data_SMR-7e6f49a37996499568aea35b106a676c_1 _entry.id SMR-7e6f49a37996499568aea35b106a676c_1 _struct.entry_id SMR-7e6f49a37996499568aea35b106a676c_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5SVT3/ ETAA1_MOUSE, Ewing's tumor-associated antigen 1 homolog Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5SVT3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 112467.488 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ETAA1_MOUSE Q5SVT3 1 ;MQLKDGGTGMSRRRKHADSPARRSTPHRAAAKNCRPAAEPWLRESRAACSSQLRRAGTRSARRAQRQAAA DGGRSPRGKETPVQIVKMDLLSCTFSSPNDPDGQTDIFWDQNSPMTKQLGKGRKKQISSAYSDEISHIVN RIAPQDEKPVTNSMLGVWIGETAIPCTPGVAKEKSRVKASCTKLKTKNREKELMKLAQQFDKNMEELDVI QEQDGKNHDFIQMTSKMGHLDNHKDSVQKPSGDVVPEITCTPVKKQMKGDSRISLAKAQDSSQKPFDQNV EAAFNAIFDGSTQMCSGQLSQDLLDAFLNNSKTSLRKKNALLQEEIITTETLLTENLLNKTPISLSPQID TTVILNSCVTPCPKTPAAPDTQLDELTANDFEDDWESLLGSEPFLMENAEMLEFVPSTTAQDTCQKAICT SVGENDTITSRTNMNLGGRLRDSKVTLDLPSKTRNGELRNAGEHRFSSHPGDESRKVPFTGNKVSFEKSV TSIVSKDEDYVAVSNLEKVKEDSRNKCILNKHSSNKSSSYTRYPSKQSSELGVNLPLQVPTTDPFDSVFL GKENIVCSTNQSHGSKLNSSFDDWNDPLLASEMVEACHRLEATWDAGEVDDDLFCQACDDIERLTQQENK GSEESESVSYTSTRGSRSSSTASKQASQSAPSKHWNVVSSAVPLSLANKSQMSKPVTVQKRGRCGDGPNI LDATNLSVCSKNSSDNKRGPVQVNSSKFVLGGSSNLNVNLGLMSTKIATNMKLSTQQLSHNSLADTAQND NKILKLPKFTFKKKNPQLNQNHLVGSVPVGKISEDLGKRETVNSLLEANQQQSSINYSESLKPSSPDEEE RNRKYSPEEIQRKRQEALVRRKAKALHTVQSAPISLP ; "Ewing's tumor-associated antigen 1 homolog" # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 877 1 877 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ETAA1_MOUSE Q5SVT3 . 1 877 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-12-21 6A03F2B9F4ED2598 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MQLKDGGTGMSRRRKHADSPARRSTPHRAAAKNCRPAAEPWLRESRAACSSQLRRAGTRSARRAQRQAAA DGGRSPRGKETPVQIVKMDLLSCTFSSPNDPDGQTDIFWDQNSPMTKQLGKGRKKQISSAYSDEISHIVN RIAPQDEKPVTNSMLGVWIGETAIPCTPGVAKEKSRVKASCTKLKTKNREKELMKLAQQFDKNMEELDVI QEQDGKNHDFIQMTSKMGHLDNHKDSVQKPSGDVVPEITCTPVKKQMKGDSRISLAKAQDSSQKPFDQNV EAAFNAIFDGSTQMCSGQLSQDLLDAFLNNSKTSLRKKNALLQEEIITTETLLTENLLNKTPISLSPQID TTVILNSCVTPCPKTPAAPDTQLDELTANDFEDDWESLLGSEPFLMENAEMLEFVPSTTAQDTCQKAICT SVGENDTITSRTNMNLGGRLRDSKVTLDLPSKTRNGELRNAGEHRFSSHPGDESRKVPFTGNKVSFEKSV TSIVSKDEDYVAVSNLEKVKEDSRNKCILNKHSSNKSSSYTRYPSKQSSELGVNLPLQVPTTDPFDSVFL GKENIVCSTNQSHGSKLNSSFDDWNDPLLASEMVEACHRLEATWDAGEVDDDLFCQACDDIERLTQQENK GSEESESVSYTSTRGSRSSSTASKQASQSAPSKHWNVVSSAVPLSLANKSQMSKPVTVQKRGRCGDGPNI LDATNLSVCSKNSSDNKRGPVQVNSSKFVLGGSSNLNVNLGLMSTKIATNMKLSTQQLSHNSLADTAQND NKILKLPKFTFKKKNPQLNQNHLVGSVPVGKISEDLGKRETVNSLLEANQQQSSINYSESLKPSSPDEEE RNRKYSPEEIQRKRQEALVRRKAKALHTVQSAPISLP ; ;MQLKDGGTGMSRRRKHADSPARRSTPHRAAAKNCRPAAEPWLRESRAACSSQLRRAGTRSARRAQRQAAA DGGRSPRGKETPVQIVKMDLLSCTFSSPNDPDGQTDIFWDQNSPMTKQLGKGRKKQISSAYSDEISHIVN RIAPQDEKPVTNSMLGVWIGETAIPCTPGVAKEKSRVKASCTKLKTKNREKELMKLAQQFDKNMEELDVI QEQDGKNHDFIQMTSKMGHLDNHKDSVQKPSGDVVPEITCTPVKKQMKGDSRISLAKAQDSSQKPFDQNV EAAFNAIFDGSTQMCSGQLSQDLLDAFLNNSKTSLRKKNALLQEEIITTETLLTENLLNKTPISLSPQID TTVILNSCVTPCPKTPAAPDTQLDELTANDFEDDWESLLGSEPFLMENAEMLEFVPSTTAQDTCQKAICT SVGENDTITSRTNMNLGGRLRDSKVTLDLPSKTRNGELRNAGEHRFSSHPGDESRKVPFTGNKVSFEKSV TSIVSKDEDYVAVSNLEKVKEDSRNKCILNKHSSNKSSSYTRYPSKQSSELGVNLPLQVPTTDPFDSVFL GKENIVCSTNQSHGSKLNSSFDDWNDPLLASEMVEACHRLEATWDAGEVDDDLFCQACDDIERLTQQENK GSEESESVSYTSTRGSRSSSTASKQASQSAPSKHWNVVSSAVPLSLANKSQMSKPVTVQKRGRCGDGPNI LDATNLSVCSKNSSDNKRGPVQVNSSKFVLGGSSNLNVNLGLMSTKIATNMKLSTQQLSHNSLADTAQND NKILKLPKFTFKKKNPQLNQNHLVGSVPVGKISEDLGKRETVNSLLEANQQQSSINYSESLKPSSPDEEE RNRKYSPEEIQRKRQEALVRRKAKALHTVQSAPISLP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLN . 1 3 LEU . 1 4 LYS . 1 5 ASP . 1 6 GLY . 1 7 GLY . 1 8 THR . 1 9 GLY . 1 10 MET . 1 11 SER . 1 12 ARG . 1 13 ARG . 1 14 ARG . 1 15 LYS . 1 16 HIS . 1 17 ALA . 1 18 ASP . 1 19 SER . 1 20 PRO . 1 21 ALA . 1 22 ARG . 1 23 ARG . 1 24 SER . 1 25 THR . 1 26 PRO . 1 27 HIS . 1 28 ARG . 1 29 ALA . 1 30 ALA . 1 31 ALA . 1 32 LYS . 1 33 ASN . 1 34 CYS . 1 35 ARG . 1 36 PRO . 1 37 ALA . 1 38 ALA . 1 39 GLU . 1 40 PRO . 1 41 TRP . 1 42 LEU . 1 43 ARG . 1 44 GLU . 1 45 SER . 1 46 ARG . 1 47 ALA . 1 48 ALA . 1 49 CYS . 1 50 SER . 1 51 SER . 1 52 GLN . 1 53 LEU . 1 54 ARG . 1 55 ARG . 1 56 ALA . 1 57 GLY . 1 58 THR . 1 59 ARG . 1 60 SER . 1 61 ALA . 1 62 ARG . 1 63 ARG . 1 64 ALA . 1 65 GLN . 1 66 ARG . 1 67 GLN . 1 68 ALA . 1 69 ALA . 1 70 ALA . 1 71 ASP . 1 72 GLY . 1 73 GLY . 1 74 ARG . 1 75 SER . 1 76 PRO . 1 77 ARG . 1 78 GLY . 1 79 LYS . 1 80 GLU . 1 81 THR . 1 82 PRO . 1 83 VAL . 1 84 GLN . 1 85 ILE . 1 86 VAL . 1 87 LYS . 1 88 MET . 1 89 ASP . 1 90 LEU . 1 91 LEU . 1 92 SER . 1 93 CYS . 1 94 THR . 1 95 PHE . 1 96 SER . 1 97 SER . 1 98 PRO . 1 99 ASN . 1 100 ASP . 1 101 PRO . 1 102 ASP . 1 103 GLY . 1 104 GLN . 1 105 THR . 1 106 ASP . 1 107 ILE . 1 108 PHE . 1 109 TRP . 1 110 ASP . 1 111 GLN . 1 112 ASN . 1 113 SER . 1 114 PRO . 1 115 MET . 1 116 THR . 1 117 LYS . 1 118 GLN . 1 119 LEU . 1 120 GLY . 1 121 LYS . 1 122 GLY . 1 123 ARG . 1 124 LYS . 1 125 LYS . 1 126 GLN . 1 127 ILE . 1 128 SER . 1 129 SER . 1 130 ALA . 1 131 TYR . 1 132 SER . 1 133 ASP . 1 134 GLU . 1 135 ILE . 1 136 SER . 1 137 HIS . 1 138 ILE . 1 139 VAL . 1 140 ASN . 1 141 ARG . 1 142 ILE . 1 143 ALA . 1 144 PRO . 1 145 GLN . 1 146 ASP . 1 147 GLU . 1 148 LYS . 1 149 PRO . 1 150 VAL . 1 151 THR . 1 152 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E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Stathmin-4 {PDB ID=4x1k, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=4x1k.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4x1k, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 3 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ADMEVIELNKATSGQSWEVILKPPSFDGVPEFNASLPRRRDPSLEEIQKKLEAAEERRKYQEAELLKHLA EKREHEREVIQKAIEENNNFIKMAKEKLAQKMESNKENREAHLAAMLERLQEKDKHAEEVRKNKELKEEA SR ; ;ADMEVIELNKATSGQSWEVILKPPSFDGVPEFNASLPRRRDPSLEEIQKKLEAAEERRKYQEAELLKHLA EKREHEREVIQKAIEENNNFIKMAKEKLAQKMESNKENREAHLAAMLERLQEKDKHAEEVRKNKELKEEA SR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 38 62 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4x1k 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 877 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 877 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 28.000 48.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQLKDGGTGMSRRRKHADSPARRSTPHRAAAKNCRPAAEPWLRESRAACSSQLRRAGTRSARRAQRQAAADGGRSPRGKETPVQIVKMDLLSCTFSSPNDPDGQTDIFWDQNSPMTKQLGKGRKKQISSAYSDEISHIVNRIAPQDEKPVTNSMLGVWIGETAIPCTPGVAKEKSRVKASCTKLKTKNREKELMKLAQQFDKNMEELDVIQEQDGKNHDFIQMTSKMGHLDNHKDSVQKPSGDVVPEITCTPVKKQMKGDSRISLAKAQDSSQKPFDQNVEAAFNAIFDGSTQMCSGQLSQDLLDAFLNNSKTSLRKKNALLQEEIITTETLLTENLLNKTPISLSPQIDTTVILNSCVTPCPKTPAAPDTQLDELTANDFEDDWESLLGSEPFLMENAEMLEFVPSTTAQDTCQKAICTSVGENDTITSRTNMNLGGRLRDSKVTLDLPSKTRNGELRNAGEHRFSSHPGDESRKVPFTGNKVSFEKSVTSIVSKDEDYVAVSNLEKVKEDSRNKCILNKHSSNKSSSYTRYPSKQSSELGVNLPLQVPTTDPFDSVFLGKENIVCSTNQSHGSKLNSSFDDWNDPLLASEMVEACHRLEATWDAGEVDDDLFCQACDDIERLTQQENKGSEESESVSYTSTRGSRSSSTASKQASQSAPSKHWNVVSSAVPLSLANKSQMSKPVTVQKRGRCGDGPNILDATNLSVCSKNSSDNKRGPVQVNSSKFVLGGSSNLNVNLGLMSTKIATNMKLSTQQLSHNSLADTAQNDNKILKLPKFTFKKKNPQLNQNHLVGSVPVGKISEDLGKRETVNSLLEANQQQSSINYSESLKPSSPDEEERNRKYSPEEIQRKRQEALVRRKAKALHTVQSAPISLP 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RRRDPSLEEIQKKLEAAEERRKYQE------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4x1k.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 845 845 ? A -11.979 29.996 70.582 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 2 C CA . TYR 845 845 ? A -11.509 31.273 69.934 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 3 C C . TYR 845 845 ? A -12.439 31.607 68.764 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 4 O O . TYR 845 845 ? A -12.623 30.757 67.903 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 5 C CB . TYR 845 845 ? A -10.028 31.038 69.492 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 6 C CG . TYR 845 845 ? A -9.431 32.239 68.809 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 845 845 ? A -9.127 32.191 67.437 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 845 845 ? A -9.142 33.407 69.535 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 845 845 ? A -8.549 33.297 66.799 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 845 845 ? A -8.552 34.510 68.897 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 11 C CZ . TYR 845 845 ? A -8.268 34.456 67.526 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 12 O OH . TYR 845 845 ? A -7.697 35.558 66.862 1 1 E TYR 0.550 1 ATOM 13 N N . SER 846 846 ? A -13.100 32.785 68.710 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 14 C CA . SER 846 846 ? A -14.069 33.090 67.664 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 15 C C . SER 846 846 ? A -13.957 34.573 67.332 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 16 O O . SER 846 846 ? A -13.982 35.370 68.269 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 17 C CB . SER 846 846 ? A -15.533 32.783 68.092 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 18 O OG . SER 846 846 ? A -15.777 33.204 69.435 1 1 E SER 0.540 1 ATOM 19 N N . PRO 847 847 ? A -13.834 35.024 66.070 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 20 C CA . PRO 847 847 ? A -13.805 36.441 65.710 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 21 C C . PRO 847 847 ? A -14.966 37.238 66.236 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 22 O O . PRO 847 847 ? A -14.741 38.320 66.765 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 23 C CB . PRO 847 847 ? A -13.770 36.473 64.176 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 24 C CG . PRO 847 847 ? A -13.152 35.129 63.768 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 25 C CD . PRO 847 847 ? A -13.407 34.185 64.952 1 1 E PRO 0.680 1 ATOM 26 N N . GLU 848 848 ? A -16.204 36.705 66.118 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 27 C CA . GLU 848 848 ? A -17.417 37.388 66.525 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 28 C C . GLU 848 848 ? A -17.381 37.783 67.984 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 29 O O . GLU 848 848 ? A -17.580 38.946 68.321 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 30 C CB . GLU 848 848 ? A -18.676 36.514 66.256 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 31 C CG . GLU 848 848 ? A -19.990 37.246 66.648 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 32 C CD . GLU 848 848 ? A -21.310 36.544 66.320 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 848 848 ? A -21.331 35.402 65.814 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 848 848 ? A -22.354 37.204 66.582 1 1 E GLU 0.730 1 ATOM 35 N N . GLU 849 849 ? A -17.019 36.880 68.902 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 36 C CA . GLU 849 849 ? A -17.064 37.178 70.313 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 37 C C . GLU 849 849 ? A -15.961 38.131 70.759 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 38 O O . GLU 849 849 ? A -16.113 38.890 71.709 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 39 C CB . GLU 849 849 ? A -17.082 35.831 71.075 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 40 C CG . GLU 849 849 ? A -18.097 35.738 72.235 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 41 C CD . GLU 849 849 ? A -19.484 36.227 71.830 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 849 849 ? A -20.044 35.669 70.860 1 1 E GLU 0.720 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 849 849 ? 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A -16.442 42.424 65.472 1 1 E GLN 0.720 1 ATOM 58 C CD . GLN 851 851 ? A -16.841 41.879 64.108 1 1 E GLN 0.720 1 ATOM 59 O OE1 . GLN 851 851 ? A -17.015 40.654 63.919 1 1 E GLN 0.720 1 ATOM 60 N NE2 . GLN 851 851 ? A -16.976 42.752 63.097 1 1 E GLN 0.720 1 ATOM 61 N N . ARG 852 852 ? A -17.501 41.444 69.429 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 62 C CA . ARG 852 852 ? A -18.460 41.867 70.425 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 63 C C . ARG 852 852 ? A -17.791 42.379 71.697 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 64 O O . ARG 852 852 ? A -17.945 43.550 72.023 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 65 C CB . ARG 852 852 ? A -19.474 40.731 70.741 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 66 C CG . ARG 852 852 ? A -20.337 40.315 69.527 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 67 C CD . ARG 852 852 ? A -21.590 39.504 69.891 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 68 N NE . ARG 852 852 ? A -22.282 39.141 68.605 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 69 C CZ . ARG 852 852 ? A -23.130 39.903 67.905 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 70 N NH1 . ARG 852 852 ? A -23.407 41.151 68.258 1 1 E ARG 0.690 1 ATOM 71 N NH2 . ARG 852 852 ? 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A -16.129 61.890 78.445 1 1 E ALA 0.400 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.646 2 1 3 0.003 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 845 TYR 1 0.550 2 1 A 846 SER 1 0.540 3 1 A 847 PRO 1 0.680 4 1 A 848 GLU 1 0.730 5 1 A 849 GLU 1 0.720 6 1 A 850 ILE 1 0.710 7 1 A 851 GLN 1 0.720 8 1 A 852 ARG 1 0.690 9 1 A 853 LYS 1 0.730 10 1 A 854 ARG 1 0.670 11 1 A 855 GLN 1 0.720 12 1 A 856 GLU 1 0.720 13 1 A 857 ALA 1 0.780 14 1 A 858 LEU 1 0.710 15 1 A 859 VAL 1 0.740 16 1 A 860 ARG 1 0.620 17 1 A 861 ARG 1 0.560 18 1 A 862 LYS 1 0.580 19 1 A 863 ALA 1 0.590 20 1 A 864 LYS 1 0.400 21 1 A 865 ALA 1 0.400 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #