data_SMR-94eb873c19ca04ffb4dd298f6ce8b9b0_4 _entry.id SMR-94eb873c19ca04ffb4dd298f6ce8b9b0_4 _struct.entry_id SMR-94eb873c19ca04ffb4dd298f6ce8b9b0_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P51825/ AFF1_HUMAN, AF4/FMR2 family member 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P51825' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 153408.583 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFF1_HUMAN P51825 1 ;MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEF LSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRT EPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPP LSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLP SKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYS NEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTS SMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSS DSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESK DPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLL PYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEH FALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLL SRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSS SSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDS SIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAEL MTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVL CMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIASTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSA GSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV DLVHYTRQGFQQLQELTKTP ; 'AF4/FMR2 family member 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1210 1 1210 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFF1_HUMAN P51825 . 1 1210 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-10-01 F0E334DF8FC2FF04 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEF LSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRT EPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPP LSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLP SKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYS NEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTS SMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSS DSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESK DPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLL 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NEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTS SMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSS DSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESK DPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLL PYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEH FALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLL SRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSS SSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDS SIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAEL MTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVL CMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIASTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSA GSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV DLVHYTRQGFQQLQELTKTP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 GLN . 1 5 SER . 1 6 SER . 1 7 LEU . 1 8 TYR . 1 9 ASN . 1 10 ASP . 1 11 ASP . 1 12 ARG . 1 13 ASN . 1 14 LEU . 1 15 LEU . 1 16 ARG . 1 17 ILE . 1 18 ARG . 1 19 GLU . 1 20 LYS . 1 21 GLU . 1 22 ARG . 1 23 ARG . 1 24 ASN . 1 25 GLN . 1 26 GLU . 1 27 ALA . 1 28 HIS . 1 29 GLN . 1 30 GLU . 1 31 LYS . 1 32 GLU . 1 33 ALA . 1 34 PHE . 1 35 PRO . 1 36 GLU . 1 37 LYS . 1 38 ILE . 1 39 PRO . 1 40 LEU . 1 41 PHE . 1 42 GLY . 1 43 GLU . 1 44 PRO . 1 45 TYR . 1 46 LYS . 1 47 THR . 1 48 ALA . 1 49 LYS . 1 50 GLY . 1 51 ASP . 1 52 GLU . 1 53 LEU . 1 54 SER . 1 55 SER . 1 56 ARG . 1 57 ILE . 1 58 GLN . 1 59 ASN . 1 60 MET . 1 61 LEU . 1 62 GLY . 1 63 ASN . 1 64 TYR . 1 65 GLU . 1 66 GLU . 1 67 VAL . 1 68 LYS . 1 69 GLU . 1 70 PHE . 1 71 LEU . 1 72 SER . 1 73 THR . 1 74 LYS . 1 75 SER . 1 76 HIS . 1 77 THR . 1 78 HIS . 1 79 ARG . 1 80 LEU . 1 81 ASP . 1 82 ALA . 1 83 SER . 1 84 GLU . 1 85 ASN . 1 86 ARG . 1 87 LEU . 1 88 GLY . 1 89 LYS . 1 90 PRO . 1 91 LYS . 1 92 TYR . 1 93 PRO . 1 94 LEU . 1 95 ILE . 1 96 PRO . 1 97 ASP . 1 98 LYS . 1 99 GLY . 1 100 SER . 1 101 SER . 1 102 ILE . 1 103 PRO . 1 104 SER . 1 105 SER . 1 106 SER . 1 107 PHE . 1 108 HIS . 1 109 THR . 1 110 SER . 1 111 VAL . 1 112 HIS . 1 113 HIS . 1 114 GLN . 1 115 SER . 1 116 ILE . 1 117 HIS . 1 118 THR . 1 119 PRO . 1 120 ALA . 1 121 SER . 1 122 GLY . 1 123 PRO . 1 124 LEU . 1 125 SER . 1 126 VAL . 1 127 GLY . 1 128 ASN . 1 129 ILE . 1 130 SER . 1 131 HIS . 1 132 ASN . 1 133 PRO . 1 134 LYS . 1 135 MET . 1 136 ALA . 1 137 GLN . 1 138 PRO . 1 139 ARG . 1 140 THR . 1 141 GLU . 1 142 PRO . 1 143 MET . 1 144 PRO . 1 145 SER . 1 146 LEU . 1 147 HIS . 1 148 ALA . 1 149 LYS . 1 150 SER . 1 151 CYS . 1 152 GLY . 1 153 PRO . 1 154 PRO . 1 155 ASP . 1 156 SER . 1 157 GLN . 1 158 HIS . 1 159 LEU . 1 160 THR . 1 161 GLN . 1 162 ASP . 1 163 ARG . 1 164 LEU . 1 165 GLY . 1 166 GLN . 1 167 GLU . 1 168 GLY . 1 169 PHE . 1 170 GLY . 1 171 SER . 1 172 SER . 1 173 HIS . 1 174 HIS . 1 175 LYS . 1 176 LYS . 1 177 GLY . 1 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A 1 1061 ALA 1061 ? ? ? A . A 1 1062 MET 1062 ? ? ? A . A 1 1063 PHE 1063 ? ? ? A . A 1 1064 ARG 1064 ? ? ? A . A 1 1065 CYS 1065 ? ? ? A . A 1 1066 LYS 1066 ? ? ? A . A 1 1067 LYS 1067 ? ? ? A . A 1 1068 ASP 1068 ? ? ? A . A 1 1069 ILE 1069 ? ? ? A . A 1 1070 ALA 1070 ? ? ? A . A 1 1071 ILE 1071 ? ? ? A . A 1 1072 LYS 1072 ? ? ? A . A 1 1073 TYR 1073 ? ? ? A . A 1 1074 SER 1074 ? ? ? A . A 1 1075 ARG 1075 ? ? ? A . A 1 1076 THR 1076 ? ? ? A . A 1 1077 LEU 1077 ? ? ? A . A 1 1078 ASN 1078 ? ? ? A . A 1 1079 LYS 1079 ? ? ? A . A 1 1080 HIS 1080 ? ? ? A . A 1 1081 PHE 1081 ? ? ? A . A 1 1082 GLU 1082 ? ? ? A . A 1 1083 SER 1083 ? ? ? A . A 1 1084 SER 1084 ? ? ? A . A 1 1085 SER 1085 ? ? ? A . A 1 1086 LYS 1086 ? ? ? A . A 1 1087 VAL 1087 ? ? ? A . A 1 1088 ALA 1088 ? ? ? A . A 1 1089 GLN 1089 ? ? ? A . A 1 1090 ALA 1090 ? ? ? A . A 1 1091 PRO 1091 ? ? ? A . A 1 1092 SER 1092 ? ? ? A . A 1 1093 PRO 1093 ? ? ? A . A 1 1094 CYS 1094 ? ? ? A . A 1 1095 ILE 1095 ? ? ? A . A 1 1096 ALA 1096 ? ? ? A . A 1 1097 SER 1097 ? ? ? A . A 1 1098 THR 1098 ? ? ? A . A 1 1099 GLY 1099 ? ? ? A . A 1 1100 THR 1100 ? ? ? A . A 1 1101 PRO 1101 ? ? ? A . A 1 1102 SER 1102 ? ? ? A . A 1 1103 PRO 1103 ? ? ? A . A 1 1104 LEU 1104 ? ? ? A . A 1 1105 SER 1105 ? ? ? A . A 1 1106 PRO 1106 ? ? ? A . A 1 1107 MET 1107 ? ? ? A . A 1 1108 PRO 1108 ? ? ? A . A 1 1109 SER 1109 ? ? ? A . A 1 1110 PRO 1110 ? ? ? A . A 1 1111 ALA 1111 ? ? ? A . A 1 1112 SER 1112 ? ? ? A . A 1 1113 SER 1113 ? ? ? A . A 1 1114 VAL 1114 ? ? ? A . A 1 1115 GLY 1115 ? ? ? A . A 1 1116 SER 1116 ? ? ? A . A 1 1117 GLN 1117 ? ? ? A . A 1 1118 SER 1118 ? ? ? A . A 1 1119 SER 1119 ? ? ? A . A 1 1120 ALA 1120 ? ? ? A . A 1 1121 GLY 1121 ? ? ? A . A 1 1122 SER 1122 ? ? ? A . A 1 1123 VAL 1123 ? ? ? A . A 1 1124 GLY 1124 ? ? ? A . A 1 1125 SER 1125 ? ? ? A . A 1 1126 SER 1126 ? ? ? A . A 1 1127 GLY 1127 ? ? ? A . A 1 1128 VAL 1128 ? ? ? A . A 1 1129 ALA 1129 ? ? ? A . A 1 1130 ALA 1130 ? ? ? A . A 1 1131 THR 1131 ? ? ? A . A 1 1132 ILE 1132 ? ? ? A . A 1 1133 SER 1133 ? ? ? A . A 1 1134 THR 1134 ? ? ? A . A 1 1135 PRO 1135 ? ? ? A . A 1 1136 VAL 1136 ? ? ? A . A 1 1137 THR 1137 ? ? ? A . A 1 1138 ILE 1138 ? ? ? A . A 1 1139 GLN 1139 ? ? ? A . A 1 1140 ASN 1140 ? ? ? A . A 1 1141 MET 1141 ? ? ? A . A 1 1142 THR 1142 ? ? ? A . A 1 1143 SER 1143 ? ? ? A . A 1 1144 SER 1144 ? ? ? A . A 1 1145 TYR 1145 ? ? ? A . A 1 1146 VAL 1146 ? ? ? A . A 1 1147 THR 1147 ? ? ? A . A 1 1148 ILE 1148 ? ? ? A . A 1 1149 THR 1149 ? ? ? A . A 1 1150 SER 1150 ? ? ? A . A 1 1151 HIS 1151 ? ? ? A . A 1 1152 VAL 1152 ? ? ? A . A 1 1153 LEU 1153 ? ? ? A . A 1 1154 THR 1154 ? ? ? A . A 1 1155 ALA 1155 ? ? ? A . A 1 1156 PHE 1156 ? ? ? A . A 1 1157 ASP 1157 ? ? ? A . A 1 1158 LEU 1158 ? ? ? A . A 1 1159 TRP 1159 ? ? ? A . A 1 1160 GLU 1160 ? ? ? A . A 1 1161 GLN 1161 ? ? ? A . A 1 1162 ALA 1162 ? ? ? A . A 1 1163 GLU 1163 ? ? ? A . A 1 1164 ALA 1164 ? ? ? A . A 1 1165 LEU 1165 ? ? ? A . A 1 1166 THR 1166 ? ? ? A . A 1 1167 ARG 1167 ? ? ? A . A 1 1168 LYS 1168 ? ? ? A . A 1 1169 ASN 1169 ? ? ? A . A 1 1170 LYS 1170 ? ? ? A . A 1 1171 GLU 1171 ? ? ? A . A 1 1172 PHE 1172 ? ? ? A . A 1 1173 PHE 1173 ? ? ? A . A 1 1174 ALA 1174 ? ? ? A . A 1 1175 ARG 1175 ? ? ? A . A 1 1176 LEU 1176 ? ? ? A . A 1 1177 SER 1177 ? ? ? A . A 1 1178 THR 1178 ? ? ? A . A 1 1179 ASN 1179 ? ? ? A . A 1 1180 VAL 1180 ? ? ? A . A 1 1181 CYS 1181 ? ? ? A . A 1 1182 THR 1182 ? ? ? A . A 1 1183 LEU 1183 ? ? ? A . A 1 1184 ALA 1184 ? ? ? A . A 1 1185 LEU 1185 ? ? ? A . A 1 1186 ASN 1186 ? ? ? A . A 1 1187 SER 1187 ? ? ? A . A 1 1188 SER 1188 ? ? ? A . A 1 1189 LEU 1189 ? ? ? A . A 1 1190 VAL 1190 ? ? ? A . A 1 1191 ASP 1191 ? ? ? A . A 1 1192 LEU 1192 ? ? ? A . A 1 1193 VAL 1193 ? ? ? A . A 1 1194 HIS 1194 ? ? ? A . A 1 1195 TYR 1195 ? ? ? A . A 1 1196 THR 1196 ? ? ? A . A 1 1197 ARG 1197 ? ? ? A . A 1 1198 GLN 1198 ? ? ? A . A 1 1199 GLY 1199 ? ? ? A . A 1 1200 PHE 1200 ? ? ? A . A 1 1201 GLN 1201 ? ? ? A . A 1 1202 GLN 1202 ? ? ? A . A 1 1203 LEU 1203 ? ? ? A . A 1 1204 GLN 1204 ? ? ? A . A 1 1205 GLU 1205 ? ? ? A . A 1 1206 LEU 1206 ? ? ? A . A 1 1207 THR 1207 ? ? ? A . A 1 1208 LYS 1208 ? ? ? A . A 1 1209 THR 1209 ? ? ? A . A 1 1210 PRO 1210 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AF4/FMR2 family member 4 {PDB ID=5jw9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5jw9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5jw9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GAMGSPSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKEGSGSGSGS GAMGSPSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKEGSGSGSGS # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 56 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5jw9 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1210 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1210 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.01e-17 72.549 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIASTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5jw9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #