data_SMR-80ca26fb66213b4907eca16acfcad0f1_3 _entry.id SMR-80ca26fb66213b4907eca16acfcad0f1_3 _struct.entry_id SMR-80ca26fb66213b4907eca16acfcad0f1_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q24JP5/ T132A_HUMAN, Transmembrane protein 132A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q24JP5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 97117.711 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP T132A_HUMAN Q24JP5 1 ;MCARMAGRTTAAPRGPYGPWLCLLVALALDVVRVDCGQAPLDPVYLHVTAARPAQPTLWTAKLDRFKGSR HHTTLITCHRAGLTEPDSSSPLELSEFLWVDFVVENSTGGGVAVTRPVTWQLEYPGQAPEAEKDKMVWEI LVSERDIRALIPLAKAEELVNTAPLTGVPQHVPVRLVTVDGGGALVEVTEHVGCESANTQVLQVSEACDA VFVAGKESRGARGVRVDFWWRRLRASLRLTVWAPLLPLRIELTDTTLEQVRGWRVPGPAEGPAEPAAEAS DEAERRARGCHLQYQRAGVRFLAPFAAHPLDGGRRLTHLLGPDWLLDVSHLVAPHARVLDSRVASLEGGR VVVGREPGVTSIEVRSPLSDSILGEQALAVTDDKVSVLELRVQPVMGISLTLSRGTAHPGEVTATCWAQS ALPAPKQEVALSLWLSFSDHTVAPAELYDRRDLGLSVSAEEPGAILPAEEQGAQLGVVVSGAGAEGLPLH VALHPPEPCRRGRHRVPLASGTAWLGLPPASTPAPALPSSPAWSPPATEATMGGKRQVAGSVGGNTGVRG KFERAEEEARKEETEAREEEEEEEEEMVPAPQHVTELELGMYALLGVFCVAIFIFLVNGVVFVLRYQRKE PPDSATDPTSPQPHNWVWLGTDQEELSRQLDRQSPGPPKGEGSCPCESGGGGEAPTLAPGPPGGTTSSSS TLARKEAGGRRKRVEFVTFAPAPPAQSPEEPVGAPAVQSILVAGEEDIRWVCEDMGLKDPEELRNYMERI RGSS ; 'Transmembrane protein 132A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 774 1 774 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . T132A_HUMAN Q24JP5 Q24JP5-2 1 774 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-04-18 7CE22843F97A190E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MCARMAGRTTAAPRGPYGPWLCLLVALALDVVRVDCGQAPLDPVYLHVTAARPAQPTLWTAKLDRFKGSR HHTTLITCHRAGLTEPDSSSPLELSEFLWVDFVVENSTGGGVAVTRPVTWQLEYPGQAPEAEKDKMVWEI LVSERDIRALIPLAKAEELVNTAPLTGVPQHVPVRLVTVDGGGALVEVTEHVGCESANTQVLQVSEACDA VFVAGKESRGARGVRVDFWWRRLRASLRLTVWAPLLPLRIELTDTTLEQVRGWRVPGPAEGPAEPAAEAS DEAERRARGCHLQYQRAGVRFLAPFAAHPLDGGRRLTHLLGPDWLLDVSHLVAPHARVLDSRVASLEGGR VVVGREPGVTSIEVRSPLSDSILGEQALAVTDDKVSVLELRVQPVMGISLTLSRGTAHPGEVTATCWAQS ALPAPKQEVALSLWLSFSDHTVAPAELYDRRDLGLSVSAEEPGAILPAEEQGAQLGVVVSGAGAEGLPLH VALHPPEPCRRGRHRVPLASGTAWLGLPPASTPAPALPSSPAWSPPATEATMGGKRQVAGSVGGNTGVRG KFERAEEEARKEETEAREEEEEEEEEMVPAPQHVTELELGMYALLGVFCVAIFIFLVNGVVFVLRYQRKE 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 CYS . 1 3 ALA . 1 4 ARG . 1 5 MET . 1 6 ALA . 1 7 GLY . 1 8 ARG . 1 9 THR . 1 10 THR . 1 11 ALA . 1 12 ALA . 1 13 PRO . 1 14 ARG . 1 15 GLY . 1 16 PRO . 1 17 TYR . 1 18 GLY . 1 19 PRO . 1 20 TRP . 1 21 LEU . 1 22 CYS . 1 23 LEU . 1 24 LEU . 1 25 VAL . 1 26 ALA . 1 27 LEU . 1 28 ALA . 1 29 LEU . 1 30 ASP . 1 31 VAL . 1 32 VAL . 1 33 ARG . 1 34 VAL . 1 35 ASP . 1 36 CYS . 1 37 GLY . 1 38 GLN . 1 39 ALA . 1 40 PRO . 1 41 LEU . 1 42 ASP . 1 43 PRO . 1 44 VAL . 1 45 TYR . 1 46 LEU . 1 47 HIS . 1 48 VAL . 1 49 THR . 1 50 ALA . 1 51 ALA . 1 52 ARG . 1 53 PRO . 1 54 ALA . 1 55 GLN . 1 56 PRO . 1 57 THR . 1 58 LEU . 1 59 TRP . 1 60 THR . 1 61 ALA . 1 62 LYS . 1 63 LEU . 1 64 ASP . 1 65 ARG . 1 66 PHE . 1 67 LYS . 1 68 GLY . 1 69 SER . 1 70 ARG . 1 71 HIS . 1 72 HIS . 1 73 THR . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 ILE . 1 77 THR . 1 78 CYS . 1 79 HIS . 1 80 ARG . 1 81 ALA . 1 82 GLY . 1 83 LEU . 1 84 THR . 1 85 GLU . 1 86 PRO . 1 87 ASP . 1 88 SER . 1 89 SER . 1 90 SER . 1 91 PRO . 1 92 LEU . 1 93 GLU . 1 94 LEU . 1 95 SER . 1 96 GLU . 1 97 PHE . 1 98 LEU . 1 99 TRP . 1 100 VAL . 1 101 ASP . 1 102 PHE . 1 103 VAL . 1 104 VAL . 1 105 GLU . 1 106 ASN . 1 107 SER . 1 108 THR . 1 109 GLY . 1 110 GLY . 1 111 GLY . 1 112 VAL . 1 113 ALA . 1 114 VAL . 1 115 THR . 1 116 ARG . 1 117 PRO . 1 118 VAL . 1 119 THR . 1 120 TRP . 1 121 GLN . 1 122 LEU . 1 123 GLU . 1 124 TYR . 1 125 PRO . 1 126 GLY . 1 127 GLN . 1 128 ALA . 1 129 PRO . 1 130 GLU . 1 131 ALA . 1 132 GLU . 1 133 LYS . 1 134 ASP . 1 135 LYS . 1 136 MET . 1 137 VAL . 1 138 TRP . 1 139 GLU . 1 140 ILE . 1 141 LEU . 1 142 VAL . 1 143 SER . 1 144 GLU . 1 145 ARG . 1 146 ASP . 1 147 ILE . 1 148 ARG . 1 149 ALA . 1 150 LEU . 1 151 ILE . 1 152 PRO . 1 153 LEU . 1 154 ALA . 1 155 LYS . 1 156 ALA . 1 157 GLU . 1 158 GLU . 1 159 LEU . 1 160 VAL . 1 161 ASN . 1 162 THR . 1 163 ALA . 1 164 PRO . 1 165 LEU . 1 166 THR . 1 167 GLY . 1 168 VAL . 1 169 PRO . 1 170 GLN . 1 171 HIS . 1 172 VAL . 1 173 PRO . 1 174 VAL . 1 175 ARG . 1 176 LEU . 1 177 VAL . 1 178 THR . 1 179 VAL . 1 180 ASP . 1 181 GLY . 1 182 GLY . 1 183 GLY . 1 184 ALA . 1 185 LEU . 1 186 VAL . 1 187 GLU . 1 188 VAL . 1 189 THR . 1 190 GLU . 1 191 HIS . 1 192 VAL . 1 193 GLY . 1 194 CYS . 1 195 GLU . 1 196 SER . 1 197 ALA . 1 198 ASN . 1 199 THR . 1 200 GLN . 1 201 VAL . 1 202 LEU . 1 203 GLN . 1 204 VAL . 1 205 SER . 1 206 GLU . 1 207 ALA . 1 208 CYS . 1 209 ASP . 1 210 ALA . 1 211 VAL . 1 212 PHE . 1 213 VAL . 1 214 ALA . 1 215 GLY . 1 216 LYS . 1 217 GLU . 1 218 SER . 1 219 ARG . 1 220 GLY . 1 221 ALA . 1 222 ARG . 1 223 GLY . 1 224 VAL . 1 225 ARG . 1 226 VAL . 1 227 ASP . 1 228 PHE . 1 229 TRP . 1 230 TRP . 1 231 ARG . 1 232 ARG . 1 233 LEU . 1 234 ARG . 1 235 ALA . 1 236 SER . 1 237 LEU . 1 238 ARG . 1 239 LEU . 1 240 THR . 1 241 VAL . 1 242 TRP . 1 243 ALA . 1 244 PRO . 1 245 LEU . 1 246 LEU . 1 247 PRO . 1 248 LEU . 1 249 ARG . 1 250 ILE . 1 251 GLU . 1 252 LEU . 1 253 THR . 1 254 ASP . 1 255 THR . 1 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A 1 580 GLU 580 ? ? ? A . A 1 581 GLU 581 ? ? ? A . A 1 582 GLU 582 ? ? ? A . A 1 583 GLU 583 ? ? ? A . A 1 584 GLU 584 ? ? ? A . A 1 585 GLU 585 ? ? ? A . A 1 586 GLU 586 ? ? ? A . A 1 587 MET 587 ? ? ? A . A 1 588 VAL 588 ? ? ? A . A 1 589 PRO 589 ? ? ? A . A 1 590 ALA 590 ? ? ? A . A 1 591 PRO 591 ? ? ? A . A 1 592 GLN 592 ? ? ? A . A 1 593 HIS 593 593 HIS HIS A . A 1 594 VAL 594 594 VAL VAL A . A 1 595 THR 595 595 THR THR A . A 1 596 GLU 596 596 GLU GLU A . A 1 597 LEU 597 597 LEU LEU A . A 1 598 GLU 598 598 GLU GLU A . A 1 599 LEU 599 599 LEU LEU A . A 1 600 GLY 600 600 GLY GLY A . A 1 601 MET 601 601 MET MET A . A 1 602 TYR 602 602 TYR TYR A . A 1 603 ALA 603 603 ALA ALA A . A 1 604 LEU 604 604 LEU LEU A . A 1 605 LEU 605 605 LEU LEU A . A 1 606 GLY 606 606 GLY GLY A . A 1 607 VAL 607 607 VAL VAL A . A 1 608 PHE 608 608 PHE PHE A . A 1 609 CYS 609 609 CYS CYS A . A 1 610 VAL 610 610 VAL VAL A . A 1 611 ALA 611 611 ALA ALA A . A 1 612 ILE 612 612 ILE ILE A . A 1 613 PHE 613 613 PHE PHE A . A 1 614 ILE 614 614 ILE ILE A . A 1 615 PHE 615 615 PHE PHE A . A 1 616 LEU 616 616 LEU LEU A . A 1 617 VAL 617 617 VAL VAL A . A 1 618 ASN 618 618 ASN ASN A . A 1 619 GLY 619 619 GLY GLY A . A 1 620 VAL 620 620 VAL VAL A . A 1 621 VAL 621 621 VAL VAL A . A 1 622 PHE 622 622 PHE PHE A . A 1 623 VAL 623 623 VAL VAL A . A 1 624 LEU 624 ? ? ? A . A 1 625 ARG 625 ? ? ? A . A 1 626 TYR 626 ? ? ? A . A 1 627 GLN 627 ? ? ? A . A 1 628 ARG 628 ? ? ? A . A 1 629 LYS 629 ? ? ? A . A 1 630 GLU 630 ? ? ? A . A 1 631 PRO 631 ? ? ? A . A 1 632 PRO 632 ? ? ? A . A 1 633 ASP 633 ? ? ? A . A 1 634 SER 634 ? ? ? A . A 1 635 ALA 635 ? ? ? A . A 1 636 THR 636 ? ? ? A . A 1 637 ASP 637 ? ? ? A . A 1 638 PRO 638 ? ? ? A . A 1 639 THR 639 ? ? ? A . A 1 640 SER 640 ? ? ? A . A 1 641 PRO 641 ? ? ? A . A 1 642 GLN 642 ? ? ? A . A 1 643 PRO 643 ? ? ? A . A 1 644 HIS 644 ? ? ? A . A 1 645 ASN 645 ? ? ? A . A 1 646 TRP 646 ? ? ? A . A 1 647 VAL 647 ? ? ? A . A 1 648 TRP 648 ? ? ? A . A 1 649 LEU 649 ? ? ? A . A 1 650 GLY 650 ? ? ? A . A 1 651 THR 651 ? ? ? A . A 1 652 ASP 652 ? ? ? A . A 1 653 GLN 653 ? ? ? A . A 1 654 GLU 654 ? ? ? A . A 1 655 GLU 655 ? ? ? A . A 1 656 LEU 656 ? ? ? A . A 1 657 SER 657 ? ? ? A . A 1 658 ARG 658 ? ? ? A . A 1 659 GLN 659 ? ? ? A . A 1 660 LEU 660 ? ? ? A . A 1 661 ASP 661 ? ? ? A . A 1 662 ARG 662 ? ? ? A . A 1 663 GLN 663 ? ? ? A . A 1 664 SER 664 ? ? ? A . A 1 665 PRO 665 ? ? ? A . A 1 666 GLY 666 ? ? ? A . A 1 667 PRO 667 ? ? ? A . A 1 668 PRO 668 ? ? ? A . A 1 669 LYS 669 ? ? ? A . A 1 670 GLY 670 ? ? ? A . A 1 671 GLU 671 ? ? ? A . A 1 672 GLY 672 ? ? ? A . A 1 673 SER 673 ? ? ? A . A 1 674 CYS 674 ? ? ? A . A 1 675 PRO 675 ? ? ? A . A 1 676 CYS 676 ? ? ? A . A 1 677 GLU 677 ? ? ? A . A 1 678 SER 678 ? ? ? A . A 1 679 GLY 679 ? ? ? A . A 1 680 GLY 680 ? ? ? A . A 1 681 GLY 681 ? ? ? A . A 1 682 GLY 682 ? ? ? A . A 1 683 GLU 683 ? ? ? A . A 1 684 ALA 684 ? ? ? A . A 1 685 PRO 685 ? ? ? A . A 1 686 THR 686 ? ? ? A . A 1 687 LEU 687 ? ? ? A . A 1 688 ALA 688 ? ? ? A . A 1 689 PRO 689 ? ? ? A . A 1 690 GLY 690 ? ? ? A . A 1 691 PRO 691 ? ? ? A . A 1 692 PRO 692 ? ? ? A . A 1 693 GLY 693 ? ? ? A . A 1 694 GLY 694 ? ? ? A . A 1 695 THR 695 ? ? ? A . A 1 696 THR 696 ? ? ? A . A 1 697 SER 697 ? ? ? A . A 1 698 SER 698 ? ? ? A . A 1 699 SER 699 ? ? ? A . A 1 700 SER 700 ? ? ? A . A 1 701 THR 701 ? ? ? A . A 1 702 LEU 702 ? ? ? A . A 1 703 ALA 703 ? ? ? A . A 1 704 ARG 704 ? ? ? A . A 1 705 LYS 705 ? ? ? A . A 1 706 GLU 706 ? ? ? A . A 1 707 ALA 707 ? ? ? A . A 1 708 GLY 708 ? ? ? A . A 1 709 GLY 709 ? ? ? A . A 1 710 ARG 710 ? ? ? A . A 1 711 ARG 711 ? ? ? A . A 1 712 LYS 712 ? ? ? A . A 1 713 ARG 713 ? ? ? A . A 1 714 VAL 714 ? ? ? A . A 1 715 GLU 715 ? ? ? A . A 1 716 PHE 716 ? ? ? A . A 1 717 VAL 717 ? ? ? A . A 1 718 THR 718 ? ? ? A . A 1 719 PHE 719 ? ? ? A . A 1 720 ALA 720 ? ? ? A . A 1 721 PRO 721 ? ? ? A . A 1 722 ALA 722 ? ? ? A . A 1 723 PRO 723 ? ? ? A . A 1 724 PRO 724 ? ? ? A . A 1 725 ALA 725 ? ? ? A . A 1 726 GLN 726 ? ? ? A . A 1 727 SER 727 ? ? ? A . A 1 728 PRO 728 ? ? ? A . A 1 729 GLU 729 ? ? ? A . A 1 730 GLU 730 ? ? ? A . A 1 731 PRO 731 ? ? ? A . A 1 732 VAL 732 ? ? ? A . A 1 733 GLY 733 ? ? ? A . A 1 734 ALA 734 ? ? ? A . A 1 735 PRO 735 ? ? ? A . A 1 736 ALA 736 ? ? ? A . A 1 737 VAL 737 ? ? ? A . A 1 738 GLN 738 ? ? ? A . A 1 739 SER 739 ? ? ? A . A 1 740 ILE 740 ? ? ? A . A 1 741 LEU 741 ? ? ? A . A 1 742 VAL 742 ? ? ? A . A 1 743 ALA 743 ? ? ? A . A 1 744 GLY 744 ? ? ? A . A 1 745 GLU 745 ? ? ? A . A 1 746 GLU 746 ? ? ? A . A 1 747 ASP 747 ? ? ? A . A 1 748 ILE 748 ? ? ? A . A 1 749 ARG 749 ? ? ? A . A 1 750 TRP 750 ? ? ? A . A 1 751 VAL 751 ? ? ? A . A 1 752 CYS 752 ? ? ? A . A 1 753 GLU 753 ? ? ? A . A 1 754 ASP 754 ? ? ? A . A 1 755 MET 755 ? ? ? A . A 1 756 GLY 756 ? ? ? A . A 1 757 LEU 757 ? ? ? A . A 1 758 LYS 758 ? ? ? A . A 1 759 ASP 759 ? ? ? A . A 1 760 PRO 760 ? ? ? A . A 1 761 GLU 761 ? ? ? A . A 1 762 GLU 762 ? ? ? A . A 1 763 LEU 763 ? ? ? A . A 1 764 ARG 764 ? ? ? A . A 1 765 ASN 765 ? ? ? A . A 1 766 TYR 766 ? ? ? A . A 1 767 MET 767 ? ? ? A . A 1 768 GLU 768 ? ? ? A . A 1 769 ARG 769 ? ? ? A . A 1 770 ILE 770 ? ? ? A . A 1 771 ARG 771 ? ? ? A . A 1 772 GLY 772 ? ? ? A . A 1 773 SER 773 ? ? ? A . A 1 774 SER 774 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Integrin alpha-IIb {PDB ID=2knc, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2knc.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2knc, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GAMGSEERAIPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFFKRNRPPLEEDDEEGE GAMGSEERAIPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFFKRNRPPLEEDDEEGE # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 9 39 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2knc 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 774 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 774 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 56.000 16.129 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MCARMAGRTTAAPRGPYGPWLCLLVALALDVVRVDCGQAPLDPVYLHVTAARPAQPTLWTAKLDRFKGSRHHTTLITCHRAGLTEPDSSSPLELSEFLWVDFVVENSTGGGVAVTRPVTWQLEYPGQAPEAEKDKMVWEILVSERDIRALIPLAKAEELVNTAPLTGVPQHVPVRLVTVDGGGALVEVTEHVGCESANTQVLQVSEACDAVFVAGKESRGARGVRVDFWWRRLRASLRLTVWAPLLPLRIELTDTTLEQVRGWRVPGPAEGPAEPAAEASDEAERRARGCHLQYQRAGVRFLAPFAAHPLDGGRRLTHLLGPDWLLDVSHLVAPHARVLDSRVASLEGGRVVVGREPGVTSIEVRSPLSDSILGEQALAVTDDKVSVLELRVQPVMGISLTLSRGTAHPGEVTATCWAQSALPAPKQEVALSLWLSFSDHTVAPAELYDRRDLGLSVSAEEPGAILPAEEQGAQLGVVVSGAGAEGLPLHVALHPPEPCRRGRHRVPLASGTAWLGLPPASTPAPALPSSPAWSPPATEATMGGKRQVAGSVGGNTGVRGKFERAEEEARKEETEAREEEEEEEEEMVPAPQHVTELELGMYALLGVFCVAIFIFLVNGVVFVLRYQRKEPPDSATDPTSPQPHNWVWLGTDQEELSRQLDRQSPGPPKGEGSCPCESGGGGEAPTLAPGPPGGTTSSSSTLARKEAGGRRKRVEFVTFAPAPPAQSPEEPVGAPAVQSILVAGEEDIRWVCEDMGLKDPEELRNYMERIRGSS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AIPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2knc.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.600 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 593 HIS 1 0.200 2 1 A 594 VAL 1 0.600 3 1 A 595 THR 1 0.510 4 1 A 596 GLU 1 0.510 5 1 A 597 LEU 1 0.520 6 1 A 598 GLU 1 0.540 7 1 A 599 LEU 1 0.560 8 1 A 600 GLY 1 0.640 9 1 A 601 MET 1 0.560 10 1 A 602 TYR 1 0.600 11 1 A 603 ALA 1 0.700 12 1 A 604 LEU 1 0.650 13 1 A 605 LEU 1 0.670 14 1 A 606 GLY 1 0.700 15 1 A 607 VAL 1 0.710 16 1 A 608 PHE 1 0.660 17 1 A 609 CYS 1 0.720 18 1 A 610 VAL 1 0.710 19 1 A 611 ALA 1 0.730 20 1 A 612 ILE 1 0.690 21 1 A 613 PHE 1 0.660 22 1 A 614 ILE 1 0.680 23 1 A 615 PHE 1 0.610 24 1 A 616 LEU 1 0.650 25 1 A 617 VAL 1 0.650 26 1 A 618 ASN 1 0.550 27 1 A 619 GLY 1 0.500 28 1 A 620 VAL 1 0.490 29 1 A 621 VAL 1 0.480 30 1 A 622 PHE 1 0.580 31 1 A 623 VAL 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #