data_SMR-9ccce105f1ea5039542bcb4c2b46715c_2 _entry.id SMR-9ccce105f1ea5039542bcb4c2b46715c_2 _struct.entry_id SMR-9ccce105f1ea5039542bcb4c2b46715c_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q969V6/ MRTFA_HUMAN, Myocardin-related transcription factor A Estimated model accuracy of this model is 0.033, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q969V6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 115774.963 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MRTFA_HUMAN Q969V6 1 ;MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDL NEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSP LEARVSEPLLSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPPLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQ SQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQ QHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDM KVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPA LVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQ ASPLQILVKEEGPRAGSCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEKR AQQPAPAPAPLGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPAHPFNPSLAAPATNHIDPCAVAPGPPSVVVKQEALQP EPEPVPAPQLLLGPQGPSLIKGVAPPTLITDSTGTHLVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAP SAQMDLEHPLQPLFGTPTSLLKKEPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPS LPGKEKPSPKTVCGSPLAAQPSPSAELPQAAPPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHDGPEPLSLI DDLHSQMLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAP SLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL ; 'Myocardin-related transcription factor A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 931 1 931 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MRTFA_HUMAN Q969V6 . 1 931 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-12-01 6EDE5E2C56D89609 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDL NEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSP LEARVSEPLLSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPPLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQ SQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQ QHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDM KVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPA LVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQ ASPLQILVKEEGPRAGSCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEKR AQQPAPAPAPLGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPAHPFNPSLAAPATNHIDPCAVAPGPPSVVVKQEALQP 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EPEPVPAPQLLLGPQGPSLIKGVAPPTLITDSTGTHLVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAP SAQMDLEHPLQPLFGTPTSLLKKEPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPS LPGKEKPSPKTVCGSPLAAQPSPSAELPQAAPPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHDGPEPLSLI DDLHSQMLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAP SLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PRO . 1 3 PRO . 1 4 LEU . 1 5 LYS . 1 6 SER . 1 7 PRO . 1 8 ALA . 1 9 ALA . 1 10 PHE . 1 11 HIS . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 ARG . 1 15 ARG . 1 16 SER . 1 17 LEU . 1 18 GLU . 1 19 ARG . 1 20 ALA . 1 21 ARG . 1 22 THR . 1 23 GLU . 1 24 ASP . 1 25 TYR . 1 26 LEU . 1 27 LYS . 1 28 ARG . 1 29 LYS . 1 30 ILE . 1 31 ARG . 1 32 SER . 1 33 ARG . 1 34 PRO . 1 35 GLU . 1 36 ARG . 1 37 SER . 1 38 GLU . 1 39 LEU . 1 40 VAL . 1 41 ARG . 1 42 MET . 1 43 HIS . 1 44 ILE . 1 45 LEU . 1 46 GLU . 1 47 GLU . 1 48 THR . 1 49 SER . 1 50 ALA . 1 51 GLU . 1 52 PRO . 1 53 SER . 1 54 LEU . 1 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A 1 872 PRO 872 ? ? ? A . A 1 873 SER 873 ? ? ? A . A 1 874 SER 874 ? ? ? A . A 1 875 THR 875 ? ? ? A . A 1 876 MET 876 ? ? ? A . A 1 877 GLY 877 ? ? ? A . A 1 878 LEU 878 ? ? ? A . A 1 879 ASP 879 ? ? ? A . A 1 880 LEU 880 ? ? ? A . A 1 881 ALA 881 ? ? ? A . A 1 882 ASP 882 ? ? ? A . A 1 883 GLY 883 ? ? ? A . A 1 884 HIS 884 ? ? ? A . A 1 885 LEU 885 ? ? ? A . A 1 886 ASP 886 ? ? ? A . A 1 887 SER 887 ? ? ? A . A 1 888 MET 888 ? ? ? A . A 1 889 ASP 889 ? ? ? A . A 1 890 TRP 890 ? ? ? A . A 1 891 LEU 891 ? ? ? A . A 1 892 GLU 892 ? ? ? A . A 1 893 LEU 893 ? ? ? A . A 1 894 SER 894 ? ? ? A . A 1 895 SER 895 ? ? ? A . A 1 896 GLY 896 ? ? ? A . A 1 897 GLY 897 ? ? ? A . A 1 898 PRO 898 ? ? ? A . A 1 899 VAL 899 ? ? ? A . A 1 900 LEU 900 ? ? ? A . A 1 901 SER 901 ? ? ? A . A 1 902 LEU 902 ? ? ? A . A 1 903 ALA 903 ? ? ? A . A 1 904 PRO 904 ? ? ? A . A 1 905 LEU 905 ? ? ? A . A 1 906 SER 906 ? ? ? A . A 1 907 THR 907 ? ? ? A . A 1 908 THR 908 ? ? ? A . A 1 909 ALA 909 ? ? ? A . A 1 910 PRO 910 ? ? ? A . A 1 911 SER 911 ? ? ? A . A 1 912 LEU 912 ? ? ? A . A 1 913 PHE 913 ? ? ? A . A 1 914 SER 914 ? ? ? A . A 1 915 THR 915 ? ? ? A . A 1 916 ASP 916 ? ? ? A . A 1 917 PHE 917 ? ? ? A . A 1 918 LEU 918 ? ? ? A . A 1 919 ASP 919 ? ? ? A . A 1 920 GLY 920 ? ? ? A . A 1 921 HIS 921 ? ? ? A . A 1 922 ASP 922 ? ? ? A . A 1 923 LEU 923 ? ? ? A . A 1 924 GLN 924 ? ? ? A . A 1 925 LEU 925 ? ? ? A . A 1 926 HIS 926 ? ? ? A . A 1 927 TRP 927 ? ? ? A . A 1 928 ASP 928 ? ? ? A . A 1 929 SER 929 ? ? ? A . A 1 930 CYS 930 ? ? ? A . A 1 931 LEU 931 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MKL/myocardin-like protein 1 {PDB ID=2kvu, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2kvu.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2kvu, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGHHHHHHSHMSTPLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAP KAPAA ; ;MGHHHHHHSHMSTPLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAP KAPAA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 17 66 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2kvu 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 931 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 931 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.3e-08 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLLSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPPLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQASPLQILVKEEGPRAGSCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEKRAQQPAPAPAPLGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPAHPFNPSLAAPATNHIDPCAVAPGPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQLLLGPQGPSLIKGVAPPTLITDSTGTHLVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAPSAQMDLEHPLQPLFGTPTSLLKKEPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPKTVCGSPLAAQPSPSAELPQAAPPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHDGPEPLSLIDDLHSQMLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAPSLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPV---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2kvu.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 338 338 ? A 6.672 -3.681 -9.829 1 1 A GLY 0.440 1 ATOM 2 C CA . GLY 338 338 ? A 5.211 -3.599 -10.229 1 1 A GLY 0.440 1 ATOM 3 C C . GLY 338 338 ? A 4.299 -4.527 -9.475 1 1 A GLY 0.440 1 ATOM 4 O O . GLY 338 338 ? A 3.375 -4.076 -8.824 1 1 A GLY 0.440 1 ATOM 5 N N . LYS 339 339 ? A 4.544 -5.852 -9.514 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 6 C CA . LYS 339 339 ? A 3.734 -6.803 -8.786 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 7 C C . LYS 339 339 ? A 4.660 -7.783 -8.077 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 8 O O . LYS 339 339 ? A 5.037 -8.783 -8.682 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 9 C CB . LYS 339 339 ? A 2.853 -7.567 -9.796 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 10 C CG . LYS 339 339 ? A 1.648 -6.737 -10.269 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 11 C CD . LYS 339 339 ? A 0.850 -7.414 -11.402 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 12 C CE . LYS 339 339 ? A 0.376 -8.847 -11.128 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 13 N NZ . LYS 339 339 ? A -0.516 -8.829 -9.954 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 14 N N . PRO 340 340 ? A 5.068 -7.546 -6.840 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 15 C CA . PRO 340 340 ? A 5.758 -8.528 -6.024 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 16 C C . PRO 340 340 ? A 4.762 -9.389 -5.248 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 17 O O . PRO 340 340 ? A 3.555 -9.138 -5.275 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 18 C CB . PRO 340 340 ? A 6.580 -7.620 -5.084 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 19 C CG . PRO 340 340 ? A 5.712 -6.369 -4.869 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 20 C CD . PRO 340 340 ? A 4.816 -6.309 -6.109 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 21 N N . GLY 341 341 ? A 5.279 -10.417 -4.539 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 22 C CA . GLY 341 341 ? A 4.553 -11.326 -3.655 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 23 C C . GLY 341 341 ? A 4.755 -10.999 -2.201 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 24 O O . GLY 341 341 ? A 4.476 -11.811 -1.341 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 25 N N . ALA 342 342 ? A 5.287 -9.803 -1.890 1 1 A ALA 0.580 1 ATOM 26 C CA . ALA 342 342 ? A 5.589 -9.421 -0.527 1 1 A ALA 0.580 1 ATOM 27 C C . ALA 342 342 ? A 5.460 -7.909 -0.434 1 1 A ALA 0.580 1 ATOM 28 O O . ALA 342 342 ? A 4.790 -7.304 -1.271 1 1 A ALA 0.580 1 ATOM 29 C CB . ALA 342 342 ? 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A 8.101 -2.002 -0.192 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 44 C CD . PRO 344 344 ? A 7.342 -3.326 -0.260 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 45 N N . ALA 345 345 ? A 10.113 -3.299 3.541 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 46 C CA . ALA 345 345 ? A 9.990 -2.999 4.959 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 47 C C . ALA 345 345 ? A 10.066 -1.495 5.250 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 48 O O . ALA 345 345 ? A 10.233 -1.062 6.384 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 49 C CB . ALA 345 345 ? A 11.135 -3.724 5.700 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 50 N N . ASN 346 346 ? A 9.923 -0.661 4.200 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 51 C CA . ASN 346 346 ? A 10.114 0.771 4.226 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 52 C C . ASN 346 346 ? A 8.833 1.493 3.799 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 53 O O . ASN 346 346 ? A 8.865 2.620 3.328 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 54 C CB . ASN 346 346 ? A 11.341 1.107 3.317 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 55 C CG . ASN 346 346 ? A 12.175 2.288 3.825 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 56 O OD1 . ASN 346 346 ? A 12.558 3.141 3.051 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 57 N ND2 . ASN 346 346 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.748 2 1 3 0.033 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 338 GLY 1 0.440 2 1 A 339 LYS 1 0.440 3 1 A 340 PRO 1 0.690 4 1 A 341 GLY 1 0.600 5 1 A 342 ALA 1 0.580 6 1 A 343 LEU 1 0.710 7 1 A 344 PRO 1 0.760 8 1 A 345 ALA 1 0.670 9 1 A 346 ASN 1 0.740 10 1 A 347 LEU 1 0.860 11 1 A 348 ASP 1 0.790 12 1 A 349 ASP 1 0.780 13 1 A 350 MET 1 0.810 14 1 A 351 LYS 1 0.760 15 1 A 352 VAL 1 0.820 16 1 A 353 ALA 1 0.850 17 1 A 354 GLU 1 0.860 18 1 A 355 LEU 1 0.880 19 1 A 356 LYS 1 0.840 20 1 A 357 GLN 1 0.860 21 1 A 358 GLU 1 0.820 22 1 A 359 LEU 1 0.880 23 1 A 360 LYS 1 0.800 24 1 A 361 LEU 1 0.800 25 1 A 362 ARG 1 0.690 26 1 A 363 SER 1 0.820 27 1 A 364 LEU 1 0.830 28 1 A 365 PRO 1 0.880 29 1 A 366 VAL 1 0.810 30 1 A 367 SER 1 0.760 31 1 A 368 GLY 1 0.790 32 1 A 369 THR 1 0.810 33 1 A 370 LYS 1 0.810 34 1 A 371 THR 1 0.820 35 1 A 372 GLU 1 0.830 36 1 A 373 LEU 1 0.880 37 1 A 374 ILE 1 0.870 38 1 A 375 GLU 1 0.830 39 1 A 376 ARG 1 0.800 40 1 A 377 LEU 1 0.890 41 1 A 378 ARG 1 0.790 42 1 A 379 ALA 1 0.850 43 1 A 380 TYR 1 0.750 44 1 A 381 GLN 1 0.710 45 1 A 382 ASP 1 0.650 46 1 A 383 GLN 1 0.550 47 1 A 384 ILE 1 0.480 48 1 A 385 SER 1 0.540 49 1 A 386 PRO 1 0.470 50 1 A 387 VAL 1 0.460 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #