data_SMR-7c192a39d1a1d4b80f23ec7dbf021955_4 _entry.id SMR-7c192a39d1a1d4b80f23ec7dbf021955_4 _struct.entry_id SMR-7c192a39d1a1d4b80f23ec7dbf021955_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y4W2/ LAS1L_HUMAN, Ribosomal biogenesis protein LAS1L Estimated model accuracy of this model is 0.266, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y4W2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 94227.537 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LAS1L_HUMAN Q9Y4W2 1 ;MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYAL NRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKC LAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEED QEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQ FTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEENV DLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYILRWTVELIVANTKTGRNA RRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQGLPDEEQEKLLRICSIY TQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGSVNDVKEEEKEEKEVLPD QVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKRGALQGSAWQVSSEDVRW DTFPLGRMPGQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLEQRLEPSTCKTDTLGLSCGVGSGNCSNSSSSNFEGL LWSQGQLHGLKTGLQLF ; 'Ribosomal biogenesis protein LAS1L' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 717 1 717 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LAS1L_HUMAN Q9Y4W2 Q9Y4W2-2 1 717 9606 'Homo sapiens (Human)' 2005-08-30 651B7F0FFB3FD07F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYAL NRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKC LAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEED QEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQ FTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEENV DLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYILRWTVELIVANTKTGRNA RRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQGLPDEEQEKLLRICSIY TQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGSVNDVKEEEKEEKEVLPD QVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKRGALQGSAWQVSSEDVRW 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8 GLY . 1 9 PRO . 1 10 GLY . 1 11 LEU . 1 12 GLY . 1 13 SER . 1 14 GLN . 1 15 GLY . 1 16 MET . 1 17 ASP . 1 18 LEU . 1 19 VAL . 1 20 TRP . 1 21 SER . 1 22 ALA . 1 23 TRP . 1 24 TYR . 1 25 GLY . 1 26 LYS . 1 27 CYS . 1 28 VAL . 1 29 LYS . 1 30 GLY . 1 31 LYS . 1 32 GLY . 1 33 SER . 1 34 LEU . 1 35 PRO . 1 36 LEU . 1 37 SER . 1 38 ALA . 1 39 HIS . 1 40 GLY . 1 41 ILE . 1 42 VAL . 1 43 VAL . 1 44 ALA . 1 45 TRP . 1 46 LEU . 1 47 SER . 1 48 ARG . 1 49 ALA . 1 50 GLU . 1 51 TRP . 1 52 ASP . 1 53 GLN . 1 54 VAL . 1 55 THR . 1 56 VAL . 1 57 TYR . 1 58 LEU . 1 59 PHE . 1 60 CYS . 1 61 ASP . 1 62 ASP . 1 63 HIS . 1 64 LYS . 1 65 LEU . 1 66 GLN . 1 67 ARG . 1 68 TYR . 1 69 ALA . 1 70 LEU . 1 71 ASN . 1 72 ARG . 1 73 ILE . 1 74 THR . 1 75 VAL . 1 76 TRP . 1 77 ARG . 1 78 SER . 1 79 ARG . 1 80 SER . 1 81 GLY . 1 82 ASN . 1 83 GLU . 1 84 LEU . 1 85 PRO . 1 86 LEU . 1 87 ALA . 1 88 VAL . 1 89 ALA . 1 90 SER . 1 91 THR . 1 92 ALA . 1 93 ASP . 1 94 LEU . 1 95 ILE . 1 96 ARG . 1 97 CYS . 1 98 LYS . 1 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A 1 618 GLY 618 ? ? ? C . A 1 619 SER 619 ? ? ? C . A 1 620 ALA 620 ? ? ? C . A 1 621 TRP 621 ? ? ? C . A 1 622 GLN 622 ? ? ? C . A 1 623 VAL 623 ? ? ? C . A 1 624 SER 624 ? ? ? C . A 1 625 SER 625 ? ? ? C . A 1 626 GLU 626 ? ? ? C . A 1 627 ASP 627 ? ? ? C . A 1 628 VAL 628 ? ? ? C . A 1 629 ARG 629 ? ? ? C . A 1 630 TRP 630 ? ? ? C . A 1 631 ASP 631 ? ? ? C . A 1 632 THR 632 ? ? ? C . A 1 633 PHE 633 ? ? ? C . A 1 634 PRO 634 ? ? ? C . A 1 635 LEU 635 ? ? ? C . A 1 636 GLY 636 ? ? ? C . A 1 637 ARG 637 ? ? ? C . A 1 638 MET 638 ? ? ? C . A 1 639 PRO 639 ? ? ? C . A 1 640 GLY 640 ? ? ? C . A 1 641 GLN 641 ? ? ? C . A 1 642 THR 642 ? ? ? C . A 1 643 GLU 643 ? ? ? C . A 1 644 ASP 644 ? ? ? C . A 1 645 PRO 645 ? ? ? C . A 1 646 ALA 646 ? ? ? C . A 1 647 GLU 647 ? ? ? C . A 1 648 LEU 648 ? ? ? C . A 1 649 MET 649 ? ? ? C . A 1 650 LEU 650 ? ? ? C . A 1 651 GLU 651 ? ? ? C . A 1 652 ASN 652 ? ? ? C . A 1 653 TYR 653 ? ? ? C . A 1 654 ASP 654 ? ? ? C . A 1 655 THR 655 ? ? ? C . A 1 656 MET 656 ? ? ? C . A 1 657 TYR 657 ? ? ? C . A 1 658 LEU 658 ? ? ? C . A 1 659 LEU 659 ? ? ? C . A 1 660 ASP 660 ? ? ? C . A 1 661 GLN 661 ? ? ? C . A 1 662 PRO 662 ? ? ? C . A 1 663 VAL 663 ? ? ? C . A 1 664 LEU 664 ? ? ? C . A 1 665 GLU 665 ? ? ? C . A 1 666 GLN 666 ? ? ? C . A 1 667 ARG 667 ? ? ? C . A 1 668 LEU 668 ? ? ? C . A 1 669 GLU 669 ? ? ? C . A 1 670 PRO 670 ? ? ? C . A 1 671 SER 671 ? ? ? C . A 1 672 THR 672 ? ? ? C . A 1 673 CYS 673 ? ? ? C . A 1 674 LYS 674 ? ? ? C . A 1 675 THR 675 ? ? ? C . A 1 676 ASP 676 ? ? ? C . A 1 677 THR 677 ? ? ? C . A 1 678 LEU 678 ? ? ? C . A 1 679 GLY 679 ? ? ? C . A 1 680 LEU 680 ? ? ? C . A 1 681 SER 681 ? ? ? C . A 1 682 CYS 682 ? ? ? C . A 1 683 GLY 683 ? ? ? C . A 1 684 VAL 684 ? ? ? C . A 1 685 GLY 685 ? ? ? C . A 1 686 SER 686 ? ? ? C . A 1 687 GLY 687 ? ? ? C . A 1 688 ASN 688 ? ? ? C . A 1 689 CYS 689 ? ? ? C . A 1 690 SER 690 ? ? ? C . A 1 691 ASN 691 ? ? ? C . A 1 692 SER 692 ? ? ? C . A 1 693 SER 693 ? ? ? C . A 1 694 SER 694 ? ? ? C . A 1 695 SER 695 ? ? ? C . A 1 696 ASN 696 ? ? ? C . A 1 697 PHE 697 ? ? ? C . A 1 698 GLU 698 ? ? ? C . A 1 699 GLY 699 699 GLY GLY C . A 1 700 LEU 700 700 LEU LEU C . A 1 701 LEU 701 701 LEU LEU C . A 1 702 TRP 702 702 TRP TRP C . A 1 703 SER 703 703 SER SER C . A 1 704 GLN 704 704 GLN GLN C . A 1 705 GLY 705 705 GLY GLY C . A 1 706 GLN 706 706 GLN GLN C . A 1 707 LEU 707 707 LEU LEU C . A 1 708 HIS 708 708 HIS HIS C . A 1 709 GLY 709 709 GLY GLY C . A 1 710 LEU 710 710 LEU LEU C . A 1 711 LYS 711 711 LYS LYS C . A 1 712 THR 712 712 THR THR C . A 1 713 GLY 713 713 GLY GLY C . A 1 714 LEU 714 714 LEU LEU C . A 1 715 GLN 715 715 GLN GLN C . A 1 716 LEU 716 716 LEU LEU C . A 1 717 PHE 717 717 PHE PHE C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Ribosomal biogenesis protein LAS1L {PDB ID=8fl4, label_asym_id=C, auth_asym_id=BD, SMTL ID=8fl4.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8fl4, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 3 1 BD # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYAL NRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKC LAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEED QEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQ FTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEDGQ TEVQRGEGTDPKSHKNVDLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYIL RWTVELIVANTKTGRNARRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQ GLPDEEQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGS VNDVKEEEKEEKEVLPDQVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKR GALQGSAWQVSSEDVRWDTFPLGRMPGQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLEQRLEPSTCKTDTLGLSCG VGSGNCSNSSSSNFEGLLWSQGQLHGLKTGLQLF ; ;MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYAL NRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKC LAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEED QEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQ FTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEDGQ TEVQRGEGTDPKSHKNVDLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYIL RWTVELIVANTKTGRNARRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQ GLPDEEQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGS VNDVKEEEKEEKEVLPDQVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKR GALQGSAWQVSSEDVRWDTFPLGRMPGQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLEQRLEPSTCKTDTLGLSCG VGSGNCSNSSSSNFEGLLWSQGQLHGLKTGLQLF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 734 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8fl4 2023-07-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 717 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 734 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1e-179 99.861 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYALNRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKCLAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEEDQEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQFTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEE-----------------NVDLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYILRWTVELIVANTKTGRNARRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQGLPDEEQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGSVNDVKEEEKEEKEVLPDQVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKRGALQGSAWQVSSEDVRWDTFPLGRMPGQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLEQRLEPSTCKTDTLGLSCGVGSGNCSNSSSSNFEGLLWSQGQLHGLKTGLQLF 2 1 2 MSWESGAGPGLGSQGMDLVWSAWYGKCVKGKGSLPLSAHGIVVAWLSRAEWDQVTVYLFCDDHKLQRYALNRITVWRSRSGNELPLAVASTADLIRCKLLDVTGGLGTDELRLLYGMALVRFVNLISERKTKFAKVPLKCLAQEVNIPDWIVDLRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRETWELEEFREGIEEEDQEEDKNIVVDDITEQKPEPQDDGKSTESDVKADGDSKGSEEVDSHCKKALSHKELYERARELLVSYEEEQFTVLEKFRYLPKAIKAWNNPSPRVECVLAELKGVTCENREAVLDAFLDDGFLVPTFEQLAALQIEYEDGQTEVQRGEGTDPKSHKNVDLNDVLVPKPFSQFWQPLLRGLHSQNFTQALLERMLSELPALGISGIRPTYILRWTVELIVANTKTGRNARRFSAGQWEARRGWRLFNCSASLDWPRMVESCLGSPCWASPQLLRIIFKAMGQGLPDEEQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASPIGKSPYTLDSLYWSVKPASSSFGSEAKAQQQEEQGSVNDVKEEEKEEKEVLPDQVEEEEENDDQEEEEEDEDDEDDEEEDRMEVGPFSTGQESPTAENARLLAQKRGALQGSAWQVSSEDVRWDTFPLGRMPGQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLEQRLEPSTCKTDTLGLSCGVGSGNCSNSSSSNFEGLLWSQGQLHGLKTGLQLF # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8fl4.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 699 699 ? A 298.440 408.823 192.936 1 1 C GLY 0.320 1 ATOM 2 C CA . GLY 699 699 ? A 297.641 409.018 191.662 1 1 C GLY 0.320 1 ATOM 3 C C . GLY 699 699 ? A 296.171 408.842 191.918 1 1 C GLY 0.320 1 ATOM 4 O O . GLY 699 699 ? A 295.810 408.339 192.976 1 1 C GLY 0.320 1 ATOM 5 N N . LEU 700 700 ? A 295.296 409.248 190.980 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 6 C CA . LEU 700 700 ? A 293.863 409.203 191.166 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 7 C C . LEU 700 700 ? A 293.333 408.161 190.207 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 8 O O . LEU 700 700 ? A 293.553 408.249 189.004 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 9 C CB . LEU 700 700 ? A 293.184 410.557 190.816 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 10 C CG . LEU 700 700 ? A 293.374 411.698 191.842 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 700 700 ? A 294.790 412.300 191.888 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 700 700 ? A 292.363 412.820 191.556 1 1 C LEU 0.800 1 ATOM 13 N N . LEU 701 701 ? A 292.614 407.141 190.722 1 1 C LEU 0.390 1 ATOM 14 C CA . LEU 701 701 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.566 2 1 3 0.266 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 699 GLY 1 0.320 2 1 A 700 LEU 1 0.800 3 1 A 701 LEU 1 0.390 4 1 A 702 TRP 1 0.400 5 1 A 703 SER 1 0.570 6 1 A 704 GLN 1 0.610 7 1 A 705 GLY 1 0.690 8 1 A 706 GLN 1 0.650 9 1 A 707 LEU 1 0.620 10 1 A 708 HIS 1 0.630 11 1 A 709 GLY 1 0.720 12 1 A 710 LEU 1 0.650 13 1 A 711 LYS 1 0.690 14 1 A 712 THR 1 0.700 15 1 A 713 GLY 1 0.690 16 1 A 714 LEU 1 0.570 17 1 A 715 GLN 1 0.520 18 1 A 716 LEU 1 0.280 19 1 A 717 PHE 1 0.250 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #