data_SMR-c8c944cb56b1f222a99849112a1f1cec_2 _entry.id SMR-c8c944cb56b1f222a99849112a1f1cec_2 _struct.entry_id SMR-c8c944cb56b1f222a99849112a1f1cec_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P42226/ STAT6_HUMAN, Signal transducer and activator of transcription 6 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P42226' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 95094.781 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP STAT6_HUMAN P42226 1 ;MEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALA MLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELE PKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQ ARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSA SFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFM AEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLR SYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIR SLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSY DLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPH PQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQ GESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW ; 'Signal transducer and activator of transcription 6' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 737 1 737 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . STAT6_HUMAN P42226 P42226-2 1 737 9606 'Homo sapiens (Human)' 1995-11-01 8A076ABC6053A831 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALA MLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELE PKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQ ARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSA SFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFM AEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLR SYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIR SLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSY DLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPH 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4 PHE . 1 5 ARG . 1 6 HIS . 1 7 LEU . 1 8 PRO . 1 9 MET . 1 10 PRO . 1 11 PHE . 1 12 HIS . 1 13 TRP . 1 14 LYS . 1 15 GLN . 1 16 GLU . 1 17 GLU . 1 18 LEU . 1 19 LYS . 1 20 PHE . 1 21 LYS . 1 22 THR . 1 23 GLY . 1 24 LEU . 1 25 ARG . 1 26 ARG . 1 27 LEU . 1 28 GLN . 1 29 HIS . 1 30 ARG . 1 31 VAL . 1 32 GLY . 1 33 GLU . 1 34 ILE . 1 35 HIS . 1 36 LEU . 1 37 LEU . 1 38 ARG . 1 39 GLU . 1 40 ALA . 1 41 LEU . 1 42 GLN . 1 43 LYS . 1 44 GLY . 1 45 ALA . 1 46 GLU . 1 47 ALA . 1 48 GLY . 1 49 GLN . 1 50 VAL . 1 51 SER . 1 52 LEU . 1 53 HIS . 1 54 SER . 1 55 LEU . 1 56 ILE . 1 57 GLU . 1 58 THR . 1 59 PRO . 1 60 ALA . 1 61 ASN . 1 62 GLY . 1 63 THR . 1 64 GLY . 1 65 PRO . 1 66 SER . 1 67 GLU . 1 68 ALA . 1 69 LEU . 1 70 ALA . 1 71 MET . 1 72 LEU . 1 73 LEU . 1 74 GLN . 1 75 GLU . 1 76 THR . 1 77 THR . 1 78 GLY . 1 79 GLU . 1 80 LEU . 1 81 GLU . 1 82 ALA . 1 83 ALA . 1 84 LYS . 1 85 ALA . 1 86 LEU . 1 87 VAL . 1 88 LEU . 1 89 LYS . 1 90 ARG . 1 91 ILE . 1 92 GLN . 1 93 ILE . 1 94 TRP . 1 95 LYS . 1 96 ARG . 1 97 GLN . 1 98 GLN . 1 99 GLN . 1 100 LEU . 1 101 ALA . 1 102 GLY . 1 103 ASN . 1 104 GLY . 1 105 ALA . 1 106 PRO . 1 107 PHE . 1 108 GLU . 1 109 GLU . 1 110 SER . 1 111 LEU . 1 112 ALA . 1 113 PRO . 1 114 LEU . 1 115 GLN . 1 116 GLU . 1 117 ARG . 1 118 CYS . 1 119 GLU . 1 120 SER . 1 121 LEU . 1 122 VAL . 1 123 ASP . 1 124 ILE . 1 125 TYR . 1 126 SER . 1 127 GLN . 1 128 LEU . 1 129 GLN . 1 130 GLN . 1 131 GLU . 1 132 VAL . 1 133 GLY . 1 134 ALA . 1 135 ALA . 1 136 GLY . 1 137 GLY . 1 138 GLU . 1 139 LEU . 1 140 GLU . 1 141 PRO . 1 142 LYS . 1 143 THR . 1 144 ARG . 1 145 ALA . 1 146 SER . 1 147 LEU . 1 148 THR . 1 149 GLY . 1 150 ARG . 1 151 LEU . 1 152 ASP . 1 153 GLU . 1 154 VAL . 1 155 LEU . 1 156 ARG . 1 157 THR . 1 158 LEU . 1 159 VAL . 1 160 THR . 1 161 SER . 1 162 CYS . 1 163 PHE . 1 164 LEU . 1 165 VAL . 1 166 GLU . 1 167 LYS . 1 168 GLN . 1 169 PRO . 1 170 PRO . 1 171 GLN . 1 172 VAL . 1 173 LEU . 1 174 LYS . 1 175 THR . 1 176 GLN . 1 177 THR . 1 178 LYS . 1 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A 1 618 SER 618 ? ? ? B . A 1 619 LEU 619 ? ? ? B . A 1 620 GLY 620 ? ? ? B . A 1 621 GLN 621 ? ? ? B . A 1 622 MET 622 ? ? ? B . A 1 623 SER 623 ? ? ? B . A 1 624 LEU 624 ? ? ? B . A 1 625 PRO 625 ? ? ? B . A 1 626 PHE 626 ? ? ? B . A 1 627 ASP 627 ? ? ? B . A 1 628 GLN 628 ? ? ? B . A 1 629 PRO 629 ? ? ? B . A 1 630 HIS 630 ? ? ? B . A 1 631 PRO 631 ? ? ? B . A 1 632 GLN 632 ? ? ? B . A 1 633 GLY 633 ? ? ? B . A 1 634 LEU 634 ? ? ? B . A 1 635 LEU 635 ? ? ? B . A 1 636 PRO 636 ? ? ? B . A 1 637 CYS 637 ? ? ? B . A 1 638 GLN 638 ? ? ? B . A 1 639 PRO 639 ? ? ? B . A 1 640 GLN 640 ? ? ? B . A 1 641 GLU 641 ? ? ? B . A 1 642 HIS 642 ? ? ? B . A 1 643 ALA 643 ? ? ? B . A 1 644 VAL 644 ? ? ? B . A 1 645 SER 645 ? ? ? B . A 1 646 SER 646 ? ? ? B . A 1 647 PRO 647 ? ? ? B . A 1 648 ASP 648 ? ? ? B . A 1 649 PRO 649 ? ? ? B . A 1 650 LEU 650 ? ? ? B . A 1 651 LEU 651 ? ? ? B . A 1 652 CYS 652 ? ? ? B . A 1 653 SER 653 ? ? ? B . A 1 654 ASP 654 ? ? ? B . A 1 655 VAL 655 ? ? ? B . 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A 1 690 GLN 690 690 GLN GLN B . A 1 691 ASP 691 691 ASP ASP B . A 1 692 LEU 692 692 LEU LEU B . A 1 693 THR 693 693 THR THR B . A 1 694 LYS 694 694 LYS LYS B . A 1 695 LEU 695 695 LEU LEU B . A 1 696 LEU 696 696 LEU LEU B . A 1 697 LEU 697 697 LEU LEU B . A 1 698 GLU 698 698 GLU GLU B . A 1 699 GLY 699 699 GLY GLY B . A 1 700 GLN 700 700 GLN GLN B . A 1 701 GLY 701 701 GLY GLY B . A 1 702 GLU 702 702 GLU GLU B . A 1 703 SER 703 703 SER SER B . A 1 704 GLY 704 704 GLY GLY B . A 1 705 GLY 705 ? ? ? B . A 1 706 GLY 706 ? ? ? B . A 1 707 SER 707 ? ? ? B . A 1 708 LEU 708 ? ? ? B . A 1 709 GLY 709 ? ? ? B . A 1 710 ALA 710 ? ? ? B . A 1 711 GLN 711 ? ? ? B . A 1 712 PRO 712 ? ? ? B . A 1 713 LEU 713 ? ? ? B . A 1 714 LEU 714 ? ? ? B . A 1 715 GLN 715 ? ? ? B . A 1 716 PRO 716 ? ? ? B . A 1 717 SER 717 ? ? ? B . A 1 718 HIS 718 ? ? ? B . A 1 719 TYR 719 ? ? ? B . A 1 720 GLY 720 ? ? ? B . A 1 721 GLN 721 ? ? ? B . A 1 722 SER 722 ? ? ? B . A 1 723 GLY 723 ? ? ? B . A 1 724 ILE 724 ? ? ? B . A 1 725 SER 725 ? ? ? B . A 1 726 MET 726 ? ? ? B . A 1 727 SER 727 ? ? ? B . A 1 728 HIS 728 ? ? ? B . A 1 729 MET 729 ? ? ? B . A 1 730 ASP 730 ? ? ? B . A 1 731 LEU 731 ? ? ? B . A 1 732 ARG 732 ? ? ? B . A 1 733 ALA 733 ? ? ? B . A 1 734 ASN 734 ? ? ? B . A 1 735 PRO 735 ? ? ? B . A 1 736 SER 736 ? ? ? B . A 1 737 TRP 737 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Signal transducer and activator of transcription 6 {PDB ID=5nwm, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5nwm.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5nwm, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 32 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5nwm 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 737 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 737 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.1e-11 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALAMLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESG--------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5nwm.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 673 673 ? A -19.667 -21.756 -4.288 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 2 C CA . GLY 673 673 ? A -20.106 -20.528 -3.533 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 3 C C . GLY 673 673 ? A -18.978 -19.528 -3.445 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 4 O O . GLY 673 673 ? A -17.865 -19.826 -3.868 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 5 N N . THR 674 674 ? A -19.225 -18.320 -2.914 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 6 C CA . THR 674 674 ? A -18.219 -17.274 -2.806 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 7 C C . THR 674 674 ? A -18.222 -16.859 -1.357 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 8 O O . THR 674 674 ? A -19.291 -16.606 -0.796 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 9 C CB . THR 674 674 ? A -18.466 -16.081 -3.755 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 10 O OG1 . THR 674 674 ? A -17.647 -14.949 -3.484 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 11 C CG2 . THR 674 674 ? A -19.917 -15.587 -3.761 1 1 B THR 0.490 1 ATOM 12 N N . TRP 675 675 ? A -17.050 -16.844 -0.687 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 13 C CA . TRP 675 675 ? A -16.944 -16.378 0.687 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 14 C C . TRP 675 675 ? A -16.960 -14.859 0.706 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 15 O O . TRP 675 675 ? A -17.894 -14.219 1.180 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 16 C CB . TRP 675 675 ? A -15.647 -16.918 1.347 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 17 C CG . TRP 675 675 ? A -15.438 -18.386 1.119 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 18 C CD1 . TRP 675 675 ? A -14.532 -19.022 0.319 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 19 C CD2 . TRP 675 675 ? A -16.239 -19.441 1.700 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 20 N NE1 . TRP 675 675 ? A -14.710 -20.390 0.346 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 21 C CE2 . TRP 675 675 ? A -15.762 -20.641 1.209 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 22 C CE3 . TRP 675 675 ? A -17.293 -19.368 2.608 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 23 C CZ2 . TRP 675 675 ? A -16.322 -21.864 1.599 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 24 C CZ3 . TRP 675 675 ? A -17.870 -20.589 2.997 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 25 C CH2 . TRP 675 675 ? A -17.389 -21.806 2.512 1 1 B TRP 0.400 1 ATOM 26 N N . ILE 676 676 ? A -15.957 -14.247 0.050 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 27 C CA . ILE 676 676 ? A -15.721 -12.812 -0.095 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 28 C C . ILE 676 676 ? A -16.914 -11.983 -0.566 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 29 O O . ILE 676 676 ? A -16.977 -10.770 -0.311 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 30 C CB . ILE 676 676 ? A -14.565 -12.516 -1.042 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 31 C CG1 . ILE 676 676 ? A -14.700 -13.287 -2.372 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 32 C CG2 . ILE 676 676 ? A -13.200 -12.718 -0.357 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 33 C CD1 . ILE 676 676 ? A -14.506 -12.349 -3.564 1 1 B ILE 0.450 1 ATOM 34 N N . GLY 677 677 ? A -17.917 -12.605 -1.205 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 35 C CA . GLY 677 677 ? A -19.235 -12.046 -1.508 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 36 C C . GLY 677 677 ? A -19.993 -11.495 -0.318 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 37 O O . GLY 677 677 ? A -20.744 -10.532 -0.467 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 38 N N . GLU 678 678 ? A -19.789 -12.077 0.879 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 39 C CA . GLU 678 678 ? A -20.334 -11.531 2.123 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 40 C C . GLU 678 678 ? A -19.498 -11.849 3.392 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 41 O O . GLU 678 678 ? A -19.753 -11.296 4.476 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 42 C CB . GLU 678 678 ? A -21.831 -11.930 2.277 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 43 C CG . GLU 678 678 ? A -22.808 -10.732 2.079 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 44 C CD . GLU 678 678 ? A -23.879 -10.609 3.167 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 45 O OE1 . GLU 678 678 ? A -23.500 -10.282 4.322 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 46 O OE2 . GLU 678 678 ? A -25.080 -10.802 2.846 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 47 N N . ASP 679 679 ? A -18.393 -12.619 3.325 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 48 C CA . ASP 679 679 ? A -17.557 -13.041 4.462 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 49 C C . ASP 679 679 ? A -16.502 -11.989 4.822 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 50 O O . ASP 679 679 ? A -15.806 -12.076 5.841 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 51 C CB . ASP 679 679 ? A -16.850 -14.367 4.052 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 52 C CG . ASP 679 679 ? A -16.335 -15.271 5.177 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 53 O OD1 . ASP 679 679 ? A -16.681 -15.046 6.362 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 54 O OD2 . ASP 679 679 ? A -15.600 -16.228 4.803 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 55 N N . ILE 680 680 ? A -16.386 -10.891 4.044 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 56 C CA . ILE 680 680 ? A -15.461 -9.798 4.375 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 57 C C . ILE 680 680 ? A -16.184 -8.774 5.230 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 58 O O . ILE 680 680 ? A -15.608 -7.790 5.702 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 59 C CB . ILE 680 680 ? A -14.874 -9.060 3.174 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 60 C CG1 . ILE 680 680 ? A -14.614 -10.004 1.989 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 61 C CG2 . ILE 680 680 ? A -13.554 -8.370 3.604 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 62 C CD1 . ILE 680 680 ? A -14.042 -9.239 0.791 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 63 N N . PHE 681 681 ? A -17.491 -9.025 5.454 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 64 C CA . PHE 681 681 ? A -18.390 -8.221 6.252 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 65 C C . PHE 681 681 ? A -18.811 -6.959 5.475 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 66 O O . PHE 681 681 ? A -17.938 -6.167 5.118 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 67 C CB . PHE 681 681 ? A -17.814 -7.922 7.685 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 68 C CG . PHE 681 681 ? A -17.891 -9.102 8.634 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 69 C CD1 . PHE 681 681 ? A -17.217 -10.311 8.361 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 70 C CD2 . PHE 681 681 ? A -18.592 -9.000 9.852 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 71 C CE1 . PHE 681 681 ? A -17.333 -11.414 9.215 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 72 C CE2 . PHE 681 681 ? A -18.665 -10.089 10.732 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 73 C CZ . PHE 681 681 ? A -18.058 -11.302 10.402 1 1 B PHE 0.440 1 ATOM 74 N N . PRO 682 682 ? A -20.089 -6.651 5.180 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 75 C CA . PRO 682 682 ? A -20.459 -5.299 4.757 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 76 C C . PRO 682 682 ? A -20.090 -4.151 5.739 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 77 O O . PRO 682 682 ? A -19.891 -3.081 5.172 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 78 C CB . PRO 682 682 ? A -21.949 -5.395 4.388 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 79 C CG . PRO 682 682 ? A -22.465 -6.473 5.340 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 80 C CD . PRO 682 682 ? A -21.289 -7.454 5.493 1 1 B PRO 0.480 1 ATOM 81 N N . PRO 683 683 ? A -19.960 -4.158 7.092 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 82 C CA . PRO 683 683 ? A -19.591 -2.944 7.836 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 83 C C . PRO 683 683 ? A -18.140 -2.524 7.655 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 84 O O . PRO 683 683 ? A -17.861 -1.335 7.764 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 85 C CB . PRO 683 683 ? A -19.880 -3.289 9.306 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 86 C CG . PRO 683 683 ? A -19.710 -4.803 9.364 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 87 C CD . PRO 683 683 ? A -20.346 -5.236 8.022 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 88 N N . LEU 684 684 ? A -17.220 -3.481 7.441 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 89 C CA . LEU 684 684 ? A -15.792 -3.243 7.285 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 90 C C . LEU 684 684 ? A -15.097 -2.480 8.429 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 91 O O . LEU 684 684 ? A -14.743 -1.301 8.334 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 92 C CB . LEU 684 684 ? A -15.496 -2.688 5.878 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 93 C CG . LEU 684 684 ? A -14.029 -2.806 5.436 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 684 684 ? A -13.963 -3.427 4.034 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 684 684 ? A -13.317 -1.448 5.483 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 96 N N . LEU 685 685 ? A -14.884 -3.117 9.596 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 97 C CA . LEU 685 685 ? A -14.391 -2.399 10.760 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 98 C C . LEU 685 685 ? A -12.862 -2.400 10.791 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 99 O O . LEU 685 685 ? A -12.259 -3.469 10.704 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 100 C CB . LEU 685 685 ? A -14.992 -2.958 12.071 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 101 C CG . LEU 685 685 ? A -16.455 -2.514 12.255 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 102 C CD1 . LEU 685 685 ? A -17.230 -3.525 13.104 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 103 C CD2 . LEU 685 685 ? A -16.541 -1.104 12.859 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 104 N N . PRO 686 686 ? A -12.186 -1.248 10.859 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 105 C CA . PRO 686 686 ? A -10.729 -1.189 10.948 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 106 C C . PRO 686 686 ? A -10.196 -1.751 12.278 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 107 O O . PRO 686 686 ? A -10.978 -1.965 13.205 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 108 C CB . PRO 686 686 ? A -10.419 0.307 10.729 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 109 C CG . PRO 686 686 ? A -11.669 1.040 11.202 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 110 C CD . PRO 686 686 ? A -12.796 0.088 10.823 1 1 B PRO 0.770 1 ATOM 111 N N . PRO 687 687 ? A -8.901 -2.040 12.396 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 112 C CA . PRO 687 687 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.534 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 673 GLY 1 0.490 2 1 A 674 THR 1 0.490 3 1 A 675 TRP 1 0.400 4 1 A 676 ILE 1 0.450 5 1 A 677 GLY 1 0.480 6 1 A 678 GLU 1 0.460 7 1 A 679 ASP 1 0.480 8 1 A 680 ILE 1 0.440 9 1 A 681 PHE 1 0.440 10 1 A 682 PRO 1 0.480 11 1 A 683 PRO 1 0.770 12 1 A 684 LEU 1 0.470 13 1 A 685 LEU 1 0.500 14 1 A 686 PRO 1 0.770 15 1 A 687 PRO 1 0.610 16 1 A 688 THR 1 0.560 17 1 A 689 GLU 1 0.630 18 1 A 690 GLN 1 0.650 19 1 A 691 ASP 1 0.660 20 1 A 692 LEU 1 0.620 21 1 A 693 THR 1 0.650 22 1 A 694 LYS 1 0.640 23 1 A 695 LEU 1 0.580 24 1 A 696 LEU 1 0.560 25 1 A 697 LEU 1 0.570 26 1 A 698 GLU 1 0.550 27 1 A 699 GLY 1 0.500 28 1 A 700 GLN 1 0.450 29 1 A 701 GLY 1 0.550 30 1 A 702 GLU 1 0.450 31 1 A 703 SER 1 0.480 32 1 A 704 GLY 1 0.250 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #