data_SMR-162307c8f11c48298938b1de286e2b35_8 _entry.id SMR-162307c8f11c48298938b1de286e2b35_8 _struct.entry_id SMR-162307c8f11c48298938b1de286e2b35_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O88286/ WIZ_MOUSE, Protein Wiz Estimated model accuracy of this model is 0.009, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O88286' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 120357.912 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP WIZ_MOUSE O88286 1 ;MEGLLAGGLAAPDHPRGPAPREDIESGAEAAEGEGDIFPSSHYLPITKEGPRDILDGRSGISVANFDPGT FSLMRCDFCGAGFDTRAGLSSHARAHLRDFGITNWELTISPINILQELLATSAAELPPSPLGREPGGPPR SFLTSRRPRLPLTMPFPPTWAEDPGPIYGDAQSLTTCEVCGACFETRKGLSSHARSHLRQLGVAESESSG APIDLLYELVKQKGLPDAPLGLTPSLTKKSNSPKEFLAGAARPGLLTLAKPMDAPAVNKAIKSPPGFSAK GLTHPSSSPLLKKAPLTLAGSPTPKNPEDKSPQLSLSPRPTSPKAQWPQSEDEGPLNLTSGPEPTRDIRC EFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQMGVTEWYVNGSPIDTLREILKRRTQSRPGGHLHPPGPSPKALAKVLS TGGPGSSLEARSPSDLHISPLTKKLPPPPGSPLGHSPTASPPPTARKMFSGLATPSLPKKLKPEHMRVEI KREMLPGTLHGEPHPSEGPWGTPREDMAPLNLSARAEPVRDIRCEFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQMGV TEWSVNGSPIDTLREILKKKSKLCLIKKEPPAGDLAPALTEDGSPTAAPGALHSPLPLSPLASRPGKPGA GPTQVPRELSLSPITGSKPSAASYLGPVATKRPLQEDRFLPAEVKAKTYIQTELPFKAKTLHEKTSHSST EACCELCGLYFENRKALASHARAHLRQFGVTEWCVNGSPIETLSEWIKHRPQKVGAYRSYIQGGRPFTKK FRSAGHGRDSDKRPPLGLAPGGLSLVGRSAGGEPGLEAGRAADSGERPLATSPPGTVKSEEHQRQNINKF ERRQARPSDASAARGGEEVNDLQQKLEEVRQPPPRVRPVPSLVPRPPQTSLVKFVGNIYTLKCRFCEVEF QGPLSIQEEWVRHLQRHILEMNFSKADPPPEEPQAPQAQTAAVEAP ; 'Protein Wiz' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 956 1 956 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . WIZ_MOUSE O88286 O88286-2 1 956 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-05-01 4DDE4A816FC04D65 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MEGLLAGGLAAPDHPRGPAPREDIESGAEAAEGEGDIFPSSHYLPITKEGPRDILDGRSGISVANFDPGT FSLMRCDFCGAGFDTRAGLSSHARAHLRDFGITNWELTISPINILQELLATSAAELPPSPLGREPGGPPR SFLTSRRPRLPLTMPFPPTWAEDPGPIYGDAQSLTTCEVCGACFETRKGLSSHARSHLRQLGVAESESSG APIDLLYELVKQKGLPDAPLGLTPSLTKKSNSPKEFLAGAARPGLLTLAKPMDAPAVNKAIKSPPGFSAK GLTHPSSSPLLKKAPLTLAGSPTPKNPEDKSPQLSLSPRPTSPKAQWPQSEDEGPLNLTSGPEPTRDIRC EFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQMGVTEWYVNGSPIDTLREILKRRTQSRPGGHLHPPGPSPKALAKVLS TGGPGSSLEARSPSDLHISPLTKKLPPPPGSPLGHSPTASPPPTARKMFSGLATPSLPKKLKPEHMRVEI KREMLPGTLHGEPHPSEGPWGTPREDMAPLNLSARAEPVRDIRCEFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQMGV TEWSVNGSPIDTLREILKKKSKLCLIKKEPPAGDLAPALTEDGSPTAAPGALHSPLPLSPLASRPGKPGA 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. 1 53 ASP . 1 54 ILE . 1 55 LEU . 1 56 ASP . 1 57 GLY . 1 58 ARG . 1 59 SER . 1 60 GLY . 1 61 ILE . 1 62 SER . 1 63 VAL . 1 64 ALA . 1 65 ASN . 1 66 PHE . 1 67 ASP . 1 68 PRO . 1 69 GLY . 1 70 THR . 1 71 PHE . 1 72 SER . 1 73 LEU . 1 74 MET . 1 75 ARG . 1 76 CYS . 1 77 ASP . 1 78 PHE . 1 79 CYS . 1 80 GLY . 1 81 ALA . 1 82 GLY . 1 83 PHE . 1 84 ASP . 1 85 THR . 1 86 ARG . 1 87 ALA . 1 88 GLY . 1 89 LEU . 1 90 SER . 1 91 SER . 1 92 HIS . 1 93 ALA . 1 94 ARG . 1 95 ALA . 1 96 HIS . 1 97 LEU . 1 98 ARG . 1 99 ASP . 1 100 PHE . 1 101 GLY . 1 102 ILE . 1 103 THR . 1 104 ASN . 1 105 TRP . 1 106 GLU . 1 107 LEU . 1 108 THR . 1 109 ILE . 1 110 SER . 1 111 PRO . 1 112 ILE . 1 113 ASN . 1 114 ILE . 1 115 LEU . 1 116 GLN . 1 117 GLU . 1 118 LEU . 1 119 LEU . 1 120 ALA . 1 121 THR . 1 122 SER . 1 123 ALA . 1 124 ALA . 1 125 GLU . 1 126 LEU . 1 127 PRO . 1 128 PRO . 1 129 SER . 1 130 PRO . 1 131 LEU . 1 132 GLY . 1 133 ARG . 1 134 GLU . 1 135 PRO . 1 136 GLY . 1 137 GLY . 1 138 PRO . 1 139 PRO . 1 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A 1 840 PHE 840 ? ? ? G . A 1 841 GLU 841 ? ? ? G . A 1 842 ARG 842 ? ? ? G . A 1 843 ARG 843 ? ? ? G . A 1 844 GLN 844 ? ? ? G . A 1 845 ALA 845 ? ? ? G . A 1 846 ARG 846 ? ? ? G . A 1 847 PRO 847 ? ? ? G . A 1 848 SER 848 ? ? ? G . A 1 849 ASP 849 ? ? ? G . A 1 850 ALA 850 ? ? ? G . A 1 851 SER 851 ? ? ? G . A 1 852 ALA 852 ? ? ? G . A 1 853 ALA 853 ? ? ? G . A 1 854 ARG 854 ? ? ? G . A 1 855 GLY 855 ? ? ? G . A 1 856 GLY 856 ? ? ? G . A 1 857 GLU 857 ? ? ? G . A 1 858 GLU 858 ? ? ? G . A 1 859 VAL 859 ? ? ? G . A 1 860 ASN 860 ? ? ? G . A 1 861 ASP 861 ? ? ? G . A 1 862 LEU 862 ? ? ? G . A 1 863 GLN 863 ? ? ? G . A 1 864 GLN 864 ? ? ? G . A 1 865 LYS 865 ? ? ? G . A 1 866 LEU 866 ? ? ? G . A 1 867 GLU 867 ? ? ? G . A 1 868 GLU 868 ? ? ? G . A 1 869 VAL 869 ? ? ? G . A 1 870 ARG 870 ? ? ? G . A 1 871 GLN 871 ? ? ? G . A 1 872 PRO 872 ? ? ? G . A 1 873 PRO 873 ? ? ? G . A 1 874 PRO 874 ? ? ? G . A 1 875 ARG 875 ? ? ? G . A 1 876 VAL 876 ? ? ? G . A 1 877 ARG 877 ? ? ? G . A 1 878 PRO 878 ? ? ? G . A 1 879 VAL 879 ? ? ? G . A 1 880 PRO 880 ? ? ? G . A 1 881 SER 881 ? ? ? G . A 1 882 LEU 882 ? ? ? G . A 1 883 VAL 883 ? ? ? G . A 1 884 PRO 884 ? ? ? G . A 1 885 ARG 885 ? ? ? G . A 1 886 PRO 886 ? ? ? G . A 1 887 PRO 887 ? ? ? G . A 1 888 GLN 888 ? ? ? G . A 1 889 THR 889 ? ? ? G . A 1 890 SER 890 ? ? ? G . A 1 891 LEU 891 ? ? ? G . A 1 892 VAL 892 ? ? ? G . A 1 893 LYS 893 ? ? ? G . A 1 894 PHE 894 ? ? ? G . A 1 895 VAL 895 ? ? ? G . A 1 896 GLY 896 ? ? ? G . A 1 897 ASN 897 ? ? ? G . A 1 898 ILE 898 ? ? ? G . A 1 899 TYR 899 ? ? ? G . A 1 900 THR 900 ? ? ? G . A 1 901 LEU 901 ? ? ? G . A 1 902 LYS 902 ? ? ? G . A 1 903 CYS 903 ? ? ? G . A 1 904 ARG 904 ? ? ? G . A 1 905 PHE 905 ? ? ? G . A 1 906 CYS 906 ? ? ? G . A 1 907 GLU 907 ? ? ? G . A 1 908 VAL 908 ? ? ? G . A 1 909 GLU 909 ? ? ? G . A 1 910 PHE 910 ? ? ? G . A 1 911 GLN 911 ? ? ? G . A 1 912 GLY 912 ? ? ? G . A 1 913 PRO 913 ? ? ? G . A 1 914 LEU 914 ? ? ? G . A 1 915 SER 915 ? ? ? G . A 1 916 ILE 916 ? ? ? G . A 1 917 GLN 917 ? ? ? G . A 1 918 GLU 918 ? ? ? G . A 1 919 GLU 919 ? ? ? G . A 1 920 TRP 920 ? ? ? G . A 1 921 VAL 921 ? ? ? G . A 1 922 ARG 922 ? ? ? G . A 1 923 HIS 923 ? ? ? G . A 1 924 LEU 924 ? ? ? G . A 1 925 GLN 925 ? ? ? G . A 1 926 ARG 926 ? ? ? G . A 1 927 HIS 927 ? ? ? G . A 1 928 ILE 928 ? ? ? G . A 1 929 LEU 929 ? ? ? G . A 1 930 GLU 930 ? ? ? G . A 1 931 MET 931 ? ? ? G . A 1 932 ASN 932 ? ? ? G . A 1 933 PHE 933 ? ? ? G . A 1 934 SER 934 ? ? ? G . A 1 935 LYS 935 ? ? ? G . A 1 936 ALA 936 ? ? ? G . A 1 937 ASP 937 ? ? ? G . A 1 938 PRO 938 ? ? ? G . A 1 939 PRO 939 ? ? ? G . A 1 940 PRO 940 ? ? ? G . A 1 941 GLU 941 ? ? ? G . A 1 942 GLU 942 ? ? ? G . A 1 943 PRO 943 ? ? ? G . A 1 944 GLN 944 ? ? ? G . A 1 945 ALA 945 ? ? ? G . A 1 946 PRO 946 ? ? ? G . A 1 947 GLN 947 ? ? ? G . A 1 948 ALA 948 ? ? ? G . A 1 949 GLN 949 ? ? ? G . A 1 950 THR 950 ? ? ? G . A 1 951 ALA 951 ? ? ? G . A 1 952 ALA 952 ? ? ? G . A 1 953 VAL 953 ? ? ? G . A 1 954 GLU 954 ? ? ? G . A 1 955 ALA 955 ? ? ? G . A 1 956 PRO 956 ? ? ? G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'RNA helicase {PDB ID=7yev, label_asym_id=G, auth_asym_id=B, SMTL ID=7yev.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7yev, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MKRIPRKTKGKSSGKGNDSTSRSDDGSSQLRDKQSNKANPATAEPGTSNCEHYKARPGIASVQKATESAE LPMKNNDEGTPDKRGNTKGALVNEHVEARDEADDATKKQAKDTEKAKAQVTYSDTGINNANELSRSGNVD NEGGSNQKPMSTRIAEATSAIVSKHPARVGLPPTASSGHGYQCHVCSAVLFSPLDLDAHVASHGLHGNMT LTSSEIQRHITEFISSWQNHPIVQVSADVENRKTAQLLHADTPRLVTWDAGLCTSFKIVPIVPAQVPQDV LAYTFFTSSYAIQSPFPEAAVSRIVVHTRWASNVDFDRDSSVIMAPPTENNIHLFKQLLNTETLSVRGAN PLMFRANVLHMLLEFVLDNLYLNRHTGFSQDHTPFTEGANLRSLPGPDAEKWYSIMYPTRMGTPNVSKIC NFVASCVRNRVGRFDRAQMMNGAMSEWVDVFETSDALTVSIRGRWMARLARMNINPTEIEWALTECAQGY VTVTSPYAPSVNRLMPYRISNAERQISQIIRVMNIGNNATVIQPVLQDISVLLQRISPLQIDPTIISNTM STVSESTTQTLSPASSILGKLRPSNSDFSSFRVALAGWLYNGVVTTVIDDSSYPKDGGSVTSLENLWDFF ILALALPLTTDPCAPVKAFMTLANMMVGFETIPMDNQIYTQSRRASAFSTPHTWPRCFMNIQLISPIDAP ILRQWAEIIHRYWPNPSQIRYGTPNVFGSANLFTPPEVLLLPIDHQPANVTTPTLDFTNELTNWRARVCE LMKNLVDNQRYQPGWTQSLVSSMRGTLGKLKLIKSMTPMYLQQLAPVELAVIAPMLPFPPFQVPYVRLDR DRVPTMVGVTRQSRDTITQPALSLSTTNTTVGVPLALDARAITVALLSGKYPPDLVTNVWYADAIYPMYA DTEVFSNLQRDVITCEAVQTLVTLVAQISETQYPVDRYLDWIPSLRASAATAATFAEWVNTSMKTAFDLS DMLLEPLLSGDPRMTQLAIQYQQYNGRTFNVIPEMPGSVIADCVQLTAEVFNHEYNLFGIARGDIIIGRV QSTHLWSPLAPPPDLVFDRDTPGVHIFGRDCRISFGMNGAAPMIRDETGMMVPFEGNWIFPLALWQMNTR YFNQQFDAWIKTGELRIRIEMGAYPYMLHYYDPRQYANAWNLTSAWLEEITPTSIPSVPFMVPISSDHDI SSAPAVQYIISTEYNDRSLFCTNSSSPQTIAGPDKHIPVERYNILTNPDAPPTQIQLPEVVDLYNVVTRY AYETPPITAVVMGVP ; ;MKRIPRKTKGKSSGKGNDSTSRSDDGSSQLRDKQSNKANPATAEPGTSNCEHYKARPGIASVQKATESAE LPMKNNDEGTPDKRGNTKGALVNEHVEARDEADDATKKQAKDTEKAKAQVTYSDTGINNANELSRSGNVD NEGGSNQKPMSTRIAEATSAIVSKHPARVGLPPTASSGHGYQCHVCSAVLFSPLDLDAHVASHGLHGNMT LTSSEIQRHITEFISSWQNHPIVQVSADVENRKTAQLLHADTPRLVTWDAGLCTSFKIVPIVPAQVPQDV LAYTFFTSSYAIQSPFPEAAVSRIVVHTRWASNVDFDRDSSVIMAPPTENNIHLFKQLLNTETLSVRGAN PLMFRANVLHMLLEFVLDNLYLNRHTGFSQDHTPFTEGANLRSLPGPDAEKWYSIMYPTRMGTPNVSKIC NFVASCVRNRVGRFDRAQMMNGAMSEWVDVFETSDALTVSIRGRWMARLARMNINPTEIEWALTECAQGY VTVTSPYAPSVNRLMPYRISNAERQISQIIRVMNIGNNATVIQPVLQDISVLLQRISPLQIDPTIISNTM STVSESTTQTLSPASSILGKLRPSNSDFSSFRVALAGWLYNGVVTTVIDDSSYPKDGGSVTSLENLWDFF ILALALPLTTDPCAPVKAFMTLANMMVGFETIPMDNQIYTQSRRASAFSTPHTWPRCFMNIQLISPIDAP ILRQWAEIIHRYWPNPSQIRYGTPNVFGSANLFTPPEVLLLPIDHQPANVTTPTLDFTNELTNWRARVCE LMKNLVDNQRYQPGWTQSLVSSMRGTLGKLKLIKSMTPMYLQQLAPVELAVIAPMLPFPPFQVPYVRLDR DRVPTMVGVTRQSRDTITQPALSLSTTNTTVGVPLALDARAITVALLSGKYPPDLVTNVWYADAIYPMYA DTEVFSNLQRDVITCEAVQTLVTLVAQISETQYPVDRYLDWIPSLRASAATAATFAEWVNTSMKTAFDLS DMLLEPLLSGDPRMTQLAIQYQQYNGRTFNVIPEMPGSVIADCVQLTAEVFNHEYNLFGIARGDIIIGRV QSTHLWSPLAPPPDLVFDRDTPGVHIFGRDCRISFGMNGAAPMIRDETGMMVPFEGNWIFPLALWQMNTR YFNQQFDAWIKTGELRIRIEMGAYPYMLHYYDPRQYANAWNLTSAWLEEITPTSIPSVPFMVPISSDHDI SSAPAVQYIISTEYNDRSLFCTNSSSPQTIAGPDKHIPVERYNILTNPDAPPTQIQLPEVVDLYNVVTRY AYETPPITAVVMGVP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 178 226 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7yev 2023-03-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 956 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 958 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 14.000 17.021 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEGLLAGGLAAPDHPRGPAPREDIESGAEAAEGEGDIFPSSHYLPITKEGPRDILDGRSGISVANFDPGTFSLMRCDFCGAGFDTRAGLSSHARAHLRDFGITNWELTISPINILQELLATSAAELPPSPLGREPGGPPRSFLTSRRPRLPLTMPFPPTWAEDPGPIYGDAQSLTTCEVCGACFETRKGLSSHARSHLRQLGVAESESSGAPIDLLYELVKQKGLPDAPLGLTPSLTKKSNSPKEFLAGAARPGLLTLAKPMDAPAVNKAIKSPPGFSAKGLTHPSSSPLLKKAPLTLAGSPTPKNPEDKSPQLSLSPRPTSPKAQWPQSEDEGPLNLTSGPEPTRDIRCEFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQ--MGVTEWYVNGSPIDTLREILKRRTQSRPGGHLHPPGPSPKALAKVLSTGGPGSSLEARSPSDLHISPLTKKLPPPPGSPLGHSPTASPPPTARKMFSGLATPSLPKKLKPEHMRVEIKREMLPGTLHGEPHPSEGPWGTPREDMAPLNLSARAEPVRDIRCEFCGEFFENRKGLSSHARSHLRQMGVTEWSVNGSPIDTLREILKKKSKLCLIKKEPPAGDLAPALTEDGSPTAAPGALHSPLPLSPLASRPGKPGAGPTQVPRELSLSPITGSKPSAASYLGPVATKRPLQEDRFLPAEVKAKTYIQTELPFKAKTLHEKTSHSSTEACCELCGLYFENRKALASHARAHLRQFGVTEWCVNGSPIETLSEWIKHRPQKVGAYRSYIQGGRPFTKKFRSAGHGRDSDKRPPLGLAPGGLSLVGRSAGGEPGLEAGRAADSGERPLATSPPGTVKSEEHQRQNINKFERRQARPSDASAARGGEEVNDLQQKLEEVRQPPPRVRPVPSLVPRPPQTSLVKFVGNIYTLKCRFCEVEFQGPLSIQEEWVRHLQRHILEMNFSKADPPPEEPQAPQAQTAAVEAP 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GHGYQCHVCSAVLFSPLDLDAHVASHGLHGNMTLTSSEIQRHITEFISS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7yev.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 345 345 ? A 217.256 198.050 185.915 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 2 C CA . THR 345 345 ? A 217.384 196.549 185.646 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 3 C C . THR 345 345 ? A 217.663 195.771 186.940 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 4 O O . THR 345 345 ? A 217.344 196.281 187.988 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 5 C CB . THR 345 345 ? A 218.541 196.252 184.680 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 6 O OG1 . THR 345 345 ? A 219.815 196.478 185.293 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 7 C CG2 . THR 345 345 ? A 218.512 196.999 183.336 1 1 G THR 0.360 1 ATOM 8 N N . ARG 346 346 ? A 218.252 194.545 186.900 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 9 C CA . ARG 346 346 ? A 218.660 193.773 188.048 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 10 C C . ARG 346 346 ? A 219.998 193.128 187.736 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 11 O O . ARG 346 346 ? A 219.982 192.066 187.125 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 12 C CB . ARG 346 346 ? A 217.609 192.637 188.174 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 13 C CG . ARG 346 346 ? A 216.211 193.163 188.527 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 14 C CD . ARG 346 346 ? A 216.210 193.784 189.920 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 15 N NE . ARG 346 346 ? A 214.825 194.279 190.181 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 16 C CZ . ARG 346 346 ? A 214.368 195.507 189.908 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 17 N NH1 . ARG 346 346 ? A 215.106 196.443 189.330 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 18 N NH2 . ARG 346 346 ? A 213.137 195.845 190.281 1 1 G ARG 0.250 1 ATOM 19 N N . ASP 347 347 ? A 221.135 193.766 188.100 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 20 C CA . ASP 347 347 ? A 222.473 193.289 187.794 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 21 C C . ASP 347 347 ? A 223.483 194.366 188.156 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 22 O O . ASP 347 347 ? A 223.209 195.558 187.997 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 23 C CB . ASP 347 347 ? A 222.705 193.047 186.291 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 24 C CG . ASP 347 347 ? A 223.890 192.151 185.992 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 25 O OD1 . ASP 347 347 ? A 224.200 192.055 184.777 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 26 O OD2 . ASP 347 347 ? A 224.473 191.599 186.953 1 1 G ASP 0.400 1 ATOM 27 N N . ILE 348 348 ? A 224.655 193.927 188.637 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 28 C CA . ILE 348 348 ? A 225.674 194.702 189.318 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 29 C C . ILE 348 348 ? A 227.003 193.972 189.218 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 30 O O . ILE 348 348 ? A 227.107 192.966 188.538 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 31 C CB . ILE 348 348 ? A 225.382 194.939 190.803 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 32 C CG1 . ILE 348 348 ? A 225.029 193.648 191.575 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 33 C CG2 . ILE 348 348 ? A 224.281 196.000 190.922 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 34 C CD1 . ILE 348 348 ? A 224.715 193.956 193.041 1 1 G ILE 0.550 1 ATOM 35 N N . ARG 349 349 ? A 228.076 194.464 189.889 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 36 C CA . ARG 349 349 ? A 229.339 193.748 189.983 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 37 C C . ARG 349 349 ? A 230.157 193.685 188.709 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 38 O O . ARG 349 349 ? A 230.346 192.640 188.097 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 39 C CB . ARG 349 349 ? A 229.220 192.364 190.694 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 40 C CG . ARG 349 349 ? A 230.551 191.647 191.029 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 41 C CD . ARG 349 349 ? A 230.323 190.325 191.770 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 42 N NE . ARG 349 349 ? A 231.655 189.637 191.956 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 43 C CZ . ARG 349 349 ? A 232.489 189.818 192.989 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 44 N NH1 . ARG 349 349 ? A 232.200 190.668 193.963 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 45 N NH2 . ARG 349 349 ? A 233.639 189.150 193.050 1 1 G ARG 0.490 1 ATOM 46 N N . CYS 350 350 ? A 230.766 194.823 188.305 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 47 C CA . CYS 350 350 ? A 231.896 194.732 187.387 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 48 C C . CYS 350 350 ? A 233.027 193.931 188.045 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 49 O O . CYS 350 350 ? A 233.256 194.033 189.250 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 50 C CB . CYS 350 350 ? A 232.374 196.142 186.918 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 51 S SG . CYS 350 350 ? A 233.590 196.168 185.551 1 1 G CYS 0.600 1 ATOM 52 N N . GLU 351 351 ? A 233.693 193.053 187.268 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 53 C CA . GLU 351 351 ? A 234.751 192.180 187.738 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 54 C C . GLU 351 351 ? A 236.027 192.920 188.102 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 55 O O . GLU 351 351 ? A 236.691 192.611 189.087 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 56 C CB . GLU 351 351 ? A 235.005 191.061 186.713 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 57 C CG . GLU 351 351 ? A 233.792 190.106 186.576 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 58 C CD . GLU 351 351 ? A 234.068 188.963 185.605 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 59 O OE1 . GLU 351 351 ? A 235.131 188.991 184.936 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 60 O OE2 . GLU 351 351 ? A 233.204 188.052 185.541 1 1 G GLU 0.570 1 ATOM 61 N N . PHE 352 352 ? A 236.364 193.973 187.332 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 62 C CA . PHE 352 352 ? A 237.394 194.923 187.708 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 63 C C . PHE 352 352 ? A 236.717 196.079 188.411 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 64 O O . PHE 352 352 ? A 235.498 196.186 188.390 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 65 C CB . PHE 352 352 ? A 238.198 195.485 186.510 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 66 C CG . PHE 352 352 ? A 238.992 194.381 185.883 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 67 C CD1 . PHE 352 352 ? A 240.205 193.969 186.455 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 68 C CD2 . PHE 352 352 ? A 238.527 193.724 184.736 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 69 C CE1 . PHE 352 352 ? A 240.956 192.941 185.874 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 70 C CE2 . PHE 352 352 ? A 239.271 192.691 184.154 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 71 C CZ . PHE 352 352 ? A 240.491 192.307 184.718 1 1 G PHE 0.490 1 ATOM 72 N N . CYS 353 353 ? A 237.501 196.954 189.078 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 73 C CA . CYS 353 353 ? A 237.079 198.210 189.702 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 74 C C . CYS 353 353 ? A 236.174 198.130 190.933 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 75 O O . CYS 353 353 ? A 236.082 199.083 191.697 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 76 C CB . CYS 353 353 ? A 236.612 199.286 188.670 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 77 S SG . CYS 353 353 ? A 234.903 199.156 188.074 1 1 G CYS 0.550 1 ATOM 78 N N . GLY 354 354 ? A 235.531 196.968 191.181 1 1 G GLY 0.600 1 ATOM 79 C CA . GLY 354 354 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #