data_SMR-b050481cda4f22789e596e89514189eb_1 _entry.id SMR-b050481cda4f22789e596e89514189eb_1 _struct.entry_id SMR-b050481cda4f22789e596e89514189eb_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5VUA4/ ZN318_HUMAN, Zinc finger protein 318 Estimated model accuracy of this model is 0.047, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VUA4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 145203.880 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZN318_HUMAN Q5VUA4 1 ;MYRSSARSSVSSHRPKDDGGGGPRSGRSSGSSSGPARRSSPPPPPSGSSSRTPARRPRSPSGHRGRRASP SPPRGRRVSPSPPRARRGSPSPPRGRRLFPPGPAGFRGSSRGESRADYARDGRGDHPGDSGSRRRSPGLC SDSLEKSLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDNLEDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISQEE GPLSPFLGQLDEDYRTKETFLHRSDYSPHISCHDELLRGTERNREKLKGYSIRSEERSREAKRPRYDDTV KINSMGGDHPSFTSGTRNYRQRRRSPSPRFLDPEFRELDLARRKREEEEERSRSLSQELVGVDGGGTGCS IPGLSGVLTASEPGYSLHRPEEVSVMPKKSILKKRIEVDIMEPSMQLESFSSSTSSSQDHPLYSGHPSLP LSGAIAAFASEIENKGTMVETALKEPQGNLYQWGPLPGIPKDNSPLREKFGSFLCHKDNLDLKAEGPERH TDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADSTSTQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDLKAESVPKPLGSSES EVMRQKASSLPSSAPAVKLESLEETNPEYAKIHDLLKTIGLDIGVAEISQLAARTQERLHGKKPSLRSSA DRRSSVDRYFSADHCSSVDHRFSADRCSSVDHCFSADRRSSDPHRLESREAHHSNTHSPEVSHPHPPSPV DPYLLTKNSPPFLKSDHPVGHISGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPSAPIRLPHTAALSQFHMPRASQFA AARIPPNYQGPAIPPASFDAYRHYMAYAASRWPMYPTSQPSNHPVPEPHRIMPITKQATRSRPNLRVIPT VTPDKPKQKESLRGSIPAAQVPVQVSIPSLIRYNPEKISDEKNRASQKQKVIEEREKLKNDREARQKKMY YLRTELERLHKQQGEMLRKKRREKDGHKDPLLVEVSRLQDNIMKDIAELRQEAEEAEKKQSELDKVAQIL GINIFDKSQKSLSDSREPTEKPGKAEKSKSPEKVSSFSNSSSNKESKVNNEKFRTKSPKPAESPQSATKQ LDQPTAAYEYYDAGNHWCKDCNTICGTMFDFFTHMHNKKHTQGQFQKSSDFQKEGLQQTFLPPERQG ; 'Zinc finger protein 318' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1117 1 1117 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZN318_HUMAN Q5VUA4 Q5VUA4-2 1 1117 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-01-15 65866465A953CF07 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MYRSSARSSVSSHRPKDDGGGGPRSGRSSGSSSGPARRSSPPPPPSGSSSRTPARRPRSPSGHRGRRASP SPPRGRRVSPSPPRARRGSPSPPRGRRLFPPGPAGFRGSSRGESRADYARDGRGDHPGDSGSRRRSPGLC SDSLEKSLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDNLEDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISQEE GPLSPFLGQLDEDYRTKETFLHRSDYSPHISCHDELLRGTERNREKLKGYSIRSEERSREAKRPRYDDTV KINSMGGDHPSFTSGTRNYRQRRRSPSPRFLDPEFRELDLARRKREEEEERSRSLSQELVGVDGGGTGCS IPGLSGVLTASEPGYSLHRPEEVSVMPKKSILKKRIEVDIMEPSMQLESFSSSTSSSQDHPLYSGHPSLP LSGAIAAFASEIENKGTMVETALKEPQGNLYQWGPLPGIPKDNSPLREKFGSFLCHKDNLDLKAEGPERH TDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADSTSTQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDLKAESVPKPLGSSES EVMRQKASSLPSSAPAVKLESLEETNPEYAKIHDLLKTIGLDIGVAEISQLAARTQERLHGKKPSLRSSA 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TDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADSTSTQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDLKAESVPKPLGSSES EVMRQKASSLPSSAPAVKLESLEETNPEYAKIHDLLKTIGLDIGVAEISQLAARTQERLHGKKPSLRSSA DRRSSVDRYFSADHCSSVDHRFSADRCSSVDHCFSADRRSSDPHRLESREAHHSNTHSPEVSHPHPPSPV DPYLLTKNSPPFLKSDHPVGHISGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPSAPIRLPHTAALSQFHMPRASQFA AARIPPNYQGPAIPPASFDAYRHYMAYAASRWPMYPTSQPSNHPVPEPHRIMPITKQATRSRPNLRVIPT VTPDKPKQKESLRGSIPAAQVPVQVSIPSLIRYNPEKISDEKNRASQKQKVIEEREKLKNDREARQKKMY YLRTELERLHKQQGEMLRKKRREKDGHKDPLLVEVSRLQDNIMKDIAELRQEAEEAEKKQSELDKVAQIL GINIFDKSQKSLSDSREPTEKPGKAEKSKSPEKVSSFSNSSSNKESKVNNEKFRTKSPKPAESPQSATKQ LDQPTAAYEYYDAGNHWCKDCNTICGTMFDFFTHMHNKKHTQGQFQKSSDFQKEGLQQTFLPPERQG ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 TYR . 1 3 ARG . 1 4 SER . 1 5 SER . 1 6 ALA . 1 7 ARG . 1 8 SER . 1 9 SER . 1 10 VAL . 1 11 SER . 1 12 SER . 1 13 HIS . 1 14 ARG . 1 15 PRO . 1 16 LYS . 1 17 ASP . 1 18 ASP . 1 19 GLY . 1 20 GLY . 1 21 GLY . 1 22 GLY . 1 23 PRO . 1 24 ARG . 1 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. 1 115 ARG . 1 116 ALA . 1 117 ASP . 1 118 TYR . 1 119 ALA . 1 120 ARG . 1 121 ASP . 1 122 GLY . 1 123 ARG . 1 124 GLY . 1 125 ASP . 1 126 HIS . 1 127 PRO . 1 128 GLY . 1 129 ASP . 1 130 SER . 1 131 GLY . 1 132 SER . 1 133 ARG . 1 134 ARG . 1 135 ARG . 1 136 SER . 1 137 PRO . 1 138 GLY . 1 139 LEU . 1 140 CYS . 1 141 SER . 1 142 ASP . 1 143 SER . 1 144 LEU . 1 145 GLU . 1 146 LYS . 1 147 SER . 1 148 LEU . 1 149 ARG . 1 150 ILE . 1 151 THR . 1 152 VAL . 1 153 GLY . 1 154 ASN . 1 155 ASP . 1 156 HIS . 1 157 PHE . 1 158 CYS . 1 159 VAL . 1 160 SER . 1 161 THR . 1 162 PRO . 1 163 GLU . 1 164 ARG . 1 165 ARG . 1 166 ARG . 1 167 LEU . 1 168 SER . 1 169 ASP . 1 170 ARG . 1 171 LEU . 1 172 GLY . 1 173 SER . 1 174 PRO . 1 175 VAL . 1 176 ASP . 1 177 ASN . 1 178 LEU . 1 179 GLU . 1 180 ASP . 1 181 MET . 1 182 ASP . 1 183 ARG . 1 184 ASP . 1 185 ASP . 1 186 LEU . 1 187 THR . 1 188 ASP . 1 189 ASP . 1 190 SER . 1 191 VAL . 1 192 PHE . 1 193 THR . 1 194 ARG . 1 195 SER . 1 196 SER . 1 197 GLN . 1 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D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nup214 {PDB ID=7tdz, label_asym_id=D, auth_asym_id=s, SMTL ID=7tdz.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7tdz, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 3 1 s # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEDDTDLPPERETKDFQFRQLKKVRLFDYPADLPKQRSNLLVISNKYGLLFVGGFMGLKVFHTKDILVTV KPKENANKTVVGPQGIHVPMNSPIHHLALSSDNLTLSVCMTSAEQGSSVSFYDVRTLLNESKQNKMPFAS CKLLRDPSSSVTDLQWNPTLPSMVAVCLSDGSISVLQVTDTVSVFANLPATLGVTSVCWSPKGKQLAVGK QNGTVVQYLPSLQEKKVIPCPSFYDSDNPVKVLDVLWLSTYVFTVVYAAADGSLEASPQLVIVTLPKKED KRAERFLNFTETCYSICSERQHHFFLNYIEDWEILLAASAASVDVGVIARPPDQVGWEQWLLEDSSRAEM PMTENNDDTLPMGVALDYTCQLEVFISESQILPPVPVLLLLSTDGVLCPFHVVNLNQGVKPLTTSPEQLS LDGEREMKVVGGTAVSTPPAPLTSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAA TPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGAAMVSSNTAKVSAPP AMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPN ATVPVKSQPTVIPSQASVQPNRPFAVEAPQAPSSVSIASVQKTVRVNPPATKITPQPQRSVALENQAKVT KESDSILNGIREEIAHFQKELDDLKARTSRACFQVGSEEEKRQLRTESDGLHSFFLEIKETTESLRGEFS AMKIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLYKKPLDPKSETQMQEIRRLNQYVKNAVQDVNDVLDLEW DQYLEEKQKKKGIIIPERETLFNSLANHQEIINQQRPKLEQLVENLQKLRLYNQISQWNVPDSSTKSFDV ELENMQKTLSQTAIDTQTKPQAKLPAKISPVKQSQLRNFLSKRKTPPVRSLAPANLSRSAFLAPSFFEDL DDVSSTSSLSDMADNDNRNPPPKEIERQETPPPESTPVRVPKHAPVARTTSVQPGLGTASLPFQSGLHPA TSTPVAPSQSIRVIPQGADSTMLATKTVKHGAPNITAAQKAAVAAMRRQTASQIPAASLTESTLQTVPQV VNVKELKNNGPGPTIPTVIGPTVPQSAAQVIHQVLATVGSVSARQAAPAAPLKNPPASASSIAPQTWQGS APNKPAAQAIPKSDPSASQAPAPSVSQVNKPVSFSPAAGGFSFSNVTSAPVTSALGSSSAGCAATARDSN QASSYMFGGTGKSLGSEGSFSFASLKPASSSSSSSVVEPTMSKPSVVTAASTTATVTSTTAASSKPGEGL FQGFSGGETLGSFSGLRVGQADEASKVEVAKTPTAAQPVKLPSNPVLFSFAGAPQPAKVGEAPSTTSSTS ASLFGNVQLASAGSTASAFTQSGSKPAFTFGIPQSTSTTAGASSAIPASFQSLLVSAAPATTTPSAPINS GLDVKQPIKPLSEPADSSSSQQQTLTTQSAAEQVPTVTPAATTATALPPPVPTIPSTAEAKIEGAAAPAI PASVISSQTVPFTSTVLASQTPLASTPAGGPTSQVPVLVTTAPPVTTESAQTVSLTGQPVAGSSAFAQST VTAASTPVFGQALASGAAPSPFAQPTSSSVSTSANSSTGFGTSAFGATGGNGGFGQPSFGQAPLWKGPAT SQSTLPFSQPTFGTQPAFGQPAASTATSSAGSLFGCTSSASSFSFGQASNTSGTSTSGVLFGQSSAPVFG QSAAFPQAAPAFGSASVSTTTTASFGFGQPAGFASGTSGSLFNPSQSGSTSVFGQQPASSSGGLFGAGSG GASTVGLFSGLGAKPSQEAANKNPFGSPGSSGFGSAGASNSSNLFGNSGAKAFGFGGTSFGDKPSATFSA GGSVASQGFSFNSPTKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGSPAFGTAAAFSNTLGSTGGKVFGEGTSAAT TGGFGFGSNSSTAAFGSLATQNTPTFGSISQQSPGFGGQSSGFSGFGAGPGAAAGNTGGFGFGVSNPTSP GFGCWRS ; ;MEDDTDLPPERETKDFQFRQLKKVRLFDYPADLPKQRSNLLVISNKYGLLFVGGFMGLKVFHTKDILVTV KPKENANKTVVGPQGIHVPMNSPIHHLALSSDNLTLSVCMTSAEQGSSVSFYDVRTLLNESKQNKMPFAS CKLLRDPSSSVTDLQWNPTLPSMVAVCLSDGSISVLQVTDTVSVFANLPATLGVTSVCWSPKGKQLAVGK QNGTVVQYLPSLQEKKVIPCPSFYDSDNPVKVLDVLWLSTYVFTVVYAAADGSLEASPQLVIVTLPKKED KRAERFLNFTETCYSICSERQHHFFLNYIEDWEILLAASAASVDVGVIARPPDQVGWEQWLLEDSSRAEM PMTENNDDTLPMGVALDYTCQLEVFISESQILPPVPVLLLLSTDGVLCPFHVVNLNQGVKPLTTSPEQLS LDGEREMKVVGGTAVSTPPAPLTSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAA TPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGAAMVSSNTAKVSAPP AMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPN ATVPVKSQPTVIPSQASVQPNRPFAVEAPQAPSSVSIASVQKTVRVNPPATKITPQPQRSVALENQAKVT KESDSILNGIREEIAHFQKELDDLKARTSRACFQVGSEEEKRQLRTESDGLHSFFLEIKETTESLRGEFS AMKIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLYKKPLDPKSETQMQEIRRLNQYVKNAVQDVNDVLDLEW DQYLEEKQKKKGIIIPERETLFNSLANHQEIINQQRPKLEQLVENLQKLRLYNQISQWNVPDSSTKSFDV ELENMQKTLSQTAIDTQTKPQAKLPAKISPVKQSQLRNFLSKRKTPPVRSLAPANLSRSAFLAPSFFEDL DDVSSTSSLSDMADNDNRNPPPKEIERQETPPPESTPVRVPKHAPVARTTSVQPGLGTASLPFQSGLHPA TSTPVAPSQSIRVIPQGADSTMLATKTVKHGAPNITAAQKAAVAAMRRQTASQIPAASLTESTLQTVPQV VNVKELKNNGPGPTIPTVIGPTVPQSAAQVIHQVLATVGSVSARQAAPAAPLKNPPASASSIAPQTWQGS APNKPAAQAIPKSDPSASQAPAPSVSQVNKPVSFSPAAGGFSFSNVTSAPVTSALGSSSAGCAATARDSN QASSYMFGGTGKSLGSEGSFSFASLKPASSSSSSSVVEPTMSKPSVVTAASTTATVTSTTAASSKPGEGL FQGFSGGETLGSFSGLRVGQADEASKVEVAKTPTAAQPVKLPSNPVLFSFAGAPQPAKVGEAPSTTSSTS ASLFGNVQLASAGSTASAFTQSGSKPAFTFGIPQSTSTTAGASSAIPASFQSLLVSAAPATTTPSAPINS GLDVKQPIKPLSEPADSSSSQQQTLTTQSAAEQVPTVTPAATTATALPPPVPTIPSTAEAKIEGAAAPAI PASVISSQTVPFTSTVLASQTPLASTPAGGPTSQVPVLVTTAPPVTTESAQTVSLTGQPVAGSSAFAQST VTAASTPVFGQALASGAAPSPFAQPTSSSVSTSANSSTGFGTSAFGATGGNGGFGQPSFGQAPLWKGPAT SQSTLPFSQPTFGTQPAFGQPAASTATSSAGSLFGCTSSASSFSFGQASNTSGTSTSGVLFGQSSAPVFG QSAAFPQAAPAFGSASVSTTTTASFGFGQPAGFASGTSGSLFNPSQSGSTSVFGQQPASSSGGLFGAGSG GASTVGLFSGLGAKPSQEAANKNPFGSPGSSGFGSAGASNSSNLFGNSGAKAFGFGGTSFGDKPSATFSA GGSVASQGFSFNSPTKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGSPAFGTAAAFSNTLGSTGGKVFGEGTSAAT TGGFGFGSNSSTAAFGSLATQNTPTFGSISQQSPGFGGQSSGFSGFGAGPGAAAGNTGGFGFGVSNPTSP GFGCWRS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 705 857 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7tdz 2024-10-09 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1117 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1147 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.200 13.821 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MYRSSARSSVSSHRPKDDGGGGPRSGRSSGSSSGPARRSSPPPPPSGSSSRTPARRPRSPSGHRGRRASPSPPRGRRVSPSPPRARRGSPSPPRGRRLFPPGPAGFRGSSRGESRADYARDGRGDHPGDSGSRRRSPGLCSDSLEKSLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDNLEDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISQEEGPLSPFLGQLDEDYRTKETFLHRSDYSPHISCHDELLRGTERNREKLKGYSIRSEERSREAKRPRYDDTVKINSMGGDHPSFTSGTRNYRQRRRSPSPRFLDPEFRELDLARRKREEEEERSRSLSQELVGVDGGGTGCSIPGLSGVLTASEPGYSLHRPEEVSVMPKKSILKKRIEVDIMEPSMQLESFSSSTSSSQDHPLYSGHPSLPLSGAIAAFASEIENKGTMVETALKEPQGNLYQWGPLPGIPKDNSPLREKFGSFLCHKDNLDLKAEGPERHTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADSTSTQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDLKAESVPKPLGSSESEVMRQKASSLPSSAPAVKLESLEETNPEYAKIHDLLKTIGLDIGVAEISQLAARTQERLHGKKPSLRSSADRRSSVDRYFSADHCSSVDHRFSADRCSSVDHCFSADRRSSDPHRLESREAHHSNTHSPEVSHPHPPSPVDPYLLTKNSPPFLKSDHPVGHISGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPSAPIRLPHTAALSQFHMPRASQFAAARIPPNYQGPAIPPASFDAYRHYMAYAASRWPMYPTSQPSNHPVPEPHRIMPITKQATRSRPNLRVIPTVTPDKPKQKESLRGSIPAAQVPVQVSIPSLIRYNPEKISDEKNRASQKQKVIEEREKLKNDREARQKK------MYYLRTELERLHKQQGEMLR---KKRREKDGHKDPLLVE----------------VSRLQDNIMKDIAELRQEAEEA-----EKKQSELDKVAQILGINIFDKSQKSLSDSREPTEKPGKAEKSKSPEKVSSFSNSSSNKESKVNNEKFRTKSPKPAESPQSATKQLDQPTAAYEYYDAGNHWCKDCNTICGTMFDFFTHMHNKKHTQGQFQKSSDFQKEGLQQTFLPPERQG 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SILNGIREEIAHFQKELDDLKARTSRACFQVGSEEEKRQLRTESDGLHSFFLEIKET----TESLRGEFSAMKIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLYKKPLDPKSETQMQEIRRLNQYVKNAVQDVNDVLDLEWDQYLEEKQKKKGIIIPE--------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7tdz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 886 886 ? A 412.475 306.691 365.090 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 2 C CA . SER 886 886 ? A 411.288 305.775 365.361 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 3 C C . SER 886 886 ? A 410.099 306.498 365.970 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 4 O O . SER 886 886 ? A 409.032 306.500 365.386 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 5 C CB . SER 886 886 ? A 411.693 304.524 366.216 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 6 O OG . SER 886 886 ? A 410.654 303.549 366.304 1 1 D SER 0.570 1 ATOM 7 N N . GLN 887 887 ? A 410.253 307.210 367.118 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 8 C CA . GLN 887 887 ? A 409.162 307.954 367.730 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 9 C C . GLN 887 887 ? A 408.554 309.030 366.845 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 10 O O . GLN 887 887 ? A 407.345 309.113 366.717 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 11 C CB . GLN 887 887 ? A 409.680 308.596 369.031 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 12 C CG . GLN 887 887 ? A 410.010 307.536 370.110 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 13 C CD . GLN 887 887 ? A 410.627 308.208 371.343 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 14 O OE1 . GLN 887 887 ? A 411.280 309.228 371.227 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 15 N NE2 . GLN 887 887 ? A 410.439 307.588 372.536 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 16 N N . LYS 888 888 ? A 409.398 309.818 366.138 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 17 C CA . LYS 888 888 ? A 408.938 310.789 365.160 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 18 C C . LYS 888 888 ? A 408.102 310.182 364.037 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 19 O O . LYS 888 888 ? A 407.045 310.695 363.719 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 20 C CB . LYS 888 888 ? A 410.142 311.566 364.566 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 21 C CG . LYS 888 888 ? A 410.800 312.493 365.604 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 22 C CD . LYS 888 888 ? A 412.013 313.258 365.044 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 23 C CE . LYS 888 888 ? A 412.656 314.206 366.070 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 24 N NZ . LYS 888 888 ? A 413.847 314.874 365.492 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 25 N N . GLN 889 889 ? A 408.534 309.025 363.476 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 26 C CA . GLN 889 889 ? A 407.794 308.297 362.458 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 27 C C . GLN 889 889 ? A 406.436 307.799 362.956 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 28 O O . GLN 889 889 ? A 405.424 307.995 362.299 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 29 C CB . GLN 889 889 ? A 408.644 307.103 361.933 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 30 C CG . GLN 889 889 ? A 407.996 306.289 360.780 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 31 C CD . GLN 889 889 ? A 407.788 307.153 359.533 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 32 O OE1 . GLN 889 889 ? A 408.497 308.130 359.310 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 33 N NE2 . GLN 889 889 ? A 406.793 306.765 358.700 1 1 D GLN 0.750 1 ATOM 34 N N . LYS 890 890 ? A 406.373 307.222 364.183 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 35 C CA . LYS 890 890 ? A 405.129 306.800 364.820 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 36 C C . LYS 890 890 ? A 404.141 307.938 365.048 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 37 O O . LYS 890 890 ? A 402.944 307.809 364.807 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 38 C CB . LYS 890 890 ? A 405.415 306.146 366.198 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 39 C CG . LYS 890 890 ? A 406.094 304.776 366.082 1 1 D LYS 0.750 1 ATOM 40 C CD . LYS 890 890 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #