data_SMR-58bdd0a1abb0944fc279061bf4209a94_3 _entry.id SMR-58bdd0a1abb0944fc279061bf4209a94_3 _struct.entry_id SMR-58bdd0a1abb0944fc279061bf4209a94_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BQI5/ SGIP1_HUMAN, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.016, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BQI5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 108206.657 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SGIP1_HUMAN Q9BQI5 1 ;MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLSQKKSNGAPNG FYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATV DELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLE SAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQS ATEVKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADS PAPGPLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSDGKTEAQRYQVICPSLQAGGNELDSYSGASSPARPATPLVPCRSTTPP PPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPS LVWFDRGKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGIT RHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYY NVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAV LPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAG YRFSLIKKRFAAGKYLADN ; 'SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 859 1 859 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SGIP1_HUMAN Q9BQI5 Q9BQI5-2 1 859 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-09-05 823A19AEAB727F86 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLSQKKSNGAPNG FYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATV DELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLE SAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQS ATEVKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADS PAPGPLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSDGKTEAQRYQVICPSLQAGGNELDSYSGASSPARPATPLVPCRSTTPP PPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPS LVWFDRGKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGIT RHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYY NVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAV LPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAG YRFSLIKKRFAAGKYLADN ; ;MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLSQKKSNGAPNG FYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATV DELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLE SAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQS ATEVKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADS PAPGPLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSDGKTEAQRYQVICPSLQAGGNELDSYSGASSPARPATPLVPCRSTTPP PPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPS LVWFDRGKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGIT RHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYY NVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAV LPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAG YRFSLIKKRFAAGKYLADN ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 MET . 1 3 GLU . 1 4 GLY . 1 5 LEU . 1 6 LYS . 1 7 LYS . 1 8 ARG . 1 9 THR . 1 10 ARG . 1 11 LYS . 1 12 ALA . 1 13 PHE . 1 14 GLY . 1 15 ILE . 1 16 ARG . 1 17 LYS . 1 18 LYS . 1 19 GLU . 1 20 LYS . 1 21 ASP . 1 22 THR . 1 23 ASP . 1 24 SER . 1 25 THR . 1 26 GLY . 1 27 SER . 1 28 PRO . 1 29 ASP . 1 30 ARG . 1 31 ASP . 1 32 GLY . 1 33 ILE . 1 34 GLN . 1 35 GLY . 1 36 LYS . 1 37 LYS . 1 38 LYS . 1 39 THR . 1 40 GLN . 1 41 LYS . 1 42 THR . 1 43 GLN . 1 44 LEU . 1 45 LEU . 1 46 LEU . 1 47 THR . 1 48 SER . 1 49 CYS . 1 50 PHE . 1 51 TRP . 1 52 LEU . 1 53 ARG . 1 54 ALA . 1 55 LEU . 1 56 SER . 1 57 LEU . 1 58 THR . 1 59 LEU . 1 60 SER . 1 61 GLN . 1 62 LYS . 1 63 LYS . 1 64 SER . 1 65 ASN . 1 66 GLY . 1 67 ALA . 1 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154 PRO . 1 155 SER . 1 156 PRO . 1 157 VAL . 1 158 ARG . 1 159 LYS . 1 160 SER . 1 161 PRO . 1 162 ARG . 1 163 ARG . 1 164 SER . 1 165 PRO . 1 166 GLY . 1 167 ALA . 1 168 ILE . 1 169 LYS . 1 170 ARG . 1 171 ASN . 1 172 LEU . 1 173 SER . 1 174 SER . 1 175 GLU . 1 176 GLU . 1 177 VAL . 1 178 ALA . 1 179 ARG . 1 180 PRO . 1 181 ARG . 1 182 ARG . 1 183 SER . 1 184 THR . 1 185 PRO . 1 186 THR . 1 187 PRO . 1 188 GLU . 1 189 LEU . 1 190 ILE . 1 191 SER . 1 192 LYS . 1 193 LYS . 1 194 PRO . 1 195 PRO . 1 196 ASP . 1 197 ASP . 1 198 THR . 1 199 THR . 1 200 ALA . 1 201 LEU . 1 202 ALA . 1 203 PRO . 1 204 LEU . 1 205 PHE . 1 206 GLY . 1 207 PRO . 1 208 PRO . 1 209 LEU . 1 210 GLU . 1 211 SER . 1 212 ALA . 1 213 PHE . 1 214 ASP . 1 215 GLU . 1 216 GLN . 1 217 LYS . 1 218 THR . 1 219 GLU . 1 220 VAL . 1 221 LEU . 1 222 LEU . 1 223 ASP . 1 224 GLN . 1 225 PRO . 1 226 GLU . 1 227 ILE . 1 228 TRP . 1 229 GLY . 1 230 SER . 1 231 GLY . 1 232 GLN . 1 233 PRO . 1 234 ILE . 1 235 ASN . 1 236 PRO . 1 237 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E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'F-BAR domain only protein 2 {PDB ID=7og1, label_asym_id=E, auth_asym_id=GGG, SMTL ID=7og1.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7og1, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 5 1 GGG # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSPEFNIPDVDEEGYSIKPETNQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELK VSIGNITLSPAISRHSPVQMNRNLSNEELTKSKPSAPPNEKGTSDLLAWDPLFGPSLDSSSSSSLTEFPG RPHHHHHHHHHH ; ;GSPEFNIPDVDEEGYSIKPETNQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELK VSIGNITLSPAISRHSPVQMNRNLSNEELTKSKPSAPPNEKGTSDLLAWDPLFGPSLDSSSSSSLTEFPG RPHHHHHHHHHH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 131 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7og1 2024-01-31 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 859 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 860 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.9e-28 50.400 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLSQKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGS-TKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATEVKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPPPTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSDGKTEAQRYQVICPSLQAGGNELDSYSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDRGKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------NIPDVDEEGYSIKPETNQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELKVSIGNITLSPAIS----RHSPVQMNRNLSNEELTKSKPSAPPNE----KGTSDLLAWDPLFGPSLDSSS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7og1.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ILE 123 123 ? A -5.692 45.723 6.892 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 2 C CA . ILE 123 123 ? A -6.409 46.350 8.049 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 3 C C . ILE 123 123 ? A -6.091 47.834 8.137 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 4 O O . ILE 123 123 ? A -4.923 48.207 8.132 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 5 C CB . ILE 123 123 ? A -6.103 45.549 9.325 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 6 C CG1 . ILE 123 123 ? A -4.626 45.069 9.450 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 7 C CG2 . ILE 123 123 ? A -7.097 44.363 9.391 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 8 C CD1 . ILE 123 123 ? A -4.276 44.513 10.840 1 1 E ILE 0.190 1 ATOM 9 N N . LYS 124 124 ? A -7.120 48.714 8.107 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 10 C CA . LYS 124 124 ? A -6.974 50.162 8.177 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 11 C C . LYS 124 124 ? A -6.962 50.640 9.622 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 12 O O . LYS 124 124 ? A -7.249 49.854 10.519 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 13 C CB . LYS 124 124 ? A -8.150 50.840 7.431 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 14 C CG . LYS 124 124 ? A -8.195 50.521 5.926 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 15 C CD . LYS 124 124 ? A -9.373 51.215 5.214 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 16 C CE . LYS 124 124 ? A -9.409 50.961 3.700 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 17 N NZ . LYS 124 124 ? A -10.562 51.653 3.074 1 1 E LYS 0.280 1 ATOM 18 N N . ILE 125 125 ? A -6.618 51.927 9.882 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 19 C CA . ILE 125 125 ? A -6.361 52.400 11.238 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 20 C C . ILE 125 125 ? A -6.598 53.920 11.292 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 21 O O . ILE 125 125 ? A -6.550 54.551 10.240 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 22 C CB . ILE 125 125 ? A -4.940 51.963 11.649 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 23 C CG1 . ILE 125 125 ? A -4.877 51.379 13.077 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 24 C CG2 . ILE 125 125 ? A -3.836 53.014 11.374 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 25 C CD1 . ILE 125 125 ? A -5.585 50.020 13.207 1 1 E ILE 0.410 1 ATOM 26 N N . LYS 126 126 ? A -6.886 54.565 12.471 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 27 C CA . LYS 126 126 ? A -7.102 56.022 12.501 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 28 C C . LYS 126 126 ? A -6.901 56.743 13.858 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 29 O O . LYS 126 126 ? A -6.880 56.086 14.892 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 30 C CB . LYS 126 126 ? A -8.498 56.419 11.927 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 31 C CG . LYS 126 126 ? A -8.402 57.105 10.550 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 32 C CD . LYS 126 126 ? A -9.277 58.365 10.451 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 33 C CE . LYS 126 126 ? A -9.137 59.119 9.121 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 34 N NZ . LYS 126 126 ? A -8.021 60.098 9.159 1 1 E LYS 0.560 1 ATOM 35 N N . PRO 127 127 ? A -6.757 58.097 13.895 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 36 C CA . PRO 127 127 ? A -6.564 58.834 15.142 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 37 C C . PRO 127 127 ? A -7.713 59.803 15.417 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 38 O O . PRO 127 127 ? A -8.745 59.768 14.755 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 39 C CB . PRO 127 127 ? A -5.265 59.587 14.828 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 40 C CG . PRO 127 127 ? A -5.458 60.045 13.381 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 41 C CD . PRO 127 127 ? A -6.252 58.889 12.765 1 1 E PRO 0.600 1 ATOM 42 N N . LEU 128 128 ? A -7.522 60.680 16.425 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 43 C CA . LEU 128 128 ? A -8.559 61.415 17.118 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 44 C C . LEU 128 128 ? A -8.430 62.933 17.010 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 45 O O . LEU 128 128 ? A -7.342 63.501 17.065 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 46 C CB . LEU 128 128 ? A -8.464 61.036 18.616 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 47 C CG . LEU 128 128 ? A -8.602 59.524 18.914 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 48 C CD1 . LEU 128 128 ? A -8.255 59.236 20.383 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 49 C CD2 . LEU 128 128 ? A -10.002 58.989 18.571 1 1 E LEU 0.540 1 ATOM 50 N N . GLN 129 129 ? A -9.577 63.627 16.853 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 51 C CA . GLN 129 129 ? A -9.692 65.067 17.000 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 52 C C . GLN 129 129 ? A -9.717 65.512 18.463 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 53 O O . GLN 129 129 ? A -9.759 64.707 19.389 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 54 C CB . GLN 129 129 ? A -10.988 65.568 16.322 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 55 C CG . GLN 129 129 ? A -11.096 65.273 14.808 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 56 C CD . GLN 129 129 ? A -10.050 66.051 14.014 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 57 O OE1 . GLN 129 129 ? A -9.963 67.277 14.099 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 58 N NE2 . GLN 129 129 ? A -9.227 65.351 13.202 1 1 E GLN 0.600 1 ATOM 59 N N . SER 130 130 ? A -9.666 66.840 18.696 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 60 C CA . SER 130 130 ? A -9.686 67.440 20.025 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 61 C C . SER 130 130 ? A -11.121 67.692 20.484 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 62 O O . SER 130 130 ? A -12.058 67.504 19.724 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 63 C CB . SER 130 130 ? A -8.803 68.718 20.105 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 64 O OG . SER 130 130 ? A -9.177 69.707 19.145 1 1 E SER 0.590 1 ATOM 65 N N . LYS 131 131 ? A -11.346 68.037 21.779 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 66 C CA . LYS 131 131 ? A -12.688 68.294 22.308 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 67 C C . LYS 131 131 ? A -13.230 69.692 22.026 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 68 O O . LYS 131 131 ? A -12.486 70.665 21.947 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 69 C CB . LYS 131 131 ? A -12.749 68.042 23.837 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 70 C CG . LYS 131 131 ? A -12.511 66.570 24.213 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 71 C CD . LYS 131 131 ? A -12.598 66.305 25.729 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 72 C CE . LYS 131 131 ? A -12.382 64.830 26.098 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 73 N NZ . LYS 131 131 ? A -12.457 64.634 27.567 1 1 E LYS 0.670 1 ATOM 74 N N . ASP 132 132 ? A -14.571 69.795 21.871 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 75 C CA . ASP 132 132 ? A -15.170 70.884 21.108 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 76 C C . ASP 132 132 ? A -15.326 72.289 21.704 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 77 O O . ASP 132 132 ? A -15.260 73.271 20.968 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 78 C CB . ASP 132 132 ? A -16.559 70.429 20.611 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 79 C CG . ASP 132 132 ? A -16.444 69.293 19.606 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 80 O OD1 . ASP 132 132 ? A -15.397 69.201 18.923 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 81 O OD2 . ASP 132 132 ? A -17.423 68.512 19.519 1 1 E ASP 0.590 1 ATOM 82 N N . ILE 133 133 ? A -15.605 72.401 23.022 1 1 E ILE 0.550 1 ATOM 83 C CA . ILE 133 133 ? A -15.659 73.614 23.867 1 1 E ILE 0.550 1 ATOM 84 C C . ILE 133 133 ? A -17.082 74.026 24.170 1 1 E ILE 0.550 1 ATOM 85 O O . ILE 133 133 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #