data_SMR-375205e098174bec97bcee23df06a453_6
_entry.id SMR-375205e098174bec97bcee23df06a453_6
_struct.entry_id SMR-375205e098174bec97bcee23df06a453_6
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q96EP0/ RNF31_HUMAN, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31

Estimated model accuracy of this model is 0.025, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96EP0'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 139092.578 1 .
2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP RNF31_HUMAN Q96EP0 1
;MPGEEEERAFLVAREELASALRRDSGQAFSLEQLRPLLASSLPLAARYLQLDAARLVRCNAHGEPRNYLN
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ARLLQKLTEEVPLGQSIPRRRK
;
'E3 ubiquitin-protein ligase RNF31'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1072 1 1072
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . RNF31_HUMAN Q96EP0 . 1 1072 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-12-01
CFAD183A14F764BA
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no B
;MPGEEEERAFLVAREELASALRRDSGQAFSLEQLRPLLASSLPLAARYLQLDAARLVRCNAHGEPRNYLN
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ARLLQKLTEEVPLGQSIPRRRK
;

;MPGEEEERAFLVAREELASALRRDSGQAFSLEQLRPLLASSLPLAARYLQLDAARLVRCNAHGEPRNYLN
TLSTALNILEKYGRNLLSPQRPRYWRGVKFNNPVFRSTVDAVQGGRDVLRLYGYTEEQPDGLSFPEGQEE
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;

#
#
loop_
_pdbx_entity_nonpoly.entity_id
_pdbx_entity_nonpoly.name
_pdbx_entity_nonpoly.comp_id
_pdbx_entity_nonpoly.ma_model_mode
2 'ZINC ION' ZN implicit
#
#
loop_
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_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 PRO .
1 3 GLY .
1 4 GLU .
1 5 GLU .
1 6 GLU .
1 7 GLU .
1 8 ARG .
1 9 ALA .
1 10 PHE .
1 11 LEU .
1 12 VAL .
1 13 ALA .
1 14 ARG .
1 15 GLU .
1 16 GLU .
1 17 LEU .
1 18 ALA .
1 19 SER .
1 20 ALA .
1 21 LEU .
1 22 ARG .
1 23 ARG .
1 24 ASP .
1 25 SER .
1 26 GLY .
1 27 GLN .
1 28 ALA .
1 29 PHE .
1 30 SER .
1 31 LEU .
1 32 GLU .
1 33 GLN .
1 34 LEU .
1 35 ARG .
1 36 PRO .
1 37 LEU .
1 38 LEU .
1 39 ALA .
1 40 SER .
1 41 SER .
1 42 LEU .
1 43 PRO .
1 44 LEU .
1 45 ALA .
1 46 ALA .
1 47 ARG .
1 48 TYR .
1 49 LEU .
1 50 GLN .
1 51 LEU .
1 52 ASP .
1 53 ALA .
1 54 ALA .
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1 56 LEU .
1 57 VAL .
1 58 ARG .
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1 60 ASN .
1 61 ALA .
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1 70 ASN .
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1 73 SER .
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1 81 LYS .
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1 83 GLY .
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1 85 ASN .
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1 87 LEU .
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1 93 ARG .
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1 96 ARG .
1 97 GLY .
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1 99 LYS .
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1 102 ASN .
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1 109 VAL .
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1 112 VAL .
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1 115 GLY .
1 116 ARG .
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1 118 VAL .
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1 124 TYR .
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1 126 GLU .
1 127 GLU .
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1 131 GLY .
1 132 LEU .
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1 134 PHE .
1 135 PRO .
1 136 GLU .
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1 139 GLU .
1 140 GLU .
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1 142 ASP .
1 143 GLU .
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1 147 ALA .
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1 149 VAL .
1 150 THR .
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1 153 VAL .
1 154 LEU .
1 155 LEU .
1 156 LEU .
1 157 ARG .
1 158 THR .
1 159 GLU .
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1 161 SER .
1 162 LEU .
1 163 LEU .
1 164 LEU .
1 165 GLN .
1 166 ASN .
1 167 THR .
1 168 HIS .
1 169 PRO .
1 170 ARG .
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1 172 GLN .
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1 175 GLU .
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1 178 LEU .
1 179 GLU .
1 180 ASP .
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1 182 VAL .
1 183 GLU .
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1 185 ASP .
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1 1025 GLU .
1 1026 LEU .
1 1027 GLU .
1 1028 THR .
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1 1030 THR .
1 1031 GLU .
1 1032 ARG .
1 1033 TYR .
1 1034 LEU .
1 1035 HIS .
1 1036 VAL .
1 1037 ARG .
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1 1040 PRO .
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1 1047 PRO .
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1 1051 ALA .
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1 1065 GLN .
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#
#
loop_
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A 1 .
B 2 .
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A 1 351 ARG 351 ? ? ? B .
A 1 352 GLY 352 352 GLY GLY B .
A 1 353 ARG 353 353 ARG ARG B .
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A 1 356 CYS 356 356 CYS CYS B .
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A 1 361 PHE 361 361 PHE PHE B .
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A 1 365 ALA 365 365 ALA ALA B .
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A 1 373 CYS 373 373 CYS CYS B .
A 1 374 GLU 374 374 GLU GLU B .
A 1 375 ARG 375 375 ARG ARG B .
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A 1 378 LEU 378 378 LEU LEU B .
A 1 379 ALA 379 ? ? ? B .
A 1 380 GLN 380 ? ? ? B .
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A 1 802 CYS 802 ? ? ? B .
A 1 803 SER 803 ? ? ? B .
A 1 804 PHE 804 ? ? ? B .
A 1 805 GLY 805 ? ? ? B .
A 1 806 PHE 806 ? ? ? B .
A 1 807 ILE 807 ? ? ? B .
A 1 808 TYR 808 ? ? ? B .
A 1 809 GLU 809 ? ? ? B .
A 1 810 ARG 810 ? ? ? B .
A 1 811 GLU 811 ? ? ? B .
A 1 812 GLN 812 ? ? ? B .
A 1 813 LEU 813 ? ? ? B .
A 1 814 GLU 814 ? ? ? B .
A 1 815 ALA 815 ? ? ? B .
A 1 816 THR 816 ? ? ? B .
A 1 817 CYS 817 ? ? ? B .
A 1 818 PRO 818 ? ? ? B .
A 1 819 GLN 819 ? ? ? B .
A 1 820 CYS 820 ? ? ? B .
A 1 821 HIS 821 ? ? ? B .
A 1 822 GLN 822 ? ? ? B .
A 1 823 THR 823 ? ? ? B .
A 1 824 PHE 824 ? ? ? B .
A 1 825 CYS 825 ? ? ? B .
A 1 826 VAL 826 ? ? ? B .
A 1 827 ARG 827 ? ? ? B .
A 1 828 CYS 828 ? ? ? B .
A 1 829 LYS 829 ? ? ? B .
A 1 830 ARG 830 ? ? ? B .
A 1 831 GLN 831 ? ? ? B .
A 1 832 TRP 832 ? ? ? B .
A 1 833 GLU 833 ? ? ? B .
A 1 834 GLU 834 ? ? ? B .
A 1 835 GLN 835 ? ? ? B .
A 1 836 HIS 836 ? ? ? B .
A 1 837 ARG 837 ? ? ? B .
A 1 838 GLY 838 ? ? ? B .
A 1 839 ARG 839 ? ? ? B .
A 1 840 SER 840 ? ? ? B .
A 1 841 CYS 841 ? ? ? B .
A 1 842 GLU 842 ? ? ? B .
A 1 843 ASP 843 ? ? ? B .
A 1 844 PHE 844 ? ? ? B .
A 1 845 GLN 845 ? ? ? B .
A 1 846 ASN 846 ? ? ? B .
A 1 847 TRP 847 ? ? ? B .
A 1 848 LYS 848 ? ? ? B .
A 1 849 ARG 849 ? ? ? B .
A 1 850 MET 850 ? ? ? B .
A 1 851 ASN 851 ? ? ? B .
A 1 852 ASP 852 ? ? ? B .
A 1 853 PRO 853 ? ? ? B .
A 1 854 GLU 854 ? ? ? B .
A 1 855 TYR 855 ? ? ? B .
A 1 856 GLN 856 ? ? ? B .
A 1 857 ALA 857 ? ? ? B .
A 1 858 GLN 858 ? ? ? B .
A 1 859 GLY 859 ? ? ? B .
A 1 860 LEU 860 ? ? ? B .
A 1 861 ALA 861 ? ? ? B .
A 1 862 MET 862 ? ? ? B .
A 1 863 TYR 863 ? ? ? B .
A 1 864 LEU 864 ? ? ? B .
A 1 865 GLN 865 ? ? ? B .
A 1 866 GLU 866 ? ? ? B .
A 1 867 ASN 867 ? ? ? B .
A 1 868 GLY 868 ? ? ? B .
A 1 869 ILE 869 ? ? ? B .
A 1 870 ASP 870 ? ? ? B .
A 1 871 CYS 871 ? ? ? B .
A 1 872 PRO 872 ? ? ? B .
A 1 873 LYS 873 ? ? ? B .
A 1 874 CYS 874 ? ? ? B .
A 1 875 LYS 875 ? ? ? B .
A 1 876 PHE 876 ? ? ? B .
A 1 877 SER 877 ? ? ? B .
A 1 878 TYR 878 ? ? ? B .
A 1 879 ALA 879 ? ? ? B .
A 1 880 LEU 880 ? ? ? B .
A 1 881 ALA 881 ? ? ? B .
A 1 882 ARG 882 ? ? ? B .
A 1 883 GLY 883 ? ? ? B .
A 1 884 GLY 884 ? ? ? B .
A 1 885 CYS 885 ? ? ? B .
A 1 886 MET 886 ? ? ? B .
A 1 887 HIS 887 ? ? ? B .
A 1 888 PHE 888 ? ? ? B .
A 1 889 HIS 889 ? ? ? B .
A 1 890 CYS 890 ? ? ? B .
A 1 891 THR 891 ? ? ? B .
A 1 892 GLN 892 ? ? ? B .
A 1 893 CYS 893 ? ? ? B .
A 1 894 ARG 894 ? ? ? B .
A 1 895 HIS 895 ? ? ? B .
A 1 896 GLN 896 ? ? ? B .
A 1 897 PHE 897 ? ? ? B .
A 1 898 CYS 898 ? ? ? B .
A 1 899 SER 899 ? ? ? B .
A 1 900 GLY 900 ? ? ? B .
A 1 901 CYS 901 ? ? ? B .
A 1 902 TYR 902 ? ? ? B .
A 1 903 ASN 903 ? ? ? B .
A 1 904 ALA 904 ? ? ? B .
A 1 905 PHE 905 ? ? ? B .
A 1 906 TYR 906 ? ? ? B .
A 1 907 ALA 907 ? ? ? B .
A 1 908 LYS 908 ? ? ? B .
A 1 909 ASN 909 ? ? ? B .
A 1 910 LYS 910 ? ? ? B .
A 1 911 CYS 911 ? ? ? B .
A 1 912 PRO 912 ? ? ? B .
A 1 913 GLU 913 ? ? ? B .
A 1 914 PRO 914 ? ? ? B .
A 1 915 ASN 915 ? ? ? B .
A 1 916 CYS 916 ? ? ? B .
A 1 917 ARG 917 ? ? ? B .
A 1 918 VAL 918 ? ? ? B .
A 1 919 LYS 919 ? ? ? B .
A 1 920 LYS 920 ? ? ? B .
A 1 921 SER 921 ? ? ? B .
A 1 922 LEU 922 ? ? ? B .
A 1 923 HIS 923 ? ? ? B .
A 1 924 GLY 924 ? ? ? B .
A 1 925 HIS 925 ? ? ? B .
A 1 926 HIS 926 ? ? ? B .
A 1 927 PRO 927 ? ? ? B .
A 1 928 ARG 928 ? ? ? B .
A 1 929 ASP 929 ? ? ? B .
A 1 930 CYS 930 ? ? ? B .
A 1 931 LEU 931 ? ? ? B .
A 1 932 PHE 932 ? ? ? B .
A 1 933 TYR 933 ? ? ? B .
A 1 934 LEU 934 ? ? ? B .
A 1 935 ARG 935 ? ? ? B .
A 1 936 ASP 936 ? ? ? B .
A 1 937 TRP 937 ? ? ? B .
A 1 938 THR 938 ? ? ? B .
A 1 939 ALA 939 ? ? ? B .
A 1 940 LEU 940 ? ? ? B .
A 1 941 ARG 941 ? ? ? B .
A 1 942 LEU 942 ? ? ? B .
A 1 943 GLN 943 ? ? ? B .
A 1 944 LYS 944 ? ? ? B .
A 1 945 LEU 945 ? ? ? B .
A 1 946 LEU 946 ? ? ? B .
A 1 947 GLN 947 ? ? ? B .
A 1 948 ASP 948 ? ? ? B .
A 1 949 ASN 949 ? ? ? B .
A 1 950 ASN 950 ? ? ? B .
A 1 951 VAL 951 ? ? ? B .
A 1 952 MET 952 ? ? ? B .
A 1 953 PHE 953 ? ? ? B .
A 1 954 ASN 954 ? ? ? B .
A 1 955 THR 955 ? ? ? B .
A 1 956 GLU 956 ? ? ? B .
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A 1 958 PRO 958 ? ? ? B .
A 1 959 ALA 959 ? ? ? B .
A 1 960 GLY 960 ? ? ? B .
A 1 961 ALA 961 ? ? ? B .
A 1 962 ARG 962 ? ? ? B .
A 1 963 ALA 963 ? ? ? B .
A 1 964 VAL 964 ? ? ? B .
A 1 965 PRO 965 ? ? ? B .
A 1 966 GLY 966 ? ? ? B .
A 1 967 GLY 967 ? ? ? B .
A 1 968 GLY 968 ? ? ? B .
A 1 969 CYS 969 ? ? ? B .
A 1 970 ARG 970 ? ? ? B .
A 1 971 VAL 971 ? ? ? B .
A 1 972 ILE 972 ? ? ? B .
A 1 973 GLU 973 ? ? ? B .
A 1 974 GLN 974 ? ? ? B .
A 1 975 LYS 975 ? ? ? B .
A 1 976 GLU 976 ? ? ? B .
A 1 977 VAL 977 ? ? ? B .
A 1 978 PRO 978 ? ? ? B .
A 1 979 ASN 979 ? ? ? B .
A 1 980 GLY 980 ? ? ? B .
A 1 981 LEU 981 ? ? ? B .
A 1 982 ARG 982 ? ? ? B .
A 1 983 ASP 983 ? ? ? B .
A 1 984 GLU 984 ? ? ? B .
A 1 985 ALA 985 ? ? ? B .
A 1 986 CYS 986 ? ? ? B .
A 1 987 GLY 987 ? ? ? B .
A 1 988 LYS 988 ? ? ? B .
A 1 989 GLU 989 ? ? ? B .
A 1 990 THR 990 ? ? ? B .
A 1 991 PRO 991 ? ? ? B .
A 1 992 ALA 992 ? ? ? B .
A 1 993 GLY 993 ? ? ? B .
A 1 994 TYR 994 ? ? ? B .
A 1 995 ALA 995 ? ? ? B .
A 1 996 GLY 996 ? ? ? B .
A 1 997 LEU 997 ? ? ? B .
A 1 998 CYS 998 ? ? ? B .
A 1 999 GLN 999 ? ? ? B .
A 1 1000 ALA 1000 ? ? ? B .
A 1 1001 HIS 1001 ? ? ? B .
A 1 1002 TYR 1002 ? ? ? B .
A 1 1003 LYS 1003 ? ? ? B .
A 1 1004 GLU 1004 ? ? ? B .
A 1 1005 TYR 1005 ? ? ? B .
A 1 1006 LEU 1006 ? ? ? B .
A 1 1007 VAL 1007 ? ? ? B .
A 1 1008 SER 1008 ? ? ? B .
A 1 1009 LEU 1009 ? ? ? B .
A 1 1010 ILE 1010 ? ? ? B .
A 1 1011 ASN 1011 ? ? ? B .
A 1 1012 ALA 1012 ? ? ? B .
A 1 1013 HIS 1013 ? ? ? B .
A 1 1014 SER 1014 ? ? ? B .
A 1 1015 LEU 1015 ? ? ? B .
A 1 1016 ASP 1016 ? ? ? B .
A 1 1017 PRO 1017 ? ? ? B .
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A 1 1022 GLU 1022 ? ? ? B .
A 1 1023 VAL 1023 ? ? ? B .
A 1 1024 GLU 1024 ? ? ? B .
A 1 1025 GLU 1025 ? ? ? B .
A 1 1026 LEU 1026 ? ? ? B .
A 1 1027 GLU 1027 ? ? ? B .
A 1 1028 THR 1028 ? ? ? B .
A 1 1029 ALA 1029 ? ? ? B .
A 1 1030 THR 1030 ? ? ? B .
A 1 1031 GLU 1031 ? ? ? B .
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A 1 1033 TYR 1033 ? ? ? B .
A 1 1034 LEU 1034 ? ? ? B .
A 1 1035 HIS 1035 ? ? ? B .
A 1 1036 VAL 1036 ? ? ? B .
A 1 1037 ARG 1037 ? ? ? B .
A 1 1038 PRO 1038 ? ? ? B .
A 1 1039 GLN 1039 ? ? ? B .
A 1 1040 PRO 1040 ? ? ? B .
A 1 1041 LEU 1041 ? ? ? B .
A 1 1042 ALA 1042 ? ? ? B .
A 1 1043 GLY 1043 ? ? ? B .
A 1 1044 GLU 1044 ? ? ? B .
A 1 1045 ASP 1045 ? ? ? B .
A 1 1046 PRO 1046 ? ? ? B .
A 1 1047 PRO 1047 ? ? ? B .
A 1 1048 ALA 1048 ? ? ? B .
A 1 1049 TYR 1049 ? ? ? B .
A 1 1050 GLN 1050 ? ? ? B .
A 1 1051 ALA 1051 ? ? ? B .
A 1 1052 ARG 1052 ? ? ? B .
A 1 1053 LEU 1053 ? ? ? B .
A 1 1054 LEU 1054 ? ? ? B .
A 1 1055 GLN 1055 ? ? ? B .
A 1 1056 LYS 1056 ? ? ? B .
A 1 1057 LEU 1057 ? ? ? B .
A 1 1058 THR 1058 ? ? ? B .
A 1 1059 GLU 1059 ? ? ? B .
A 1 1060 GLU 1060 ? ? ? B .
A 1 1061 VAL 1061 ? ? ? B .
A 1 1062 PRO 1062 ? ? ? B .
A 1 1063 LEU 1063 ? ? ? B .
A 1 1064 GLY 1064 ? ? ? B .
A 1 1065 GLN 1065 ? ? ? B .
A 1 1066 SER 1066 ? ? ? B .
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A 1 1068 PRO 1068 ? ? ? B .
A 1 1069 ARG 1069 ? ? ? B .
A 1 1070 ARG 1070 ? ? ? B .
A 1 1071 ARG 1071 ? ? ? B .
A 1 1072 LYS 1072 ? ? ? B .
#
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 ZN 1 5 5 ZN '_' .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Nuclear pore complex protein Nup153 {PDB ID=3gj7, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3gj7.1.B}'
'template structure' .
2 'ZINC ION {PDB ID=3gj7, label_asym_id=I, auth_asym_id=B, SMTL ID=3gj7.1._.5}'
'template structure' .
3 . target .
4 'ZINC ION' target .
5 'Target-template alignment by HHblits to 3gj7, label_asym_id=B'
'target-template alignment' .
6 'model 6' 'model coordinates' .
7 SMTL 'reference database' .
8 PDB 'reference database' .
9 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 3
2 1 7
3 1 8
4 2 9
5 3 3
6 3 4
7 3 1
8 3 2
9 3 5
10 4 1
11 4 2
12 4 5
13 4 4
14 5 6
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27
8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 3 'reference database'
2 4 .
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
B 2 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B
2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B I 5 1 B
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;GPLGSAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLPLKETAKQTGIGTPSKSDKPASTSGTGFGDKFKPAI
GTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKPG
;

;GPLGSAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLPLKETAKQTGIGTPSKSDKPASTSGTGFGDKFKPAI
GTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKPG
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 6 97
#
#
loop_
_ma_template_non_poly.template_id
_ma_template_non_poly.comp_id
_ma_template_non_poly.details
2 ZN 'ZINC ION'
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 3gj7 2023-09-06
2 PDB . 3gj7 2023-09-06
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1072
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 5 1 1085 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.8e-10 26.582
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
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2 1 2
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLPLKETAKQTGIGTPSKSDKPASTSGTGFGDKFKPAIGTWDCDTCLVQNKPEAVKCVACETPKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
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1 2
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'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3gj7.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 6' . 6 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
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_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
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ATOM 3 C C . GLY 352 352 ? A -18.762 -12.344 28.211 1 1 B GLY 0.440 1
ATOM 4 O O . GLY 352 352 ? A -19.563 -11.424 28.069 1 1 B GLY 0.440 1
ATOM 5 N N . ARG 353 353 ? A -17.641 -12.245 28.948 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 6 C CA . ARG 353 353 ? A -17.115 -11.048 29.576 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 7 C C . ARG 353 353 ? A -16.933 -9.838 28.661 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 8 O O . ARG 353 353 ? A -17.050 -9.930 27.440 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 9 C CB . ARG 353 353 ? A -15.801 -11.385 30.308 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 10 C CG . ARG 353 353 ? A -15.921 -12.523 31.330 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 11 C CD . ARG 353 353 ? A -14.743 -12.554 32.285 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 12 N NE . ARG 353 353 ? A -15.029 -13.486 33.388 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 13 C CZ . ARG 353 353 ? A -14.102 -13.822 34.287 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 14 N NH1 . ARG 353 353 ? A -12.869 -13.331 34.188 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 15 N NH2 . ARG 353 353 ? A -14.438 -14.663 35.261 1 1 B ARG 0.450 1
ATOM 16 N N . TRP 354 354 ? A -16.649 -8.655 29.235 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 17 C CA . TRP 354 354 ? A -16.495 -7.451 28.453 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 18 C C . TRP 354 354 ? A -15.445 -6.548 29.065 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 19 O O . TRP 354 354 ? A -15.230 -6.533 30.272 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 20 C CB . TRP 354 354 ? A -17.848 -6.699 28.290 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 21 C CG . TRP 354 354 ? A -18.544 -6.285 29.588 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 22 C CD1 . TRP 354 354 ? A -19.256 -7.060 30.460 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 23 C CD2 . TRP 354 354 ? A -18.525 -4.964 30.153 1 1 B TRP 0.470 1
ATOM 24 N NE1 . TRP 354 354 ? A -19.708 -6.307 31.517 1 1 B TRP 0.470 1
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ATOM 45 C CB . GLN 357 357 ? A -14.820 2.004 26.896 1 1 B GLN 0.620 1
ATOM 46 C CG . GLN 357 357 ? A -15.866 2.912 27.611 1 1 B GLN 0.620 1
ATOM 47 C CD . GLN 357 357 ? A -16.992 2.191 28.371 1 1 B GLN 0.620 1
ATOM 48 O OE1 . GLN 357 357 ? A -16.893 1.041 28.796 1 1 B GLN 0.620 1
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ATOM 62 N N . THR 360 360 ? A -10.146 -0.257 31.206 1 1 B THR 0.620 1
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ATOM 65 O O . THR 360 360 ? A -9.506 -3.849 31.041 1 1 B THR 0.620 1
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ATOM 81 C CA . GLU 362 362 ? A -12.532 -7.071 32.347 1 1 B GLU 0.640 1
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ATOM 84 C CB . GLU 362 362 ? A -11.789 -8.374 31.973 1 1 B GLU 0.640 1
ATOM 85 C CG . GLU 362 362 ? A -12.730 -9.437 31.361 1 1 B GLU 0.640 1
ATOM 86 C CD . GLU 362 362 ? A -12.035 -10.772 31.104 1 1 B GLU 0.640 1
ATOM 87 O OE1 . GLU 362 362 ? A -11.991 -11.607 32.056 1 1 B GLU 0.640 1
ATOM 88 O OE2 . GLU 362 362 ? A -11.603 -10.994 29.948 1 1 B GLU 0.640 1
ATOM 89 N N . ASN 363 363 ? A -14.896 -7.177 32.984 1 1 B ASN 0.650 1
ATOM 90 C CA . ASN 363 363 ? A -16.038 -7.431 33.832 1 1 B ASN 0.650 1
ATOM 91 C C . ASN 363 363 ? A -16.809 -8.613 33.308 1 1 B ASN 0.650 1
ATOM 92 O O . ASN 363 363 ? A -16.943 -8.811 32.107 1 1 B ASN 0.650 1
ATOM 93 C CB . ASN 363 363 ? A -17.023 -6.243 33.834 1 1 B ASN 0.650 1
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ATOM 95 O OD1 . ASN 363 363 ? A -15.992 -4.065 33.971 1 1 B ASN 0.650 1
ATOM 96 N ND2 . ASN 363 363 ? A -16.209 -5.255 35.877 1 1 B ASN 0.650 1
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ATOM 98 C CA . GLU 364 364 ? A -18.266 -10.503 33.840 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 99 C C . GLU 364 364 ? A -19.540 -10.000 33.175 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 100 O O . GLU 364 364 ? A -20.025 -8.916 33.452 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 101 C CB . GLU 364 364 ? A -18.476 -11.564 34.951 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 102 C CG . GLU 364 364 ? A -19.256 -12.845 34.556 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 103 C CD . GLU 364 364 ? A -18.557 -13.576 33.431 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 104 O OE1 . GLU 364 364 ? A -19.021 -13.467 32.262 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 105 O OE2 . GLU 364 364 ? A -17.508 -14.204 33.728 1 1 B GLU 0.610 1
ATOM 106 N N . ALA 365 365 ? A -20.062 -10.824 32.235 1 1 B ALA 0.650 1
ATOM 107 C CA . ALA 365 365 ? A -21.158 -10.569 31.318 1 1 B ALA 0.650 1
ATOM 108 C C . ALA 365 365 ? A -22.427 -10.015 31.946 1 1 B ALA 0.650 1
ATOM 109 O O . ALA 365 365 ? A -23.165 -9.259 31.314 1 1 B ALA 0.650 1
ATOM 110 C CB . ALA 365 365 ? A -21.519 -11.909 30.645 1 1 B ALA 0.650 1
ATOM 111 N N . ALA 366 366 ? A -22.681 -10.440 33.199 1 1 B ALA 0.680 1
ATOM 112 C CA . ALA 366 366 ? A -23.766 -10.048 34.067 1 1 B ALA 0.680 1
ATOM 113 C C . ALA 366 366 ? A -23.724 -8.598 34.559 1 1 B ALA 0.680 1
ATOM 114 O O . ALA 366 366 ? A -24.762 -7.960 34.723 1 1 B ALA 0.680 1
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ATOM 116 N N . ALA 367 367 ? A -22.523 -8.052 34.862 1 1 B ALA 0.610 1
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ATOM 121 N N . VAL 368 368 ? A -23.568 -4.599 35.206 1 1 B VAL 0.540 1
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ATOM 123 C C . VAL 368 368 ? A -23.107 -2.325 34.339 1 1 B VAL 0.540 1
ATOM 124 O O . VAL 368 368 ? A -23.055 -1.646 33.313 1 1 B VAL 0.540 1
ATOM 125 C CB . VAL 368 368 ? A -25.385 -2.933 35.244 1 1 B VAL 0.540 1
ATOM 126 C CG1 . VAL 368 368 ? A -25.144 -2.457 36.693 1 1 B VAL 0.540 1
ATOM 127 C CG2 . VAL 368 368 ? A -26.063 -1.846 34.388 1 1 B VAL 0.540 1
ATOM 128 N N . LEU 369 369 ? A -22.242 -2.145 35.344 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 129 C CA . LEU 369 369 ? A -21.227 -1.137 35.390 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 130 C C . LEU 369 369 ? A -19.909 -1.839 35.598 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 131 O O . LEU 369 369 ? A -19.862 -3.030 35.916 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 132 C CB . LEU 369 369 ? A -21.550 -0.059 36.472 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 133 C CG . LEU 369 369 ? A -21.783 -0.485 37.943 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 134 C CD1 . LEU 369 369 ? A -20.529 -0.969 38.660 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 135 C CD2 . LEU 369 369 ? A -22.308 0.701 38.763 1 1 B LEU 0.570 1
ATOM 136 N N . CYS 370 370 ? A -18.786 -1.137 35.389 1 1 B CYS 0.610 1
ATOM 137 C CA . CYS 370 370 ? A -17.478 -1.648 35.734 1 1 B CYS 0.610 1
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ATOM 140 C CB . CYS 370 370 ? A -16.354 -0.771 35.127 1 1 B CYS 0.610 1
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ATOM 162 N N . GLU 374 374 ? A -16.815 2.150 38.220 1 1 B GLU 0.600 1
ATOM 163 C CA . GLU 374 374 ? A -18.238 2.418 38.274 1 1 B GLU 0.600 1
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ATOM 168 C CD . GLU 374 374 ? A -18.478 1.586 41.482 1 1 B GLU 0.600 1
ATOM 169 O OE1 . GLU 374 374 ? A -19.053 0.725 40.774 1 1 B GLU 0.600 1
ATOM 170 O OE2 . GLU 374 374 ? A -18.275 1.461 42.718 1 1 B GLU 0.600 1
ATOM 171 N N . ARG 375 375 ? A -18.047 2.715 35.836 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 172 C CA . ARG 375 375 ? A -18.462 3.201 34.535 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 173 C C . ARG 375 375 ? A -19.516 2.278 33.922 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 174 O O . ARG 375 375 ? A -19.206 1.097 33.759 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 175 C CB . ARG 375 375 ? A -17.272 3.406 33.553 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 176 C CG . ARG 375 375 ? A -17.677 4.006 32.184 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 177 C CD . ARG 375 375 ? A -18.145 5.477 32.200 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 178 N NE . ARG 375 375 ? A -16.991 6.404 32.074 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 179 C CZ . ARG 375 375 ? A -16.970 7.703 32.395 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 180 N NH1 . ARG 375 375 ? A -18.057 8.319 32.834 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 181 N NH2 . ARG 375 375 ? A -15.842 8.395 32.222 1 1 B ARG 0.560 1
ATOM 182 N N . PRO 376 376 ? A -20.739 2.710 33.581 1 1 B PRO 0.540 1
ATOM 183 C CA . PRO 376 376 ? A -21.718 1.903 32.855 1 1 B PRO 0.540 1
ATOM 184 C C . PRO 376 376 ? A -21.204 1.213 31.604 1 1 B PRO 0.540 1
ATOM 185 O O . PRO 376 376 ? A -20.367 1.776 30.893 1 1 B PRO 0.540 1
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ATOM 187 C CG . PRO 376 376 ? A -22.701 4.025 33.530 1 1 B PRO 0.540 1
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ATOM 199 N NH2 . ARG 377 377 ? A -21.558 -7.183 26.723 1 1 B ARG 0.400 1
ATOM 200 N N . LEU 378 378 ? A -21.447 0.178 27.744 1 1 B LEU 0.420 1
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ATOM 205 C CG . LEU 378 378 ? A -19.558 1.641 25.825 1 1 B LEU 0.420 1
ATOM 206 C CD1 . LEU 378 378 ? A -18.318 1.344 24.967 1 1 B LEU 0.420 1
ATOM 207 C CD2 . LEU 378 378 ? A -19.941 3.124 25.728 1 1 B LEU 0.420 1
ATOM 208 O OXT . LEU 378 378 ? A -23.611 0.370 24.788 1 1 B LEU 0.420 1
HETATM 209 ZN ZN . ZN . 5 ? B -13.711 0.628 34.353 1 2 '_' ZN . 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
ZN
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.582
2 1 3 0.025
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 352 GLY 1 0.440
2 1 A 353 ARG 1 0.450
3 1 A 354 TRP 1 0.470
4 1 A 355 ALA 1 0.680
5 1 A 356 CYS 1 0.620
6 1 A 357 GLN 1 0.620
7 1 A 358 SER 1 0.650
8 1 A 359 CYS 1 0.630
9 1 A 360 THR 1 0.620
10 1 A 361 PHE 1 0.560
11 1 A 362 GLU 1 0.640
12 1 A 363 ASN 1 0.650
13 1 A 364 GLU 1 0.610
14 1 A 365 ALA 1 0.650
15 1 A 366 ALA 1 0.680
16 1 A 367 ALA 1 0.610
17 1 A 368 VAL 1 0.540
18 1 A 369 LEU 1 0.570
19 1 A 370 CYS 1 0.610
20 1 A 371 SER 1 0.640
21 1 A 372 ILE 1 0.630
22 1 A 373 CYS 1 0.630
23 1 A 374 GLU 1 0.600
24 1 A 375 ARG 1 0.560
25 1 A 376 PRO 1 0.540
26 1 A 377 ARG 1 0.400
27 1 A 378 LEU 1 0.420
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
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the corresponding papers mentioned under JRNL.
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#