data_SMR-ce176c99a3f9f5ac7e6e8aa725cd7ae1_3 _entry.id SMR-ce176c99a3f9f5ac7e6e8aa725cd7ae1_3 _struct.entry_id SMR-ce176c99a3f9f5ac7e6e8aa725cd7ae1_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9NQS7/ INCE_HUMAN, Inner centromere protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9NQS7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 121632.794 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP INCE_HUMAN Q9NQS7 1 ;MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTREFSKEPELMPKTPSQKNRRKKRR ISYVQDENRDPIRRRLSRRKSRSSQLSSRRLRSKDSVEKLATVVGENGSVLRRVTRAAAAAAAATMALAA PSSPTPESPTMLTKKPEDNHTQCQLVPVVEIGISERQNAEQHVTQLMSTEPLPRTLSPTPASATAPTSQG IPTSDEESTPKKSKARILESITVSSLMATPQDPKGQGVGTGRSASKLRIAQVSPGPRDSPAFPDSPWRER VLAPILPDNFSTPTGSRTDSQSVRHSPIAPSSPSPQVLAQKYSLVAKQESVVRRASRRLAKKTAEEPAAS GRIICHSYLERLLNVEVPQKVGSEQKEPPEEAEPVAAAEPEVPENNGNNSWPHNDTEIANSTPNPKPAAS SPETPSAGQQEAKTDQADGPREPPQSARRKRSYKQAVSELDEEQHLEDEELQPPRSKTPSSPCPASKVVR PLRTFLHTVQRNQMLMTPTSAPRSVMKSFIKRNTPLRMDPKEKERQRLENLRRKEEAEQLRRQKVEEDKR RRLEEVKLKREERLRKVLQARERVEQMKEEKKKQIEQKFAQIDEKTEKAKEERLAEEKAKKKAAAKKMEE VEARRKQEEEARRLRWLQQEEEERRHQELLQKKKEEEQERLRKAAEAKRLAEQREQERREQERREQERRE QERREQERREQERQLAEQERRREQERLQAERELQEREKALRLQKEQLQRELEEKKKKEEQQRLAERQLQE EQEKKAKEAAGASKALNVTVDVQSPACTSYQMTPQGHRAPPKINPDNYGMDLNSDDSTDDEAHPRKPIPT WARGTPLSQAIIHQYYHPPNLLELFGTILPLDLEDIFKKSKPRYHKRTSSAVWNSPPLQGARVPSSLAYS LKKH ; 'Inner centromere protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 914 1 914 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . INCE_HUMAN Q9NQS7 Q9NQS7-2 1 914 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-11-04 6E8C5E65A9C918E8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTREFSKEPELMPKTPSQKNRRKKRR ISYVQDENRDPIRRRLSRRKSRSSQLSSRRLRSKDSVEKLATVVGENGSVLRRVTRAAAAAAAATMALAA PSSPTPESPTMLTKKPEDNHTQCQLVPVVEIGISERQNAEQHVTQLMSTEPLPRTLSPTPASATAPTSQG IPTSDEESTPKKSKARILESITVSSLMATPQDPKGQGVGTGRSASKLRIAQVSPGPRDSPAFPDSPWRER VLAPILPDNFSTPTGSRTDSQSVRHSPIAPSSPSPQVLAQKYSLVAKQESVVRRASRRLAKKTAEEPAAS GRIICHSYLERLLNVEVPQKVGSEQKEPPEEAEPVAAAEPEVPENNGNNSWPHNDTEIANSTPNPKPAAS SPETPSAGQQEAKTDQADGPREPPQSARRKRSYKQAVSELDEEQHLEDEELQPPRSKTPSSPCPASKVVR PLRTFLHTVQRNQMLMTPTSAPRSVMKSFIKRNTPLRMDPKEKERQRLENLRRKEEAEQLRRQKVEEDKR RRLEEVKLKREERLRKVLQARERVEQMKEEKKKQIEQKFAQIDEKTEKAKEERLAEEKAKKKAAAKKMEE VEARRKQEEEARRLRWLQQEEEERRHQELLQKKKEEEQERLRKAAEAKRLAEQREQERREQERREQERRE QERREQERREQERQLAEQERRREQERLQAERELQEREKALRLQKEQLQRELEEKKKKEEQQRLAERQLQE EQEKKAKEAAGASKALNVTVDVQSPACTSYQMTPQGHRAPPKINPDNYGMDLNSDDSTDDEAHPRKPIPT WARGTPLSQAIIHQYYHPPNLLELFGTILPLDLEDIFKKSKPRYHKRTSSAVWNSPPLQGARVPSSLAYS LKKH ; ;MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTREFSKEPELMPKTPSQKNRRKKRR ISYVQDENRDPIRRRLSRRKSRSSQLSSRRLRSKDSVEKLATVVGENGSVLRRVTRAAAAAAAATMALAA PSSPTPESPTMLTKKPEDNHTQCQLVPVVEIGISERQNAEQHVTQLMSTEPLPRTLSPTPASATAPTSQG IPTSDEESTPKKSKARILESITVSSLMATPQDPKGQGVGTGRSASKLRIAQVSPGPRDSPAFPDSPWRER VLAPILPDNFSTPTGSRTDSQSVRHSPIAPSSPSPQVLAQKYSLVAKQESVVRRASRRLAKKTAEEPAAS GRIICHSYLERLLNVEVPQKVGSEQKEPPEEAEPVAAAEPEVPENNGNNSWPHNDTEIANSTPNPKPAAS SPETPSAGQQEAKTDQADGPREPPQSARRKRSYKQAVSELDEEQHLEDEELQPPRSKTPSSPCPASKVVR PLRTFLHTVQRNQMLMTPTSAPRSVMKSFIKRNTPLRMDPKEKERQRLENLRRKEEAEQLRRQKVEEDKR RRLEEVKLKREERLRKVLQARERVEQMKEEKKKQIEQKFAQIDEKTEKAKEERLAEEKAKKKAAAKKMEE VEARRKQEEEARRLRWLQQEEEERRHQELLQKKKEEEQERLRKAAEAKRLAEQREQERREQERREQERRE QERREQERREQERQLAEQERRREQERLQAERELQEREKALRLQKEQLQRELEEKKKKEEQQRLAERQLQE EQEKKAKEAAGASKALNVTVDVQSPACTSYQMTPQGHRAPPKINPDNYGMDLNSDDSTDDEAHPRKPIPT WARGTPLSQAIIHQYYHPPNLLELFGTILPLDLEDIFKKSKPRYHKRTSSAVWNSPPLQGARVPSSLAYS LKKH ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLY . 1 3 THR . 1 4 THR . 1 5 ALA . 1 6 PRO . 1 7 GLY . 1 8 PRO . 1 9 ILE . 1 10 HIS . 1 11 LEU . 1 12 LEU . 1 13 GLU . 1 14 LEU . 1 15 CYS . 1 16 ASP . 1 17 GLN . 1 18 LYS . 1 19 LEU . 1 20 MET . 1 21 GLU . 1 22 PHE . 1 23 LEU . 1 24 CYS . 1 25 ASN . 1 26 MET . 1 27 ASP . 1 28 ASN . 1 29 LYS . 1 30 ASP . 1 31 LEU . 1 32 VAL . 1 33 TRP . 1 34 LEU . 1 35 GLU . 1 36 GLU . 1 37 ILE . 1 38 GLN . 1 39 GLU . 1 40 GLU . 1 41 ALA . 1 42 GLU . 1 43 ARG . 1 44 MET . 1 45 PHE . 1 46 THR . 1 47 ARG . 1 48 GLU . 1 49 PHE . 1 50 SER . 1 51 LYS . 1 52 GLU . 1 53 PRO . 1 54 GLU . 1 55 LEU . 1 56 MET . 1 57 PRO . 1 58 LYS . 1 59 THR . 1 60 PRO . 1 61 SER . 1 62 GLN . 1 63 LYS . 1 64 ASN . 1 65 ARG . 1 66 ARG . 1 67 LYS . 1 68 LYS . 1 69 ARG . 1 70 ARG . 1 71 ILE . 1 72 SER . 1 73 TYR . 1 74 VAL . 1 75 GLN . 1 76 ASP . 1 77 GLU . 1 78 ASN . 1 79 ARG . 1 80 ASP . 1 81 PRO . 1 82 ILE . 1 83 ARG . 1 84 ARG . 1 85 ARG . 1 86 LEU . 1 87 SER . 1 88 ARG . 1 89 ARG . 1 90 LYS . 1 91 SER . 1 92 ARG . 1 93 SER . 1 94 SER . 1 95 GLN . 1 96 LEU . 1 97 SER . 1 98 SER . 1 99 ARG . 1 100 ARG . 1 101 LEU . 1 102 ARG . 1 103 SER . 1 104 LYS . 1 105 ASP . 1 106 SER . 1 107 VAL . 1 108 GLU . 1 109 LYS . 1 110 LEU . 1 111 ALA . 1 112 THR . 1 113 VAL . 1 114 VAL . 1 115 GLY . 1 116 GLU . 1 117 ASN . 1 118 GLY . 1 119 SER . 1 120 VAL . 1 121 LEU . 1 122 ARG . 1 123 ARG . 1 124 VAL . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 ALA . 1 128 ALA . 1 129 ALA . 1 130 ALA . 1 131 ALA . 1 132 ALA . 1 133 ALA . 1 134 ALA . 1 135 THR . 1 136 MET . 1 137 ALA . 1 138 LEU . 1 139 ALA . 1 140 ALA . 1 141 PRO . 1 142 SER . 1 143 SER . 1 144 PRO . 1 145 THR . 1 146 PRO . 1 147 GLU . 1 148 SER . 1 149 PRO . 1 150 THR . 1 151 MET . 1 152 LEU . 1 153 THR . 1 154 LYS . 1 155 LYS . 1 156 PRO . 1 157 GLU . 1 158 ASP . 1 159 ASN . 1 160 HIS . 1 161 THR . 1 162 GLN . 1 163 CYS . 1 164 GLN . 1 165 LEU . 1 166 VAL . 1 167 PRO . 1 168 VAL . 1 169 VAL . 1 170 GLU . 1 171 ILE . 1 172 GLY . 1 173 ILE . 1 174 SER . 1 175 GLU . 1 176 ARG . 1 177 GLN . 1 178 ASN . 1 179 ALA . 1 180 GLU . 1 181 GLN . 1 182 HIS . 1 183 VAL . 1 184 THR . 1 185 GLN . 1 186 LEU . 1 187 MET . 1 188 SER . 1 189 THR . 1 190 GLU . 1 191 PRO . 1 192 LEU . 1 193 PRO . 1 194 ARG . 1 195 THR . 1 196 LEU . 1 197 SER . 1 198 PRO . 1 199 THR . 1 200 PRO . 1 201 ALA . 1 202 SER . 1 203 ALA . 1 204 THR . 1 205 ALA . 1 206 PRO . 1 207 THR . 1 208 SER . 1 209 GLN . 1 210 GLY . 1 211 ILE . 1 212 PRO . 1 213 THR . 1 214 SER . 1 215 ASP . 1 216 GLU . 1 217 GLU . 1 218 SER . 1 219 THR . 1 220 PRO . 1 221 LYS . 1 222 LYS . 1 223 SER . 1 224 LYS . 1 225 ALA . 1 226 ARG 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A 1 876 ILE 876 ? ? ? C . A 1 877 PHE 877 ? ? ? C . A 1 878 LYS 878 ? ? ? C . A 1 879 LYS 879 ? ? ? C . A 1 880 SER 880 ? ? ? C . A 1 881 LYS 881 ? ? ? C . A 1 882 PRO 882 ? ? ? C . A 1 883 ARG 883 ? ? ? C . A 1 884 TYR 884 ? ? ? C . A 1 885 HIS 885 ? ? ? C . A 1 886 LYS 886 ? ? ? C . A 1 887 ARG 887 ? ? ? C . A 1 888 THR 888 ? ? ? C . A 1 889 SER 889 ? ? ? C . A 1 890 SER 890 ? ? ? C . A 1 891 ALA 891 ? ? ? C . A 1 892 VAL 892 ? ? ? C . A 1 893 TRP 893 ? ? ? C . A 1 894 ASN 894 ? ? ? C . A 1 895 SER 895 ? ? ? C . A 1 896 PRO 896 ? ? ? C . A 1 897 PRO 897 ? ? ? C . A 1 898 LEU 898 ? ? ? C . A 1 899 GLN 899 ? ? ? C . A 1 900 GLY 900 ? ? ? C . A 1 901 ALA 901 ? ? ? C . A 1 902 ARG 902 ? ? ? C . A 1 903 VAL 903 ? ? ? C . A 1 904 PRO 904 ? ? ? C . A 1 905 SER 905 ? ? ? C . A 1 906 SER 906 ? ? ? C . A 1 907 LEU 907 ? ? ? C . A 1 908 ALA 908 ? ? ? C . A 1 909 TYR 909 ? ? ? C . A 1 910 SER 910 ? ? ? C . A 1 911 LEU 911 ? ? ? C . A 1 912 LYS 912 ? ? ? C . A 1 913 LYS 913 ? ? ? C . A 1 914 HIS 914 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Inner centromere protein {PDB ID=2qfa, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=2qfa.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2qfa, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 3 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTR MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTR # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 47 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2qfa 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 914 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 914 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.7e-18 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTREFSKEPELMPKTPSQKNRRKKRRISYVQDENRDPIRRRLSRRKSRSSQLSSRRLRSKDSVEKLATVVGENGSVLRRVTRAAAAAAAATMALAAPSSPTPESPTMLTKKPEDNHTQCQLVPVVEIGISERQNAEQHVTQLMSTEPLPRTLSPTPASATAPTSQGIPTSDEESTPKKSKARILESITVSSLMATPQDPKGQGVGTGRSASKLRIAQVSPGPRDSPAFPDSPWRERVLAPILPDNFSTPTGSRTDSQSVRHSPIAPSSPSPQVLAQKYSLVAKQESVVRRASRRLAKKTAEEPAASGRIICHSYLERLLNVEVPQKVGSEQKEPPEEAEPVAAAEPEVPENNGNNSWPHNDTEIANSTPNPKPAASSPETPSAGQQEAKTDQADGPREPPQSARRKRSYKQAVSELDEEQHLEDEELQPPRSKTPSSPCPASKVVRPLRTFLHTVQRNQMLMTPTSAPRSVMKSFIKRNTPLRMDPKEKERQRLENLRRKEEAEQLRRQKVEEDKRRRLEEVKLKREERLRKVLQARERVEQMKEEKKKQIEQKFAQIDEKTEKAKEERLAEEKAKKKAAAKKMEEVEARRKQEEEARRLRWLQQEEEERRHQELLQKKKEEEQERLRKAAEAKRLAEQREQERREQERREQERREQERREQERREQERQLAEQERRREQERLQAERELQEREKALRLQKEQLQRELEEKKKKEEQQRLAERQLQEEQEKKAKEAAGASKALNVTVDVQSPACTSYQMTPQGHRAPPKINPDNYGMDLNSDDSTDDEAHPRKPIPTWARGTPLSQAIIHQYYHPPNLLELFGTILPLDLEDIFKKSKPRYHKRTSSAVWNSPPLQGARVPSSLAYSLKKH 2 1 2 MGTTAPGPIHLLELCDQKLMEFLCNMDNKDLVWLEEIQEEAERMFTR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2qfa.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 3 3 ? A 38.408 -12.816 15.278 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 2 C CA . THR 3 3 ? A 37.959 -13.721 16.404 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 3 C C . THR 3 3 ? A 38.855 -13.481 17.596 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 4 O O . THR 3 3 ? A 39.911 -12.876 17.435 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 5 C CB . THR 3 3 ? A 38.024 -15.199 15.984 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 6 O OG1 . THR 3 3 ? A 39.286 -15.530 15.415 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 7 C CG2 . THR 3 3 ? A 36.965 -15.492 14.906 1 1 C THR 0.470 1 ATOM 8 N N . THR 4 4 ? A 38.466 -13.890 18.814 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 9 C CA . THR 4 4 ? A 39.232 -13.596 20.013 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 10 C C . THR 4 4 ? A 39.157 -14.811 20.904 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 11 O O . THR 4 4 ? A 38.203 -15.583 20.840 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 12 C CB . THR 4 4 ? A 38.711 -12.387 20.795 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 13 O OG1 . THR 4 4 ? A 37.297 -12.385 20.939 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 14 C CG2 . THR 4 4 ? A 39.069 -11.104 20.031 1 1 C THR 0.510 1 ATOM 15 N N . ALA 5 5 ? A 40.203 -15.060 21.722 1 1 C ALA 0.860 1 ATOM 16 C CA . ALA 5 5 ? A 40.161 -16.059 22.773 1 1 C ALA 0.860 1 ATOM 17 C C . ALA 5 5 ? A 39.209 -15.607 23.901 1 1 C ALA 0.860 1 ATOM 18 O O . ALA 5 5 ? A 39.140 -14.401 24.149 1 1 C ALA 0.860 1 ATOM 19 C CB . ALA 5 5 ? A 41.587 -16.313 23.309 1 1 C ALA 0.860 1 ATOM 20 N N . PRO 6 6 ? A 38.448 -16.460 24.588 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 21 C CA . PRO 6 6 ? A 37.710 -16.113 25.807 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 22 C C . PRO 6 6 ? A 38.508 -15.435 26.920 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 23 O O . PRO 6 6 ? A 39.692 -15.721 27.093 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 24 C CB . PRO 6 6 ? A 37.106 -17.452 26.276 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 25 C CG . PRO 6 6 ? A 37.070 -18.324 25.019 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 26 C CD . PRO 6 6 ? A 38.317 -17.877 24.262 1 1 C PRO 0.820 1 ATOM 27 N N . GLY 7 7 ? A 37.857 -14.554 27.715 1 1 C GLY 0.780 1 ATOM 28 C CA . GLY 7 7 ? A 38.466 -13.860 28.849 1 1 C GLY 0.780 1 ATOM 29 C C . GLY 7 7 ? A 38.540 -12.388 28.541 1 1 C GLY 0.780 1 ATOM 30 O O . GLY 7 7 ? A 38.112 -11.995 27.456 1 1 C GLY 0.780 1 ATOM 31 N N . PRO 8 8 ? A 39.028 -11.509 29.427 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 32 C CA . PRO 8 8 ? A 38.843 -10.079 29.172 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 33 C C . PRO 8 8 ? A 40.031 -9.429 28.477 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 34 O O . PRO 8 8 ? A 39.872 -8.322 27.971 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 35 C CB . PRO 8 8 ? A 38.596 -9.455 30.553 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 36 C CG . PRO 8 8 ? A 39.214 -10.443 31.538 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 37 C CD . PRO 8 8 ? A 38.977 -11.791 30.868 1 1 C PRO 0.800 1 ATOM 38 N N . ILE 9 9 ? A 41.239 -10.036 28.446 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 39 C CA . ILE 9 9 ? A 42.442 -9.345 27.964 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 40 C C . ILE 9 9 ? A 42.422 -8.951 26.478 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 41 O O . ILE 9 9 ? A 43.046 -7.971 26.070 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 42 C CB . ILE 9 9 ? A 43.753 -10.040 28.356 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 43 C CG1 . ILE 9 9 ? A 44.938 -9.038 28.296 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 44 C CG2 . ILE 9 9 ? A 43.993 -11.307 27.508 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 45 C CD1 . ILE 9 9 ? A 46.221 -9.511 28.988 1 1 C ILE 0.700 1 ATOM 46 N N . HIS 10 10 ? A 41.637 -9.664 25.629 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 47 C CA . HIS 10 10 ? A 41.501 -9.364 24.198 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 48 C C . HIS 10 10 ? A 40.881 -8.007 23.915 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 49 O O . HIS 10 10 ? A 41.050 -7.468 22.823 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 50 C CB . HIS 10 10 ? A 40.699 -10.423 23.383 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 51 C CG . HIS 10 10 ? A 39.223 -10.462 23.647 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 52 N ND1 . HIS 10 10 ? A 38.333 -9.574 23.067 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 53 C CD2 . HIS 10 10 ? A 38.589 -11.223 24.571 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 54 C CE1 . HIS 10 10 ? A 37.183 -9.804 23.672 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 55 N NE2 . HIS 10 10 ? A 37.285 -10.793 24.591 1 1 C HIS 0.720 1 ATOM 56 N N . LEU 11 11 ? A 40.183 -7.401 24.908 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 57 C CA . LEU 11 11 ? A 39.510 -6.121 24.774 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 58 C C . LEU 11 11 ? A 40.443 -5.022 24.302 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 59 O O . LEU 11 11 ? A 40.056 -4.189 23.488 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 60 C CB . LEU 11 11 ? A 38.847 -5.673 26.105 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 61 C CG . LEU 11 11 ? A 37.548 -6.416 26.482 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 62 C CD1 . LEU 11 11 ? A 37.162 -6.109 27.940 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 63 C CD2 . LEU 11 11 ? A 36.399 -6.037 25.536 1 1 C LEU 0.820 1 ATOM 64 N N . LEU 12 12 ? A 41.710 -5.023 24.765 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 65 C CA . LEU 12 12 ? A 42.709 -4.084 24.290 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 66 C C . LEU 12 12 ? A 42.975 -4.205 22.791 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 67 O O . LEU 12 12 ? A 42.775 -3.257 22.037 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 68 C CB . LEU 12 12 ? A 44.032 -4.279 25.078 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 69 C CG . LEU 12 12 ? A 43.956 -3.953 26.587 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 70 C CD1 . LEU 12 12 ? A 45.297 -4.259 27.275 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 71 C CD2 . LEU 12 12 ? A 43.560 -2.488 26.823 1 1 C LEU 0.810 1 ATOM 72 N N . GLU 13 13 ? A 43.314 -5.416 22.303 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 73 C CA . GLU 13 13 ? A 43.565 -5.646 20.890 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 74 C C . GLU 13 13 ? A 42.338 -5.416 20.021 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 75 O O . GLU 13 13 ? A 42.393 -4.803 18.953 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 76 C CB . GLU 13 13 ? A 44.086 -7.079 20.662 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 77 C CG . GLU 13 13 ? A 44.498 -7.359 19.198 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 78 C CD . GLU 13 13 ? A 45.060 -8.765 18.996 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 79 O OE1 . GLU 13 13 ? A 44.977 -9.597 19.936 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 80 O OE2 . GLU 13 13 ? A 45.560 -9.012 17.869 1 1 C GLU 0.810 1 ATOM 81 N N . LEU 14 14 ? A 41.166 -5.894 20.480 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 82 C CA . LEU 14 14 ? A 39.915 -5.710 19.780 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 83 C C . LEU 14 14 ? A 39.446 -4.260 19.656 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 84 O O . LEU 14 14 ? A 39.011 -3.826 18.588 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 85 C CB . LEU 14 14 ? A 38.809 -6.561 20.438 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 86 C CG . LEU 14 14 ? A 37.472 -6.571 19.674 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 87 C CD1 . LEU 14 14 ? A 37.650 -7.101 18.241 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 88 C CD2 . LEU 14 14 ? A 36.424 -7.384 20.445 1 1 C LEU 0.860 1 ATOM 89 N N . CYS 15 15 ? A 39.520 -3.459 20.738 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 90 C CA . CYS 15 15 ? A 39.189 -2.041 20.704 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 91 C C . CYS 15 15 ? A 40.160 -1.234 19.847 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 92 O O . CYS 15 15 ? A 39.726 -0.392 19.056 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 93 C CB . CYS 15 15 ? A 39.020 -1.448 22.126 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 94 S SG . CYS 15 15 ? A 37.546 -2.110 22.982 1 1 C CYS 0.870 1 ATOM 95 N N . ASP 16 16 ? A 41.479 -1.525 19.917 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 96 C CA . ASP 16 16 ? A 42.477 -0.963 19.019 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 97 C C . ASP 16 16 ? A 42.193 -1.288 17.551 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 98 O O . ASP 16 16 ? A 42.215 -0.403 16.697 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 99 C CB . ASP 16 16 ? A 43.900 -1.453 19.398 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 100 C CG . ASP 16 16 ? A 44.404 -0.834 20.700 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 101 O OD1 . ASP 16 16 ? A 43.740 0.090 21.234 1 1 C ASP 0.870 1 ATOM 102 O OD2 . ASP 16 16 ? 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A 36.853 -1.530 16.830 1 1 C LYS 0.820 1 ATOM 117 C CG . LYS 18 18 ? A 36.345 -2.971 16.701 1 1 C LYS 0.820 1 ATOM 118 C CD . LYS 18 18 ? A 35.207 -3.312 17.668 1 1 C LYS 0.820 1 ATOM 119 C CE . LYS 18 18 ? A 34.673 -4.728 17.454 1 1 C LYS 0.820 1 ATOM 120 N NZ . LYS 18 18 ? A 34.079 -4.826 16.103 1 1 C LYS 0.820 1 ATOM 121 N N . LEU 19 19 ? A 39.084 0.810 16.460 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 122 C CA . LEU 19 19 ? A 39.567 2.160 16.241 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 123 C C . LEU 19 19 ? A 40.333 2.308 14.927 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 124 O O . LEU 19 19 ? A 40.060 3.212 14.138 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 125 C CB . LEU 19 19 ? A 40.468 2.612 17.412 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 126 C CG . LEU 19 19 ? A 41.102 4.010 17.252 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 127 C CD1 . LEU 19 19 ? A 40.059 5.120 17.046 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 128 C CD2 . LEU 19 19 ? A 42.019 4.316 18.444 1 1 C LEU 0.870 1 ATOM 129 N N . MET 20 20 ? A 41.271 1.391 14.616 1 1 C MET 0.860 1 ATOM 130 C CA . MET 20 20 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #