data_SMR-6917c7c7aede82bf1e27b0df8273f096_1 _entry.id SMR-6917c7c7aede82bf1e27b0df8273f096_1 _struct.entry_id SMR-6917c7c7aede82bf1e27b0df8273f096_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O94850/ DEND_HUMAN, Dendrin Estimated model accuracy of this model is 0.002, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O94850' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 88906.518 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DEND_HUMAN O94850 1 ;MLDGPLFSEGPDSPRELQDEESGSCLWVQKSKLLVIEVKTISCHYSRRAPSRQPMDFQASHWARGFQNRT CGPRPGSPQPPPRRPWASRVLQEATNWRAGPLAEVRAREQEKRKAASQEREAKETERKRRKAGGARRSPP GRPRPEPRNAPRVAQLAGLPAPLRPERLAPVGRAPRPSAQPQSDPGSAWAGPWGGRRPGPPSYEAHLLLR GSAGTAPRRRWDRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGPGNSQVPTSSAPAATPARTDGGRTKKRLDPRIYRD VLGAWGLRQGQGLLGGSPGCGAARARPEPGKGVVEKSLGLAAADLNSGSDSHPQAKATGSAGTEIAPAGS ATAAPCAPHPAPRSRHHLKGSREGKEGEQIWFPKCWIPSPKKQPPRHSQTLPRPWAPGGTGWRESLGLGE GAGPETLEGWKATRRAHTLPRSSQGLSRGEGVFVIDATCVVIRSQYVPTPRTQQVQLLPSGVTRVVGDSP SQSKPGKEEGEGATVFPSPCQKRLSSSRLLHQPGGGRGGEAEGGRPGDSTLEERTFRILGLPAPEVNLRD APTQPGSPEHQALGPAASGAQGRAEGSEVAVVQRRAGRGWARTPGPYAGALREAVSRIRRHTAPDSDTDE AEELSVHSGSSDGSDTEAPGASWRNERTLPEVGNSSPEEDGKTAELSDSVGEILDVISQTEEVLFGVRDI RGTQQGNRKRQ ; Dendrin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 711 1 711 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DEND_HUMAN O94850 . 1 711 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-02-10 D55B3CBE792519D4 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MLDGPLFSEGPDSPRELQDEESGSCLWVQKSKLLVIEVKTISCHYSRRAPSRQPMDFQASHWARGFQNRT CGPRPGSPQPPPRRPWASRVLQEATNWRAGPLAEVRAREQEKRKAASQEREAKETERKRRKAGGARRSPP GRPRPEPRNAPRVAQLAGLPAPLRPERLAPVGRAPRPSAQPQSDPGSAWAGPWGGRRPGPPSYEAHLLLR GSAGTAPRRRWDRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGPGNSQVPTSSAPAATPARTDGGRTKKRLDPRIYRD VLGAWGLRQGQGLLGGSPGCGAARARPEPGKGVVEKSLGLAAADLNSGSDSHPQAKATGSAGTEIAPAGS ATAAPCAPHPAPRSRHHLKGSREGKEGEQIWFPKCWIPSPKKQPPRHSQTLPRPWAPGGTGWRESLGLGE GAGPETLEGWKATRRAHTLPRSSQGLSRGEGVFVIDATCVVIRSQYVPTPRTQQVQLLPSGVTRVVGDSP SQSKPGKEEGEGATVFPSPCQKRLSSSRLLHQPGGGRGGEAEGGRPGDSTLEERTFRILGLPAPEVNLRD APTQPGSPEHQALGPAASGAQGRAEGSEVAVVQRRAGRGWARTPGPYAGALREAVSRIRRHTAPDSDTDE 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GLU . 1 10 GLY . 1 11 PRO . 1 12 ASP . 1 13 SER . 1 14 PRO . 1 15 ARG . 1 16 GLU . 1 17 LEU . 1 18 GLN . 1 19 ASP . 1 20 GLU . 1 21 GLU . 1 22 SER . 1 23 GLY . 1 24 SER . 1 25 CYS . 1 26 LEU . 1 27 TRP . 1 28 VAL . 1 29 GLN . 1 30 LYS . 1 31 SER . 1 32 LYS . 1 33 LEU . 1 34 LEU . 1 35 VAL . 1 36 ILE . 1 37 GLU . 1 38 VAL . 1 39 LYS . 1 40 THR . 1 41 ILE . 1 42 SER . 1 43 CYS . 1 44 HIS . 1 45 TYR . 1 46 SER . 1 47 ARG . 1 48 ARG . 1 49 ALA . 1 50 PRO . 1 51 SER . 1 52 ARG . 1 53 GLN . 1 54 PRO . 1 55 MET . 1 56 ASP . 1 57 PHE . 1 58 GLN . 1 59 ALA . 1 60 SER . 1 61 HIS . 1 62 TRP . 1 63 ALA . 1 64 ARG . 1 65 GLY . 1 66 PHE . 1 67 GLN . 1 68 ASN . 1 69 ARG . 1 70 THR . 1 71 CYS . 1 72 GLY . 1 73 PRO . 1 74 ARG . 1 75 PRO . 1 76 GLY . 1 77 SER . 1 78 PRO . 1 79 GLN . 1 80 PRO . 1 81 PRO . 1 82 PRO . 1 83 ARG . 1 84 ARG . 1 85 PRO . 1 86 TRP . 1 87 ALA . 1 88 SER . 1 89 ARG . 1 90 VAL . 1 91 LEU . 1 92 GLN . 1 93 GLU . 1 94 ALA . 1 95 THR . 1 96 ASN . 1 97 TRP . 1 98 ARG . 1 99 ALA . 1 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A 1 614 ALA 614 ? ? ? B . A 1 615 VAL 615 ? ? ? B . A 1 616 SER 616 ? ? ? B . A 1 617 ARG 617 ? ? ? B . A 1 618 ILE 618 ? ? ? B . A 1 619 ARG 619 ? ? ? B . A 1 620 ARG 620 ? ? ? B . A 1 621 HIS 621 ? ? ? B . A 1 622 THR 622 ? ? ? B . A 1 623 ALA 623 ? ? ? B . A 1 624 PRO 624 ? ? ? B . A 1 625 ASP 625 ? ? ? B . A 1 626 SER 626 ? ? ? B . A 1 627 ASP 627 ? ? ? B . A 1 628 THR 628 ? ? ? B . A 1 629 ASP 629 ? ? ? B . A 1 630 GLU 630 ? ? ? B . A 1 631 ALA 631 ? ? ? B . A 1 632 GLU 632 ? ? ? B . A 1 633 GLU 633 ? ? ? B . A 1 634 LEU 634 ? ? ? B . A 1 635 SER 635 ? ? ? B . A 1 636 VAL 636 ? ? ? B . A 1 637 HIS 637 ? ? ? B . A 1 638 SER 638 ? ? ? B . A 1 639 GLY 639 ? ? ? B . A 1 640 SER 640 ? ? ? B . A 1 641 SER 641 ? ? ? B . A 1 642 ASP 642 ? ? ? B . A 1 643 GLY 643 ? ? ? B . A 1 644 SER 644 ? ? ? B . A 1 645 ASP 645 ? ? ? B . A 1 646 THR 646 ? ? ? B . A 1 647 GLU 647 ? ? ? B . A 1 648 ALA 648 ? ? ? B . A 1 649 PRO 649 ? ? ? B . A 1 650 GLY 650 ? ? ? B . A 1 651 ALA 651 ? ? ? B . A 1 652 SER 652 ? ? ? B . A 1 653 TRP 653 ? ? ? B . A 1 654 ARG 654 ? ? ? B . A 1 655 ASN 655 ? ? ? B . A 1 656 GLU 656 ? ? ? B . A 1 657 ARG 657 ? ? ? B . A 1 658 THR 658 ? ? ? B . A 1 659 LEU 659 ? ? ? B . A 1 660 PRO 660 ? ? ? B . A 1 661 GLU 661 ? ? ? B . A 1 662 VAL 662 ? ? ? B . A 1 663 GLY 663 ? ? ? B . A 1 664 ASN 664 ? ? ? B . A 1 665 SER 665 ? ? ? B . A 1 666 SER 666 ? ? ? B . A 1 667 PRO 667 ? ? ? B . A 1 668 GLU 668 ? ? ? B . A 1 669 GLU 669 ? ? ? B . A 1 670 ASP 670 ? ? ? B . A 1 671 GLY 671 ? ? ? B . A 1 672 LYS 672 ? ? ? B . A 1 673 THR 673 ? ? ? B . A 1 674 ALA 674 ? ? ? B . A 1 675 GLU 675 ? ? ? B . A 1 676 LEU 676 ? ? ? B . A 1 677 SER 677 ? ? ? B . A 1 678 ASP 678 ? ? ? B . A 1 679 SER 679 ? ? ? B . A 1 680 VAL 680 ? ? ? B . A 1 681 GLY 681 ? ? ? B . A 1 682 GLU 682 ? ? ? B . A 1 683 ILE 683 ? ? ? B . A 1 684 LEU 684 ? ? ? B . A 1 685 ASP 685 ? ? ? B . A 1 686 VAL 686 ? ? ? B . A 1 687 ILE 687 ? ? ? B . A 1 688 SER 688 ? ? ? B . A 1 689 GLN 689 ? ? ? B . A 1 690 THR 690 ? ? ? B . A 1 691 GLU 691 ? ? ? B . A 1 692 GLU 692 ? ? ? B . A 1 693 VAL 693 ? ? ? B . A 1 694 LEU 694 ? ? ? B . A 1 695 PHE 695 ? ? ? B . A 1 696 GLY 696 ? ? ? B . A 1 697 VAL 697 ? ? ? B . A 1 698 ARG 698 ? ? ? B . A 1 699 ASP 699 ? ? ? B . A 1 700 ILE 700 ? ? ? B . A 1 701 ARG 701 ? ? ? B . A 1 702 GLY 702 ? ? ? B . A 1 703 THR 703 ? ? ? B . A 1 704 GLN 704 ? ? ? B . A 1 705 GLN 705 ? ? ? B . A 1 706 GLY 706 ? ? ? B . A 1 707 ASN 707 ? ? ? B . A 1 708 ARG 708 ? ? ? B . A 1 709 LYS 709 ? ? ? B . A 1 710 ARG 710 ? ? ? B . A 1 711 GLN 711 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Peptide from Dendrin {PDB ID=6j69, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=6j69.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6j69, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 DRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGP DRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGP # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 25 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6j69 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 711 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 711 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 8.6e-13 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLDGPLFSEGPDSPRELQDEESGSCLWVQKSKLLVIEVKTISCHYSRRAPSRQPMDFQASHWARGFQNRTCGPRPGSPQPPPRRPWASRVLQEATNWRAGPLAEVRAREQEKRKAASQEREAKETERKRRKAGGARRSPPGRPRPEPRNAPRVAQLAGLPAPLRPERLAPVGRAPRPSAQPQSDPGSAWAGPWGGRRPGPPSYEAHLLLRGSAGTAPRRRWDRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGPGNSQVPTSSAPAATPARTDGGRTKKRLDPRIYRDVLGAWGLRQGQGLLGGSPGCGAARARPEPGKGVVEKSLGLAAADLNSGSDSHPQAKATGSAGTEIAPAGSATAAPCAPHPAPRSRHHLKGSREGKEGEQIWFPKCWIPSPKKQPPRHSQTLPRPWAPGGTGWRESLGLGEGAGPETLEGWKATRRAHTLPRSSQGLSRGEGVFVIDATCVVIRSQYVPTPRTQQVQLLPSGVTRVVGDSPSQSKPGKEEGEGATVFPSPCQKRLSSSRLLHQPGGGRGGEAEGGRPGDSTLEERTFRILGLPAPEVNLRDAPTQPGSPEHQALGPAASGAQGRAEGSEVAVVQRRAGRGWARTPGPYAGALREAVSRIRRHTAPDSDTDEAEELSVHSGSSDGSDTEAPGASWRNERTLPEVGNSSPEEDGKTAELSDSVGEILDVISQTEEVLFGVRDIRGTQQGNRKRQ 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DRPPPYVAPPSYEGPHRTLGTKRGP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6j69.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 222 222 ? A 15.512 59.726 19.684 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 2 C CA . ASP 222 222 ? A 16.913 59.306 19.353 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 3 C C . ASP 222 222 ? A 17.886 60.435 19.668 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 4 O O . ASP 222 222 ? A 17.642 61.188 20.608 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 5 C CB . ASP 222 222 ? A 16.922 58.779 17.885 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 6 C CG . ASP 222 222 ? A 16.416 59.823 16.902 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 222 222 ? A 16.352 59.516 15.701 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 222 222 ? A 15.991 60.895 17.401 1 1 B ASP 0.400 1 ATOM 9 N N . ARG 223 223 ? A 18.989 60.582 18.917 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 10 C CA . ARG 223 223 ? A 19.887 61.706 19.021 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 11 C C . ARG 223 223 ? A 19.805 62.490 17.716 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 12 O O . ARG 223 223 ? A 19.969 61.872 16.665 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 13 C CB . ARG 223 223 ? A 21.334 61.204 19.204 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 14 C CG . ARG 223 223 ? A 22.368 62.335 19.325 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 15 C CD . ARG 223 223 ? A 23.751 61.788 19.631 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 16 N NE . ARG 223 223 ? A 24.663 62.968 19.742 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 17 C CZ . ARG 223 223 ? A 25.972 62.848 19.994 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 18 N NH1 . ARG 223 223 ? A 26.518 61.648 20.166 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 19 N NH2 . ARG 223 223 ? A 26.746 63.925 20.072 1 1 B ARG 0.400 1 ATOM 20 N N . PRO 224 224 ? A 19.566 63.803 17.698 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 21 C CA . PRO 224 224 ? A 19.493 64.574 16.468 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 22 C C . PRO 224 224 ? A 20.883 64.717 15.837 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 23 O O . PRO 224 224 ? A 21.859 64.676 16.595 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 24 C CB . PRO 224 224 ? A 18.928 65.927 16.950 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 25 C CG . PRO 224 224 ? A 19.486 66.097 18.368 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 26 C CD . PRO 224 224 ? A 19.579 64.659 18.883 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 27 N N . PRO 225 225 ? A 21.056 64.848 14.519 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 28 C CA . PRO 225 225 ? A 22.314 65.256 13.894 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 29 C C . PRO 225 225 ? A 22.966 66.477 14.549 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 30 O O . PRO 225 225 ? A 22.220 67.396 14.894 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 31 C CB . PRO 225 225 ? A 21.960 65.498 12.410 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 32 C CG . PRO 225 225 ? A 20.670 64.697 12.198 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 33 C CD . PRO 225 225 ? A 19.968 64.798 13.552 1 1 B PRO 0.820 1 ATOM 34 N N . PRO 226 226 ? A 24.278 66.553 14.772 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 35 C CA . PRO 226 226 ? A 24.913 67.732 15.342 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 36 C C . PRO 226 226 ? A 24.799 68.940 14.431 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 37 O O . PRO 226 226 ? A 24.609 68.798 13.225 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 38 C CB . PRO 226 226 ? A 26.375 67.287 15.530 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 39 C CG . PRO 226 226 ? A 26.613 66.313 14.370 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 40 C CD . PRO 226 226 ? A 25.254 65.623 14.211 1 1 B PRO 0.810 1 ATOM 41 N N . TYR 227 227 ? A 24.894 70.151 15.009 1 1 B TYR 0.760 1 ATOM 42 C CA . TYR 227 227 ? A 24.838 71.394 14.274 1 1 B TYR 0.760 1 ATOM 43 C C . TYR 227 227 ? 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A 30.227 77.637 -4.027 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 128 C CA . ARG 238 238 ? A 29.544 77.283 -5.260 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 129 C C . ARG 238 238 ? A 28.342 78.189 -5.445 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 130 O O . ARG 238 238 ? A 27.380 78.113 -4.690 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 131 C CB . ARG 238 238 ? A 29.068 75.810 -5.221 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 132 C CG . ARG 238 238 ? A 28.411 75.315 -6.528 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 133 C CD . ARG 238 238 ? A 28.033 73.836 -6.437 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 134 N NE . ARG 238 238 ? A 27.416 73.432 -7.743 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 135 C CZ . ARG 238 238 ? A 26.930 72.204 -7.978 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 136 N NH1 . ARG 238 238 ? A 26.978 71.260 -7.043 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 137 N NH2 . ARG 238 238 ? A 26.384 71.909 -9.154 1 1 B ARG 0.330 1 ATOM 138 N N . THR 239 239 ? A 28.418 79.078 -6.448 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 139 C CA . THR 239 239 ? A 27.418 80.075 -6.756 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 140 C C . THR 239 239 ? A 26.875 79.861 -8.185 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 141 O O . THR 239 239 ? A 27.330 78.911 -8.883 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 142 C CB . THR 239 239 ? A 27.955 81.502 -6.594 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 143 O OG1 . THR 239 239 ? A 29.108 81.793 -7.372 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 144 C CG2 . THR 239 239 ? A 28.430 81.703 -5.149 1 1 B THR 0.340 1 ATOM 145 O OXT . THR 239 239 ? A 25.959 80.638 -8.571 1 1 B THR 0.340 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.658 2 1 3 0.002 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 222 ASP 1 0.400 2 1 A 223 ARG 1 0.400 3 1 A 224 PRO 1 0.810 4 1 A 225 PRO 1 0.820 5 1 A 226 PRO 1 0.810 6 1 A 227 TYR 1 0.760 7 1 A 228 VAL 1 0.770 8 1 A 229 ALA 1 0.820 9 1 A 230 PRO 1 0.820 10 1 A 231 PRO 1 0.700 11 1 A 232 SER 1 0.690 12 1 A 233 TYR 1 0.660 13 1 A 234 GLU 1 0.780 14 1 A 235 GLY 1 0.660 15 1 A 236 PRO 1 0.680 16 1 A 237 HIS 1 0.600 17 1 A 238 ARG 1 0.330 18 1 A 239 THR 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #