data_SMR-6225b9bd9207b157472551f1118faa2e_2 _entry.id SMR-6225b9bd9207b157472551f1118faa2e_2 _struct.entry_id SMR-6225b9bd9207b157472551f1118faa2e_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9NRA8/ 4ET_HUMAN, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9NRA8' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 102928.079 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP 4ET_HUMAN Q9NRA8 1 ;MDRRSMGETESGDAFLDLKKPPASKCPHRYTKEELLDIKELPHSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASL YPASGRSSPVESLKKELDTDRPSLVRRIVGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPAADQEVPRDAVLPEQSPG DFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAIL SPGQNSGNYFAPIPLEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLK GLKVDQQVKNSTPFMAEHLEETLSAVTNNRQLKKDGDMTAFNKLVSTMKRNLESHLMSPAEIPGQPVPKN ILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEPTTSLLGQRAPSPPLSQVFQTRAASADYLRPRIPSPIGFTPGP QQLLGDPFQGMRKPMSPITAQQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQAANFYQPGFGKPQVDRTRDGFRNRQ QRVTKSPAPVHRGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESKEKSKEEPASGKAALGDSKEDTQKAS EENLLSSSSVPSADRDSSPTTNSKLSALQRSSCSTPLSQANRYTKEQDYRPKATGRKTPTLASPVPTTPF LRPVHQVPLVPHVPMVRPAHQLHPGLVQRMLAQGVHPQHLPSLLQTGVLPPGMDLSHLQGISGPILGQPF YPLPAASHPLLNPRPGTPLHLAMVQQQLQRSVLHPPGSGSHAAAVSVQTTPQNVPSRSGLPHMHSQLEHR PSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ ; 'Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 811 1 811 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 4ET_HUMAN Q9NRA8 Q9NRA8-2 1 811 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-08-02 B93D3AE24B15E7C0 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MDRRSMGETESGDAFLDLKKPPASKCPHRYTKEELLDIKELPHSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASL YPASGRSSPVESLKKELDTDRPSLVRRIVGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPAADQEVPRDAVLPEQSPG DFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAIL SPGQNSGNYFAPIPLEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLK GLKVDQQVKNSTPFMAEHLEETLSAVTNNRQLKKDGDMTAFNKLVSTMKRNLESHLMSPAEIPGQPVPKN ILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEPTTSLLGQRAPSPPLSQVFQTRAASADYLRPRIPSPIGFTPGP QQLLGDPFQGMRKPMSPITAQQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQAANFYQPGFGKPQVDRTRDGFRNRQ QRVTKSPAPVHRGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESKEKSKEEPASGKAALGDSKEDTQKAS EENLLSSSSVPSADRDSSPTTNSKLSALQRSSCSTPLSQANRYTKEQDYRPKATGRKTPTLASPVPTTPF LRPVHQVPLVPHVPMVRPAHQLHPGLVQRMLAQGVHPQHLPSLLQTGVLPPGMDLSHLQGISGPILGQPF YPLPAASHPLLNPRPGTPLHLAMVQQQLQRSVLHPPGSGSHAAAVSVQTTPQNVPSRSGLPHMHSQLEHR PSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ ; ;MDRRSMGETESGDAFLDLKKPPASKCPHRYTKEELLDIKELPHSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASL YPASGRSSPVESLKKELDTDRPSLVRRIVGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPAADQEVPRDAVLPEQSPG DFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAIL SPGQNSGNYFAPIPLEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLK GLKVDQQVKNSTPFMAEHLEETLSAVTNNRQLKKDGDMTAFNKLVSTMKRNLESHLMSPAEIPGQPVPKN ILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEPTTSLLGQRAPSPPLSQVFQTRAASADYLRPRIPSPIGFTPGP QQLLGDPFQGMRKPMSPITAQQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQAANFYQPGFGKPQVDRTRDGFRNRQ QRVTKSPAPVHRGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESKEKSKEEPASGKAALGDSKEDTQKAS EENLLSSSSVPSADRDSSPTTNSKLSALQRSSCSTPLSQANRYTKEQDYRPKATGRKTPTLASPVPTTPF LRPVHQVPLVPHVPMVRPAHQLHPGLVQRMLAQGVHPQHLPSLLQTGVLPPGMDLSHLQGISGPILGQPF YPLPAASHPLLNPRPGTPLHLAMVQQQLQRSVLHPPGSGSHAAAVSVQTTPQNVPSRSGLPHMHSQLEHR PSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 ARG . 1 4 ARG . 1 5 SER . 1 6 MET . 1 7 GLY . 1 8 GLU . 1 9 THR . 1 10 GLU . 1 11 SER . 1 12 GLY . 1 13 ASP . 1 14 ALA . 1 15 PHE . 1 16 LEU . 1 17 ASP . 1 18 LEU . 1 19 LYS . 1 20 LYS . 1 21 PRO . 1 22 PRO . 1 23 ALA . 1 24 SER . 1 25 LYS . 1 26 CYS . 1 27 PRO . 1 28 HIS . 1 29 ARG . 1 30 TYR . 1 31 THR . 1 32 LYS . 1 33 GLU . 1 34 GLU . 1 35 LEU . 1 36 LEU . 1 37 ASP . 1 38 ILE . 1 39 LYS . 1 40 GLU . 1 41 LEU . 1 42 PRO . 1 43 HIS . 1 44 SER . 1 45 LYS . 1 46 GLN 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LEU . 1 135 PRO . 1 136 GLU . 1 137 GLN . 1 138 SER . 1 139 PRO . 1 140 GLY . 1 141 ASP . 1 142 PHE . 1 143 ASP . 1 144 PHE . 1 145 ASN . 1 146 GLU . 1 147 PHE . 1 148 PHE . 1 149 ASN . 1 150 LEU . 1 151 ASP . 1 152 LYS . 1 153 VAL . 1 154 PRO . 1 155 CYS . 1 156 LEU . 1 157 ALA . 1 158 SER . 1 159 MET . 1 160 ILE . 1 161 GLU . 1 162 ASP . 1 163 VAL . 1 164 LEU . 1 165 GLY . 1 166 GLU . 1 167 GLY . 1 168 SER . 1 169 VAL . 1 170 SER . 1 171 ALA . 1 172 SER . 1 173 ARG . 1 174 PHE . 1 175 SER . 1 176 ARG . 1 177 TRP . 1 178 PHE . 1 179 SER . 1 180 ASN . 1 181 PRO . 1 182 SER . 1 183 ARG . 1 184 SER . 1 185 GLY . 1 186 SER . 1 187 ARG . 1 188 SER . 1 189 SER . 1 190 SER . 1 191 LEU . 1 192 GLY . 1 193 SER . 1 194 THR . 1 195 PRO . 1 196 HIS . 1 197 GLU . 1 198 GLU . 1 199 LEU . 1 200 GLU . 1 201 ARG . 1 202 LEU . 1 203 ALA . 1 204 GLY . 1 205 LEU . 1 206 GLU . 1 207 GLN . 1 208 ALA . 1 209 ILE . 1 210 LEU . 1 211 SER . 1 212 PRO . 1 213 GLY . 1 214 GLN . 1 215 ASN . 1 216 SER . 1 217 GLY 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# loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 37 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6f9w 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 811 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 811 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.2e-14 96.875 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDRRSMGETESGDAFLDLKKPPASKCPHRYTKEELLDIKELPHSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLYPASGRSSPVESLKKELDTDRPSLVRRIVGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPAADQEVPRDAVLPEQSPGDFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAILSPGQNSGNYFAPIPLEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQVKNSTPFMAEHLEETLSAVTNNRQLKKDGDMTAFNKLVSTMKRNLESHLMSPAEIPGQPVPKNILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEPTTSLLGQRAPSPPLSQVFQTRAASADYLRPRIPSPIGFTPGPQQLLGDPFQGMRKPMSPITAQQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQAANFYQPGFGKPQVDRTRDGFRNRQQRVTKSPAPVHRGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESKEKSKEEPASGKAALGDSKEDTQKASEENLLSSSSVPSADRDSSPTTNSKLSALQRSSCSTPLSQANRYTKEQDYRPKATGRKTPTLASPVPTTPFLRPVHQVPLVPHVPMVRPAHQLHPGLVQRMLAQGVHPQHLPSLLQTGVLPPGMDLSHLQGISGPILGQPFYPLPAASHPLLNPRPGTPLHLAMVQQQLQRSVLHPPGSGSHAAAVSVQTTPQNVPSRSGLPHMHSQLEHRPSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.021}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6f9w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 780 780 ? A 30.599 15.974 52.939 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 2 C CA . GLY 780 780 ? A 30.514 17.373 52.343 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 3 C C . GLY 780 780 ? A 29.124 17.955 52.365 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 4 O O . GLY 780 780 ? A 28.892 18.956 53.023 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 5 N N . LEU 781 781 ? A 28.137 17.300 51.709 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 6 C CA . LEU 781 781 ? A 26.743 17.721 51.714 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 7 C C . LEU 781 781 ? A 26.005 17.451 53.024 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 8 O O . LEU 781 781 ? A 24.951 18.018 53.279 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 9 C CB . LEU 781 781 ? A 26.002 17.002 50.564 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 10 C CG . LEU 781 781 ? A 26.342 17.521 49.152 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 781 781 ? A 25.583 16.662 48.128 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 781 781 ? A 25.956 19.004 48.971 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 13 N N . ALA 782 782 ? A 26.584 16.628 53.929 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 14 C CA . ALA 782 782 ? A 26.032 16.301 55.234 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 15 C C . ALA 782 782 ? A 25.877 17.504 56.163 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 16 O O . ALA 782 782 ? A 25.148 17.467 57.141 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 17 C CB . ALA 782 782 ? A 26.959 15.275 55.929 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 18 N N . LYS 783 783 ? A 26.552 18.628 55.836 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 19 C CA . LYS 783 783 ? A 26.399 19.897 56.510 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 20 C C . LYS 783 783 ? A 25.008 20.519 56.350 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 21 O O . LYS 783 783 ? A 24.595 21.344 57.162 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 22 C CB . LYS 783 783 ? A 27.445 20.880 55.926 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 23 C CG . LYS 783 783 ? A 27.686 22.109 56.816 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 24 C CD . LYS 783 783 ? A 28.694 23.083 56.185 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 25 C CE . LYS 783 783 ? A 29.202 24.173 57.135 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 26 N NZ . LYS 783 783 ? A 28.141 25.175 57.364 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 27 N N . TRP 784 784 ? A 24.271 20.150 55.276 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 28 C CA . TRP 784 784 ? A 22.984 20.733 54.952 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 29 C C . TRP 784 784 ? A 21.860 19.705 54.899 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 30 O O . TRP 784 784 ? A 20.687 20.063 54.973 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 31 C CB . TRP 784 784 ? A 23.066 21.393 53.548 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 32 C CG . TRP 784 784 ? A 24.302 22.258 53.337 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 33 C CD1 . TRP 784 784 ? A 25.360 22.034 52.500 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 34 C CD2 . TRP 784 784 ? A 24.607 23.473 54.052 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 35 N NE1 . TRP 784 784 ? A 26.303 23.039 52.627 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 36 C CE2 . TRP 784 784 ? A 25.841 23.938 53.572 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 37 C CE3 . TRP 784 784 ? A 23.904 24.170 55.032 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 38 C CZ2 . TRP 784 784 ? A 26.387 25.134 54.041 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 39 C CZ3 . TRP 784 784 ? A 24.456 25.367 55.516 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 40 C CH2 . TRP 784 784 ? A 25.672 25.853 55.018 1 1 B TRP 0.520 1 ATOM 41 N N . PHE 785 785 ? A 22.175 18.396 54.773 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 42 C CA . PHE 785 785 ? A 21.172 17.366 54.567 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 43 C C . PHE 785 785 ? A 21.302 16.303 55.628 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 44 O O . PHE 785 785 ? A 22.399 15.915 56.017 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 45 C CB . PHE 785 785 ? A 21.282 16.665 53.187 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 46 C CG . PHE 785 785 ? A 21.089 17.673 52.087 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 47 C CD1 . PHE 785 785 ? A 19.819 18.187 51.775 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 48 C CD2 . PHE 785 785 ? A 22.197 18.141 51.369 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 49 C CE1 . PHE 785 785 ? A 19.663 19.131 50.749 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 50 C CE2 . PHE 785 785 ? A 22.051 19.093 50.355 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 51 C CZ . PHE 785 785 ? A 20.781 19.581 50.036 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 52 N N . GLY 786 786 ? A 20.149 15.802 56.126 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 53 C CA . GLY 786 786 ? A 20.088 14.711 57.094 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 54 C C . GLY 786 786 ? A 20.722 13.415 56.661 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 55 O O . GLY 786 786 ? A 20.716 13.062 55.482 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 56 N N . SER 787 787 ? A 21.224 12.625 57.633 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 57 C CA . SER 787 787 ? A 21.944 11.381 57.395 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 58 C C . SER 787 787 ? A 21.142 10.341 56.640 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 59 O O . SER 787 787 ? A 21.650 9.737 55.703 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 60 C CB . SER 787 787 ? A 22.436 10.723 58.710 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 61 O OG . SER 787 787 ? A 23.030 11.716 59.548 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 62 N N . ASP 788 788 ? A 19.848 10.172 57.001 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 63 C CA . ASP 788 788 ? A 18.881 9.297 56.359 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 64 C C . ASP 788 788 ? A 18.636 9.634 54.886 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 65 O O . ASP 788 788 ? A 18.490 8.764 54.029 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 66 C CB . ASP 788 788 ? A 17.527 9.381 57.121 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 67 C CG . ASP 788 788 ? A 17.636 8.697 58.472 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 68 O OD1 . ASP 788 788 ? A 18.311 7.644 58.543 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 69 O OD2 . ASP 788 788 ? A 17.056 9.244 59.442 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 70 N N . VAL 789 789 ? A 18.602 10.943 54.544 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 71 C CA . VAL 789 789 ? A 18.379 11.431 53.187 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 72 C C . VAL 789 789 ? A 19.493 11.041 52.236 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 73 O O . VAL 789 789 ? A 19.231 10.601 51.124 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 74 C CB . VAL 789 789 ? A 18.164 12.942 53.132 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 75 C CG1 . VAL 789 789 ? A 17.988 13.425 51.669 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 76 C CG2 . VAL 789 789 ? A 16.900 13.272 53.954 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 77 N N . LEU 790 790 ? A 20.768 11.147 52.673 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 78 C CA . LEU 790 790 ? A 21.927 10.787 51.870 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 79 C C . LEU 790 790 ? A 22.051 9.283 51.635 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 80 O O . LEU 790 790 ? A 22.797 8.847 50.764 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 81 C CB . LEU 790 790 ? A 23.220 11.248 52.597 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 82 C CG . LEU 790 790 ? A 23.522 12.757 52.477 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 83 C CD1 . LEU 790 790 ? A 24.022 13.331 53.813 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 84 C CD2 . LEU 790 790 ? A 24.553 13.016 51.360 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 85 N N . GLN 791 791 ? A 21.342 8.463 52.437 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 86 C CA . GLN 791 791 ? A 21.347 7.019 52.347 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 87 C C . GLN 791 791 ? A 20.291 6.437 51.430 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 88 O O . GLN 791 791 ? A 20.571 5.525 50.656 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 89 C CB . GLN 791 791 ? A 21.106 6.439 53.753 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 90 C CG . GLN 791 791 ? A 22.318 6.684 54.670 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 91 C CD . GLN 791 791 ? A 22.018 6.204 56.083 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 92 O OE1 . GLN 791 791 ? A 21.054 5.502 56.353 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 93 N NE2 . GLN 791 791 ? A 22.913 6.572 57.031 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 94 N N . GLN 792 792 ? A 19.026 6.903 51.532 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 95 C CA . GLN 792 792 ? A 17.928 6.360 50.745 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 96 C C . GLN 792 792 ? A 18.070 6.542 49.223 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 97 O O . GLN 792 792 ? A 18.727 7.489 48.791 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 98 C CB . GLN 792 792 ? A 16.547 6.869 51.241 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 99 C CG . GLN 792 792 ? A 16.277 8.358 50.928 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 100 C CD . GLN 792 792 ? A 14.796 8.677 51.115 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 101 O OE1 . GLN 792 792 ? A 13.907 7.980 50.638 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 102 N NE2 . GLN 792 792 ? A 14.502 9.784 51.833 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 103 N N . PRO 793 793 ? A 17.520 5.690 48.346 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 104 C CA . PRO 793 793 ? A 17.529 5.925 46.903 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 105 C C . PRO 793 793 ? A 17.005 7.292 46.467 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 106 O O . PRO 793 793 ? A 15.922 7.697 46.886 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 107 C CB . PRO 793 793 ? A 16.687 4.775 46.300 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 108 C CG . PRO 793 793 ? A 16.548 3.750 47.436 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 109 C CD . PRO 793 793 ? A 16.597 4.617 48.693 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 110 N N . LEU 794 794 ? A 17.747 8.012 45.609 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 111 C CA . LEU 794 794 ? A 17.392 9.349 45.188 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 112 C C . LEU 794 794 ? A 16.977 9.301 43.729 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 113 O O . LEU 794 794 ? A 17.506 8.462 42.996 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 114 C CB . LEU 794 794 ? A 18.601 10.303 45.347 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 115 C CG . LEU 794 794 ? A 18.967 10.544 46.826 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 116 C CD1 . LEU 794 794 ? A 20.400 11.083 46.946 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 117 C CD2 . LEU 794 794 ? A 17.959 11.480 47.522 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 118 N N . PRO 795 795 ? A 16.048 10.128 43.239 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 119 C CA . PRO 795 795 ? A 15.863 10.372 41.811 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 120 C C . PRO 795 795 ? A 17.144 10.625 41.034 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 121 O O . PRO 795 795 ? A 18.037 11.313 41.529 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 122 C CB . PRO 795 795 ? A 14.886 11.565 41.725 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 123 C CG . PRO 795 795 ? A 14.202 11.592 43.099 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 124 C CD . PRO 795 795 ? A 15.290 11.080 44.043 1 1 B PRO 0.660 1 ATOM 125 N N . SER 796 796 ? A 17.261 10.081 39.810 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 126 C CA . SER 796 796 ? A 18.376 10.345 38.923 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 127 C C . SER 796 796 ? A 18.464 11.811 38.537 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 128 O O . SER 796 796 ? A 17.462 12.506 38.374 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 129 C CB . SER 796 796 ? A 18.355 9.422 37.669 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 130 O OG . SER 796 796 ? A 17.035 9.302 37.132 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 131 N N . MET 797 797 ? A 19.707 12.335 38.433 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 132 C CA . MET 797 797 ? A 19.975 13.714 38.068 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 133 C C . MET 797 797 ? A 19.415 14.016 36.676 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 134 O O . MET 797 797 ? A 19.530 13.133 35.821 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 135 C CB . MET 797 797 ? A 21.516 13.988 38.083 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 136 C CG . MET 797 797 ? A 21.955 15.441 38.364 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 137 S SD . MET 797 797 ? A 21.591 15.930 40.076 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 138 C CE . MET 797 797 ? A 22.584 17.448 40.114 1 1 B MET 0.600 1 ATOM 139 N N . PRO 798 798 ? A 18.802 15.155 36.343 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 140 C CA . PRO 798 798 ? A 18.490 15.506 34.962 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 141 C C . PRO 798 798 ? A 19.706 15.443 34.061 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 142 O O . PRO 798 798 ? A 20.828 15.665 34.520 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 143 C CB . PRO 798 798 ? A 17.872 16.916 35.045 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 144 C CG . PRO 798 798 ? A 18.427 17.489 36.355 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 145 C CD . PRO 798 798 ? A 18.525 16.257 37.259 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 146 N N . ALA 799 799 ? A 19.511 15.113 32.769 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 147 C CA . ALA 799 799 ? A 20.588 15.048 31.813 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 148 C C . ALA 799 799 ? A 21.310 16.381 31.686 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 149 O O . ALA 799 799 ? A 20.693 17.439 31.575 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 150 C CB . ALA 799 799 ? A 20.045 14.603 30.435 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 151 N N . LYS 800 800 ? A 22.654 16.366 31.728 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 152 C CA . LYS 800 800 ? A 23.425 17.577 31.566 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 153 C C . LYS 800 800 ? A 23.339 18.098 30.132 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 154 O O . LYS 800 800 ? A 23.819 17.490 29.175 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 155 C CB . LYS 800 800 ? A 24.886 17.402 32.066 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 156 C CG . LYS 800 800 ? A 25.705 16.334 31.320 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 157 C CD . LYS 800 800 ? A 27.138 16.211 31.853 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 158 C CE . LYS 800 800 ? A 27.986 15.266 30.996 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 159 N NZ . LYS 800 800 ? A 29.363 15.212 31.527 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 160 N N . VAL 801 801 ? A 22.686 19.253 29.950 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 161 C CA . VAL 801 801 ? A 22.466 19.837 28.647 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 162 C C . VAL 801 801 ? A 23.345 21.051 28.599 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 163 O O . VAL 801 801 ? A 23.148 22.012 29.342 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 164 C CB . VAL 801 801 ? A 21.003 20.205 28.425 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 165 C CG1 . VAL 801 801 ? A 20.827 21.004 27.114 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 166 C CG2 . VAL 801 801 ? A 20.182 18.898 28.363 1 1 B VAL 0.610 1 ATOM 167 N N . ILE 802 802 ? A 24.373 21.018 27.733 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 168 C CA . ILE 802 802 ? A 25.310 22.108 27.604 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 169 C C . ILE 802 802 ? A 25.108 22.829 26.295 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 170 O O . ILE 802 802 ? A 24.686 22.255 25.289 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 171 C CB . ILE 802 802 ? A 26.762 21.657 27.795 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 172 C CG1 . ILE 802 802 ? A 27.698 22.837 28.143 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 173 C CG2 . ILE 802 802 ? A 27.292 20.850 26.581 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 174 C CD1 . ILE 802 802 ? A 27.275 23.609 29.401 1 1 B ILE 0.610 1 ATOM 175 N N . SER 803 803 ? A 25.383 24.144 26.282 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 176 C CA . SER 803 803 ? A 25.384 24.943 25.077 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 177 C C . SER 803 803 ? A 26.770 24.898 24.452 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 178 O O . SER 803 803 ? A 27.777 24.685 25.130 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 179 C CB . SER 803 803 ? A 24.829 26.391 25.312 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 180 O OG . SER 803 803 ? A 25.791 27.337 25.783 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 181 N N . VAL 804 804 ? A 26.868 25.087 23.120 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 182 C CA . VAL 804 804 ? A 28.131 25.192 22.403 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 183 C C . VAL 804 804 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #