data_SMR-bd7cb09de219b424baf20f135f514ba4_4 _entry.id SMR-bd7cb09de219b424baf20f135f514ba4_4 _struct.entry_id SMR-bd7cb09de219b424baf20f135f514ba4_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q14244/ MAP7_HUMAN, Ensconsin Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14244' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 96226.045 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MAP7_HUMAN Q14244 1 ;MEDTKLYSPDSYKVQDKKNASSRPASAISGQNNNHSGNKPDPPPVLRVDDRQRLARERREEREKQLAARE IVWLEREERARQHYEKHLEERKKRLEEQRQKEERRRAAVEEKRRQRLEEDKERHEAVVRRTMERSQKPKQ KHNRWSWGGSLHGSPSIHSADPDRRSVSTMNLSKYVDPVISKRLSSSSATLLNSPDRARRLQLSPWESSV VNRLLTPTHSFLARSKSTAALSGEAASCSPIIMPYKAAHSRNSMDRPKLFVTPPEGSSRRRIIHGTASYK KERERENVLFLTSGTRRAVSPSNPKARQPARSRLWLPSKSLPHLPGTPRPTSSLPPGSVKAAPAQVRPPS PGNIRPVKREVKVEPEKKDPEKEPQKVANEPSLKGRAPLVKVEEATVEERTPAEPEVGPAAPAMAPAPAS APAPASAPAPAPVPTPAMVSAPSSTVNASASVKTSAGTTDPEEATRLLAEKRRLAREQREKEERERREQE ELERQKREELAQRVAEERTTRREEESRRLEAEQAREKEEQLQRQAEERALREREEAERAQRQKEEEARVR EEAERVRQEREKHFQREEQERLERKKRLEEIMKRTRRTEATDKKTSDQRNGDIAKGALTGGTEVSALPCT TNAPGNGKPVGSPHVVTSHQSKVTVESTPDLEKQPNENGVSVQNENFEEIINLPIGSKPSRLDVTNSESP EIPLNPILAFDDEGTLGPLPQVDGVQTQQTAEVI ; Ensconsin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 734 1 734 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MAP7_HUMAN Q14244 Q14244-2 1 734 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-11-01 442B7844C6097C72 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MEDTKLYSPDSYKVQDKKNASSRPASAISGQNNNHSGNKPDPPPVLRVDDRQRLARERREEREKQLAARE IVWLEREERARQHYEKHLEERKKRLEEQRQKEERRRAAVEEKRRQRLEEDKERHEAVVRRTMERSQKPKQ KHNRWSWGGSLHGSPSIHSADPDRRSVSTMNLSKYVDPVISKRLSSSSATLLNSPDRARRLQLSPWESSV VNRLLTPTHSFLARSKSTAALSGEAASCSPIIMPYKAAHSRNSMDRPKLFVTPPEGSSRRRIIHGTASYK KERERENVLFLTSGTRRAVSPSNPKARQPARSRLWLPSKSLPHLPGTPRPTSSLPPGSVKAAPAQVRPPS PGNIRPVKREVKVEPEKKDPEKEPQKVANEPSLKGRAPLVKVEEATVEERTPAEPEVGPAAPAMAPAPAS APAPASAPAPAPVPTPAMVSAPSSTVNASASVKTSAGTTDPEEATRLLAEKRRLAREQREKEERERREQE ELERQKREELAQRVAEERTTRREEESRRLEAEQAREKEEQLQRQAEERALREREEAERAQRQKEEEARVR EEAERVRQEREKHFQREEQERLERKKRLEEIMKRTRRTEATDKKTSDQRNGDIAKGALTGGTEVSALPCT 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. 1 5 LYS . 1 6 LEU . 1 7 TYR . 1 8 SER . 1 9 PRO . 1 10 ASP . 1 11 SER . 1 12 TYR . 1 13 LYS . 1 14 VAL . 1 15 GLN . 1 16 ASP . 1 17 LYS . 1 18 LYS . 1 19 ASN . 1 20 ALA . 1 21 SER . 1 22 SER . 1 23 ARG . 1 24 PRO . 1 25 ALA . 1 26 SER . 1 27 ALA . 1 28 ILE . 1 29 SER . 1 30 GLY . 1 31 GLN . 1 32 ASN . 1 33 ASN . 1 34 ASN . 1 35 HIS . 1 36 SER . 1 37 GLY . 1 38 ASN . 1 39 LYS . 1 40 PRO . 1 41 ASP . 1 42 PRO . 1 43 PRO . 1 44 PRO . 1 45 VAL . 1 46 LEU . 1 47 ARG . 1 48 VAL . 1 49 ASP . 1 50 ASP . 1 51 ARG . 1 52 GLN . 1 53 ARG . 1 54 LEU . 1 55 ALA . 1 56 ARG . 1 57 GLU . 1 58 ARG . 1 59 ARG . 1 60 GLU . 1 61 GLU . 1 62 ARG . 1 63 GLU . 1 64 LYS . 1 65 GLN . 1 66 LEU . 1 67 ALA . 1 68 ALA . 1 69 ARG . 1 70 GLU . 1 71 ILE . 1 72 VAL . 1 73 TRP . 1 74 LEU . 1 75 GLU . 1 76 ARG . 1 77 GLU . 1 78 GLU . 1 79 ARG . 1 80 ALA . 1 81 ARG . 1 82 GLN . 1 83 HIS . 1 84 TYR . 1 85 GLU . 1 86 LYS . 1 87 HIS . 1 88 LEU . 1 89 GLU . 1 90 GLU . 1 91 ARG . 1 92 LYS . 1 93 LYS . 1 94 ARG . 1 95 LEU . 1 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A . A 1 612 ASP 612 ? ? ? A . A 1 613 ILE 613 ? ? ? A . A 1 614 ALA 614 ? ? ? A . A 1 615 LYS 615 ? ? ? A . A 1 616 GLY 616 ? ? ? A . A 1 617 ALA 617 ? ? ? A . A 1 618 LEU 618 ? ? ? A . A 1 619 THR 619 ? ? ? A . A 1 620 GLY 620 ? ? ? A . A 1 621 GLY 621 ? ? ? A . A 1 622 THR 622 ? ? ? A . A 1 623 GLU 623 ? ? ? A . A 1 624 VAL 624 ? ? ? A . A 1 625 SER 625 ? ? ? A . A 1 626 ALA 626 ? ? ? A . A 1 627 LEU 627 ? ? ? A . A 1 628 PRO 628 ? ? ? A . A 1 629 CYS 629 ? ? ? A . A 1 630 THR 630 ? ? ? A . A 1 631 THR 631 ? ? ? A . A 1 632 ASN 632 ? ? ? A . A 1 633 ALA 633 ? ? ? A . A 1 634 PRO 634 ? ? ? A . A 1 635 GLY 635 ? ? ? A . A 1 636 ASN 636 ? ? ? A . A 1 637 GLY 637 ? ? ? A . A 1 638 LYS 638 ? ? ? A . A 1 639 PRO 639 ? ? ? A . A 1 640 VAL 640 ? ? ? A . A 1 641 GLY 641 ? ? ? A . A 1 642 SER 642 ? ? ? A . A 1 643 PRO 643 ? ? ? A . A 1 644 HIS 644 ? ? ? A . A 1 645 VAL 645 ? ? ? A . A 1 646 VAL 646 ? ? ? A . A 1 647 THR 647 ? ? ? A . A 1 648 SER 648 ? ? ? A . A 1 649 HIS 649 ? ? ? A . 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A 1 688 LYS 688 ? ? ? A . A 1 689 PRO 689 ? ? ? A . A 1 690 SER 690 ? ? ? A . A 1 691 ARG 691 ? ? ? A . A 1 692 LEU 692 ? ? ? A . A 1 693 ASP 693 ? ? ? A . A 1 694 VAL 694 ? ? ? A . A 1 695 THR 695 ? ? ? A . A 1 696 ASN 696 ? ? ? A . A 1 697 SER 697 ? ? ? A . A 1 698 GLU 698 ? ? ? A . A 1 699 SER 699 ? ? ? A . A 1 700 PRO 700 ? ? ? A . A 1 701 GLU 701 ? ? ? A . A 1 702 ILE 702 ? ? ? A . A 1 703 PRO 703 ? ? ? A . A 1 704 LEU 704 ? ? ? A . A 1 705 ASN 705 ? ? ? A . A 1 706 PRO 706 ? ? ? A . A 1 707 ILE 707 ? ? ? A . A 1 708 LEU 708 ? ? ? A . A 1 709 ALA 709 ? ? ? A . A 1 710 PHE 710 ? ? ? A . A 1 711 ASP 711 ? ? ? A . A 1 712 ASP 712 ? ? ? A . A 1 713 GLU 713 ? ? ? A . A 1 714 GLY 714 ? ? ? A . A 1 715 THR 715 ? ? ? A . A 1 716 LEU 716 ? ? ? A . A 1 717 GLY 717 ? ? ? A . A 1 718 PRO 718 ? ? ? A . A 1 719 LEU 719 ? ? ? A . A 1 720 PRO 720 ? ? ? A . A 1 721 GLN 721 ? ? ? A . A 1 722 VAL 722 ? ? ? A . A 1 723 ASP 723 ? ? ? A . A 1 724 GLY 724 ? ? ? A . A 1 725 VAL 725 ? ? ? A . A 1 726 GLN 726 ? ? ? A . A 1 727 THR 727 ? ? ? A . A 1 728 GLN 728 ? ? ? A . A 1 729 GLN 729 ? ? ? A . A 1 730 THR 730 ? ? ? A . A 1 731 ALA 731 ? ? ? A . A 1 732 GLU 732 ? ? ? A . A 1 733 VAL 733 ? ? ? A . A 1 734 ILE 734 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Cilia- and flagella-associated protein 45 {PDB ID=8j07, label_asym_id=L, auth_asym_id=1E, SMTL ID=8j07.12.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8j07, label_asym_id=L' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A L 7 1 1E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MPLSTAGILSSSSAASNRSRNKARYRTKAVSSEVDESLFGDIKSPAQGQSDSPIVLLRDKHTLQKTLTAL GLDRKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEARDQAFKKEKEATMD AVMTRKKIMKQKEMVWNNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQ ILEKQQIQKELDTEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELERKRREERIRGRRQIVEQMEKNQEERSLLAEQRE QEKEQMLEYMEQLQEEDLKDMERRQQQKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMAR EAEFEAEQERIRREKEKEIARLRAMQEKAQDYQAEQDALRAKRNQEVADREWRRKEKENARKKMETEAEL RKSRLEQVAFKEHALAVQVQRDRDEFERILRAQREQIEKERLEEEKKATGRLQHANELRRQVRENQQKEV QNRIATFEEGRRLKEEAQKRRERIDEIKRKKLEELRATGLPEKYCIEAERKANILPATSVN ; ;MPLSTAGILSSSSAASNRSRNKARYRTKAVSSEVDESLFGDIKSPAQGQSDSPIVLLRDKHTLQKTLTAL GLDRKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEARDQAFKKEKEATMD AVMTRKKIMKQKEMVWNNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQ ILEKQQIQKELDTEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELERKRREERIRGRRQIVEQMEKNQEERSLLAEQRE QEKEQMLEYMEQLQEEDLKDMERRQQQKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMAR EAEFEAEQERIRREKEKEIARLRAMQEKAQDYQAEQDALRAKRNQEVADREWRRKEKENARKKMETEAEL RKSRLEQVAFKEHALAVQVQRDRDEFERILRAQREQIEKERLEEEKKATGRLQHANELRRQVRENQQKEV QNRIATFEEGRRLKEEAQKRRERIDEIKRKKLEELRATGLPEKYCIEAERKANILPATSVN ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 402 430 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8j07 2023-08-02 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 734 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 734 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 51.000 20.690 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEDTKLYSPDSYKVQDKKNASSRPASAISGQNNNHSGNKPDPPPVLRVDDRQRLARERREEREKQLAAREIVWLEREERARQHYEKHLEERKKRLEEQRQKEERRRAAVEEKRRQRLEEDKERHEAVVRRTMERSQKPKQKHNRWSWGGSLHGSPSIHSADPDRRSVSTMNLSKYVDPVISKRLSSSSATLLNSPDRARRLQLSPWESSVVNRLLTPTHSFLARSKSTAALSGEAASCSPIIMPYKAAHSRNSMDRPKLFVTPPEGSSRRRIIHGTASYKKERERENVLFLTSGTRRAVSPSNPKARQPARSRLWLPSKSLPHLPGTPRPTSSLPPGSVKAAPAQVRPPSPGNIRPVKREVKVEPEKKDPEKEPQKVANEPSLKGRAPLVKVEEATVEERTPAEPEVGPAAPAMAPAPASAPAPASAPAPAPVPTPAMVSAPSSTVNASASVKTSAGTTDPEEATRLLAEKRRLAREQREKEERERREQEELERQKREELAQRVAEERTTRREEESRRLEAEQAREKEEQLQRQAEERALREREEAERAQRQKEEEARVREEAERVRQEREKHFQREEQERLERKKRLEEIMKRTRRTEATDKKTSDQRNGDIAKGALTGGTEVSALPCTTNAPGNGKPVGSPHVVTSHQSKVTVESTPDLEKQPNENGVSVQNENFEEIINLPIGSKPSRLDVTNSESPEIPLNPILAFDDEGTLGPLPQVDGVQTQQTAEVI 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------WRRKEKENARKKMETEAELRKSRLEQVAF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8j07.12' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 668.601 611.111 983.796 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 15 O O . GLN 575 575 ? A 668.557 611.590 984.920 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 16 C CB . GLN 575 575 ? A 668.823 612.734 981.861 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 17 C CG . GLN 575 575 ? A 669.827 613.578 981.038 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 18 C CD . GLN 575 575 ? A 669.085 614.621 980.199 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 19 O OE1 . GLN 575 575 ? A 667.942 614.424 979.819 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 20 N NE2 . GLN 575 575 ? A 669.767 615.752 979.880 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 21 N N . ARG 576 576 ? A 667.873 610.020 983.471 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 22 C CA . ARG 576 576 ? A 667.087 609.273 984.438 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 23 C C . ARG 576 576 ? A 667.874 608.692 985.616 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 24 O O . ARG 576 576 ? A 667.449 608.788 986.757 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 25 C CB . ARG 576 576 ? A 666.318 608.145 983.707 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 26 C CG . ARG 576 576 ? A 665.166 607.497 984.512 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 27 C CD . ARG 576 576 ? 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A 673.211 614.635 1008.443 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 184 C CD . LYS 593 593 ? A 673.131 615.991 1007.729 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 185 C CE . LYS 593 593 ? A 674.399 616.296 1006.927 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 186 N NZ . LYS 593 593 ? A 674.254 617.582 1006.210 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 187 N N . ARG 594 594 ? A 669.646 612.505 1010.572 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 188 C CA . ARG 594 594 ? A 668.546 612.292 1011.503 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 189 C C . ARG 594 594 ? A 668.815 611.180 1012.500 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 190 O O . ARG 594 594 ? A 668.609 611.367 1013.694 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 191 C CB . ARG 594 594 ? A 667.214 611.990 1010.767 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 192 C CG . ARG 594 594 ? A 666.643 613.212 1010.018 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 193 C CD . ARG 594 594 ? A 665.327 612.975 1009.261 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 194 N NE . ARG 594 594 ? A 664.944 614.248 1008.569 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 195 C CZ . ARG 594 594 ? A 664.332 615.307 1009.105 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 196 N NH1 . ARG 594 594 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.677 2 1 3 0.006 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 574 PHE 1 0.590 2 1 A 575 GLN 1 0.770 3 1 A 576 ARG 1 0.670 4 1 A 577 GLU 1 0.730 5 1 A 578 GLU 1 0.740 6 1 A 579 GLN 1 0.720 7 1 A 580 GLU 1 0.720 8 1 A 581 ARG 1 0.720 9 1 A 582 LEU 1 0.780 10 1 A 583 GLU 1 0.750 11 1 A 584 ARG 1 0.720 12 1 A 585 LYS 1 0.760 13 1 A 586 LYS 1 0.760 14 1 A 587 ARG 1 0.750 15 1 A 588 LEU 1 0.770 16 1 A 589 GLU 1 0.760 17 1 A 590 GLU 1 0.740 18 1 A 591 ILE 1 0.730 19 1 A 592 MET 1 0.700 20 1 A 593 LYS 1 0.690 21 1 A 594 ARG 1 0.610 22 1 A 595 THR 1 0.610 23 1 A 596 ARG 1 0.530 24 1 A 597 ARG 1 0.530 25 1 A 598 THR 1 0.580 26 1 A 599 GLU 1 0.540 27 1 A 600 ALA 1 0.550 28 1 A 601 THR 1 0.590 29 1 A 602 ASP 1 0.510 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #