data_SMR-2b76801b424de4f780708925bdb09507_2 _entry.id SMR-2b76801b424de4f780708925bdb09507_2 _struct.entry_id SMR-2b76801b424de4f780708925bdb09507_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9EST3/ 4ET_MOUSE, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9EST3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 122796.370 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP 4ET_MOUSE Q9EST3 1 ;MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLY PASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLE KDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRN DSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVIL AQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRS SSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKE KLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTM KASGTLPTQPKVSELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQRAPSPPMSQVFRTQAASADYLHPRI PSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDR TRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGD GKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLSQTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLA SPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLS GPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPGSSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPH MHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELEYRQ ; 'Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 959 1 959 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 4ET_MOUSE Q9EST3 Q9EST3-2 1 959 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 8B4CC73C34EB492C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLY PASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLE KDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRN DSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVIL AQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRS SSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKE KLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTM KASGTLPTQPKVSELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQRAPSPPMSQVFRTQAASADYLHPRI PSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDR TRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGD GKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLSQTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLA SPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLS GPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPGSSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPH MHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELEYRQ ; ;MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLY PASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLE KDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRN DSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVIL AQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRS SSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKE KLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTM KASGTLPTQPKVSELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQRAPSPPMSQVFRTQAASADYLHPRI PSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDR TRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGD GKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLSQTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLA SPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLS GPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPGSSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPH MHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELEYRQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 LYS . 1 4 SER . 1 5 VAL . 1 6 ALA . 1 7 GLU . 1 8 THR . 1 9 GLU . 1 10 ASN . 1 11 GLY . 1 12 ASP . 1 13 ALA . 1 14 PHE . 1 15 LEU . 1 16 GLU . 1 17 LEU . 1 18 LYS . 1 19 LYS . 1 20 LEU . 1 21 PRO . 1 22 THR . 1 23 SER . 1 24 LYS . 1 25 SER . 1 26 PRO . 1 27 HIS . 1 28 ARG . 1 29 TYR . 1 30 THR . 1 31 LYS . 1 32 GLU . 1 33 GLU . 1 34 LEU . 1 35 LEU . 1 36 ASP . 1 37 ILE . 1 38 LYS . 1 39 GLU . 1 40 ARG . 1 41 PRO . 1 42 TYR . 1 43 SER . 1 44 LYS . 1 45 GLN . 1 46 ARG . 1 47 PRO . 1 48 SER . 1 49 CYS . 1 50 LEU . 1 51 SER . 1 52 GLU . 1 53 LYS . 1 54 TYR . 1 55 ASP . 1 56 SER . 1 57 ASP . 1 58 GLY . 1 59 VAL . 1 60 TRP . 1 61 ASP . 1 62 PRO . 1 63 GLU . 1 64 LYS . 1 65 TRP . 1 66 HIS . 1 67 ALA . 1 68 SER . 1 69 LEU . 1 70 TYR . 1 71 PRO . 1 72 ALA . 1 73 SER . 1 74 GLY . 1 75 ARG . 1 76 SER . 1 77 SER . 1 78 PRO . 1 79 VAL . 1 80 GLU . 1 81 SER . 1 82 LEU . 1 83 LYS . 1 84 LYS . 1 85 GLU . 1 86 SER . 1 87 GLU . 1 88 SER . 1 89 ASP . 1 90 ARG . 1 91 PRO . 1 92 SER . 1 93 LEU . 1 94 VAL . 1 95 ARG . 1 96 ARG . 1 97 ILE . 1 98 ALA . 1 99 ASP . 1 100 PRO . 1 101 ARG . 1 102 GLU . 1 103 ARG . 1 104 VAL . 1 105 LYS . 1 106 GLU . 1 107 ASP . 1 108 ASP . 1 109 LEU . 1 110 ASP . 1 111 VAL . 1 112 VAL . 1 113 LEU . 1 114 SER . 1 115 PRO . 1 116 GLN . 1 117 ARG . 1 118 ARG . 1 119 SER . 1 120 PHE . 1 121 GLY . 1 122 GLY . 1 123 GLY . 1 124 CYS . 1 125 HIS . 1 126 VAL . 1 127 THR . 1 128 ALA . 1 129 ALA . 1 130 VAL . 1 131 SER . 1 132 SER . 1 133 ARG . 1 134 ARG . 1 135 SER . 1 136 GLY . 1 137 SER . 1 138 PRO . 1 139 LEU . 1 140 GLU . 1 141 LYS . 1 142 ASP . 1 143 SER . 1 144 ASP . 1 145 GLY . 1 146 LEU . 1 147 ARG . 1 148 LEU . 1 149 LEU . 1 150 GLY . 1 151 GLY . 1 152 ARG . 1 153 ARG . 1 154 ILE . 1 155 GLY . 1 156 SER . 1 157 GLY . 1 158 ARG . 1 159 ILE . 1 160 ILE . 1 161 SER . 1 162 ALA . 1 163 ARG . 1 164 ALA . 1 165 PHE . 1 166 GLU . 1 167 LYS . 1 168 ASP . 1 169 HIS . 1 170 ARG . 1 171 LEU . 1 172 SER . 1 173 ASP . 1 174 LYS . 1 175 ASP . 1 176 LEU . 1 177 ARG . 1 178 ASP . 1 179 LEU . 1 180 ARG . 1 181 ASP . 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A 1 846 GLN 846 ? ? ? B . A 1 847 PRO 847 ? ? ? B . A 1 848 LEU 848 ? ? ? B . A 1 849 TYR 849 ? ? ? B . A 1 850 PRO 850 ? ? ? B . A 1 851 LEU 851 ? ? ? B . A 1 852 VAL 852 ? ? ? B . A 1 853 SER 853 ? ? ? B . A 1 854 ALA 854 ? ? ? B . A 1 855 ALA 855 ? ? ? B . A 1 856 SER 856 ? ? ? B . A 1 857 HIS 857 ? ? ? B . A 1 858 PRO 858 ? ? ? B . A 1 859 LEU 859 ? ? ? B . A 1 860 LEU 860 ? ? ? B . A 1 861 ASN 861 ? ? ? B . A 1 862 PRO 862 ? ? ? B . A 1 863 ARG 863 ? ? ? B . A 1 864 PRO 864 ? ? ? B . A 1 865 GLY 865 ? ? ? B . A 1 866 THR 866 ? ? ? B . A 1 867 PRO 867 ? ? ? B . A 1 868 LEU 868 ? ? ? B . A 1 869 HIS 869 ? ? ? B . A 1 870 LEU 870 ? ? ? B . A 1 871 ALA 871 ? ? ? B . A 1 872 VAL 872 ? ? ? B . A 1 873 MET 873 ? ? ? B . A 1 874 GLN 874 ? ? ? B . A 1 875 GLN 875 ? ? ? B . A 1 876 GLN 876 ? ? ? B . A 1 877 LEU 877 ? ? ? B . A 1 878 GLN 878 ? ? ? B . A 1 879 ARG 879 ? ? ? B . A 1 880 SER 880 ? ? ? B . A 1 881 VAL 881 ? ? ? B . A 1 882 LEU 882 ? ? ? B . A 1 883 HIS 883 ? ? ? B . A 1 884 PRO 884 ? ? ? B . A 1 885 PRO 885 ? ? ? B . A 1 886 GLY 886 ? ? ? B . A 1 887 SER 887 ? ? ? B . A 1 888 SER 888 ? ? ? B . A 1 889 SER 889 ? ? ? B . A 1 890 GLN 890 ? ? ? B . A 1 891 ALA 891 ? ? ? B . A 1 892 ALA 892 ? ? ? B . A 1 893 ALA 893 ? ? ? B . A 1 894 ILE 894 ? ? ? B . A 1 895 SER 895 ? ? ? B . A 1 896 VAL 896 ? ? ? B . A 1 897 GLN 897 ? ? ? B . A 1 898 THR 898 ? ? ? B . A 1 899 PRO 899 ? ? ? B . A 1 900 GLN 900 ? ? ? B . A 1 901 ASN 901 ? ? ? B . A 1 902 VAL 902 ? ? ? B . A 1 903 PRO 903 ? ? ? B . A 1 904 SER 904 ? ? ? B . A 1 905 ARG 905 ? ? ? B . A 1 906 SER 906 ? ? ? B . A 1 907 GLY 907 ? ? ? B . A 1 908 MET 908 ? ? ? B . A 1 909 PRO 909 ? ? ? B . A 1 910 HIS 910 ? ? ? B . A 1 911 MET 911 ? ? ? B . A 1 912 HIS 912 ? ? ? B . A 1 913 SER 913 ? ? ? B . A 1 914 GLN 914 ? ? ? B . A 1 915 LEU 915 ? ? ? B . A 1 916 GLU 916 ? ? ? B . A 1 917 HIS 917 ? ? ? B . A 1 918 ARG 918 ? ? ? B . A 1 919 THR 919 ? ? ? B . A 1 920 SER 920 ? ? ? B . A 1 921 GLN 921 ? ? ? B . A 1 922 ARG 922 ? ? ? B . A 1 923 SER 923 ? ? ? B . A 1 924 SER 924 ? ? ? B . A 1 925 SER 925 ? ? ? B . A 1 926 PRO 926 ? ? ? B . A 1 927 VAL 927 ? ? ? B . A 1 928 GLY 928 928 GLY GLY B . A 1 929 LEU 929 929 LEU LEU B . A 1 930 ALA 930 930 ALA ALA B . A 1 931 LYS 931 931 LYS LYS B . A 1 932 TRP 932 932 TRP TRP B . A 1 933 PHE 933 933 PHE PHE B . A 1 934 GLY 934 934 GLY GLY B . A 1 935 SER 935 935 SER SER B . A 1 936 ASP 936 936 ASP ASP B . A 1 937 VAL 937 937 VAL VAL B . A 1 938 LEU 938 938 LEU LEU B . A 1 939 GLN 939 939 GLN GLN B . A 1 940 GLN 940 940 GLN GLN B . A 1 941 PRO 941 941 PRO PRO B . A 1 942 LEU 942 942 LEU LEU B . A 1 943 PRO 943 943 PRO PRO B . A 1 944 SER 944 944 SER SER B . A 1 945 MET 945 945 MET MET B . A 1 946 PRO 946 946 PRO PRO B . A 1 947 THR 947 947 THR THR B . A 1 948 LYS 948 948 LYS LYS B . A 1 949 VAL 949 949 VAL VAL B . A 1 950 ILE 950 950 ILE ILE B . A 1 951 SER 951 951 SER SER B . A 1 952 VAL 952 952 VAL VAL B . A 1 953 ASP 953 953 ASP ASP B . A 1 954 GLU 954 954 GLU GLU B . A 1 955 LEU 955 955 LEU LEU B . A 1 956 GLU 956 956 GLU GLU B . A 1 957 TYR 957 957 TYR TYR B . A 1 958 ARG 958 958 ARG ARG B . A 1 959 GLN 959 959 GLN GLN B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter {PDB ID=6f9w, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=6f9w.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6f9w, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 37 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6f9w 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 959 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 959 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2e-15 93.750 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLYPASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLEKDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRNDSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTMKASGTLPTQPKVSELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQRAPSPPMSQVFRTQAASADYLHPRIPSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDRTRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGDGKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLSQTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLASPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLSGPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPGSSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPHMHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELEYRQ 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6f9w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 928 928 ? A 30.600 15.974 52.939 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 2 C CA . GLY 928 928 ? A 30.514 17.373 52.343 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 3 C C . GLY 928 928 ? A 29.124 17.955 52.365 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 4 O O . GLY 928 928 ? A 28.892 18.956 53.024 1 1 B GLY 0.480 1 ATOM 5 N N . LEU 929 929 ? A 28.137 17.300 51.709 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 6 C CA . LEU 929 929 ? A 26.743 17.721 51.714 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 7 C C . LEU 929 929 ? A 26.005 17.451 53.024 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 8 O O . LEU 929 929 ? A 24.951 18.018 53.279 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 9 C CB . LEU 929 929 ? A 26.002 17.002 50.564 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 10 C CG . LEU 929 929 ? A 26.342 17.521 49.152 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 929 929 ? A 25.583 16.662 48.128 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 929 929 ? A 25.956 19.004 48.971 1 1 B LEU 0.490 1 ATOM 13 N N . ALA 930 930 ? A 26.584 16.628 53.929 1 1 B ALA 0.640 1 ATOM 14 C CA . ALA 930 930 ? A 26.032 16.301 55.235 1 1 B ALA 0.640 1 ATOM 15 C C . ALA 930 930 ? A 25.878 17.504 56.164 1 1 B ALA 0.640 1 ATOM 16 O O . ALA 930 930 ? A 25.148 17.467 57.142 1 1 B ALA 0.640 1 ATOM 17 C CB . ALA 930 930 ? A 26.959 15.275 55.929 1 1 B ALA 0.640 1 ATOM 18 N N . LYS 931 931 ? A 26.552 18.628 55.837 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 19 C CA . LYS 931 931 ? A 26.399 19.897 56.510 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 20 C C . LYS 931 931 ? A 25.007 20.519 56.351 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 21 O O . LYS 931 931 ? A 24.595 21.344 57.162 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 22 C CB . LYS 931 931 ? A 27.445 20.880 55.926 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 23 C CG . LYS 931 931 ? A 27.686 22.109 56.816 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 24 C CD . LYS 931 931 ? A 28.694 23.083 56.185 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 25 C CE . LYS 931 931 ? A 29.202 24.173 57.135 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 26 N NZ . LYS 931 931 ? A 28.140 25.175 57.364 1 1 B LYS 0.580 1 ATOM 27 N N . TRP 932 932 ? A 24.271 20.150 55.276 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 28 C CA . TRP 932 932 ? A 22.984 20.734 54.952 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 29 C C . TRP 932 932 ? A 21.860 19.705 54.899 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 30 O O . TRP 932 932 ? A 20.687 20.063 54.973 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 31 C CB . TRP 932 932 ? A 23.066 21.393 53.548 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 32 C CG . TRP 932 932 ? A 24.302 22.258 53.337 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 33 C CD1 . TRP 932 932 ? A 25.360 22.034 52.500 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 34 C CD2 . TRP 932 932 ? A 24.607 23.473 54.052 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 35 N NE1 . TRP 932 932 ? A 26.303 23.039 52.627 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 36 C CE2 . TRP 932 932 ? A 25.842 23.938 53.572 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 37 C CE3 . TRP 932 932 ? A 23.904 24.170 55.032 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 38 C CZ2 . TRP 932 932 ? A 26.387 25.134 54.041 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 39 C CZ3 . TRP 932 932 ? A 24.456 25.367 55.516 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 40 C CH2 . TRP 932 932 ? A 25.672 25.853 55.018 1 1 B TRP 0.510 1 ATOM 41 N N . PHE 933 933 ? A 22.175 18.396 54.773 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 42 C CA . PHE 933 933 ? A 21.172 17.366 54.567 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 43 C C . PHE 933 933 ? A 21.302 16.303 55.628 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 44 O O . PHE 933 933 ? A 22.399 15.915 56.017 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 45 C CB . PHE 933 933 ? A 21.282 16.665 53.187 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 46 C CG . PHE 933 933 ? A 21.089 17.673 52.087 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 47 C CD1 . PHE 933 933 ? A 19.819 18.187 51.775 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 48 C CD2 . PHE 933 933 ? A 22.197 18.141 51.369 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 49 C CE1 . PHE 933 933 ? A 19.663 19.131 50.749 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 50 C CE2 . PHE 933 933 ? A 22.051 19.093 50.355 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 51 C CZ . PHE 933 933 ? A 20.780 19.581 50.036 1 1 B PHE 0.580 1 ATOM 52 N N . GLY 934 934 ? A 20.149 15.802 56.126 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 53 C CA . GLY 934 934 ? A 20.088 14.711 57.094 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 54 C C . GLY 934 934 ? A 20.722 13.415 56.661 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 55 O O . GLY 934 934 ? A 20.715 13.062 55.482 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 56 N N . SER 935 935 ? A 21.224 12.625 57.633 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 57 C CA . SER 935 935 ? A 21.944 11.381 57.395 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 58 C C . SER 935 935 ? A 21.142 10.341 56.640 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 59 O O . SER 935 935 ? A 21.651 9.737 55.703 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 60 C CB . SER 935 935 ? A 22.436 10.723 58.710 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 61 O OG . SER 935 935 ? A 23.031 11.716 59.548 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 62 N N . ASP 936 936 ? A 19.848 10.172 57.001 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 63 C CA . ASP 936 936 ? A 18.881 9.297 56.359 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 64 C C . ASP 936 936 ? A 18.636 9.634 54.886 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 65 O O . ASP 936 936 ? A 18.491 8.764 54.029 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 66 C CB . ASP 936 936 ? A 17.527 9.381 57.121 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 67 C CG . ASP 936 936 ? A 17.636 8.697 58.472 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 68 O OD1 . ASP 936 936 ? A 18.311 7.644 58.543 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 69 O OD2 . ASP 936 936 ? A 17.057 9.245 59.442 1 1 B ASP 0.680 1 ATOM 70 N N . VAL 937 937 ? A 18.602 10.943 54.544 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 71 C CA . VAL 937 937 ? 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A 16.277 8.358 50.928 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 100 C CD . GLN 940 940 ? A 14.796 8.677 51.115 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 101 O OE1 . GLN 940 940 ? A 13.907 7.980 50.638 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 102 N NE2 . GLN 940 940 ? A 14.502 9.784 51.833 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 103 N N . PRO 941 941 ? A 17.520 5.690 48.346 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 104 C CA . PRO 941 941 ? A 17.529 5.925 46.902 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 105 C C . PRO 941 941 ? A 17.005 7.292 46.467 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 106 O O . PRO 941 941 ? A 15.922 7.696 46.886 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 107 C CB . PRO 941 941 ? A 16.687 4.775 46.300 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 108 C CG . PRO 941 941 ? A 16.548 3.749 47.436 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 109 C CD . PRO 941 941 ? A 16.597 4.616 48.693 1 1 B PRO 0.710 1 ATOM 110 N N . LEU 942 942 ? A 17.747 8.012 45.609 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 111 C CA . LEU 942 942 ? A 17.392 9.349 45.188 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 112 C C . LEU 942 942 ? A 16.977 9.301 43.730 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 113 O O . LEU 942 942 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #