data_SMR-6abdd431c7fdf3c26fc2fed77b74e04e_4 _entry.id SMR-6abdd431c7fdf3c26fc2fed77b74e04e_4 _struct.entry_id SMR-6abdd431c7fdf3c26fc2fed77b74e04e_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9R1V6/ ADA22_MOUSE, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9R1V6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 110290.443 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ADA22_MOUSE Q9R1V6 1 ;MQAAAAASFWLLCVLGTCPLARCGRAGVASLKGLERGKENRFLERQSIIPLRLIYRLGGEDETQHNQLDT RVRGDPGGPQLTHVDKASFRVDAFGTSFVLDVLLNHELLSSGYVERQIEHGGKVVENKGGEHCYYQGQIR GNPVSFVALSTCHGLHGMFYDGNHTYLIEPEENEKSQESSHCHSVYKSRQFEFPLDDLPSEFQRVNITPP QFILKPRLKRRKRQLLRFPRNVEEETKYIELMIVNDHLMFKKHRLSVVYTNTYAKSVVNMADVIYKDQLK TRIVLVAMETWAADNKFAISENPLITLREFMKYRRDFIKEKADAVHLFSGSQFESSRSGAAYIGGICSLL RGGGVNEFGKTDLMAVTLAQSLAHNVGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNVEEY HDFLNSGGGACLFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECALEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCK KCKFQPLGTVCREAVNDCDIREICSGNSSQCAPNVHKMDGYSCDGTQGICFGGRCKTRDRQCKYIWGQKV TASDRYCYEKLNIEGTEKGNCGKDKDTWTQCNKRDVLCGYLLCTNIGNIPRLGELDGEITSTLVVQQGRT LNCSGAHVKLEEDVDLGYVEDGTPCGPQMMCLEHRCLPVASFNFSTCSSSKAGTVCSGNGVCSNELKCVC NRHWTGADCGTHFPHNDDAKTGITLSGNGVAGTNIIIGIIAGTILVLALILGITAWGYKNYREQRQLPQG DYVKKPGDGDSFYSDFPPGGSTNSASSSKKRSNGLSHSWSERIPDTKHISDICENGRPRSNSWQGNMGGN KKKIRGKRFRPRSNSTE ; 'Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 857 1 857 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ADA22_MOUSE Q9R1V6 Q9R1V6-4 1 857 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2006-05-02 CB88FB7000208E09 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MQAAAAASFWLLCVLGTCPLARCGRAGVASLKGLERGKENRFLERQSIIPLRLIYRLGGEDETQHNQLDT RVRGDPGGPQLTHVDKASFRVDAFGTSFVLDVLLNHELLSSGYVERQIEHGGKVVENKGGEHCYYQGQIR GNPVSFVALSTCHGLHGMFYDGNHTYLIEPEENEKSQESSHCHSVYKSRQFEFPLDDLPSEFQRVNITPP QFILKPRLKRRKRQLLRFPRNVEEETKYIELMIVNDHLMFKKHRLSVVYTNTYAKSVVNMADVIYKDQLK TRIVLVAMETWAADNKFAISENPLITLREFMKYRRDFIKEKADAVHLFSGSQFESSRSGAAYIGGICSLL RGGGVNEFGKTDLMAVTLAQSLAHNVGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNVEEY HDFLNSGGGACLFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECALEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCK KCKFQPLGTVCREAVNDCDIREICSGNSSQCAPNVHKMDGYSCDGTQGICFGGRCKTRDRQCKYIWGQKV TASDRYCYEKLNIEGTEKGNCGKDKDTWTQCNKRDVLCGYLLCTNIGNIPRLGELDGEITSTLVVQQGRT 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LEU . 1 69 ASP . 1 70 THR . 1 71 ARG . 1 72 VAL . 1 73 ARG . 1 74 GLY . 1 75 ASP . 1 76 PRO . 1 77 GLY . 1 78 GLY . 1 79 PRO . 1 80 GLN . 1 81 LEU . 1 82 THR . 1 83 HIS . 1 84 VAL . 1 85 ASP . 1 86 LYS . 1 87 ALA . 1 88 SER . 1 89 PHE . 1 90 ARG . 1 91 VAL . 1 92 ASP . 1 93 ALA . 1 94 PHE . 1 95 GLY . 1 96 THR . 1 97 SER . 1 98 PHE . 1 99 VAL . 1 100 LEU . 1 101 ASP . 1 102 VAL . 1 103 LEU . 1 104 LEU . 1 105 ASN . 1 106 HIS . 1 107 GLU . 1 108 LEU . 1 109 LEU . 1 110 SER . 1 111 SER . 1 112 GLY . 1 113 TYR . 1 114 VAL . 1 115 GLU . 1 116 ARG . 1 117 GLN . 1 118 ILE . 1 119 GLU . 1 120 HIS . 1 121 GLY . 1 122 GLY . 1 123 LYS . 1 124 VAL . 1 125 VAL . 1 126 GLU . 1 127 ASN . 1 128 LYS . 1 129 GLY . 1 130 GLY . 1 131 GLU . 1 132 HIS . 1 133 CYS . 1 134 TYR . 1 135 TYR . 1 136 GLN . 1 137 GLY . 1 138 GLN . 1 139 ILE . 1 140 ARG . 1 141 GLY . 1 142 ASN . 1 143 PRO . 1 144 VAL . 1 145 SER . 1 146 PHE . 1 147 VAL . 1 148 ALA . 1 149 LEU . 1 150 SER . 1 151 THR . 1 152 CYS . 1 153 HIS . 1 154 GLY . 1 155 LEU . 1 156 HIS . 1 157 GLY . 1 158 MET . 1 159 PHE . 1 160 TYR . 1 161 ASP . 1 162 GLY . 1 163 ASN . 1 164 HIS . 1 165 THR . 1 166 TYR . 1 167 LEU . 1 168 ILE . 1 169 GLU . 1 170 PRO . 1 171 GLU . 1 172 GLU . 1 173 ASN . 1 174 GLU . 1 175 LYS . 1 176 SER . 1 177 GLN . 1 178 GLU . 1 179 SER . 1 180 SER . 1 181 HIS . 1 182 CYS . 1 183 HIS . 1 184 SER . 1 185 VAL . 1 186 TYR . 1 187 LYS . 1 188 SER . 1 189 ARG . 1 190 GLN . 1 191 PHE . 1 192 GLU . 1 193 PHE . 1 194 PRO . 1 195 LEU . 1 196 ASP . 1 197 ASP . 1 198 LEU . 1 199 PRO . 1 200 SER . 1 201 GLU . 1 202 PHE . 1 203 GLN . 1 204 ARG . 1 205 VAL . 1 206 ASN . 1 207 ILE . 1 208 THR . 1 209 PRO . 1 210 PRO . 1 211 GLN . 1 212 PHE . 1 213 ILE . 1 214 LEU . 1 215 LYS . 1 216 PRO . 1 217 ARG . 1 218 LEU . 1 219 LYS . 1 220 ARG . 1 221 ARG . 1 222 LYS . 1 223 ARG . 1 224 GLN . 1 225 LEU . 1 226 LEU . 1 227 ARG . 1 228 PHE . 1 229 PRO . 1 230 ARG . 1 231 ASN . 1 232 VAL . 1 233 GLU . 1 234 GLU . 1 235 GLU . 1 236 THR . 1 237 LYS 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D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, green fluorescent protein {PDB ID=7phr, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=7phr.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7phr, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 4 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;FKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYKDKESTVQVHYR MCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRDPPVATMVSKGEELFTGVVPILVELDGDV NGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLSYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGY VQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIK VNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLG MDELYK ; ;FKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYKDKESTVQVHYR MCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRDPPVATMVSKGEELFTGVVPILVELDGDV NGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLSYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGY VQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIK VNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLG MDELYK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 81 117 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7phr 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 857 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 857 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 17.000 16.216 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQAAAAASFWLLCVLGTCPLARCGRAGVASLKGLERGKENRFLERQSIIPLRLIYRLGGEDETQHNQLDTRVRGDPGGPQLTHVDKASFRVDAFGTSFVLDVLLNHELLSSGYVERQIEHGGKVVENKGGEHCYYQGQIRGNPVSFVALSTCHGLHGMFYDGNHTYLIEPEENEKSQESSHCHSVYKSRQFEFPLDDLPSEFQRVNITPPQFILKPRLKRRKRQLLRFPRNVEEETKYIELMIVNDHLMFKKHRLSVVYTNTYAKSVVNMADVIYKDQLKTRIVLVAMETWAADNKFAISENPLITLREFMKYRRDFIKEKADAVHLFSGSQFESSRSGAAYIGGICSLLRGGGVNEFGKTDLMAVTLAQSLAHNVGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNVEEYHDFLNSGGGACLFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECALEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCKKCKFQPLGTVCREAVNDCDIREICSGNSSQCAPNVHKMDGYSCDGTQGICFGGRCKTRDRQCKYIWGQKVTASDRYCYEKLNIEGTEKGNCGKDKDTWTQCNKRDVLCGYLLCTNIGNIPRLGELDGEITSTLVVQQGRTLNCSGAHVKLEEDVDLGYVEDGTPCGPQMMCLEHRCLPVASFNFSTCSSSKAGTVCSGNGVCSNELKCVCNRHWTGADCGTHFPHNDDAKTGITLSGNGVAGTNIIIGIIAGTILVLALILGITAWGYKNYREQRQLPQGDYVKKPGDGDSFYSDFPPGGSTNSASSSKKRSNGLSHSWSERIPDTKHISDICENGRPRSNSWQGNMGGNKKKIRGKRFRPRSNSTE 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAG-HETGRDPPVAT-------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7phr.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASN 734 734 ? A 183.663 195.917 193.847 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 2 C CA . ASN 734 734 ? A 183.582 196.930 192.713 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 3 C C . ASN 734 734 ? A 184.859 197.117 191.923 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 4 O O . ASN 734 734 ? A 184.856 196.894 190.722 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 5 C CB . ASN 734 734 ? A 183.026 198.305 193.188 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 6 C CG . ASN 734 734 ? A 181.623 198.050 193.728 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 7 O OD1 . ASN 734 734 ? A 181.153 196.921 193.572 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 8 N ND2 . ASN 734 734 ? A 180.990 199.017 194.416 1 1 D ASN 0.330 1 ATOM 9 N N . ILE 735 735 ? A 185.996 197.468 192.566 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 10 C CA . ILE 735 735 ? A 187.285 197.589 191.882 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 11 C C . ILE 735 735 ? A 187.715 196.307 191.171 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 12 O O . ILE 735 735 ? A 188.103 196.350 190.010 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 13 C CB . ILE 735 735 ? A 188.356 198.067 192.857 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 14 C CG1 . ILE 735 735 ? A 188.018 199.496 193.352 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 15 C CG2 . ILE 735 735 ? A 189.754 198.042 192.198 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 16 C CD1 . ILE 735 735 ? A 188.885 199.961 194.528 1 1 D ILE 0.460 1 ATOM 17 N N . ILE 736 736 ? A 187.562 195.117 191.804 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 18 C CA . ILE 736 736 ? A 187.823 193.829 191.157 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 19 C C . ILE 736 736 ? A 187.044 193.643 189.855 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 20 O O . ILE 736 736 ? A 187.613 193.319 188.820 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 21 C CB . ILE 736 736 ? A 187.477 192.669 192.102 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 22 C CG1 . ILE 736 736 ? A 188.409 192.654 193.338 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 23 C CG2 . ILE 736 736 ? A 187.533 191.304 191.370 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 24 C CD1 . ILE 736 736 ? A 187.939 191.704 194.450 1 1 D ILE 0.350 1 ATOM 25 N N . ILE 737 737 ? A 185.723 193.920 189.861 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 26 C CA . ILE 737 737 ? A 184.861 193.855 188.685 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 27 C C . ILE 737 737 ? A 185.318 194.812 187.588 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 28 O O . ILE 737 737 ? A 185.419 194.433 186.424 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 29 C CB . ILE 737 737 ? A 183.406 194.142 189.079 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 30 C CG1 . ILE 737 737 ? A 182.865 193.026 190.010 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 31 C CG2 . ILE 737 737 ? A 182.507 194.298 187.828 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 32 C CD1 . ILE 737 737 ? A 181.519 193.361 190.668 1 1 D ILE 0.430 1 ATOM 33 N N . GLY 738 738 ? A 185.663 196.068 187.948 1 1 D GLY 0.500 1 ATOM 34 C CA . GLY 738 738 ? A 186.133 197.065 186.989 1 1 D GLY 0.500 1 ATOM 35 C C . GLY 738 738 ? A 187.485 196.762 186.377 1 1 D GLY 0.500 1 ATOM 36 O O . GLY 738 738 ? A 187.689 196.971 185.184 1 1 D GLY 0.500 1 ATOM 37 N N . ILE 739 739 ? A 188.436 196.223 187.177 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 38 C CA . ILE 739 739 ? A 189.723 195.721 186.693 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 39 C C . ILE 739 739 ? A 189.549 194.540 185.760 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 40 O O . ILE 739 739 ? A 190.090 194.531 184.656 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 41 C CB . ILE 739 739 ? A 190.675 195.319 187.836 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 42 C CG1 . ILE 739 739 ? A 191.123 196.590 188.600 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 43 C CG2 . ILE 739 739 ? A 191.899 194.511 187.320 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 44 C CD1 . ILE 739 739 ? A 192.059 196.336 189.790 1 1 D ILE 0.510 1 ATOM 45 N N . ILE 740 740 ? A 188.753 193.517 186.152 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 46 C CA . ILE 740 740 ? A 188.541 192.341 185.317 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 47 C C . ILE 740 740 ? A 187.848 192.711 184.015 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 48 O O . ILE 740 740 ? A 188.314 192.345 182.937 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 49 C CB . ILE 740 740 ? A 187.799 191.215 186.049 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 50 C CG1 . ILE 740 740 ? A 188.636 190.721 187.256 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 51 C CG2 . ILE 740 740 ? A 187.501 190.046 185.081 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 52 C CD1 . ILE 740 740 ? A 187.950 189.636 188.097 1 1 D ILE 0.560 1 ATOM 53 N N . ALA 741 741 ? A 186.764 193.517 184.070 1 1 D ALA 0.620 1 ATOM 54 C CA . ALA 741 741 ? A 186.057 193.970 182.890 1 1 D ALA 0.620 1 ATOM 55 C C . ALA 741 741 ? A 186.924 194.794 181.945 1 1 D ALA 0.620 1 ATOM 56 O O . ALA 741 741 ? A 186.951 194.541 180.743 1 1 D ALA 0.620 1 ATOM 57 C CB . ALA 741 741 ? A 184.807 194.773 183.303 1 1 D ALA 0.620 1 ATOM 58 N N . GLY 742 742 ? A 187.720 195.754 182.470 1 1 D GLY 0.620 1 ATOM 59 C CA . GLY 742 742 ? A 188.622 196.551 181.647 1 1 D GLY 0.620 1 ATOM 60 C C . GLY 742 742 ? A 189.730 195.745 181.015 1 1 D GLY 0.620 1 ATOM 61 O O . GLY 742 742 ? A 190.030 195.918 179.838 1 1 D GLY 0.620 1 ATOM 62 N N . THR 743 743 ? A 190.328 194.789 181.756 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 63 C CA . THR 743 743 ? A 191.309 193.842 181.211 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 64 C C . THR 743 743 ? A 190.725 192.966 180.113 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 65 O O . THR 743 743 ? A 191.322 192.832 179.048 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 66 C CB . THR 743 743 ? A 191.967 192.963 182.277 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 67 O OG1 . THR 743 743 ? A 192.701 193.776 183.179 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 68 C CG2 . THR 743 743 ? A 193.003 191.985 181.699 1 1 D THR 0.620 1 ATOM 69 N N . ILE 744 744 ? A 189.505 192.400 180.290 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 70 C CA . ILE 744 744 ? A 188.806 191.627 179.257 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 71 C C . ILE 744 744 ? A 188.542 192.449 177.997 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 72 O O . ILE 744 744 ? A 188.784 191.989 176.881 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 73 C CB . ILE 744 744 ? A 187.496 191.023 179.783 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 74 C CG1 . ILE 744 744 ? A 187.792 189.947 180.854 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 75 C CG2 . ILE 744 744 ? A 186.634 190.407 178.651 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 76 C CD1 . ILE 744 744 ? A 186.549 189.539 181.654 1 1 D ILE 0.640 1 ATOM 77 N N . LEU 745 745 ? A 188.089 193.713 178.142 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 78 C CA . LEU 745 745 ? A 187.902 194.634 177.029 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 79 C C . LEU 745 745 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #