data_SMR-332dea00b32c68fe1e96cd13c4649d03_1
_entry.id SMR-332dea00b32c68fe1e96cd13c4649d03_1
_struct.entry_id SMR-332dea00b32c68fe1e96cd13c4649d03_1
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q6Y7W6 (isoform 3)/ GGYF2_HUMAN, GRB10-interacting GYF protein 2

Estimated model accuracy of this model is 0.03, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6Y7W6 (isoform 3)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
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_citation.id
_citation.title
_citation.journal_abbrev
_citation.journal_volume
_citation.page_first
_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 5 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 172971.771 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP GGYF2_HUMAN Q6Y7W6 1
;MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPSDLLDKEFLPI
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KQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKK
QKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
;
'GRB10-interacting GYF protein 2'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1293 1 1293
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . GGYF2_HUMAN Q6Y7W6 Q6Y7W6-3 1 1293 9606 'Homo sapiens (Human)'
2004-07-05 DD5D60E71FFAC884
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPSDLLDKEFLPI
LQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGRSSSRGRGRGRGECGFYQRSF
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QKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
;

;MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPSDLLDKEFLPI
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QKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ALA .
1 3 ALA .
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1 5 THR .
1 6 GLN .
1 7 THR .
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1 22 GLY .
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1 25 THR .
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1 28 PRO .
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1 87 GLU .
1 88 GLU .
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1 92 PHE .
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1 107 ARG .
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1 109 GLY .
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1 118 ARG .
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1 122 SER .
1 123 SER .
1 124 ARG .
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1 130 ARG .
1 131 GLY .
1 132 GLU .
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1 134 GLY .
1 135 PHE .
1 136 TYR .
1 137 GLN .
1 138 ARG .
1 139 SER .
1 140 PHE .
1 141 ASP .
1 142 GLU .
1 143 VAL .
1 144 GLU .
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1 146 VAL .
1 147 PHE .
1 148 GLY .
1 149 ARG .
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1 151 GLY .
1 152 GLY .
1 153 ARG .
1 154 GLU .
1 155 MET .
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1 157 ARG .
1 158 SER .
1 159 GLN .
1 160 SER .
1 161 TRP .
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1 163 GLU .
1 164 ARG .
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1 168 ARG .
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1 1189 ARG .
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1 1197 GLN .
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1 1280 GLU .
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1 1282 LEU .
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#
#
loop_
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_struct_asym.entity_id
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A 1 .
#
#
loop_
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A 1 246 ARG 246 ? ? ? A .
A 1 247 ARG 247 ? ? ? A .
A 1 248 ARG 248 ? ? ? A .
A 1 249 PHE 249 ? ? ? A .
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A 1 251 PHE 251 ? ? ? A .
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A 1 535 PRO 535 535 PRO PRO A .
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A 1 566 ALA 566 566 ALA ALA A .
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A 1 1061 SER 1061 ? ? ? A .
A 1 1062 ASN 1062 ? ? ? A .
A 1 1063 ALA 1063 ? ? ? A .
A 1 1064 ASP 1064 ? ? ? A .
A 1 1065 THR 1065 ? ? ? A .
A 1 1066 LYS 1066 ? ? ? A .
A 1 1067 ASN 1067 ? ? ? A .
A 1 1068 SER 1068 ? ? ? A .
A 1 1069 ASN 1069 ? ? ? A .
A 1 1070 MET 1070 ? ? ? A .
A 1 1071 GLY 1071 ? ? ? A .
A 1 1072 PHE 1072 ? ? ? A .
A 1 1073 TRP 1073 ? ? ? A .
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A 1 1075 ASP 1075 ? ? ? A .
A 1 1076 ALA 1076 ? ? ? A .
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A 1 1078 LYS 1078 ? ? ? A .
A 1 1079 GLU 1079 ? ? ? A .
A 1 1080 VAL 1080 ? ? ? A .
A 1 1081 GLY 1081 ? ? ? A .
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A 1 1083 ARG 1083 ? ? ? A .
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A 1 1090 LYS 1090 ? ? ? A .
A 1 1091 ASN 1091 ? ? ? A .
A 1 1092 ASN 1092 ? ? ? A .
A 1 1093 ALA 1093 ? ? ? A .
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A 1 1100 GLY 1100 ? ? ? A .
A 1 1101 VAL 1101 ? ? ? A .
A 1 1102 SER 1102 ? ? ? A .
A 1 1103 ASN 1103 ? ? ? A .
A 1 1104 ARG 1104 ? ? ? A .
A 1 1105 GLN 1105 ? ? ? A .
A 1 1106 ASN 1106 ? ? ? A .
A 1 1107 LYS 1107 ? ? ? A .
A 1 1108 LYS 1108 ? ? ? A .
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A 1 1111 GLU 1111 ? ? ? A .
A 1 1112 GLU 1112 ? ? ? A .
A 1 1113 GLU 1113 ? ? ? A .
A 1 1114 LYS 1114 ? ? ? A .
A 1 1115 LEU 1115 ? ? ? A .
A 1 1116 LEU 1116 ? ? ? A .
A 1 1117 LYS 1117 ? ? ? A .
A 1 1118 LEU 1118 ? ? ? A .
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A 1 1120 GLN 1120 ? ? ? A .
A 1 1121 GLY 1121 ? ? ? A .
A 1 1122 VAL 1122 ? ? ? A .
A 1 1123 ASN 1123 ? ? ? A .
A 1 1124 LYS 1124 ? ? ? A .
A 1 1125 ALA 1125 ? ? ? A .
A 1 1126 GLN 1126 ? ? ? A .
A 1 1127 ASP 1127 ? ? ? A .
A 1 1128 GLY 1128 ? ? ? A .
A 1 1129 PHE 1129 ? ? ? A .
A 1 1130 THR 1130 ? ? ? A .
A 1 1131 GLN 1131 ? ? ? A .
A 1 1132 TRP 1132 ? ? ? A .
A 1 1133 CYS 1133 ? ? ? A .
A 1 1134 GLU 1134 ? ? ? A .
A 1 1135 GLN 1135 ? ? ? A .
A 1 1136 MET 1136 ? ? ? A .
A 1 1137 LEU 1137 ? ? ? A .
A 1 1138 HIS 1138 ? ? ? A .
A 1 1139 ALA 1139 ? ? ? A .
A 1 1140 LEU 1140 ? ? ? A .
A 1 1141 ASN 1141 ? ? ? A .
A 1 1142 THR 1142 ? ? ? A .
A 1 1143 ALA 1143 ? ? ? A .
A 1 1144 ASN 1144 ? ? ? A .
A 1 1145 ASN 1145 ? ? ? A .
A 1 1146 LEU 1146 ? ? ? A .
A 1 1147 ASP 1147 ? ? ? A .
A 1 1148 VAL 1148 ? ? ? A .
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A 1 1151 PHE 1151 ? ? ? A .
A 1 1152 VAL 1152 ? ? ? A .
A 1 1153 SER 1153 ? ? ? A .
A 1 1154 PHE 1154 ? ? ? A .
A 1 1155 LEU 1155 ? ? ? A .
A 1 1156 LYS 1156 ? ? ? A .
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A 1 1158 VAL 1158 ? ? ? A .
A 1 1159 GLU 1159 ? ? ? A .
A 1 1160 SER 1160 ? ? ? A .
A 1 1161 PRO 1161 ? ? ? A .
A 1 1162 TYR 1162 ? ? ? A .
A 1 1163 GLU 1163 ? ? ? A .
A 1 1164 VAL 1164 ? ? ? A .
A 1 1165 HIS 1165 ? ? ? A .
A 1 1166 ASP 1166 ? ? ? A .
A 1 1167 TYR 1167 ? ? ? A .
A 1 1168 ILE 1168 ? ? ? A .
A 1 1169 ARG 1169 ? ? ? A .
A 1 1170 ALA 1170 ? ? ? A .
A 1 1171 TYR 1171 ? ? ? A .
A 1 1172 LEU 1172 ? ? ? A .
A 1 1173 GLY 1173 ? ? ? A .
A 1 1174 ASP 1174 ? ? ? A .
A 1 1175 THR 1175 ? ? ? A .
A 1 1176 SER 1176 ? ? ? A .
A 1 1177 GLU 1177 ? ? ? A .
A 1 1178 ALA 1178 ? ? ? A .
A 1 1179 LYS 1179 ? ? ? A .
A 1 1180 GLU 1180 ? ? ? A .
A 1 1181 PHE 1181 ? ? ? A .
A 1 1182 ALA 1182 ? ? ? A .
A 1 1183 LYS 1183 ? ? ? A .
A 1 1184 GLN 1184 ? ? ? A .
A 1 1185 PHE 1185 ? ? ? A .
A 1 1186 LEU 1186 ? ? ? A .
A 1 1187 GLU 1187 ? ? ? A .
A 1 1188 ARG 1188 ? ? ? A .
A 1 1189 ARG 1189 ? ? ? A .
A 1 1190 ALA 1190 ? ? ? A .
A 1 1191 LYS 1191 ? ? ? A .
A 1 1192 GLN 1192 ? ? ? A .
A 1 1193 LYS 1193 ? ? ? A .
A 1 1194 ALA 1194 ? ? ? A .
A 1 1195 ASN 1195 ? ? ? A .
A 1 1196 GLN 1196 ? ? ? A .
A 1 1197 GLN 1197 ? ? ? A .
A 1 1198 ARG 1198 ? ? ? A .
A 1 1199 GLN 1199 ? ? ? A .
A 1 1200 GLN 1200 ? ? ? A .
A 1 1201 GLN 1201 ? ? ? A .
A 1 1202 GLN 1202 ? ? ? A .
A 1 1203 LEU 1203 ? ? ? A .
A 1 1204 PRO 1204 ? ? ? A .
A 1 1205 GLN 1205 ? ? ? A .
A 1 1206 GLN 1206 ? ? ? A .
A 1 1207 GLN 1207 ? ? ? A .
A 1 1208 GLN 1208 ? ? ? A .
A 1 1209 GLN 1209 ? ? ? A .
A 1 1210 GLN 1210 ? ? ? A .
A 1 1211 PRO 1211 ? ? ? A .
A 1 1212 PRO 1212 ? ? ? A .
A 1 1213 GLN 1213 ? ? ? A .
A 1 1214 GLN 1214 ? ? ? A .
A 1 1215 PRO 1215 ? ? ? A .
A 1 1216 PRO 1216 ? ? ? A .
A 1 1217 GLN 1217 ? ? ? A .
A 1 1218 GLN 1218 ? ? ? A .
A 1 1219 PRO 1219 ? ? ? A .
A 1 1220 GLN 1220 ? ? ? A .
A 1 1221 GLN 1221 ? ? ? A .
A 1 1222 GLN 1222 ? ? ? A .
A 1 1223 ASP 1223 ? ? ? A .
A 1 1224 SER 1224 ? ? ? A .
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A 1 1226 TRP 1226 ? ? ? A .
A 1 1227 GLY 1227 ? ? ? A .
A 1 1228 MET 1228 ? ? ? A .
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A 1 1230 HIS 1230 ? ? ? A .
A 1 1231 SER 1231 ? ? ? A .
A 1 1232 THR 1232 ? ? ? A .
A 1 1233 LEU 1233 ? ? ? A .
A 1 1234 HIS 1234 ? ? ? A .
A 1 1235 SER 1235 ? ? ? A .
A 1 1236 VAL 1236 ? ? ? A .
A 1 1237 PHE 1237 ? ? ? A .
A 1 1238 GLN 1238 ? ? ? A .
A 1 1239 THR 1239 ? ? ? A .
A 1 1240 ASN 1240 ? ? ? A .
A 1 1241 GLN 1241 ? ? ? A .
A 1 1242 SER 1242 ? ? ? A .
A 1 1243 ASN 1243 ? ? ? A .
A 1 1244 ASN 1244 ? ? ? A .
A 1 1245 GLN 1245 ? ? ? A .
A 1 1246 GLN 1246 ? ? ? A .
A 1 1247 SER 1247 ? ? ? A .
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A 1 1250 GLU 1250 ? ? ? A .
A 1 1251 ALA 1251 ? ? ? A .
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A 1 1253 GLN 1253 ? ? ? A .
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A 1 1257 LYS 1257 ? ? ? A .
A 1 1258 LYS 1258 ? ? ? A .
A 1 1259 LYS 1259 ? ? ? A .
A 1 1260 LYS 1260 ? ? ? A .
A 1 1261 GLN 1261 ? ? ? A .
A 1 1262 LYS 1262 ? ? ? A .
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A 1 1264 VAL 1264 ? ? ? A .
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A 1 1267 ASP 1267 ? ? ? A .
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A 1 1270 LEU 1270 ? ? ? A .
A 1 1271 LEU 1271 ? ? ? A .
A 1 1272 GLY 1272 ? ? ? A .
A 1 1273 PHE 1273 ? ? ? A .
A 1 1274 SER 1274 ? ? ? A .
A 1 1275 VAL 1275 ? ? ? A .
A 1 1276 ASN 1276 ? ? ? A .
A 1 1277 ALA 1277 ? ? ? A .
A 1 1278 SER 1278 ? ? ? A .
A 1 1279 SER 1279 ? ? ? A .
A 1 1280 GLU 1280 ? ? ? A .
A 1 1281 ARG 1281 ? ? ? A .
A 1 1282 LEU 1282 ? ? ? A .
A 1 1283 ASN 1283 ? ? ? A .
A 1 1284 MET 1284 ? ? ? A .
A 1 1285 GLY 1285 ? ? ? A .
A 1 1286 GLU 1286 ? ? ? A .
A 1 1287 ILE 1287 ? ? ? A .
A 1 1288 GLU 1288 ? ? ? A .
A 1 1289 THR 1289 ? ? ? A .
A 1 1290 LEU 1290 ? ? ? A .
A 1 1291 ASP 1291 ? ? ? A .
A 1 1292 ASP 1292 ? ? ? A .
A 1 1293 TYR 1293 ? ? ? A .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'GRB10-interacting GYF protein 2 {PDB ID=7rup, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7rup.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by BLAST to 7rup, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 1' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;GPLEMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSP
GPA
;

;GPLEMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSP
GPA
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 5 73
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 7rup 2024-10-23
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1293
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1293 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.84e-42 100.000
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPSDLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGRSSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDGGWRLAGSRRDGERWRPHSPGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSEGSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDEPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPSPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQEHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQVLAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
2 1 2
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7rup.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
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ATOM 174 O OE1 . GLU 547 547 ? A -8.076 0.718 8.569 1 1 A GLU 0.790 1
ATOM 175 O OE2 . GLU 547 547 ? A -7.928 2.249 6.965 1 1 A GLU 0.790 1
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ATOM 202 C CB . TRP 551 551 ? A -5.731 -4.674 1.552 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 203 C CG . TRP 551 551 ? A -5.628 -3.157 1.556 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 204 C CD1 . TRP 551 551 ? A -5.829 -2.287 0.521 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 205 C CD2 . TRP 551 551 ? A -5.269 -2.361 2.691 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 206 N NE1 . TRP 551 551 ? A -5.611 -0.997 0.935 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 207 C CE2 . TRP 551 551 ? A -5.272 -1.007 2.262 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 208 C CE3 . TRP 551 551 ? A -4.974 -2.690 4.005 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 209 C CZ2 . TRP 551 551 ? A -4.976 0.015 3.145 1 1 A TRP 0.690 1
ATOM 210 C CZ3 . TRP 551 551 ? A -4.673 -1.654 4.892 1 1 A TRP 0.690 1
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ATOM 221 C CE2 . PHE 552 552 ? A -8.043 -13.458 2.796 1 1 A PHE 0.770 1
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ATOM 224 C CA . GLN 553 553 ? A -9.858 -9.377 -1.497 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 225 C C . GLN 553 553 ? A -9.411 -8.752 -2.810 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 226 O O . GLN 553 553 ? A -9.601 -9.324 -3.877 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 227 C CB . GLN 553 553 ? A -11.335 -9.031 -1.206 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 228 C CG . GLN 553 553 ? A -11.917 -9.934 -0.096 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 229 C CD . GLN 553 553 ? A -13.429 -9.771 0.071 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 230 O OE1 . GLN 553 553 ? A -14.093 -8.946 -0.543 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 231 N NE2 . GLN 553 553 ? A -14.011 -10.636 0.944 1 1 A GLN 0.730 1
ATOM 232 N N . ALA 554 554 ? A -8.762 -7.572 -2.756 1 1 A ALA 0.690 1
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ATOM 235 O O . ALA 554 554 ? A -6.472 -7.415 -5.545 1 1 A ALA 0.690 1
ATOM 236 C CB . ALA 554 554 ? A -7.837 -5.469 -3.554 1 1 A ALA 0.690 1
ATOM 237 N N . GLY 555 555 ? A -6.280 -8.506 -3.590 1 1 A GLY 0.690 1
ATOM 238 C CA . GLY 555 555 ? A -5.151 -9.326 -4.016 1 1 A GLY 0.690 1
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ATOM 245 C CB . TYR 556 556 ? A -2.626 -5.813 -1.626 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 246 C CG . TYR 556 556 ? A -3.117 -4.690 -2.484 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 247 C CD1 . TYR 556 556 ? A -2.228 -3.994 -3.318 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 248 C CD2 . TYR 556 556 ? A -4.447 -4.261 -2.402 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 249 C CE1 . TYR 556 556 ? A -2.665 -2.877 -4.042 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 250 C CE2 . TYR 556 556 ? A -4.887 -3.144 -3.124 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 251 C CZ . TYR 556 556 ? A -3.989 -2.446 -3.937 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 252 O OH . TYR 556 556 ? A -4.402 -1.291 -4.627 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 253 N N . PHE 557 557 ? A -2.204 -8.957 -0.823 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 254 C CA . PHE 557 557 ? A -1.537 -9.732 0.195 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 255 C C . PHE 557 557 ? A -1.286 -11.153 -0.264 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 256 O O . PHE 557 557 ? A -2.198 -11.904 -0.604 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 257 C CB . PHE 557 557 ? A -2.383 -9.828 1.487 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 258 C CG . PHE 557 557 ? A -2.719 -8.514 2.143 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 259 C CD1 . PHE 557 557 ? A -1.972 -7.332 1.968 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 260 C CD2 . PHE 557 557 ? A -3.773 -8.506 3.070 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 261 C CE1 . PHE 557 557 ? A -2.261 -6.189 2.723 1 1 A PHE 0.690 1
ATOM 262 C CE2 . PHE 557 557 ? A -4.080 -7.357 3.805 1 1 A PHE 0.690 1
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ATOM 264 N N . THR 558 558 ? A -0.011 -11.581 -0.234 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 265 C CA . THR 558 558 ? A 0.347 -12.982 -0.386 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 266 C C . THR 558 558 ? A 0.080 -13.724 0.914 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 267 O O . THR 558 558 ? A -0.151 -13.130 1.965 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 268 C CB . THR 558 558 ? A 1.797 -13.240 -0.831 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 269 O OG1 . THR 558 558 ? A 2.763 -12.926 0.163 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 270 C CG2 . THR 558 558 ? A 2.134 -12.391 -2.063 1 1 A THR 0.740 1
ATOM 271 N N . MET 559 559 ? A 0.154 -15.069 0.901 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 272 C CA . MET 559 559 ? A 0.063 -15.878 2.105 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 273 C C . MET 559 559 ? A 1.265 -15.749 3.033 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 274 O O . MET 559 559 ? A 1.219 -16.168 4.184 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 275 C CB . MET 559 559 ? A -0.176 -17.361 1.734 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 276 C CG . MET 559 559 ? A -1.628 -17.679 1.317 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 277 S SD . MET 559 559 ? A -2.840 -17.468 2.660 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 278 C CE . MET 559 559 ? A -3.485 -15.849 2.165 1 1 A MET 0.740 1
ATOM 279 N N . SER 560 560 ? A 2.356 -15.117 2.561 1 1 A SER 0.760 1
ATOM 280 C CA . SER 560 560 ? A 3.568 -14.937 3.333 1 1 A SER 0.760 1
ATOM 281 C C . SER 560 560 ? A 3.596 -13.584 4.016 1 1 A SER 0.760 1
ATOM 282 O O . SER 560 560 ? A 4.546 -13.265 4.724 1 1 A SER 0.760 1
ATOM 283 C CB . SER 560 560 ? A 4.833 -15.000 2.439 1 1 A SER 0.760 1
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ATOM 285 N N . LEU 561 561 ? A 2.553 -12.740 3.835 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 286 C CA . LEU 561 561 ? A 2.445 -11.475 4.547 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 287 C C . LEU 561 561 ? A 2.300 -11.671 6.045 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 288 O O . LEU 561 561 ? A 1.406 -12.374 6.513 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 289 C CB . LEU 561 561 ? A 1.244 -10.617 4.088 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 290 C CG . LEU 561 561 ? A 1.215 -9.187 4.673 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 291 C CD1 . LEU 561 561 ? A 2.138 -8.243 3.891 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 292 C CD2 . LEU 561 561 ? A -0.220 -8.656 4.702 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 293 N N . LEU 562 562 ? A 3.178 -11.020 6.826 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 294 C CA . LEU 562 562 ? A 3.220 -11.149 8.260 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 295 C C . LEU 562 562 ? A 2.282 -10.162 8.911 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 296 O O . LEU 562 562 ? A 2.451 -8.950 8.769 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 297 C CB . LEU 562 562 ? A 4.648 -10.876 8.776 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 298 C CG . LEU 562 562 ? A 5.689 -11.890 8.274 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 299 C CD1 . LEU 562 562 ? A 7.111 -11.326 8.398 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 300 C CD2 . LEU 562 562 ? A 5.556 -13.228 9.011 1 1 A LEU 0.790 1
ATOM 301 N N . VAL 563 563 ? A 1.284 -10.658 9.658 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 302 C CA . VAL 563 563 ? A 0.265 -9.833 10.266 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 303 C C . VAL 563 563 ? A 0.173 -10.131 11.740 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 304 O O . VAL 563 563 ? A 0.540 -11.214 12.200 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 305 C CB . VAL 563 563 ? A -1.122 -10.020 9.643 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 306 C CG1 . VAL 563 563 ? A -1.039 -9.761 8.131 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 307 C CG2 . VAL 563 563 ? A -1.690 -11.428 9.904 1 1 A VAL 0.830 1
ATOM 308 N N . LYS 564 564 ? A -0.328 -9.161 12.520 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 309 C CA . LYS 564 564 ? A -0.812 -9.430 13.852 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 310 C C . LYS 564 564 ? A -1.696 -8.298 14.295 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 311 O O . LYS 564 564 ? A -1.640 -7.192 13.757 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 312 C CB . LYS 564 564 ? A 0.302 -9.605 14.923 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 313 C CG . LYS 564 564 ? A 1.117 -8.352 15.303 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 314 C CD . LYS 564 564 ? A 2.289 -8.646 16.264 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 315 C CE . LYS 564 564 ? A 1.955 -9.368 17.576 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 316 N NZ . LYS 564 564 ? A 1.195 -8.528 18.519 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 317 N N . ARG 565 565 ? A -2.521 -8.518 15.325 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 318 C CA . ARG 565 565 ? A -3.097 -7.450 16.097 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 319 C C . ARG 565 565 ? A -2.165 -7.109 17.243 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 320 O O . ARG 565 565 ? A -1.230 -7.836 17.568 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 321 C CB . ARG 565 565 ? A -4.491 -7.835 16.641 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 322 C CG . ARG 565 565 ? A -5.492 -8.119 15.506 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 323 C CD . ARG 565 565 ? A -6.690 -8.982 15.903 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 324 N NE . ARG 565 565 ? A -6.167 -10.354 16.162 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 325 C CZ . ARG 565 565 ? A -6.900 -11.468 16.255 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 326 N NH1 . ARG 565 565 ? A -8.212 -11.446 16.047 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 327 N NH2 . ARG 565 565 ? A -6.308 -12.615 16.565 1 1 A ARG 0.570 1
ATOM 328 N N . ALA 566 566 ? A -2.401 -5.980 17.934 1 1 A ALA 0.470 1
ATOM 329 C CA . ALA 566 566 ? A -1.648 -5.624 19.130 1 1 A ALA 0.470 1
ATOM 330 C C . ALA 566 566 ? A -1.729 -6.670 20.253 1 1 A ALA 0.470 1
ATOM 331 O O . ALA 566 566 ? A -0.738 -6.958 20.910 1 1 A ALA 0.470 1
ATOM 332 C CB . ALA 566 566 ? A -2.104 -4.251 19.658 1 1 A ALA 0.470 1
ATOM 333 N N . CYS 567 567 ? A -2.925 -7.280 20.418 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 334 C CA . CYS 567 567 ? A -3.262 -8.308 21.388 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 335 C C . CYS 567 567 ? A -2.734 -9.710 21.072 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 336 O O . CYS 567 567 ? A -2.676 -10.560 21.955 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 337 C CB . CYS 567 567 ? A -4.813 -8.363 21.559 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 338 S SG . CYS 567 567 ? A -5.757 -8.602 20.012 1 1 A CYS 0.330 1
ATOM 339 N N . ASP 568 568 ? A -2.331 -9.998 19.813 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 340 C CA . ASP 568 568 ? A -1.794 -11.296 19.438 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 341 C C . ASP 568 568 ? A -0.362 -11.466 19.967 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 342 O O . ASP 568 568 ? A 0.372 -10.490 20.105 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 343 C CB . ASP 568 568 ? A -1.816 -11.497 17.896 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 344 C CG . ASP 568 568 ? A -3.214 -11.576 17.320 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 345 O OD1 . ASP 568 568 ? A -4.011 -12.457 17.720 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 346 O OD2 . ASP 568 568 ? A -3.531 -10.755 16.424 1 1 A ASP 0.460 1
ATOM 347 N N . GLU 569 569 ? A 0.081 -12.712 20.252 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 348 C CA . GLU 569 569 ? A 1.425 -13.051 20.729 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 349 C C . GLU 569 569 ? A 2.528 -12.622 19.777 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 350 O O . GLU 569 569 ? A 3.497 -11.963 20.134 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 351 C CB . GLU 569 569 ? A 1.506 -14.597 20.918 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 352 C CG . GLU 569 569 ? A 2.895 -15.196 21.274 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 353 C CD . GLU 569 569 ? A 3.421 -14.735 22.631 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 354 O OE1 . GLU 569 569 ? A 2.598 -14.294 23.472 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 355 O OE2 . GLU 569 569 ? A 4.656 -14.861 22.831 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 356 N N . SER 570 570 ? A 2.363 -12.933 18.480 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 357 C CA . SER 570 570 ? A 3.454 -12.819 17.540 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 358 C C . SER 570 570 ? A 2.885 -12.490 16.184 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 359 O O . SER 570 570 ? A 1.694 -12.661 15.940 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 360 C CB . SER 570 570 ? A 4.266 -14.136 17.457 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 361 O OG . SER 570 570 ? A 5.444 -13.983 16.663 1 1 A SER 0.640 1
ATOM 362 N N . PHE 571 571 ? A 3.730 -11.962 15.277 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 363 C CA . PHE 571 571 ? A 3.467 -11.915 13.851 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 364 C C . PHE 571 571 ? A 3.377 -13.316 13.283 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 365 O O . PHE 571 571 ? A 4.173 -14.192 13.614 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 366 C CB . PHE 571 571 ? A 4.584 -11.167 13.076 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 367 C CG . PHE 571 571 ? A 4.412 -9.678 13.134 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 368 C CD1 . PHE 571 571 ? A 3.517 -9.079 12.242 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 369 C CD2 . PHE 571 571 ? A 5.132 -8.859 14.021 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 370 C CE1 . PHE 571 571 ? A 3.329 -7.696 12.226 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 371 C CE2 . PHE 571 571 ? A 4.947 -7.467 14.010 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 372 C CZ . PHE 571 571 ? A 4.047 -6.886 13.109 1 1 A PHE 0.670 1
ATOM 373 N N . GLN 572 572 ? A 2.411 -13.551 12.390 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 374 C CA . GLN 572 572 ? A 2.270 -14.824 11.736 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 375 C C . GLN 572 572 ? A 2.114 -14.529 10.266 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 376 O O . GLN 572 572 ? A 1.528 -13.496 9.932 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 377 C CB . GLN 572 572 ? A 1.000 -15.551 12.230 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 378 C CG . GLN 572 572 ? A 1.043 -15.923 13.726 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 379 C CD . GLN 572 572 ? A -0.314 -16.461 14.174 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 380 O OE1 . GLN 572 572 ? A -1.221 -15.727 14.526 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 381 N NE2 . GLN 572 572 ? A -0.464 -17.809 14.159 1 1 A GLN 0.740 1
ATOM 382 N N . PRO 573 573 ? A 2.588 -15.341 9.333 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 383 C CA . PRO 573 573 ? A 2.145 -15.237 7.957 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 384 C C . PRO 573 573 ? A 0.670 -15.602 7.849 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 385 O O . PRO 573 573 ? A 0.172 -16.427 8.620 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 386 C CB . PRO 573 573 ? A 3.080 -16.183 7.189 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 387 C CG . PRO 573 573 ? A 3.494 -17.235 8.216 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 388 C CD . PRO 573 573 ? A 3.449 -16.506 9.560 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 389 N N . LEU 574 574 ? A -0.063 -14.995 6.897 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 390 C CA . LEU 574 574 ? A -1.470 -15.273 6.650 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 391 C C . LEU 574 574 ? A -1.756 -16.740 6.371 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 392 O O . LEU 574 574 ? A -2.766 -17.286 6.801 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 393 C CB . LEU 574 574 ? A -1.990 -14.435 5.462 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 394 C CG . LEU 574 574 ? A -2.173 -12.935 5.749 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 395 C CD1 . LEU 574 574 ? A -2.519 -12.203 4.446 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 396 C CD2 . LEU 574 574 ? A -3.274 -12.680 6.786 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 397 N N . GLY 575 575 ? A -0.831 -17.421 5.667 1 1 A GLY 0.790 1
ATOM 398 C CA . GLY 575 575 ? A -0.903 -18.855 5.434 1 1 A GLY 0.790 1
ATOM 399 C C . GLY 575 575 ? A -0.870 -19.721 6.671 1 1 A GLY 0.790 1
ATOM 400 O O . GLY 575 575 ? A -1.583 -20.716 6.729 1 1 A GLY 0.790 1
ATOM 401 N N . ASP 576 576 ? A -0.095 -19.368 7.715 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 402 C CA . ASP 576 576 ? A -0.113 -20.085 8.981 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 403 C C . ASP 576 576 ? A -1.420 -19.882 9.723 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 404 O O . ASP 576 576 ? A -1.991 -20.819 10.276 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 405 C CB . ASP 576 576 ? A 1.079 -19.722 9.891 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 406 C CG . ASP 576 576 ? A 2.368 -20.356 9.380 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 407 O OD1 . ASP 576 576 ? A 2.336 -21.109 8.367 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 408 O OD2 . ASP 576 576 ? A 3.410 -20.077 10.023 1 1 A ASP 0.690 1
ATOM 409 N N . ILE 577 577 ? A -1.969 -18.649 9.707 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 410 C CA . ILE 577 577 ? A -3.273 -18.366 10.299 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 411 C C . ILE 577 577 ? A -4.377 -19.179 9.622 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 412 O O . ILE 577 577 ? A -5.217 -19.800 10.271 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 413 C CB . ILE 577 577 ? A -3.610 -16.877 10.278 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 414 C CG1 . ILE 577 577 ? A -2.565 -16.074 11.086 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 415 C CG2 . ILE 577 577 ? A -5.033 -16.638 10.836 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 416 C CD1 . ILE 577 577 ? A -2.717 -14.555 10.953 1 1 A ILE 0.710 1
ATOM 417 N N . MET 578 578 ? A -4.341 -19.255 8.279 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 418 C CA . MET 578 578 ? A -5.214 -20.105 7.492 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 419 C C . MET 578 578 ? A -5.098 -21.590 7.808 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 420 O O . MET 578 578 ? A -6.101 -22.282 7.935 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 421 C CB . MET 578 578 ? A -4.925 -19.915 5.985 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 422 C CG . MET 578 578 ? A -5.515 -18.630 5.379 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 423 S SD . MET 578 578 ? A -7.326 -18.463 5.490 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 424 C CE . MET 578 578 ? A -7.881 -20.144 5.084 1 1 A MET 0.660 1
ATOM 425 N N . LYS 579 579 ? A -3.870 -22.117 7.965 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 426 C CA . LYS 579 579 ? A -3.644 -23.495 8.372 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 427 C C . LYS 579 579 ? A -4.159 -23.837 9.764 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 428 O O . LYS 579 579 ? A -4.719 -24.903 9.988 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 429 C CB . LYS 579 579 ? A -2.138 -23.834 8.322 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 430 C CG . LYS 579 579 ? A -1.583 -23.911 6.896 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 431 C CD . LYS 579 579 ? A -0.066 -24.137 6.890 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 432 C CE . LYS 579 579 ? A 0.528 -24.116 5.485 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 433 N NZ . LYS 579 579 ? A 1.989 -24.314 5.574 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 434 N N . MET 580 580 ? A -3.945 -22.931 10.733 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 435 C CA . MET 580 580 ? A -4.322 -23.126 12.116 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 436 C C . MET 580 580 ? A -5.798 -22.908 12.442 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 437 O O . MET 580 580 ? A -6.377 -23.648 13.232 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 438 C CB . MET 580 580 ? A -3.432 -22.220 12.997 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 439 C CG . MET 580 580 ? A -1.954 -22.665 13.049 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 440 S SD . MET 580 580 ? A -1.683 -24.366 13.646 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 441 C CE . MET 580 580 ? A -2.463 -24.198 15.278 1 1 A MET 0.510 1
ATOM 442 N N . TRP 581 581 ? A -6.443 -21.876 11.854 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 443 C CA . TRP 581 581 ? A -7.818 -21.525 12.179 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 444 C C . TRP 581 581 ? A -8.807 -21.732 11.037 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 445 O O . TRP 581 581 ? A -10.014 -21.605 11.224 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 446 C CB . TRP 581 581 ? A -7.884 -20.029 12.590 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 447 C CG . TRP 581 581 ? A -7.452 -19.746 14.023 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 448 C CD1 . TRP 581 581 ? A -8.213 -19.790 15.156 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 449 C CD2 . TRP 581 581 ? A -6.139 -19.353 14.434 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 450 N NE1 . TRP 581 581 ? A -7.460 -19.432 16.252 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 451 C CE2 . TRP 581 581 ? A -6.180 -19.161 15.837 1 1 A TRP 0.430 1
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ATOM 453 C CZ2 . TRP 581 581 ? A -5.046 -18.765 16.531 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 454 C CZ3 . TRP 581 581 ? A -3.829 -18.768 14.424 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 455 C CH2 . TRP 581 581 ? A -3.861 -18.566 15.809 1 1 A TRP 0.430 1
ATOM 456 N N . GLY 582 582 ? A -8.339 -22.036 9.808 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 457 C CA . GLY 582 582 ? A -9.209 -22.229 8.644 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 458 C C . GLY 582 582 ? A -9.731 -20.948 8.049 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 459 O O . GLY 582 582 ? A -10.489 -20.956 7.085 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 460 N N . ARG 583 583 ? A -9.331 -19.798 8.614 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 461 C CA . ARG 583 583 ? A -9.760 -18.497 8.170 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 462 C C . ARG 583 583 ? A -8.834 -17.464 8.768 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 463 O O . ARG 583 583 ? A -8.152 -17.738 9.751 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 464 C CB . ARG 583 583 ? A -11.217 -18.168 8.600 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 465 C CG . ARG 583 583 ? A -11.452 -18.143 10.127 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 466 C CD . ARG 583 583 ? A -12.906 -17.874 10.543 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 467 N NE . ARG 583 583 ? A -13.293 -16.473 10.120 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 468 C CZ . ARG 583 583 ? A -13.165 -15.366 10.866 1 1 A ARG 0.540 1
ATOM 469 N NH1 . ARG 583 583 ? A -12.664 -15.418 12.097 1 1 A ARG 0.540 1
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ATOM 471 N N . VAL 584 584 ? A -8.813 -16.228 8.226 1 1 A VAL 0.800 1
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ATOM 476 C CG1 . VAL 584 584 ? A -6.183 -15.228 7.330 1 1 A VAL 0.800 1
ATOM 477 C CG2 . VAL 584 584 ? A -8.088 -13.652 6.760 1 1 A VAL 0.800 1
ATOM 478 N N . PRO 585 585 ? A -8.948 -13.606 10.709 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 479 C CA . PRO 585 585 ? A -10.042 -13.090 11.523 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 480 C C . PRO 585 585 ? A -10.822 -11.935 10.931 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 481 O O . PRO 585 585 ? A -11.983 -11.788 11.299 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 482 C CB . PRO 585 585 ? A -9.409 -12.678 12.855 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 483 C CG . PRO 585 585 ? A -8.119 -13.492 12.936 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 484 C CD . PRO 585 585 ? A -7.701 -13.669 11.474 1 1 A PRO 0.790 1
ATOM 485 N N . PHE 586 586 ? A -10.189 -11.112 10.063 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 486 C CA . PHE 586 586 ? A -10.763 -9.917 9.474 1 1 A PHE 0.710 1
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ATOM 488 O O . PHE 586 586 ? A -12.378 -9.325 7.809 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 489 C CB . PHE 586 586 ? A -9.663 -8.869 9.093 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 490 C CG . PHE 586 586 ? A -8.555 -9.390 8.207 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 491 C CD1 . PHE 586 586 ? A -8.775 -9.638 6.843 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 492 C CD2 . PHE 586 586 ? A -7.254 -9.568 8.714 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 493 C CE1 . PHE 586 586 ? A -7.735 -10.080 6.020 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 494 C CE2 . PHE 586 586 ? A -6.209 -9.997 7.886 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 495 C CZ . PHE 586 586 ? A -6.448 -10.249 6.534 1 1 A PHE 0.710 1
ATOM 496 N N . SER 587 587 ? A -11.684 -11.460 7.767 1 1 A SER 0.780 1
ATOM 497 C CA . SER 587 587 ? A -12.562 -11.858 6.667 1 1 A SER 0.780 1
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ATOM 501 O OG . SER 587 587 ? A -11.076 -13.446 5.538 1 1 A SER 0.780 1
ATOM 502 N N . PRO 588 588 ? A -14.874 -10.995 6.318 1 1 A PRO 0.560 1
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ATOM 515 C C . PRO 590 590 ? A -22.280 -14.280 9.755 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 516 O O . PRO 590 590 ? A -21.149 -14.802 9.957 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 517 C CB . PRO 590 590 ? A -23.586 -14.535 7.622 1 1 A PRO 0.230 1
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ATOM 519 C CD . PRO 590 590 ? A -21.474 -14.737 6.535 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 520 O OXT . PRO 590 590 ? A -23.204 -14.271 10.620 1 1 A PRO 0.230 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.670
2 1 3 0.030
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 528 GLN 1 0.380
2 1 A 529 LYS 1 0.540
3 1 A 530 TRP 1 0.600
4 1 A 531 TYR 1 0.710
5 1 A 532 TYR 1 0.760
6 1 A 533 LYS 1 0.740
7 1 A 534 ASP 1 0.740
8 1 A 535 PRO 1 0.670
9 1 A 536 GLN 1 0.610
10 1 A 537 GLY 1 0.760
11 1 A 538 GLU 1 0.730
12 1 A 539 ILE 1 0.720
13 1 A 540 GLN 1 0.710
14 1 A 541 GLY 1 0.740
15 1 A 542 PRO 1 0.680
16 1 A 543 PHE 1 0.650
17 1 A 544 ASN 1 0.670
18 1 A 545 ASN 1 0.760
19 1 A 546 GLN 1 0.780
20 1 A 547 GLU 1 0.790
21 1 A 548 MET 1 0.830
22 1 A 549 ALA 1 0.890
23 1 A 550 GLU 1 0.820
24 1 A 551 TRP 1 0.690
25 1 A 552 PHE 1 0.770
26 1 A 553 GLN 1 0.730
27 1 A 554 ALA 1 0.690
28 1 A 555 GLY 1 0.690
29 1 A 556 TYR 1 0.620
30 1 A 557 PHE 1 0.690
31 1 A 558 THR 1 0.740
32 1 A 559 MET 1 0.740
33 1 A 560 SER 1 0.760
34 1 A 561 LEU 1 0.790
35 1 A 562 LEU 1 0.790
36 1 A 563 VAL 1 0.830
37 1 A 564 LYS 1 0.740
38 1 A 565 ARG 1 0.570
39 1 A 566 ALA 1 0.470
40 1 A 567 CYS 1 0.330
41 1 A 568 ASP 1 0.460
42 1 A 569 GLU 1 0.520
43 1 A 570 SER 1 0.640
44 1 A 571 PHE 1 0.670
45 1 A 572 GLN 1 0.740
46 1 A 573 PRO 1 0.790
47 1 A 574 LEU 1 0.800
48 1 A 575 GLY 1 0.790
49 1 A 576 ASP 1 0.690
50 1 A 577 ILE 1 0.710
51 1 A 578 MET 1 0.660
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53 1 A 580 MET 1 0.510
54 1 A 581 TRP 1 0.430
55 1 A 582 GLY 1 0.530
56 1 A 583 ARG 1 0.540
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63 1 A 590 PRO 1 0.230
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#