data_SMR-1c8ff46107b466de1e9f904ce2993ffc_2 _entry.id SMR-1c8ff46107b466de1e9f904ce2993ffc_2 _struct.entry_id SMR-1c8ff46107b466de1e9f904ce2993ffc_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y2H0/ DLGP4_HUMAN, Disks large-associated protein 4 Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y2H0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 126006.208 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DLGP4_HUMAN Q9Y2H0 1 ;MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSST FPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIR HLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDN LDGEAGAFRSSGPASGLMTLGRQAERSQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSL GVGTDTNYVKRGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRE TDAAAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLD SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYEAACESACSEA ESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKT PPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAP EAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQVDCIQPVPKEEPSPATKFQSIGVQVEDDWR SSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDP ALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLG KVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSW QLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADS IEIYVPEAQTRL ; 'Disks large-associated protein 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 992 1 992 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DLGP4_HUMAN Q9Y2H0 . 1 992 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-07-22 F0EBFBE0DE1AC814 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no J ;MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSST FPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIR HLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDN LDGEAGAFRSSGPASGLMTLGRQAERSQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSL GVGTDTNYVKRGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRE TDAAAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLD SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYEAACESACSEA ESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKT PPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAP EAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQVDCIQPVPKEEPSPATKFQSIGVQVEDDWR SSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDP ALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLG KVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSW QLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADS IEIYVPEAQTRL ; ;MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSST FPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIR HLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDN LDGEAGAFRSSGPASGLMTLGRQAERSQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSL GVGTDTNYVKRGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRE TDAAAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLD SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYEAACESACSEA ESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKT PPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAP EAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQVDCIQPVPKEEPSPATKFQSIGVQVEDDWR SSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDP ALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLG KVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSW QLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADS IEIYVPEAQTRL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 LYS . 1 3 GLY . 1 4 LEU . 1 5 GLY . 1 6 ASP . 1 7 SER . 1 8 ARG . 1 9 PRO . 1 10 ARG . 1 11 HIS . 1 12 LEU . 1 13 SER . 1 14 ASP . 1 15 SER . 1 16 LEU . 1 17 ASP . 1 18 PRO . 1 19 PRO . 1 20 HIS . 1 21 GLU . 1 22 PRO . 1 23 LEU . 1 24 PHE . 1 25 ALA . 1 26 GLY . 1 27 THR . 1 28 ASP . 1 29 ARG . 1 30 ASN . 1 31 PRO . 1 32 TYR . 1 33 LEU . 1 34 LEU . 1 35 SER . 1 36 PRO . 1 37 THR . 1 38 GLU . 1 39 ALA . 1 40 PHE . 1 41 ALA . 1 42 ARG . 1 43 GLU . 1 44 ALA . 1 45 ARG . 1 46 PHE . 1 47 PRO . 1 48 GLY . 1 49 GLN . 1 50 ASN . 1 51 THR . 1 52 LEU . 1 53 PRO . 1 54 GLY . 1 55 ASP . 1 56 GLY . 1 57 LEU . 1 58 PHE . 1 59 PRO . 1 60 LEU . 1 61 ASN . 1 62 ASN . 1 63 GLN . 1 64 LEU . 1 65 PRO . 1 66 PRO . 1 67 PRO . 1 68 SER . 1 69 SER . 1 70 THR . 1 71 PHE . 1 72 PRO . 1 73 ARG . 1 74 ILE . 1 75 HIS . 1 76 TYR . 1 77 ASN . 1 78 SER . 1 79 HIS . 1 80 PHE . 1 81 GLU . 1 82 VAL . 1 83 PRO . 1 84 GLU . 1 85 GLU . 1 86 SER . 1 87 PRO . 1 88 PHE . 1 89 PRO . 1 90 SER . 1 91 HIS . 1 92 ALA . 1 93 GLN . 1 94 ALA . 1 95 THR . 1 96 LYS . 1 97 ILE . 1 98 ASN . 1 99 ARG . 1 100 LEU . 1 101 PRO . 1 102 ALA . 1 103 ASN . 1 104 LEU . 1 105 LEU . 1 106 ASP . 1 107 GLN . 1 108 PHE . 1 109 GLU . 1 110 LYS . 1 111 GLN . 1 112 LEU . 1 113 PRO . 1 114 ILE . 1 115 HIS . 1 116 ARG . 1 117 ASP . 1 118 GLY . 1 119 PHE . 1 120 SER . 1 121 THR . 1 122 LEU . 1 123 GLN . 1 124 PHE . 1 125 PRO . 1 126 ARG . 1 127 GLY . 1 128 GLU . 1 129 ALA . 1 130 LYS . 1 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A 1 839 LEU 839 839 LEU LEU J . A 1 840 GLY 840 840 GLY GLY J . A 1 841 LYS 841 841 LYS LYS J . A 1 842 VAL 842 842 VAL VAL J . A 1 843 LEU 843 843 LEU LEU J . A 1 844 SER 844 844 SER SER J . A 1 845 ALA 845 845 ALA ALA J . A 1 846 VAL 846 846 VAL VAL J . A 1 847 GLY 847 847 GLY GLY J . A 1 848 SER 848 848 SER SER J . A 1 849 ALA 849 849 ALA ALA J . A 1 850 GLN 850 850 GLN GLN J . A 1 851 LEU 851 851 LEU LEU J . A 1 852 LEU 852 852 LEU LEU J . A 1 853 MET 853 853 MET MET J . A 1 854 SER 854 854 SER SER J . A 1 855 GLN 855 855 GLN GLN J . A 1 856 LYS 856 856 LYS LYS J . A 1 857 PHE 857 857 PHE PHE J . A 1 858 GLN 858 858 GLN GLN J . A 1 859 GLN 859 859 GLN GLN J . A 1 860 PHE 860 860 PHE PHE J . A 1 861 ARG 861 861 ARG ARG J . A 1 862 GLY 862 862 GLY GLY J . A 1 863 LEU 863 863 LEU LEU J . A 1 864 CYS 864 864 CYS CYS J . A 1 865 GLU 865 865 GLU GLU J . A 1 866 GLN 866 866 GLN GLN J . A 1 867 ASN 867 ? ? ? J . A 1 868 LEU 868 ? ? ? J . A 1 869 ASN 869 ? ? ? J . A 1 870 PRO 870 ? ? ? J . A 1 871 ASP 871 ? ? ? J . A 1 872 ALA 872 ? ? ? J . A 1 873 ASN 873 ? ? ? J . A 1 874 PRO 874 ? ? ? J . A 1 875 ARG 875 ? ? ? J . A 1 876 PRO 876 ? ? ? J . A 1 877 THR 877 ? ? ? J . A 1 878 ALA 878 ? ? ? J . A 1 879 GLN 879 ? ? ? J . A 1 880 ASP 880 ? ? ? J . A 1 881 LEU 881 ? ? ? J . A 1 882 ALA 882 ? ? ? J . A 1 883 GLY 883 ? ? ? J . A 1 884 PHE 884 ? ? ? J . A 1 885 TRP 885 ? ? ? J . A 1 886 ASP 886 ? ? ? J . A 1 887 LEU 887 ? ? ? J . A 1 888 LEU 888 ? ? ? J . A 1 889 GLN 889 ? ? ? J . A 1 890 LEU 890 ? ? ? J . A 1 891 SER 891 ? ? ? J . A 1 892 ILE 892 ? ? ? J . A 1 893 GLU 893 ? ? ? J . A 1 894 ASP 894 ? ? ? J . A 1 895 ILE 895 ? ? ? J . A 1 896 SER 896 ? ? ? J . A 1 897 MET 897 ? ? ? J . A 1 898 LYS 898 ? ? ? J . A 1 899 PHE 899 ? ? ? J . A 1 900 ASP 900 ? ? ? J . A 1 901 GLU 901 ? ? ? J . A 1 902 LEU 902 ? ? ? J . A 1 903 TYR 903 ? ? ? J . A 1 904 HIS 904 ? ? ? J . A 1 905 LEU 905 ? ? ? J . A 1 906 LYS 906 ? ? ? J . A 1 907 ALA 907 ? ? ? J . A 1 908 ASN 908 ? ? ? J . A 1 909 SER 909 ? ? ? J . A 1 910 TRP 910 ? ? ? J . A 1 911 GLN 911 ? ? ? J . A 1 912 LEU 912 ? ? ? J . A 1 913 VAL 913 ? ? ? J . A 1 914 GLU 914 ? ? ? J . A 1 915 THR 915 ? ? ? J . A 1 916 PRO 916 ? ? ? J . A 1 917 GLU 917 ? ? ? J . A 1 918 LYS 918 ? ? ? J . A 1 919 ARG 919 ? ? ? J . A 1 920 LYS 920 ? ? ? J . A 1 921 GLU 921 ? ? ? J . A 1 922 GLU 922 ? ? ? J . A 1 923 LYS 923 ? ? ? J . A 1 924 LYS 924 ? ? ? J . A 1 925 PRO 925 ? ? ? J . A 1 926 PRO 926 ? ? ? J . A 1 927 PRO 927 ? ? ? J . A 1 928 PRO 928 ? ? ? J . A 1 929 VAL 929 ? ? ? J . A 1 930 PRO 930 ? ? ? J . A 1 931 LYS 931 ? ? ? J . A 1 932 LYS 932 ? ? ? J . A 1 933 PRO 933 ? ? ? J . A 1 934 ALA 934 ? ? ? J . A 1 935 LYS 935 ? ? ? J . A 1 936 SER 936 ? ? ? J . A 1 937 LYS 937 ? ? ? J . A 1 938 PRO 938 ? ? ? J . A 1 939 ALA 939 ? ? ? J . A 1 940 VAL 940 ? ? ? J . A 1 941 SER 941 ? ? ? J . A 1 942 ARG 942 ? ? ? J . A 1 943 ASP 943 ? ? ? J . A 1 944 LYS 944 ? ? ? J . A 1 945 ALA 945 ? ? ? J . A 1 946 SER 946 ? ? ? J . A 1 947 ASP 947 ? ? ? J . A 1 948 ALA 948 ? ? ? J . A 1 949 SER 949 ? ? ? J . A 1 950 ASP 950 ? ? ? J . A 1 951 LYS 951 ? ? ? J . A 1 952 GLN 952 ? ? ? J . A 1 953 ARG 953 ? ? ? J . A 1 954 GLN 954 ? ? ? J . A 1 955 GLU 955 ? ? ? J . A 1 956 ALA 956 ? ? ? J . A 1 957 ARG 957 ? ? ? J . A 1 958 LYS 958 ? ? ? J . A 1 959 ARG 959 ? ? ? J . A 1 960 LEU 960 ? ? ? J . A 1 961 LEU 961 ? ? ? J . A 1 962 ALA 962 ? ? ? J . A 1 963 ALA 963 ? ? ? J . A 1 964 LYS 964 ? ? ? J . A 1 965 ARG 965 ? ? ? J . A 1 966 ALA 966 ? ? ? J . A 1 967 ALA 967 ? ? ? J . A 1 968 SER 968 ? ? ? J . A 1 969 VAL 969 ? ? ? J . A 1 970 ARG 970 ? ? ? J . A 1 971 GLN 971 ? ? ? J . A 1 972 ASN 972 ? ? ? J . A 1 973 SER 973 ? ? ? J . A 1 974 ALA 974 ? ? ? J . A 1 975 THR 975 ? ? ? J . A 1 976 GLU 976 ? ? ? J . A 1 977 SER 977 ? ? ? J . A 1 978 ALA 978 ? ? ? J . A 1 979 ASP 979 ? ? ? J . A 1 980 SER 980 ? ? ? J . A 1 981 ILE 981 ? ? ? J . A 1 982 GLU 982 ? ? ? J . A 1 983 ILE 983 ? ? ? J . A 1 984 TYR 984 ? ? ? J . A 1 985 VAL 985 ? ? ? J . A 1 986 PRO 986 ? ? ? J . A 1 987 GLU 987 ? ? ? J . A 1 988 ALA 988 ? ? ? J . A 1 989 GLN 989 ? ? ? J . A 1 990 THR 990 ? ? ? J . A 1 991 ARG 991 ? ? ? J . A 1 992 LEU 992 ? ? ? J . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nucleoporin NUP49/NSP49 {PDB ID=7n85, label_asym_id=J, auth_asym_id=F, SMTL ID=7n85.2.J}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7n85, label_asym_id=J' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-14 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A J 6 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 276 342 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7n85 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 992 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 999 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 23.000 15.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMTLGRQAERSQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVKRGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLDSVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYEAACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQVDCIQPVPKEEPSPATKFQSIGVQVEDDWRSSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKE-----NNLSEEVLGKVLSAVGSAQLL--MSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EIEQLDQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7n85.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 239.395 -15.128 29.953 1 1 J CYS 0.620 1 ATOM 139 O O . CYS 823 823 ? A 240.471 -15.550 30.345 1 1 J CYS 0.620 1 ATOM 140 C CB . CYS 823 823 ? A 238.028 -13.518 31.289 1 1 J CYS 0.620 1 ATOM 141 S SG . CYS 823 823 ? A 238.493 -14.135 32.949 1 1 J CYS 0.620 1 ATOM 142 N N . GLN 824 824 ? A 238.504 -15.959 29.382 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 143 C CA . GLN 824 824 ? A 238.806 -17.364 29.198 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 144 C C . GLN 824 824 ? A 239.762 -17.662 28.054 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 145 O O . GLN 824 824 ? A 240.580 -18.564 28.162 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 146 C CB . GLN 824 824 ? A 237.514 -18.195 29.096 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 147 C CG . GLN 824 824 ? A 236.625 -18.082 30.361 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 148 C CD . GLN 824 824 ? A 237.334 -18.577 31.621 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 149 O OE1 . GLN 824 824 ? A 237.901 -19.655 31.691 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 150 N NE2 . GLN 824 824 ? A 237.258 -17.787 32.725 1 1 J GLN 0.600 1 ATOM 151 N N . MET 825 825 ? A 239.708 -16.897 26.949 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 152 C CA . MET 825 825 ? A 240.601 -17.076 25.821 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 153 C C . MET 825 825 ? A 242.026 -16.587 26.065 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 154 O O . MET 825 825 ? A 242.970 -17.210 25.605 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 155 C CB . MET 825 825 ? A 239.992 -16.470 24.536 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 156 C CG . MET 825 825 ? A 238.708 -17.188 24.047 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 157 S SD . MET 825 825 ? A 238.878 -18.962 23.662 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 158 C CE . MET 825 825 ? A 240.046 -18.813 22.281 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 159 N N . ASP 826 826 ? A 242.254 -15.507 26.844 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 160 C CA . ASP 826 826 ? A 243.595 -15.123 27.260 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 161 C C . ASP 826 826 ? A 244.198 -16.136 28.244 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 162 O O . ASP 826 826 ? A 245.410 -16.332 28.325 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 163 C CB . ASP 826 826 ? A 243.556 -13.713 27.899 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 164 C CG . ASP 826 826 ? A 243.335 -12.594 26.884 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 165 O OD1 . ASP 826 826 ? A 243.433 -12.833 25.655 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 166 O OD2 . ASP 826 826 ? A 243.081 -11.455 27.360 1 1 J ASP 0.530 1 ATOM 167 N N . LYS 827 827 ? A 243.337 -16.856 28.999 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 168 C CA . LYS 827 827 ? A 243.748 -17.955 29.854 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 169 C C . LYS 827 827 ? A 244.055 -19.230 29.081 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 170 O O . LYS 827 827 ? A 244.666 -20.146 29.634 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 171 C CB . LYS 827 827 ? A 242.664 -18.302 30.904 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 172 C CG . LYS 827 827 ? A 242.533 -17.257 32.016 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 173 C CD . LYS 827 827 ? A 241.364 -17.559 32.961 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 174 C CE . LYS 827 827 ? A 241.178 -16.456 33.997 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 175 N NZ . LYS 827 827 ? A 240.042 -16.789 34.878 1 1 J LYS 0.520 1 ATOM 176 N N . GLU 828 828 ? A 243.645 -19.324 27.802 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 177 C CA . GLU 828 828 ? A 243.749 -20.528 27.005 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 178 C C . GLU 828 828 ? A 244.719 -20.336 25.850 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 179 O O . GLU 828 828 ? A 244.598 -19.456 25.001 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 180 C CB . GLU 828 828 ? A 242.362 -20.950 26.464 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 181 C CG . GLU 828 828 ? A 242.370 -22.270 25.653 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 182 C CD . GLU 828 828 ? A 240.991 -22.710 25.151 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 183 O OE1 . GLU 828 828 ? A 239.969 -22.055 25.477 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 184 O OE2 . GLU 828 828 ? A 240.963 -23.739 24.425 1 1 J GLU 0.500 1 ATOM 185 N N . THR 829 829 ? A 245.762 -21.182 25.783 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 186 C CA . THR 829 829 ? A 246.843 -21.024 24.826 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 187 C C . THR 829 829 ? A 246.942 -22.274 23.974 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 188 O O . THR 829 829 ? A 246.175 -23.218 24.112 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 189 C CB . THR 829 829 ? A 248.196 -20.638 25.445 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 190 O OG1 . THR 829 829 ? A 248.762 -21.666 26.241 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 191 C CG2 . THR 829 829 ? A 248.033 -19.417 26.365 1 1 J THR 0.290 1 ATOM 192 N N . LYS 830 830 ? A 247.872 -22.279 23.001 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 193 C CA . LYS 830 830 ? A 248.117 -23.406 22.125 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 194 C C . LYS 830 830 ? A 249.429 -24.053 22.489 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 195 O O . LYS 830 830 ? A 250.216 -23.519 23.266 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 196 C CB . LYS 830 830 ? A 248.194 -22.973 20.644 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 197 C CG . LYS 830 830 ? A 246.877 -22.369 20.152 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 198 C CD . LYS 830 830 ? A 246.960 -21.985 18.671 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 199 C CE . LYS 830 830 ? A 245.651 -21.405 18.139 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 200 N NZ . LYS 830 830 ? A 245.815 -21.045 16.714 1 1 J LYS 0.350 1 ATOM 201 N N . GLU 831 831 ? A 249.688 -25.230 21.899 1 1 J GLU 0.290 1 ATOM 202 C CA . GLU 831 831 ? A 250.884 -25.991 22.114 1 1 J GLU 0.290 1 ATOM 203 C C . GLU 831 831 ? 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A 253.089 -24.964 17.838 1 1 J ASN 0.370 1 ATOM 217 N ND2 . ASN 832 832 ? A 254.600 -24.069 19.245 1 1 J ASN 0.370 1 ATOM 218 N N . ASN 833 833 ? A 253.548 -29.494 20.797 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 219 C CA . ASN 833 833 ? A 254.009 -30.832 21.168 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 220 C C . ASN 833 833 ? A 253.649 -31.941 20.163 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 221 O O . ASN 833 833 ? A 254.271 -32.986 20.079 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 222 C CB . ASN 833 833 ? A 253.404 -31.201 22.553 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 223 C CG . ASN 833 833 ? A 253.954 -30.301 23.661 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 224 O OD1 . ASN 833 833 ? A 255.140 -30.011 23.719 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 225 N ND2 . ASN 833 833 ? A 253.083 -29.832 24.588 1 1 J ASN 0.460 1 ATOM 226 N N . LEU 834 834 ? A 252.627 -31.693 19.320 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 227 C CA . LEU 834 834 ? A 252.195 -32.574 18.260 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 228 C C . LEU 834 834 ? A 253.246 -32.852 17.194 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 229 O O . LEU 834 834 ? A 253.338 -33.956 16.679 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 230 C CB . LEU 834 834 ? A 250.878 -32.043 17.654 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 231 C CG . LEU 834 834 ? A 249.702 -32.109 18.655 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 232 C CD1 . LEU 834 834 ? A 248.434 -31.477 18.061 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 233 C CD2 . LEU 834 834 ? A 249.402 -33.553 19.095 1 1 J LEU 0.410 1 ATOM 234 N N . SER 835 835 ? A 254.116 -31.871 16.858 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 235 C CA . SER 835 835 ? A 255.229 -32.093 15.931 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 236 C C . SER 835 835 ? A 256.206 -33.141 16.463 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 237 O O . SER 835 835 ? A 256.645 -34.024 15.727 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 238 C CB . SER 835 835 ? A 255.997 -30.799 15.537 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 239 O OG . SER 835 835 ? A 256.500 -30.136 16.694 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 240 N N . GLU 836 836 ? A 256.505 -33.102 17.782 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 241 C CA . GLU 836 836 ? A 257.267 -34.101 18.509 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 242 C C . GLU 836 836 ? A 256.604 -35.466 18.512 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 243 O O . GLU 836 836 ? A 257.261 -36.477 18.272 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 244 C CB . GLU 836 836 ? A 257.542 -33.647 19.959 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 245 C CG . GLU 836 836 ? A 258.511 -32.445 20.057 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 246 C CD . GLU 836 836 ? A 258.792 -32.028 21.503 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 247 O OE1 . GLU 836 836 ? A 258.177 -32.608 22.432 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 248 O OE2 . GLU 836 836 ? A 259.650 -31.123 21.671 1 1 J GLU 0.420 1 ATOM 249 N N . GLU 837 837 ? A 255.268 -35.536 18.715 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 250 C CA . GLU 837 837 ? A 254.506 -36.772 18.606 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 251 C C . GLU 837 837 ? A 254.602 -37.416 17.233 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 252 O O . GLU 837 837 ? A 254.815 -38.624 17.117 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 253 C CB . GLU 837 837 ? A 253.009 -36.582 18.960 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 254 C CG . GLU 837 837 ? A 252.251 -37.941 18.982 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 255 C CD . GLU 837 837 ? A 250.753 -37.908 19.286 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 256 O OE1 . GLU 837 837 ? A 250.220 -36.846 19.682 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 257 O OE2 . GLU 837 837 ? A 250.136 -38.996 19.071 1 1 J GLU 0.460 1 ATOM 258 N N . VAL 838 838 ? A 254.505 -36.616 16.145 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 259 C CA . VAL 838 838 ? A 254.730 -37.091 14.793 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 260 C C . VAL 838 838 ? A 256.119 -37.697 14.639 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 261 O O . VAL 838 838 ? A 256.244 -38.859 14.320 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 262 C CB . VAL 838 838 ? A 254.502 -35.981 13.769 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 263 C CG1 . VAL 838 838 ? A 254.913 -36.378 12.334 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 264 C CG2 . VAL 838 838 ? A 253.010 -35.592 13.775 1 1 J VAL 0.580 1 ATOM 265 N N . LEU 839 839 ? A 257.194 -36.948 14.991 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 266 C CA . LEU 839 839 ? A 258.567 -37.436 14.900 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 267 C C . LEU 839 839 ? A 258.846 -38.662 15.755 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 268 O O . LEU 839 839 ? A 259.558 -39.574 15.335 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 269 C CB . LEU 839 839 ? A 259.588 -36.330 15.231 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 270 C CG . LEU 839 839 ? A 259.605 -35.171 14.214 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 271 C CD1 . LEU 839 839 ? A 260.513 -34.059 14.754 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 272 C CD2 . LEU 839 839 ? A 260.059 -35.605 12.806 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 273 N N . GLY 840 840 ? A 258.237 -38.737 16.956 1 1 J GLY 0.570 1 ATOM 274 C CA . GLY 840 840 ? A 258.336 -39.888 17.843 1 1 J GLY 0.570 1 ATOM 275 C C . GLY 840 840 ? A 257.791 -41.175 17.273 1 1 J GLY 0.570 1 ATOM 276 O O . GLY 840 840 ? A 258.322 -42.252 17.527 1 1 J GLY 0.570 1 ATOM 277 N N . LYS 841 841 ? A 256.733 -41.103 16.444 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 278 C CA . LYS 841 841 ? A 256.265 -42.247 15.686 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 279 C C . LYS 841 841 ? A 256.993 -42.453 14.368 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 280 O O . LYS 841 841 ? A 257.060 -43.582 13.881 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 281 C CB . LYS 841 841 ? A 254.769 -42.106 15.345 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 282 C CG . LYS 841 841 ? A 253.870 -42.133 16.586 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 283 C CD . LYS 841 841 ? A 252.381 -41.978 16.235 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 284 C CE . LYS 841 841 ? A 251.485 -41.959 17.481 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 285 N NZ . LYS 841 841 ? A 250.071 -41.705 17.124 1 1 J LYS 0.550 1 ATOM 286 N N . VAL 842 842 ? A 257.562 -41.388 13.754 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 287 C CA . VAL 842 842 ? A 258.300 -41.481 12.494 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 288 C C . VAL 842 842 ? A 259.488 -42.417 12.619 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 289 O O . VAL 842 842 ? A 259.599 -43.380 11.880 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 290 C CB . VAL 842 842 ? A 258.766 -40.108 11.971 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 291 C CG1 . VAL 842 842 ? A 259.841 -40.165 10.862 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 292 C CG2 . VAL 842 842 ? A 257.577 -39.345 11.369 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 293 N N . LEU 843 843 ? A 260.367 -42.216 13.624 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 294 C CA . LEU 843 843 ? A 261.534 -43.065 13.815 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 295 C C . LEU 843 843 ? A 261.186 -44.513 14.115 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 296 O O . LEU 843 843 ? A 261.829 -45.436 13.618 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 297 C CB . LEU 843 843 ? A 262.473 -42.500 14.896 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 298 C CG . LEU 843 843 ? A 263.134 -41.158 14.514 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 299 C CD1 . LEU 843 843 ? A 263.899 -40.613 15.727 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 300 C CD2 . LEU 843 843 ? A 264.080 -41.279 13.304 1 1 J LEU 0.520 1 ATOM 301 N N . SER 844 844 ? A 260.108 -44.749 14.885 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 302 C CA . SER 844 844 ? A 259.576 -46.081 15.129 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 303 C C . SER 844 844 ? A 259.146 -46.793 13.859 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 304 O O . SER 844 844 ? A 259.473 -47.953 13.640 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 305 C CB . SER 844 844 ? A 258.367 -46.041 16.089 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 306 O OG . SER 844 844 ? A 258.763 -45.471 17.336 1 1 J SER 0.550 1 ATOM 307 N N . ALA 845 845 ? A 258.447 -46.089 12.945 1 1 J ALA 0.570 1 ATOM 308 C CA . ALA 845 845 ? A 258.116 -46.600 11.633 1 1 J ALA 0.570 1 ATOM 309 C C . ALA 845 845 ? A 259.322 -46.864 10.730 1 1 J ALA 0.570 1 ATOM 310 O O . ALA 845 845 ? A 259.359 -47.866 10.016 1 1 J ALA 0.570 1 ATOM 311 C CB . ALA 845 845 ? A 257.118 -45.649 10.953 1 1 J ALA 0.570 1 ATOM 312 N N . VAL 846 846 ? A 260.360 -45.993 10.762 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 313 C CA . VAL 846 846 ? A 261.629 -46.212 10.068 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 314 C C . VAL 846 846 ? A 262.299 -47.491 10.538 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 315 O O . VAL 846 846 ? A 262.689 -48.329 9.731 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 316 C CB . VAL 846 846 ? A 262.594 -45.032 10.234 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 317 C CG1 . VAL 846 846 ? A 263.969 -45.303 9.585 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 318 C CG2 . VAL 846 846 ? A 261.992 -43.781 9.570 1 1 J VAL 0.540 1 ATOM 319 N N . GLY 847 847 ? A 262.361 -47.713 11.872 1 1 J GLY 0.510 1 ATOM 320 C CA . GLY 847 847 ? A 262.881 -48.955 12.435 1 1 J GLY 0.510 1 ATOM 321 C C . GLY 847 847 ? A 262.085 -50.171 12.032 1 1 J GLY 0.510 1 ATOM 322 O O . GLY 847 847 ? A 262.645 -51.208 11.707 1 1 J GLY 0.510 1 ATOM 323 N N . SER 848 848 ? A 260.746 -50.058 11.956 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 324 C CA . SER 848 848 ? A 259.894 -51.121 11.431 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 325 C C . SER 848 848 ? A 260.158 -51.513 9.985 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 326 O O . SER 848 848 ? A 260.161 -52.694 9.657 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 327 C CB . SER 848 848 ? A 258.382 -50.817 11.557 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 328 O OG . SER 848 848 ? A 258.000 -50.719 12.930 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 329 N N . ALA 849 849 ? A 260.399 -50.544 9.075 1 1 J ALA 0.470 1 ATOM 330 C CA . ALA 849 849 ? A 260.797 -50.816 7.705 1 1 J ALA 0.470 1 ATOM 331 C C . ALA 849 849 ? A 262.173 -51.471 7.565 1 1 J ALA 0.470 1 ATOM 332 O O . ALA 849 849 ? A 262.396 -52.294 6.684 1 1 J ALA 0.470 1 ATOM 333 C CB . ALA 849 849 ? A 260.771 -49.508 6.895 1 1 J ALA 0.470 1 ATOM 334 N N . GLN 850 850 ? A 263.134 -51.101 8.439 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 335 C CA . GLN 850 850 ? A 264.451 -51.722 8.518 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 336 C C . GLN 850 850 ? A 264.453 -53.206 8.889 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 337 O O . GLN 850 850 ? A 265.259 -53.981 8.379 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 338 C CB . GLN 850 850 ? A 265.363 -50.996 9.531 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 339 C CG . GLN 850 850 ? A 265.766 -49.577 9.083 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 340 C CD . GLN 850 850 ? A 266.570 -48.876 10.178 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 341 O OE1 . GLN 850 850 ? A 266.472 -49.157 11.365 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 342 N NE2 . GLN 850 850 ? A 267.415 -47.903 9.755 1 1 J GLN 0.420 1 ATOM 343 N N . LEU 851 851 ? A 263.557 -53.628 9.810 1 1 J LEU 0.380 1 ATOM 344 C CA . LEU 851 851 ? A 263.416 -55.005 10.282 1 1 J LEU 0.380 1 ATOM 345 C C . LEU 851 851 ? A 262.723 -55.901 9.278 1 1 J LEU 0.380 1 ATOM 346 O O . LEU 851 851 ? A 261.707 -56.554 9.530 1 1 J LEU 0.380 1 ATOM 347 C CB . LEU 851 851 ? A 262.699 -55.078 11.649 1 1 J LEU 0.380 1 ATOM 348 C CG . 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A 263.144 -61.045 5.522 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 362 O O . MET 853 853 ? A 263.357 -62.230 5.304 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 363 C CB . MET 853 853 ? A 262.358 -61.446 7.832 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 364 C CG . MET 853 853 ? A 262.385 -61.108 9.333 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 365 S SD . MET 853 853 ? A 261.326 -62.205 10.329 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 366 C CE . MET 853 853 ? A 262.273 -63.739 10.108 1 1 J MET 0.360 1 ATOM 367 N N . SER 854 854 ? A 262.890 -60.183 4.512 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 368 C CA . SER 854 854 ? A 262.762 -60.531 3.098 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 369 C C . SER 854 854 ? A 263.997 -61.222 2.540 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 370 O O . SER 854 854 ? A 263.885 -62.205 1.820 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 371 C CB . SER 854 854 ? A 262.382 -59.314 2.198 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 372 O OG . SER 854 854 ? A 263.458 -58.382 2.068 1 1 J SER 0.480 1 ATOM 373 N N . GLN 855 855 ? A 265.207 -60.754 2.937 1 1 J GLN 0.530 1 ATOM 374 C CA . GLN 855 855 ? A 266.476 -61.371 2.602 1 1 J GLN 0.530 1 ATOM 375 C C . 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.519 2 1 3 0.014 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 807 PHE 1 0.560 2 1 A 808 LEU 1 0.620 3 1 A 809 LYS 1 0.520 4 1 A 810 LEU 1 0.510 5 1 A 811 LEU 1 0.550 6 1 A 812 GLN 1 0.570 7 1 A 813 ALA 1 0.640 8 1 A 814 GLU 1 0.610 9 1 A 815 THR 1 0.630 10 1 A 816 GLU 1 0.600 11 1 A 817 ARG 1 0.560 12 1 A 818 LEU 1 0.620 13 1 A 819 GLU 1 0.620 14 1 A 820 GLY 1 0.700 15 1 A 821 TRP 1 0.600 16 1 A 822 CYS 1 0.660 17 1 A 823 CYS 1 0.620 18 1 A 824 GLN 1 0.600 19 1 A 825 MET 1 0.570 20 1 A 826 ASP 1 0.530 21 1 A 827 LYS 1 0.520 22 1 A 828 GLU 1 0.500 23 1 A 829 THR 1 0.290 24 1 A 830 LYS 1 0.350 25 1 A 831 GLU 1 0.290 26 1 A 832 ASN 1 0.370 27 1 A 833 ASN 1 0.460 28 1 A 834 LEU 1 0.410 29 1 A 835 SER 1 0.480 30 1 A 836 GLU 1 0.420 31 1 A 837 GLU 1 0.460 32 1 A 838 VAL 1 0.580 33 1 A 839 LEU 1 0.520 34 1 A 840 GLY 1 0.570 35 1 A 841 LYS 1 0.550 36 1 A 842 VAL 1 0.540 37 1 A 843 LEU 1 0.520 38 1 A 844 SER 1 0.550 39 1 A 845 ALA 1 0.570 40 1 A 846 VAL 1 0.540 41 1 A 847 GLY 1 0.510 42 1 A 848 SER 1 0.480 43 1 A 849 ALA 1 0.470 44 1 A 850 GLN 1 0.420 45 1 A 851 LEU 1 0.380 46 1 A 852 LEU 1 0.340 47 1 A 853 MET 1 0.360 48 1 A 854 SER 1 0.480 49 1 A 855 GLN 1 0.530 50 1 A 856 LYS 1 0.510 51 1 A 857 PHE 1 0.460 52 1 A 858 GLN 1 0.530 53 1 A 859 GLN 1 0.570 54 1 A 860 PHE 1 0.510 55 1 A 861 ARG 1 0.490 56 1 A 862 GLY 1 0.600 57 1 A 863 LEU 1 0.490 58 1 A 864 CYS 1 0.490 59 1 A 865 GLU 1 0.700 60 1 A 866 GLN 1 0.460 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #