data_SMR-e6914f946787419b29213b1114d2773f_4 _entry.id SMR-e6914f946787419b29213b1114d2773f_4 _struct.entry_id SMR-e6914f946787419b29213b1114d2773f_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q14203/ DCTN1_HUMAN, Dynactin subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.025, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14203' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 164899.936 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DCTN1_HUMAN Q14203 1 ;MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF ELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRG PPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMK ASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVA QLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRH RLVLTQEQLHQLHSRLIS ; 'Dynactin subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1278 1 1278 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DCTN1_HUMAN Q14203 . 1 1278 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-10-18 6DCEA5E67856E4BC # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF ELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRG PPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMK ASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVA QLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRH RLVLTQEQLHQLHSRLIS ; ;MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR 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RLVLTQEQLHQLHSRLIS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 GLN . 1 4 SER . 1 5 LYS . 1 6 ARG . 1 7 HIS . 1 8 VAL . 1 9 TYR . 1 10 SER . 1 11 ARG . 1 12 THR . 1 13 PRO . 1 14 SER . 1 15 GLY . 1 16 SER . 1 17 ARG . 1 18 MET . 1 19 SER . 1 20 ALA . 1 21 GLU . 1 22 ALA . 1 23 SER . 1 24 ALA . 1 25 ARG . 1 26 PRO . 1 27 LEU . 1 28 ARG . 1 29 VAL . 1 30 GLY . 1 31 SER . 1 32 ARG . 1 33 VAL . 1 34 GLU . 1 35 VAL . 1 36 ILE . 1 37 GLY . 1 38 LYS . 1 39 GLY . 1 40 HIS . 1 41 ARG . 1 42 GLY . 1 43 THR . 1 44 VAL . 1 45 ALA . 1 46 TYR . 1 47 VAL . 1 48 GLY . 1 49 ALA . 1 50 THR . 1 51 LEU . 1 52 PHE . 1 53 ALA . 1 54 THR . 1 55 GLY . 1 56 LYS . 1 57 TRP . 1 58 VAL . 1 59 GLY . 1 60 VAL . 1 61 ILE . 1 62 LEU . 1 63 ASP . 1 64 GLU . 1 65 ALA . 1 66 LYS . 1 67 GLY . 1 68 LYS . 1 69 ASN . 1 70 ASP . 1 71 GLY . 1 72 THR . 1 73 VAL . 1 74 GLN . 1 75 GLY . 1 76 ARG . 1 77 LYS . 1 78 TYR . 1 79 PHE . 1 80 THR . 1 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B 1 1117 ALA 1117 ? ? ? B . B 1 1118 GLN 1118 ? ? ? B . B 1 1119 MET 1119 ? ? ? B . B 1 1120 LYS 1120 ? ? ? B . B 1 1121 ALA 1121 ? ? ? B . B 1 1122 SER 1122 ? ? ? B . B 1 1123 LEU 1123 ? ? ? B . B 1 1124 ALA 1124 ? ? ? B . B 1 1125 SER 1125 ? ? ? B . B 1 1126 LEU 1126 ? ? ? B . B 1 1127 PRO 1127 ? ? ? B . B 1 1128 PRO 1128 ? ? ? B . B 1 1129 LEU 1129 ? ? ? B . B 1 1130 HIS 1130 ? ? ? B . B 1 1131 VAL 1131 ? ? ? B . B 1 1132 ALA 1132 ? ? ? B . B 1 1133 LYS 1133 ? ? ? B . B 1 1134 LEU 1134 ? ? ? B . B 1 1135 SER 1135 ? ? ? B . B 1 1136 HIS 1136 ? ? ? B . B 1 1137 GLU 1137 ? ? ? B . B 1 1138 GLY 1138 ? ? ? B . B 1 1139 PRO 1139 ? ? ? B . B 1 1140 GLY 1140 ? ? ? B . B 1 1141 SER 1141 ? ? ? B . B 1 1142 GLU 1142 ? ? ? B . B 1 1143 LEU 1143 ? ? ? B . B 1 1144 PRO 1144 ? ? ? B . B 1 1145 ALA 1145 ? ? ? B . B 1 1146 GLY 1146 ? ? ? B . B 1 1147 ALA 1147 ? ? ? B . B 1 1148 LEU 1148 ? ? ? B . B 1 1149 TYR 1149 ? ? ? B . B 1 1150 ARG 1150 ? ? ? B . B 1 1151 LYS 1151 ? ? ? B . B 1 1152 THR 1152 ? ? ? B . B 1 1153 SER 1153 ? ? ? B . B 1 1154 GLN 1154 ? ? ? B . B 1 1155 LEU 1155 ? ? ? B . B 1 1156 LEU 1156 ? ? ? B . B 1 1157 GLU 1157 ? ? ? B . B 1 1158 THR 1158 ? ? ? B . B 1 1159 LEU 1159 ? ? ? B . B 1 1160 ASN 1160 ? ? ? B . B 1 1161 GLN 1161 ? ? ? B . B 1 1162 LEU 1162 ? ? ? B . B 1 1163 SER 1163 ? ? ? B . B 1 1164 THR 1164 ? ? ? B . B 1 1165 HIS 1165 ? ? ? B . B 1 1166 THR 1166 ? ? ? B . B 1 1167 HIS 1167 ? ? ? B . B 1 1168 VAL 1168 ? ? ? B . B 1 1169 VAL 1169 ? ? ? B . B 1 1170 ASP 1170 ? ? ? B . B 1 1171 ILE 1171 ? ? ? B . B 1 1172 THR 1172 ? ? ? B . B 1 1173 ARG 1173 ? ? ? B . B 1 1174 THR 1174 ? ? ? B . B 1 1175 SER 1175 ? ? ? B . B 1 1176 PRO 1176 ? ? ? B . B 1 1177 ALA 1177 ? ? ? B . B 1 1178 ALA 1178 ? ? ? B . B 1 1179 LYS 1179 ? ? ? B . B 1 1180 SER 1180 ? ? ? B . B 1 1181 PRO 1181 ? ? ? B . B 1 1182 SER 1182 ? ? ? B . B 1 1183 ALA 1183 ? ? ? B . B 1 1184 GLN 1184 ? ? ? B . B 1 1185 LEU 1185 ? ? ? B . B 1 1186 MET 1186 ? ? ? B . B 1 1187 GLU 1187 ? ? ? B . B 1 1188 GLN 1188 ? ? ? B . B 1 1189 VAL 1189 ? ? ? B . B 1 1190 ALA 1190 ? ? ? B . B 1 1191 GLN 1191 ? ? ? B . B 1 1192 LEU 1192 ? ? ? B . B 1 1193 LYS 1193 ? ? ? B . B 1 1194 SER 1194 ? ? ? B . B 1 1195 LEU 1195 ? ? ? B . B 1 1196 SER 1196 ? ? ? B . B 1 1197 ASP 1197 ? ? ? B . B 1 1198 THR 1198 ? ? ? B . B 1 1199 VAL 1199 ? ? ? B . B 1 1200 GLU 1200 ? ? ? B . B 1 1201 LYS 1201 ? ? ? B . B 1 1202 LEU 1202 ? ? ? B . B 1 1203 LYS 1203 ? ? ? B . B 1 1204 ASP 1204 ? ? ? B . B 1 1205 GLU 1205 ? ? ? B . B 1 1206 VAL 1206 ? ? ? B . B 1 1207 LEU 1207 ? ? ? B . B 1 1208 LYS 1208 ? ? ? B . B 1 1209 GLU 1209 ? ? ? B . B 1 1210 THR 1210 ? ? ? B . B 1 1211 VAL 1211 ? ? ? B . B 1 1212 SER 1212 ? ? ? B . B 1 1213 GLN 1213 ? ? ? B . B 1 1214 ARG 1214 ? ? ? B . B 1 1215 PRO 1215 ? ? ? B . B 1 1216 GLY 1216 ? ? ? B . B 1 1217 ALA 1217 ? ? ? B . B 1 1218 THR 1218 ? ? ? B . B 1 1219 VAL 1219 ? ? ? B . B 1 1220 PRO 1220 ? ? ? B . B 1 1221 THR 1221 ? ? ? B . B 1 1222 ASP 1222 ? ? ? B . B 1 1223 PHE 1223 ? ? ? B . B 1 1224 ALA 1224 ? ? ? B . B 1 1225 THR 1225 ? ? ? B . B 1 1226 PHE 1226 ? ? ? B . B 1 1227 PRO 1227 ? ? ? B . B 1 1228 SER 1228 ? ? ? B . B 1 1229 SER 1229 ? ? ? B . B 1 1230 ALA 1230 ? ? ? B . B 1 1231 PHE 1231 ? ? ? B . B 1 1232 LEU 1232 ? ? ? B . B 1 1233 ARG 1233 ? ? ? B . B 1 1234 ALA 1234 ? ? ? B . B 1 1235 LYS 1235 ? ? ? B . B 1 1236 GLU 1236 ? ? ? B . B 1 1237 GLU 1237 ? ? ? B . B 1 1238 GLN 1238 ? ? ? B . B 1 1239 GLN 1239 ? ? ? B . B 1 1240 ASP 1240 ? ? ? B . B 1 1241 ASP 1241 ? ? ? B . B 1 1242 THR 1242 ? ? ? B . B 1 1243 VAL 1243 ? ? ? B . B 1 1244 TYR 1244 ? ? ? B . B 1 1245 MET 1245 ? ? ? B . B 1 1246 GLY 1246 ? ? ? B . B 1 1247 LYS 1247 ? ? ? B . B 1 1248 VAL 1248 ? ? ? B . B 1 1249 THR 1249 ? ? ? B . B 1 1250 PHE 1250 ? ? ? B . B 1 1251 SER 1251 ? ? ? B . B 1 1252 CYS 1252 ? ? ? B . B 1 1253 ALA 1253 ? ? ? B . B 1 1254 ALA 1254 ? ? ? B . B 1 1255 GLY 1255 ? ? ? B . B 1 1256 PHE 1256 ? ? ? B . B 1 1257 GLY 1257 ? ? ? B . B 1 1258 GLN 1258 ? ? ? B . B 1 1259 ARG 1259 ? ? ? B . B 1 1260 HIS 1260 ? ? ? B . B 1 1261 ARG 1261 ? ? ? B . B 1 1262 LEU 1262 ? ? ? B . B 1 1263 VAL 1263 ? ? ? B . B 1 1264 LEU 1264 ? ? ? B . B 1 1265 THR 1265 ? ? ? B . B 1 1266 GLN 1266 ? ? ? B . B 1 1267 GLU 1267 ? ? ? B . B 1 1268 GLN 1268 ? ? ? B . B 1 1269 LEU 1269 ? ? ? B . B 1 1270 HIS 1270 ? ? ? B . B 1 1271 GLN 1271 ? ? ? B . B 1 1272 LEU 1272 ? ? ? B . B 1 1273 HIS 1273 ? ? ? B . B 1 1274 SER 1274 ? ? ? B . B 1 1275 ARG 1275 ? ? ? B . B 1 1276 LEU 1276 ? ? ? B . B 1 1277 ILE 1277 ? ? ? B . B 1 1278 SER 1278 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynactin subunit 1 {PDB ID=4rfx, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=4rfx.2.A}' 'template structure' . 2 'Dynactin subunit 1 {PDB ID=4rfx, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=4rfx.2.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 4rfx, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4rfx, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 6 'model 4' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 1 1 C 2 2 'reference database' polymer 1 2 B D 1 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDHHHHHHHHTTETGYVQGAEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNE MNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE A ; ;MDHHHHHHHHTTETGYVQGAEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNE MNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE A ; 2 ;MDHHHHHHHHTTETGYVQGAEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNE MNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE A ; ;MDHHHHHHHHTTETGYVQGAEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNE MNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE A ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 20 140 2 2 20 140 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4rfx 2024-02-28 2 PDB . 4rfx 2024-02-28 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1278 2 2 B 1 1278 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1278 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1278 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.9e-18 90.083 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 3.9e-18 90.083 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 4 2 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AEKTVDEVKEQVDAALGAEEMVETLTERNLDLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDLAAARVREAEKRVEAAQETVADYQQTIKKYRELTAHLQDVNRELMSQQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.516}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4rfx.2, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 438 438 ? A 92.158 100.141 46.659 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 2 C CA . GLU 438 438 ? A 91.428 99.444 45.541 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 3 C C . GLU 438 438 ? A 90.045 99.969 45.187 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 4 O O . GLU 438 438 ? A 89.455 100.721 45.959 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 5 C CB . GLU 438 438 ? A 91.251 97.965 45.925 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 6 C CG . GLU 438 438 ? A 91.965 97.012 44.948 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 7 C CD . GLU 438 438 ? A 91.955 95.599 45.522 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 438 438 ? A 92.200 95.489 46.749 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 438 438 ? A 91.659 94.664 44.744 1 1 A GLU 0.540 1 ATOM 10 N N . MET 439 439 ? A 89.467 99.529 44.034 1 1 A MET 0.560 1 ATOM 11 C CA . MET 439 439 ? A 88.065 99.757 43.712 1 1 A MET 0.560 1 ATOM 12 C C . MET 439 439 ? A 87.152 98.923 44.557 1 1 A MET 0.560 1 ATOM 13 O O . MET 439 439 ? A 86.031 99.289 44.819 1 1 A MET 0.560 1 ATOM 14 C CB . MET 439 439 ? A 87.666 99.433 42.254 1 1 A MET 0.560 1 ATOM 15 C CG . MET 439 439 ? 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LYS 453 453 ? A 68.303 104.111 48.474 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 128 C C . LYS 453 453 ? A 67.140 103.421 47.768 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 129 O O . LYS 453 453 ? A 66.033 103.950 47.719 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 130 C CB . LYS 453 453 ? A 69.103 104.989 47.479 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 131 C CG . LYS 453 453 ? A 68.329 106.245 47.032 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 132 C CD . LYS 453 453 ? A 68.209 107.325 48.123 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 133 C CE . LYS 453 453 ? A 67.019 108.261 47.903 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 134 N NZ . LYS 453 453 ? A 67.100 109.424 48.812 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 135 N N . VAL 454 454 ? A 67.344 102.203 47.218 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 136 C CA . VAL 454 454 ? A 66.240 101.396 46.715 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 137 C C . VAL 454 454 ? A 65.268 100.969 47.799 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 138 O O . VAL 454 454 ? A 64.068 100.959 47.577 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 139 C CB . VAL 454 454 ? A 66.617 100.185 45.858 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 140 C CG1 . VAL 454 454 ? A 67.488 100.649 44.678 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 141 C CG2 . VAL 454 454 ? A 67.336 99.086 46.659 1 1 A VAL 0.760 1 ATOM 142 N N . ARG 455 455 ? A 65.749 100.616 49.008 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 143 C CA . ARG 455 455 ? A 64.926 100.224 50.138 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 144 C C . ARG 455 455 ? A 64.011 101.345 50.611 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 145 O O . ARG 455 455 ? A 62.808 101.131 50.764 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 146 C CB . ARG 455 455 ? A 65.852 99.812 51.306 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 147 C CG . ARG 455 455 ? A 65.174 99.099 52.497 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 148 C CD . ARG 455 455 ? A 65.866 99.274 53.868 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 149 N NE . ARG 455 455 ? A 67.350 99.292 53.739 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 150 C CZ . ARG 455 455 ? A 68.167 98.299 53.361 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 151 N NH1 . ARG 455 455 ? A 67.748 97.052 53.172 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 152 N NH2 . ARG 455 455 ? A 69.445 98.624 53.195 1 1 A ARG 0.640 1 ATOM 153 N N . GLU 456 456 ? A 64.583 102.568 50.753 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 154 C CA . GLU 456 456 ? A 63.897 103.821 51.055 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 155 C C . GLU 456 456 ? A 62.855 104.143 50.002 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 156 O O . GLU 456 456 ? A 61.675 104.343 50.289 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 157 C CB . GLU 456 456 ? A 64.940 104.985 51.114 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 158 C CG . GLU 456 456 ? A 64.405 106.421 51.449 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 159 C CD . GLU 456 456 ? A 64.472 107.451 50.312 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 160 O OE1 . GLU 456 456 ? A 64.226 107.072 49.143 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 161 O OE2 . GLU 456 456 ? A 64.845 108.636 50.559 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 162 N N . LEU 457 457 ? A 63.244 104.104 48.710 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 163 C CA . LEU 457 457 ? A 62.310 104.368 47.638 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 164 C C . LEU 457 457 ? A 61.191 103.340 47.515 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 165 O O . LEU 457 457 ? A 60.036 103.701 47.331 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 166 C CB . LEU 457 457 ? A 63.006 104.584 46.276 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 167 C CG . LEU 457 457 ? A 63.798 105.901 46.139 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 168 C CD1 . LEU 457 457 ? A 64.599 105.924 44.825 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 169 C CD2 . LEU 457 457 ? A 62.881 107.132 46.252 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 170 N N . ARG 458 458 ? A 61.476 102.031 47.665 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 171 C CA . ARG 458 458 ? A 60.468 100.984 47.668 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 172 C C . ARG 458 458 ? A 59.425 101.145 48.763 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 173 O O . ARG 458 458 ? A 58.240 100.916 48.528 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 174 C CB . ARG 458 458 ? A 61.096 99.588 47.887 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 175 C CG . ARG 458 458 ? A 61.845 98.979 46.692 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 176 C CD . ARG 458 458 ? A 62.202 97.519 46.969 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 177 N NE . ARG 458 458 ? A 62.857 96.939 45.752 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 178 C CZ . ARG 458 458 ? A 62.188 96.622 44.639 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 179 N NH1 . ARG 458 458 ? A 60.913 96.950 44.459 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 180 N NH2 . ARG 458 458 ? A 62.801 95.894 43.709 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 181 N N . GLU 459 459 ? A 59.865 101.543 49.974 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 182 C CA . GLU 459 459 ? A 58.988 101.888 51.077 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 183 C C . GLU 459 459 ? A 58.086 103.085 50.746 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 184 O O . GLU 459 459 ? A 56.861 102.978 50.794 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 185 C CB . GLU 459 459 ? A 59.836 102.174 52.335 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 186 C CG . GLU 459 459 ? A 59.010 102.303 53.635 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 187 C CD . GLU 459 459 ? A 59.896 102.479 54.869 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 188 O OE1 . GLU 459 459 ? A 61.070 102.908 54.718 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 189 O OE2 . GLU 459 459 ? A 59.413 102.143 55.981 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 190 N N . THR 460 460 ? A 58.675 104.205 50.245 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 191 C CA . THR 460 460 ? A 57.954 105.420 49.814 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 192 C C . THR 460 460 ? A 56.914 105.150 48.748 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 193 O O . THR 460 460 ? A 55.793 105.658 48.784 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 194 C CB . THR 460 460 ? A 58.877 106.473 49.175 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 195 O OG1 . THR 460 460 ? A 59.731 107.048 50.147 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 196 C CG2 . THR 460 460 ? A 58.152 107.671 48.519 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 197 N N . VAL 461 461 ? A 57.276 104.332 47.734 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 198 C CA . VAL 461 461 ? A 56.385 103.944 46.650 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 199 C C . VAL 461 461 ? A 55.195 103.162 47.190 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 200 O O . VAL 461 461 ? A 54.053 103.506 46.903 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 201 C CB . VAL 461 461 ? A 57.116 103.188 45.533 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 202 C CG1 . VAL 461 461 ? A 56.137 102.765 44.426 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 203 C CG2 . VAL 461 461 ? A 58.141 104.124 44.863 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 204 N N . GLY 462 462 ? A 55.446 102.167 48.073 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 205 C CA . GLY 462 462 ? A 54.431 101.402 48.799 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 206 C C . GLY 462 462 ? A 53.408 102.227 49.555 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 207 O O . GLY 462 462 ? A 52.206 101.977 49.464 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 208 N N . ASP 463 463 ? A 53.855 103.257 50.309 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 209 C CA . ASP 463 463 ? A 52.956 104.207 50.948 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 210 C C . ASP 463 463 ? A 52.141 105.045 49.968 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 211 O O . ASP 463 463 ? A 50.931 105.212 50.118 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 212 C CB . ASP 463 463 ? A 53.702 105.171 51.896 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 213 C CG . ASP 463 463 ? A 54.279 104.433 53.090 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 214 O OD1 . ASP 463 463 ? A 53.603 103.493 53.583 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 215 O OD2 . ASP 463 463 ? A 55.368 104.854 53.549 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 216 N N . LEU 464 464 ? A 52.773 105.569 48.898 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 217 C CA . LEU 464 464 ? A 52.096 106.315 47.849 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 218 C C . LEU 464 464 ? A 51.031 105.511 47.110 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 219 O O . LEU 464 464 ? A 49.940 106.020 46.842 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 220 C CB . LEU 464 464 ? A 53.109 106.869 46.821 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 221 C CG . LEU 464 464 ? A 53.623 108.293 47.103 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 222 C CD1 . LEU 464 464 ? 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ALA 466 466 ? A 46.263 103.556 49.776 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 237 C CB . ALA 466 466 ? A 49.095 102.072 50.804 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 238 N N . MET 467 467 ? A 48.051 104.902 49.812 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 239 C CA . MET 467 467 ? A 47.322 106.153 49.896 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 240 C C . MET 467 467 ? A 46.513 106.512 48.648 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 241 O O . MET 467 467 ? A 45.402 107.027 48.742 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 242 C CB . MET 467 467 ? A 48.300 107.279 50.264 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 243 C CG . MET 467 467 ? A 48.897 107.123 51.675 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 244 S SD . MET 467 467 ? A 50.125 108.408 52.057 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 245 C CE . MET 467 467 ? A 48.967 109.808 52.100 1 1 A MET 0.520 1 ATOM 246 N N . ASN 468 468 ? A 47.040 106.228 47.436 1 1 A ASN 0.550 1 ATOM 247 C CA . ASN 468 468 ? A 46.300 106.304 46.183 1 1 A ASN 0.550 1 ATOM 248 C C . ASN 468 468 ? A 45.106 105.337 46.168 1 1 A ASN 0.550 1 ATOM 249 O O . ASN 468 468 ? 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ARG 495 495 ? A 5.063 115.888 40.334 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 467 C CB . ARG 495 495 ? A 7.366 114.034 41.743 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 468 C CG . ARG 495 495 ? A 6.953 112.606 42.147 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 469 C CD . ARG 495 495 ? A 7.678 112.068 43.391 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 470 N NE . ARG 495 495 ? A 7.011 112.611 44.633 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 471 C CZ . ARG 495 495 ? A 7.096 112.050 45.849 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 472 N NH1 . ARG 495 495 ? A 7.916 111.026 46.054 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 473 N NH2 . ARG 495 495 ? A 6.385 112.524 46.873 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 474 N N . VAL 496 496 ? A 7.106 116.866 40.247 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 475 C CA . VAL 496 496 ? A 6.666 118.236 40.002 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 476 C C . VAL 496 496 ? A 5.901 118.358 38.701 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 477 O O . VAL 496 496 ? A 4.741 118.749 38.699 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 478 C CB . VAL 496 496 ? A 7.846 119.224 40.024 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 479 C CG1 . VAL 496 496 ? A 7.609 120.522 39.219 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 480 C CG2 . 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B 66.841 105.788 36.991 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 962 C CG . ARG 455 455 ? B 66.474 106.787 35.872 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 963 C CD . ARG 455 455 ? B 66.683 106.257 34.442 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 964 N NE . ARG 455 455 ? B 65.736 105.132 34.188 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 965 C CZ . ARG 455 455 ? B 64.407 105.166 34.016 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 966 N NH1 . ARG 455 455 ? B 63.699 106.273 33.974 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 967 N NH2 . ARG 455 455 ? B 63.780 103.997 33.918 1 1 B ARG 0.680 1 ATOM 968 N N . GLU 456 456 ? B 64.229 104.247 37.915 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 969 C CA . GLU 456 456 ? B 62.895 103.665 37.817 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 970 C C . GLU 456 456 ? B 62.001 104.067 38.989 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 971 O O . GLU 456 456 ? B 60.917 104.617 38.812 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 972 C CB . GLU 456 456 ? B 63.031 102.111 37.747 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 973 C CG . GLU 456 456 ? B 61.712 101.284 37.600 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 974 C CD . GLU 456 456 ? B 61.295 100.484 38.842 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 975 O OE1 . 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B 55.633 110.021 42.423 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 1016 C CB . VAL 461 461 ? B 58.444 108.694 43.620 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 1017 C CG1 . VAL 461 461 ? B 58.104 109.887 44.545 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 1018 C CG2 . VAL 461 461 ? B 58.795 107.491 44.511 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 1019 N N . GLY 462 462 ? B 57.434 110.155 41.066 1 1 B GLY 0.720 1 ATOM 1020 C CA . GLY 462 462 ? B 57.030 111.349 40.332 1 1 B GLY 0.720 1 ATOM 1021 C C . GLY 462 462 ? B 55.651 111.294 39.710 1 1 B GLY 0.720 1 ATOM 1022 O O . GLY 462 462 ? B 54.872 112.243 39.813 1 1 B GLY 0.720 1 ATOM 1023 N N . ASP 463 463 ? B 55.303 110.153 39.077 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1024 C CA . ASP 463 463 ? B 53.963 109.876 38.594 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1025 C C . ASP 463 463 ? B 52.915 109.759 39.701 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1026 O O . ASP 463 463 ? B 51.845 110.357 39.627 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1027 C CB . ASP 463 463 ? B 53.941 108.596 37.728 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1028 C CG . ASP 463 463 ? B 54.741 108.783 36.448 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1029 O OD1 . ASP 463 463 ? B 54.733 109.918 35.905 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1030 O OD2 . ASP 463 463 ? B 55.312 107.768 35.981 1 1 B ASP 0.630 1 ATOM 1031 N N . LEU 464 464 ? B 53.201 109.028 40.797 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1032 C CA . LEU 464 464 ? B 52.306 108.894 41.939 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1033 C C . LEU 464 464 ? B 52.007 110.223 42.642 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1034 O O . LEU 464 464 ? B 50.863 110.485 43.013 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1035 C CB . LEU 464 464 ? B 52.883 107.898 42.969 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1036 C CG . LEU 464 464 ? B 52.798 106.404 42.602 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1037 C CD1 . LEU 464 464 ? B 54.068 105.700 43.092 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1038 C CD2 . LEU 464 464 ? B 51.548 105.733 43.199 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1039 N N . GLU 465 465 ? B 53.024 111.097 42.815 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1040 C CA . GLU 465 465 ? B 52.899 112.461 43.308 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1041 C C . GLU 465 465 ? B 52.053 113.348 42.399 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1042 O O . GLU 465 465 ? B 51.123 114.011 42.853 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1043 C CB . GLU 465 465 ? B 54.292 113.120 43.463 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1044 C CG . GLU 465 465 ? B 55.186 112.509 44.570 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1045 C CD . GLU 465 465 ? B 56.510 113.263 44.710 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1046 O OE1 . GLU 465 465 ? B 57.164 113.520 43.666 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1047 O OE2 . GLU 465 465 ? B 56.884 113.568 45.872 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 1048 N N . ALA 466 466 ? B 52.313 113.319 41.071 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 1049 C CA . ALA 466 466 ? B 51.537 114.036 40.071 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 1050 C C . ALA 466 466 ? B 50.068 113.588 40.007 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 1051 O O . ALA 466 466 ? B 49.137 114.386 40.012 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 1052 C CB . ALA 466 466 ? B 52.216 113.878 38.687 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 1053 N N . MET 467 467 ? B 49.814 112.267 40.005 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1054 C CA . MET 467 467 ? B 48.481 111.698 40.055 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1055 C C . MET 467 467 ? B 47.708 111.955 41.345 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1056 O O . MET 467 467 ? B 46.496 112.141 41.327 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1057 C CB . MET 467 467 ? B 48.547 110.184 39.813 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1058 C CG . MET 467 467 ? B 48.978 109.805 38.388 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1059 S SD . MET 467 467 ? B 49.131 108.007 38.188 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1060 C CE . MET 467 467 ? B 47.349 107.655 38.264 1 1 B MET 0.520 1 ATOM 1061 N N . ASN 468 468 ? B 48.401 111.952 42.506 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1062 C CA . ASN 468 468 ? B 47.860 112.339 43.801 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1063 C C . ASN 468 468 ? B 47.382 113.795 43.776 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1064 O O . ASN 468 468 ? B 46.231 114.057 44.107 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1065 C CB . ASN 468 468 ? B 48.937 112.097 44.903 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1066 C CG . ASN 468 468 ? B 48.470 112.427 46.317 1 1 B ASN 0.550 1 ATOM 1067 O OD1 . ASN 468 468 ? 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B 20.861 122.944 43.397 1 1 B GLN 0.600 1 ATOM 1237 C CD . GLN 488 488 ? B 21.577 122.805 42.048 1 1 B GLN 0.600 1 ATOM 1238 O OE1 . GLN 488 488 ? B 22.558 123.491 41.788 1 1 B GLN 0.600 1 ATOM 1239 N NE2 . GLN 488 488 ? B 21.049 121.962 41.131 1 1 B GLN 0.600 1 ATOM 1240 N N . LEU 489 489 ? B 18.630 119.722 46.039 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1241 C CA . LEU 489 489 ? B 17.685 118.698 46.445 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1242 C C . LEU 489 489 ? B 16.670 119.189 47.451 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1243 O O . LEU 489 489 ? B 15.477 119.056 47.206 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1244 C CB . LEU 489 489 ? B 18.378 117.409 46.958 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1245 C CG . LEU 489 489 ? B 17.436 116.184 46.985 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1246 C CD1 . LEU 489 489 ? B 18.169 114.885 46.633 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1247 C CD2 . LEU 489 489 ? B 16.696 115.995 48.317 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1248 N N . ASP 490 490 ? B 17.092 119.851 48.548 1 1 B ASP 0.620 1 ATOM 1249 C CA . ASP 490 490 ? 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B 17.604 126.021 46.016 1 1 B MET 0.580 1 ATOM 1263 C CE . MET 491 491 ? B 16.303 127.017 45.228 1 1 B MET 0.580 1 ATOM 1264 N N . ALA 492 492 ? B 14.212 121.381 45.690 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 1265 C CA . ALA 492 492 ? B 13.342 120.512 44.912 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 1266 C C . ALA 492 492 ? B 12.348 119.738 45.791 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 1267 O O . ALA 492 492 ? B 11.159 119.685 45.490 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 1268 C CB . ALA 492 492 ? B 14.164 119.563 44.010 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 1269 N N . GLY 493 493 ? B 12.809 119.189 46.936 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 1270 C CA . GLY 493 493 ? B 12.032 118.491 47.958 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 1271 C C . GLY 493 493 ? B 10.966 119.312 48.642 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 1272 O O . GLY 493 493 ? B 9.962 118.777 49.105 1 1 B GLY 0.680 1 ATOM 1273 N N . ALA 494 494 ? B 11.166 120.639 48.735 1 1 B ALA 0.660 1 ATOM 1274 C CA . ALA 494 494 ? B 10.159 121.611 49.111 1 1 B ALA 0.660 1 ATOM 1275 C C . ALA 494 494 ? B 9.118 121.903 48.021 1 1 B ALA 0.660 1 ATOM 1276 O O . ALA 494 494 ? B 7.916 121.865 48.277 1 1 B ALA 0.660 1 ATOM 1277 C CB . ALA 494 494 ? B 10.877 122.909 49.530 1 1 B ALA 0.660 1 ATOM 1278 N N . ARG 495 495 ? B 9.574 122.140 46.768 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1279 C CA . ARG 495 495 ? B 8.758 122.375 45.581 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1280 C C . ARG 495 495 ? B 7.846 121.208 45.201 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1281 O O . ARG 495 495 ? B 6.704 121.411 44.800 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1282 C CB . ARG 495 495 ? B 9.659 122.781 44.380 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1283 C CG . ARG 495 495 ? B 9.974 124.296 44.302 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1284 C CD . ARG 495 495 ? B 10.834 124.723 43.100 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1285 N NE . ARG 495 495 ? B 12.138 123.988 43.222 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1286 C CZ . ARG 495 495 ? B 13.027 123.830 42.232 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1287 N NH1 . ARG 495 495 ? B 12.866 124.425 41.053 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1288 N NH2 . ARG 495 495 ? B 14.102 123.061 42.412 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 1289 N N . VAL 496 496 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.605 2 1 3 0.025 3 1 4 0.516 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 438 GLU 1 0.540 2 1 A 439 MET 1 0.560 3 1 A 440 VAL 1 0.620 4 1 A 441 GLU 1 0.540 5 1 A 442 MET 1 0.560 6 1 A 443 LEU 1 0.630 7 1 A 444 THR 1 0.600 8 1 A 445 ASP 1 0.600 9 1 A 446 ARG 1 0.560 10 1 A 447 ASN 1 0.610 11 1 A 448 LEU 1 0.610 12 1 A 449 ASN 1 0.630 13 1 A 450 LEU 1 0.720 14 1 A 451 GLU 1 0.670 15 1 A 452 GLU 1 0.670 16 1 A 453 LYS 1 0.730 17 1 A 454 VAL 1 0.760 18 1 A 455 ARG 1 0.640 19 1 A 456 GLU 1 0.710 20 1 A 457 LEU 1 0.770 21 1 A 458 ARG 1 0.660 22 1 A 459 GLU 1 0.660 23 1 A 460 THR 1 0.720 24 1 A 461 VAL 1 0.740 25 1 A 462 GLY 1 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #