data_SMR-07c401bb91b44536b17f6fd4488ef722_1 _entry.id SMR-07c401bb91b44536b17f6fd4488ef722_1 _struct.entry_id SMR-07c401bb91b44536b17f6fd4488ef722_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8NET4/ RTL9_HUMAN, Retrotransposon Gag-like protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8NET4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 169375.564 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RTL9_HUMAN Q8NET4 1 ;MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGGTSTQLMTSPV FDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSP GMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQD MNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTEAMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGG TSPQPTSTQNSGGIPTPLMSDLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPAL MTALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDSGAMSTPLMGAPA SGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVMSTEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKR ATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMSMPQMRTMASG LTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGVMSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTE KMTTTASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQ DPGVMPASLMRAKVSGKMLSQPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTSETMSTP LMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAP ISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSPLVRAPASGTM STPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASGTMPMPLMSAMASGEMSMPLM ETMASGATSTLQTSVANSRSMSLSQTTYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATAS GCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPT SHMTATTPETAKPPPKEVPSFGMLTPALCYLLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLV SLHLGAAERWFILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVRQYATDFLLLA RHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKELIDRSLYTECQLAEEKDSPGNSSQVLPTACK RNNEEAMGNELSSQQQTEEHQHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGHHQKAHTNK ; 'Retrotransposon Gag-like protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1388 1 1388 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RTL9_HUMAN Q8NET4 . 1 1388 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-10-01 19A18E68DC8C5A06 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGGTSTQLMTSPV FDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSP GMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQD MNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTEAMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGG TSPQPTSTQNSGGIPTPLMSDLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPAL MTALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDSGAMSTPLMGAPA SGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVMSTEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKR ATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMSMPQMRTMASG LTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGVMSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTE KMTTTASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQ DPGVMPASLMRAKVSGKMLSQPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTSETMSTP LMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAP ISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSPLVRAPASGTM STPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASGTMPMPLMSAMASGEMSMPLM ETMASGATSTLQTSVANSRSMSLSQTTYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATAS GCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPT SHMTATTPETAKPPPKEVPSFGMLTPALCYLLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLV SLHLGAAERWFILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVRQYATDFLLLA RHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKELIDRSLYTECQLAEEKDSPGNSSQVLPTACK RNNEEAMGNELSSQQQTEEHQHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGHHQKAHTNK ; ;MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGGTSTQLMTSPV FDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSP GMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQD 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GLN . 1 65 LEU . 1 66 MET . 1 67 THR . 1 68 SER . 1 69 PRO . 1 70 VAL . 1 71 PHE . 1 72 ASP . 1 73 THR . 1 74 MET . 1 75 SER . 1 76 ALA . 1 77 PRO . 1 78 LEU . 1 79 MET . 1 80 GLY . 1 81 VAL . 1 82 PRO . 1 83 ASN . 1 84 SER . 1 85 GLY . 1 86 ALA . 1 87 LEU . 1 88 SER . 1 89 PRO . 1 90 PRO . 1 91 LEU . 1 92 MET . 1 93 PRO . 1 94 ALA . 1 95 SER . 1 96 ASP . 1 97 SER . 1 98 GLY . 1 99 ALA . 1 100 LEU . 1 101 SER . 1 102 PRO . 1 103 LEU . 1 104 LEU . 1 105 MET . 1 106 PRO . 1 107 ALA . 1 108 SER . 1 109 ASP . 1 110 SER . 1 111 GLY . 1 112 ALA . 1 113 LEU . 1 114 SER . 1 115 PRO . 1 116 LEU . 1 117 LEU . 1 118 MET . 1 119 PRO . 1 120 ALA . 1 121 LEU . 1 122 ASP . 1 123 SER . 1 124 GLY . 1 125 THR . 1 126 LEU . 1 127 SER . 1 128 PRO . 1 129 LEU . 1 130 LEU . 1 131 SER . 1 132 THR . 1 133 SER . 1 134 GLU . 1 135 TYR . 1 136 GLY . 1 137 VAL . 1 138 MET . 1 139 SER . 1 140 PRO . 1 141 GLY . 1 142 MET . 1 143 MET . 1 144 THR . 1 145 ILE . 1 146 PRO . 1 147 ASP . 1 148 PHE . 1 149 GLY . 1 150 THR 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A 1 1269 ILE 1269 1269 ILE ILE B . A 1 1270 LEU 1270 1270 LEU LEU B . A 1 1271 ARG 1271 1271 ARG ARG B . A 1 1272 THR 1272 1272 THR THR B . A 1 1273 ARG 1273 1273 ARG ARG B . A 1 1274 PHE 1274 1274 PHE PHE B . A 1 1275 LEU 1275 1275 LEU LEU B . A 1 1276 GLU 1276 1276 GLU GLU B . A 1 1277 GLY 1277 1277 GLY GLY B . A 1 1278 LEU 1278 1278 LEU LEU B . A 1 1279 SER 1279 1279 SER SER B . A 1 1280 GLU 1280 1280 GLU GLU B . A 1 1281 ALA 1281 1281 ALA ALA B . A 1 1282 VAL 1282 1282 VAL VAL B . A 1 1283 THR 1283 1283 THR THR B . A 1 1284 THR 1284 1284 THR THR B . A 1 1285 LYS 1285 1285 LYS LYS B . A 1 1286 MET 1286 1286 MET MET B . A 1 1287 GLY 1287 1287 GLY GLY B . A 1 1288 ARG 1288 1288 ARG ARG B . A 1 1289 ILE 1289 1289 ILE ILE B . A 1 1290 PHE 1290 1290 PHE PHE B . A 1 1291 LEU 1291 1291 LEU LEU B . A 1 1292 LYS 1292 1292 LYS LYS B . A 1 1293 VAL 1293 1293 VAL VAL B . A 1 1294 ALA 1294 1294 ALA ALA B . A 1 1295 GLY 1295 1295 GLY GLY B . A 1 1296 SER 1296 1296 SER SER B . A 1 1297 LEU 1297 1297 LEU LEU B . A 1 1298 LYS 1298 1298 LYS LYS B . A 1 1299 GLU 1299 1299 GLU GLU B . A 1 1300 LEU 1300 1300 LEU LEU B . A 1 1301 ILE 1301 1301 ILE ILE B . A 1 1302 ASP 1302 1302 ASP ASP B . A 1 1303 ARG 1303 1303 ARG ARG B . A 1 1304 SER 1304 1304 SER SER B . A 1 1305 LEU 1305 1305 LEU LEU B . A 1 1306 TYR 1306 1306 TYR TYR B . A 1 1307 THR 1307 1307 THR THR B . A 1 1308 GLU 1308 1308 GLU GLU B . A 1 1309 CYS 1309 ? ? ? B . A 1 1310 GLN 1310 ? ? ? B . A 1 1311 LEU 1311 ? ? ? B . A 1 1312 ALA 1312 ? ? ? B . A 1 1313 GLU 1313 ? ? ? B . A 1 1314 GLU 1314 ? ? ? B . A 1 1315 LYS 1315 ? ? ? B . A 1 1316 ASP 1316 ? ? ? B . A 1 1317 SER 1317 ? ? ? B . A 1 1318 PRO 1318 ? ? ? B . A 1 1319 GLY 1319 ? ? ? B . A 1 1320 ASN 1320 ? ? ? B . A 1 1321 SER 1321 ? ? ? B . A 1 1322 SER 1322 ? ? ? B . A 1 1323 GLN 1323 ? ? ? B . A 1 1324 VAL 1324 ? ? ? B . A 1 1325 LEU 1325 ? ? ? B . A 1 1326 PRO 1326 ? ? ? B . A 1 1327 THR 1327 ? ? ? B . A 1 1328 ALA 1328 ? ? ? B . A 1 1329 CYS 1329 ? ? ? B . A 1 1330 LYS 1330 ? ? ? B . A 1 1331 ARG 1331 ? ? ? B . A 1 1332 ASN 1332 ? ? ? B . A 1 1333 ASN 1333 ? ? ? B . A 1 1334 GLU 1334 ? ? ? B . A 1 1335 GLU 1335 ? ? ? B . A 1 1336 ALA 1336 ? ? ? B . A 1 1337 MET 1337 ? ? ? B . A 1 1338 GLY 1338 ? ? ? B . A 1 1339 ASN 1339 ? ? ? B . A 1 1340 GLU 1340 ? ? ? B . A 1 1341 LEU 1341 ? ? ? B . A 1 1342 SER 1342 ? ? ? B . A 1 1343 SER 1343 ? ? ? B . A 1 1344 GLN 1344 ? ? ? B . A 1 1345 GLN 1345 ? ? ? B . A 1 1346 GLN 1346 ? ? ? B . A 1 1347 THR 1347 ? ? ? B . A 1 1348 GLU 1348 ? ? ? B . A 1 1349 GLU 1349 ? ? ? B . A 1 1350 HIS 1350 ? ? ? B . A 1 1351 GLN 1351 ? ? ? B . A 1 1352 HIS 1352 ? ? ? B . A 1 1353 VAL 1353 ? ? ? B . A 1 1354 SER 1354 ? ? ? B . A 1 1355 LYS 1355 ? ? ? B . A 1 1356 ARG 1356 ? ? ? B . A 1 1357 CYS 1357 ? ? ? B . A 1 1358 TYR 1358 ? ? ? B . A 1 1359 TYR 1359 ? ? ? B . A 1 1360 LEU 1360 ? ? ? B . A 1 1361 LYS 1361 ? ? ? B . A 1 1362 GLU 1362 ? ? ? B . A 1 1363 HIS 1363 ? ? ? B . A 1 1364 GLY 1364 ? ? ? B . A 1 1365 ASP 1365 ? ? ? B . A 1 1366 PRO 1366 ? ? ? B . A 1 1367 GLN 1367 ? ? ? B . A 1 1368 GLU 1368 ? ? ? B . A 1 1369 GLY 1369 ? ? ? B . A 1 1370 LEU 1370 ? ? ? B . A 1 1371 HIS 1371 ? ? ? B . A 1 1372 ASP 1372 ? ? ? B . A 1 1373 HIS 1373 ? ? ? B . A 1 1374 LEU 1374 ? ? ? B . A 1 1375 GLY 1375 ? ? ? B . A 1 1376 GLN 1376 ? ? ? B . A 1 1377 SER 1377 ? ? ? B . A 1 1378 THR 1378 ? ? ? B . A 1 1379 GLY 1379 ? ? ? B . A 1 1380 HIS 1380 ? ? ? B . A 1 1381 HIS 1381 ? ? ? B . A 1 1382 GLN 1382 ? ? ? B . A 1 1383 LYS 1383 ? ? ? B . A 1 1384 ALA 1384 ? ? ? B . A 1 1385 HIS 1385 ? ? ? B . A 1 1386 THR 1386 ? ? ? B . A 1 1387 ASN 1387 ? ? ? B . A 1 1388 LYS 1388 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Retrotransposon-derived protein PEG10 {PDB ID=7lga, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=7lga.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7lga, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GHHHHHHGSPQRREVAKRKIRRLRQGMGSVIDYSNAFQMIAQDLDWNEPALIDQYHEGLSDHIQEELSHL EVAKSLSALIGQCIHIERRLARAAAARKPRS ; ;GHHHHHHGSPQRREVAKRKIRRLRQGMGSVIDYSNAFQMIAQDLDWNEPALIDQYHEGLSDHIQEELSHL EVAKSLSALIGQCIHIERRLARAAAARKPRS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 87 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7lga 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1388 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1388 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.3e-14 26.923 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGGTSTQLMTSPVFDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTEAMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPTSTQNSGGIPTPLMSDLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPALMTALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDSGAMSTPLMGAPASGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVMSTEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKRATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMSMPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGVMSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTEKMTTTASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQDPGVMPASLMRAKVSGKMLSQPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTSETMSTPLMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAPISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSPLVRAPASGTMSTPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASGTMPMPLMSAMASGEMSMPLMETMASGATSTLQTSVANSRSMSLSQTTYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATASGCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPTSHMTATTPETAKPPPKEVPSFGMLTPALCYLLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERWFILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVRQYATDFLLLARHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKELIDRSLYTECQLAEEKDSPGNSSQVLPTACKRNNEEAMGNELSSQQQTEEHQHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGHHQKAHTNK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PQRREVAKRKIRRLRQGMGSVIDYSNAFQMIAQDLDWNEPALIDQYHEGLSDHIQEELSHL--EVAKSLSALIGQCIHIE-------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7lga.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 1230 1230 ? A -4.202 53.229 34.515 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 2 C CA . SER 1230 1230 ? A -3.733 52.870 35.903 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 3 C C . SER 1230 1230 ? A -4.414 51.664 36.508 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 4 O O . SER 1230 1230 ? A -3.750 50.681 36.809 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 5 C CB . SER 1230 1230 ? A -3.795 54.092 36.875 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 6 O OG . SER 1230 1230 ? A -3.243 55.255 36.251 1 1 B SER 0.280 1 ATOM 7 N N . GLU 1231 1231 ? A -5.763 51.662 36.678 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 8 C CA . GLU 1231 1231 ? A -6.499 50.505 37.180 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 9 C C . GLU 1231 1231 ? A -6.292 49.258 36.324 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 10 O O . GLU 1231 1231 ? A -5.903 48.223 36.838 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 11 C CB . GLU 1231 1231 ? A -8.000 50.857 37.295 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 12 C CG . GLU 1231 1231 ? A -8.302 51.930 38.371 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 13 C CD . GLU 1231 1231 ? A -9.752 52.420 38.319 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 14 O OE1 . GLU 1231 1231 ? A -10.358 52.361 37.219 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 15 O OE2 . GLU 1231 1231 ? A -10.228 52.914 39.368 1 1 B GLU 0.280 1 ATOM 16 N N . ILE 1232 1232 ? A -6.405 49.376 34.978 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 17 C CA . ILE 1232 1232 ? A -6.200 48.300 34.004 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 18 C C . ILE 1232 1232 ? A -4.894 47.523 34.216 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 19 O O . ILE 1232 1232 ? A -4.894 46.294 34.309 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 20 C CB . ILE 1232 1232 ? A -6.267 48.867 32.579 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 21 C CG1 . ILE 1232 1232 ? A -7.628 49.564 32.304 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 22 C CG2 . ILE 1232 1232 ? A -6.035 47.733 31.554 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 23 C CD1 . ILE 1232 1232 ? A -7.690 50.368 30.998 1 1 B ILE 0.440 1 ATOM 24 N N . ASP 1233 1233 ? A -3.764 48.242 34.367 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 25 C CA . ASP 1233 1233 ? A -2.427 47.728 34.596 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 26 C C . ASP 1233 1233 ? A -2.289 46.899 35.876 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 27 O O . ASP 1233 1233 ? A -1.687 45.826 35.901 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 28 C CB . ASP 1233 1233 ? A -1.428 48.927 34.643 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 29 C CG . ASP 1233 1233 ? A -1.722 49.911 33.510 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 30 O OD1 . ASP 1233 1233 ? A -1.918 49.441 32.376 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 31 O OD2 . ASP 1233 1233 ? A -1.900 51.139 33.798 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 32 N N . ILE 1234 1234 ? A -2.897 47.365 36.989 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 33 C CA . ILE 1234 1234 ? A -2.897 46.670 38.267 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 34 C C . ILE 1234 1234 ? A -3.626 45.345 38.123 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 35 O O . ILE 1234 1234 ? A -3.152 44.296 38.539 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 36 C CB . ILE 1234 1234 ? A -3.527 47.558 39.349 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 37 C CG1 . ILE 1234 1234 ? A -2.570 48.734 39.678 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 38 C CG2 . ILE 1234 1234 ? A -3.892 46.751 40.619 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 39 C CD1 . ILE 1234 1234 ? A -3.180 49.814 40.583 1 1 B ILE 0.420 1 ATOM 40 N N . LEU 1235 1235 ? A -4.788 45.356 37.463 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 41 C CA . LEU 1235 1235 ? A -5.666 44.223 37.285 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 42 C C . LEU 1235 1235 ? A -5.178 43.163 36.338 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 43 O O . LEU 1235 1235 ? A -5.464 41.989 36.525 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 44 C CB . LEU 1235 1235 ? A -7.033 44.663 36.784 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 45 C CG . LEU 1235 1235 ? A -7.634 45.802 37.589 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 46 C CD1 . LEU 1235 1235 ? A -8.488 46.565 36.621 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 47 C CD2 . LEU 1235 1235 ? A -8.365 45.255 38.808 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 48 N N . SER 1236 1236 ? A -4.432 43.505 35.275 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 49 C CA . SER 1236 1236 ? A -3.858 42.493 34.405 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 50 C C . SER 1236 1236 ? A -2.826 41.653 35.143 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 51 O O . SER 1236 1236 ? A -2.755 40.435 34.976 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 52 C CB . SER 1236 1236 ? A -3.346 43.115 33.086 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 53 O OG . SER 1236 1236 ? A -2.259 44.007 33.311 1 1 B SER 0.550 1 ATOM 54 N N . ALA 1237 1237 ? A -2.065 42.290 36.056 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 55 C CA . ALA 1237 1237 ? A -1.314 41.620 37.094 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 56 C C . ALA 1237 1237 ? A -2.165 40.891 38.153 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 57 O O . ALA 1237 1237 ? A -2.007 39.689 38.362 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 58 C CB . ALA 1237 1237 ? A -0.376 42.671 37.725 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 59 N N . VAL 1238 1238 ? A -3.142 41.555 38.813 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 60 C CA . VAL 1238 1238 ? A -3.961 40.947 39.861 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 61 C C . VAL 1238 1238 ? A -4.834 39.781 39.371 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 62 O O . VAL 1238 1238 ? A -4.972 38.815 40.099 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 63 C CB . VAL 1238 1238 ? A -4.791 41.939 40.701 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 64 C CG1 . VAL 1238 1238 ? A -5.462 41.222 41.889 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 65 C CG2 . VAL 1238 1238 ? A -3.958 43.068 41.348 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 66 N N . LEU 1239 1239 ? A -5.413 39.799 38.143 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 67 C CA . LEU 1239 1239 ? A -6.192 38.714 37.549 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 68 C C . LEU 1239 1239 ? A -5.314 37.581 36.988 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 69 O O . LEU 1239 1239 ? A -5.758 36.448 36.805 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 70 C CB . LEU 1239 1239 ? A -7.206 39.261 36.500 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 71 C CG . LEU 1239 1239 ? A -8.406 38.340 36.131 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 72 C CD1 . LEU 1239 1239 ? A -9.613 39.088 35.534 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 73 C CD2 . LEU 1239 1239 ? A -7.986 37.187 35.217 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 74 N N . CYS 1240 1240 ? A -4.002 37.762 36.783 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 75 C CA . CYS 1240 1240 ? A -3.136 36.607 36.552 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 76 C C . CYS 1240 1240 ? A -2.731 35.914 37.839 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 77 O O . CYS 1240 1240 ? A -2.425 34.726 37.824 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 78 C CB . CYS 1240 1240 ? A -1.895 36.919 35.679 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 79 S SG . CYS 1240 1240 ? A -2.392 37.204 33.934 1 1 B CYS 0.570 1 ATOM 80 N N . HIS 1241 1241 ? A -2.776 36.593 38.997 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 81 C CA . HIS 1241 1241 ? A -2.489 35.951 40.265 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 82 C C . HIS 1241 1241 ? A -3.659 35.535 41.160 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 83 O O . HIS 1241 1241 ? A -3.322 35.059 42.251 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 84 C CB . HIS 1241 1241 ? A -1.629 36.881 41.144 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 85 C CG . HIS 1241 1241 ? A -0.304 37.205 40.548 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 86 N ND1 . HIS 1241 1241 ? A 0.646 36.211 40.409 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 87 C CD2 . HIS 1241 1241 ? A 0.175 38.385 40.081 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 88 C CE1 . HIS 1241 1241 ? A 1.681 36.806 39.855 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 89 N NE2 . HIS 1241 1241 ? A 1.450 38.123 39.634 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 90 N N . PRO 1242 1242 ? A -4.981 35.627 40.943 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 91 C CA . PRO 1242 1242 ? A -5.929 35.233 41.936 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 92 C C . PRO 1242 1242 ? A -6.179 33.763 41.802 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 93 O O . PRO 1242 1242 ? A -6.096 33.182 40.721 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 94 C CB . PRO 1242 1242 ? A -7.191 36.033 41.610 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 95 C CG . PRO 1242 1242 ? A -7.159 36.225 40.100 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 96 C CD . PRO 1242 1242 ? A -5.691 35.966 39.727 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 97 N N . LYS 1243 1243 ? A -6.471 33.108 42.917 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 98 C CA . LYS 1243 1243 ? A -6.669 31.691 42.888 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 99 C C . LYS 1243 1243 ? A -7.725 31.434 43.909 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 100 O O . LYS 1243 1243 ? A -7.759 32.072 44.960 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 101 C CB . LYS 1243 1243 ? A -5.387 30.882 43.238 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 102 C CG . LYS 1243 1243 ? A -4.253 31.060 42.216 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 103 C CD . LYS 1243 1243 ? A -2.962 30.333 42.607 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 104 C CE . LYS 1243 1243 ? A -1.859 30.527 41.564 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 105 N NZ . LYS 1243 1243 ? A -0.656 29.772 41.974 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 106 N N . GLN 1244 1244 ? A -8.623 30.474 43.646 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 107 C CA . GLN 1244 1244 ? A -9.517 29.990 44.669 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 108 C C . GLN 1244 1244 ? A -8.729 29.353 45.799 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 109 O O . GLN 1244 1244 ? 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A -9.855 27.090 51.166 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 123 C CB . GLN 1246 1246 ? A -7.022 26.933 51.012 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 124 C CG . GLN 1246 1246 ? A -5.594 26.374 50.829 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 125 C CD . GLN 1246 1246 ? A -5.607 24.877 50.518 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 126 O OE1 . GLN 1246 1246 ? A -6.183 24.061 51.234 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 127 N NE2 . GLN 1246 1246 ? A -4.926 24.490 49.415 1 1 B GLN 0.470 1 ATOM 128 N N . LYS 1247 1247 ? A -9.768 28.437 49.383 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 129 C CA . LYS 1247 1247 ? A -10.982 29.154 49.705 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 130 C C . LYS 1247 1247 ? A -12.144 28.714 48.834 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 131 O O . LYS 1247 1247 ? A -12.093 27.724 48.107 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 132 C CB . LYS 1247 1247 ? A -10.782 30.681 49.547 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 133 C CG . LYS 1247 1247 ? A -9.722 31.275 50.482 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 134 C CD . LYS 1247 1247 ? A -9.634 32.795 50.275 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 135 C CE . LYS 1247 1247 ? 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A -13.255 43.281 35.091 1 1 B ALA 0.680 1 ATOM 240 O O . ALA 1260 1260 ? A -13.163 43.556 33.898 1 1 B ALA 0.680 1 ATOM 241 C CB . ALA 1260 1260 ? A -13.253 40.780 35.347 1 1 B ALA 0.680 1 ATOM 242 N N . ARG 1261 1261 ? A -13.980 44.068 35.912 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 243 C CA . ARG 1261 1261 ? A -14.789 45.199 35.471 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 244 C C . ARG 1261 1261 ? A -14.001 46.292 34.817 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 245 O O . ARG 1261 1261 ? A -14.499 47.051 33.988 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 246 C CB . ARG 1261 1261 ? A -15.504 45.829 36.679 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 247 C CG . ARG 1261 1261 ? A -16.803 45.095 37.019 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 248 C CD . ARG 1261 1261 ? A -17.503 45.735 38.209 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 249 N NE . ARG 1261 1261 ? A -18.720 44.916 38.471 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 250 C CZ . ARG 1261 1261 ? A -19.575 45.151 39.473 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 251 N NH1 . ARG 1261 1261 ? A -19.399 46.162 40.318 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 252 N NH2 . ARG 1261 1261 ? 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A -19.985 23.141 47.866 1 1 B GLU 0.330 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #