data_SMR-ee288d6964d9b3de739c4e928b3585c5_1 _entry.id SMR-ee288d6964d9b3de739c4e928b3585c5_1 _struct.entry_id SMR-ee288d6964d9b3de739c4e928b3585c5_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9UMZ2/ SYNRG_HUMAN, Synergin gamma Estimated model accuracy of this model is 0.091, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9UMZ2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 147557.358 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SYNRG_HUMAN Q9UMZ2 1 ;MALRPGAGSGGGGAAGAGAGSAGGGGFMFPVAGGIRPPQAGLMPMQQQGFPMVSVMQPNMQGIMGMNYSS QMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYLGQAPFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQKLLEEERKR RQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKSRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPGVGVFPSQDPAQPR MPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTV LAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFSMTLPTPVSQPTVIPSGPAGSMPLSLGQPVMGINLVG PVGGAAAQASSGFIPTYPANQVVKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFSDFQELPASSKTSNSQHGNSAPSL LMPLPGTKALPSMDKYAVFKGIAADKSSENTVPPGDPGDKYSAFRELEQTAENKPLGESFAEFRSAGTDD GFTDFKTADSVSPLEPPTKDKTFPPSFPSGTIQQKQQTQVKNPLNLADLDMFSSVNCSSEKPLSFSAVFS TSKSVSTPQSTGSAATMTALAATKTSSLADDFGEFSLFGEYSGLAPVGEQDDFADFMAFSNSSISSEQKP DDKYDALKEEASPVPLTSNVGSTVKGGQNSTAASTKYDVFRQLSLEGSGLGVEDLKDNTPSGKSDDDFAD FHSSKFSSINSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLK HVMSDSSLDLPTVSGQHPPAAAGSGSPSATSILQKKETSFGSSENITMTSLSKVTTFVSEDALPETTFPA LASFKDTIPQTSEQKEYENRDYKDFTKQDLPTAERSQEATCPSPASSGASQETPNECSDDFGEFQSEKPK ISKFDFLVATSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLNE KPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWQRCLGSALNVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLG VVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQ ELACGVCLLNVDSRSRAFNSETDSFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLVLPDLL ; 'Synergin gamma' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1179 1 1179 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SYNRG_HUMAN Q9UMZ2 Q9UMZ2-3 1 1179 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-04-03 BAEC72332586ED58 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MALRPGAGSGGGGAAGAGAGSAGGGGFMFPVAGGIRPPQAGLMPMQQQGFPMVSVMQPNMQGIMGMNYSS QMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYLGQAPFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQKLLEEERKR RQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKSRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPGVGVFPSQDPAQPR MPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTV LAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFSMTLPTPVSQPTVIPSGPAGSMPLSLGQPVMGINLVG PVGGAAAQASSGFIPTYPANQVVKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFSDFQELPASSKTSNSQHGNSAPSL LMPLPGTKALPSMDKYAVFKGIAADKSSENTVPPGDPGDKYSAFRELEQTAENKPLGESFAEFRSAGTDD GFTDFKTADSVSPLEPPTKDKTFPPSFPSGTIQQKQQTQVKNPLNLADLDMFSSVNCSSEKPLSFSAVFS TSKSVSTPQSTGSAATMTALAATKTSSLADDFGEFSLFGEYSGLAPVGEQDDFADFMAFSNSSISSEQKP 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GLY . 1 104 MET . 1 105 ARG . 1 106 PRO . 1 107 PRO . 1 108 GLY . 1 109 PRO . 1 110 GLN . 1 111 TYR . 1 112 THR . 1 113 PRO . 1 114 ASP . 1 115 MET . 1 116 GLN . 1 117 LYS . 1 118 GLN . 1 119 PHE . 1 120 ALA . 1 121 GLU . 1 122 GLU . 1 123 GLN . 1 124 GLN . 1 125 LYS . 1 126 ARG . 1 127 PHE . 1 128 GLU . 1 129 GLN . 1 130 GLN . 1 131 GLN . 1 132 LYS . 1 133 LEU . 1 134 LEU . 1 135 GLU . 1 136 GLU . 1 137 GLU . 1 138 ARG . 1 139 LYS . 1 140 ARG . 1 141 ARG . 1 142 GLN . 1 143 PHE . 1 144 GLU . 1 145 GLU . 1 146 GLN . 1 147 LYS . 1 148 GLN . 1 149 LYS . 1 150 LEU . 1 151 ARG . 1 152 LEU . 1 153 LEU . 1 154 SER . 1 155 SER . 1 156 VAL . 1 157 LYS . 1 158 PRO . 1 159 LYS . 1 160 THR . 1 161 GLY . 1 162 GLU . 1 163 LYS . 1 164 SER . 1 165 ARG . 1 166 ASP . 1 167 ASP . 1 168 ALA . 1 169 LEU . 1 170 GLU . 1 171 ALA . 1 172 ILE . 1 173 LYS . 1 174 GLY . 1 175 ASN . 1 176 LEU . 1 177 ASP . 1 178 GLY . 1 179 PHE . 1 180 SER . 1 181 ARG . 1 182 ASP . 1 183 ALA . 1 184 LYS . 1 185 MET . 1 186 HIS 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A 1 1045 MET 1045 ? ? ? A . A 1 1046 GLU 1046 ? ? ? A . A 1 1047 TYR 1047 ? ? ? A . A 1 1048 LEU 1048 ? ? ? A . A 1 1049 LEU 1049 ? ? ? A . A 1 1050 GLY 1050 ? ? ? A . A 1 1051 VAL 1051 ? ? ? A . A 1 1052 VAL 1052 ? ? ? A . A 1 1053 GLU 1053 ? ? ? A . A 1 1054 VAL 1054 ? ? ? A . A 1 1055 TYR 1055 ? ? ? A . A 1 1056 ARG 1056 ? ? ? A . A 1 1057 VAL 1057 ? ? ? A . A 1 1058 THR 1058 ? ? ? A . A 1 1059 LYS 1059 ? ? ? A . A 1 1060 ARG 1060 ? ? ? A . A 1 1061 VAL 1061 ? ? ? A . A 1 1062 GLU 1062 ? ? ? A . A 1 1063 LEU 1063 ? ? ? A . A 1 1064 GLY 1064 ? ? ? A . A 1 1065 ILE 1065 ? ? ? A . A 1 1066 LYS 1066 ? ? ? A . A 1 1067 ALA 1067 ? ? ? A . A 1 1068 THR 1068 ? ? ? A . A 1 1069 ALA 1069 ? ? ? A . A 1 1070 VAL 1070 ? ? ? A . A 1 1071 CYS 1071 ? ? ? A . A 1 1072 SER 1072 ? ? ? A . A 1 1073 GLU 1073 ? ? ? A . A 1 1074 LYS 1074 ? ? ? A . A 1 1075 LEU 1075 ? ? ? A . A 1 1076 GLN 1076 ? ? ? A . A 1 1077 GLN 1077 ? ? ? A . A 1 1078 LEU 1078 ? ? ? A . A 1 1079 LEU 1079 ? ? ? A . A 1 1080 LYS 1080 ? ? ? A . A 1 1081 ASP 1081 ? ? ? A . A 1 1082 ILE 1082 ? ? ? A . A 1 1083 ASP 1083 ? ? ? A . A 1 1084 LYS 1084 ? ? ? A . A 1 1085 VAL 1085 ? ? ? A . A 1 1086 TRP 1086 ? ? ? A . A 1 1087 ASN 1087 ? ? ? A . A 1 1088 ASN 1088 ? ? ? A . A 1 1089 LEU 1089 ? ? ? A . A 1 1090 ILE 1090 ? ? ? A . A 1 1091 GLY 1091 ? ? ? A . A 1 1092 PHE 1092 ? ? ? A . A 1 1093 MET 1093 ? ? ? A . A 1 1094 SER 1094 ? ? ? A . A 1 1095 LEU 1095 ? ? ? A . A 1 1096 ALA 1096 ? ? ? A . A 1 1097 THR 1097 ? ? ? A . A 1 1098 LEU 1098 ? ? ? A . A 1 1099 THR 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PRO 1100 ? ? ? A . A 1 1101 ASP 1101 ? ? ? A . A 1 1102 GLU 1102 ? ? ? A . A 1 1103 ASN 1103 ? ? ? A . A 1 1104 SER 1104 ? ? ? A . A 1 1105 LEU 1105 ? ? ? A . A 1 1106 ASP 1106 ? ? ? A . A 1 1107 PHE 1107 ? ? ? A . A 1 1108 SER 1108 ? ? ? A . A 1 1109 SER 1109 ? ? ? A . A 1 1110 CYS 1110 ? ? ? A . A 1 1111 MET 1111 ? ? ? A . A 1 1112 LEU 1112 ? ? ? A . A 1 1113 ARG 1113 ? ? ? A . A 1 1114 PRO 1114 ? ? ? A . A 1 1115 GLY 1115 ? ? ? A . A 1 1116 ILE 1116 ? ? ? A . A 1 1117 LYS 1117 ? ? ? A . A 1 1118 ASN 1118 ? ? ? A . A 1 1119 ALA 1119 ? ? ? A . A 1 1120 GLN 1120 ? ? ? A . A 1 1121 GLU 1121 ? ? ? A . A 1 1122 LEU 1122 ? ? ? A . A 1 1123 ALA 1123 ? ? ? A . A 1 1124 CYS 1124 ? ? ? A . A 1 1125 GLY 1125 ? ? ? A . A 1 1126 VAL 1126 ? ? ? A . A 1 1127 CYS 1127 ? ? ? A . A 1 1128 LEU 1128 ? ? ? A . A 1 1129 LEU 1129 ? ? ? A . A 1 1130 ASN 1130 ? ? ? A . A 1 1131 VAL 1131 ? ? ? A . A 1 1132 ASP 1132 ? ? ? A . A 1 1133 SER 1133 ? ? ? A . A 1 1134 ARG 1134 ? ? ? A . A 1 1135 SER 1135 ? ? ? A . A 1 1136 ARG 1136 ? ? ? A . A 1 1137 ALA 1137 ? ? ? A . A 1 1138 PHE 1138 ? ? ? A . A 1 1139 ASN 1139 ? ? ? A . A 1 1140 SER 1140 ? ? ? A . A 1 1141 GLU 1141 ? ? ? A . A 1 1142 THR 1142 ? ? ? A . A 1 1143 ASP 1143 ? ? ? A . A 1 1144 SER 1144 ? ? ? A . A 1 1145 PHE 1145 ? ? ? A . A 1 1146 LYS 1146 ? ? ? A . A 1 1147 LEU 1147 ? ? ? A . A 1 1148 ALA 1148 ? ? ? A . A 1 1149 TYR 1149 ? ? ? A . A 1 1150 GLY 1150 ? ? ? A . A 1 1151 GLY 1151 ? ? ? A . A 1 1152 HIS 1152 ? ? ? A . A 1 1153 GLN 1153 ? ? ? A . A 1 1154 TYR 1154 ? ? ? A . A 1 1155 HIS 1155 ? ? ? A . A 1 1156 ALA 1156 ? ? ? A . A 1 1157 SER 1157 ? ? ? A . A 1 1158 CYS 1158 ? ? ? A . A 1 1159 ALA 1159 ? ? ? A . A 1 1160 ASN 1160 ? ? ? A . A 1 1161 PHE 1161 ? ? ? A . A 1 1162 TRP 1162 ? ? ? A . A 1 1163 ILE 1163 ? ? ? A . A 1 1164 ASN 1164 ? ? ? A . A 1 1165 CYS 1165 ? ? ? A . A 1 1166 VAL 1166 ? ? ? A . A 1 1167 GLU 1167 ? ? ? A . A 1 1168 PRO 1168 ? ? ? A . A 1 1169 LYS 1169 ? ? ? A . A 1 1170 PRO 1170 ? ? ? A . A 1 1171 PRO 1171 ? ? ? A . A 1 1172 GLY 1172 ? ? ? A . A 1 1173 LEU 1173 ? ? ? A . A 1 1174 VAL 1174 ? ? ? A . A 1 1175 LEU 1175 ? ? ? A . A 1 1176 PRO 1176 ? ? ? A . A 1 1177 ASP 1177 ? ? ? A . A 1 1178 LEU 1178 ? ? ? A . A 1 1179 LEU 1179 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Synergin gamma {PDB ID=2mx7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2mx7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2mx7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SMFPSQDPAQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTT PGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTL ; ;SMFPSQDPAQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTT PGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 112 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2mx7 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1179 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1179 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.8e-17 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MALRPGAGSGGGGAAGAGAGSAGGGGFMFPVAGGIRPPQAGLMPMQQQGFPMVSVMQPNMQGIMGMNYSSQMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYLGQAPFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQKLLEEERKRRQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKSRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPGVGVFPSQDPAQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFSMTLPTPVSQPTVIPSGPAGSMPLSLGQPVMGINLVGPVGGAAAQASSGFIPTYPANQVVKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFSDFQELPASSKTSNSQHGNSAPSLLMPLPGTKALPSMDKYAVFKGIAADKSSENTVPPGDPGDKYSAFRELEQTAENKPLGESFAEFRSAGTDDGFTDFKTADSVSPLEPPTKDKTFPPSFPSGTIQQKQQTQVKNPLNLADLDMFSSVNCSSEKPLSFSAVFSTSKSVSTPQSTGSAATMTALAATKTSSLADDFGEFSLFGEYSGLAPVGEQDDFADFMAFSNSSISSEQKPDDKYDALKEEASPVPLTSNVGSTVKGGQNSTAASTKYDVFRQLSLEGSGLGVEDLKDNTPSGKSDDDFADFHSSKFSSINSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAAAGSGSPSATSILQKKETSFGSSENITMTSLSKVTTFVSEDALPETTFPALASFKDTIPQTSEQKEYENRDYKDFTKQDLPTAERSQEATCPSPASSGASQETPNECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLVATSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLNEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWQRCLGSALNVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLGVVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQELACGVCLLNVDSRSRAFNSETDSFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLVLPDLL 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FPSQDPAQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTMTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2mx7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PHE 201 201 ? A 20.206 -0.159 5.279 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 2 C CA . PHE 201 201 ? A 21.280 0.781 4.773 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 3 C C . PHE 201 201 ? A 21.530 0.562 3.289 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 4 O O . PHE 201 201 ? A 21.012 -0.436 2.790 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 5 C CB . PHE 201 201 ? A 22.585 0.610 5.610 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 6 C CG . PHE 201 201 ? A 22.356 1.012 7.039 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 7 C CD1 . PHE 201 201 ? A 22.315 2.367 7.410 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 8 C CD2 . PHE 201 201 ? A 22.181 0.028 8.025 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 9 C CE1 . PHE 201 201 ? A 22.120 2.729 8.749 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 10 C CE2 . PHE 201 201 ? A 21.978 0.390 9.362 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 11 C CZ . PHE 201 201 ? A 21.952 1.741 9.725 1 1 A PHE 0.240 1 ATOM 12 N N . PRO 202 202 ? A 22.219 1.410 2.529 1 1 A PRO 0.280 1 ATOM 13 C CA . PRO 202 202 ? A 22.277 1.264 1.082 1 1 A PRO 0.280 1 ATOM 14 C C . PRO 202 202 ? A 23.544 0.520 0.693 1 1 A PRO 0.280 1 ATOM 15 O O . PRO 202 202 ? 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A 23.391 -5.356 -8.764 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 44 C C . PRO 206 206 ? A 22.210 -6.293 -9.033 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 45 O O . PRO 206 206 ? A 21.975 -6.630 -10.189 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 46 C CB . PRO 206 206 ? A 24.574 -5.694 -9.715 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 47 C CG . PRO 206 206 ? A 25.804 -5.885 -8.815 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 48 C CD . PRO 206 206 ? A 25.218 -6.236 -7.454 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 49 N N . ALA 207 207 ? A 21.436 -6.703 -8.012 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 50 C CA . ALA 207 207 ? A 20.271 -7.534 -8.189 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 51 C C . ALA 207 207 ? A 19.273 -7.269 -7.078 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 52 O O . ALA 207 207 ? A 18.062 -7.332 -7.284 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 53 C CB . ALA 207 207 ? A 20.719 -9.008 -8.059 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 54 N N . GLN 208 208 ? A 19.749 -6.922 -5.866 1 1 A GLN 0.370 1 ATOM 55 C CA . GLN 208 208 ? A 18.875 -6.615 -4.748 1 1 A GLN 0.370 1 ATOM 56 C C . GLN 208 208 ? A 18.008 -5.355 -4.924 1 1 A GLN 0.370 1 ATOM 57 O O . GLN 208 208 ? 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A 16.372 -0.911 -2.720 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 72 C C . ARG 210 210 ? A 15.086 -0.181 -2.326 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 73 O O . ARG 210 210 ? A 15.073 1.007 -1.989 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 74 C CB . ARG 210 210 ? A 17.463 0.072 -3.201 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 75 C CG . ARG 210 210 ? A 18.231 0.721 -2.030 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 76 C CD . ARG 210 210 ? A 18.468 2.230 -2.150 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 77 N NE . ARG 210 210 ? A 17.117 2.870 -1.996 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 78 C CZ . ARG 210 210 ? A 16.896 4.177 -1.790 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 79 N NH1 . ARG 210 210 ? A 17.903 5.036 -1.714 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 80 N NH2 . ARG 210 210 ? A 15.659 4.637 -1.621 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 81 N N . MET 211 211 ? A 13.947 -0.886 -2.419 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 82 C CA . MET 211 211 ? A 12.617 -0.373 -2.178 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 83 C C . MET 211 211 ? A 12.305 -0.258 -0.685 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 84 O O . MET 211 211 ? A 13.099 -0.739 0.120 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 85 C CB . MET 211 211 ? A 11.619 -1.290 -2.908 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 86 C CG . MET 211 211 ? A 11.697 -1.129 -4.436 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 87 S SD . MET 211 211 ? A 10.306 -1.871 -5.341 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 88 C CE . MET 211 211 ? A 8.963 -0.803 -4.724 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 89 N N . PRO 212 212 ? A 11.223 0.391 -0.243 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 90 C CA . PRO 212 212 ? A 10.933 0.557 1.174 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 91 C C . PRO 212 212 ? A 10.952 -0.726 2.036 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 92 O O . PRO 212 212 ? A 10.245 -1.656 1.640 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 93 C CB . PRO 212 212 ? A 9.552 1.211 1.163 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 94 C CG . PRO 212 212 ? A 9.553 2.099 -0.080 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 95 C CD . PRO 212 212 ? A 10.402 1.291 -1.064 1 1 A PRO 0.820 1 ATOM 96 N N . PRO 213 213 ? A 11.665 -0.842 3.170 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 97 C CA . PRO 213 213 ? A 11.832 -2.064 3.969 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 98 C C . PRO 213 213 ? A 10.565 -2.812 4.325 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 99 O O . PRO 213 213 ? 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ASP 239 239 ? A -12.415 -7.421 -3.245 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 310 C CG . ASP 239 239 ? A -13.651 -6.884 -3.927 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 311 O OD1 . ASP 239 239 ? A -13.617 -6.799 -5.182 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 312 O OD2 . ASP 239 239 ? A -14.611 -6.476 -3.224 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 313 N N . THR 240 240 ? A -10.893 -4.470 -4.759 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 314 C CA . THR 240 240 ? A -11.010 -3.021 -4.734 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 315 C C . THR 240 240 ? A -12.456 -2.562 -4.734 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 316 O O . THR 240 240 ? A -12.753 -1.420 -4.391 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 317 C CB . THR 240 240 ? A -10.254 -2.366 -5.883 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 318 O OG1 . THR 240 240 ? A -10.196 -0.952 -5.752 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 319 C CG2 . THR 240 240 ? A -10.822 -2.755 -7.256 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 320 N N . ALA 241 241 ? A -13.427 -3.435 -5.071 1 1 A ALA 0.880 1 ATOM 321 C CA . ALA 241 241 ? A -14.803 -3.053 -5.297 1 1 A ALA 0.880 1 ATOM 322 C C . ALA 241 241 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.795 2 1 3 0.091 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 201 PHE 1 0.240 2 1 A 202 PRO 1 0.280 3 1 A 203 SER 1 0.570 4 1 A 204 GLN 1 0.310 5 1 A 205 ASP 1 0.290 6 1 A 206 PRO 1 0.550 7 1 A 207 ALA 1 0.590 8 1 A 208 GLN 1 0.370 9 1 A 209 PRO 1 0.530 10 1 A 210 ARG 1 0.470 11 1 A 211 MET 1 0.680 12 1 A 212 PRO 1 0.820 13 1 A 213 PRO 1 0.760 14 1 A 214 TRP 1 0.730 15 1 A 215 ILE 1 0.850 16 1 A 216 TYR 1 0.720 17 1 A 217 ASN 1 0.710 18 1 A 218 GLU 1 0.610 19 1 A 219 SER 1 0.440 20 1 A 220 LEU 1 0.460 21 1 A 221 VAL 1 0.700 22 1 A 222 PRO 1 0.850 23 1 A 223 ASP 1 0.840 24 1 A 224 ALA 1 0.970 25 1 A 225 TYR 1 0.870 26 1 A 226 LYS 1 0.840 27 1 A 227 LYS 1 0.850 28 1 A 228 ILE 1 0.900 29 1 A 229 LEU 1 0.840 30 1 A 230 GLU 1 0.790 31 1 A 231 THR 1 0.860 32 1 A 232 THR 1 0.870 33 1 A 233 MET 1 0.790 34 1 A 234 THR 1 0.790 35 1 A 235 PRO 1 0.660 36 1 A 236 THR 1 0.570 37 1 A 237 GLY 1 0.840 38 1 A 238 ILE 1 0.870 39 1 A 239 ASP 1 0.850 40 1 A 240 THR 1 0.870 41 1 A 241 ALA 1 0.880 42 1 A 242 LYS 1 0.840 43 1 A 243 LEU 1 0.890 44 1 A 244 TYR 1 0.870 45 1 A 245 PRO 1 0.910 46 1 A 246 ILE 1 0.900 47 1 A 247 LEU 1 0.920 48 1 A 248 MET 1 0.870 49 1 A 249 SER 1 0.880 50 1 A 250 SER 1 0.930 51 1 A 251 GLY 1 0.940 52 1 A 252 LEU 1 0.920 53 1 A 253 PRO 1 0.920 54 1 A 254 ARG 1 0.820 55 1 A 255 GLU 1 0.870 56 1 A 256 THR 1 0.910 57 1 A 257 LEU 1 0.900 58 1 A 258 GLY 1 0.920 59 1 A 259 GLN 1 0.850 60 1 A 260 ILE 1 0.900 61 1 A 261 TRP 1 0.830 62 1 A 262 ALA 1 0.900 63 1 A 263 LEU 1 0.840 64 1 A 264 ALA 1 0.910 65 1 A 265 ASN 1 0.790 66 1 A 266 ARG 1 0.630 67 1 A 267 THR 1 0.670 68 1 A 268 THR 1 0.690 69 1 A 269 PRO 1 0.600 70 1 A 270 GLY 1 0.700 71 1 A 271 LYS 1 0.760 72 1 A 272 LEU 1 0.860 73 1 A 273 THR 1 0.890 74 1 A 274 LYS 1 0.870 75 1 A 275 GLU 1 0.860 76 1 A 276 GLU 1 0.870 77 1 A 277 LEU 1 0.910 78 1 A 278 TYR 1 0.910 79 1 A 279 THR 1 0.920 80 1 A 280 VAL 1 0.950 81 1 A 281 LEU 1 0.950 82 1 A 282 ALA 1 1.000 83 1 A 283 MET 1 0.910 84 1 A 284 ILE 1 0.950 85 1 A 285 ALA 1 1.000 86 1 A 286 VAL 1 0.960 87 1 A 287 THR 1 0.950 88 1 A 288 GLN 1 0.910 89 1 A 289 ARG 1 0.840 90 1 A 290 GLY 1 0.880 91 1 A 291 VAL 1 0.870 92 1 A 292 PRO 1 0.840 93 1 A 293 ALA 1 0.880 94 1 A 294 MET 1 0.650 95 1 A 295 SER 1 0.800 96 1 A 296 PRO 1 0.850 97 1 A 297 ASP 1 0.790 98 1 A 298 ALA 1 0.870 99 1 A 299 LEU 1 0.850 100 1 A 300 ASN 1 0.810 101 1 A 301 GLN 1 0.780 102 1 A 302 PHE 1 0.770 103 1 A 303 PRO 1 0.760 104 1 A 304 ALA 1 0.820 105 1 A 305 ALA 1 0.940 106 1 A 306 PRO 1 0.940 107 1 A 307 ILE 1 0.940 108 1 A 308 PRO 1 0.980 109 1 A 309 THR 1 0.740 110 1 A 310 LEU 1 0.620 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #