LYS 266 266 ? A -28.652 -45.462 -5.217 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 124 C C . LYS 266 266 ? A -27.374 -46.248 -5.467 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 125 O O . LYS 266 266 ? A -26.639 -46.570 -4.523 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 126 C CB . LYS 266 266 ? A -29.884 -46.388 -5.253 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 127 C CG . LYS 266 266 ? A -29.825 -47.534 -4.230 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 128 C CD . LYS 266 266 ? A -31.131 -48.340 -4.227 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 129 C CE . LYS 266 266 ? A -31.028 -49.732 -3.598 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 130 N NZ . LYS 266 266 ? A -31.010 -49.638 -2.122 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 131 N N . LYS 267 267 ? A -27.056 -46.535 -6.739 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 132 C CA . LYS 267 267 ? A -25.805 -47.158 -7.140 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 133 C C . LYS 267 267 ? A -24.589 -46.302 -6.831 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 134 O O . LYS 267 267 ? A -23.559 -46.815 -6.357 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 135 C CB . LYS 267 267 ? A -25.824 -47.490 -8.648 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 136 C CG . LYS 267 267 ? A -24.576 -48.261 -9.104 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 137 C CD . LYS 267 267 ? A -24.644 -48.678 -10.578 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 138 C CE . LYS 267 267 ? A -23.399 -49.442 -11.031 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 139 N NZ . LYS 267 267 ? A -23.544 -49.836 -12.450 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 140 N N . ILE 268 268 ? A -24.636 -44.980 -7.050 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 141 C CA . ILE 268 268 ? A -23.562 -44.071 -6.654 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 142 C C . ILE 268 268 ? A -23.341 -44.097 -5.152 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 143 O O . ILE 268 268 ? A -22.207 -44.259 -4.693 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 144 C CB . ILE 268 268 ? A -23.788 -42.649 -7.168 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 145 C CG1 . ILE 268 268 ? A -23.594 -42.644 -8.702 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 146 C CG2 . ILE 268 268 ? A -22.843 -41.628 -6.486 1 1 B ILE 0.750 1 ATOM 147 C CD1 . ILE 268 268 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #