data_SMR-7863c6741490c54ae72f236151935570_3 _entry.id SMR-7863c6741490c54ae72f236151935570_3 _struct.entry_id SMR-7863c6741490c54ae72f236151935570_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P20849/ CO9A1_HUMAN, Collagen alpha-1(IX) chain Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P20849' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-12.2 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 2 . 4 2 4 . 5 2 5 . 6 2 6 . 7 3 1 . 8 3 4 . 9 4 1 . 10 4 2 . 11 4 4 . 12 5 3 . 13 6 1 . 14 6 3 . 15 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 108548.149 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO9A1_HUMAN P20849 1 ;MKTCWKIPVFFFVCSFLEPWASAAVKRRPRFPVNSNSNGGNELCPKIRIGQDDLPGFDLISQFQVDKAAS RRAIQRVVGSATLQVAYKLGNNVDFRIPTRNLYPSGLPEEYSFLTTFRMTGSTLKKNWNIWQIQDSSGKE QVGIKINGQTQSVVFSYKGLDGSLQTAAFSNLSSLFDSQWHKIMIGVERSSATLFVDCNRIESLPIKPRG PIDIDGFAVLGKLADNPQVSVPFELQWMLIHCDPLRPRRETCHELPARITPSQTTDERGPPGEQGPPGPP GPPGVPGIDGIDGDRGPKGPPGPPGPAGEPGKPGAPGKPGTPGADGLTGPDGSPGSIGSKGQKGEPGVPG SRGFPGRGIPGPPGPPGTAGLPGELGRVGPVGDPGRRGPPGPPGPPGPRGTIGFHDGDPLCPNACPPGRS GYPGLPGMRGHKGAKGEIGEPGRQGHKGEEGDQGELGEVGAQGPPGAQGLRGITGIVGDKGEKGARGLDG EPGPQGLPGAPGDQGQRGPPGEAGPKGDRGAEGARGIPGLPGPKGDTGLPGVDGRDGIPGMPGTKGEPGK PGPPGDAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGEL GPVGSPGLPGKLGSLGSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPG PKGSAGNPGEPGLRGPEGSRGLPGVEGPRGPPGPRGVQGEQGATGLPGVQGPPGRAPTDQHIKQVCMRVI QEHFAEMAASLKRPDSGATGLPGRPGPPGPPGPPGENGFPGQMGIRGLPGIKGPPGALGLRGPKGDLGEK GERGPPGRGPNGLPGAIGLPGDPGPASYGRNGRDGERGPPGVAGIPGVPGPPGPPGLPGFCEPASCTMQA GQRAFNKGPDP ; 'Collagen alpha-1(IX) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 921 1 921 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CO9A1_HUMAN P20849 . 1 921 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 A69BF076127283D0 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MKTCWKIPVFFFVCSFLEPWASAAVKRRPRFPVNSNSNGGNELCPKIRIGQDDLPGFDLISQFQVDKAAS RRAIQRVVGSATLQVAYKLGNNVDFRIPTRNLYPSGLPEEYSFLTTFRMTGSTLKKNWNIWQIQDSSGKE QVGIKINGQTQSVVFSYKGLDGSLQTAAFSNLSSLFDSQWHKIMIGVERSSATLFVDCNRIESLPIKPRG PIDIDGFAVLGKLADNPQVSVPFELQWMLIHCDPLRPRRETCHELPARITPSQTTDERGPPGEQGPPGPP GPPGVPGIDGIDGDRGPKGPPGPPGPAGEPGKPGAPGKPGTPGADGLTGPDGSPGSIGSKGQKGEPGVPG SRGFPGRGIPGPPGPPGTAGLPGELGRVGPVGDPGRRGPPGPPGPPGPRGTIGFHDGDPLCPNACPPGRS GYPGLPGMRGHKGAKGEIGEPGRQGHKGEEGDQGELGEVGAQGPPGAQGLRGITGIVGDKGEKGARGLDG EPGPQGLPGAPGDQGQRGPPGEAGPKGDRGAEGARGIPGLPGPKGDTGLPGVDGRDGIPGMPGTKGEPGK PGPPGDAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGEL 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1 56 GLY . 1 57 PHE . 1 58 ASP . 1 59 LEU . 1 60 ILE . 1 61 SER . 1 62 GLN . 1 63 PHE . 1 64 GLN . 1 65 VAL . 1 66 ASP . 1 67 LYS . 1 68 ALA . 1 69 ALA . 1 70 SER . 1 71 ARG . 1 72 ARG . 1 73 ALA . 1 74 ILE . 1 75 GLN . 1 76 ARG . 1 77 VAL . 1 78 VAL . 1 79 GLY . 1 80 SER . 1 81 ALA . 1 82 THR . 1 83 LEU . 1 84 GLN . 1 85 VAL . 1 86 ALA . 1 87 TYR . 1 88 LYS . 1 89 LEU . 1 90 GLY . 1 91 ASN . 1 92 ASN . 1 93 VAL . 1 94 ASP . 1 95 PHE . 1 96 ARG . 1 97 ILE . 1 98 PRO . 1 99 THR . 1 100 ARG . 1 101 ASN . 1 102 LEU . 1 103 TYR . 1 104 PRO . 1 105 SER . 1 106 GLY . 1 107 LEU . 1 108 PRO . 1 109 GLU . 1 110 GLU . 1 111 TYR . 1 112 SER . 1 113 PHE . 1 114 LEU . 1 115 THR . 1 116 THR . 1 117 PHE . 1 118 ARG . 1 119 MET . 1 120 THR . 1 121 GLY . 1 122 SER . 1 123 THR . 1 124 LEU . 1 125 LYS . 1 126 LYS . 1 127 ASN . 1 128 TRP . 1 129 ASN . 1 130 ILE . 1 131 TRP . 1 132 GLN . 1 133 ILE . 1 134 GLN . 1 135 ASP . 1 136 SER . 1 137 SER . 1 138 GLY . 1 139 LYS . 1 140 GLU . 1 141 GLN . 1 142 VAL . 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A 1 877 ARG 877 ? ? ? A . A 1 878 GLY 878 ? ? ? A . A 1 879 PRO 879 ? ? ? A . A 1 880 PRO 880 ? ? ? A . A 1 881 GLY 881 ? ? ? A . A 1 882 VAL 882 ? ? ? A . A 1 883 ALA 883 ? ? ? A . A 1 884 GLY 884 ? ? ? A . A 1 885 ILE 885 ? ? ? A . A 1 886 PRO 886 ? ? ? A . A 1 887 GLY 887 ? ? ? A . A 1 888 VAL 888 ? ? ? A . A 1 889 PRO 889 ? ? ? A . A 1 890 GLY 890 ? ? ? A . A 1 891 PRO 891 ? ? ? A . A 1 892 PRO 892 ? ? ? A . A 1 893 GLY 893 ? ? ? A . A 1 894 PRO 894 ? ? ? A . A 1 895 PRO 895 ? ? ? A . A 1 896 GLY 896 ? ? ? A . A 1 897 LEU 897 ? ? ? A . A 1 898 PRO 898 ? ? ? A . A 1 899 GLY 899 ? ? ? A . A 1 900 PHE 900 ? ? ? A . A 1 901 CYS 901 ? ? ? A . A 1 902 GLU 902 ? ? ? A . A 1 903 PRO 903 ? ? ? A . A 1 904 ALA 904 ? ? ? A . A 1 905 SER 905 ? ? ? A . A 1 906 CYS 906 ? ? ? A . A 1 907 THR 907 ? ? ? A . A 1 908 MET 908 ? ? ? A . A 1 909 GLN 909 ? ? ? A . A 1 910 ALA 910 ? ? ? A . A 1 911 GLY 911 ? ? ? A . A 1 912 GLN 912 ? ? ? A . A 1 913 ARG 913 ? ? ? A . A 1 914 ALA 914 ? ? ? A . A 1 915 PHE 915 ? ? ? A . A 1 916 ASN 916 ? ? ? A . A 1 917 LYS 917 ? ? ? A . A 1 918 GLY 918 ? ? ? A . A 1 919 PRO 919 ? ? ? A . A 1 920 ASP 920 ? ? ? A . A 1 921 PRO 921 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Collagen alpha-1(I) chain,Collagen alpha-1(IX) chain {PDB ID=5ctd, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5ctd.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5ctd, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'AlphaFold DB' 'reference database' . 8 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 1 7 5 2 8 6 3 2 7 3 1 8 3 3 9 4 1 10 4 3 11 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 7 'AlphaFold DB' https://alphafold.ebi.ac.uk v4 . # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSGPPGPPGPPGPPGARGQAGVMGFPGPPGPPGPPGRAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDSGA T ; ;GSGPPGPPGPPGPPGARGQAGVMGFPGPPGPPGPPGRAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDSGA T ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 37 68 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5ctd 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 921 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 921 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 3.59e-14 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKTCWKIPVFFFVCSFLEPWASAAVKRRPRFPVNSNSNGGNELCPKIRIGQDDLPGFDLISQFQVDKAASRRAIQRVVGSATLQVAYKLGNNVDFRIPTRNLYPSGLPEEYSFLTTFRMTGSTLKKNWNIWQIQDSSGKEQVGIKINGQTQSVVFSYKGLDGSLQTAAFSNLSSLFDSQWHKIMIGVERSSATLFVDCNRIESLPIKPRGPIDIDGFAVLGKLADNPQVSVPFELQWMLIHCDPLRPRRETCHELPARITPSQTTDERGPPGEQGPPGPPGPPGVPGIDGIDGDRGPKGPPGPPGPAGEPGKPGAPGKPGTPGADGLTGPDGSPGSIGSKGQKGEPGVPGSRGFPGRGIPGPPGPPGTAGLPGELGRVGPVGDPGRRGPPGPPGPPGPRGTIGFHDGDPLCPNACPPGRSGYPGLPGMRGHKGAKGEIGEPGRQGHKGEEGDQGELGEVGAQGPPGAQGLRGITGIVGDKGEKGARGLDGEPGPQGLPGAPGDQGQRGPPGEAGPKGDRGAEGARGIPGLPGPKGDTGLPGVDGRDGIPGMPGTKGEPGKPGPPGDAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGKLGSLGSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPGPKGSAGNPGEPGLRGPEGSRGLPGVEGPRGPPGPRGVQGEQGATGLPGVQGPPGRAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDSGATGLPGRPGPPGPPGPPGENGFPGQMGIRGLPGIKGPPGALGLRGPKGDLGEKGERGPPGRGPNGLPGAIGLPGDPGPASYGRNGRDGERGPPGVAGIPGVPGPPGPPGLPGFCEPASCTMQAGQRAFNKGPDP 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB & AlphaFold DB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL, target not predicted to be a monomer {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5ctd.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 755 755 ? A 12.548 28.503 6.361 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 2 C CA . ARG 755 755 ? A 11.761 29.227 7.421 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 3 C C . ARG 755 755 ? A 12.713 29.885 8.402 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 4 O O . ARG 755 755 ? A 13.717 29.275 8.739 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 5 C CB . ARG 755 755 ? A 10.839 28.222 8.179 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 6 C CG . ARG 755 755 ? A 9.680 27.653 7.328 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 7 C CD . ARG 755 755 ? A 8.690 26.745 8.091 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 8 N NE . ARG 755 755 ? A 9.119 25.309 7.928 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 9 C CZ . ARG 755 755 ? A 8.630 24.458 7.009 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 755 755 ? A 7.745 24.836 6.092 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 755 755 ? A 9.027 23.187 7.007 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 12 N N . ALA 756 756 ? A 12.450 31.129 8.853 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 13 C CA . ALA 756 756 ? A 13.237 31.797 9.869 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 14 C C . ALA 756 756 ? A 12.600 31.454 11.221 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 15 O O . ALA 756 756 ? A 11.434 31.050 11.228 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 16 C CB . ALA 756 756 ? A 13.255 33.322 9.595 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 17 N N . PRO 757 757 ? A 13.276 31.531 12.361 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 18 C CA . PRO 757 757 ? A 12.665 31.283 13.658 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 19 C C . PRO 757 757 ? A 11.646 32.350 14.040 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 20 O O . PRO 757 757 ? A 11.873 33.533 13.809 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 21 C CB . PRO 757 757 ? A 13.844 31.254 14.654 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 22 C CG . PRO 757 757 ? A 15.110 31.672 13.888 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 23 C CD . PRO 757 757 ? A 14.656 31.989 12.465 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 24 N N . THR 758 758 ? A 10.511 31.932 14.634 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 25 C CA . THR 758 758 ? A 9.520 32.804 15.253 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 26 C C . THR 758 758 ? A 9.979 33.214 16.644 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 27 O O . THR 758 758 ? A 10.768 32.507 17.273 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 28 C CB . THR 758 758 ? A 8.134 32.143 15.379 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 29 O OG1 . THR 758 758 ? A 8.136 31.005 16.238 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 30 C CG2 . THR 758 758 ? A 7.668 31.638 14.008 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 31 N N . ASP 759 759 ? A 9.465 34.329 17.209 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 32 C CA . ASP 759 759 ? A 9.749 34.748 18.574 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 33 C C . ASP 759 759 ? A 9.391 33.700 19.615 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 34 O O . ASP 759 759 ? A 10.078 33.508 20.610 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 35 C CB . ASP 759 759 ? A 8.937 36.007 18.949 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 36 C CG . ASP 759 759 ? A 9.410 37.236 18.192 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 37 O OD1 . ASP 759 759 ? A 10.412 37.147 17.447 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 38 O OD2 . ASP 759 759 ? A 8.733 38.274 18.380 1 1 A ASP 0.750 1 ATOM 39 N N . GLN 760 760 ? A 8.265 32.986 19.410 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 40 C CA . GLN 760 760 ? A 7.899 31.863 20.251 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 41 C C . GLN 760 760 ? A 8.909 30.714 20.190 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 42 O O . GLN 760 760 ? A 9.310 30.202 21.231 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 43 C CB . GLN 760 760 ? A 6.480 31.323 19.947 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 44 C CG . GLN 760 760 ? A 5.947 30.398 21.076 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 45 C CD . GLN 760 760 ? A 5.002 29.323 20.534 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 46 O OE1 . GLN 760 760 ? A 5.304 28.688 19.532 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 47 N NE2 . GLN 760 760 ? A 3.873 29.056 21.228 1 1 A GLN 0.750 1 ATOM 48 N N . HIS 761 761 ? A 9.388 30.322 18.986 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 49 C CA . HIS 761 761 ? A 10.410 29.293 18.822 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 50 C C . HIS 761 761 ? A 11.731 29.655 19.496 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 51 O O . HIS 761 761 ? A 12.318 28.849 20.209 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 52 C CB . HIS 761 761 ? A 10.658 28.971 17.327 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 53 C CG . HIS 761 761 ? A 11.627 27.850 17.120 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 54 N ND1 . HIS 761 761 ? A 11.291 26.603 17.598 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 55 C CD2 . HIS 761 761 ? A 12.884 27.835 16.612 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 56 C CE1 . HIS 761 761 ? A 12.345 25.852 17.376 1 1 A HIS 0.720 1 ATOM 57 N NE2 . HIS 761 761 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #