data_SMR-1c6fd956dbe99f017e2c85d6ce36d258_5 _entry.id SMR-1c6fd956dbe99f017e2c85d6ce36d258_5 _struct.entry_id SMR-1c6fd956dbe99f017e2c85d6ce36d258_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A0E8NQ10/ A0A0E8NQ10_MYCTX, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme - A0A0H3L8Z0/ A0A0H3L8Z0_MYCTE, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme - A5U1U6/ KGD_MYCTA, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme - P9WIS4/ KGD_MYCTO, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme - P9WIS5/ KGD_MYCTU, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme Estimated model accuracy of this model is 0.371, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A0E8NQ10, A0A0H3L8Z0, A5U1U6, P9WIS4, P9WIS5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 158233.365 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KGD_MYCTA A5U1U6 1 ;MANISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTSQPAAEPTRVTSPLVAERAAAAAPQ APPKPADTAAAGNGVVAALAAKTAVPPPAEGDEVAVLRGAAAAVVKNMSASLEVPTATSVRAVPAKLLID NRIVINNQLKRTRGGKISFTHLLGYALVQAVKKFPNMNRHYTEVDGKPTAVTPAHTNLGLAIDLQGKDGK RSLVVAGIKRCETMRFAQFVTAYEDIVRRARDGKLTTEDFAGVTISLTNPGTIGTVHSVPRLMPGQGAII 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metabolism enzyme' 2 1 UNP KGD_MYCTO P9WIS4 1 ;MANISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTSQPAAEPTRVTSPLVAERAAAAAPQ APPKPADTAAAGNGVVAALAAKTAVPPPAEGDEVAVLRGAAAAVVKNMSASLEVPTATSVRAVPAKLLID NRIVINNQLKRTRGGKISFTHLLGYALVQAVKKFPNMNRHYTEVDGKPTAVTPAHTNLGLAIDLQGKDGK RSLVVAGIKRCETMRFAQFVTAYEDIVRRARDGKLTTEDFAGVTISLTNPGTIGTVHSVPRLMPGQGAII GVGAMEYPAEFQGASEERIAELGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHELLLSDGFWDEVFRELSI PYLPVRWSTDNPDSIVDKNARVMNLIAAYRNRGHLMADTDPLRLDKARFRSHPDLEVLTHGLTLWDLDRV FKVDGFAGAQYKKLRDVLGLLRDAYCRHIGVEYAHILDPEQKEWLEQRVETKHVKPTVAQQKYILSKLNA AEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAESVIPMMDAAIDQCAEHGLDEVVIGMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIF TEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGLYLQMFGDNDIQVSLTANPSHLEAVDPVLEGLVRAKQDLLDHGS IDSDGQRAFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLANLPGYRVGGTIHIIVNNQIGFTTAPEYSRSSEYCT DVAKMIGAPIFHVNGDDPEACVWVARLAVDFRQRFKKDVVIDMLCYRRRGHNEGDDPSMTNPYVYDVVDT KRGARKSYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHGVQPSESVESDQMIPAGLATAVD KSLLARIGDAFLALPNGFTAHPRVQPVLEKRREMAYEGKIDWAFGELLALGSLVAEGKLVRLSGQDSRRG 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_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A0A0H3L8Z0_MYCTE A0A0H3L8Z0 . 1 1231 652616 'Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 35801 / TMC 107 / Erdman)' 2015-09-16 96C255612BA12889 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no M ;MANISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTSQPAAEPTRVTSPLVAERAAAAAPQ APPKPADTAAAGNGVVAALAAKTAVPPPAEGDEVAVLRGAAAAVVKNMSASLEVPTATSVRAVPAKLLID NRIVINNQLKRTRGGKISFTHLLGYALVQAVKKFPNMNRHYTEVDGKPTAVTPAHTNLGLAIDLQGKDGK RSLVVAGIKRCETMRFAQFVTAYEDIVRRARDGKLTTEDFAGVTISLTNPGTIGTVHSVPRLMPGQGAII GVGAMEYPAEFQGASEERIAELGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHELLLSDGFWDEVFRELSI PYLPVRWSTDNPDSIVDKNARVMNLIAAYRNRGHLMADTDPLRLDKARFRSHPDLEVLTHGLTLWDLDRV FKVDGFAGAQYKKLRDVLGLLRDAYCRHIGVEYAHILDPEQKEWLEQRVETKHVKPTVAQQKYILSKLNA AEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAESVIPMMDAAIDQCAEHGLDEVVIGMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIF 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M . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme {PDB ID=8p5r, label_asym_id=M, auth_asym_id=N, SMTL ID=8p5r.1.M}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8p5r, label_asym_id=M' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A M 1 1 N # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASVSSSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTD SASNGRTTTAAPVTPPTPAPAPAPEPKAAPKPAAKTEAKPAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMN ASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPT AITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTN PGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLR TIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRF RSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERV ETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAM PHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLE AVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEEGSDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVN NQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGH NEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEP SESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALG SLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVG FEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIER FLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEP MYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWV QEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASVSSSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTD SASNGRTTTAAPVTPPTPAPAPAPEPKAAPKPAAKTEAKPAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMN ASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPT AITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTN PGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLR TIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRF RSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERV ETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAM PHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLE AVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEEGSDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVN NQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGH NEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEP SESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALG SLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVG FEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIER FLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEP MYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWV QEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 26 1250 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8p5r 2023-08-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1231 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1231 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2e-234 84.408 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MANISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTSQPAAEPTRVTSPLVAERAAAAAPQAPPKPADTAAAGNGVVAALAAKTAVPPPAEGDEVAVLRGAAAAVVKNMSASLEVPTATSVRAVPAKLLIDNRIVINNQLKRTRGGKISFTHLLGYALVQAVKKFPNMNRHYTEVDGKPTAVTPAHTNLGLAIDLQGKDGKRSLVVAGIKRCETMRFAQFVTAYEDIVRRARDGKLTTEDFAGVTISLTNPGTIGTVHSVPRLMPGQGAIIGVGAMEYPAEFQGASEERIAELGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHELLLSDGFWDEVFRELSIPYLPVRWSTDNPDSIVDKNARVMNLIAAYRNRGHLMADTDPLRLDKARFRSHPDLEVLTHGLTLWDLDRVFKVDGFAGAQYKKLRDVLGLLRDAYCRHIGVEYAHILDPEQKEWLEQRVETKHVKPTVAQQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAESVIPMMDAAIDQCAEHGLDEVVIGMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIFTEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGLYLQMFGDNDIQVSLTANPSHLEAVDPVLEGLVRAKQDLLDHGSIDSDGQRAFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLANLPGYRVGGTIHIIVNNQIGFTTAPEYSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACVWVARLAVDFRQRFKKDVVIDMLCYRRRGHNEGDDPSMTNPYVYDVVDTKRGARKSYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHGVQPSESVESDQMIPAGLATAVDKSLLARIGDAFLALPNGFTAHPRVQPVLEKRREMAYEGKIDWAFGELLALGSLVAEGKLVRLSGQDSRRGTFSQRHSVLIDRHTGEEFTPLQLLATNSDGSPTGGKFLVYDSPLSEYAAVGFEYGYTVGNPDAVVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSNVVLLLPHGHEGQGPDHTSARIERFLQLWAEGSMTIAMPSTPSNYFHLLRRHALDGIQRPLIVFTPKSMLRHKAAVSEIKDFTEIKFRSVLEEPTYEDGIGDRNKVSRILLTSGKLYYELAARKAKDNRNDLAIVRLEQLAPLPRRRLRETLDRYENVKEFFWVQEEPANQGAWPRFGLELPELLPDKLAGIKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDEAFG 2 1 2 --SSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTDSAS-NGRTTTAAPVTPPTPAPAPA-PEPKAAPKPAAKTEAKPAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMNASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPTAITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTNPGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRFRSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERVETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLEAVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEEG--SDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVNNQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGHNEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEPSESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALGSLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVGFEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIERFLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEPMYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWVQEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.270}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8p5r.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 12 12 ? A 148.923 -124.474 -3.193 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 2 C CA . GLU 12 12 ? A 147.700 -123.860 -2.569 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 3 C C . GLU 12 12 ? A 147.281 -124.559 -1.292 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 4 O O . GLU 12 12 ? A 147.716 -124.114 -0.228 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 5 C CB . GLU 12 12 ? A 146.573 -123.855 -3.601 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 6 C CG . GLU 12 12 ? A 145.285 -123.118 -3.168 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 7 C CD . GLU 12 12 ? A 144.092 -123.694 -3.937 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 12 12 ? A 142.945 -123.421 -3.526 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 12 12 ? A 144.349 -124.455 -4.906 1 1 M GLU 0.330 1 ATOM 10 N N . TRP 13 13 ? A 146.539 -125.665 -1.285 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 11 C CA . TRP 13 13 ? A 146.184 -126.393 -0.075 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 12 C C . TRP 13 13 ? A 147.283 -127.327 0.407 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 13 O O . TRP 13 13 ? A 147.856 -127.177 1.485 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 14 C CB . TRP 13 13 ? A 144.909 -127.197 -0.436 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 15 C CG . TRP 13 13 ? A 144.333 -128.105 0.641 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 16 C CD1 . TRP 13 13 ? A 144.126 -127.790 1.950 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 17 C CD2 . TRP 13 13 ? A 144.059 -129.499 0.485 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 18 N NE1 . TRP 13 13 ? A 143.738 -128.913 2.626 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 19 C CE2 . TRP 13 13 ? A 143.679 -129.984 1.787 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 20 C CE3 . TRP 13 13 ? A 144.125 -130.369 -0.592 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 21 C CZ2 . TRP 13 13 ? A 143.378 -131.319 1.973 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 22 C CZ3 . TRP 13 13 ? A 143.827 -131.717 -0.386 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 23 C CH2 . TRP 13 13 ? A 143.462 -132.192 0.886 1 1 M TRP 0.370 1 ATOM 24 N N . LEU 14 14 ? A 147.719 -128.289 -0.423 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 25 C CA . LEU 14 14 ? A 148.643 -129.330 0.011 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 26 C C . LEU 14 14 ? A 150.095 -128.851 0.143 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 27 O O . LEU 14 14 ? A 151.006 -129.600 0.457 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 28 C CB . LEU 14 14 ? A 148.448 -130.593 -0.872 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 29 C CG . LEU 14 14 ? A 148.297 -131.910 -0.067 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 30 C CD1 . LEU 14 14 ? A 147.153 -132.005 0.953 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 31 C CD2 . LEU 14 14 ? A 148.303 -133.184 -0.912 1 1 M LEU 0.610 1 ATOM 32 N N . VAL 15 15 ? A 150.341 -127.540 -0.005 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 33 C CA . VAL 15 15 ? A 151.606 -126.889 0.275 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 34 C C . VAL 15 15 ? A 151.812 -126.707 1.772 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 35 O O . VAL 15 15 ? A 152.936 -126.653 2.263 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 36 C CB . VAL 15 15 ? A 151.696 -125.578 -0.509 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 37 C CG1 . VAL 15 15 ? A 150.734 -124.521 0.035 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 38 C CG2 . VAL 15 15 ? A 153.130 -125.046 -0.536 1 1 M VAL 0.630 1 ATOM 39 N N . GLU 16 16 ? A 150.711 -126.667 2.543 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 40 C CA . GLU 16 16 ? A 150.774 -126.479 3.967 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 41 C C . GLU 16 16 ? A 150.135 -127.654 4.666 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 42 O O . GLU 16 16 ? A 150.716 -128.223 5.599 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 43 C CB . GLU 16 16 ? A 150.167 -125.101 4.353 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 44 C CG . GLU 16 16 ? A 148.933 -124.603 3.549 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 45 C CD . GLU 16 16 ? A 147.592 -125.000 4.174 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 46 O OE1 . GLU 16 16 ? A 147.607 -125.385 5.372 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 47 O OE2 . GLU 16 16 ? A 146.564 -124.921 3.469 1 1 M GLU 0.700 1 ATOM 48 N N . GLU 17 17 ? A 148.994 -128.147 4.191 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 49 C CA . GLU 17 17 ? A 148.307 -129.253 4.808 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 50 C C . GLU 17 17 ? A 149.066 -130.578 4.908 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 51 O O . GLU 17 17 ? A 149.159 -131.141 5.999 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 52 C CB . GLU 17 17 ? A 146.936 -129.364 4.132 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 53 C CG . GLU 17 17 ? A 146.046 -130.497 4.646 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 54 C CD . GLU 17 17 ? A 145.682 -130.297 6.113 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 55 O OE1 . GLU 17 17 ? A 145.436 -129.149 6.554 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 56 O OE2 . GLU 17 17 ? A 145.688 -131.341 6.806 1 1 M GLU 0.770 1 ATOM 57 N N . MET 18 18 ? A 149.726 -131.102 3.836 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 58 C CA . MET 18 18 ? A 150.460 -132.357 3.972 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 59 C C . MET 18 18 ? A 151.775 -132.205 4.644 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 60 O O . MET 18 18 ? A 152.327 -133.197 5.119 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 61 C CB . MET 18 18 ? A 150.690 -133.206 2.702 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 62 C CG . MET 18 18 ? A 151.596 -132.600 1.644 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 63 S SD . MET 18 18 ? A 151.807 -133.574 0.127 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 64 C CE . MET 18 18 ? A 152.767 -132.195 -0.532 1 1 M MET 0.780 1 ATOM 65 N N . TYR 19 19 ? A 152.313 -130.993 4.777 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 66 C CA . TYR 19 19 ? A 153.494 -130.756 5.572 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 67 C C . TYR 19 19 ? A 153.247 -131.173 7.026 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 68 O O . TYR 19 19 ? A 154.052 -131.894 7.615 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 69 C CB . TYR 19 19 ? A 153.915 -129.275 5.401 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 70 C CG . TYR 19 19 ? A 155.222 -129.017 6.087 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 71 C CD1 . TYR 19 19 ? A 156.390 -129.679 5.679 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 72 C CD2 . TYR 19 19 ? A 155.256 -128.219 7.239 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 73 C CE1 . TYR 19 19 ? A 157.539 -129.655 6.480 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 74 C CE2 . TYR 19 19 ? A 156.397 -128.177 8.033 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 75 C CZ . TYR 19 19 ? A 157.515 -128.925 7.677 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 76 O OH . TYR 19 19 ? A 158.565 -128.904 8.629 1 1 M TYR 0.760 1 ATOM 77 N N . ARG 20 20 ? A 152.076 -130.851 7.609 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 78 C CA . ARG 20 20 ? A 151.670 -131.415 8.890 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 79 C C . ARG 20 20 ? A 151.448 -132.917 8.837 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 80 O O . ARG 20 20 ? A 151.995 -133.665 9.658 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 81 C CB . ARG 20 20 ? A 150.451 -130.653 9.467 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 82 C CG . ARG 20 20 ? A 150.806 -129.184 9.799 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 83 C CD . ARG 20 20 ? A 149.665 -128.350 10.408 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 84 N NE . ARG 20 20 ? A 148.654 -128.010 9.332 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 85 C CZ . ARG 20 20 ? A 148.643 -126.941 8.507 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 86 N NH1 . ARG 20 20 ? A 149.543 -125.969 8.610 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 87 N NH2 . ARG 20 20 ? A 147.714 -126.865 7.554 1 1 M ARG 0.790 1 ATOM 88 N N . LYS 21 21 ? A 150.780 -133.436 7.801 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 89 C CA . LYS 21 21 ? A 150.471 -134.844 7.678 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 90 C C . LYS 21 21 ? A 151.686 -135.735 7.447 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 91 O O . LYS 21 21 ? A 151.573 -136.943 7.472 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 92 C CB . LYS 21 21 ? A 149.501 -135.127 6.508 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 93 C CG . LYS 21 21 ? A 148.119 -134.459 6.574 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 94 C CD . LYS 21 21 ? A 147.447 -134.507 5.192 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 95 C CE . LYS 21 21 ? A 145.947 -134.224 5.167 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 96 N NZ . LYS 21 21 ? A 145.551 -133.975 3.765 1 1 M LYS 0.830 1 ATOM 97 N N . PHE 22 22 ? A 152.858 -135.144 7.167 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 98 C CA . PHE 22 22 ? A 154.103 -135.854 6.978 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 99 C C . PHE 22 22 ? A 155.024 -135.635 8.166 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 100 O O . PHE 22 22 ? A 155.703 -136.565 8.605 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 101 C CB . PHE 22 22 ? A 154.681 -135.303 5.644 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 102 C CG . PHE 22 22 ? A 156.166 -135.310 5.489 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 103 C CD1 . PHE 22 22 ? A 156.882 -134.125 5.731 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 104 C CD2 . PHE 22 22 ? A 156.853 -136.476 5.143 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 105 C CE1 . PHE 22 22 ? A 158.275 -134.115 5.663 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 106 C CE2 . PHE 22 22 ? A 158.250 -136.480 5.102 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 107 C CZ . PHE 22 22 ? A 158.955 -135.301 5.375 1 1 M PHE 0.800 1 ATOM 108 N N . ARG 23 23 ? A 155.078 -134.420 8.738 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 109 C CA . ARG 23 23 ? A 155.944 -134.122 9.865 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 110 C C . ARG 23 23 ? A 155.540 -134.837 11.143 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 111 O O . ARG 23 23 ? A 156.372 -135.410 11.843 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 112 C CB . ARG 23 23 ? A 155.975 -132.593 10.090 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 113 C CG . ARG 23 23 ? A 157.045 -132.117 11.089 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 114 C CD . ARG 23 23 ? A 156.950 -130.655 11.521 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 115 N NE . ARG 23 23 ? A 155.692 -130.572 12.320 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 116 C CZ . ARG 23 23 ? A 154.541 -130.007 11.951 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 117 N NH1 . ARG 23 23 ? A 154.438 -129.333 10.811 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 118 N NH2 . ARG 23 23 ? A 153.471 -130.225 12.670 1 1 M ARG 0.780 1 ATOM 119 N N . ASP 24 24 ? A 154.237 -134.827 11.455 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 120 C CA . ASP 24 24 ? A 153.670 -135.522 12.583 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 121 C C . ASP 24 24 ? A 153.602 -137.046 12.332 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 122 O O . ASP 24 24 ? A 153.968 -137.832 13.208 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 123 C CB . ASP 24 24 ? A 152.354 -134.780 12.959 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 124 C CG . ASP 24 24 ? A 152.656 -133.287 13.154 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 125 O OD1 . ASP 24 24 ? A 153.587 -132.908 13.913 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 126 O OD2 . ASP 24 24 ? A 151.999 -132.450 12.481 1 1 M ASP 0.810 1 ATOM 127 N N . 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PRO 26 26 ? A 155.915 -139.802 10.065 1 1 M PRO 0.830 1 ATOM 142 N N . SER 27 27 ? A 153.974 -141.822 7.503 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 143 C CA . SER 27 27 ? A 153.295 -142.887 6.787 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 144 C C . SER 27 27 ? A 152.003 -142.431 6.090 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 145 O O . SER 27 27 ? A 151.602 -143.008 5.084 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 146 C CB . SER 27 27 ? A 152.944 -144.052 7.755 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 147 O OG . SER 27 27 ? A 151.943 -143.664 8.700 1 1 M SER 0.840 1 ATOM 148 N N . SER 28 28 ? A 151.312 -141.388 6.621 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 149 C CA . SER 28 28 ? A 150.074 -140.831 6.047 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 150 C C . SER 28 28 ? A 150.269 -140.138 4.714 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 151 O O . SER 28 28 ? A 149.382 -140.149 3.851 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 152 C CB . SER 28 28 ? A 149.384 -139.738 6.924 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 153 O OG . SER 28 28 ? A 148.576 -140.203 8.014 1 1 M SER 0.850 1 ATOM 154 N N . VAL 29 29 ? A 151.382 -139.428 4.525 1 1 M VAL 0.860 1 ATOM 155 C CA . VAL 29 29 ? 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SER 41 41 ? A 159.966 -124.833 8.474 1 1 M SER 0.540 1 ATOM 267 O OXT . SER 41 41 ? A 162.686 -126.747 8.158 1 1 M SER 0.540 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.723 2 1 3 0.371 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 12 GLU 1 0.330 2 1 A 13 TRP 1 0.370 3 1 A 14 LEU 1 0.610 4 1 A 15 VAL 1 0.630 5 1 A 16 GLU 1 0.700 6 1 A 17 GLU 1 0.770 7 1 A 18 MET 1 0.780 8 1 A 19 TYR 1 0.760 9 1 A 20 ARG 1 0.790 10 1 A 21 LYS 1 0.830 11 1 A 22 PHE 1 0.800 12 1 A 23 ARG 1 0.780 13 1 A 24 ASP 1 0.810 14 1 A 25 ASP 1 0.790 15 1 A 26 PRO 1 0.830 16 1 A 27 SER 1 0.840 17 1 A 28 SER 1 0.850 18 1 A 29 VAL 1 0.860 19 1 A 30 ASP 1 0.840 20 1 A 31 PRO 1 0.830 21 1 A 32 SER 1 0.820 22 1 A 33 TRP 1 0.730 23 1 A 34 HIS 1 0.790 24 1 A 35 GLU 1 0.730 25 1 A 36 PHE 1 0.680 26 1 A 37 LEU 1 0.740 27 1 A 38 VAL 1 0.720 28 1 A 39 ASP 1 0.640 29 1 A 40 TYR 1 0.490 30 1 A 41 SER 1 0.540 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #