data_SMR-3354da461abaf3a506e68ce008f64ab9_7 _entry.id SMR-3354da461abaf3a506e68ce008f64ab9_7 _struct.entry_id SMR-3354da461abaf3a506e68ce008f64ab9_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O15056 (isoform 2)/ SYNJ2_HUMAN, Synaptojanin-2 Estimated model accuracy of this model is 0.04, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O15056 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 166821.488 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SYNJ2_HUMAN O15056 1 ;MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLK SGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRF DLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEAN APAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLE TLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVY GEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLL DSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLV GVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDY KEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFH EGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPG ALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPED LRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIR KRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTAL APPSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVK KSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGA SEEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKIVFCSRSQASQP CLLLQRHEFVRTVAAQRLASVDTSGSSV ; Synaptojanin-2 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1288 1 1288 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SYNJ2_HUMAN O15056 O15056-2 1 1288 9606 'Homo sapiens (Human)' 2005-03-01 9A4EAA3AA9AE2451 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLK SGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRF DLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEAN APAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLE TLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVY GEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLL DSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLV 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Synaptojanin 2 {PDB ID=1ufw, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1ufw.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 1ufw, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHS ALSVLDVDGMKVKGRAVKISGPSSG ; ;GSSGSSGSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHS ALSVLDVDGMKVKGRAVKISGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 89 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1ufw 2023-12-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1288 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1288 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.51e-47 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTALAPPSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKIVFCSRSQASQPCLLLQRHEFVRTVAAQRLASVDTSGSSV 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1ufw.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 882 882 ? A -8.514 18.157 -17.130 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 2 C CA . SER 882 882 ? A -9.029 18.954 -15.949 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 3 C C . SER 882 882 ? A -9.966 18.104 -15.095 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 4 O O . SER 882 882 ? A -11.171 18.264 -15.163 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 5 C CB . SER 882 882 ? A -9.676 20.291 -16.455 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 6 O OG . SER 882 882 ? A -10.622 20.085 -17.490 1 1 A SER 0.300 1 ATOM 7 N N . SER 883 883 ? A -9.435 17.128 -14.293 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 8 C CA . SER 883 883 ? A -10.292 16.198 -13.540 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 9 C C . SER 883 883 ? A -10.589 16.768 -12.159 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 10 O O . SER 883 883 ? A -11.741 17.039 -11.822 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 11 C CB . SER 883 883 ? A -9.686 14.759 -13.418 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 12 O OG . SER 883 883 ? A -10.729 13.820 -13.161 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 13 N N . PHE 884 884 ? A -9.536 17.068 -11.367 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 14 C CA . PHE 884 884 ? A -9.600 17.784 -10.100 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 15 C C . PHE 884 884 ? A -10.413 17.124 -8.983 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 16 O O . PHE 884 884 ? A -11.433 17.627 -8.535 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 17 C CB . PHE 884 884 ? A -9.912 19.300 -10.289 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 18 C CG . PHE 884 884 ? A -8.892 20.143 -9.579 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 19 C CD1 . PHE 884 884 ? A -7.630 20.368 -10.157 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 20 C CD2 . PHE 884 884 ? A -9.196 20.748 -8.352 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 21 C CE1 . PHE 884 884 ? A -6.718 21.245 -9.557 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 22 C CE2 . PHE 884 884 ? A -8.288 21.628 -7.750 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 23 C CZ . PHE 884 884 ? A -7.053 21.888 -8.359 1 1 A PHE 0.490 1 ATOM 24 N N . GLN 885 885 ? A -9.993 15.943 -8.491 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 25 C CA . GLN 885 885 ? A -10.846 15.187 -7.611 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 26 C C . GLN 885 885 ? A -9.983 14.333 -6.728 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 27 O O . GLN 885 885 ? A -9.291 13.421 -7.164 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 28 C CB . GLN 885 885 ? A -11.895 14.325 -8.378 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 29 C CG . GLN 885 885 ? A -13.341 14.837 -8.138 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 30 C CD . GLN 885 885 ? A -14.425 13.830 -8.534 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 31 O OE1 . GLN 885 885 ? A -14.195 12.641 -8.729 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 32 N NE2 . GLN 885 885 ? A -15.690 14.313 -8.610 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 33 N N . GLY 886 886 ? A -9.980 14.617 -5.422 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 34 C CA . GLY 886 886 ? A -9.281 13.739 -4.528 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 35 C C . GLY 886 886 ? A -9.247 14.386 -3.190 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 36 O O . GLY 886 886 ? A -9.212 15.614 -3.133 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 37 N N . PRO 887 887 ? A -9.261 13.656 -2.092 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 38 C CA . PRO 887 887 ? A -9.055 14.263 -0.793 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 39 C C . PRO 887 887 ? A -7.640 14.828 -0.657 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 40 O O . PRO 887 887 ? A -6.703 14.219 -1.157 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 41 C CB . PRO 887 887 ? A -9.314 13.103 0.195 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 42 C CG . PRO 887 887 ? A -9.099 11.794 -0.592 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 43 C CD . PRO 887 887 ? A -9.084 12.204 -2.069 1 1 A PRO 0.810 1 ATOM 44 N N . LEU 888 888 ? A -7.480 15.975 0.043 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 45 C CA . LEU 888 888 ? A -6.212 16.604 0.396 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 46 C C . LEU 888 888 ? A -5.343 15.789 1.348 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 47 O O . LEU 888 888 ? A -4.134 16.008 1.416 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 48 C CB . LEU 888 888 ? A -6.492 18.003 1.036 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 49 C CG . LEU 888 888 ? A -7.350 18.024 2.338 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 50 C CD1 . LEU 888 888 ? A -6.539 17.860 3.642 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 51 C CD2 . LEU 888 888 ? A -8.153 19.335 2.435 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 52 N N . ASP 889 889 ? A -5.944 14.831 2.094 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 53 C CA . ASP 889 889 ? A -5.299 13.834 2.930 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 54 C C . ASP 889 889 ? A -4.384 12.957 2.095 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 55 O O . ASP 889 889 ? A -3.223 12.736 2.426 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 56 C CB . ASP 889 889 ? A -6.424 12.957 3.573 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 57 C CG . ASP 889 889 ? A -6.237 12.791 5.074 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 58 O OD1 . ASP 889 889 ? A -5.186 12.245 5.486 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 59 O OD2 . ASP 889 889 ? A -7.186 13.151 5.812 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 60 N N . ALA 890 890 ? A -4.894 12.490 0.943 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 61 C CA . ALA 890 890 ? A -4.240 11.592 0.025 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 62 C C . ALA 890 890 ? A -3.897 10.237 0.654 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 63 O O . ALA 890 890 ? A -2.843 9.665 0.410 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 64 C CB . ALA 890 890 ? A -3.048 12.288 -0.663 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 65 N N . THR 891 891 ? A -4.833 9.684 1.458 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 66 C CA . THR 891 891 ? A -4.640 8.520 2.332 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 67 C C . THR 891 891 ? A -5.423 7.355 1.785 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 68 O O . THR 891 891 ? A -6.584 7.482 1.424 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 69 C CB . THR 891 891 ? A -5.101 8.721 3.784 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 70 O OG1 . THR 891 891 ? A -4.422 9.823 4.354 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 71 C CG2 . THR 891 891 ? A -4.729 7.520 4.671 1 1 A THR 0.910 1 ATOM 72 N N . VAL 892 892 ? A -4.780 6.172 1.712 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 73 C CA . VAL 892 892 ? A -5.321 4.964 1.117 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 74 C C . VAL 892 892 ? A -4.945 3.789 1.994 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 75 O O . VAL 892 892 ? A -3.908 3.769 2.640 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 76 C CB . VAL 892 892 ? A -4.785 4.677 -0.285 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 77 C CG1 . VAL 892 892 ? A -5.292 5.753 -1.258 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 78 C CG2 . VAL 892 892 ? A -3.243 4.629 -0.298 1 1 A VAL 0.960 1 ATOM 79 N N . VAL 893 893 ? A -5.819 2.768 2.047 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 80 C CA . VAL 893 893 ? A -5.684 1.619 2.909 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 81 C C . VAL 893 893 ? A -5.129 0.477 2.094 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 82 O O . VAL 893 893 ? A -5.681 0.095 1.088 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 83 C CB . VAL 893 893 ? A -7.034 1.206 3.523 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 84 C CG1 . VAL 893 893 ? A -8.198 1.232 2.505 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 85 C CG2 . VAL 893 893 ? 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A 9.594 -3.832 5.984 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 212 C CB . GLU 909 909 ? A 9.982 -4.523 9.221 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 213 C CG . GLU 909 909 ? A 9.689 -3.182 9.932 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 214 C CD . GLU 909 909 ? A 10.707 -2.884 11.022 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 215 O OE1 . GLU 909 909 ? A 11.921 -2.916 10.712 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 216 O OE2 . GLU 909 909 ? A 10.253 -2.572 12.151 1 1 A GLU 0.830 1 ATOM 217 N N . ASP 910 910 ? A 10.047 -6.035 6.287 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 218 C CA . ASP 910 910 ? A 10.512 -6.421 4.958 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 219 C C . ASP 910 910 ? A 9.516 -6.099 3.860 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 220 O O . ASP 910 910 ? A 9.874 -5.844 2.710 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 221 C CB . ASP 910 910 ? A 10.745 -7.957 4.913 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 222 C CG . ASP 910 910 ? A 11.968 -8.349 5.718 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 223 O OD1 . ASP 910 910 ? A 11.941 -8.108 6.952 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 224 O OD2 . ASP 910 910 ? A 12.912 -8.913 5.111 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 225 N N . LEU 911 911 ? A 8.211 -6.110 4.165 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 226 C CA . LEU 911 911 ? A 7.212 -5.663 3.223 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 227 C C . LEU 911 911 ? A 6.799 -4.230 3.396 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 228 O O . LEU 911 911 ? A 6.550 -3.563 2.404 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 229 C CB . LEU 911 911 ? A 5.931 -6.498 3.294 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 230 C CG . LEU 911 911 ? A 6.152 -7.975 2.952 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 231 C CD1 . LEU 911 911 ? A 4.808 -8.694 2.794 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 232 C CD2 . LEU 911 911 ? A 6.951 -8.173 1.672 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 233 N N . ARG 912 912 ? A 6.690 -3.698 4.631 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 234 C CA . ARG 912 912 ? A 6.374 -2.300 4.876 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 235 C C . ARG 912 912 ? A 7.290 -1.350 4.187 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 236 O O . ARG 912 912 ? A 6.833 -0.558 3.375 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 237 C CB . ARG 912 912 ? A 6.530 -1.905 6.367 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 238 C CG . ARG 912 912 ? A 5.235 -1.986 7.167 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 239 C CD . ARG 912 912 ? A 5.383 -2.821 8.427 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 240 N NE . ARG 912 912 ? A 4.741 -2.106 9.559 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 241 C CZ . ARG 912 912 ? A 5.366 -1.166 10.271 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 242 N NH1 . ARG 912 912 ? A 6.621 -0.829 10.007 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 243 N NH2 . ARG 912 912 ? A 4.767 -0.662 11.337 1 1 A ARG 0.820 1 ATOM 244 N N . THR 913 913 ? A 8.594 -1.402 4.461 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 245 C CA . THR 913 913 ? A 9.593 -0.516 3.891 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 246 C C . THR 913 913 ? A 9.644 -0.640 2.387 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 247 O O . THR 913 913 ? A 9.729 0.362 1.685 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 248 C CB . THR 913 913 ? A 10.977 -0.822 4.418 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 249 O OG1 . THR 913 913 ? A 11.033 -0.597 5.816 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 250 C CG2 . THR 913 913 ? A 12.058 0.061 3.779 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 251 N N . GLU 914 914 ? A 9.539 -1.867 1.850 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 252 C CA . GLU 914 914 ? A 9.350 -2.152 0.443 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 253 C C . GLU 914 914 ? A 8.082 -1.547 -0.132 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 254 O O . GLU 914 914 ? A 8.117 -0.986 -1.236 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 255 C CB . GLU 914 914 ? A 9.402 -3.673 0.170 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 256 C CG . GLU 914 914 ? A 10.820 -4.220 -0.164 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 257 C CD . GLU 914 914 ? A 11.959 -4.164 0.861 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 258 O OE1 . GLU 914 914 ? A 12.243 -3.092 1.441 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 259 O OE2 . GLU 914 914 ? A 12.646 -5.222 0.910 1 1 A GLU 0.870 1 ATOM 260 N N . LEU 915 915 ? A 6.926 -1.578 0.528 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 261 C CA . LEU 915 915 ? A 5.762 -0.811 0.150 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 262 C C . LEU 915 915 ? A 5.908 0.695 0.285 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 263 O O . LEU 915 915 ? A 5.586 1.447 -0.615 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 264 C CB . LEU 915 915 ? A 4.534 -1.276 0.948 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 265 C CG . LEU 915 915 ? A 3.644 -2.180 0.096 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 266 C CD1 . LEU 915 915 ? A 4.123 -3.618 0.227 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 267 C CD2 . LEU 915 915 ? A 2.221 -2.090 0.585 1 1 A LEU 0.910 1 ATOM 268 N N . MET 916 916 ? A 6.434 1.202 1.402 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 269 C CA . MET 916 916 ? A 6.584 2.620 1.666 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 270 C C . MET 916 916 ? A 7.507 3.305 0.685 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 271 O O . MET 916 916 ? A 7.190 4.365 0.165 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 272 C CB . MET 916 916 ? A 7.113 2.873 3.106 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 273 C CG . MET 916 916 ? A 6.174 2.405 4.219 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 274 S SD . MET 916 916 ? A 4.502 2.947 3.931 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 275 C CE . MET 916 916 ? A 3.861 1.373 4.421 1 1 A MET 0.870 1 ATOM 276 N N . GLN 917 917 ? A 8.648 2.678 0.353 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 277 C CA . GLN 917 917 ? A 9.517 3.102 -0.725 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 278 C C . GLN 917 917 ? A 8.869 2.965 -2.122 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 279 O O . GLN 917 917 ? A 8.965 3.870 -2.945 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 280 C CB . GLN 917 917 ? A 10.896 2.366 -0.614 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 281 C CG . GLN 917 917 ? A 10.964 0.928 -1.201 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 282 C CD . GLN 917 917 ? A 12.316 0.218 -1.049 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 283 O OE1 . GLN 917 917 ? A 13.099 0.148 -1.991 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 284 N NE2 . GLN 917 917 ? A 12.578 -0.377 0.134 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 285 N N . THR 918 918 ? A 8.162 1.836 -2.419 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 286 C CA . THR 918 918 ? A 7.627 1.499 -3.751 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 287 C C . THR 918 918 ? A 6.399 2.291 -4.059 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 288 O O . THR 918 918 ? A 6.320 2.879 -5.119 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 289 C CB . THR 918 918 ? A 7.194 0.027 -3.933 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 290 O OG1 . THR 918 918 ? A 8.311 -0.819 -4.114 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 291 C CG2 . THR 918 918 ? A 6.217 -0.316 -5.083 1 1 A THR 0.890 1 ATOM 292 N N . LEU 919 919 ? A 5.407 2.344 -3.137 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 293 C CA . LEU 919 919 ? A 4.181 3.119 -3.219 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 294 C C . LEU 919 919 ? A 4.537 4.566 -3.145 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 295 O O . LEU 919 919 ? A 4.058 5.388 -3.925 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 296 C CB . LEU 919 919 ? A 3.129 2.838 -2.104 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 297 C CG . LEU 919 919 ? A 2.732 1.368 -1.892 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 298 C CD1 . LEU 919 919 ? A 1.496 1.248 -1.000 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 299 C CD2 . LEU 919 919 ? A 2.454 0.647 -3.193 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 300 N N . GLY 920 920 ? A 5.462 4.894 -2.232 1 1 A GLY 0.900 1 ATOM 301 C CA . GLY 920 920 ? A 6.121 6.181 -2.161 1 1 A GLY 0.900 1 ATOM 302 C C . GLY 920 920 ? A 6.703 6.731 -3.430 1 1 A GLY 0.900 1 ATOM 303 O O . GLY 920 920 ? A 6.524 7.922 -3.669 1 1 A GLY 0.900 1 ATOM 304 N N . SER 921 921 ? A 7.357 5.925 -4.284 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 305 C CA . SER 921 921 ? A 7.970 6.308 -5.562 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 306 C C . SER 921 921 ? A 7.023 6.982 -6.566 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 307 O O . SER 921 921 ? A 7.385 7.909 -7.277 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 308 C CB . SER 921 921 ? A 8.502 5.034 -6.273 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 309 O OG . SER 921 921 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #