data_SMR-99bdfad7be78f4b292dd4536a18ae91b_2 _entry.id SMR-99bdfad7be78f4b292dd4536a18ae91b_2 _struct.entry_id SMR-99bdfad7be78f4b292dd4536a18ae91b_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5T5Y3 (isoform 2)/ CAMP1_HUMAN, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.02, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5T5Y3 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 170603.666 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CAMP1_HUMAN Q5T5Y3 1 ;MADSLYNIRLLREFSNEYLNKCFYLTLEDMLYAPLVLKPNVMVFIAELFWWFENVKPDFVQPRDVQELKD AKTVLHQKSSRPPVPISNATKRSFLGSPAAGTLAELQPPVQLPAEGCHRHYLHPEEPEYLGKGTAAFSPS HPLLPLRQKQQKSIQGEDIPDQRHRSNSLTRVDGQPRGAAIAWPEKKTRPASQPTPFALHHAASCEVDPS SGDSISLARSISKDSLASNIVNLTPQNQPHPTATKSHGKSLLSNVSIEDEEEELVAIVRADVVPQQADPE FPRASPRALGLTANARSPQGQLDTSESKPDSFFLEPLMPAVLKPAKEKQVITKEDERGEGRPRSIVSRRP SEGPQPLVRRKMTGSRDLNRTFTPIPCSEFPMGIDPTETGPLSVETAGEVCGGPLALGGFDPFPQGPSTD GFFLHVGRADEDTEGRLYVSCSKSPNSHDSEPWTLLRQDSDSDVVDIEEAEHDFMGEAHPVVFSRYIGEE ESAKLQEDMKVKEHEDKDDASGRSSPCLSTASQMSSVSMASGSVKMTSFAERKLQRLNSCETKSSTSSSQ KTTPDASESCPAPLTTWRQKREQSPSQHGKDPASLLASELVQLHMQLEEKRRAIEAQKKKMEALSARQRL KLGKAAFLHVVKKGKAEAAPPLRPEHFAKEYSQHNGEDCGDAVSKTEDFLVKEEQREELLHEPQDVDKES LAFAQQHKAKDPVALHELERNKVISAALLEDTVGEVVDVNECDLSIEKLNETISTLQQAILKISQQQEQL LMKSPTVPVPGSKNNSQDHKVKAPVHFVEPLSPTGVAGHRKAPRLGQGRNSRSGRPAELKVPKDRPQGSS RSKTPTPSVETLPHLRPFPASSHPRTPTDPGLDSALEPSGDPHGKCLFDSYRLHDESNQRTLTLSSSKDA NILSEQMSLKEVLDASVKEVGSSSSDVSGKESVPVEEPLRSRASLIEVDLSDLKAPDEDGELVSLDGSAD LVSEGDQKPGVGFFFKDEQKAEDELAKKRAAFLLKQQRKAEEARVRKQQLEAEVELKRDEARRKAEEDRV RKEEEKARRELIKQEYLRRKQQQILEEQGLGKPKSKPKKPRPKSVHREESCSDSGTKCSSTPDNLSRTQS GSSLSLASAATTEPESVHSGGTPSQRVESMEALPILSRNPSRSTDRDWETASAASSLASVAEYTGPKLFK EPSSKSNKPIIHNAISHCCLAGKVNEPHKNSILEELEKCDANHYIILFRDAGCQFRALYCYYPDTEEIYK LTGTGPKNITKKMIDKLYKYSSDRKQFNLIPAKTMSVSVDALTIHNHLWQPKRPAVPKKAQTRK ; 'Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1324 1 1324 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CAMP1_HUMAN Q5T5Y3 Q5T5Y3-2 1 1324 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-02-20 FA81C36B97C9F87F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MADSLYNIRLLREFSNEYLNKCFYLTLEDMLYAPLVLKPNVMVFIAELFWWFENVKPDFVQPRDVQELKD AKTVLHQKSSRPPVPISNATKRSFLGSPAAGTLAELQPPVQLPAEGCHRHYLHPEEPEYLGKGTAAFSPS HPLLPLRQKQQKSIQGEDIPDQRHRSNSLTRVDGQPRGAAIAWPEKKTRPASQPTPFALHHAASCEVDPS SGDSISLARSISKDSLASNIVNLTPQNQPHPTATKSHGKSLLSNVSIEDEEEELVAIVRADVVPQQADPE FPRASPRALGLTANARSPQGQLDTSESKPDSFFLEPLMPAVLKPAKEKQVITKEDERGEGRPRSIVSRRP SEGPQPLVRRKMTGSRDLNRTFTPIPCSEFPMGIDPTETGPLSVETAGEVCGGPLALGGFDPFPQGPSTD GFFLHVGRADEDTEGRLYVSCSKSPNSHDSEPWTLLRQDSDSDVVDIEEAEHDFMGEAHPVVFSRYIGEE ESAKLQEDMKVKEHEDKDDASGRSSPCLSTASQMSSVSMASGSVKMTSFAERKLQRLNSCETKSSTSSSQ KTTPDASESCPAPLTTWRQKREQSPSQHGKDPASLLASELVQLHMQLEEKRRAIEAQKKKMEALSARQRL KLGKAAFLHVVKKGKAEAAPPLRPEHFAKEYSQHNGEDCGDAVSKTEDFLVKEEQREELLHEPQDVDKES LAFAQQHKAKDPVALHELERNKVISAALLEDTVGEVVDVNECDLSIEKLNETISTLQQAILKISQQQEQL LMKSPTVPVPGSKNNSQDHKVKAPVHFVEPLSPTGVAGHRKAPRLGQGRNSRSGRPAELKVPKDRPQGSS RSKTPTPSVETLPHLRPFPASSHPRTPTDPGLDSALEPSGDPHGKCLFDSYRLHDESNQRTLTLSSSKDA NILSEQMSLKEVLDASVKEVGSSSSDVSGKESVPVEEPLRSRASLIEVDLSDLKAPDEDGELVSLDGSAD LVSEGDQKPGVGFFFKDEQKAEDELAKKRAAFLLKQQRKAEEARVRKQQLEAEVELKRDEARRKAEEDRV RKEEEKARRELIKQEYLRRKQQQILEEQGLGKPKSKPKKPRPKSVHREESCSDSGTKCSSTPDNLSRTQS GSSLSLASAATTEPESVHSGGTPSQRVESMEALPILSRNPSRSTDRDWETASAASSLASVAEYTGPKLFK EPSSKSNKPIIHNAISHCCLAGKVNEPHKNSILEELEKCDANHYIILFRDAGCQFRALYCYYPDTEEIYK LTGTGPKNITKKMIDKLYKYSSDRKQFNLIPAKTMSVSVDALTIHNHLWQPKRPAVPKKAQTRK ; ;MADSLYNIRLLREFSNEYLNKCFYLTLEDMLYAPLVLKPNVMVFIAELFWWFENVKPDFVQPRDVQELKD AKTVLHQKSSRPPVPISNATKRSFLGSPAAGTLAELQPPVQLPAEGCHRHYLHPEEPEYLGKGTAAFSPS HPLLPLRQKQQKSIQGEDIPDQRHRSNSLTRVDGQPRGAAIAWPEKKTRPASQPTPFALHHAASCEVDPS SGDSISLARSISKDSLASNIVNLTPQNQPHPTATKSHGKSLLSNVSIEDEEEELVAIVRADVVPQQADPE FPRASPRALGLTANARSPQGQLDTSESKPDSFFLEPLMPAVLKPAKEKQVITKEDERGEGRPRSIVSRRP SEGPQPLVRRKMTGSRDLNRTFTPIPCSEFPMGIDPTETGPLSVETAGEVCGGPLALGGFDPFPQGPSTD GFFLHVGRADEDTEGRLYVSCSKSPNSHDSEPWTLLRQDSDSDVVDIEEAEHDFMGEAHPVVFSRYIGEE ESAKLQEDMKVKEHEDKDDASGRSSPCLSTASQMSSVSMASGSVKMTSFAERKLQRLNSCETKSSTSSSQ KTTPDASESCPAPLTTWRQKREQSPSQHGKDPASLLASELVQLHMQLEEKRRAIEAQKKKMEALSARQRL KLGKAAFLHVVKKGKAEAAPPLRPEHFAKEYSQHNGEDCGDAVSKTEDFLVKEEQREELLHEPQDVDKES LAFAQQHKAKDPVALHELERNKVISAALLEDTVGEVVDVNECDLSIEKLNETISTLQQAILKISQQQEQL LMKSPTVPVPGSKNNSQDHKVKAPVHFVEPLSPTGVAGHRKAPRLGQGRNSRSGRPAELKVPKDRPQGSS RSKTPTPSVETLPHLRPFPASSHPRTPTDPGLDSALEPSGDPHGKCLFDSYRLHDESNQRTLTLSSSKDA NILSEQMSLKEVLDASVKEVGSSSSDVSGKESVPVEEPLRSRASLIEVDLSDLKAPDEDGELVSLDGSAD LVSEGDQKPGVGFFFKDEQKAEDELAKKRAAFLLKQQRKAEEARVRKQQLEAEVELKRDEARRKAEEDRV RKEEEKARRELIKQEYLRRKQQQILEEQGLGKPKSKPKKPRPKSVHREESCSDSGTKCSSTPDNLSRTQS GSSLSLASAATTEPESVHSGGTPSQRVESMEALPILSRNPSRSTDRDWETASAASSLASVAEYTGPKLFK EPSSKSNKPIIHNAISHCCLAGKVNEPHKNSILEELEKCDANHYIILFRDAGCQFRALYCYYPDTEEIYK LTGTGPKNITKKMIDKLYKYSSDRKQFNLIPAKTMSVSVDALTIHNHLWQPKRPAVPKKAQTRK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ASP . 1 4 SER . 1 5 LEU . 1 6 TYR . 1 7 ASN . 1 8 ILE . 1 9 ARG . 1 10 LEU . 1 11 LEU . 1 12 ARG . 1 13 GLU . 1 14 PHE . 1 15 SER . 1 16 ASN . 1 17 GLU . 1 18 TYR . 1 19 LEU . 1 20 ASN . 1 21 LYS . 1 22 CYS . 1 23 PHE . 1 24 TYR . 1 25 LEU . 1 26 THR . 1 27 LEU . 1 28 GLU . 1 29 ASP . 1 30 MET . 1 31 LEU . 1 32 TYR . 1 33 ALA . 1 34 PRO . 1 35 LEU . 1 36 VAL . 1 37 LEU . 1 38 LYS . 1 39 PRO . 1 40 ASN . 1 41 VAL . 1 42 MET . 1 43 VAL . 1 44 PHE . 1 45 ILE . 1 46 ALA . 1 47 GLU . 1 48 LEU . 1 49 PHE . 1 50 TRP . 1 51 TRP . 1 52 PHE . 1 53 GLU . 1 54 ASN . 1 55 VAL . 1 56 LYS . 1 57 PRO . 1 58 ASP . 1 59 PHE . 1 60 VAL . 1 61 GLN . 1 62 PRO . 1 63 ARG . 1 64 ASP . 1 65 VAL . 1 66 GLN . 1 67 GLU . 1 68 LEU . 1 69 LYS . 1 70 ASP . 1 71 ALA . 1 72 LYS . 1 73 THR . 1 74 VAL . 1 75 LEU . 1 76 HIS . 1 77 GLN . 1 78 LYS . 1 79 SER . 1 80 SER . 1 81 ARG . 1 82 PRO . 1 83 PRO . 1 84 VAL . 1 85 PRO . 1 86 ILE . 1 87 SER . 1 88 ASN . 1 89 ALA . 1 90 THR . 1 91 LYS . 1 92 ARG . 1 93 SER . 1 94 PHE . 1 95 LEU . 1 96 GLY . 1 97 SER . 1 98 PRO . 1 99 ALA . 1 100 ALA . 1 101 GLY . 1 102 THR . 1 103 LEU . 1 104 ALA . 1 105 GLU . 1 106 LEU . 1 107 GLN . 1 108 PRO . 1 109 PRO . 1 110 VAL . 1 111 GLN . 1 112 LEU . 1 113 PRO . 1 114 ALA . 1 115 GLU . 1 116 GLY . 1 117 CYS . 1 118 HIS . 1 119 ARG . 1 120 HIS . 1 121 TYR . 1 122 LEU . 1 123 HIS . 1 124 PRO . 1 125 GLU . 1 126 GLU . 1 127 PRO . 1 128 GLU . 1 129 TYR . 1 130 LEU . 1 131 GLY . 1 132 LYS . 1 133 GLY . 1 134 THR . 1 135 ALA . 1 136 ALA . 1 137 PHE . 1 138 SER . 1 139 PRO . 1 140 SER . 1 141 HIS . 1 142 PRO . 1 143 LEU . 1 144 LEU . 1 145 PRO . 1 146 LEU . 1 147 ARG . 1 148 GLN . 1 149 LYS . 1 150 GLN . 1 151 GLN . 1 152 LYS . 1 153 SER . 1 154 ILE . 1 155 GLN . 1 156 GLY . 1 157 GLU . 1 158 ASP . 1 159 ILE . 1 160 PRO . 1 161 ASP . 1 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Cilia- and flagella-associated protein 141 {PDB ID=8j07, label_asym_id=MA, auth_asym_id=2I, SMTL ID=8j07.39.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8j07, label_asym_id=MA' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A MA 14 1 2I # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSVEKMTKVEESFQKAMGLKKTVDRWRNSHTHCLWQMALGQRRNPYATLRMQDTMVQELALAKKQLLMVR QAALHQLFEKEHQQYQQELNQMGKAFYVERF ; ;MSVEKMTKVEESFQKAMGLKKTVDRWRNSHTHCLWQMALGQRRNPYATLRMQDTMVQELALAKKQLLMVR QAALHQLFEKEHQQYQQELNQMGKAFYVERF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 20 83 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8j07 2023-08-02 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1324 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1330 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 380.000 13.793 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MADSLYNIRLLREFSNEYLNKCFYLTLEDMLYAPLVLKPNVMVFIAELFWWFENVKPDFVQPRDVQELKDAKTVLHQKSSRPPVPISNATKRSFLGSPAAGTLAELQPPVQLPAEGCHRHYLHPEEPEYLGKGTAAFSPSHPLLPLRQKQQKSIQGEDIPDQRHRSNSLTRVDGQPRGAAIAWPEKKTRPASQPTPFALHHAASCEVDPSSGDSISLARSISKDSLASNIVNLTPQNQPHPTATKSHGKSLLSNVSIEDEEEELVAIVRADVVPQQADPEFPRASPRALGLTANARSPQGQLDTSESKPDSFFLEPLMPAVLKPAKEKQVITKEDERGEGRPRSIVSRRPSEGPQPLVRRKMTGSRDLNRTFTPIPCSEFPMGIDPTETGPLSVETAGEVCGGPLALGGFDPFPQGPSTDGFFLHVGRADEDTEGRLYVSCSKSPNSHDSEPWTLLRQDSDSDVVDIEEAEHDFMGEAHPVVFSRYIGEEESAKLQEDMKVKEHEDKDDASGRSSPCLSTASQMSSVSMASGSVKMTSFAERKLQRLNSCETKSSTSSSQKTTPDASESCPAPLTTWRQKREQSPSQHGKDPASLLASELVQLHMQLEEKRRAIEAQKKKMEALSARQRLKLGKAAFLHVVKKGKAEAAPPLRPEHFAKEYSQHNGEDCGDAVSKTEDFLVKEEQREELLHEPQDVDKESLAFAQQHKAKDPVALHELERNKVISAALLEDTVGEVVDVNECDLSIEKLNETISTLQQAILKISQQQEQLLMKSPTVPVPGSKNNSQDHKVKAPVHFVEPLSPTGVAGHRKAPRLGQGRNSRSGRPAELKVPKDRPQGSSRSKTPTPSVETLPHLRPFPASSHPRTPTDPGLDSALEPSGDPHGKCLFDSYRLHDESNQRTLTLSSSKDANILSEQMSLKEVLDASVKEVGSSSSDVSGKESVPVEEPLRSRASLIEVDLSDLKAPDEDGELVSLDGSADLVSEGDQKPGVGFFFKDEQKAEDELAKKRAAFLLKQQRKAEEARVRKQQLEAEVE------LKRDEARRKAEEDRVRKEEEKARRELIKQEYLRRKQQQILEEQGLGKPKSKPKKPRPKSVHREESCSDSGTKCSSTPDNLSRTQSGSSLSLASAATTEPESVHSGGTPSQRVESMEALPILSRNPSRSTDRDWETASAASSLASVAEYTGPKLFKEPSSKSNKPIIHNAISHCCLAGKVNEPHKNSILEELEKCDANHYIILFRDAGCQFRALYCYYPDTEEIYKLTGTGPKNITKKMIDKLYKYSSDRKQFNLIPAKTMSVSVDALTIHNHLWQPKRPAVPKKAQTRK 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KKTVDRWRNSHTHCLWQMALGQRRNPYATLRMQDTMVQELALAKKQLLMVRQAALHQLFEKEHQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8j07.39' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1040 1040 ? A 436.179 638.747 812.463 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 2 C CA . GLU 1040 1040 ? A 435.315 637.820 813.275 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 3 C C . GLU 1040 1040 ? A 433.809 637.900 813.082 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 4 O O . GLU 1040 1040 ? A 433.181 636.886 812.819 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 5 C CB . GLU 1040 1040 ? A 435.662 638.063 814.732 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 6 C CG . GLU 1040 1040 ? A 437.122 637.696 815.065 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 7 C CD . GLU 1040 1040 ? A 437.359 638.014 816.535 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1040 1040 ? A 436.407 638.539 817.170 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1040 1040 ? A 438.479 637.728 817.003 1 1 A GLU 0.660 1 ATOM 10 N N . ALA 1041 1041 ? A 433.184 639.104 813.135 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 11 C CA . ALA 1041 1041 ? A 431.772 639.305 812.857 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 12 C C . ALA 1041 1041 ? A 431.337 638.816 811.473 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 13 O O . ALA 1041 1041 ? A 430.284 638.222 811.327 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 14 C CB . ALA 1041 1041 ? A 431.441 640.801 813.030 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 15 N N . ARG 1042 1042 ? A 432.198 638.973 810.433 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 16 C CA . ARG 1042 1042 ? A 431.958 638.368 809.132 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 17 C C . ARG 1042 1042 ? A 431.823 636.841 809.186 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 18 O O . ARG 1042 1042 ? A 430.901 636.276 808.630 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 19 C CB . ARG 1042 1042 ? A 433.083 638.737 808.120 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 20 C CG . ARG 1042 1042 ? A 432.836 638.207 806.687 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 21 C CD . ARG 1042 1042 ? A 431.542 638.737 806.050 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 22 N NE . ARG 1042 1042 ? A 431.419 638.122 804.702 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 23 C CZ . ARG 1042 1042 ? A 431.957 638.587 803.574 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 24 N NH1 . ARG 1042 1042 ? A 432.743 639.659 803.560 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 25 N NH2 . ARG 1042 1042 ? A 431.670 637.950 802.446 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 26 N N . ARG 1043 1043 ? A 432.723 636.143 809.923 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 27 C CA . ARG 1043 1043 ? A 432.662 634.702 810.109 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 28 C C . ARG 1043 1043 ? A 431.408 634.233 810.840 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 29 O O . ARG 1043 1043 ? A 430.845 633.199 810.490 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 30 C CB . ARG 1043 1043 ? A 433.912 634.173 810.870 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 31 C CG . ARG 1043 1043 ? A 433.937 632.634 811.056 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 32 C CD . ARG 1043 1043 ? A 433.970 631.843 809.736 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 33 N NE . ARG 1043 1043 ? A 433.867 630.376 810.067 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 34 C CZ . ARG 1043 1043 ? A 432.717 629.677 810.088 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 35 N NH1 . ARG 1043 1043 ? A 431.526 630.205 809.883 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 36 N NH2 . ARG 1043 1043 ? A 432.693 628.375 810.361 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 37 N N . LYS 1044 1044 ? A 430.966 635.004 811.868 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 38 C CA . LYS 1044 1044 ? A 429.698 634.815 812.558 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 39 C C . LYS 1044 1044 ? A 428.502 634.947 811.613 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 40 O O . LYS 1044 1044 ? 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A 428.029 632.199 808.001 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 54 O O . GLU 1046 1046 ? A 427.241 631.476 807.410 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 55 C CB . GLU 1046 1046 ? A 429.972 633.235 806.736 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 56 C CG . GLU 1046 1046 ? A 430.509 634.409 805.857 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 57 C CD . GLU 1046 1046 ? A 429.740 634.804 804.588 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 58 O OE1 . GLU 1046 1046 ? A 428.868 634.053 804.079 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 59 O OE2 . GLU 1046 1046 ? A 430.057 635.922 804.087 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 60 N N . GLU 1047 1047 ? A 428.399 631.938 809.285 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 61 C CA . GLU 1047 1047 ? A 427.894 630.819 810.077 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 62 C C . GLU 1047 1047 ? A 426.377 630.867 810.264 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 63 O O . GLU 1047 1047 ? A 425.681 629.877 810.061 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 64 C CB . GLU 1047 1047 ? A 428.549 630.788 811.489 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 65 C CG . GLU 1047 1047 ? A 428.250 629.516 812.311 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 66 C CD . GLU 1047 1047 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.656 2 1 3 0.020 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1040 GLU 1 0.660 2 1 A 1041 ALA 1 0.770 3 1 A 1042 ARG 1 0.610 4 1 A 1043 ARG 1 0.610 5 1 A 1044 LYS 1 0.660 6 1 A 1045 ALA 1 0.730 7 1 A 1046 GLU 1 0.670 8 1 A 1047 GLU 1 0.670 9 1 A 1048 ASP 1 0.670 10 1 A 1049 ARG 1 0.610 11 1 A 1050 VAL 1 0.700 12 1 A 1051 ARG 1 0.610 13 1 A 1052 LYS 1 0.670 14 1 A 1053 GLU 1 0.670 15 1 A 1054 GLU 1 0.670 16 1 A 1055 GLU 1 0.690 17 1 A 1056 LYS 1 0.690 18 1 A 1057 ALA 1 0.750 19 1 A 1058 ARG 1 0.640 20 1 A 1059 ARG 1 0.640 21 1 A 1060 GLU 1 0.660 22 1 A 1061 LEU 1 0.630 23 1 A 1062 ILE 1 0.620 24 1 A 1063 LYS 1 0.640 25 1 A 1064 GLN 1 0.590 26 1 A 1065 GLU 1 0.630 27 1 A 1066 TYR 1 0.610 28 1 A 1067 LEU 1 0.590 29 1 A 1068 ARG 1 0.570 30 1 A 1069 ARG 1 0.560 31 1 A 1070 LYS 1 0.750 32 1 A 1071 GLN 1 0.750 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #