data_SMR-c0966c6beb76a75d62db84a2f9b3d18c_7 _entry.id SMR-c0966c6beb76a75d62db84a2f9b3d18c_7 _struct.entry_id SMR-c0966c6beb76a75d62db84a2f9b3d18c_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q14203/ DCTN1_HUMAN, Dynactin subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14203' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 147406.864 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DCTN1_HUMAN Q14203 1 ;MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSP GAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQR RLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKA EIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQE ELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELE LREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFD FKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRK QAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSA HERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEV GRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHL TWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLA TAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLS LLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRT IEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQM KASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQV AQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQR HRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; 'Dynactin subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1139 1 1139 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DCTN1_HUMAN Q14203 Q14203-2 1 1139 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-10-18 1997342C3ADA9F82 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSP GAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQR RLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKA EIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQE ELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELE LREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFD FKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRK QAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSA HERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEV 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FKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRK QAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSA HERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEV GRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHL TWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLA TAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLS LLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRT IEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQM KASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQV AQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQR HRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 MET . 1 3 ARG . 1 4 GLN . 1 5 ALA . 1 6 PRO . 1 7 THR . 1 8 ALA . 1 9 ARG . 1 10 LYS . 1 11 THR . 1 12 THR . 1 13 THR . 1 14 ARG . 1 15 ARG . 1 16 PRO . 1 17 LYS . 1 18 PRO . 1 19 THR . 1 20 ARG . 1 21 PRO . 1 22 ALA . 1 23 SER . 1 24 THR . 1 25 GLY . 1 26 VAL . 1 27 ALA . 1 28 GLY . 1 29 ALA . 1 30 SER . 1 31 SER . 1 32 SER . 1 33 LEU . 1 34 GLY . 1 35 PRO . 1 36 SER . 1 37 GLY . 1 38 SER . 1 39 ALA . 1 40 SER . 1 41 ALA . 1 42 GLY . 1 43 GLU . 1 44 LEU . 1 45 SER . 1 46 SER . 1 47 SER . 1 48 GLU . 1 49 PRO . 1 50 SER . 1 51 THR . 1 52 PRO . 1 53 ALA . 1 54 GLN . 1 55 THR . 1 56 PRO . 1 57 LEU . 1 58 ALA . 1 59 ALA . 1 60 PRO . 1 61 ILE . 1 62 ILE . 1 63 PRO . 1 64 THR . 1 65 PRO . 1 66 VAL . 1 67 LEU . 1 68 THR . 1 69 SER . 1 70 PRO . 1 71 GLY . 1 72 ALA . 1 73 VAL . 1 74 PRO . 1 75 PRO . 1 76 LEU . 1 77 PRO . 1 78 SER . 1 79 PRO . 1 80 SER . 1 81 LYS . 1 82 GLU . 1 83 GLU . 1 84 GLU . 1 85 GLY . 1 86 LEU . 1 87 ARG . 1 88 ALA . 1 89 GLN . 1 90 VAL . 1 91 ARG . 1 92 ASP . 1 93 LEU . 1 94 GLU . 1 95 GLU . 1 96 LYS . 1 97 LEU . 1 98 GLU . 1 99 THR . 1 100 LEU . 1 101 ARG . 1 102 LEU . 1 103 LYS . 1 104 ARG . 1 105 ALA . 1 106 GLU . 1 107 ASP . 1 108 LYS . 1 109 ALA . 1 110 LYS . 1 111 LEU . 1 112 LYS . 1 113 GLU . 1 114 LEU . 1 115 GLU . 1 116 LYS . 1 117 HIS . 1 118 LYS . 1 119 ILE . 1 120 GLN . 1 121 LEU . 1 122 GLU . 1 123 GLN . 1 124 VAL . 1 125 GLN . 1 126 GLU . 1 127 TRP . 1 128 LYS . 1 129 SER . 1 130 LYS . 1 131 MET . 1 132 GLN . 1 133 GLU . 1 134 GLN . 1 135 GLN . 1 136 ALA . 1 137 ASP . 1 138 LEU . 1 139 GLN . 1 140 ARG . 1 141 ARG . 1 142 LEU . 1 143 LYS . 1 144 GLU . 1 145 ALA . 1 146 ARG . 1 147 LYS . 1 148 GLU . 1 149 ALA . 1 150 LYS . 1 151 GLU . 1 152 ALA . 1 153 LEU . 1 154 GLU . 1 155 ALA . 1 156 LYS . 1 157 GLU . 1 158 ARG . 1 159 TYR . 1 160 MET . 1 161 GLU . 1 162 GLU . 1 163 MET . 1 164 ALA . 1 165 ASP . 1 166 THR . 1 167 ALA . 1 168 ASP . 1 169 ALA . 1 170 ILE . 1 171 GLU . 1 172 MET . 1 173 ALA . 1 174 THR . 1 175 LEU . 1 176 ASP . 1 177 LYS . 1 178 GLU . 1 179 MET . 1 180 ALA . 1 181 GLU . 1 182 GLU . 1 183 ARG . 1 184 ALA . 1 185 GLU . 1 186 SER . 1 187 LEU . 1 188 GLN . 1 189 GLN . 1 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A 1 1096 LYS 1096 ? ? ? A . A 1 1097 GLU 1097 ? ? ? A . A 1 1098 GLU 1098 ? ? ? A . A 1 1099 GLN 1099 ? ? ? A . A 1 1100 GLN 1100 ? ? ? A . A 1 1101 ASP 1101 ? ? ? A . A 1 1102 ASP 1102 ? ? ? A . A 1 1103 THR 1103 ? ? ? A . A 1 1104 VAL 1104 ? ? ? A . A 1 1105 TYR 1105 ? ? ? A . A 1 1106 MET 1106 ? ? ? A . A 1 1107 GLY 1107 ? ? ? A . A 1 1108 LYS 1108 ? ? ? A . A 1 1109 VAL 1109 ? ? ? A . A 1 1110 THR 1110 ? ? ? A . A 1 1111 PHE 1111 ? ? ? A . A 1 1112 SER 1112 ? ? ? A . A 1 1113 CYS 1113 ? ? ? A . A 1 1114 ALA 1114 ? ? ? A . A 1 1115 ALA 1115 ? ? ? A . A 1 1116 GLY 1116 ? ? ? A . A 1 1117 PHE 1117 ? ? ? A . A 1 1118 GLY 1118 ? ? ? A . A 1 1119 GLN 1119 ? ? ? A . A 1 1120 ARG 1120 ? ? ? A . A 1 1121 HIS 1121 ? ? ? A . A 1 1122 ARG 1122 ? ? ? A . A 1 1123 LEU 1123 ? ? ? A . A 1 1124 VAL 1124 ? ? ? A . A 1 1125 LEU 1125 ? ? ? A . A 1 1126 THR 1126 ? ? ? A . A 1 1127 GLN 1127 ? ? ? A . A 1 1128 GLU 1128 ? ? ? A . A 1 1129 GLN 1129 ? ? ? A . A 1 1130 LEU 1130 ? ? ? A . A 1 1131 HIS 1131 ? ? ? A . A 1 1132 GLN 1132 ? ? ? A . A 1 1133 LEU 1133 ? ? ? A . A 1 1134 HIS 1134 ? ? ? A . A 1 1135 SER 1135 ? ? ? A . A 1 1136 ARG 1136 ? ? ? A . A 1 1137 LEU 1137 ? ? ? A . A 1 1138 ILE 1138 ? ? ? A . A 1 1139 SER 1139 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tektin-5 {PDB ID=8to0, label_asym_id=LO, auth_asym_id=GY, SMTL ID=8to0.402.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8to0, label_asym_id=LO' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A LO 26 1 GY # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 215 251 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8to0 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1139 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1139 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 91.000 16.216 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------LIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8to0.402' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 86 86 ? A 245.387 407.077 110.359 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 2 C CA . LEU 86 86 ? A 246.521 407.716 111.118 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 3 C C . LEU 86 86 ? A 246.125 408.849 112.048 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 4 O O . LEU 86 86 ? A 246.269 408.712 113.248 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 5 C CB . LEU 86 86 ? A 247.643 408.150 110.150 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 6 C CG . LEU 86 86 ? A 248.265 407.002 109.329 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 86 86 ? A 249.203 407.573 108.258 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 86 86 ? A 249.032 406.011 110.217 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 9 N N . ARG 87 87 ? A 245.580 409.989 111.571 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 10 C CA . ARG 87 87 ? A 245.224 411.105 112.447 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 11 C C . ARG 87 87 ? A 244.289 410.806 113.627 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 12 O O . ARG 87 87 ? A 244.418 411.409 114.682 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 13 C CB . ARG 87 87 ? A 244.563 412.218 111.620 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 14 C CG . ARG 87 87 ? A 245.461 412.859 110.549 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 15 C CD . ARG 87 87 ? A 244.659 413.866 109.726 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 16 N NE . ARG 87 87 ? A 245.583 414.449 108.712 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 17 C CZ . ARG 87 87 ? A 245.172 415.261 107.728 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 18 N NH1 . ARG 87 87 ? A 243.887 415.571 107.579 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 19 N NH2 . ARG 87 87 ? A 246.054 415.784 106.882 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 20 N N . ALA 88 88 ? A 243.332 409.863 113.464 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 21 C CA . ALA 88 88 ? A 242.553 409.312 114.561 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 22 C C . ALA 88 88 ? A 243.420 408.662 115.659 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 23 O O . ALA 88 88 ? A 243.358 409.071 116.805 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 24 C CB . ALA 88 88 ? A 241.514 408.332 113.958 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 25 N N . GLN 89 89 ? A 244.356 407.762 115.272 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 26 C CA . GLN 89 89 ? A 245.326 407.088 116.131 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 27 C C . GLN 89 89 ? A 246.287 408.028 116.862 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 28 O O . GLN 89 89 ? A 246.668 407.782 118.004 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 29 C CB . GLN 89 89 ? A 246.179 406.097 115.287 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 30 C CG . GLN 89 89 ? A 245.391 404.950 114.604 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 31 C CD . GLN 89 89 ? A 246.290 404.162 113.639 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 32 O OE1 . GLN 89 89 ? A 247.055 404.746 112.882 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 33 N NE2 . GLN 89 89 ? A 246.107 402.816 113.583 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 34 N N . VAL 90 90 ? A 246.718 409.130 116.209 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 35 C CA . VAL 90 90 ? A 247.482 410.215 116.834 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 36 C C . VAL 90 90 ? A 246.706 410.925 117.944 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 37 O O . VAL 90 90 ? A 247.228 411.124 119.043 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 38 C CB . VAL 90 90 ? A 247.940 411.258 115.804 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 39 C CG1 . VAL 90 90 ? A 248.646 412.462 116.469 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 40 C CG2 . VAL 90 90 ? A 248.923 410.617 114.807 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 41 N N . ARG 91 91 ? A 245.426 411.287 117.698 1 1 A ARG 0.790 1 ATOM 42 C CA . ARG 91 91 ? A 244.540 411.892 118.689 1 1 A ARG 0.790 1 ATOM 43 C C . ARG 91 91 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.789 2 1 3 0.014 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 86 LEU 1 0.740 2 1 A 87 ARG 1 0.600 3 1 A 88 ALA 1 0.790 4 1 A 89 GLN 1 0.750 5 1 A 90 VAL 1 0.790 6 1 A 91 ARG 1 0.790 7 1 A 92 ASP 1 0.810 8 1 A 93 LEU 1 0.810 9 1 A 94 GLU 1 0.810 10 1 A 95 GLU 1 0.800 11 1 A 96 LYS 1 0.810 12 1 A 97 LEU 1 0.820 13 1 A 98 GLU 1 0.820 14 1 A 99 THR 1 0.830 15 1 A 100 LEU 1 0.830 16 1 A 101 ARG 1 0.800 17 1 A 102 LEU 1 0.850 18 1 A 103 LYS 1 0.820 19 1 A 104 ARG 1 0.790 20 1 A 105 ALA 1 0.850 21 1 A 106 GLU 1 0.800 22 1 A 107 ASP 1 0.820 23 1 A 108 LYS 1 0.800 24 1 A 109 ALA 1 0.840 25 1 A 110 LYS 1 0.800 26 1 A 111 LEU 1 0.820 27 1 A 112 LYS 1 0.800 28 1 A 113 GLU 1 0.790 29 1 A 114 LEU 1 0.830 30 1 A 115 GLU 1 0.800 31 1 A 116 LYS 1 0.790 32 1 A 117 HIS 1 0.770 33 1 A 118 LYS 1 0.780 34 1 A 119 ILE 1 0.780 35 1 A 120 GLN 1 0.760 36 1 A 121 LEU 1 0.640 37 1 A 122 GLU 1 0.660 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #