data_SMR-b0949340f0ef4ebcb89a4dced4bfee86_1 _entry.id SMR-b0949340f0ef4ebcb89a4dced4bfee86_1 _struct.entry_id SMR-b0949340f0ef4ebcb89a4dced4bfee86_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y2D5/ PLAK2_HUMAN, PALM2-AKAP2 fusion protein Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y2D5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 121296.311 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PLAK2_HUMAN Q9Y2D5 1 ;MRWPQPGAAARLPPESPGPPESPGPPEREAAAARRWTGAEPQDCAPGSGRPEKPPQLSEDDIWLKSEGDN YSATLLEPAASSLSPDHKNMEIEVSVAECKSVPGITSTPHPMDHPSAFYSPPHNGLLTDHHESLDNDVAR EIRYLDEVLEANCCDSAVDGTYNGTSSPEPGAVVLVGGLSPPVHEATQPEPTERTASRQAPPHIELSNSS PDPMAEAERTNGHSPSQPRDALGDSLQVPVSPSSTTSSRCSSRDGEFTLTTLKKEAKFELRAFHEDKKPS KLFEDDEHEKEQYCIRKVRPSEEMLELEKERRELIRSQAVKKNPGIAAKWWNPPQEKTIEEQLDEEHLES HKKYKERKERRAQQEQLLLQKQLQQQQQQPPSQLCTAPASSHERASMIDKAKEDIVTEQIDFSAARKQFQ LMENSRQAVAKGQSTPRLFSIKPFYRPLGSVNSDKPLTNPRPPSVGGPPEDSGASAAKGQKSPGALETPS AAGSQGNTASQGKEGPYSEPSKRGPLSKLWAEDGEFTSARAVLTVVKDDDHGILDQFSRSVNVSLTQEEL DSGLDELSVRSQDTTVLETLSNDFSMDNISDSGASNETTNALQENSLADFSLPQTPQTDNPSEGRGEGVS KSFSDHGFYSPSSTLGDSPLVDDPLEYQAGLLVQNAIQQAIAEQVDKAVSKTSRDGAEQQGPEATVEEAE AAAFGSEKPQSMFEPPQVSSPVQEKRDVLPKILPAEDRALRERGPPQPLPAVQPSGPINMEETRPEGSYF SKYSEAAELRSTASLLATQESDVMVGPFKLRSRKQRTLSMIEEEIRAAQEREEELKRQRQVLQSTQSPRT KNAPSLPSRTCYKTAPGKIEKVKPPPSPTTEGPSLQPDLAPEEAAGTQRPKNLMQTLMEDYETHKSKRRE RMDDSSVLEATRVNRRKSALALRWEAGIYANQEEEDNE ; 'PALM2-AKAP2 fusion protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 948 1 948 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PLAK2_HUMAN Q9Y2D5 Q9Y2D5-3 1 948 9606 'Homo sapiens (Human)' 2023-11-08 9DBF30D86F05F61F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no I ;MRWPQPGAAARLPPESPGPPESPGPPEREAAAARRWTGAEPQDCAPGSGRPEKPPQLSEDDIWLKSEGDN YSATLLEPAASSLSPDHKNMEIEVSVAECKSVPGITSTPHPMDHPSAFYSPPHNGLLTDHHESLDNDVAR EIRYLDEVLEANCCDSAVDGTYNGTSSPEPGAVVLVGGLSPPVHEATQPEPTERTASRQAPPHIELSNSS PDPMAEAERTNGHSPSQPRDALGDSLQVPVSPSSTTSSRCSSRDGEFTLTTLKKEAKFELRAFHEDKKPS KLFEDDEHEKEQYCIRKVRPSEEMLELEKERRELIRSQAVKKNPGIAAKWWNPPQEKTIEEQLDEEHLES HKKYKERKERRAQQEQLLLQKQLQQQQQQPPSQLCTAPASSHERASMIDKAKEDIVTEQIDFSAARKQFQ LMENSRQAVAKGQSTPRLFSIKPFYRPLGSVNSDKPLTNPRPPSVGGPPEDSGASAAKGQKSPGALETPS AAGSQGNTASQGKEGPYSEPSKRGPLSKLWAEDGEFTSARAVLTVVKDDDHGILDQFSRSVNVSLTQEEL DSGLDELSVRSQDTTVLETLSNDFSMDNISDSGASNETTNALQENSLADFSLPQTPQTDNPSEGRGEGVS 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LYS . 1 54 PRO . 1 55 PRO . 1 56 GLN . 1 57 LEU . 1 58 SER . 1 59 GLU . 1 60 ASP . 1 61 ASP . 1 62 ILE . 1 63 TRP . 1 64 LEU . 1 65 LYS . 1 66 SER . 1 67 GLU . 1 68 GLY . 1 69 ASP . 1 70 ASN . 1 71 TYR . 1 72 SER . 1 73 ALA . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 LEU . 1 77 GLU . 1 78 PRO . 1 79 ALA . 1 80 ALA . 1 81 SER . 1 82 SER . 1 83 LEU . 1 84 SER . 1 85 PRO . 1 86 ASP . 1 87 HIS . 1 88 LYS . 1 89 ASN . 1 90 MET . 1 91 GLU . 1 92 ILE . 1 93 GLU . 1 94 VAL . 1 95 SER . 1 96 VAL . 1 97 ALA . 1 98 GLU . 1 99 CYS . 1 100 LYS . 1 101 SER . 1 102 VAL . 1 103 PRO . 1 104 GLY . 1 105 ILE . 1 106 THR . 1 107 SER . 1 108 THR . 1 109 PRO . 1 110 HIS . 1 111 PRO . 1 112 MET . 1 113 ASP . 1 114 HIS . 1 115 PRO . 1 116 SER . 1 117 ALA . 1 118 PHE . 1 119 TYR . 1 120 SER . 1 121 PRO . 1 122 PRO . 1 123 HIS . 1 124 ASN . 1 125 GLY . 1 126 LEU . 1 127 LEU . 1 128 THR . 1 129 ASP . 1 130 HIS . 1 131 HIS . 1 132 GLU . 1 133 SER . 1 134 LEU . 1 135 ASP . 1 136 ASN . 1 137 ASP . 1 138 VAL . 1 139 ALA . 1 140 ARG . 1 141 GLU . 1 142 ILE . 1 143 ARG . 1 144 TYR . 1 145 LEU . 1 146 ASP . 1 147 GLU . 1 148 VAL . 1 149 LEU . 1 150 GLU . 1 151 ALA . 1 152 ASN . 1 153 CYS . 1 154 CYS . 1 155 ASP . 1 156 SER . 1 157 ALA . 1 158 VAL . 1 159 ASP . 1 160 GLY . 1 161 THR . 1 162 TYR . 1 163 ASN . 1 164 GLY . 1 165 THR . 1 166 SER . 1 167 SER . 1 168 PRO . 1 169 GLU . 1 170 PRO . 1 171 GLY . 1 172 ALA . 1 173 VAL . 1 174 VAL . 1 175 LEU . 1 176 VAL . 1 177 GLY . 1 178 GLY . 1 179 LEU . 1 180 SER . 1 181 PRO . 1 182 PRO . 1 183 VAL . 1 184 HIS . 1 185 GLU . 1 186 ALA . 1 187 THR . 1 188 GLN . 1 189 PRO . 1 190 GLU . 1 191 PRO . 1 192 THR . 1 193 GLU . 1 194 ARG . 1 195 THR . 1 196 ALA . 1 197 SER . 1 198 ARG . 1 199 GLN . 1 200 ALA . 1 201 PRO . 1 202 PRO . 1 203 HIS . 1 204 ILE . 1 205 GLU . 1 206 LEU . 1 207 SER . 1 208 ASN . 1 209 SER . 1 210 SER . 1 211 PRO . 1 212 ASP . 1 213 PRO . 1 214 MET . 1 215 ALA . 1 216 GLU . 1 217 ALA . 1 218 GLU . 1 219 ARG . 1 220 THR . 1 221 ASN . 1 222 GLY . 1 223 HIS 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A 1 840 THR 840 ? ? ? I . A 1 841 LYS 841 ? ? ? I . A 1 842 ASN 842 ? ? ? I . A 1 843 ALA 843 ? ? ? I . A 1 844 PRO 844 ? ? ? I . A 1 845 SER 845 ? ? ? I . A 1 846 LEU 846 ? ? ? I . A 1 847 PRO 847 ? ? ? I . A 1 848 SER 848 ? ? ? I . A 1 849 ARG 849 ? ? ? I . A 1 850 THR 850 ? ? ? I . A 1 851 CYS 851 ? ? ? I . A 1 852 TYR 852 ? ? ? I . A 1 853 LYS 853 ? ? ? I . A 1 854 THR 854 ? ? ? I . A 1 855 ALA 855 ? ? ? I . A 1 856 PRO 856 ? ? ? I . A 1 857 GLY 857 ? ? ? I . A 1 858 LYS 858 ? ? ? I . A 1 859 ILE 859 ? ? ? I . A 1 860 GLU 860 ? ? ? I . A 1 861 LYS 861 ? ? ? I . A 1 862 VAL 862 ? ? ? I . A 1 863 LYS 863 ? ? ? I . A 1 864 PRO 864 ? ? ? I . A 1 865 PRO 865 ? ? ? I . A 1 866 PRO 866 ? ? ? I . A 1 867 SER 867 ? ? ? I . A 1 868 PRO 868 ? ? ? I . A 1 869 THR 869 ? ? ? I . A 1 870 THR 870 ? ? ? I . A 1 871 GLU 871 ? ? ? I . A 1 872 GLY 872 ? ? ? I . A 1 873 PRO 873 ? ? ? I . A 1 874 SER 874 ? ? ? I . A 1 875 LEU 875 ? ? ? I . A 1 876 GLN 876 ? ? ? I . A 1 877 PRO 877 ? ? ? I . A 1 878 ASP 878 ? ? ? I . A 1 879 LEU 879 ? ? ? I . A 1 880 ALA 880 ? ? ? I . A 1 881 PRO 881 ? ? ? I . A 1 882 GLU 882 ? ? ? I . A 1 883 GLU 883 ? ? ? I . A 1 884 ALA 884 ? ? ? I . A 1 885 ALA 885 ? ? ? I . A 1 886 GLY 886 ? ? ? I . A 1 887 THR 887 ? ? ? I . A 1 888 GLN 888 ? ? ? I . A 1 889 ARG 889 ? ? ? I . A 1 890 PRO 890 ? ? ? I . A 1 891 LYS 891 ? ? ? I . A 1 892 ASN 892 ? ? ? I . A 1 893 LEU 893 ? ? ? I . A 1 894 MET 894 ? ? ? I . A 1 895 GLN 895 ? ? ? I . A 1 896 THR 896 ? ? ? I . A 1 897 LEU 897 ? ? ? I . A 1 898 MET 898 ? ? ? I . A 1 899 GLU 899 ? ? ? I . A 1 900 ASP 900 ? ? ? I . A 1 901 TYR 901 ? ? ? I . A 1 902 GLU 902 ? ? ? I . A 1 903 THR 903 ? ? ? I . A 1 904 HIS 904 ? ? ? I . A 1 905 LYS 905 ? ? ? I . A 1 906 SER 906 ? ? ? I . A 1 907 LYS 907 ? ? ? I . A 1 908 ARG 908 ? ? ? I . A 1 909 ARG 909 ? ? ? I . A 1 910 GLU 910 ? ? ? I . A 1 911 ARG 911 ? ? ? I . A 1 912 MET 912 ? ? ? I . A 1 913 ASP 913 ? ? ? I . A 1 914 ASP 914 ? ? ? I . A 1 915 SER 915 ? ? ? I . A 1 916 SER 916 ? ? ? I . A 1 917 VAL 917 ? ? ? I . A 1 918 LEU 918 ? ? ? I . A 1 919 GLU 919 ? ? ? I . A 1 920 ALA 920 ? ? ? I . A 1 921 THR 921 ? ? ? I . A 1 922 ARG 922 ? ? ? I . A 1 923 VAL 923 ? ? ? I . A 1 924 ASN 924 ? ? ? I . A 1 925 ARG 925 ? ? ? I . A 1 926 ARG 926 ? ? ? I . A 1 927 LYS 927 ? ? ? I . A 1 928 SER 928 ? ? ? I . A 1 929 ALA 929 ? ? ? I . A 1 930 LEU 930 ? ? ? I . A 1 931 ALA 931 ? ? ? I . A 1 932 LEU 932 ? ? ? I . A 1 933 ARG 933 ? ? ? I . A 1 934 TRP 934 ? ? ? I . A 1 935 GLU 935 ? ? ? I . A 1 936 ALA 936 ? ? ? I . A 1 937 GLY 937 ? ? ? I . A 1 938 ILE 938 ? ? ? I . A 1 939 TYR 939 ? ? ? I . A 1 940 ALA 940 ? ? ? I . A 1 941 ASN 941 ? ? ? I . A 1 942 GLN 942 ? ? ? I . A 1 943 GLU 943 ? ? ? I . A 1 944 GLU 944 ? ? ? I . A 1 945 GLU 945 ? ? ? I . A 1 946 ASP 946 ? ? ? I . A 1 947 ASN 947 ? ? ? I . A 1 948 GLU 948 ? ? ? I . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MerR family transcriptional regulator EcmrR {PDB ID=6xl5, label_asym_id=I, auth_asym_id=G, SMTL ID=6xl5.1.I}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6xl5, label_asym_id=I' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A I 8 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SQIGLFSKICRVTIKTLHYYNKIGLLVPAYINPDNGYRFYTSDQLMKFHQIASLRQLGFTITEIVTLTQD ENSCHIIERRRLEIQKQIRDMADMLSRINHYLQHKKKERIMLYQAALKEIPECIVYSKRFIVPDFSSYIK LIPPIGQEVMKANPGLTLTTPAYCFTLYHDKEYKEKNMDVEFCEAVNDFGKNEGNIIFQVIPAITAVTVI HKGPYDSLRNAYIYLMQWVEDNGYLLTNSPRESYIDGIWNKQDSAEWMTEIQFPVEKV ; ;SQIGLFSKICRVTIKTLHYYNKIGLLVPAYINPDNGYRFYTSDQLMKFHQIASLRQLGFTITEIVTLTQD ENSCHIIERRRLEIQKQIRDMADMLSRINHYLQHKKKERIMLYQAALKEIPECIVYSKRFIVPDFSSYIK LIPPIGQEVMKANPGLTLTTPAYCFTLYHDKEYKEKNMDVEFCEAVNDFGKNEGNIIFQVIPAITAVTVI HKGPYDSLRNAYIYLMQWVEDNGYLLTNSPRESYIDGIWNKQDSAEWMTEIQFPVEKV ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 81 107 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6xl5 2024-03-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 948 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 948 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 350.000 14.815 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRWPQPGAAARLPPESPGPPESPGPPEREAAAARRWTGAEPQDCAPGSGRPEKPPQLSEDDIWLKSEGDNYSATLLEPAASSLSPDHKNMEIEVSVAECKSVPGITSTPHPMDHPSAFYSPPHNGLLTDHHESLDNDVAREIRYLDEVLEANCCDSAVDGTYNGTSSPEPGAVVLVGGLSPPVHEATQPEPTERTASRQAPPHIELSNSSPDPMAEAERTNGHSPSQPRDALGDSLQVPVSPSSTTSSRCSSRDGEFTLTTLKKEAKFELRAFHEDKKPSKLFEDDEHEKEQYCIRKVRPSEEMLELEKERRELIRSQAVKKNPGIAAKWWNPPQEKTIEEQLDEEHLESHKKYKERKERRAQQEQLLLQKQLQQQQQQPPSQLCTAPASSHERASMIDKAKEDIVTEQIDFSAARKQFQLMENSRQAVAKGQSTPRLFSIKPFYRPLGSVNSDKPLTNPRPPSVGGPPEDSGASAAKGQKSPGALETPSAAGSQGNTASQGKEGPYSEPSKRGPLSKLWAEDGEFTSARAVLTVVKDDDHGILDQFSRSVNVSLTQEELDSGLDELSVRSQDTTVLETLSNDFSMDNISDSGASNETTNALQENSLADFSLPQTPQTDNPSEGRGEGVSKSFSDHGFYSPSSTLGDSPLVDDPLEYQAGLLVQNAIQQAIAEQVDKAVSKTSRDGAEQQGPEATVEEAEAAAFGSEKPQSMFEPPQVSSPVQEKRDVLPKILPAEDRALRERGPPQPLPAVQPSGPINMEETRPEGSYFSKYSEAAELRSTASLLATQESDVMVGPFKLRSRKQRTLSMIEEEIRAAQEREEELKRQRQVLQSTQSPRTKNAPSLPSRTCYKTAPGKIEKVKPPPSPTTEGPSLQPDLAPEEAAGTQRPKNLMQTLMEDYETHKSKRRERMDDSSVLEATRVNRRKSALALRWEAGIYANQEEEDNE 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RLEIQKQIRDMADMLSRINHYLQHKKK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.012}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6xl5.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 808 808 ? A 132.350 98.149 134.730 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 2 C CA . LEU 808 808 ? A 131.930 96.916 135.493 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 3 C C . LEU 808 808 ? A 133.051 95.936 135.762 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 4 O O . LEU 808 808 ? A 133.318 95.639 136.909 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 5 C CB . LEU 808 808 ? A 130.758 96.228 134.764 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 6 C CG . LEU 808 808 ? A 129.461 97.064 134.750 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 808 808 ? A 128.426 96.365 133.855 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 808 808 ? A 128.888 97.258 136.169 1 1 I LEU 0.460 1 ATOM 9 N N . SER 809 809 ? A 133.798 95.483 134.722 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 10 C CA . SER 809 809 ? A 134.927 94.573 134.886 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 11 C C . SER 809 809 ? A 136.020 95.076 135.812 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 12 O O . SER 809 809 ? A 136.500 94.343 136.658 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 13 C CB . SER 809 809 ? A 135.581 94.258 133.520 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 14 O OG . SER 809 809 ? A 134.585 93.768 132.628 1 1 I SER 0.430 1 ATOM 15 N N . MET 810 810 ? A 136.365 96.389 135.702 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 16 C CA . MET 810 810 ? A 137.255 97.075 136.625 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 17 C C . MET 810 810 ? A 136.743 97.070 138.060 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 18 O O . MET 810 810 ? A 137.478 96.746 138.966 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 19 C CB . MET 810 810 ? A 137.546 98.533 136.158 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 20 C CG . MET 810 810 ? A 138.358 98.600 134.845 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 21 S SD . MET 810 810 ? A 139.939 97.697 134.908 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 22 C CE . MET 810 810 ? A 140.777 98.716 136.162 1 1 I MET 0.570 1 ATOM 23 N N . ILE 811 811 ? A 135.422 97.318 138.282 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 24 C CA . ILE 811 811 ? A 134.821 97.255 139.615 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 25 C C . ILE 811 811 ? A 134.970 95.866 140.228 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 26 O O . ILE 811 811 ? A 135.450 95.734 141.345 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 27 C CB . ILE 811 811 ? A 133.342 97.702 139.608 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 28 C CG1 . ILE 811 811 ? A 133.278 99.247 139.446 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 29 C CG2 . ILE 811 811 ? A 132.583 97.231 140.885 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 30 C CD1 . ILE 811 811 ? A 131.857 99.810 139.263 1 1 I ILE 0.610 1 ATOM 31 N N . GLU 812 812 ? A 134.648 94.767 139.504 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 32 C CA . GLU 812 812 ? A 134.845 93.427 140.038 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 33 C C . GLU 812 812 ? A 136.297 93.057 140.286 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 34 O O . GLU 812 812 ? A 136.625 92.374 141.255 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 35 C CB . GLU 812 812 ? A 134.206 92.348 139.159 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 36 C CG . GLU 812 812 ? A 132.664 92.362 139.208 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 37 C CD . GLU 812 812 ? A 132.106 91.225 138.363 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 38 O OE1 . GLU 812 812 ? A 132.922 90.509 137.721 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 39 O OE2 . GLU 812 812 ? A 130.861 91.069 138.367 1 1 I GLU 0.650 1 ATOM 40 N N . GLU 813 813 ? A 137.221 93.515 139.419 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 41 C CA . GLU 813 813 ? A 138.644 93.391 139.656 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 42 C C . GLU 813 813 ? A 139.131 94.117 140.902 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 43 O O . GLU 813 813 ? A 139.832 93.539 141.733 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 44 C CB . GLU 813 813 ? A 139.437 93.886 138.433 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 45 C CG . GLU 813 813 ? A 140.957 93.648 138.569 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 46 C CD . GLU 813 813 ? A 141.712 94.026 137.302 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 813 813 ? A 141.054 94.393 136.299 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 813 813 ? A 142.959 93.882 137.336 1 1 I GLU 0.680 1 ATOM 49 N N . GLU 814 814 ? A 138.694 95.375 141.105 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 50 C CA . GLU 814 814 ? A 138.930 96.140 142.310 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 51 C C . GLU 814 814 ? A 138.320 95.515 143.551 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 52 O O . GLU 814 814 ? A 138.948 95.540 144.609 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 53 C CB . GLU 814 814 ? A 138.430 97.587 142.159 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 54 C CG . GLU 814 814 ? A 139.279 98.398 141.152 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 55 C CD . GLU 814 814 ? A 138.736 99.807 140.945 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 56 O OE1 . GLU 814 814 ? A 137.670 100.134 141.527 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 57 O OE2 . GLU 814 814 ? A 139.399 100.567 140.195 1 1 I GLU 0.700 1 ATOM 58 N N . ILE 815 815 ? A 137.110 94.910 143.457 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 59 C CA . ILE 815 815 ? A 136.482 94.109 144.509 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 60 C C . ILE 815 815 ? A 137.314 92.894 144.893 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 61 O O . ILE 815 815 ? A 137.555 92.665 146.072 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 62 C CB . ILE 815 815 ? A 135.037 93.696 144.175 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 63 C CG1 . ILE 815 815 ? A 134.142 94.963 144.264 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 64 C CG2 . ILE 815 815 ? A 134.519 92.559 145.107 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 65 C CD1 . ILE 815 815 ? A 132.647 94.712 144.016 1 1 I ILE 0.710 1 ATOM 66 N N . ARG 816 816 ? A 137.840 92.114 143.913 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 67 C CA . ARG 816 816 ? A 138.746 91.006 144.200 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 68 C C . ARG 816 816 ? A 140.009 91.459 144.913 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 69 O O . ARG 816 816 ? A 140.369 90.925 145.949 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 70 C CB . ARG 816 816 ? A 139.182 90.272 142.904 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 71 C CG . ARG 816 816 ? A 138.084 89.368 142.306 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 72 C CD . ARG 816 816 ? A 138.549 88.480 141.140 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 73 N NE . ARG 816 816 ? A 139.061 89.373 140.035 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 74 C CZ . ARG 816 816 ? A 138.403 89.715 138.915 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 75 N NH1 . ARG 816 816 ? A 139.015 90.459 137.990 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 76 N NH2 . ARG 816 816 ? A 137.139 89.365 138.712 1 1 I ARG 0.690 1 ATOM 77 N N . ALA 817 817 ? A 140.646 92.536 144.402 1 1 I ALA 0.800 1 ATOM 78 C CA . ALA 817 817 ? A 141.806 93.133 145.021 1 1 I ALA 0.800 1 ATOM 79 C C . ALA 817 817 ? A 141.525 93.691 146.425 1 1 I ALA 0.800 1 ATOM 80 O O . ALA 817 817 ? A 142.341 93.608 147.329 1 1 I ALA 0.800 1 ATOM 81 C CB . ALA 817 817 ? A 142.339 94.257 144.106 1 1 I ALA 0.800 1 ATOM 82 N N . ALA 818 818 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.676 2 1 3 0.006 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 808 LEU 1 0.460 2 1 A 809 SER 1 0.430 3 1 A 810 MET 1 0.570 4 1 A 811 ILE 1 0.610 5 1 A 812 GLU 1 0.650 6 1 A 813 GLU 1 0.680 7 1 A 814 GLU 1 0.700 8 1 A 815 ILE 1 0.710 9 1 A 816 ARG 1 0.690 10 1 A 817 ALA 1 0.800 11 1 A 818 ALA 1 0.800 12 1 A 819 GLN 1 0.760 13 1 A 820 GLU 1 0.760 14 1 A 821 ARG 1 0.710 15 1 A 822 GLU 1 0.760 16 1 A 823 GLU 1 0.760 17 1 A 824 GLU 1 0.750 18 1 A 825 LEU 1 0.750 19 1 A 826 LYS 1 0.740 20 1 A 827 ARG 1 0.690 21 1 A 828 GLN 1 0.720 22 1 A 829 ARG 1 0.640 23 1 A 830 GLN 1 0.680 24 1 A 831 VAL 1 0.670 25 1 A 832 LEU 1 0.620 26 1 A 833 GLN 1 0.570 27 1 A 834 SER 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #