data_SMR-14af72d6b224f1e1c188ec94e1c60116_1 _entry.id SMR-14af72d6b224f1e1c188ec94e1c60116_1 _struct.entry_id SMR-14af72d6b224f1e1c188ec94e1c60116_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - O60271/ JIP4_HUMAN, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 Estimated model accuracy of this model is 0.026, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O60271' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 120094.518 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP JIP4_HUMAN O60271 1 ;MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQE HQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYAD QISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLP AGDGLLTPDAQKGGETPGSEQWKFQELSQPRSHTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTANSDVATIPTDTPL KEENEGFVKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMDKDLSGYKGSS TPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDL IAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFT RVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPPV NLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQ AFGWSLPQKYKQVTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYK DVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDS FTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTG AATSPSTNGASPVMDKPPEMEAENSEVDENVPTAEEATEATEGNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLG VQIPEDLSPVYQSRYNNGSST ; 'C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 931 1 931 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . JIP4_HUMAN O60271 O60271-2 1 931 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-05-02 1A427D7B60367814 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQE HQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYAD QISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLP AGDGLLTPDAQKGGETPGSEQWKFQELSQPRSHTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTANSDVATIPTDTPL KEENEGFVKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMDKDLSGYKGSS TPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDL IAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFT RVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPPV NLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQ 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AFGWSLPQKYKQVTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYK DVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDS FTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTG AATSPSTNGASPVMDKPPEMEAENSEVDENVPTAEEATEATEGNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLG VQIPEDLSPVYQSRYNNGSST ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 LEU . 1 4 GLU . 1 5 ASP . 1 6 GLY . 1 7 VAL . 1 8 VAL . 1 9 TYR . 1 10 GLN . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 PRO . 1 14 GLY . 1 15 GLY . 1 16 SER . 1 17 GLY . 1 18 ALA . 1 19 VAL . 1 20 MET . 1 21 SER . 1 22 GLU . 1 23 ARG . 1 24 VAL . 1 25 SER . 1 26 GLY . 1 27 LEU . 1 28 ALA . 1 29 GLY . 1 30 SER . 1 31 ILE . 1 32 TYR . 1 33 ARG . 1 34 GLU . 1 35 PHE . 1 36 GLU . 1 37 ARG . 1 38 LEU . 1 39 ILE . 1 40 GLY . 1 41 ARG . 1 42 TYR . 1 43 ASP . 1 44 GLU . 1 45 GLU . 1 46 VAL . 1 47 VAL . 1 48 LYS . 1 49 GLU . 1 50 LEU . 1 51 MET . 1 52 PRO . 1 53 LEU . 1 54 VAL . 1 55 VAL . 1 56 ALA . 1 57 VAL . 1 58 LEU . 1 59 GLU . 1 60 ASN . 1 61 LEU . 1 62 ASP . 1 63 SER . 1 64 VAL . 1 65 PHE . 1 66 ALA . 1 67 GLN . 1 68 ASP . 1 69 GLN . 1 70 GLU . 1 71 HIS . 1 72 GLN . 1 73 VAL . 1 74 GLU . 1 75 LEU . 1 76 GLU . 1 77 LEU . 1 78 LEU . 1 79 ARG . 1 80 ASP . 1 81 ASP . 1 82 ASN . 1 83 GLU . 1 84 GLN . 1 85 LEU . 1 86 ILE . 1 87 THR . 1 88 GLN . 1 89 TYR . 1 90 GLU . 1 91 ARG . 1 92 GLU . 1 93 LYS . 1 94 ALA . 1 95 LEU . 1 96 ARG . 1 97 LYS . 1 98 HIS . 1 99 ALA . 1 100 GLU . 1 101 GLU . 1 102 LYS . 1 103 PHE . 1 104 ILE . 1 105 GLU . 1 106 PHE . 1 107 GLU . 1 108 ASP . 1 109 SER . 1 110 GLN . 1 111 GLU . 1 112 GLN . 1 113 GLU . 1 114 LYS . 1 115 LYS . 1 116 ASP . 1 117 LEU . 1 118 GLN . 1 119 THR . 1 120 ARG . 1 121 VAL . 1 122 GLU . 1 123 SER . 1 124 LEU . 1 125 GLU . 1 126 SER . 1 127 GLN . 1 128 THR . 1 129 ARG . 1 130 GLN . 1 131 LEU . 1 132 GLU . 1 133 LEU . 1 134 LYS . 1 135 ALA . 1 136 LYS . 1 137 ASN . 1 138 TYR . 1 139 ALA . 1 140 ASP . 1 141 GLN . 1 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B 1 679 VAL 679 ? ? ? B . B 1 680 ASN 680 ? ? ? B . B 1 681 LEU 681 ? ? ? B . B 1 682 SER 682 ? ? ? B . B 1 683 GLY 683 ? ? ? B . B 1 684 GLY 684 ? ? ? B . B 1 685 LYS 685 ? ? ? B . B 1 686 THR 686 ? ? ? B . B 1 687 ARG 687 ? ? ? B . B 1 688 ASP 688 ? ? ? B . B 1 689 GLY 689 ? ? ? B . B 1 690 GLY 690 ? ? ? B . B 1 691 SER 691 ? ? ? B . B 1 692 VAL 692 ? ? ? B . B 1 693 VAL 693 ? ? ? B . B 1 694 GLY 694 ? ? ? B . B 1 695 ALA 695 ? ? ? B . B 1 696 SER 696 ? ? ? B . B 1 697 VAL 697 ? ? ? B . B 1 698 PHE 698 ? ? ? B . B 1 699 TYR 699 ? ? ? B . B 1 700 LYS 700 ? ? ? B . B 1 701 ASP 701 ? ? ? B . B 1 702 VAL 702 ? ? ? B . B 1 703 ALA 703 ? ? ? B . B 1 704 GLY 704 ? ? ? B . B 1 705 LEU 705 ? ? ? B . B 1 706 ASP 706 ? ? ? B . B 1 707 THR 707 ? ? ? B . B 1 708 GLU 708 ? ? ? B . B 1 709 GLY 709 ? ? ? B . B 1 710 SER 710 ? ? ? B . B 1 711 LYS 711 ? ? ? B . B 1 712 GLN 712 ? ? ? B . B 1 713 ARG 713 ? ? ? B . B 1 714 SER 714 ? ? ? B . B 1 715 ALA 715 ? ? ? B . B 1 716 SER 716 ? ? ? B . B 1 717 GLN 717 ? ? ? B . B 1 718 SER 718 ? ? ? B . B 1 719 SER 719 ? ? ? B . B 1 720 LEU 720 ? ? ? B . B 1 721 ASP 721 ? ? ? B . B 1 722 LYS 722 ? ? ? B . B 1 723 LEU 723 ? ? ? B . B 1 724 ASP 724 ? ? ? B . B 1 725 GLN 725 ? ? ? B . B 1 726 GLU 726 ? ? ? B . B 1 727 LEU 727 ? ? ? B . B 1 728 LYS 728 ? ? ? B . B 1 729 GLU 729 ? ? ? B . B 1 730 GLN 730 ? ? ? B . B 1 731 GLN 731 ? ? ? B . B 1 732 LYS 732 ? ? ? B . B 1 733 GLU 733 ? ? ? B . B 1 734 LEU 734 ? ? ? B . B 1 735 LYS 735 ? ? ? B . B 1 736 ASN 736 ? ? ? B . B 1 737 GLN 737 ? ? ? B . B 1 738 GLU 738 ? ? ? B . B 1 739 GLU 739 ? ? ? B . B 1 740 LEU 740 ? ? ? B . B 1 741 SER 741 ? ? ? B . B 1 742 SER 742 ? ? ? B . B 1 743 LEU 743 ? ? ? B . B 1 744 VAL 744 ? ? ? B . B 1 745 TRP 745 ? ? ? B . B 1 746 ILE 746 ? ? ? B . B 1 747 CYS 747 ? ? ? B . B 1 748 THR 748 ? ? ? B . B 1 749 SER 749 ? ? ? B . B 1 750 THR 750 ? ? ? B . B 1 751 HIS 751 ? ? ? B . B 1 752 SER 752 ? ? ? B . B 1 753 ALA 753 ? ? ? B . B 1 754 THR 754 ? ? ? B . 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B 1 831 VAL 831 ? ? ? B . B 1 832 GLY 832 ? ? ? B . B 1 833 CYS 833 ? ? ? B . B 1 834 SER 834 ? ? ? B . B 1 835 ALA 835 ? ? ? B . B 1 836 GLU 836 ? ? ? B . B 1 837 GLY 837 ? ? ? B . B 1 838 VAL 838 ? ? ? B . B 1 839 THR 839 ? ? ? B . B 1 840 GLY 840 ? ? ? B . B 1 841 ALA 841 ? ? ? B . B 1 842 ALA 842 ? ? ? B . B 1 843 THR 843 ? ? ? B . B 1 844 SER 844 ? ? ? B . B 1 845 PRO 845 ? ? ? B . B 1 846 SER 846 ? ? ? B . B 1 847 THR 847 ? ? ? B . B 1 848 ASN 848 ? ? ? B . B 1 849 GLY 849 ? ? ? B . B 1 850 ALA 850 ? ? ? B . B 1 851 SER 851 ? ? ? B . B 1 852 PRO 852 ? ? ? B . B 1 853 VAL 853 ? ? ? B . B 1 854 MET 854 ? ? ? B . B 1 855 ASP 855 ? ? ? B . B 1 856 LYS 856 ? ? ? B . B 1 857 PRO 857 ? ? ? B . B 1 858 PRO 858 ? ? ? B . B 1 859 GLU 859 ? ? ? B . B 1 860 MET 860 ? ? ? B . B 1 861 GLU 861 ? ? ? B . B 1 862 ALA 862 ? ? ? B . B 1 863 GLU 863 ? ? ? B . B 1 864 ASN 864 ? ? ? B . B 1 865 SER 865 ? ? ? B . B 1 866 GLU 866 ? ? ? B . B 1 867 VAL 867 ? ? ? B . B 1 868 ASP 868 ? ? ? B . B 1 869 GLU 869 ? ? ? B . B 1 870 ASN 870 ? ? ? B . B 1 871 VAL 871 ? ? ? B . B 1 872 PRO 872 ? ? ? B . B 1 873 THR 873 ? ? ? B . B 1 874 ALA 874 ? ? ? B . B 1 875 GLU 875 ? ? ? B . B 1 876 GLU 876 ? ? ? B . B 1 877 ALA 877 ? ? ? B . B 1 878 THR 878 ? ? ? B . B 1 879 GLU 879 ? ? ? B . B 1 880 ALA 880 ? ? ? B . B 1 881 THR 881 ? ? ? B . B 1 882 GLU 882 ? ? ? B . B 1 883 GLY 883 ? ? ? B . B 1 884 ASN 884 ? ? ? B . B 1 885 ALA 885 ? ? ? B . B 1 886 GLY 886 ? ? ? B . B 1 887 SER 887 ? ? ? B . B 1 888 ALA 888 ? ? ? B . B 1 889 GLU 889 ? ? ? B . B 1 890 ASP 890 ? ? ? B . B 1 891 THR 891 ? ? ? B . B 1 892 VAL 892 ? ? ? B . B 1 893 ASP 893 ? ? ? B . B 1 894 ILE 894 ? ? ? B . B 1 895 SER 895 ? ? ? B . B 1 896 GLN 896 ? ? ? B . B 1 897 THR 897 ? ? ? B . B 1 898 GLY 898 ? ? ? B . B 1 899 VAL 899 ? ? ? B . B 1 900 TYR 900 ? ? ? B . B 1 901 THR 901 ? ? ? B . B 1 902 GLU 902 ? ? ? B . B 1 903 HIS 903 ? ? ? B . B 1 904 VAL 904 ? ? ? B . B 1 905 PHE 905 ? ? ? B . B 1 906 THR 906 ? ? ? B . B 1 907 ASP 907 ? ? ? B . B 1 908 PRO 908 ? ? ? B . B 1 909 LEU 909 ? ? ? B . B 1 910 GLY 910 ? ? ? B . B 1 911 VAL 911 ? ? ? B . B 1 912 GLN 912 ? ? ? B . B 1 913 ILE 913 ? ? ? B . B 1 914 PRO 914 ? ? ? B . B 1 915 GLU 915 ? ? ? B . B 1 916 ASP 916 ? ? ? B . B 1 917 LEU 917 ? ? ? B . B 1 918 SER 918 ? ? ? B . B 1 919 PRO 919 ? ? ? B . B 1 920 VAL 920 ? ? ? B . B 1 921 TYR 921 ? ? ? B . B 1 922 GLN 922 ? ? ? B . B 1 923 SER 923 ? ? ? B . B 1 924 ARG 924 ? ? ? B . B 1 925 TYR 925 ? ? ? B . B 1 926 ASN 926 ? ? ? B . B 1 927 ASN 927 ? ? ? B . B 1 928 GLY 928 ? ? ? B . B 1 929 SER 929 ? ? ? B . B 1 930 SER 930 ? ? ? B . B 1 931 THR 931 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Vimentin {PDB ID=3swk, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3swk.1.A}' 'template structure' . 2 'Vimentin {PDB ID=3swk, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3swk.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 3swk, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 3swk, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLER KVESLQEEIAFLKKLH ; ;EMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLER KVESLQEEIAFLKKLH ; 2 ;EMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLER KVESLQEEIAFLKKLH ; ;EMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLER KVESLQEEIAFLKKLH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 80 2 2 8 80 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3swk 2024-02-28 2 PDB . 3swk 2024-02-28 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 931 2 2 B 1 931 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 934 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 934 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.100 24.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 3.100 24.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQE---KKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQKGGETPGSEQWKFQELSQPRSHTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTANSDVATIPTDTPLKEENEGFVKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMDKDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGASPVMDKPPEMEAENSEVDENVPTAEEATEATEGNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQSRYNNGSST 2 1 2 -----------------------------------------------------------QVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQE---KKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQKGGETPGSEQWKFQELSQPRSHTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTANSDVATIPTDTPLKEENEGFVKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMDKDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGASPVMDKPPEMEAENSEVDENVPTAEEATEATEGNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQSRYNNGSST 4 2 2 -----------------------------------------------------------QVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.243}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3swk.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASN 60 60 ? A 67.027 36.567 4.710 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 2 C CA . ASN 60 60 ? A 66.312 35.274 5.026 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 3 C C . ASN 60 60 ? A 66.411 34.851 6.472 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 4 O O . ASN 60 60 ? A 65.384 34.643 7.088 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 5 C CB . ASN 60 60 ? A 66.738 34.091 4.112 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 6 C CG . ASN 60 60 ? A 66.349 34.400 2.674 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 7 O OD1 . ASN 60 60 ? A 65.596 35.344 2.482 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 8 N ND2 . ASN 60 60 ? A 66.900 33.660 1.689 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 9 N N . LEU 61 61 ? A 67.626 34.760 7.069 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 10 C CA . LEU 61 61 ? A 67.801 34.381 8.460 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 11 C C . LEU 61 61 ? A 66.958 35.182 9.450 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 12 O O . LEU 61 61 ? A 66.186 34.604 10.203 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 13 C CB . LEU 61 61 ? A 69.302 34.542 8.801 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 14 C CG . LEU 61 61 ? A 69.667 34.353 10.285 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 15 C CD1 . LEU 61 61 ? A 69.241 32.962 10.759 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 16 C CD2 . LEU 61 61 ? A 71.167 34.588 10.520 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 17 N N . ASP 62 62 ? A 67.021 36.530 9.381 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 18 C CA . ASP 62 62 ? A 66.266 37.417 10.244 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 19 C C . ASP 62 62 ? A 64.760 37.290 10.076 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 20 O O . ASP 62 62 ? A 63.999 37.235 11.035 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 21 C CB . ASP 62 62 ? A 66.711 38.871 9.959 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 22 C CG . ASP 62 62 ? A 68.175 39.040 10.331 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 23 O OD1 . ASP 62 62 ? A 68.677 38.242 11.160 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 24 O OD2 . ASP 62 62 ? A 68.815 39.921 9.709 1 1 A ASP 0.600 1 ATOM 25 N N . SER 63 63 ? A 64.306 37.184 8.808 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 26 C CA . SER 63 63 ? A 62.904 37.070 8.449 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 27 C C . SER 63 63 ? A 62.287 35.803 8.960 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 28 O O . SER 63 63 ? A 61.230 35.836 9.573 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 29 C CB . SER 63 63 ? A 62.662 37.062 6.917 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 30 O OG . SER 63 63 ? A 63.242 38.193 6.263 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 31 N N . VAL 64 64 ? A 62.969 34.656 8.757 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 32 C CA . VAL 64 64 ? A 62.501 33.393 9.273 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 33 C C . VAL 64 64 ? A 62.544 33.355 10.802 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 34 O O . VAL 64 64 ? A 61.597 32.924 11.430 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 35 C CB . VAL 64 64 ? A 63.244 32.192 8.713 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 36 C CG1 . VAL 64 64 ? A 62.434 30.987 9.201 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 37 C CG2 . VAL 64 64 ? A 63.304 32.101 7.182 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 38 N N . PHE 65 65 ? A 63.606 33.910 11.454 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 39 C CA . PHE 65 65 ? A 63.696 33.993 12.907 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 40 C C . PHE 65 65 ? A 62.516 34.746 13.513 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 41 O O . PHE 65 65 ? A 61.920 34.323 14.498 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 42 C CB . PHE 65 65 ? A 65.029 34.706 13.281 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 43 C CG . PHE 65 65 ? A 65.239 34.814 14.766 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 44 C CD1 . PHE 65 65 ? A 64.930 36.003 15.445 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 45 C CD2 . PHE 65 65 ? A 65.681 33.710 15.503 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 46 C CE1 . PHE 65 65 ? A 65.066 36.087 16.835 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 47 C CE2 . PHE 65 65 ? A 65.826 33.791 16.892 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 48 C CZ . PHE 65 65 ? A 65.523 34.982 17.560 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 49 N N . ALA 66 66 ? A 62.133 35.877 12.887 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 50 C CA . ALA 66 66 ? A 60.952 36.617 13.260 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 51 C C . ALA 66 66 ? A 59.655 35.814 13.087 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 52 O O . ALA 66 66 ? A 58.876 35.702 14.026 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 53 C CB . ALA 66 66 ? A 60.919 37.924 12.439 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 54 N N . GLN 67 67 ? A 59.448 35.164 11.915 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 55 C CA . GLN 67 67 ? A 58.269 34.355 11.625 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 56 C C . GLN 67 67 ? A 58.103 33.161 12.557 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 57 O O . GLN 67 67 ? A 57.042 32.990 13.151 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 58 C CB . GLN 67 67 ? A 58.284 33.882 10.148 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 59 C CG . GLN 67 67 ? A 58.098 35.053 9.153 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 60 C CD . GLN 67 67 ? A 58.249 34.623 7.692 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 61 O OE1 . GLN 67 67 ? A 59.023 33.761 7.302 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 62 N NE2 . GLN 67 67 ? A 57.514 35.338 6.797 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 63 N N . ASP 68 68 ? A 59.187 32.389 12.803 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 64 C CA . ASP 68 68 ? A 59.199 31.233 13.678 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 65 C C . ASP 68 68 ? A 58.793 31.633 15.089 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 66 O O . ASP 68 68 ? A 57.919 31.045 15.715 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 67 C CB . ASP 68 68 ? A 60.621 30.611 13.635 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 68 C CG . ASP 68 68 ? A 60.686 29.275 14.351 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 69 O OD1 . ASP 68 68 ? A 61.354 29.214 15.418 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 70 O OD2 . ASP 68 68 ? A 60.114 28.302 13.811 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 71 N N . GLN 69 69 ? A 59.347 32.764 15.579 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 72 C CA . GLN 69 69 ? A 58.984 33.326 16.862 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 73 C C . GLN 69 69 ? A 57.506 33.715 16.955 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 74 O O . GLN 69 69 ? A 56.845 33.419 17.949 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 75 C CB . GLN 69 69 ? A 59.875 34.549 17.198 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 76 C CG . GLN 69 69 ? A 59.699 35.097 18.636 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 77 C CD . GLN 69 69 ? A 60.117 34.057 19.678 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 78 O OE1 . GLN 69 69 ? A 61.237 33.564 19.671 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 79 N NE2 . GLN 69 69 ? A 59.205 33.723 20.627 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 80 N N . GLU 70 70 ? A 56.940 34.357 15.906 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 81 C CA . GLU 70 70 ? A 55.523 34.679 15.814 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 82 C C . GLU 70 70 ? A 54.620 33.452 15.784 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 83 O O . GLU 70 70 ? A 53.674 33.340 16.566 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 84 C CB . GLU 70 70 ? A 55.238 35.514 14.541 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 85 C CG . GLU 70 70 ? A 55.834 36.942 14.567 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 86 C CD . GLU 70 70 ? A 55.645 37.709 13.255 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 87 O OE1 . GLU 70 70 ? A 55.125 37.130 12.268 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 88 O OE2 . GLU 70 70 ? A 56.034 38.907 13.244 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 89 N N . HIS 71 71 ? A 54.932 32.462 14.923 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 90 C CA . HIS 71 71 ? A 54.204 31.211 14.835 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 91 C C . HIS 71 71 ? A 54.296 30.376 16.090 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 92 O O . HIS 71 71 ? A 53.295 29.829 16.538 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 93 C CB . HIS 71 71 ? A 54.604 30.391 13.605 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 94 C CG . HIS 71 71 ? A 54.206 31.084 12.349 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 95 N ND1 . HIS 71 71 ? A 55.036 30.913 11.274 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 96 C CD2 . HIS 71 71 ? A 53.144 31.852 12.005 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 97 C CE1 . HIS 71 71 ? A 54.489 31.581 10.298 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 98 N NE2 . HIS 71 71 ? A 53.329 32.177 10.676 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 99 N N . GLN 72 72 ? A 55.469 30.306 16.748 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 100 C CA . GLN 72 72 ? A 55.593 29.652 18.037 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 101 C C . GLN 72 72 ? 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A 47.136 29.442 22.206 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 144 O O . LEU 77 77 ? A 46.243 29.185 23.001 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 145 C CB . LEU 77 77 ? A 48.040 31.743 21.759 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 146 C CG . LEU 77 77 ? A 48.925 32.924 22.213 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 147 C CD1 . LEU 77 77 ? A 48.788 34.107 21.236 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 148 C CD2 . LEU 77 77 ? A 48.615 33.354 23.657 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 149 N N . LEU 78 78 ? A 47.211 28.781 21.033 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 150 C CA . LEU 78 78 ? A 46.241 27.771 20.654 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 151 C C . LEU 78 78 ? A 46.235 26.551 21.551 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 152 O O . LEU 78 78 ? A 45.185 25.967 21.823 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 153 C CB . LEU 78 78 ? A 46.469 27.280 19.212 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 154 C CG . LEU 78 78 ? A 46.248 28.347 18.130 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 155 C CD1 . LEU 78 78 ? A 46.663 27.779 16.767 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 156 C CD2 . LEU 78 78 ? A 44.802 28.872 18.085 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 157 N N . ARG 79 79 ? 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B 18.477 19.773 26.942 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 928 C CG . HIS 98 98 ? B 17.328 18.937 26.501 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 929 N ND1 . HIS 98 98 ? B 16.185 19.585 26.095 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 930 C CD2 . HIS 98 98 ? B 17.138 17.597 26.496 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 931 C CE1 . HIS 98 98 ? B 15.319 18.637 25.858 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 932 N NE2 . HIS 98 98 ? B 15.838 17.400 26.076 1 1 B HIS 0.600 1 ATOM 933 N N . ALA 99 99 ? B 19.141 18.584 29.777 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 934 C CA . ALA 99 99 ? B 19.070 17.582 30.826 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 935 C C . ALA 99 99 ? B 18.693 18.158 32.187 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 936 O O . ALA 99 99 ? B 17.858 17.600 32.899 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 937 C CB . ALA 99 99 ? B 20.417 16.840 30.954 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 938 N N . GLU 100 100 ? B 19.290 19.315 32.557 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 939 C CA . GLU 100 100 ? B 18.956 20.055 33.757 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 940 C C . GLU 100 100 ? B 17.502 20.541 33.740 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 941 O O . GLU 100 100 ? 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B 16.533 25.438 29.566 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 956 N N . LYS 102 102 ? B 14.895 19.219 32.017 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 957 C CA . LYS 102 102 ? B 14.082 18.025 32.165 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 958 C C . LYS 102 102 ? B 14.013 17.485 33.592 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 959 O O . LYS 102 102 ? B 12.969 17.044 34.071 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 960 C CB . LYS 102 102 ? B 14.628 16.911 31.242 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 961 C CG . LYS 102 102 ? B 13.726 15.667 31.196 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 962 C CD . LYS 102 102 ? B 14.203 14.616 30.183 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 963 C CE . LYS 102 102 ? B 13.160 13.518 29.949 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 964 N NZ . LYS 102 102 ? B 13.676 12.472 29.038 1 1 B LYS 0.550 1 ATOM 965 N N . PHE 103 103 ? B 15.156 17.520 34.310 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 966 C CA . PHE 103 103 ? B 15.244 17.224 35.725 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 967 C C . PHE 103 103 ? B 14.425 18.198 36.580 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 968 O O . PHE 103 103 ? B 13.652 17.755 37.422 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 969 C CB . PHE 103 103 ? 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B 11.507 15.280 36.613 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 998 C CG . PHE 106 106 ? B 11.126 13.914 37.128 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 999 C CD1 . PHE 106 106 ? B 11.358 13.598 38.475 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 1000 C CD2 . PHE 106 106 ? B 10.463 12.974 36.325 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 1001 C CE1 . PHE 106 106 ? B 10.916 12.388 39.007 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 1002 C CE2 . PHE 106 106 ? B 10.102 11.723 36.841 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 1003 C CZ . PHE 106 106 ? B 10.337 11.427 38.184 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 1004 N N . GLU 107 107 ? B 11.163 17.319 38.966 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1005 C CA . GLU 107 107 ? B 11.105 17.684 40.366 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1006 C C . GLU 107 107 ? B 9.826 18.449 40.671 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1007 O O . GLU 107 107 ? B 9.089 18.051 41.559 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1008 C CB . GLU 107 107 ? B 12.367 18.469 40.786 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1009 C CG . GLU 107 107 ? B 12.471 18.750 42.307 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1010 C CD . GLU 107 107 ? B 13.847 19.285 42.728 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 1011 O OE1 . 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.575 2 1 3 0.026 3 1 4 0.243 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 60 ASN 1 0.610 2 1 A 61 LEU 1 0.630 3 1 A 62 ASP 1 0.600 4 1 A 63 SER 1 0.610 5 1 A 64 VAL 1 0.600 6 1 A 65 PHE 1 0.570 7 1 A 66 ALA 1 0.640 8 1 A 67 GLN 1 0.590 9 1 A 68 ASP 1 0.620 10 1 A 69 GLN 1 0.600 11 1 A 70 GLU 1 0.580 12 1 A 71 HIS 1 0.590 13 1 A 72 GLN 1 0.610 14 1 A 73 VAL 1 0.640 15 1 A 74 GLU 1 0.600 16 1 A 75 LEU 1 0.650 17 1 A 76 GLU 1 0.600 18 1 A 77 LEU 1 0.640 19 1 A 78 LEU 1 0.630 20 1 A 79 ARG 1 0.540 21 1 A 80 ASP 1 0.610 22 1 A 81 ASP 1 0.620 23 1 A 82 ASN 1 0.630 24 1 A 83 GLU 1 0.610 25 1 A 84 GLN 1 0.610 26 1 A 85 LEU 1 0.650 27 1 A 86 ILE 1 0.640 28 1 A 87 THR 1 0.640 29 1 A 88 GLN 1 0.610 30 1 A 89 TYR 1 0.620 31 1 A 90 GLU 1 0.600 32 1 A 91 ARG 1 0.600 33 1 A 92 GLU 1 0.600 34 1 A 93 LYS 1 0.620 35 1 A 94 ALA 1 0.660 36 1 A 95 LEU 1 0.620 37 1 A 96 ARG 1 0.590 38 1 A 97 LYS 1 0.610 39 1 A 98 HIS 1 0.610 40 1 A 99 ALA 1 0.680 41 1 A 100 GLU 1 0.590 42 1 A 101 GLU 1 0.580 43 1 A 102 LYS 1 0.570 44 1 A 103 PHE 1 0.560 45 1 A 104 ILE 1 0.540 46 1 A 105 GLU 1 0.490 47 1 A 106 PHE 1 0.520 48 1 A 107 GLU 1 0.490 49 1 A 108 ASP 1 0.490 50 1 A 109 SER 1 0.460 51 1 A 110 GLN 1 0.300 52 1 A 111 GLU 1 0.240 53 1 A 112 GLN 1 0.320 54 1 A 113 GLU 1 0.230 55 1 A 114 LYS 1 0.280 56 1 A 115 LYS 1 0.420 57 1 A 116 ASP 1 0.480 58 1 A 117 LEU 1 0.510 59 1 A 118 GLN 1 0.500 60 1 A 119 THR 1 0.580 61 1 A 120 ARG 1 0.500 62 1 A 121 VAL 1 0.630 63 1 A 122 GLU 1 0.590 64 1 A 123 SER 1 0.650 65 1 A 124 LEU 1 0.660 66 1 A 125 GLU 1 0.630 67 1 A 126 SER 1 0.650 68 1 A 127 GLN 1 0.600 69 1 A 128 THR 1 0.640 70 1 A 129 ARG 1 0.630 71 1 B 60 ASN 1 0.510 72 1 B 61 LEU 1 0.590 73 1 B 62 ASP 1 0.500 74 1 B 63 SER 1 0.580 75 1 B 64 VAL 1 0.590 76 1 B 65 PHE 1 0.560 77 1 B 66 ALA 1 0.610 78 1 B 67 GLN 1 0.570 79 1 B 68 ASP 1 0.600 80 1 B 69 GLN 1 0.560 81 1 B 70 GLU 1 0.550 82 1 B 71 HIS 1 0.570 83 1 B 72 GLN 1 0.610 84 1 B 73 VAL 1 0.640 85 1 B 74 GLU 1 0.590 86 1 B 75 LEU 1 0.650 87 1 B 76 GLU 1 0.590 88 1 B 77 LEU 1 0.630 89 1 B 78 LEU 1 0.630 90 1 B 79 ARG 1 0.540 91 1 B 80 ASP 1 0.600 92 1 B 81 ASP 1 0.620 93 1 B 82 ASN 1 0.630 94 1 B 83 GLU 1 0.610 95 1 B 84 GLN 1 0.600 96 1 B 85 LEU 1 0.650 97 1 B 86 ILE 1 0.630 98 1 B 87 THR 1 0.630 99 1 B 88 GLN 1 0.620 100 1 B 89 TYR 1 0.620 101 1 B 90 GLU 1 0.610 102 1 B 91 ARG 1 0.600 103 1 B 92 GLU 1 0.610 104 1 B 93 LYS 1 0.620 105 1 B 94 ALA 1 0.660 106 1 B 95 LEU 1 0.630 107 1 B 96 ARG 1 0.590 108 1 B 97 LYS 1 0.610 109 1 B 98 HIS 1 0.600 110 1 B 99 ALA 1 0.670 111 1 B 100 GLU 1 0.600 112 1 B 101 GLU 1 0.560 113 1 B 102 LYS 1 0.550 114 1 B 103 PHE 1 0.580 115 1 B 104 ILE 1 0.580 116 1 B 105 GLU 1 0.530 117 1 B 106 PHE 1 0.590 118 1 B 107 GLU 1 0.510 119 1 B 108 ASP 1 0.540 120 1 B 109 SER 1 0.520 121 1 B 110 GLN 1 0.470 122 1 B 111 GLU 1 0.460 123 1 B 112 GLN 1 0.430 124 1 B 113 GLU 1 0.320 125 1 B 114 LYS 1 0.330 126 1 B 115 LYS 1 0.480 127 1 B 116 ASP 1 0.520 128 1 B 117 LEU 1 0.540 129 1 B 118 GLN 1 0.530 130 1 B 119 THR 1 0.610 131 1 B 120 ARG 1 0.530 132 1 B 121 VAL 1 0.630 133 1 B 122 GLU 1 0.610 134 1 B 123 SER 1 0.670 135 1 B 124 LEU 1 0.660 136 1 B 125 GLU 1 0.630 137 1 B 126 SER 1 0.650 138 1 B 127 GLN 1 0.600 139 1 B 128 THR 1 0.640 140 1 B 129 ARG 1 0.640 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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