data_SMR-7386c7b6e7b2cf60d1ea630ab9b392df_2 _entry.id SMR-7386c7b6e7b2cf60d1ea630ab9b392df_2 _struct.entry_id SMR-7386c7b6e7b2cf60d1ea630ab9b392df_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P51816/ AFF2_HUMAN, AF4/FMR2 family member 2 Estimated model accuracy of this model is 0.01, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P51816' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 168558.267 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFF2_HUMAN P51816 1 ;MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANR VQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPS VVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVE ESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSM GQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSL PSDPSCVEEILREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSES ESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPP PIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQ PKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGP GKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLS ISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTA VTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEE KLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKAS SATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPL LSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEA KSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFK QNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHW DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL ; 'AF4/FMR2 family member 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1311 1 1311 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFF2_HUMAN P51816 . 1 1311 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-10-17 B5310BC074F893CB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANR VQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPS VVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVE ESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSM GQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSL PSDPSCVEEILREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSES ESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPP PIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQ 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DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 LEU . 1 4 PHE . 1 5 ASP . 1 6 PHE . 1 7 PHE . 1 8 ARG . 1 9 ASP . 1 10 TRP . 1 11 ASP . 1 12 LEU . 1 13 GLU . 1 14 GLN . 1 15 GLN . 1 16 CYS . 1 17 HIS . 1 18 TYR . 1 19 GLU . 1 20 GLN . 1 21 ASP . 1 22 ARG . 1 23 SER . 1 24 ALA . 1 25 LEU . 1 26 LYS . 1 27 LYS . 1 28 ARG . 1 29 GLU . 1 30 TRP . 1 31 GLU . 1 32 ARG . 1 33 ARG . 1 34 ASN . 1 35 GLN . 1 36 GLU . 1 37 VAL . 1 38 GLN . 1 39 GLN . 1 40 GLU . 1 41 ASP . 1 42 ASP . 1 43 LEU . 1 44 PHE . 1 45 SER . 1 46 SER . 1 47 GLY . 1 48 PHE . 1 49 ASP . 1 50 LEU . 1 51 PHE . 1 52 GLY . 1 53 GLU . 1 54 PRO . 1 55 TYR . 1 56 LYS . 1 57 VAL . 1 58 ALA . 1 59 GLU . 1 60 TYR . 1 61 THR . 1 62 ASN . 1 63 LYS . 1 64 GLY . 1 65 ASP . 1 66 ALA . 1 67 LEU . 1 68 ALA . 1 69 ASN . 1 70 ARG . 1 71 VAL . 1 72 GLN . 1 73 ASN . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 GLY . 1 77 ASN . 1 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C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AF4/FMR2 family member 4 {PDB ID=4ogr, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=4ogr.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4ogr, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 3 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SNANREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGD RSIPK ; ;SNANREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGD RSIPK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 74 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4ogr 2024-11-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1311 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1311 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4e-31 50.704 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL 2 1 2 -----------------NREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKV---TSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4ogr.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 20 20 ? A 50.192 -41.868 -48.621 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 2 C CA . GLN 20 20 ? A 50.816 -40.896 -49.582 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 3 C C . GLN 20 20 ? A 49.953 -39.690 -49.900 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 4 O O . GLN 20 20 ? A 50.476 -38.594 -50.028 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 5 C CB . GLN 20 20 ? A 51.214 -41.665 -50.865 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 6 C CG . GLN 20 20 ? A 52.354 -42.699 -50.649 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 7 C CD . GLN 20 20 ? A 52.656 -43.436 -51.962 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 20 20 ? A 51.792 -43.552 -52.812 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 20 20 ? A 53.896 -43.966 -52.100 1 1 C GLN 0.360 1 ATOM 10 N N . ASP 21 21 ? A 48.609 -39.857 -49.979 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 11 C CA . ASP 21 21 ? A 47.672 -38.783 -50.156 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 12 C C . ASP 21 21 ? A 47.670 -37.821 -48.972 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 13 O O . ASP 21 21 ? A 47.927 -38.214 -47.828 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 14 C CB . ASP 21 21 ? A 46.282 -39.412 -50.414 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 15 C CG . ASP 21 21 ? A 45.345 -38.339 -50.926 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 16 O OD1 . ASP 21 21 ? A 44.830 -37.572 -50.070 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 17 O OD2 . ASP 21 21 ? A 45.214 -38.233 -52.161 1 1 C ASP 0.460 1 ATOM 18 N N . ARG 22 22 ? A 47.372 -36.541 -49.240 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 19 C CA . ARG 22 22 ? A 47.261 -35.468 -48.281 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 20 C C . ARG 22 22 ? A 46.182 -35.687 -47.259 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 21 O O . ARG 22 22 ? A 46.393 -35.408 -46.093 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 22 C CB . ARG 22 22 ? A 46.953 -34.125 -48.983 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 23 C CG . ARG 22 22 ? A 48.006 -33.711 -50.024 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 24 C CD . ARG 22 22 ? A 49.408 -33.709 -49.420 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 25 N NE . ARG 22 22 ? A 50.339 -33.132 -50.431 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 26 C CZ . ARG 22 22 ? A 51.667 -33.296 -50.385 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 27 N NH1 . ARG 22 22 ? A 52.236 -34.036 -49.439 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 28 N NH2 . ARG 22 22 ? A 52.440 -32.710 -51.294 1 1 C ARG 0.560 1 ATOM 29 N N . SER 23 23 ? A 45.006 -36.216 -47.660 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 30 C CA . SER 23 23 ? A 43.925 -36.508 -46.730 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 31 C C . SER 23 23 ? A 44.328 -37.539 -45.698 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 32 O O . SER 23 23 ? A 44.033 -37.404 -44.517 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 33 C CB . SER 23 23 ? A 42.661 -37.057 -47.431 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 34 O OG . SER 23 23 ? A 41.949 -36.040 -48.130 1 1 C SER 0.690 1 ATOM 35 N N . ALA 24 24 ? A 45.044 -38.602 -46.117 1 1 C ALA 0.800 1 ATOM 36 C CA . ALA 24 24 ? A 45.587 -39.586 -45.204 1 1 C ALA 0.800 1 ATOM 37 C C . ALA 24 24 ? A 46.711 -39.053 -44.318 1 1 C ALA 0.800 1 ATOM 38 O O . ALA 24 24 ? A 46.709 -39.278 -43.116 1 1 C ALA 0.800 1 ATOM 39 C CB . ALA 24 24 ? A 46.108 -40.800 -45.995 1 1 C ALA 0.800 1 ATOM 40 N N . LEU 25 25 ? A 47.685 -38.306 -44.887 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 41 C CA . LEU 25 25 ? A 48.781 -37.677 -44.158 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 42 C C . LEU 25 25 ? A 48.302 -36.652 -43.138 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 43 O O . LEU 25 25 ? A 48.847 -36.541 -42.046 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 44 C CB . LEU 25 25 ? A 49.792 -37.023 -45.140 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 45 C CG . LEU 25 25 ? A 50.593 -38.017 -46.020 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 46 C CD1 . LEU 25 25 ? A 51.413 -37.248 -47.073 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 47 C CD2 . LEU 25 25 ? A 51.508 -38.932 -45.187 1 1 C LEU 0.740 1 ATOM 48 N N . LYS 26 26 ? A 47.231 -35.910 -43.473 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 49 C CA . LYS 26 26 ? A 46.543 -35.006 -42.581 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 50 C C . LYS 26 26 ? A 45.832 -35.682 -41.409 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 51 O O . LYS 26 26 ? A 45.922 -35.242 -40.265 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 52 C CB . LYS 26 26 ? A 45.495 -34.222 -43.404 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 53 C CG . LYS 26 26 ? A 44.827 -33.096 -42.612 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 54 C CD . LYS 26 26 ? A 43.888 -32.242 -43.472 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 55 C CE . LYS 26 26 ? A 43.245 -31.111 -42.664 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 56 N NZ . LYS 26 26 ? A 42.352 -30.304 -43.521 1 1 C LYS 0.780 1 ATOM 57 N N . LYS 27 27 ? A 45.090 -36.782 -41.669 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 58 C CA . LYS 27 27 ? A 44.406 -37.561 -40.645 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 59 C C . LYS 27 27 ? A 45.334 -38.285 -39.692 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 60 O O . LYS 27 27 ? A 45.107 -38.303 -38.487 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 61 C CB . LYS 27 27 ? A 43.455 -38.600 -41.265 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 62 C CG . LYS 27 27 ? A 42.234 -37.952 -41.923 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 63 C CD . LYS 27 27 ? A 41.344 -39.008 -42.587 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 64 C CE . LYS 27 27 ? A 40.148 -38.386 -43.308 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 65 N NZ . LYS 27 27 ? A 39.326 -39.443 -43.933 1 1 C LYS 0.750 1 ATOM 66 N N . ARG 28 28 ? A 46.431 -38.867 -40.218 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 67 C CA . ARG 28 28 ? A 47.476 -39.496 -39.429 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 68 C C . ARG 28 28 ? A 48.130 -38.515 -38.451 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 69 O O . ARG 28 28 ? A 48.450 -38.854 -37.317 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 70 C CB . ARG 28 28 ? A 48.561 -40.089 -40.368 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 71 C CG . ARG 28 28 ? A 48.123 -41.329 -41.181 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 72 C CD . ARG 28 28 ? A 49.230 -41.782 -42.138 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 73 N NE . ARG 28 28 ? A 48.713 -42.947 -42.936 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 74 C CZ . ARG 28 28 ? A 49.370 -43.512 -43.956 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 75 N NH1 . ARG 28 28 ? A 50.555 -43.041 -44.344 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 76 N NH2 . ARG 28 28 ? A 48.890 -44.608 -44.543 1 1 C ARG 0.610 1 ATOM 77 N N . GLU 29 29 ? A 48.312 -37.245 -38.878 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 78 C CA . GLU 29 29 ? A 48.790 -36.173 -38.025 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 79 C C . GLU 29 29 ? A 47.758 -35.694 -37.004 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 80 O O . GLU 29 29 ? A 48.088 -35.355 -35.867 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 81 C CB . GLU 29 29 ? A 49.306 -34.993 -38.879 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 82 C CG . GLU 29 29 ? A 49.885 -33.805 -38.044 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 83 C CD . GLU 29 29 ? A 50.983 -34.138 -37.018 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 84 O OE1 . GLU 29 29 ? A 51.612 -35.222 -37.077 1 1 C GLU 0.700 1 ATOM 85 O OE2 . GLU 29 29 ? 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A 37.519 -35.707 -19.076 1 1 C ASP 0.510 1 ATOM 198 O OD2 . ASP 41 41 ? A 37.741 -37.882 -19.472 1 1 C ASP 0.510 1 ATOM 199 N N . ASP 42 42 ? A 37.102 -40.758 -17.432 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 200 C CA . ASP 42 42 ? A 36.087 -41.707 -17.842 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 201 C C . ASP 42 42 ? A 36.097 -43.003 -17.015 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 202 O O . ASP 42 42 ? A 35.563 -44.032 -17.393 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 203 C CB . ASP 42 42 ? A 36.241 -41.945 -19.380 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 204 C CG . ASP 42 42 ? A 37.568 -42.547 -19.841 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 205 O OD1 . ASP 42 42 ? A 37.658 -42.839 -21.063 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 206 O OD2 . ASP 42 42 ? A 38.480 -42.741 -18.996 1 1 C ASP 0.490 1 ATOM 207 N N . LEU 43 43 ? A 36.710 -42.948 -15.806 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 208 C CA . LEU 43 43 ? A 37.037 -44.137 -15.045 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 209 C C . LEU 43 43 ? A 35.870 -44.774 -14.313 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 210 O O . LEU 43 43 ? A 35.615 -45.959 -14.393 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 211 C CB . LEU 43 43 ? A 38.113 -43.777 -13.993 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 212 C CG . LEU 43 43 ? A 39.451 -43.315 -14.601 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 213 C CD1 . LEU 43 43 ? A 40.382 -42.838 -13.475 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 214 C CD2 . LEU 43 43 ? A 40.121 -44.424 -15.434 1 1 C LEU 0.480 1 ATOM 215 N N . PHE 44 44 ? A 35.124 -43.946 -13.560 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 216 C CA . PHE 44 44 ? A 34.003 -44.426 -12.799 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 217 C C . PHE 44 44 ? A 33.066 -43.257 -12.635 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 218 O O . PHE 44 44 ? A 33.479 -42.097 -12.700 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 219 C CB . PHE 44 44 ? A 34.417 -45.047 -11.414 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 220 C CG . PHE 44 44 ? A 35.092 -44.052 -10.486 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 221 C CD1 . PHE 44 44 ? A 36.474 -43.812 -10.562 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 222 C CD2 . PHE 44 44 ? A 34.339 -43.310 -9.559 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 223 C CE1 . PHE 44 44 ? A 37.086 -42.843 -9.756 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 224 C CE2 . PHE 44 44 ? A 34.945 -42.342 -8.747 1 1 C PHE 0.470 1 ATOM 225 C CZ . PHE 44 44 ? 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A 26.537 -58.771 16.245 1 1 C ASN 0.550 1 ATOM 366 C CG . ASN 62 62 ? A 25.290 -59.647 16.163 1 1 C ASN 0.550 1 ATOM 367 O OD1 . ASN 62 62 ? A 25.267 -60.679 15.507 1 1 C ASN 0.550 1 ATOM 368 N ND2 . ASN 62 62 ? A 24.219 -59.237 16.885 1 1 C ASN 0.550 1 ATOM 369 N N . LYS 63 63 ? A 28.134 -59.549 13.502 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 370 C CA . LYS 63 63 ? A 29.272 -59.703 14.401 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 371 C C . LYS 63 63 ? A 30.102 -58.451 14.646 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 372 O O . LYS 63 63 ? A 30.309 -57.630 13.768 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 373 C CB . LYS 63 63 ? A 30.180 -60.893 14.045 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 374 C CG . LYS 63 63 ? A 29.405 -62.210 14.146 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 375 C CD . LYS 63 63 ? A 30.319 -63.394 13.837 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 376 C CE . LYS 63 63 ? A 29.603 -64.742 13.907 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 377 N NZ . LYS 63 63 ? A 30.553 -65.818 13.553 1 1 C LYS 0.390 1 ATOM 378 N N . GLY 64 64 ? A 30.602 -58.280 15.887 1 1 C GLY 0.620 1 ATOM 379 C CA . GLY 64 64 ? 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A 21.306 -29.565 7.270 1 1 C HIS 0.300 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.574 2 1 3 0.010 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 20 GLN 1 0.360 2 1 A 21 ASP 1 0.460 3 1 A 22 ARG 1 0.560 4 1 A 23 SER 1 0.690 5 1 A 24 ALA 1 0.800 6 1 A 25 LEU 1 0.740 7 1 A 26 LYS 1 0.780 8 1 A 27 LYS 1 0.750 9 1 A 28 ARG 1 0.610 10 1 A 29 GLU 1 0.700 11 1 A 30 TRP 1 0.650 12 1 A 31 GLU 1 0.660 13 1 A 32 ARG 1 0.590 14 1 A 33 ARG 1 0.610 15 1 A 34 ASN 1 0.760 16 1 A 35 GLN 1 0.740 17 1 A 36 GLU 1 0.640 18 1 A 37 VAL 1 0.610 19 1 A 38 GLN 1 0.480 20 1 A 39 GLN 1 0.470 21 1 A 40 GLU 1 0.420 22 1 A 41 ASP 1 0.510 23 1 A 42 ASP 1 0.490 24 1 A 43 LEU 1 0.480 25 1 A 44 PHE 1 0.470 26 1 A 45 SER 1 0.510 27 1 A 46 SER 1 0.510 28 1 A 47 GLY 1 0.570 29 1 A 48 PHE 1 0.400 30 1 A 49 ASP 1 0.490 31 1 A 50 LEU 1 0.430 32 1 A 51 PHE 1 0.390 33 1 A 52 GLY 1 0.530 34 1 A 53 GLU 1 0.430 35 1 A 54 PRO 1 0.500 36 1 A 55 TYR 1 0.450 37 1 A 56 LYS 1 0.590 38 1 A 57 VAL 1 0.400 39 1 A 58 ALA 1 0.520 40 1 A 59 GLU 1 0.520 41 1 A 60 TYR 1 0.520 42 1 A 61 THR 1 0.560 43 1 A 62 ASN 1 0.550 44 1 A 63 LYS 1 0.390 45 1 A 64 GLY 1 0.620 46 1 A 65 ASP 1 0.640 47 1 A 66 ALA 1 0.700 48 1 A 67 LEU 1 0.670 49 1 A 68 ALA 1 0.780 50 1 A 69 ASN 1 0.690 51 1 A 70 ARG 1 0.550 52 1 A 71 VAL 1 0.710 53 1 A 72 GLN 1 0.720 54 1 A 73 ASN 1 0.730 55 1 A 74 THR 1 0.760 56 1 A 75 LEU 1 0.730 57 1 A 76 GLY 1 0.790 58 1 A 77 ASN 1 0.720 59 1 A 78 TYR 1 0.590 60 1 A 79 ASP 1 0.670 61 1 A 80 GLU 1 0.610 62 1 A 81 MET 1 0.530 63 1 A 82 LYS 1 0.530 64 1 A 83 ASN 1 0.510 65 1 A 84 LEU 1 0.500 66 1 A 85 LEU 1 0.470 67 1 A 86 THR 1 0.420 68 1 A 87 ASN 1 0.390 69 1 A 88 HIS 1 0.300 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #