data_SMR-9ba0d9798fa352040b5adb1c584b85dd_2 _entry.id SMR-9ba0d9798fa352040b5adb1c584b85dd_2 _struct.entry_id SMR-9ba0d9798fa352040b5adb1c584b85dd_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9EST3/ 4ET_MOUSE, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9EST3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 125824.743 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP 4ET_MOUSE Q9EST3 1 ;MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLY PASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLE KDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRN DSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVIL AQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRS SSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKE KLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTM KASGTLPTQPKVSRNVESHLLAPAEIPGQPVSKNILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQR APSPPMSQVFRTQAASADYLHPRIPSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLA LPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDRTRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSV IRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGDGKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLS QTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLASPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQ HLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLSGPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPG SSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPHMHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELE YRQ ; 'Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 983 1 983 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 4ET_MOUSE Q9EST3 . 1 983 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 C010A10376699DA8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLY PASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLE 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KDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRN DSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVIL AQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRS SSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKE KLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTM KASGTLPTQPKVSRNVESHLLAPAEIPGQPVSKNILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQR APSPPMSQVFRTQAASADYLHPRIPSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLA LPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDRTRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSV IRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGDGKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLS QTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLASPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQ HLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLSGPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPG SSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPHMHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELE YRQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 LYS . 1 4 SER . 1 5 VAL . 1 6 ALA . 1 7 GLU . 1 8 THR . 1 9 GLU . 1 10 ASN . 1 11 GLY . 1 12 ASP . 1 13 ALA . 1 14 PHE . 1 15 LEU . 1 16 GLU . 1 17 LEU . 1 18 LYS . 1 19 LYS . 1 20 LEU . 1 21 PRO . 1 22 THR . 1 23 SER . 1 24 LYS . 1 25 SER . 1 26 PRO . 1 27 HIS . 1 28 ARG . 1 29 TYR . 1 30 THR . 1 31 LYS . 1 32 GLU . 1 33 GLU . 1 34 LEU . 1 35 LEU . 1 36 ASP . 1 37 ILE . 1 38 LYS . 1 39 GLU . 1 40 ARG . 1 41 PRO . 1 42 TYR . 1 43 SER . 1 44 LYS . 1 45 GLN . 1 46 ARG . 1 47 PRO . 1 48 SER . 1 49 CYS . 1 50 LEU . 1 51 SER . 1 52 GLU . 1 53 LYS . 1 54 TYR . 1 55 ASP . 1 56 SER . 1 57 ASP . 1 58 GLY . 1 59 VAL . 1 60 TRP . 1 61 ASP . 1 62 PRO . 1 63 GLU . 1 64 LYS . 1 65 TRP . 1 66 HIS . 1 67 ALA . 1 68 SER . 1 69 LEU . 1 70 TYR . 1 71 PRO . 1 72 ALA . 1 73 SER . 1 74 GLY . 1 75 ARG . 1 76 SER . 1 77 SER . 1 78 PRO . 1 79 VAL . 1 80 GLU . 1 81 SER . 1 82 LEU . 1 83 LYS . 1 84 LYS . 1 85 GLU . 1 86 SER . 1 87 GLU . 1 88 SER . 1 89 ASP . 1 90 ARG . 1 91 PRO . 1 92 SER . 1 93 LEU . 1 94 VAL . 1 95 ARG . 1 96 ARG . 1 97 ILE . 1 98 ALA . 1 99 ASP . 1 100 PRO . 1 101 ARG . 1 102 GLU . 1 103 ARG . 1 104 VAL . 1 105 LYS . 1 106 GLU . 1 107 ASP . 1 108 ASP . 1 109 LEU . 1 110 ASP . 1 111 VAL . 1 112 VAL . 1 113 LEU . 1 114 SER . 1 115 PRO . 1 116 GLN . 1 117 ARG . 1 118 ARG . 1 119 SER . 1 120 PHE . 1 121 GLY . 1 122 GLY . 1 123 GLY . 1 124 CYS . 1 125 HIS . 1 126 VAL . 1 127 THR . 1 128 ALA . 1 129 ALA . 1 130 VAL . 1 131 SER . 1 132 SER . 1 133 ARG . 1 134 ARG . 1 135 SER . 1 136 GLY . 1 137 SER . 1 138 PRO . 1 139 LEU . 1 140 GLU . 1 141 LYS . 1 142 ASP . 1 143 SER . 1 144 ASP . 1 145 GLY . 1 146 LEU . 1 147 ARG . 1 148 LEU . 1 149 LEU . 1 150 GLY . 1 151 GLY . 1 152 ARG . 1 153 ARG . 1 154 ILE . 1 155 GLY . 1 156 SER . 1 157 GLY . 1 158 ARG . 1 159 ILE . 1 160 ILE . 1 161 SER . 1 162 ALA . 1 163 ARG . 1 164 ALA . 1 165 PHE . 1 166 GLU . 1 167 LYS . 1 168 ASP . 1 169 HIS . 1 170 ARG . 1 171 LEU . 1 172 SER . 1 173 ASP . 1 174 LYS . 1 175 ASP . 1 176 LEU . 1 177 ARG . 1 178 ASP . 1 179 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A 1 846 LEU 846 ? ? ? B . A 1 847 GLN 847 ? ? ? B . A 1 848 ALA 848 ? ? ? B . A 1 849 GLY 849 ? ? ? B . A 1 850 VAL 850 ? ? ? B . A 1 851 LEU 851 ? ? ? B . A 1 852 PRO 852 ? ? ? B . A 1 853 PRO 853 ? ? ? B . A 1 854 GLY 854 ? ? ? B . A 1 855 ILE 855 ? ? ? B . A 1 856 ASP 856 ? ? ? B . A 1 857 MET 857 ? ? ? B . A 1 858 ALA 858 ? ? ? B . A 1 859 PRO 859 ? ? ? B . A 1 860 LEU 860 ? ? ? B . A 1 861 GLN 861 ? ? ? B . A 1 862 GLY 862 ? ? ? B . A 1 863 LEU 863 ? ? ? B . A 1 864 SER 864 ? ? ? B . A 1 865 GLY 865 ? ? ? B . A 1 866 PRO 866 ? ? ? B . A 1 867 LEU 867 ? ? ? B . A 1 868 LEU 868 ? ? ? B . A 1 869 GLY 869 ? ? ? B . A 1 870 GLN 870 ? ? ? B . A 1 871 PRO 871 ? ? ? B . A 1 872 LEU 872 ? ? ? B . A 1 873 TYR 873 ? ? ? B . A 1 874 PRO 874 ? ? ? B . A 1 875 LEU 875 ? ? ? B . A 1 876 VAL 876 ? ? ? B . A 1 877 SER 877 ? ? ? B . A 1 878 ALA 878 ? ? ? B . A 1 879 ALA 879 ? ? ? B . A 1 880 SER 880 ? ? ? B . A 1 881 HIS 881 ? ? ? B . A 1 882 PRO 882 ? ? ? B . A 1 883 LEU 883 ? ? ? B . A 1 884 LEU 884 ? ? ? B . A 1 885 ASN 885 ? ? ? B . A 1 886 PRO 886 ? ? ? B . A 1 887 ARG 887 ? ? ? B . A 1 888 PRO 888 ? ? ? B . A 1 889 GLY 889 ? ? ? B . A 1 890 THR 890 ? ? ? B . A 1 891 PRO 891 ? ? ? B . A 1 892 LEU 892 ? ? ? B . A 1 893 HIS 893 ? ? ? B . A 1 894 LEU 894 ? ? ? B . A 1 895 ALA 895 ? ? ? B . A 1 896 VAL 896 ? ? ? B . A 1 897 MET 897 ? ? ? B . A 1 898 GLN 898 ? ? ? B . A 1 899 GLN 899 ? ? ? B . A 1 900 GLN 900 ? ? ? B . A 1 901 LEU 901 ? ? ? B . A 1 902 GLN 902 ? ? ? B . A 1 903 ARG 903 ? ? ? B . A 1 904 SER 904 ? ? ? B . A 1 905 VAL 905 ? ? ? B . A 1 906 LEU 906 ? ? ? B . A 1 907 HIS 907 ? ? ? B . A 1 908 PRO 908 ? ? ? B . A 1 909 PRO 909 ? ? ? B . A 1 910 GLY 910 ? ? ? B . A 1 911 SER 911 ? ? ? B . A 1 912 SER 912 ? ? ? B . A 1 913 SER 913 ? ? ? B . A 1 914 GLN 914 ? ? ? B . A 1 915 ALA 915 ? ? ? B . A 1 916 ALA 916 ? ? ? B . A 1 917 ALA 917 ? ? ? B . A 1 918 ILE 918 ? ? ? B . A 1 919 SER 919 ? ? ? B . A 1 920 VAL 920 ? ? ? B . A 1 921 GLN 921 ? ? ? B . A 1 922 THR 922 ? ? ? B . A 1 923 PRO 923 ? ? ? B . A 1 924 GLN 924 ? ? ? B . A 1 925 ASN 925 ? ? ? B . A 1 926 VAL 926 ? ? ? B . A 1 927 PRO 927 ? ? ? B . A 1 928 SER 928 ? ? ? B . A 1 929 ARG 929 ? ? ? B . A 1 930 SER 930 ? ? ? B . A 1 931 GLY 931 ? ? ? B . A 1 932 MET 932 ? ? ? B . A 1 933 PRO 933 ? ? ? B . A 1 934 HIS 934 ? ? ? B . A 1 935 MET 935 ? ? ? B . A 1 936 HIS 936 ? ? ? B . A 1 937 SER 937 ? ? ? B . A 1 938 GLN 938 ? ? ? B . A 1 939 LEU 939 ? ? ? B . A 1 940 GLU 940 ? ? ? B . A 1 941 HIS 941 ? ? ? B . A 1 942 ARG 942 ? ? ? B . A 1 943 THR 943 ? ? ? B . A 1 944 SER 944 ? ? ? B . A 1 945 GLN 945 ? ? ? B . A 1 946 ARG 946 ? ? ? B . A 1 947 SER 947 ? ? ? B . A 1 948 SER 948 ? ? ? B . A 1 949 SER 949 ? ? ? B . A 1 950 PRO 950 ? ? ? B . A 1 951 VAL 951 ? ? ? B . A 1 952 GLY 952 952 GLY GLY B . A 1 953 LEU 953 953 LEU LEU B . A 1 954 ALA 954 954 ALA ALA B . A 1 955 LYS 955 955 LYS LYS B . A 1 956 TRP 956 956 TRP TRP B . A 1 957 PHE 957 957 PHE PHE B . A 1 958 GLY 958 958 GLY GLY B . A 1 959 SER 959 959 SER SER B . A 1 960 ASP 960 960 ASP ASP B . A 1 961 VAL 961 961 VAL VAL B . A 1 962 LEU 962 962 LEU LEU B . A 1 963 GLN 963 963 GLN GLN B . A 1 964 GLN 964 964 GLN GLN B . A 1 965 PRO 965 965 PRO PRO B . A 1 966 LEU 966 966 LEU LEU B . A 1 967 PRO 967 967 PRO PRO B . A 1 968 SER 968 968 SER SER B . A 1 969 MET 969 969 MET MET B . A 1 970 PRO 970 970 PRO PRO B . A 1 971 THR 971 971 THR THR B . A 1 972 LYS 972 972 LYS LYS B . A 1 973 VAL 973 973 VAL VAL B . A 1 974 ILE 974 974 ILE ILE B . A 1 975 SER 975 975 SER SER B . A 1 976 VAL 976 976 VAL VAL B . A 1 977 ASP 977 977 ASP ASP B . A 1 978 GLU 978 978 GLU GLU B . A 1 979 LEU 979 979 LEU LEU B . A 1 980 GLU 980 980 GLU GLU B . A 1 981 TYR 981 981 TYR TYR B . A 1 982 ARG 982 982 ARG ARG B . A 1 983 GLN 983 983 GLN GLN B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter {PDB ID=6f9w, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=6f9w.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6f9w, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ GPLGSGLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 37 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6f9w 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 983 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 983 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.9e-15 93.750 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEKSVAETENGDAFLELKKLPTSKSPHRYTKEELLDIKERPYSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLYPASGRSSPVESLKKESESDRPSLVRRIADPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRRSGSPLEKDSDGLRLLGGRRIGSGRIISARAFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRNDSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPSADQEVPRDVILPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAVLSPGQNSGNYFAPIPSEDHAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQMKNSTPFMAEHLEETLSAASSNRQLKKDGDMTAFNKLVNTMKASGTLPTQPKVSRNVESHLLAPAEIPGQPVSKNILQELLGQPVQRPASSNLLSGLMGSLEATASLLSQRAPSPPMSQVFRTQAASADYLHPRIPSPIGFPSGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVSAQMSQLELQQAALEGLALPHDLAVQTAPFYQPGFSKPQVDRTRDGLRNRQQRMSKSPAPMHGGNSSSPAPAASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESREKTKEEMAPGMVVPGDGKEDTQKTSEENLLSSNPIPNTDQDSSTTNPKLSTLQRSSCSTPLSQTSRYTKEQDYRPKTAGRKTPTLASPVPGTPFLRPTHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRLIAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGIDMAPLQGLSGPLLGQPLYPLVSAASHPLLNPRPGTPLHLAVMQQQLQRSVLHPPGSSSQAAAISVQTPQNVPSRSGMPHMHSQLEHRTSQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPTKVISVDELEYRQ 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GLAKWFGSDMLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6f9w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 952 952 ? A 30.600 15.974 52.939 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 2 C CA . GLY 952 952 ? A 30.514 17.373 52.343 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 3 C C . GLY 952 952 ? A 29.124 17.955 52.365 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 4 O O . GLY 952 952 ? A 28.892 18.956 53.024 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 5 N N . LEU 953 953 ? A 28.137 17.300 51.709 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 6 C CA . LEU 953 953 ? A 26.743 17.721 51.714 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 7 C C . LEU 953 953 ? A 26.005 17.451 53.024 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 8 O O . LEU 953 953 ? A 24.951 18.018 53.279 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 9 C CB . LEU 953 953 ? A 26.002 17.002 50.564 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 10 C CG . LEU 953 953 ? A 26.342 17.521 49.152 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 11 C CD1 . LEU 953 953 ? A 25.583 16.662 48.128 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 12 C CD2 . LEU 953 953 ? A 25.956 19.004 48.971 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 13 N N . ALA 954 954 ? A 26.584 16.628 53.929 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 14 C CA . ALA 954 954 ? A 26.032 16.301 55.235 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 15 C C . ALA 954 954 ? A 25.878 17.504 56.164 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 16 O O . ALA 954 954 ? A 25.148 17.467 57.142 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 17 C CB . ALA 954 954 ? A 26.959 15.275 55.929 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 18 N N . LYS 955 955 ? A 26.552 18.628 55.837 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 19 C CA . LYS 955 955 ? A 26.399 19.897 56.510 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 20 C C . LYS 955 955 ? A 25.007 20.519 56.351 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 21 O O . LYS 955 955 ? A 24.595 21.344 57.162 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 22 C CB . LYS 955 955 ? A 27.445 20.880 55.926 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 23 C CG . LYS 955 955 ? A 27.686 22.109 56.816 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 24 C CD . LYS 955 955 ? A 28.694 23.083 56.185 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 25 C CE . LYS 955 955 ? A 29.202 24.173 57.135 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 26 N NZ . LYS 955 955 ? A 28.140 25.175 57.364 1 1 B LYS 0.640 1 ATOM 27 N N . TRP 956 956 ? A 24.271 20.150 55.276 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 28 C CA . TRP 956 956 ? A 22.984 20.734 54.952 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 29 C C . TRP 956 956 ? A 21.860 19.705 54.899 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 30 O O . TRP 956 956 ? A 20.687 20.063 54.973 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 31 C CB . TRP 956 956 ? A 23.066 21.393 53.548 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 32 C CG . TRP 956 956 ? A 24.302 22.258 53.337 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 33 C CD1 . TRP 956 956 ? A 25.360 22.034 52.500 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 34 C CD2 . TRP 956 956 ? A 24.607 23.473 54.052 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 35 N NE1 . TRP 956 956 ? A 26.303 23.039 52.627 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 36 C CE2 . TRP 956 956 ? A 25.842 23.938 53.572 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 37 C CE3 . TRP 956 956 ? A 23.904 24.170 55.032 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 38 C CZ2 . TRP 956 956 ? A 26.387 25.134 54.041 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 39 C CZ3 . TRP 956 956 ? A 24.456 25.367 55.516 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 40 C CH2 . TRP 956 956 ? A 25.672 25.853 55.018 1 1 B TRP 0.530 1 ATOM 41 N N . PHE 957 957 ? A 22.175 18.396 54.773 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 42 C CA . PHE 957 957 ? A 21.172 17.366 54.567 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 43 C C . PHE 957 957 ? A 21.302 16.303 55.628 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 44 O O . PHE 957 957 ? A 22.399 15.915 56.017 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 45 C CB . PHE 957 957 ? A 21.282 16.665 53.187 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 46 C CG . PHE 957 957 ? A 21.089 17.673 52.087 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 47 C CD1 . PHE 957 957 ? A 19.819 18.187 51.775 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 48 C CD2 . PHE 957 957 ? A 22.197 18.141 51.369 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 49 C CE1 . PHE 957 957 ? A 19.663 19.131 50.749 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 50 C CE2 . PHE 957 957 ? A 22.051 19.093 50.355 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 51 C CZ . PHE 957 957 ? A 20.780 19.581 50.036 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 52 N N . GLY 958 958 ? A 20.149 15.802 56.126 1 1 B GLY 0.780 1 ATOM 53 C CA . GLY 958 958 ? A 20.088 14.711 57.094 1 1 B GLY 0.780 1 ATOM 54 C C . GLY 958 958 ? A 20.722 13.415 56.661 1 1 B GLY 0.780 1 ATOM 55 O O . GLY 958 958 ? A 20.715 13.062 55.482 1 1 B GLY 0.780 1 ATOM 56 N N . SER 959 959 ? A 21.224 12.625 57.633 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 57 C CA . SER 959 959 ? 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A 16.277 8.358 50.928 1 1 B GLN 0.780 1 ATOM 100 C CD . GLN 964 964 ? A 14.796 8.677 51.115 1 1 B GLN 0.780 1 ATOM 101 O OE1 . GLN 964 964 ? A 13.907 7.980 50.638 1 1 B GLN 0.780 1 ATOM 102 N NE2 . GLN 964 964 ? A 14.502 9.784 51.833 1 1 B GLN 0.780 1 ATOM 103 N N . PRO 965 965 ? A 17.520 5.690 48.346 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 104 C CA . PRO 965 965 ? A 17.529 5.925 46.902 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 105 C C . PRO 965 965 ? A 17.005 7.292 46.467 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 106 O O . PRO 965 965 ? A 15.922 7.696 46.886 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 107 C CB . PRO 965 965 ? A 16.687 4.775 46.300 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 108 C CG . PRO 965 965 ? A 16.548 3.749 47.436 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 109 C CD . PRO 965 965 ? A 16.597 4.616 48.693 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 110 N N . LEU 966 966 ? A 17.747 8.012 45.609 1 1 B LEU 0.730 1 ATOM 111 C CA . LEU 966 966 ? A 17.392 9.349 45.188 1 1 B LEU 0.730 1 ATOM 112 C C . LEU 966 966 ? A 16.977 9.301 43.730 1 1 B LEU 0.730 1 ATOM 113 O O . LEU 966 966 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #