data_SMR-f6f91c9fc7bc389bc064ad268358bbd5_5
_entry.id SMR-f6f91c9fc7bc389bc064ad268358bbd5_5
_struct.entry_id SMR-f6f91c9fc7bc389bc064ad268358bbd5_5
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q8IWC1/ MA7D3_HUMAN, MAP7 domain-containing protein 3

Estimated model accuracy of this model is 0.004, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IWC1'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
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#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
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_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
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_software.type
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_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
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_ma_software_group.ordinal_id
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_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
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#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
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#
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_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
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1 polymer man . 114363.988 1 .
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_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
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1 1 UNP MA7D3_HUMAN Q8IWC1 1
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;
'MAP7 domain-containing protein 3'
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_struct_ref_seq.ref_id
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_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 876 1 876
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
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_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . MA7D3_HUMAN Q8IWC1 . 1 876 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-10-02
C149899FB0002B39
#
#
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_entity_poly.nstd_monomer
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_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no c
;MMADGAAAGAGGSPSLRELRARMVAAANEIAKERRKQDVVNRVATHSSNIRSTFKPVIDGSMLKNDIKQR
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;

;MMADGAAAGAGGSPSLRELRARMVAAANEIAKERRKQDVVNRVATHSSNIRSTFKPVIDGSMLKNDIKQR
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1 2 MET .
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A 1 529 ILE 529 ? ? ? c .
A 1 530 SER 530 ? ? ? c .
A 1 531 LYS 531 ? ? ? c .
A 1 532 GLN 532 ? ? ? c .
A 1 533 SER 533 ? ? ? c .
A 1 534 PRO 534 ? ? ? c .
A 1 535 GLN 535 ? ? ? c .
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A 1 537 SER 537 ? ? ? c .
A 1 538 PHE 538 ? ? ? c .
A 1 539 PRO 539 ? ? ? c .
A 1 540 TYR 540 ? ? ? c .
A 1 541 LYS 541 ? ? ? c .
A 1 542 ILE 542 ? ? ? c .
A 1 543 MET 543 ? ? ? c .
A 1 544 PRO 544 ? ? ? c .
A 1 545 ILE 545 ? ? ? c .
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A 1 659 ASN 659 ? ? ? c .
A 1 660 GLU 660 ? ? ? c .
A 1 661 THR 661 ? ? ? c .
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A 1 664 LYS 664 ? ? ? c .
A 1 665 LYS 665 ? ? ? c .
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A 1 698 GLU 698 698 GLU GLU c .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A {PDB ID=6zp4, label_asym_id=MA, auth_asym_id=A, SMTL ID=6zp4.1.c}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 6zp4, label_asym_id=MA'
'target-template alignment' .
4 'model 5' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
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4 2 7
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7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
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_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
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_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
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1.000000 0 0 0
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_ma_template_details.template_origin
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_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
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_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A MA 39 1 A
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#
loop_
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_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEG
LYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKMAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDR
TDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQR
HHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVS
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IKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFER
AKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQS
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LREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWRKGPEADSEWR
RGPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRR
GADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWRHADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRR
GGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPW
RNADDDRIPRRGAEDDRGPWRNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSRPGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWG
PPRESRPSEEREWDREKERDRDNQDREENDKDPERERDRERDVDREDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWR
DSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRV
PPPALSRDRERDRDREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTVRR
;

;MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEG
LYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKMAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDR
TDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQR
HHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVS
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LREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDSSLSRKDSRWGDRDSEGTWRKGPEADSEWR
RGPPEKEWRRGEGRDEDRSHRRDEERPRRLGDDEDREPSLRPDDDRVPRRGMDDDRGPRRGPEEDRFSRR
GADDDRPSWRNTDDDRPPRRIADEDRGNWRHADDDRPPRRGLDEDRGSWRTADEDRGPRRGMDDDRGPRR
GGADDERSSWRNADDDRGPRRGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPW
RNADDDRIPRRGAEDDRGPWRNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSRPGPWRPLVKPGGWREKEKAREESWG
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DSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRERRDLRDDRDRRGPPLRSEREEVSSWRRADDRKDDRVEERDPPRRV
PPPALSRDRERDRDREREGEKEKASWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTVRR
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 674 707
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 6zp4 2024-05-01
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 876
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 878 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.220 37.500
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
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2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6zp4.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
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ATOM 3 C C . GLN 687 687 ? A 245.882 94.832 213.633 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 4 O O . GLN 687 687 ? A 246.433 93.940 213.001 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 5 C CB . GLN 687 687 ? A 243.467 94.801 214.504 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 6 C CG . GLN 687 687 ? A 242.863 94.307 213.157 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 7 C CD . GLN 687 687 ? A 242.978 92.788 213.031 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 8 O OE1 . GLN 687 687 ? A 242.757 92.081 214.019 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 9 N NE2 . GLN 687 687 ? A 243.368 92.268 211.857 1 1 c GLN 0.640 1
ATOM 10 N N . GLU 688 688 ? A 246.196 96.118 213.398 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 11 C CA . GLU 688 688 ? A 247.086 96.552 212.336 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 12 C C . GLU 688 688 ? A 248.458 95.922 212.410 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 13 O O . GLU 688 688 ? A 248.956 95.389 211.425 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 14 C CB . GLU 688 688 ? A 247.237 98.075 212.408 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 15 C CG . GLU 688 688 ? A 245.925 98.814 212.078 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 16 C CD . GLU 688 688 ? A 246.103 100.327 212.171 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 17 O OE1 . GLU 688 688 ? A 247.211 100.773 212.566 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 18 O OE2 . GLU 688 688 ? A 245.117 101.032 211.851 1 1 c GLU 0.770 1
ATOM 19 N N . GLU 689 689 ? A 249.070 95.869 213.607 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 20 C CA . GLU 689 689 ? A 250.317 95.164 213.827 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 21 C C . GLU 689 689 ? A 250.267 93.674 213.479 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 22 O O . GLU 689 689 ? A 251.143 93.153 212.806 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 23 C CB . GLU 689 689 ? A 250.837 95.416 215.269 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 24 C CG . GLU 689 689 ? A 251.143 96.907 215.562 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 25 C CD . GLU 689 689 ? A 252.003 97.502 214.450 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 26 O OE1 . GLU 689 689 ? A 253.091 96.943 214.173 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 27 O OE2 . GLU 689 689 ? A 251.557 98.494 213.817 1 1 c GLU 0.660 1
ATOM 28 N N . ALA 690 690 ? A 249.183 92.964 213.857 1 1 c ALA 0.710 1
ATOM 29 C CA . ALA 690 690 ? A 248.941 91.579 213.489 1 1 c ALA 0.710 1
ATOM 30 C C . ALA 690 690 ? A 248.840 91.360 211.972 1 1 c ALA 0.710 1
ATOM 31 O O . ALA 690 690 ? A 249.430 90.418 211.435 1 1 c ALA 0.710 1
ATOM 32 C CB . ALA 690 690 ? A 247.650 91.088 214.183 1 1 c ALA 0.710 1
ATOM 33 N N . ASP 691 691 ? A 248.133 92.257 211.250 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 34 C CA . ASP 691 691 ? A 248.059 92.326 209.799 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 35 C C . ASP 691 691 ? A 249.409 92.584 209.151 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 36 O O . ASP 691 691 ? A 249.771 91.944 208.172 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 37 C CB . ASP 691 691 ? A 247.046 93.414 209.359 1 1 c ASP 0.680 1
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ATOM 39 O OD1 . ASP 691 691 ? A 245.405 91.747 209.877 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 40 O OD2 . ASP 691 691 ? A 244.770 93.870 209.902 1 1 c ASP 0.680 1
ATOM 41 N N . LYS 692 692 ? A 250.219 93.504 209.717 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 42 C CA . LYS 692 692 ? A 251.584 93.754 209.277 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 43 C C . LYS 692 692 ? A 252.465 92.519 209.369 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 44 O O . LYS 692 692 ? A 253.147 92.177 208.407 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 45 C CB . LYS 692 692 ? A 252.244 94.914 210.060 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 46 C CG . LYS 692 692 ? A 251.640 96.289 209.750 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 47 C CD . LYS 692 692 ? A 252.229 97.361 210.674 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 48 C CE . LYS 692 692 ? A 251.560 98.727 210.541 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 49 N NZ . LYS 692 692 ? A 252.126 99.636 211.549 1 1 c LYS 0.670 1
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ATOM 51 C CA . ARG 693 693 ? A 253.109 90.519 210.677 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 52 C C . ARG 693 693 ? A 252.740 89.439 209.682 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 53 O O . ARG 693 693 ? A 253.584 88.709 209.180 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 54 C CB . ARG 693 693 ? A 252.906 89.956 212.110 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 55 C CG . ARG 693 693 ? A 253.470 90.836 213.242 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 56 C CD . ARG 693 693 ? A 254.854 91.376 212.918 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 57 N NE . ARG 693 693 ? A 255.331 92.147 214.086 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 58 C CZ . ARG 693 693 ? A 256.429 92.905 213.988 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 59 N NH1 . ARG 693 693 ? A 257.159 92.950 212.880 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 60 N NH2 . ARG 693 693 ? A 256.784 93.648 215.033 1 1 c ARG 0.630 1
ATOM 61 N N . LYS 694 694 ? A 251.442 89.333 209.347 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 62 C CA . LYS 694 694 ? A 251.002 88.482 208.262 1 1 c LYS 0.670 1
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ATOM 64 O O . LYS 694 694 ? A 252.097 88.069 206.182 1 1 c LYS 0.670 1
ATOM 65 C CB . LYS 694 694 ? A 249.471 88.443 208.225 1 1 c LYS 0.670 1
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ATOM 77 C CE . LYS 695 695 ? A 248.752 94.558 204.889 1 1 c LYS 0.670 1
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ATOM 79 N N . GLU 696 696 ? A 254.372 90.629 206.333 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 80 C CA . GLU 696 696 ? A 255.778 90.272 206.458 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 81 C C . GLU 696 696 ? A 256.006 88.788 206.167 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 82 O O . GLU 696 696 ? A 256.881 88.424 205.375 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 83 C CB . GLU 696 696 ? A 256.316 90.620 207.884 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 84 C CG . GLU 696 696 ? A 256.434 92.143 208.198 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 85 C CD . GLU 696 696 ? A 256.758 92.516 209.651 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 86 O OE1 . GLU 696 696 ? A 256.650 91.657 210.564 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 87 O OE2 . GLU 696 696 ? A 257.099 93.702 209.893 1 1 c GLU 0.670 1
ATOM 88 N N . HIS 697 697 ? A 255.158 87.905 206.744 1 1 c HIS 0.610 1
ATOM 89 C CA . HIS 697 697 ? A 255.136 86.468 206.507 1 1 c HIS 0.610 1
ATOM 90 C C . HIS 697 697 ? A 254.874 86.125 205.040 1 1 c HIS 0.610 1
ATOM 91 O O . HIS 697 697 ? A 255.561 85.294 204.451 1 1 c HIS 0.610 1
ATOM 92 C CB . HIS 697 697 ? A 254.115 85.764 207.442 1 1 c HIS 0.610 1
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ATOM 105 O OE1 . GLU 698 698 ? A 249.980 88.813 202.123 1 1 c GLU 0.610 1
ATOM 106 O OE2 . GLU 698 698 ? A 248.738 87.369 203.276 1 1 c GLU 0.610 1
ATOM 107 N N . ARG 699 699 ? A 255.584 88.066 202.410 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 108 C CA . ARG 699 699 ? A 256.777 88.430 201.669 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 109 C C . ARG 699 699 ? A 257.859 87.361 201.719 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 110 O O . ARG 699 699 ? A 258.437 87.026 200.688 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 111 C CB . ARG 699 699 ? A 257.347 89.788 202.136 1 1 c ARG 0.540 1
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ATOM 113 C CD . ARG 699 699 ? A 256.985 92.284 202.325 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 114 N NE . ARG 699 699 ? A 256.023 93.372 201.960 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 115 C CZ . ARG 699 699 ? A 256.176 94.643 202.358 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 116 N NH1 . ARG 699 699 ? A 257.223 95.006 203.092 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 117 N NH2 . ARG 699 699 ? A 255.283 95.568 202.016 1 1 c ARG 0.540 1
ATOM 118 N N . ILE 700 700 ? A 258.124 86.768 202.903 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 119 C CA . ILE 700 700 ? A 259.097 85.695 203.067 1 1 c ILE 0.550 1
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ATOM 121 O O . ILE 700 700 ? A 259.485 83.892 201.533 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 122 C CB . ILE 700 700 ? A 259.339 85.385 204.548 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 123 C CG1 . ILE 700 700 ? A 259.985 86.625 205.215 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 124 C CG2 . ILE 700 700 ? A 260.241 84.139 204.725 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 125 C CD1 . ILE 700 700 ? A 260.054 86.544 206.745 1 1 c ILE 0.550 1
ATOM 126 N N . MET 701 701 ? A 257.399 84.061 202.312 1 1 c MET 0.500 1
ATOM 127 C CA . MET 701 701 ? A 256.893 82.930 201.554 1 1 c MET 0.500 1
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ATOM 130 C CB . MET 701 701 ? A 255.447 82.571 201.977 1 1 c MET 0.500 1
ATOM 131 C CG . MET 701 701 ? A 255.346 82.059 203.432 1 1 c MET 0.500 1
ATOM 132 S SD . MET 701 701 ? A 256.415 80.636 203.840 1 1 c MET 0.500 1
ATOM 133 C CE . MET 701 701 ? A 255.625 79.425 202.745 1 1 c MET 0.500 1
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ATOM 137 O O . LEU 702 702 ? A 258.813 84.199 196.621 1 1 c LEU 0.500 1
ATOM 138 C CB . LEU 702 702 ? A 256.357 85.999 197.757 1 1 c LEU 0.500 1
ATOM 139 C CG . LEU 702 702 ? A 254.817 86.035 197.862 1 1 c LEU 0.500 1
ATOM 140 C CD1 . LEU 702 702 ? A 254.315 87.474 197.669 1 1 c LEU 0.500 1
ATOM 141 C CD2 . LEU 702 702 ? A 254.122 85.070 196.884 1 1 c LEU 0.500 1
ATOM 142 N N . GLN 703 703 ? A 259.382 85.089 198.583 1 1 c GLN 0.480 1
ATOM 143 C CA . GLN 703 703 ? A 260.815 85.011 198.334 1 1 c GLN 0.480 1
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ATOM 147 C CG . GLN 703 703 ? A 261.326 87.391 199.063 1 1 c GLN 0.480 1
ATOM 148 C CD . GLN 703 703 ? A 262.062 88.245 200.089 1 1 c GLN 0.480 1
ATOM 149 O OE1 . GLN 703 703 ? A 262.396 87.829 201.189 1 1 c GLN 0.480 1
ATOM 150 N NE2 . GLN 703 703 ? A 262.331 89.518 199.705 1 1 c GLN 0.480 1
ATOM 151 N N . ASN 704 704 ? A 260.798 82.713 199.199 1 1 c ASN 0.480 1
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ATOM 153 C C . ASN 704 704 ? A 260.552 80.492 198.143 1 1 c ASN 0.480 1
ATOM 154 O O . ASN 704 704 ? A 260.490 79.263 198.194 1 1 c ASN 0.480 1
ATOM 155 C CB . ASN 704 704 ? A 260.628 80.662 200.599 1 1 c ASN 0.480 1
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ATOM 157 O OD1 . ASN 704 704 ? A 262.540 81.597 201.746 1 1 c ASN 0.480 1
ATOM 158 N ND2 . ASN 704 704 ? A 260.710 81.163 202.980 1 1 c ASN 0.480 1
ATOM 159 N N . LEU 705 705 ? A 260.112 81.156 197.061 1 1 c LEU 0.420 1
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ATOM 164 C CG . LEU 705 705 ? A 258.494 81.011 193.595 1 1 c LEU 0.420 1
ATOM 165 C CD1 . LEU 705 705 ? A 257.275 80.123 193.892 1 1 c LEU 0.420 1
ATOM 166 C CD2 . LEU 705 705 ? A 258.142 82.155 192.637 1 1 c LEU 0.420 1
ATOM 167 N N . GLN 706 706 ? A 260.865 78.443 195.358 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 168 C CA . GLN 706 706 ? A 261.854 77.572 194.776 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 169 C C . GLN 706 706 ? A 261.558 77.263 193.327 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 170 O O . GLN 706 706 ? A 261.036 76.219 192.955 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 171 C CB . GLN 706 706 ? A 262.066 76.272 195.566 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 172 C CG . GLN 706 706 ? A 263.278 75.472 195.028 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 173 C CD . GLN 706 706 ? A 263.589 74.270 195.915 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 174 O OE1 . GLN 706 706 ? A 263.616 74.400 197.137 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 175 N NE2 . GLN 706 706 ? A 263.860 73.085 195.323 1 1 c GLN 0.430 1
ATOM 176 N N . GLU 707 707 ? A 261.920 78.210 192.461 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 177 C CA . GLU 707 707 ? A 261.724 78.035 191.052 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 178 C C . GLU 707 707 ? A 262.972 78.368 190.243 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 179 O O . GLU 707 707 ? A 263.137 77.943 189.101 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 180 C CB . GLU 707 707 ? A 260.629 78.976 190.576 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 181 C CG . GLU 707 707 ? A 259.153 78.593 190.785 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 182 C CD . GLU 707 707 ? A 258.312 79.450 189.815 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 183 O OE1 . GLU 707 707 ? A 257.117 79.681 190.106 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 184 O OE2 . GLU 707 707 ? A 258.873 79.863 188.748 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 185 N N . ARG 708 708 ? A 263.898 79.162 190.808 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 186 C CA . ARG 708 708 ? A 265.192 79.416 190.204 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 187 C C . ARG 708 708 ? A 266.128 78.219 190.259 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 188 O O . ARG 708 708 ? A 266.914 78.009 189.348 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 189 C CB . ARG 708 708 ? A 265.878 80.636 190.847 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 190 C CG . ARG 708 708 ? A 265.167 81.966 190.539 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 191 C CD . ARG 708 708 ? A 265.872 83.134 191.224 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 192 N NE . ARG 708 708 ? A 265.133 84.386 190.869 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 193 C CZ . ARG 708 708 ? A 265.435 85.584 191.390 1 1 c ARG 0.400 1
ATOM 194 N NH1 . ARG 708 708 ? A 266.423 85.718 192.269 1 1 c ARG 0.400 1
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ATOM 196 N N . LEU 709 709 ? A 266.048 77.414 191.342 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 197 C CA . LEU 709 709 ? A 266.836 76.204 191.507 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 198 C C . LEU 709 709 ? A 266.398 75.059 190.614 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 199 O O . LEU 709 709 ? A 267.218 74.236 190.256 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 200 C CB . LEU 709 709 ? A 266.820 75.712 192.974 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 201 C CG . LEU 709 709 ? A 267.504 76.658 193.981 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 202 C CD1 . LEU 709 709 ? A 267.319 76.129 195.412 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 203 C CD2 . LEU 709 709 ? A 269.003 76.823 193.675 1 1 c LEU 0.390 1
ATOM 204 N N . GLU 710 710 ? A 265.102 74.998 190.238 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 205 C CA . GLU 710 710 ? A 264.596 73.981 189.332 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 206 C C . GLU 710 710 ? A 264.880 74.268 187.859 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 207 O O . GLU 710 710 ? A 264.926 73.376 187.021 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 208 C CB . GLU 710 710 ? A 263.060 73.854 189.492 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 209 C CG . GLU 710 710 ? A 262.554 73.412 190.891 1 1 c GLU 0.450 1
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ATOM 211 O OE1 . GLU 710 710 ? A 263.404 71.169 190.816 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 212 O OE2 . GLU 710 710 ? A 263.752 72.374 192.661 1 1 c GLU 0.450 1
ATOM 213 N N . ARG 711 711 ? A 265.033 75.561 187.493 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 214 C CA . ARG 711 711 ? A 265.448 75.951 186.156 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 215 C C . ARG 711 711 ? A 266.949 75.837 185.895 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 216 O O . ARG 711 711 ? A 267.355 75.663 184.749 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 217 C CB . ARG 711 711 ? A 265.028 77.412 185.852 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 218 C CG . ARG 711 711 ? A 263.505 77.615 185.706 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 219 C CD . ARG 711 711 ? A 263.136 79.064 185.360 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 220 N NE . ARG 711 711 ? A 261.632 79.171 185.207 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 221 C CZ . ARG 711 711 ? A 260.811 79.579 186.189 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 222 N NH1 . ARG 711 711 ? A 261.262 79.863 187.392 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 223 N NH2 . ARG 711 711 ? A 259.486 79.661 186.068 1 1 c ARG 0.430 1
ATOM 224 N N . LYS 712 712 ? A 267.781 75.997 186.940 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 225 C CA . LYS 712 712 ? A 269.222 75.863 186.876 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 226 C C . LYS 712 712 ? A 269.691 74.410 187.186 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 227 O O . LYS 712 712 ? A 268.854 73.578 187.615 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 228 C CB . LYS 712 712 ? A 269.849 76.903 187.852 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 229 C CG . LYS 712 712 ? A 271.381 76.967 187.792 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 230 C CD . LYS 712 712 ? A 272.020 78.073 188.635 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 231 C CE . LYS 712 712 ? A 273.542 77.997 188.543 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 232 N NZ . LYS 712 712 ? A 274.138 79.051 189.384 1 1 c LYS 0.440 1
ATOM 233 O OXT . LYS 712 712 ? A 270.902 74.117 186.968 1 1 c LYS 0.440 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.556
2 1 3 0.004
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 687 GLN 1 0.640
2 1 A 688 GLU 1 0.770
3 1 A 689 GLU 1 0.660
4 1 A 690 ALA 1 0.710
5 1 A 691 ASP 1 0.680
6 1 A 692 LYS 1 0.670
7 1 A 693 ARG 1 0.630
8 1 A 694 LYS 1 0.670
9 1 A 695 LYS 1 0.670
10 1 A 696 GLU 1 0.670
11 1 A 697 HIS 1 0.610
12 1 A 698 GLU 1 0.610
13 1 A 699 ARG 1 0.540
14 1 A 700 ILE 1 0.550
15 1 A 701 MET 1 0.500
16 1 A 702 LEU 1 0.500
17 1 A 703 GLN 1 0.480
18 1 A 704 ASN 1 0.480
19 1 A 705 LEU 1 0.420
20 1 A 706 GLN 1 0.430
21 1 A 707 GLU 1 0.450
22 1 A 708 ARG 1 0.400
23 1 A 709 LEU 1 0.390
24 1 A 710 GLU 1 0.450
25 1 A 711 ARG 1 0.430
26 1 A 712 LYS 1 0.440
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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