data_SMR-f16479e921d86c57604836c08f88cf6a_3 _entry.id SMR-f16479e921d86c57604836c08f88cf6a_3 _struct.entry_id SMR-f16479e921d86c57604836c08f88cf6a_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6P9K9/ NRX3A_MOUSE, Neurexin-3 Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6P9K9' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 141730.588 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NRX3A_MOUSE Q6P9K9 1 ;MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIGDTKMKIYGEVVFKCENV ATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDVRSQKNTKVDFFAVELL DGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCK NNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKVIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLV ATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARF GLRNIIADPVTFKTKSSYLTLATLQAYTSMHLFFQFKTTSADGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFD LGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDSSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEVALTKADLQGPSTTCQEDSCANQGVC MQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYP TGNTDNERLQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVL NMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSVSGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDL VSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYR NRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQASSKSGHKKQKNKDKEYYV ; Neurexin-3 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1100 1 1100 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NRX3A_MOUSE Q6P9K9 Q6P9K9-2 1 1100 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-12-14 F2D6860CFAF3C8F0 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIGDTKMKIYGEVVFKCENV ATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDVRSQKNTKVDFFAVELL DGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCK NNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKVIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLV ATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARF GLRNIIADPVTFKTKSSYLTLATLQAYTSMHLFFQFKTTSADGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFD LGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDSSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS 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ASN . 1 27 ASN . 1 28 PHE . 1 29 MET . 1 30 GLY . 1 31 CYS . 1 32 LEU . 1 33 LYS . 1 34 GLU . 1 35 VAL . 1 36 VAL . 1 37 TYR . 1 38 LYS . 1 39 ASN . 1 40 ASN . 1 41 ASP . 1 42 ILE . 1 43 ARG . 1 44 LEU . 1 45 GLU . 1 46 LEU . 1 47 SER . 1 48 ARG . 1 49 LEU . 1 50 ALA . 1 51 ARG . 1 52 ILE . 1 53 GLY . 1 54 ASP . 1 55 THR . 1 56 LYS . 1 57 MET . 1 58 LYS . 1 59 ILE . 1 60 TYR . 1 61 GLY . 1 62 GLU . 1 63 VAL . 1 64 VAL . 1 65 PHE . 1 66 LYS . 1 67 CYS . 1 68 GLU . 1 69 ASN . 1 70 VAL . 1 71 ALA . 1 72 THR . 1 73 LEU . 1 74 ASP . 1 75 PRO . 1 76 ILE . 1 77 ASN . 1 78 PHE . 1 79 GLU . 1 80 THR . 1 81 PRO . 1 82 GLU . 1 83 ALA . 1 84 TYR . 1 85 ILE . 1 86 SER . 1 87 LEU . 1 88 PRO . 1 89 LYS . 1 90 TRP . 1 91 ASN . 1 92 THR . 1 93 LYS . 1 94 ARG . 1 95 MET . 1 96 GLY . 1 97 SER . 1 98 ILE . 1 99 SER . 1 100 PHE . 1 101 ASP . 1 102 PHE . 1 103 ARG . 1 104 THR . 1 105 THR . 1 106 GLU . 1 107 PRO . 1 108 ASN . 1 109 GLY . 1 110 LEU . 1 111 ILE . 1 112 LEU . 1 113 PHE . 1 114 THR . 1 115 HIS . 1 116 GLY . 1 117 LYS . 1 118 PRO . 1 119 GLN . 1 120 GLU . 1 121 ARG . 1 122 LYS . 1 123 ASP . 1 124 VAL . 1 125 ARG . 1 126 SER . 1 127 GLN . 1 128 LYS . 1 129 ASN . 1 130 THR . 1 131 LYS . 1 132 VAL . 1 133 ASP . 1 134 PHE . 1 135 PHE . 1 136 ALA . 1 137 VAL . 1 138 GLU . 1 139 LEU . 1 140 LEU . 1 141 ASP . 1 142 GLY . 1 143 ASN . 1 144 LEU . 1 145 TYR . 1 146 LEU . 1 147 LEU . 1 148 LEU . 1 149 ASP . 1 150 MET . 1 151 GLY . 1 152 SER . 1 153 GLY . 1 154 THR . 1 155 ILE . 1 156 LYS . 1 157 VAL . 1 158 LYS . 1 159 ALA . 1 160 THR . 1 161 GLN . 1 162 LYS . 1 163 LYS . 1 164 ALA . 1 165 ASN . 1 166 ASP . 1 167 GLY . 1 168 GLU . 1 169 TRP . 1 170 TYR . 1 171 HIS . 1 172 VAL . 1 173 ASP . 1 174 ILE . 1 175 GLN . 1 176 ARG . 1 177 ASP . 1 178 GLY . 1 179 ARG . 1 180 SER . 1 181 GLY . 1 182 THR . 1 183 ILE . 1 184 SER . 1 185 VAL . 1 186 ASN . 1 187 SER . 1 188 ARG . 1 189 ARG . 1 190 THR . 1 191 PRO . 1 192 PHE . 1 193 THR . 1 194 ALA . 1 195 SER . 1 196 GLY . 1 197 GLU . 1 198 SER . 1 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C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 {PDB ID=8fy5, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=8fy5.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8fy5, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAAPGSARRPLLLLLLLLLLGLMHCASAAMFMVKNGNGTACIMANFSAAFSVNYDTKSGPKNMTFDLPSD ATVVLNRSSCGKENTSDPSLVIAFGRGHTLTLNFTRNATRYSVQLMSFVYNLSDTHLFPNASSKEIKTVE SITDIRADIDKKYRCVSGTQVHMNNVTVTLHDATIQAYLSNSSFSRGETRCEQDRPSPTTAPPAPPSPSP SPVPKSPSVDKYNVSGTNGTCLLASMGLQLNLTYERKDNTTVTRLLNINPNKTSASGSCGAHLVTLELHS EGTTVLLFQFGMNASSSRFFLQGIQLNTILPDARDPAFKAANGSLRALQATVGNSYKCNAEEHVRVTKAF SVNIFKVWVQAFKVEGGQFGSVEECLLDENSMLIPIAVGGALAGLVLIVLIAYLVGRKRSHAGYQTI ; ;MAAPGSARRPLLLLLLLLLLGLMHCASAAMFMVKNGNGTACIMANFSAAFSVNYDTKSGPKNMTFDLPSD ATVVLNRSSCGKENTSDPSLVIAFGRGHTLTLNFTRNATRYSVQLMSFVYNLSDTHLFPNASSKEIKTVE SITDIRADIDKKYRCVSGTQVHMNNVTVTLHDATIQAYLSNSSFSRGETRCEQDRPSPTTAPPAPPSPSP SPVPKSPSVDKYNVSGTNGTCLLASMGLQLNLTYERKDNTTVTRLLNINPNKTSASGSCGAHLVTLELHS EGTTVLLFQFGMNASSSRFFLQGIQLNTILPDARDPAFKAANGSLRALQATVGNSYKCNAEEHVRVTKAF SVNIFKVWVQAFKVEGGQFGSVEECLLDENSMLIPIAVGGALAGLVLIVLIAYLVGRKRSHAGYQTI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 383 415 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8fy5 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1100 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1100 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.180 24.242 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIGDTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDVRSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKVIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLTLATLQAYTSMHLFFQFKTTSADGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDSSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEVALTKADLQGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERLQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSVSGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQASSKSGHKKQKNKDKEYYV 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LIPIAVGGALAGLVLIVLIAYLVGRKRSHA--GYQ------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8fy5.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 1024 1024 ? A 151.374 100.118 133.410 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 2 C CA . THR 1024 1024 ? A 150.755 98.875 132.784 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 3 C C . THR 1024 1024 ? A 149.653 99.188 131.816 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 4 O O . THR 1024 1024 ? A 149.895 99.239 130.620 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 5 C CB . THR 1024 1024 ? A 150.274 97.864 133.823 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 6 O OG1 . THR 1024 1024 ? A 151.362 97.563 134.680 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 7 C CG2 . THR 1024 1024 ? A 149.816 96.540 133.182 1 1 C THR 0.420 1 ATOM 8 N N . THR 1025 1025 ? A 148.422 99.471 132.290 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 9 C CA . THR 1025 1025 ? A 147.246 99.696 131.451 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 10 C C . THR 1025 1025 ? A 147.393 100.782 130.405 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 11 O O . THR 1025 1025 ? A 146.969 100.612 129.270 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 12 C CB . THR 1025 1025 ? A 146.021 99.959 132.307 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 13 O OG1 . THR 1025 1025 ? A 145.885 98.863 133.198 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 14 C CG2 . THR 1025 1025 ? A 144.736 100.058 131.473 1 1 C THR 0.450 1 ATOM 15 N N . GLY 1026 1026 ? A 148.068 101.908 130.725 1 1 C GLY 0.580 1 ATOM 16 C CA . GLY 1026 1026 ? A 148.387 102.943 129.735 1 1 C GLY 0.580 1 ATOM 17 C C . GLY 1026 1026 ? A 149.222 102.491 128.549 1 1 C GLY 0.580 1 ATOM 18 O O . GLY 1026 1026 ? A 149.009 102.926 127.423 1 1 C GLY 0.580 1 ATOM 19 N N . MET 1027 1027 ? A 150.170 101.555 128.769 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 20 C CA . MET 1027 1027 ? A 150.886 100.865 127.711 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 21 C C . MET 1027 1027 ? A 149.991 99.914 126.938 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 22 O O . MET 1027 1027 ? A 150.029 99.892 125.714 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 23 C CB . MET 1027 1027 ? A 152.138 100.119 128.246 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 24 C CG . MET 1027 1027 ? A 153.243 101.064 128.763 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 25 S SD . MET 1027 1027 ? A 153.824 102.276 127.531 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 26 C CE . MET 1027 1027 ? A 154.578 101.104 126.365 1 1 C MET 0.550 1 ATOM 27 N N . VAL 1028 1028 ? A 149.115 99.141 127.625 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 28 C CA . VAL 1028 1028 ? A 148.165 98.234 126.980 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 29 C C . VAL 1028 1028 ? A 147.240 98.971 126.019 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 30 O O . VAL 1028 1028 ? A 147.131 98.614 124.848 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 31 C CB . VAL 1028 1028 ? A 147.322 97.467 128.009 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 32 C CG1 . VAL 1028 1028 ? A 146.223 96.604 127.344 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 33 C CG2 . VAL 1028 1028 ? A 148.248 96.568 128.852 1 1 C VAL 0.600 1 ATOM 34 N N . VAL 1029 1029 ? A 146.609 100.079 126.459 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 35 C CA . VAL 1029 1029 ? A 145.733 100.887 125.619 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 36 C C . VAL 1029 1029 ? A 146.470 101.577 124.475 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 37 O O . VAL 1029 1029 ? A 145.951 101.709 123.367 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 38 C CB . VAL 1029 1029 ? A 144.851 101.867 126.398 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 39 C CG1 . VAL 1029 1029 ? A 144.065 101.102 127.485 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 40 C CG2 . VAL 1029 1029 ? A 145.667 103.015 127.019 1 1 C VAL 0.620 1 ATOM 41 N N . GLY 1030 1030 ? A 147.736 101.996 124.703 1 1 C GLY 0.650 1 ATOM 42 C CA . GLY 1030 1030 ? A 148.605 102.558 123.674 1 1 C GLY 0.650 1 ATOM 43 C C . GLY 1030 1030 ? A 148.999 101.569 122.597 1 1 C GLY 0.650 1 ATOM 44 O O . GLY 1030 1030 ? A 149.070 101.915 121.420 1 1 C GLY 0.650 1 ATOM 45 N N . ILE 1031 1031 ? A 149.218 100.289 122.973 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 46 C CA . ILE 1031 1031 ? A 149.385 99.154 122.063 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 47 C C . ILE 1031 1031 ? A 148.118 98.898 121.256 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 48 O O . ILE 1031 1031 ? A 148.178 98.720 120.041 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 49 C CB . ILE 1031 1031 ? A 149.833 97.876 122.788 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 50 C CG1 . ILE 1031 1031 ? A 151.257 98.064 123.364 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 51 C CG2 . ILE 1031 1031 ? A 149.798 96.638 121.854 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 52 C CD1 . ILE 1031 1031 ? A 151.639 96.993 124.393 1 1 C ILE 0.630 1 ATOM 53 N N . VAL 1032 1032 ? A 146.923 98.928 121.893 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 54 C CA . VAL 1032 1032 ? A 145.631 98.785 121.215 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 55 C C . VAL 1032 1032 ? A 145.408 99.878 120.170 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 56 O O . VAL 1032 1032 ? A 145.007 99.609 119.037 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 57 C CB . VAL 1032 1032 ? A 144.458 98.764 122.205 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 58 C CG1 . VAL 1032 1032 ? A 143.089 98.754 121.486 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 59 C CG2 . VAL 1032 1032 ? A 144.553 97.510 123.098 1 1 C VAL 0.670 1 ATOM 60 N N . ALA 1033 1033 ? A 145.718 101.146 120.511 1 1 C ALA 0.710 1 ATOM 61 C CA . ALA 1033 1033 ? A 145.686 102.268 119.591 1 1 C ALA 0.710 1 ATOM 62 C C . ALA 1033 1033 ? A 146.681 102.145 118.437 1 1 C ALA 0.710 1 ATOM 63 O O . ALA 1033 1033 ? A 146.350 102.424 117.284 1 1 C ALA 0.710 1 ATOM 64 C CB . ALA 1033 1033 ? A 145.930 103.582 120.359 1 1 C ALA 0.710 1 ATOM 65 N N . ALA 1034 1034 ? A 147.920 101.677 118.715 1 1 C ALA 0.730 1 ATOM 66 C CA . ALA 1034 1034 ? A 148.909 101.355 117.702 1 1 C ALA 0.730 1 ATOM 67 C C . ALA 1034 1034 ? A 148.420 100.261 116.752 1 1 C ALA 0.730 1 ATOM 68 O O . ALA 1034 1034 ? A 148.503 100.406 115.535 1 1 C ALA 0.730 1 ATOM 69 C CB . ALA 1034 1034 ? A 150.244 100.935 118.364 1 1 C ALA 0.730 1 ATOM 70 N N . ALA 1035 1035 ? A 147.813 99.175 117.286 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 71 C CA . ALA 1035 1035 ? A 147.181 98.116 116.517 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 72 C C . ALA 1035 1035 ? A 146.059 98.637 115.613 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 73 O O . ALA 1035 1035 ? A 145.999 98.275 114.439 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 74 C CB . ALA 1035 1035 ? A 146.647 96.995 117.446 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 75 N N . ALA 1036 1036 ? A 145.191 99.544 116.127 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 76 C CA . ALA 1036 1036 ? A 144.139 100.227 115.387 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 77 C C . ALA 1036 1036 ? A 144.639 101.088 114.231 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 78 O O . ALA 1036 1036 ? A 144.108 101.033 113.126 1 1 C ALA 0.740 1 ATOM 79 C CB . ALA 1036 1036 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #