data_SMR-98584101e5907e85f975de98676e8b38_2 _entry.id SMR-98584101e5907e85f975de98676e8b38_2 _struct.entry_id SMR-98584101e5907e85f975de98676e8b38_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8CC12/ CDAN1_MOUSE, Codanin-1 Estimated model accuracy of this model is 0.024, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8CC12' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 157365.772 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CDAN1_MOUSE Q8CC12 1 ;MAAVLESLLREEVPVAAAVRWIARSTPSSEDSSEVAALSALRPLRKEFVPFLLNFLREQSSRVLPQGPST PAKTPVASAALPARQGAPARGGRGARSQLFPAAEPLSAAAEAPLARRAGRRRGPGPGPSRERGGRGSGAA EEGASGESPPWAGGRKPKGSGSPGSPRLSLSDPPNLSNLEEFPPVGTVPPGSAGRTKPSRRINPTPVSEE RSLSKPKTCFTSPPISCVPSSQPSTLDTSPWGLGLPPGCRSLQEEREMLRKARTKQLQQSPTPASPIPES GSPVPSRTGNLTAEPADPARVSSRQRLELVALIYSSCIAENLVPNLFLELFFVLQLLTARRMVATKDSDL ESSQGALDSLDTPLFRSIHDCVFFAVQVLEHQFQVLSYLDKGTLKLLAENERLLCFSPALQGRLRAAYEG SVAKVSLVIPPSAQAVSFQPETDNRANFSSDRAFHTFKKQRDVFYEVLREWEDHHEEPSWDFEKGLGSRI RAMMGQLSAACSHSHFVRLFQKQLLQMCQSPGGAGGSVLGEAPDVLNMLGADKLGRLRQLQERLIAPQSS GGPCPPPTFPGCQGFFRDFIMSASSFHFNQHLMDSLSLKIRELNGLRLPQHEPGDEDGESDMDWQGERRQ FAVVLLSLRLLAKFLGFVAFLPYRGHEPPPTRELQDSILALRSQVPPVLDIRALLQQGLWARRAVLTVPW LVEFLSFADHIVPLLDYYRSVFTLLLRLHRSLVLSKENEGEMCFLNKLLLLAVLGWLFQIPTVPEDLFFL EDGQVDAFEVTTTASEHGLDSVPVVDQQLLYTCCPYIGELRKLLASWVSGSSGRSGGFVRKITPTTTSSL GALPLQTSQGLQAQLAEAFFHNQPPSLRRTVEFVAERIGSNCVKHIKATLVADLVHQAESLLQEQLVARG QEGGDPAQLLESLCSQLCPHGAQALTQGREFCQRKSPTAVRALLPEETPAAVLSSAENIAVGLATEKACS WLSANITALIRREVKAAVSRMLRAQGPEPTARVERRGCSRACEHHAPLPSHLISEIKDVLSLAAGPRDPE EGVSPEHLEQLLNQMGQSLRCRQFLCPTAEQHLAKCSVELASLLVADQIPILGPPTQHRLERGHARRLLH MLLSLWKDDFQGPVPLQLLLSPRNVGLLADTRPREWDLLLFLLRELVEKDLMGHLEIEACLGRLNEAQWP GDFSEELSTLFRLFLAEPHLLEPQLRACELMQPNRGTVLAQS ; Codanin-1 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1232 1 1232 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CDAN1_MOUSE Q8CC12 Q8CC12-2 1 1232 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-07-24 110402EDED275C4E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAVLESLLREEVPVAAAVRWIARSTPSSEDSSEVAALSALRPLRKEFVPFLLNFLREQSSRVLPQGPST PAKTPVASAALPARQGAPARGGRGARSQLFPAAEPLSAAAEAPLARRAGRRRGPGPGPSRERGGRGSGAA EEGASGESPPWAGGRKPKGSGSPGSPRLSLSDPPNLSNLEEFPPVGTVPPGSAGRTKPSRRINPTPVSEE RSLSKPKTCFTSPPISCVPSSQPSTLDTSPWGLGLPPGCRSLQEEREMLRKARTKQLQQSPTPASPIPES GSPVPSRTGNLTAEPADPARVSSRQRLELVALIYSSCIAENLVPNLFLELFFVLQLLTARRMVATKDSDL ESSQGALDSLDTPLFRSIHDCVFFAVQVLEHQFQVLSYLDKGTLKLLAENERLLCFSPALQGRLRAAYEG SVAKVSLVIPPSAQAVSFQPETDNRANFSSDRAFHTFKKQRDVFYEVLREWEDHHEEPSWDFEKGLGSRI RAMMGQLSAACSHSHFVRLFQKQLLQMCQSPGGAGGSVLGEAPDVLNMLGADKLGRLRQLQERLIAPQSS GGPCPPPTFPGCQGFFRDFIMSASSFHFNQHLMDSLSLKIRELNGLRLPQHEPGDEDGESDMDWQGERRQ 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_entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 VAL . 1 5 LEU . 1 6 GLU . 1 7 SER . 1 8 LEU . 1 9 LEU . 1 10 ARG . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 VAL . 1 14 PRO . 1 15 VAL . 1 16 ALA . 1 17 ALA . 1 18 ALA . 1 19 VAL . 1 20 ARG . 1 21 TRP . 1 22 ILE . 1 23 ALA . 1 24 ARG . 1 25 SER . 1 26 THR . 1 27 PRO . 1 28 SER . 1 29 SER . 1 30 GLU . 1 31 ASP . 1 32 SER . 1 33 SER . 1 34 GLU . 1 35 VAL . 1 36 ALA . 1 37 ALA . 1 38 LEU . 1 39 SER . 1 40 ALA . 1 41 LEU . 1 42 ARG . 1 43 PRO . 1 44 LEU . 1 45 ARG . 1 46 LYS . 1 47 GLU . 1 48 PHE . 1 49 VAL . 1 50 PRO . 1 51 PHE . 1 52 LEU . 1 53 LEU . 1 54 ASN . 1 55 PHE . 1 56 LEU . 1 57 ARG . 1 58 GLU . 1 59 GLN . 1 60 SER . 1 61 SER . 1 62 ARG . 1 63 VAL . 1 64 LEU . 1 65 PRO . 1 66 GLN . 1 67 GLY . 1 68 PRO . 1 69 SER . 1 70 THR . 1 71 PRO . 1 72 ALA . 1 73 LYS . 1 74 THR . 1 75 PRO . 1 76 VAL . 1 77 ALA . 1 78 SER . 1 79 ALA . 1 80 ALA . 1 81 LEU . 1 82 PRO . 1 83 ALA . 1 84 ARG . 1 85 GLN . 1 86 GLY . 1 87 ALA . 1 88 PRO . 1 89 ALA . 1 90 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A . A 1 1034 SER 1034 ? ? ? A . A 1 1035 GLU 1035 ? ? ? A . A 1 1036 ILE 1036 ? ? ? A . A 1 1037 LYS 1037 ? ? ? A . A 1 1038 ASP 1038 ? ? ? A . A 1 1039 VAL 1039 ? ? ? A . A 1 1040 LEU 1040 ? ? ? A . A 1 1041 SER 1041 ? ? ? A . A 1 1042 LEU 1042 ? ? ? A . A 1 1043 ALA 1043 ? ? ? A . A 1 1044 ALA 1044 ? ? ? A . A 1 1045 GLY 1045 ? ? ? A . A 1 1046 PRO 1046 ? ? ? A . A 1 1047 ARG 1047 ? ? ? A . A 1 1048 ASP 1048 ? ? ? A . A 1 1049 PRO 1049 ? ? ? A . A 1 1050 GLU 1050 ? ? ? A . A 1 1051 GLU 1051 ? ? ? A . A 1 1052 GLY 1052 ? ? ? A . A 1 1053 VAL 1053 ? ? ? A . A 1 1054 SER 1054 ? ? ? A . A 1 1055 PRO 1055 ? ? ? A . A 1 1056 GLU 1056 ? ? ? A . A 1 1057 HIS 1057 ? ? ? A . A 1 1058 LEU 1058 ? ? ? A . A 1 1059 GLU 1059 ? ? ? A . A 1 1060 GLN 1060 ? ? ? A . A 1 1061 LEU 1061 ? ? ? A . A 1 1062 LEU 1062 ? ? ? A . A 1 1063 ASN 1063 ? ? ? A . A 1 1064 GLN 1064 ? ? ? A . A 1 1065 MET 1065 ? ? ? A . A 1 1066 GLY 1066 ? ? ? A . A 1 1067 GLN 1067 ? ? ? A . A 1 1068 SER 1068 ? ? ? A . A 1 1069 LEU 1069 ? ? ? A . A 1 1070 ARG 1070 ? ? ? A . A 1 1071 CYS 1071 ? ? ? A . A 1 1072 ARG 1072 ? ? ? A . A 1 1073 GLN 1073 ? ? ? A . A 1 1074 PHE 1074 ? ? ? A . A 1 1075 LEU 1075 ? ? ? A . A 1 1076 CYS 1076 ? ? ? A . A 1 1077 PRO 1077 ? ? ? A . A 1 1078 THR 1078 ? ? ? A . A 1 1079 ALA 1079 ? ? ? A . A 1 1080 GLU 1080 ? ? ? A . A 1 1081 GLN 1081 ? ? ? A . A 1 1082 HIS 1082 ? ? ? A . A 1 1083 LEU 1083 ? ? ? A . A 1 1084 ALA 1084 ? ? ? A . A 1 1085 LYS 1085 ? ? ? A . A 1 1086 CYS 1086 ? ? ? A . A 1 1087 SER 1087 ? ? ? A . A 1 1088 VAL 1088 ? ? ? A . A 1 1089 GLU 1089 ? ? ? A . A 1 1090 LEU 1090 ? ? ? A . A 1 1091 ALA 1091 ? ? ? A . A 1 1092 SER 1092 ? ? ? A . A 1 1093 LEU 1093 ? ? ? A . A 1 1094 LEU 1094 ? ? ? A . A 1 1095 VAL 1095 ? ? ? A . A 1 1096 ALA 1096 ? ? ? A . A 1 1097 ASP 1097 ? ? ? A . A 1 1098 GLN 1098 ? ? ? A . A 1 1099 ILE 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PRO 1100 ? ? ? A . A 1 1101 ILE 1101 ? ? ? A . A 1 1102 LEU 1102 ? ? ? A . A 1 1103 GLY 1103 ? ? ? A . A 1 1104 PRO 1104 ? ? ? A . A 1 1105 PRO 1105 ? ? ? A . A 1 1106 THR 1106 ? ? ? A . A 1 1107 GLN 1107 ? ? ? A . A 1 1108 HIS 1108 ? ? ? A . A 1 1109 ARG 1109 ? ? ? A . A 1 1110 LEU 1110 ? ? ? A . A 1 1111 GLU 1111 ? ? ? A . A 1 1112 ARG 1112 ? ? ? A . A 1 1113 GLY 1113 ? ? ? A . A 1 1114 HIS 1114 ? ? ? A . A 1 1115 ALA 1115 ? ? ? A . A 1 1116 ARG 1116 ? ? ? A . A 1 1117 ARG 1117 ? ? ? A . A 1 1118 LEU 1118 ? ? ? A . A 1 1119 LEU 1119 ? ? ? A . A 1 1120 HIS 1120 ? ? ? A . A 1 1121 MET 1121 ? ? ? A . A 1 1122 LEU 1122 ? ? ? A . A 1 1123 LEU 1123 ? ? ? A . A 1 1124 SER 1124 ? ? ? A . A 1 1125 LEU 1125 ? ? ? A . A 1 1126 TRP 1126 ? ? ? A . A 1 1127 LYS 1127 ? ? ? A . A 1 1128 ASP 1128 ? ? ? A . A 1 1129 ASP 1129 ? ? ? A . A 1 1130 PHE 1130 ? ? ? A . A 1 1131 GLN 1131 ? ? ? A . A 1 1132 GLY 1132 ? ? ? A . A 1 1133 PRO 1133 ? ? ? A . A 1 1134 VAL 1134 ? ? ? A . A 1 1135 PRO 1135 ? ? ? A . A 1 1136 LEU 1136 ? ? ? A . A 1 1137 GLN 1137 ? ? ? A . A 1 1138 LEU 1138 ? ? ? A . A 1 1139 LEU 1139 ? ? ? A . A 1 1140 LEU 1140 1140 LEU LEU A . A 1 1141 SER 1141 1141 SER SER A . A 1 1142 PRO 1142 1142 PRO PRO A . A 1 1143 ARG 1143 1143 ARG ARG A . A 1 1144 ASN 1144 1144 ASN ASN A . A 1 1145 VAL 1145 1145 VAL VAL A . A 1 1146 GLY 1146 1146 GLY GLY A . A 1 1147 LEU 1147 1147 LEU LEU A . A 1 1148 LEU 1148 1148 LEU LEU A . A 1 1149 ALA 1149 1149 ALA ALA A . A 1 1150 ASP 1150 1150 ASP ASP A . A 1 1151 THR 1151 1151 THR THR A . A 1 1152 ARG 1152 1152 ARG ARG A . A 1 1153 PRO 1153 1153 PRO PRO A . A 1 1154 ARG 1154 1154 ARG ARG A . A 1 1155 GLU 1155 1155 GLU GLU A . A 1 1156 TRP 1156 1156 TRP TRP A . A 1 1157 ASP 1157 1157 ASP ASP A . A 1 1158 LEU 1158 1158 LEU LEU A . A 1 1159 LEU 1159 1159 LEU LEU A . A 1 1160 LEU 1160 1160 LEU LEU A . A 1 1161 PHE 1161 1161 PHE PHE A . A 1 1162 LEU 1162 1162 LEU LEU A . A 1 1163 LEU 1163 1163 LEU LEU A . A 1 1164 ARG 1164 1164 ARG ARG A . A 1 1165 GLU 1165 1165 GLU GLU A . A 1 1166 LEU 1166 1166 LEU LEU A . A 1 1167 VAL 1167 1167 VAL VAL A . A 1 1168 GLU 1168 1168 GLU GLU A . A 1 1169 LYS 1169 1169 LYS LYS A . A 1 1170 ASP 1170 1170 ASP ASP A . A 1 1171 LEU 1171 1171 LEU LEU A . A 1 1172 MET 1172 1172 MET MET A . A 1 1173 GLY 1173 1173 GLY GLY A . A 1 1174 HIS 1174 1174 HIS HIS A . A 1 1175 LEU 1175 1175 LEU LEU A . A 1 1176 GLU 1176 1176 GLU GLU A . A 1 1177 ILE 1177 1177 ILE ILE A . A 1 1178 GLU 1178 1178 GLU GLU A . A 1 1179 ALA 1179 1179 ALA ALA A . A 1 1180 CYS 1180 1180 CYS CYS A . A 1 1181 LEU 1181 1181 LEU LEU A . A 1 1182 GLY 1182 1182 GLY GLY A . A 1 1183 ARG 1183 1183 ARG ARG A . A 1 1184 LEU 1184 1184 LEU LEU A . A 1 1185 ASN 1185 1185 ASN ASN A . A 1 1186 GLU 1186 1186 GLU GLU A . A 1 1187 ALA 1187 1187 ALA ALA A . A 1 1188 GLN 1188 1188 GLN GLN A . A 1 1189 TRP 1189 1189 TRP TRP A . A 1 1190 PRO 1190 1190 PRO PRO A . A 1 1191 GLY 1191 1191 GLY GLY A . A 1 1192 ASP 1192 1192 ASP ASP A . A 1 1193 PHE 1193 1193 PHE PHE A . A 1 1194 SER 1194 1194 SER SER A . A 1 1195 GLU 1195 1195 GLU GLU A . A 1 1196 GLU 1196 1196 GLU GLU A . A 1 1197 LEU 1197 1197 LEU LEU A . A 1 1198 SER 1198 1198 SER SER A . A 1 1199 THR 1199 1199 THR THR A . A 1 1200 LEU 1200 1200 LEU LEU A . A 1 1201 PHE 1201 1201 PHE PHE A . A 1 1202 ARG 1202 1202 ARG ARG A . A 1 1203 LEU 1203 1203 LEU LEU A . A 1 1204 PHE 1204 1204 PHE PHE A . A 1 1205 LEU 1205 1205 LEU LEU A . A 1 1206 ALA 1206 1206 ALA ALA A . A 1 1207 GLU 1207 1207 GLU GLU A . A 1 1208 PRO 1208 1208 PRO PRO A . A 1 1209 HIS 1209 1209 HIS HIS A . A 1 1210 LEU 1210 1210 LEU LEU A . A 1 1211 LEU 1211 1211 LEU LEU A . A 1 1212 GLU 1212 ? ? ? A . A 1 1213 PRO 1213 ? ? ? A . A 1 1214 GLN 1214 ? ? ? A . A 1 1215 LEU 1215 ? ? ? A . A 1 1216 ARG 1216 ? ? ? A . A 1 1217 ALA 1217 ? ? ? A . A 1 1218 CYS 1218 ? ? ? A . A 1 1219 GLU 1219 ? ? ? A . A 1 1220 LEU 1220 ? ? ? A . A 1 1221 MET 1221 ? ? ? A . A 1 1222 GLN 1222 ? ? ? A . A 1 1223 PRO 1223 ? ? ? A . A 1 1224 ASN 1224 ? ? ? A . A 1 1225 ARG 1225 ? ? ? A . A 1 1226 GLY 1226 ? ? ? A . A 1 1227 THR 1227 ? ? ? A . A 1 1228 VAL 1228 ? ? ? A . A 1 1229 LEU 1229 ? ? ? A . A 1 1230 ALA 1230 ? ? ? A . A 1 1231 GLN 1231 ? ? ? A . A 1 1232 SER 1232 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Programmed Cell Death 4, Pdcd4 {PDB ID=2ios, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2ios.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2ios, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GQQPVNHLVKEIDMLLKEYLLSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESAFKMILDLLKS LWKSSTITIDQMKRGYERIYNEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEG DGGRLKPESY ; ;GQQPVNHLVKEIDMLLKEYLLSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESAFKMILDLLKS LWKSSTITIDQMKRGYERIYNEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEG DGGRLKPESY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 44 121 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2ios 2023-08-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1232 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1239 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 110.000 11.268 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAVLESLLREEVPVAAAVRWIARSTPSSEDSSEVAALSALRPLRKEFVPFLLNFLREQSSRVLPQGPSTPAKTPVASAALPARQGAPARGGRGARSQLFPAAEPLSAAAEAPLARRAGRRRGPGPGPSRERGGRGSGAAEEGASGESPPWAGGRKPKGSGSPGSPRLSLSDPPNLSNLEEFPPVGTVPPGSAGRTKPSRRINPTPVSEERSLSKPKTCFTSPPISCVPSSQPSTLDTSPWGLGLPPGCRSLQEEREMLRKARTKQLQQSPTPASPIPESGSPVPSRTGNLTAEPADPARVSSRQRLELVALIYSSCIAENLVPNLFLELFFVLQLLTARRMVATKDSDLESSQGALDSLDTPLFRSIHDCVFFAVQVLEHQFQVLSYLDKGTLKLLAENERLLCFSPALQGRLRAAYEGSVAKVSLVIPPSAQAVSFQPETDNRANFSSDRAFHTFKKQRDVFYEVLREWEDHHEEPSWDFEKGLGSRIRAMMGQLSAACSHSHFVRLFQKQLLQMCQSPGGAGGSVLGEAPDVLNMLGADKLGRLRQLQERLIAPQSSGGPCPPPTFPGCQGFFRDFIMSASSFHFNQHLMDSLSLKIRELNGLRLPQHEPGDEDGESDMDWQGERRQFAVVLLSLRLLAKFLGFVAFLPYRGHEPPPTRELQDSILALRSQVPPVLDIRALLQQGLWARRAVLTVPWLVEFLSFADHIVPLLDYYRSVFTLLLRLHRSLVLSKENEGEMCFLNKLLLLAVLGWLFQIPTVPEDLFFLEDGQVDAFEVTTTASEHGLDSVPVVDQQLLYTCCPYIGELRKLLASWVSGSSGRSGGFVRKITPTTTSSLGALPLQTSQGLQAQLAEAFFHNQPPSLRRTVEFVAERIGSNCVKHIKATLVADLVHQAESLLQEQLVARGQEGGDPAQLLESLCSQLCPHGAQALTQGREFCQRKSPTAVRALLPEETPAAVLSSAENIAVGLATEKACSWLSANITALIRREVKAAVSRMLRAQGPEPTARVERRGCSRACEHHAPLPSHLISEIKDVLSLAAGPRDPEEGVSPEHLEQLLNQMGQSLRCRQFLCPTAEQHLAKCSVELASLLVADQIPILGPPTQHRLERGHARRLLHMLLSLWKDDFQGPVPLQLLLSPRNVGLLADTRP-REWDLLLFLLRELVEKDLMGHLEIEACLGRLNEAQWPG------DFSEELSTLFRLFLAEPHLLEPQLRACELMQPNRGTVLAQS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LVYEAIVMVLESTGESAFKMILDLLKSLWKSSTITIDQMKRGYERIYN-EIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIIS--------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2ios.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 1140 1140 ? A 9.513 -6.305 14.378 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 2 C CA . LEU 1140 1140 ? A 8.561 -5.493 13.533 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 3 C C . LEU 1140 1140 ? A 9.077 -4.219 12.914 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 4 O O . LEU 1140 1140 ? A 9.114 -4.133 11.697 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 5 C CB . LEU 1140 1140 ? A 7.262 -5.210 14.300 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 6 C CG . LEU 1140 1140 ? A 6.214 -4.430 13.467 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 1140 1140 ? A 4.816 -5.032 13.638 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 1140 1140 ? A 6.183 -2.930 13.816 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 9 N N . SER 1141 1141 ? A 9.559 -3.226 13.698 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 10 C CA . SER 1141 1141 ? A 10.236 -2.086 13.125 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 11 C C . SER 1141 1141 ? A 11.399 -2.423 12.150 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 12 O O . SER 1141 1141 ? A 11.444 -1.693 11.169 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 13 C CB . SER 1141 1141 ? A 10.807 -1.227 14.270 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 14 O OG . SER 1141 1141 ? A 9.884 -0.843 15.282 1 1 A SER 0.340 1 ATOM 15 N N . PRO 1142 1142 ? A 12.314 -3.453 12.260 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 16 C CA . PRO 1142 1142 ? A 13.335 -3.754 11.249 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 17 C C . PRO 1142 1142 ? A 12.752 -4.290 9.969 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 18 O O . PRO 1142 1142 ? A 13.210 -3.943 8.889 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 19 C CB . PRO 1142 1142 ? A 14.251 -4.837 11.864 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 20 C CG . PRO 1142 1142 ? A 13.409 -5.495 12.951 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 21 C CD . PRO 1142 1142 ? A 12.483 -4.366 13.394 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 22 N N . ARG 1143 1143 ? A 11.747 -5.174 10.068 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 23 C CA . ARG 1143 1143 ? A 11.059 -5.695 8.911 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 24 C C . ARG 1143 1143 ? A 10.311 -4.617 8.164 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 25 O O . ARG 1143 1143 ? A 10.346 -4.551 6.942 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 26 C CB . ARG 1143 1143 ? A 10.048 -6.784 9.329 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 27 C CG . ARG 1143 1143 ? A 9.317 -7.436 8.132 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 28 C CD . ARG 1143 1143 ? A 7.984 -8.099 8.478 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 29 N NE . ARG 1143 1143 ? A 7.064 -7.003 8.946 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 30 C CZ . ARG 1143 1143 ? A 5.916 -7.208 9.604 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 31 N NH1 . ARG 1143 1143 ? A 5.530 -8.436 9.933 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 32 N NH2 . ARG 1143 1143 ? A 5.151 -6.166 9.915 1 1 A ARG 0.500 1 ATOM 33 N N . ASN 1144 1144 ? A 9.623 -3.730 8.903 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 34 C CA . ASN 1144 1144 ? A 8.907 -2.621 8.330 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 35 C C . ASN 1144 1144 ? A 9.816 -1.650 7.606 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 36 O O . ASN 1144 1144 ? A 9.591 -1.339 6.451 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 37 C CB . ASN 1144 1144 ? A 8.169 -1.908 9.470 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 38 C CG . ASN 1144 1144 ? A 6.943 -2.710 9.863 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 39 O OD1 . ASN 1144 1144 ? A 6.670 -3.843 9.451 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 40 N ND2 . ASN 1144 1144 ? A 6.152 -2.080 10.755 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 41 N N . VAL 1145 1145 ? A 10.924 -1.199 8.213 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 42 C CA . VAL 1145 1145 ? A 11.860 -0.317 7.534 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 43 C C . VAL 1145 1145 ? A 12.544 -0.945 6.322 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 44 O O . VAL 1145 1145 ? A 12.817 -0.260 5.340 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 45 C CB . VAL 1145 1145 ? A 12.906 0.254 8.469 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 46 C CG1 . VAL 1145 1145 ? A 12.238 1.120 9.554 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 47 C CG2 . VAL 1145 1145 ? A 13.694 -0.901 9.106 1 1 A VAL 0.620 1 ATOM 48 N N . GLY 1146 1146 ? A 12.810 -2.275 6.352 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 49 C CA . GLY 1146 1146 ? A 13.256 -3.046 5.196 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 50 C C . GLY 1146 1146 ? A 12.230 -3.112 4.090 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 51 O O . GLY 1146 1146 ? A 12.584 -3.121 2.923 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 52 N N . LEU 1147 1147 ? A 10.926 -3.129 4.439 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 53 C CA . LEU 1147 1147 ? A 9.841 -2.940 3.485 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 54 C C . LEU 1147 1147 ? A 9.580 -1.524 3.014 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 55 O O . LEU 1147 1147 ? A 8.884 -1.335 2.042 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 56 C CB . LEU 1147 1147 ? A 8.430 -3.306 3.990 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 57 C CG . LEU 1147 1147 ? A 8.160 -4.778 4.267 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 58 C CD1 . LEU 1147 1147 ? A 6.782 -4.868 4.941 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 59 C CD2 . LEU 1147 1147 ? A 8.198 -5.606 2.971 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 60 N N . LEU 1148 1148 ? A 10.089 -0.474 3.688 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 61 C CA . LEU 1148 1148 ? A 10.215 0.805 3.045 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 62 C C . LEU 1148 1148 ? A 11.317 0.839 2.023 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 63 O O . LEU 1148 1148 ? A 11.119 1.353 0.932 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 64 C CB . LEU 1148 1148 ? A 10.475 1.914 4.072 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 65 C CG . LEU 1148 1148 ? A 10.744 3.310 3.482 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 66 C CD1 . LEU 1148 1148 ? A 10.346 4.267 4.576 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 67 C CD2 . LEU 1148 1148 ? A 12.203 3.659 3.127 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 68 N N . ALA 1149 1149 ? A 12.514 0.318 2.365 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 69 C CA . ALA 1149 1149 ? A 13.684 0.466 1.529 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 70 C C . ALA 1149 1149 ? A 13.565 -0.229 0.184 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 71 O O . ALA 1149 1149 ? A 13.175 -1.394 0.121 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 72 C CB . ALA 1149 1149 ? A 14.883 -0.088 2.298 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 73 N N . ASP 1150 1150 ? A 13.831 0.506 -0.917 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 74 C CA . ASP 1150 1150 ? A 13.764 0.007 -2.280 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 75 C C . ASP 1150 1150 ? A 12.328 -0.201 -2.756 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 76 O O . ASP 1150 1150 ? A 12.073 -0.699 -3.856 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 77 C CB . ASP 1150 1150 ? A 14.621 -1.272 -2.541 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 78 C CG . ASP 1150 1150 ? A 16.082 -1.016 -2.230 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 79 O OD1 . ASP 1150 1150 ? A 16.610 0.006 -2.736 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 80 O OD2 . ASP 1150 1150 ? A 16.695 -1.862 -1.530 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 81 N N . THR 1151 1151 ? A 11.323 0.203 -1.951 1 1 A THR 0.560 1 ATOM 82 C CA . THR 1151 1151 ? A 9.926 0.045 -2.307 1 1 A THR 0.560 1 ATOM 83 C C . THR 1151 1151 ? A 9.355 1.368 -2.743 1 1 A THR 0.560 1 ATOM 84 O O . THR 1151 1151 ? A 10.029 2.349 -3.026 1 1 A THR 0.560 1 ATOM 85 C CB . THR 1151 1151 ? 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A 18.755 2.664 22.251 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 322 O OE1 . GLU 1178 1178 ? A 17.963 2.781 23.223 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 323 O OE2 . GLU 1178 1178 ? A 19.999 2.835 22.325 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 324 N N . ALA 1179 1179 ? A 16.510 -0.612 19.313 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 325 C CA . ALA 1179 1179 ? A 17.130 -1.849 18.860 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 326 C C . ALA 1179 1179 ? A 16.892 -2.120 17.397 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 327 O O . ALA 1179 1179 ? A 17.753 -2.551 16.632 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 328 C CB . ALA 1179 1179 ? A 16.563 -3.047 19.656 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 329 N N . CYS 1180 1180 ? A 15.664 -1.866 16.972 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 330 C CA . CYS 1180 1180 ? A 15.244 -2.042 15.622 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 331 C C . CYS 1180 1180 ? A 15.822 -1.091 14.602 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 332 O O . CYS 1180 1180 ? A 16.194 -1.507 13.506 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 333 C CB . CYS 1180 1180 ? A 13.750 -1.860 15.649 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 334 S SG . CYS 1180 1180 ? A 12.919 -3.180 16.626 1 1 A CYS 0.600 1 ATOM 335 N N . LEU 1181 1181 ? A 15.917 0.210 14.944 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 336 C CA . LEU 1181 1181 ? A 16.672 1.148 14.151 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 337 C C . LEU 1181 1181 ? A 18.145 0.786 14.123 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 338 O O . LEU 1181 1181 ? A 18.783 0.820 13.077 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 339 C CB . LEU 1181 1181 ? A 16.515 2.585 14.672 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 340 C CG . LEU 1181 1181 ? A 17.253 3.606 13.785 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 341 C CD1 . LEU 1181 1181 ? A 16.559 3.795 12.427 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 342 C CD2 . LEU 1181 1181 ? A 17.374 4.947 14.497 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 343 N N . GLY 1182 1182 ? A 18.722 0.376 15.272 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 344 C CA . GLY 1182 1182 ? A 20.100 -0.095 15.334 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 345 C C . GLY 1182 1182 ? A 20.435 -1.260 14.429 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 346 O O . GLY 1182 1182 ? A 21.500 -1.286 13.824 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 347 N N . ARG 1183 1183 ? A 19.503 -2.221 14.259 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 348 C CA . ARG 1183 1183 ? 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A 20.620 -0.645 8.879 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 362 C CB . LEU 1184 1184 ? A 17.616 -0.283 10.136 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 363 C CG . LEU 1184 1184 ? A 17.437 0.241 8.712 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 364 C CD1 . LEU 1184 1184 ? A 17.082 -0.881 7.739 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 365 C CD2 . LEU 1184 1184 ? A 16.323 1.267 8.685 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 366 N N . ASN 1185 1185 ? A 20.499 0.311 10.932 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 367 C CA . ASN 1185 1185 ? A 21.725 1.081 10.857 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 368 C C . ASN 1185 1185 ? A 22.906 0.200 10.612 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 369 O O . ASN 1185 1185 ? A 23.730 0.503 9.751 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 370 C CB . ASN 1185 1185 ? A 22.050 1.819 12.175 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 371 C CG . ASN 1185 1185 ? A 21.078 2.958 12.391 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 372 O OD1 . ASN 1185 1185 ? A 20.426 3.463 11.479 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 373 N ND2 . ASN 1185 1185 ? A 20.984 3.415 13.661 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 374 N N . GLU 1186 1186 ? A 22.998 -0.941 11.328 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 375 C CA . GLU 1186 1186 ? A 24.043 -1.847 10.930 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 376 C C . GLU 1186 1186 ? A 23.919 -3.332 11.186 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 377 O O . GLU 1186 1186 ? A 23.291 -3.817 12.118 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 378 C CB . GLU 1186 1186 ? A 25.425 -1.366 11.425 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 379 C CG . GLU 1186 1186 ? A 25.584 -1.359 12.959 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 380 C CD . GLU 1186 1186 ? A 26.877 -0.678 13.401 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 381 O OE1 . GLU 1186 1186 ? A 27.683 -0.277 12.521 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 382 O OE2 . GLU 1186 1186 ? A 27.054 -0.550 14.639 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 383 N N . ALA 1187 1187 ? A 24.524 -4.174 10.315 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 384 C CA . ALA 1187 1187 ? A 25.234 -3.856 9.075 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 385 C C . ALA 1187 1187 ? A 24.465 -4.273 7.810 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 386 O O . ALA 1187 1187 ? A 25.058 -4.683 6.826 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 387 C CB . ALA 1187 1187 ? A 26.745 -4.200 9.082 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 388 N N . GLN 1188 1188 ? A 23.109 -4.147 7.799 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 389 C CA . GLN 1188 1188 ? A 22.314 -4.272 6.577 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 390 C C . GLN 1188 1188 ? A 22.061 -2.942 5.877 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 391 O O . GLN 1188 1188 ? A 21.607 -2.915 4.742 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 392 C CB . GLN 1188 1188 ? A 20.928 -4.886 6.885 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 393 C CG . GLN 1188 1188 ? A 20.994 -6.291 7.526 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 394 C CD . GLN 1188 1188 ? A 21.686 -7.294 6.601 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 395 O OE1 . GLN 1188 1188 ? A 21.269 -7.508 5.466 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 396 N NE2 . GLN 1188 1188 ? A 22.755 -7.966 7.089 1 1 A GLN 0.460 1 ATOM 397 N N . TRP 1189 1189 ? A 22.366 -1.785 6.512 1 1 A TRP 0.450 1 ATOM 398 C CA . TRP 1189 1189 ? A 22.440 -0.515 5.795 1 1 A TRP 0.450 1 ATOM 399 C C . TRP 1189 1189 ? A 23.559 -0.479 4.737 1 1 A TRP 0.450 1 ATOM 400 O O . TRP 1189 1189 ? A 23.288 0.002 3.638 1 1 A TRP 0.450 1 ATOM 401 C CB . TRP 1189 1189 ? A 22.484 0.715 6.749 1 1 A TRP 0.450 1 ATOM 402 C CG . 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ASP 1192 1192 ? A 21.317 -4.005 1.346 1 1 A ASP 0.380 1 ATOM 430 N N . PHE 1193 1193 ? A 20.608 1.088 0.417 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 431 C CA . PHE 1193 1193 ? A 19.873 2.332 0.407 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 432 C C . PHE 1193 1193 ? A 20.520 3.206 1.439 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 433 O O . PHE 1193 1193 ? A 21.099 2.743 2.412 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 434 C CB . PHE 1193 1193 ? A 18.335 2.202 0.700 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 435 C CG . PHE 1193 1193 ? A 18.057 1.451 1.980 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 436 C CD1 . PHE 1193 1193 ? A 18.299 0.077 2.007 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 437 C CD2 . PHE 1193 1193 ? A 17.538 2.055 3.137 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 438 C CE1 . PHE 1193 1193 ? A 18.148 -0.671 3.166 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 439 C CE2 . PHE 1193 1193 ? A 17.306 1.303 4.299 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 440 C CZ . PHE 1193 1193 ? A 17.629 -0.059 4.302 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 441 N N . SER 1194 1194 ? A 20.468 4.525 1.237 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 442 C CA . SER 1194 1194 ? A 21.124 5.452 2.137 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 443 C C . SER 1194 1194 ? A 20.291 6.685 2.241 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 444 O O . SER 1194 1194 ? A 19.852 7.080 3.319 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 445 C CB . SER 1194 1194 ? A 22.595 5.767 1.737 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 446 O OG . SER 1194 1194 ? A 22.686 6.250 0.397 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 447 N N . GLU 1195 1195 ? A 20.015 7.271 1.075 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 448 C CA . GLU 1195 1195 ? A 19.143 8.389 0.841 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 449 C C . GLU 1195 1195 ? A 17.702 8.181 1.290 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 450 O O . GLU 1195 1195 ? A 17.117 9.040 1.937 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 451 C CB . GLU 1195 1195 ? A 19.226 8.672 -0.665 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 452 C CG . GLU 1195 1195 ? A 20.653 9.084 -1.103 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 453 C CD . GLU 1195 1195 ? A 20.740 9.287 -2.612 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 454 O OE1 . GLU 1195 1195 ? A 19.754 8.960 -3.318 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 455 O OE2 . GLU 1195 1195 ? A 21.815 9.761 -3.056 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 456 N N . GLU 1196 1196 ? A 17.088 7.013 1.025 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 457 C CA . GLU 1196 1196 ? A 15.771 6.695 1.551 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 458 C C . GLU 1196 1196 ? A 15.713 6.493 3.051 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 459 O O . GLU 1196 1196 ? A 14.761 6.860 3.733 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 460 C CB . GLU 1196 1196 ? A 15.229 5.429 0.895 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 461 C CG . GLU 1196 1196 ? A 14.951 5.614 -0.606 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 462 C CD . GLU 1196 1196 ? A 14.436 4.317 -1.218 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 463 O OE1 . GLU 1196 1196 ? A 14.436 3.273 -0.512 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 464 O OE2 . GLU 1196 1196 ? A 14.036 4.384 -2.404 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 465 N N . LEU 1197 1197 ? A 16.758 5.875 3.633 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 466 C CA . LEU 1197 1197 ? A 16.854 5.768 5.068 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 467 C C . LEU 1197 1197 ? A 16.998 7.102 5.773 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 468 O O . LEU 1197 1197 ? A 16.373 7.355 6.803 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 469 C CB . LEU 1197 1197 ? A 18.058 4.903 5.486 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 470 C CG . LEU 1197 1197 ? A 18.193 4.749 7.008 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 471 C CD1 . LEU 1197 1197 ? A 16.873 4.220 7.556 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 472 C CD2 . LEU 1197 1197 ? A 19.330 3.795 7.362 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 473 N N . SER 1198 1198 ? A 17.834 8.001 5.215 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 474 C CA . SER 1198 1198 ? A 18.058 9.324 5.771 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 475 C C . SER 1198 1198 ? A 16.779 10.127 5.807 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 476 O O . SER 1198 1198 ? A 16.452 10.740 6.820 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 477 C CB . SER 1198 1198 ? A 19.177 10.144 5.047 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 478 O OG . SER 1198 1198 ? A 18.808 10.627 3.752 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 479 N N . THR 1199 1199 ? A 15.985 10.093 4.719 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 480 C CA . THR 1199 1199 ? A 14.693 10.745 4.655 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 481 C C . THR 1199 1199 ? A 13.691 10.166 5.633 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 482 O O . THR 1199 1199 ? A 13.001 10.912 6.326 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 483 C CB . THR 1199 1199 ? A 14.096 10.772 3.257 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 484 O OG1 . THR 1199 1199 ? A 13.946 9.470 2.719 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 485 C CG2 . THR 1199 1199 ? A 14.988 11.544 2.281 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 486 N N . LEU 1200 1200 ? A 13.627 8.827 5.765 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 487 C CA . LEU 1200 1200 ? A 12.799 8.149 6.740 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 488 C C . LEU 1200 1200 ? A 13.130 8.476 8.191 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 489 O O . LEU 1200 1200 ? A 12.250 8.835 8.974 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 490 C CB . LEU 1200 1200 ? A 12.930 6.625 6.526 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 491 C CG . LEU 1200 1200 ? A 12.183 5.770 7.559 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 492 C CD1 . LEU 1200 1200 ? A 10.664 6.053 7.502 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 493 C CD2 . LEU 1200 1200 ? A 12.617 4.295 7.477 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 494 N N . PHE 1201 1201 ? A 14.421 8.414 8.579 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 495 C CA . PHE 1201 1201 ? A 14.889 8.747 9.910 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 496 C C . PHE 1201 1201 ? A 14.578 10.202 10.266 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 497 O O . PHE 1201 1201 ? A 14.099 10.512 11.354 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 498 C CB . PHE 1201 1201 ? A 16.411 8.438 9.965 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 499 C CG . PHE 1201 1201 ? A 17.062 8.845 11.262 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 500 C CD1 . PHE 1201 1201 ? A 17.752 10.065 11.354 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 501 C CD2 . PHE 1201 1201 ? A 16.941 8.052 12.411 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 502 C CE1 . PHE 1201 1201 ? A 18.312 10.482 12.566 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 503 C CE2 . PHE 1201 1201 ? A 17.496 8.471 13.628 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 504 C CZ . PHE 1201 1201 ? A 18.187 9.682 13.704 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 505 N N . ARG 1202 1202 ? A 14.788 11.130 9.311 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 506 C CA . ARG 1202 1202 ? A 14.433 12.528 9.473 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 507 C C . ARG 1202 1202 ? A 12.948 12.777 9.668 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 508 O O . ARG 1202 1202 ? A 12.555 13.580 10.510 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 509 C CB . ARG 1202 1202 ? A 14.853 13.353 8.245 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 510 C CG . ARG 1202 1202 ? A 16.368 13.562 8.114 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 511 C CD . ARG 1202 1202 ? A 16.688 14.233 6.781 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 512 N NE . ARG 1202 1202 ? A 18.176 14.349 6.676 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 513 C CZ . ARG 1202 1202 ? A 18.806 14.800 5.583 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 514 N NH1 . ARG 1202 1202 ? A 18.125 15.185 4.509 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 515 N NH2 . ARG 1202 1202 ? A 20.134 14.884 5.563 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 516 N N . LEU 1203 1203 ? A 12.085 12.089 8.895 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 517 C CA . LEU 1203 1203 ? A 10.648 12.136 9.069 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 518 C C . LEU 1203 1203 ? A 10.225 11.591 10.401 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 519 O O . LEU 1203 1203 ? A 9.422 12.210 11.070 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 520 C CB . LEU 1203 1203 ? A 9.898 11.446 7.913 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 521 C CG . LEU 1203 1203 ? A 9.405 12.449 6.849 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 522 C CD1 . LEU 1203 1203 ? A 10.528 13.335 6.279 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 523 C CD2 . LEU 1203 1203 ? A 8.705 11.684 5.722 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 524 N N . PHE 1204 1204 ? A 10.794 10.469 10.874 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 525 C CA . PHE 1204 1204 ? A 10.520 9.995 12.219 1 1 A PHE 0.570 1 ATOM 526 C C . 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A 13.955 13.012 13.705 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 540 C CG . LEU 1205 1205 ? A 14.552 14.151 14.553 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 541 C CD1 . LEU 1205 1205 ? A 14.638 13.759 16.038 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 542 C CD2 . LEU 1205 1205 ? A 15.919 14.568 13.997 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 543 N N . ALA 1206 1206 ? A 11.240 14.343 12.939 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 544 C CA . ALA 1206 1206 ? A 10.268 15.412 12.804 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 545 C C . ALA 1206 1206 ? A 8.881 14.981 13.314 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 546 O O . ALA 1206 1206 ? A 8.102 15.778 13.821 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 547 C CB . ALA 1206 1206 ? A 10.114 15.854 11.333 1 1 A ALA 0.540 1 ATOM 548 N N . GLU 1207 1207 ? A 8.560 13.679 13.201 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 549 C CA . GLU 1207 1207 ? A 7.368 13.056 13.807 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 550 C C . GLU 1207 1207 ? A 7.584 12.599 15.202 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 551 O O . GLU 1207 1207 ? A 7.654 11.400 15.356 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 552 C CB . GLU 1207 1207 ? A 6.861 11.829 12.993 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 553 C CG . 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A 16.937 12.414 19.130 1 1 A LEU 0.170 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #