data_SMR-9d8c53f80c5e882a54db49e55232d2fb_3 _entry.id SMR-9d8c53f80c5e882a54db49e55232d2fb_3 _struct.entry_id SMR-9d8c53f80c5e882a54db49e55232d2fb_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q60988/ STIL_MOUSE, SCL-interrupting locus protein homolog Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q60988' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 161607.924 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP STIL_MOUSE Q60988 1 ;MNTRFPSSKMVPFHFPPSKLALWNPMPIGECIYLHLSYYRKPKLMVTEKAIRLAYRHAKQNKKNVPCFLL GSLTVDEDEEGVTLTIDRFDPGREIPECLERTPTASLPGDFLIPCRVHIQGLGSRDVIVHNADDFSSALK ALQYHVCSKDFLDCGKLLCLRAQITPRESLDGVDFNLQWTAVTLANSFKCVPVKPIPIIPTALARNLSSN LNISQVQGTYKHGYITMDETRKLLLLLQSDPKVSSLPLVGIWLAGIIHVYSPQVWACCLRYMFSSSIQER VFSESGNFIIVLYSLTHKEPEFYECLPCESRTPDLQFQLLTNKETLHLFNNVEPSGKNPIHFELSAESQD AEAEAEVLSKISKTLPVKRSSQKLSPGKIPINKHDTDLEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKVQPSVPELSL VLDNNFTESSNQSNPLEMMTVENPLLIKPSQPELCDAKHSSEATTGEPFRRGPTNQLSQDTALRQSRGKQ SSTCKKESLQFRNTNAKPSLSVPSPDVAEKLQAVSAGSMQKEDYPVRPSTLDSRQPSLAPQAQPHNLVFS THNSTRPMELQVPTPSLPSYYPTNVCSCCQHHGHIQYSTINSWQGNTVGSIQDLRSESLPKHAFFHSSGC PSLCPNAIYSSSSPVSMKQGGMGAYSPHSNGEPSPVAGPSHVDSCVPHPCAMCMHTPNTAPDNGMMGLSP DAYRFVTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLDPGSHKTVATVEDTVKAAKQMELVSMEAQSSPGLHMRKSVS IAVSTGASLFWNAAGDDQEPDSQPKQDDTKISSEDMNFSVDINNEATSLPGSASSLKAVDIPSFEESNLA VEEVNQPLPESNSSSEQSKEPGVPVFFPNALLAESVSMCLQTAPTEGASNSTELPQGTKDEPYRPSDNQK IYQDLLGQVNHLLSNASQETEEPPTKAVVTNRECAKTQNTHHARKKRHNSGLVDKDCVLSATIKQLRSLG VKIDSPTKVKKNEQKVDHASVLACISPEAVISGLNYMSFGNVGMSSLSPTGVDLSMEANAIALKYLSENQ LSQLSLARSKQNNGDSSVGLLHINSDRSTVGLSLVSPSNMSFATKKYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPSHA DSESDHVLNRNPACRPVQCGHEKEPSWNACEIAQCSDCGSADTRTDVPVLRNITNQAVQPRATEHLNEDS AISLRNLKPNPAMNLRTGKAEFTHHPEKENERDIAVFPGTLPSPETLKQMNSMDSVGTFLDVKRLRQLPK LF ; 'SCL-interrupting locus protein homolog' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1262 1 1262 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . STIL_MOUSE Q60988 . 1 1262 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2024-01-24 C460223E2269E4DF # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MNTRFPSSKMVPFHFPPSKLALWNPMPIGECIYLHLSYYRKPKLMVTEKAIRLAYRHAKQNKKNVPCFLL GSLTVDEDEEGVTLTIDRFDPGREIPECLERTPTASLPGDFLIPCRVHIQGLGSRDVIVHNADDFSSALK ALQYHVCSKDFLDCGKLLCLRAQITPRESLDGVDFNLQWTAVTLANSFKCVPVKPIPIIPTALARNLSSN LNISQVQGTYKHGYITMDETRKLLLLLQSDPKVSSLPLVGIWLAGIIHVYSPQVWACCLRYMFSSSIQER VFSESGNFIIVLYSLTHKEPEFYECLPCESRTPDLQFQLLTNKETLHLFNNVEPSGKNPIHFELSAESQD AEAEAEVLSKISKTLPVKRSSQKLSPGKIPINKHDTDLEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKVQPSVPELSL VLDNNFTESSNQSNPLEMMTVENPLLIKPSQPELCDAKHSSEATTGEPFRRGPTNQLSQDTALRQSRGKQ SSTCKKESLQFRNTNAKPSLSVPSPDVAEKLQAVSAGSMQKEDYPVRPSTLDSRQPSLAPQAQPHNLVFS THNSTRPMELQVPTPSLPSYYPTNVCSCCQHHGHIQYSTINSWQGNTVGSIQDLRSESLPKHAFFHSSGC 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AEAEAEVLSKISKTLPVKRSSQKLSPGKIPINKHDTDLEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKVQPSVPELSL VLDNNFTESSNQSNPLEMMTVENPLLIKPSQPELCDAKHSSEATTGEPFRRGPTNQLSQDTALRQSRGKQ SSTCKKESLQFRNTNAKPSLSVPSPDVAEKLQAVSAGSMQKEDYPVRPSTLDSRQPSLAPQAQPHNLVFS THNSTRPMELQVPTPSLPSYYPTNVCSCCQHHGHIQYSTINSWQGNTVGSIQDLRSESLPKHAFFHSSGC PSLCPNAIYSSSSPVSMKQGGMGAYSPHSNGEPSPVAGPSHVDSCVPHPCAMCMHTPNTAPDNGMMGLSP DAYRFVTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLDPGSHKTVATVEDTVKAAKQMELVSMEAQSSPGLHMRKSVS IAVSTGASLFWNAAGDDQEPDSQPKQDDTKISSEDMNFSVDINNEATSLPGSASSLKAVDIPSFEESNLA VEEVNQPLPESNSSSEQSKEPGVPVFFPNALLAESVSMCLQTAPTEGASNSTELPQGTKDEPYRPSDNQK IYQDLLGQVNHLLSNASQETEEPPTKAVVTNRECAKTQNTHHARKKRHNSGLVDKDCVLSATIKQLRSLG VKIDSPTKVKKNEQKVDHASVLACISPEAVISGLNYMSFGNVGMSSLSPTGVDLSMEANAIALKYLSENQ LSQLSLARSKQNNGDSSVGLLHINSDRSTVGLSLVSPSNMSFATKKYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPSHA DSESDHVLNRNPACRPVQCGHEKEPSWNACEIAQCSDCGSADTRTDVPVLRNITNQAVQPRATEHLNEDS AISLRNLKPNPAMNLRTGKAEFTHHPEKENERDIAVFPGTLPSPETLKQMNSMDSVGTFLDVKRLRQLPK LF ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 THR . 1 4 ARG . 1 5 PHE . 1 6 PRO . 1 7 SER . 1 8 SER . 1 9 LYS . 1 10 MET . 1 11 VAL . 1 12 PRO . 1 13 PHE . 1 14 HIS . 1 15 PHE . 1 16 PRO . 1 17 PRO . 1 18 SER . 1 19 LYS . 1 20 LEU . 1 21 ALA . 1 22 LEU . 1 23 TRP . 1 24 ASN . 1 25 PRO . 1 26 MET . 1 27 PRO . 1 28 ILE . 1 29 GLY . 1 30 GLU . 1 31 CYS . 1 32 ILE . 1 33 TYR . 1 34 LEU . 1 35 HIS . 1 36 LEU . 1 37 SER . 1 38 TYR . 1 39 TYR . 1 40 ARG . 1 41 LYS . 1 42 PRO . 1 43 LYS . 1 44 LEU . 1 45 MET . 1 46 VAL . 1 47 THR . 1 48 GLU . 1 49 LYS . 1 50 ALA . 1 51 ILE . 1 52 ARG . 1 53 LEU . 1 54 ALA . 1 55 TYR . 1 56 ARG . 1 57 HIS . 1 58 ALA . 1 59 LYS . 1 60 GLN . 1 61 ASN . 1 62 LYS . 1 63 LYS . 1 64 ASN . 1 65 VAL . 1 66 PRO . 1 67 CYS . 1 68 PHE . 1 69 LEU . 1 70 LEU . 1 71 GLY . 1 72 SER . 1 73 LEU . 1 74 THR . 1 75 VAL . 1 76 ASP . 1 77 GLU . 1 78 ASP . 1 79 GLU . 1 80 GLU . 1 81 GLY . 1 82 VAL . 1 83 THR . 1 84 LEU . 1 85 THR . 1 86 ILE . 1 87 ASP . 1 88 ARG . 1 89 PHE . 1 90 ASP . 1 91 PRO . 1 92 GLY . 1 93 ARG . 1 94 GLU . 1 95 ILE . 1 96 PRO . 1 97 GLU . 1 98 CYS . 1 99 LEU . 1 100 GLU . 1 101 ARG . 1 102 THR . 1 103 PRO . 1 104 THR . 1 105 ALA . 1 106 SER . 1 107 LEU . 1 108 PRO . 1 109 GLY . 1 110 ASP . 1 111 PHE . 1 112 LEU . 1 113 ILE . 1 114 PRO . 1 115 CYS . 1 116 ARG . 1 117 VAL . 1 118 HIS . 1 119 ILE . 1 120 GLN . 1 121 GLY . 1 122 LEU . 1 123 GLY . 1 124 SER . 1 125 ARG . 1 126 ASP . 1 127 VAL . 1 128 ILE . 1 129 VAL . 1 130 HIS . 1 131 ASN . 1 132 ALA . 1 133 ASP . 1 134 ASP . 1 135 PHE . 1 136 SER . 1 137 SER . 1 138 ALA . 1 139 LEU . 1 140 LYS . 1 141 ALA . 1 142 LEU . 1 143 GLN . 1 144 TYR . 1 145 HIS . 1 146 VAL . 1 147 CYS . 1 148 SER . 1 149 LYS . 1 150 ASP . 1 151 PHE . 1 152 LEU . 1 153 ASP . 1 154 CYS . 1 155 GLY . 1 156 LYS . 1 157 LEU . 1 158 LEU . 1 159 CYS . 1 160 LEU . 1 161 ARG . 1 162 ALA . 1 163 GLN . 1 164 ILE . 1 165 THR . 1 166 PRO . 1 167 ARG . 1 168 GLU . 1 169 SER . 1 170 LEU . 1 171 ASP . 1 172 GLY 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'SCL-interrupting locus protein {PDB ID=5lhw, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5lhw.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5lhw, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GGSLTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLM GGSLTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLM # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 27 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5lhw 2024-01-10 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1262 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1262 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 8.2e-11 95.833 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNTRFPSSKMVPFHFPPSKLALWNPMPIGECIYLHLSYYRKPKLMVTEKAIRLAYRHAKQNKKNVPCFLLGSLTVDEDEEGVTLTIDRFDPGREIPECLERTPTASLPGDFLIPCRVHIQGLGSRDVIVHNADDFSSALKALQYHVCSKDFLDCGKLLCLRAQITPRESLDGVDFNLQWTAVTLANSFKCVPVKPIPIIPTALARNLSSNLNISQVQGTYKHGYITMDETRKLLLLLQSDPKVSSLPLVGIWLAGIIHVYSPQVWACCLRYMFSSSIQERVFSESGNFIIVLYSLTHKEPEFYECLPCESRTPDLQFQLLTNKETLHLFNNVEPSGKNPIHFELSAESQDAEAEAEVLSKISKTLPVKRSSQKLSPGKIPINKHDTDLEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKVQPSVPELSLVLDNNFTESSNQSNPLEMMTVENPLLIKPSQPELCDAKHSSEATTGEPFRRGPTNQLSQDTALRQSRGKQSSTCKKESLQFRNTNAKPSLSVPSPDVAEKLQAVSAGSMQKEDYPVRPSTLDSRQPSLAPQAQPHNLVFSTHNSTRPMELQVPTPSLPSYYPTNVCSCCQHHGHIQYSTINSWQGNTVGSIQDLRSESLPKHAFFHSSGCPSLCPNAIYSSSSPVSMKQGGMGAYSPHSNGEPSPVAGPSHVDSCVPHPCAMCMHTPNTAPDNGMMGLSPDAYRFVTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLDPGSHKTVATVEDTVKAAKQMELVSMEAQSSPGLHMRKSVSIAVSTGASLFWNAAGDDQEPDSQPKQDDTKISSEDMNFSVDINNEATSLPGSASSLKAVDIPSFEESNLAVEEVNQPLPESNSSSEQSKEPGVPVFFPNALLAESVSMCLQTAPTEGASNSTELPQGTKDEPYRPSDNQKIYQDLLGQVNHLLSNASQETEEPPTKAVVTNRECAKTQNTHHARKKRHNSGLVDKDCVLSATIKQLRSLGVKIDSPTKVKKNEQKVDHASVLACISPEAVISGLNYMSFGNVGMSSLSPTGVDLSMEANAIALKYLSENQLSQLSLARSKQNNGDSSVGLLHINSDRSTVGLSLVSPSNMSFATKKYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPSHADSESDHVLNRNPACRPVQCGHEKEPSWNACEIAQCSDCGSADTRTDVPVLRNITNQAVQPRATEHLNEDSAISLRNLKPNPAMNLRTGKAEFTHHPEKENERDIAVFPGTLPSPETLKQMNSMDSVGTFLDVKRLRQLPKLF 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.224}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5lhw.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 706 706 ? A 7.402 18.030 18.208 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 2 C CA . VAL 706 706 ? A 6.988 16.986 19.223 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 3 C C . VAL 706 706 ? A 5.542 17.088 19.643 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 4 O O . VAL 706 706 ? A 4.884 16.065 19.696 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 5 C CB . VAL 706 706 ? A 7.948 16.958 20.409 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 706 706 ? A 7.499 15.947 21.497 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 706 706 ? A 9.337 16.541 19.877 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 8 N N . THR 707 707 ? A 4.974 18.305 19.853 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 9 C CA . THR 707 707 ? A 3.560 18.504 20.194 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 10 C C . THR 707 707 ? A 2.597 17.799 19.268 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 11 O O . THR 707 707 ? A 1.706 17.073 19.703 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 12 C CB . THR 707 707 ? A 3.228 19.990 20.123 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 13 O OG1 . THR 707 707 ? A 4.096 20.692 20.997 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 14 C CG2 . THR 707 707 ? A 1.771 20.294 20.511 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 15 N N . GLU 708 708 ? A 2.809 17.952 17.946 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 16 C CA . GLU 708 708 ? A 2.061 17.230 16.942 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 17 C C . GLU 708 708 ? A 2.304 15.723 16.927 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 18 O O . GLU 708 708 ? A 1.376 14.920 16.899 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 19 C CB . GLU 708 708 ? A 2.322 17.860 15.545 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 20 C CG . GLU 708 708 ? A 1.390 17.305 14.438 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 21 C CD . GLU 708 708 ? A -0.094 17.535 14.741 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 22 O OE1 . GLU 708 708 ? A -0.442 18.251 15.714 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 23 O OE2 . GLU 708 708 ? A -0.913 16.941 14.000 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 24 N N . GLN 709 709 ? A 3.575 15.277 17.017 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 25 C CA . GLN 709 709 ? A 3.924 13.861 17.059 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 26 C C . GLN 709 709 ? A 3.365 13.103 18.258 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 27 O O . GLN 709 709 ? A 2.870 11.989 18.081 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 28 C CB . GLN 709 709 ? A 5.452 13.627 17.025 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 29 C CG . GLN 709 709 ? A 6.126 14.074 15.708 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 30 C CD . GLN 709 709 ? A 7.605 13.717 15.724 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 31 O OE1 . GLN 709 709 ? A 7.991 12.595 16.115 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 32 N NE2 . GLN 709 709 ? A 8.498 14.629 15.315 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 33 N N . ASP 710 710 ? A 3.388 13.692 19.483 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 34 C CA . ASP 710 710 ? A 2.733 13.177 20.680 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 35 C C . ASP 710 710 ? A 1.248 13.010 20.400 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 36 O O . ASP 710 710 ? A 0.676 11.937 20.590 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 37 C CB . ASP 710 710 ? A 2.958 14.159 21.889 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 38 C CG . ASP 710 710 ? A 1.981 13.893 23.034 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 39 O OD1 . ASP 710 710 ? A 2.179 12.918 23.789 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 40 O OD2 . ASP 710 710 ? A 0.933 14.603 23.080 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 41 N N . ARG 711 711 ? A 0.595 14.063 19.878 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 42 C CA . ARG 711 711 ? A -0.822 14.054 19.637 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 43 C C . ARG 711 711 ? A -1.268 12.973 18.671 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 44 O O . ARG 711 711 ? A -2.205 12.236 18.951 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 45 C CB . ARG 711 711 ? A -1.255 15.443 19.123 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 46 C CG . ARG 711 711 ? A -2.663 15.469 18.508 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 47 C CD . ARG 711 711 ? A -3.178 16.884 18.275 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 48 N NE . ARG 711 711 ? A -4.435 16.776 17.453 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 49 C CZ . ARG 711 711 ? A -5.633 16.354 17.886 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 50 N NH1 . ARG 711 711 ? A -5.838 16.023 19.156 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 51 N NH2 . ARG 711 711 ? A -6.642 16.234 17.025 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 52 N N . GLN 712 712 ? A -0.559 12.833 17.534 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 53 C CA . GLN 712 712 ? A -0.810 11.787 16.566 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 54 C C . GLN 712 712 ? A -0.497 10.396 17.090 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 55 O O . GLN 712 712 ? A -1.228 9.448 16.830 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 56 C CB . GLN 712 712 ? A -0.098 12.070 15.218 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 57 C CG . GLN 712 712 ? A -0.496 13.428 14.577 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 58 C CD . GLN 712 712 ? A -2.014 13.597 14.454 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 59 O OE1 . GLN 712 712 ? A -2.782 12.659 14.286 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 60 N NE2 . GLN 712 712 ? A -2.485 14.865 14.515 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 61 N N . LEU 713 713 ? A 0.578 10.242 17.894 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 62 C CA . LEU 713 713 ? A 0.874 8.995 18.575 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 63 C C . LEU 713 713 ? A -0.194 8.579 19.583 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 64 O O . LEU 713 713 ? A -0.645 7.433 19.590 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 65 C CB . LEU 713 713 ? A 2.240 9.087 19.297 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 66 C CG . LEU 713 713 ? A 2.650 7.829 20.098 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 67 C CD1 . LEU 713 713 ? A 2.632 6.551 19.233 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 68 C CD2 . LEU 713 713 ? A 4.026 8.047 20.748 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 69 N N . ARG 714 714 ? A -0.685 9.500 20.432 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 70 C CA . ARG 714 714 ? A -1.774 9.231 21.358 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 71 C C . ARG 714 714 ? 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A -5.246 11.627 18.150 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 86 C CD1 . LEU 715 715 ? A -5.210 12.662 17.015 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 87 C CD2 . LEU 715 715 ? A -6.652 11.522 18.771 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 88 N N . LEU 716 716 ? A -3.160 7.481 17.619 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 89 C CA . LEU 716 716 ? A -2.851 6.149 17.139 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 90 C C . LEU 716 716 ? A -3.096 5.073 18.195 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 91 O O . LEU 716 716 ? A -3.749 4.069 17.923 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 92 C CB . LEU 716 716 ? A -1.381 6.060 16.650 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 93 C CG . LEU 716 716 ? A -0.921 4.655 16.195 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 716 716 ? A -1.810 4.099 15.065 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 716 716 ? A 0.563 4.679 15.789 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 96 N N . GLN 717 717 ? A -2.642 5.286 19.451 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 97 C CA . GLN 717 717 ? A -2.860 4.371 20.565 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 98 C C . GLN 717 717 ? A -4.334 4.150 20.871 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 99 O O . GLN 717 717 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.641 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 706 VAL 1 0.740 2 1 A 707 THR 1 0.650 3 1 A 708 GLU 1 0.610 4 1 A 709 GLN 1 0.620 5 1 A 710 ASP 1 0.630 6 1 A 711 ARG 1 0.570 7 1 A 712 GLN 1 0.600 8 1 A 713 LEU 1 0.670 9 1 A 714 ARG 1 0.570 10 1 A 715 LEU 1 0.690 11 1 A 716 LEU 1 0.670 12 1 A 717 GLN 1 0.610 13 1 A 718 ALA 1 0.640 14 1 A 719 GLN 1 0.600 15 1 A 720 ILE 1 0.590 16 1 A 721 GLN 1 0.590 17 1 A 722 ARG 1 0.550 18 1 A 723 LEU 1 0.640 19 1 A 724 LEU 1 0.700 20 1 A 725 GLU 1 0.610 21 1 A 726 ALA 1 0.630 22 1 A 727 GLN 1 0.670 23 1 A 728 SER 1 0.790 24 1 A 729 LEU 1 0.750 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #