data_SMR-5eb4d2c5afdda81779613f991eb80843_3 _entry.id SMR-5eb4d2c5afdda81779613f991eb80843_3 _struct.entry_id SMR-5eb4d2c5afdda81779613f991eb80843_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O95405/ ZFYV9_HUMAN, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O95405' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 182210.747 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZFYV9_HUMAN O95405 1 ;MENYFQAEAYNLDKVLDEFEQNEDETVSSTLLDTKWNKILDPPSHRLSFNPTLASVNESAVSNESQPQLK VFSLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVGEKKCGNLA CLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTEKDMNSE KQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPA VKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSG RNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKE KFLQISQPEDTNGDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSF VPKTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCSQVPSVLGQ SSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTKNKNDILGKAKLGENSATN VCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDNDLRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDS QAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASCCSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSAS SQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEV ADAAKLTMNGTSSAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILIS TGVKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVI LLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPT PPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTL PVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISI HNQPRKVTGASFFVFSGALKSSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEP QEHIHIQWVDDDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPA DHSRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVI HGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV ; 'Zinc finger FYVE domain-containing protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1425 1 1425 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZFYV9_HUMAN O95405 . 1 1425 9606 'Homo sapiens (Human)' 2001-08-14 ADE5CB530C1272C6 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MENYFQAEAYNLDKVLDEFEQNEDETVSSTLLDTKWNKILDPPSHRLSFNPTLASVNESAVSNESQPQLK VFSLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVGEKKCGNLA CLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTEKDMNSE KQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPA VKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSG RNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKE KFLQISQPEDTNGDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSF VPKTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCSQVPSVLGQ SSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTKNKNDILGKAKLGENSATN 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CLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTEKDMNSE KQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPA VKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSG RNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKE KFLQISQPEDTNGDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSF VPKTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCSQVPSVLGQ SSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTKNKNDILGKAKLGENSATN VCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDNDLRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDS QAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASCCSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSAS SQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEV ADAAKLTMNGTSSAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILIS TGVKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVI LLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPT PPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTL 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. 1 55 SER . 1 56 VAL . 1 57 ASN . 1 58 GLU . 1 59 SER . 1 60 ALA . 1 61 VAL . 1 62 SER . 1 63 ASN . 1 64 GLU . 1 65 SER . 1 66 GLN . 1 67 PRO . 1 68 GLN . 1 69 LEU . 1 70 LYS . 1 71 VAL . 1 72 PHE . 1 73 SER . 1 74 LEU . 1 75 ALA . 1 76 HIS . 1 77 SER . 1 78 ALA . 1 79 PRO . 1 80 LEU . 1 81 THR . 1 82 THR . 1 83 GLU . 1 84 GLU . 1 85 GLU . 1 86 ASP . 1 87 HIS . 1 88 CYS . 1 89 ALA . 1 90 ASN . 1 91 GLY . 1 92 GLN . 1 93 ASP . 1 94 CYS . 1 95 ASN . 1 96 LEU . 1 97 ASN . 1 98 PRO . 1 99 GLU . 1 100 ILE . 1 101 ALA . 1 102 THR . 1 103 MET . 1 104 TRP . 1 105 ILE . 1 106 ASP . 1 107 GLU . 1 108 ASN . 1 109 ALA . 1 110 VAL . 1 111 ALA . 1 112 GLU . 1 113 ASP . 1 114 GLN . 1 115 LEU . 1 116 ILE . 1 117 LYS . 1 118 ARG . 1 119 ASN . 1 120 TYR . 1 121 SER . 1 122 TRP . 1 123 ASP . 1 124 ASP . 1 125 GLN . 1 126 CYS . 1 127 SER . 1 128 ALA . 1 129 VAL . 1 130 GLU . 1 131 VAL . 1 132 GLY . 1 133 GLU . 1 134 LYS . 1 135 LYS . 1 136 CYS . 1 137 GLY . 1 138 ASN . 1 139 LEU . 1 140 ALA . 1 141 CYS . 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A 1 1271 ASP 1271 ? ? ? B . A 1 1272 ASP 1272 ? ? ? B . A 1 1273 LYS 1273 ? ? ? B . A 1 1274 ASN 1274 ? ? ? B . A 1 1275 VAL 1275 ? ? ? B . A 1 1276 SER 1276 ? ? ? B . A 1 1277 LYS 1277 ? ? ? B . A 1 1278 GLY 1278 ? ? ? B . A 1 1279 VAL 1279 ? ? ? B . A 1 1280 VAL 1280 ? ? ? B . A 1 1281 SER 1281 ? ? ? B . A 1 1282 PRO 1282 ? ? ? B . A 1 1283 ILE 1283 ? ? ? B . A 1 1284 ASP 1284 ? ? ? B . A 1 1285 GLY 1285 ? ? ? B . A 1 1286 LYS 1286 ? ? ? B . A 1 1287 SER 1287 ? ? ? B . A 1 1288 MET 1288 ? ? ? B . A 1 1289 GLU 1289 ? ? ? B . A 1 1290 THR 1290 ? ? ? B . A 1 1291 ILE 1291 ? ? ? B . A 1 1292 THR 1292 ? ? ? B . A 1 1293 ASN 1293 ? ? ? B . A 1 1294 VAL 1294 ? ? ? B . A 1 1295 LYS 1295 ? ? ? B . A 1 1296 ILE 1296 ? ? ? B . A 1 1297 PHE 1297 ? ? ? B . A 1 1298 HIS 1298 ? ? ? B . A 1 1299 GLY 1299 ? ? ? B . A 1 1300 SER 1300 ? ? ? B . A 1 1301 GLU 1301 ? ? ? B . A 1 1302 TYR 1302 ? ? ? B . A 1 1303 LYS 1303 ? ? ? B . A 1 1304 ALA 1304 ? ? ? B . A 1 1305 ASN 1305 ? ? ? B . A 1 1306 GLY 1306 ? ? ? B . A 1 1307 LYS 1307 ? ? ? B . A 1 1308 VAL 1308 ? ? ? B . A 1 1309 ILE 1309 ? ? ? B . A 1 1310 ARG 1310 ? ? ? B . A 1 1311 TRP 1311 ? ? ? B . A 1 1312 THR 1312 ? ? ? B . A 1 1313 GLU 1313 ? ? ? B . A 1 1314 VAL 1314 ? ? ? B . A 1 1315 PHE 1315 ? ? ? B . A 1 1316 PHE 1316 ? ? ? B . A 1 1317 LEU 1317 ? ? ? B . A 1 1318 GLU 1318 ? ? ? B . A 1 1319 ASN 1319 ? ? ? B . A 1 1320 ASP 1320 ? ? ? B . A 1 1321 ASP 1321 ? ? ? B . A 1 1322 GLN 1322 ? ? ? B . A 1 1323 HIS 1323 ? ? ? B . A 1 1324 ASN 1324 ? ? ? B . A 1 1325 CYS 1325 ? ? ? B . A 1 1326 LEU 1326 ? ? ? B . A 1 1327 SER 1327 ? ? ? B . A 1 1328 ASP 1328 ? ? ? B . A 1 1329 PRO 1329 ? ? ? B . A 1 1330 ALA 1330 ? ? ? B . A 1 1331 ASP 1331 ? ? ? B . A 1 1332 HIS 1332 ? ? ? B . A 1 1333 SER 1333 ? ? ? B . A 1 1334 ARG 1334 ? ? ? B . A 1 1335 LEU 1335 ? ? ? B . A 1 1336 THR 1336 ? ? ? B . A 1 1337 GLU 1337 ? ? ? B . A 1 1338 HIS 1338 ? ? ? B . A 1 1339 VAL 1339 ? ? ? B . A 1 1340 ALA 1340 ? ? ? B . A 1 1341 LYS 1341 ? ? ? B . A 1 1342 ALA 1342 ? ? ? B . A 1 1343 PHE 1343 ? ? ? B . A 1 1344 CYS 1344 ? ? ? B . A 1 1345 LEU 1345 ? ? ? B . A 1 1346 ALA 1346 ? ? ? B . A 1 1347 LEU 1347 ? ? ? B . A 1 1348 CYS 1348 ? ? ? B . A 1 1349 PRO 1349 ? ? ? B . A 1 1350 HIS 1350 ? ? ? B . A 1 1351 LEU 1351 ? ? ? B . A 1 1352 LYS 1352 ? ? ? B . A 1 1353 LEU 1353 ? ? ? B . A 1 1354 LEU 1354 ? ? ? B . A 1 1355 LYS 1355 ? ? ? B . A 1 1356 GLU 1356 ? ? ? B . A 1 1357 ASP 1357 ? ? ? B . A 1 1358 GLY 1358 ? ? ? B . A 1 1359 MET 1359 ? ? ? B . A 1 1360 THR 1360 ? ? ? B . A 1 1361 LYS 1361 ? ? ? B . A 1 1362 LEU 1362 ? ? ? B . A 1 1363 GLY 1363 ? ? ? B . A 1 1364 LEU 1364 ? ? ? B . A 1 1365 ARG 1365 ? ? ? B . A 1 1366 VAL 1366 ? ? ? B . A 1 1367 THR 1367 ? ? ? B . A 1 1368 LEU 1368 ? ? ? B . A 1 1369 ASP 1369 ? ? ? B . A 1 1370 SER 1370 ? ? ? B . A 1 1371 ASP 1371 ? ? ? B . A 1 1372 GLN 1372 ? ? ? B . A 1 1373 VAL 1373 ? ? ? B . A 1 1374 GLY 1374 ? ? ? B . A 1 1375 TYR 1375 ? ? ? B . A 1 1376 GLN 1376 ? ? ? B . A 1 1377 ALA 1377 ? ? ? B . A 1 1378 GLY 1378 ? ? ? B . A 1 1379 SER 1379 ? ? ? B . A 1 1380 ASN 1380 ? ? ? B . A 1 1381 GLY 1381 ? ? ? B . A 1 1382 GLN 1382 ? ? ? B . A 1 1383 PRO 1383 ? ? ? B . A 1 1384 LEU 1384 ? ? ? B . A 1 1385 PRO 1385 ? ? ? B . A 1 1386 SER 1386 ? ? ? B . A 1 1387 GLN 1387 ? ? ? B . A 1 1388 TYR 1388 ? ? ? B . A 1 1389 MET 1389 ? ? ? B . A 1 1390 ASN 1390 ? ? ? B . A 1 1391 ASP 1391 ? ? ? B . A 1 1392 LEU 1392 ? ? ? B . A 1 1393 ASP 1393 ? ? ? B . A 1 1394 SER 1394 ? ? ? B . A 1 1395 ALA 1395 ? ? ? B . A 1 1396 LEU 1396 ? ? ? B . A 1 1397 VAL 1397 ? ? ? B . A 1 1398 PRO 1398 ? ? ? B . A 1 1399 VAL 1399 ? ? ? B . A 1 1400 ILE 1400 ? ? ? B . A 1 1401 HIS 1401 ? ? ? B . A 1 1402 GLY 1402 ? ? ? B . A 1 1403 GLY 1403 ? ? ? B . A 1 1404 ALA 1404 ? ? ? B . A 1 1405 CYS 1405 ? ? ? B . A 1 1406 GLN 1406 ? ? ? B . A 1 1407 LEU 1407 ? ? ? B . A 1 1408 SER 1408 ? ? ? B . A 1 1409 GLU 1409 ? ? ? B . A 1 1410 GLY 1410 ? ? ? B . A 1 1411 PRO 1411 ? ? ? B . A 1 1412 VAL 1412 ? ? ? B . A 1 1413 VAL 1413 ? ? ? B . A 1 1414 MET 1414 ? ? ? B . A 1 1415 GLU 1415 ? ? ? B . A 1 1416 LEU 1416 ? ? ? B . A 1 1417 ILE 1417 ? ? ? B . A 1 1418 PHE 1418 ? ? ? B . A 1 1419 TYR 1419 ? ? ? B . A 1 1420 ILE 1420 ? ? ? B . A 1 1421 LEU 1421 ? ? ? B . A 1 1422 GLU 1422 ? ? ? B . A 1 1423 ASN 1423 ? ? ? B . A 1 1424 ILE 1424 ? ? ? B . A 1 1425 VAL 1425 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Madh-interacting protein {PDB ID=1mk2, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1mk2.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1mk2, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 SPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVG SPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 38 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1mk2 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1425 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1425 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.003 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MENYFQAEAYNLDKVLDEFEQNEDETVSSTLLDTKWNKILDPPSHRLSFNPTLASVNESAVSNESQPQLKVFSLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVGEKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTNGDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVPKTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCSQVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTKNKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDNDLRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASCCSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTSSAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTGVKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADHSRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1mk2.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 774 774 ? A 15.335 33.905 81.802 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 2 C CA . PRO 774 774 ? A 14.937 34.741 82.978 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 3 C C . PRO 774 774 ? A 13.440 34.641 83.144 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 4 O O . PRO 774 774 ? A 12.754 34.287 82.187 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 5 C CB . PRO 774 774 ? A 15.411 36.123 82.526 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 6 C CG . PRO 774 774 ? A 15.112 36.191 81.028 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 7 C CD . PRO 774 774 ? A 15.411 34.770 80.553 1 1 B PRO 0.550 1 ATOM 8 N N . ASN 775 775 ? A 12.923 34.943 84.347 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 9 C CA . ASN 775 775 ? A 11.524 35.141 84.642 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 10 C C . ASN 775 775 ? A 11.073 36.505 84.060 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 11 O O . ASN 775 775 ? A 11.734 37.510 84.320 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 12 C CB . ASN 775 775 ? A 11.342 35.084 86.193 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 13 C CG . ASN 775 775 ? A 9.885 35.031 86.630 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 14 O OD1 . ASN 775 775 ? A 9.016 35.627 85.979 1 1 B ASN 0.590 1 ATOM 15 N ND2 . ASN 775 775 ? 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A 27.982 47.434 71.383 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 142 O O . ALA 792 792 ? A 28.332 46.877 70.340 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 143 C CB . ALA 792 792 ? A 25.725 48.546 71.029 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 144 N N . GLN 793 793 ? A 28.890 48.031 72.188 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 145 C CA . GLN 793 793 ? A 30.325 47.934 71.992 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 146 C C . GLN 793 793 ? A 30.941 46.585 72.334 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 147 O O . GLN 793 793 ? A 31.602 45.968 71.499 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 148 C CB . GLN 793 793 ? A 31.088 48.979 72.860 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 149 C CG . GLN 793 793 ? A 30.741 50.469 72.606 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 150 C CD . GLN 793 793 ? A 30.953 51.019 71.192 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 151 O OE1 . GLN 793 793 ? A 30.528 52.131 70.886 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 152 N NE2 . GLN 793 793 ? A 31.586 50.249 70.286 1 1 B GLN 0.610 1 ATOM 153 N N . ALA 794 794 ? A 30.702 46.064 73.556 1 1 B ALA 0.610 1 ATOM 154 C CA . ALA 794 794 ? A 31.233 44.812 74.073 1 1 B ALA 0.610 1 ATOM 155 C C . ALA 794 794 ? A 30.394 43.618 73.624 1 1 B ALA 0.610 1 ATOM 156 O O . ALA 794 794 ? A 30.116 42.676 74.357 1 1 B ALA 0.610 1 ATOM 157 C CB . ALA 794 794 ? A 31.280 44.885 75.613 1 1 B ALA 0.610 1 ATOM 158 N N . SER 795 795 ? A 30.005 43.668 72.348 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 159 C CA . SER 795 795 ? A 29.216 42.687 71.641 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 160 C C . SER 795 795 ? A 29.493 42.813 70.158 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 161 O O . SER 795 795 ? A 29.034 41.989 69.372 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 162 C CB . SER 795 795 ? A 27.685 42.874 71.901 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 163 O OG . SER 795 795 ? A 27.155 44.082 71.345 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 164 N N . GLY 796 796 ? A 30.307 43.826 69.739 1 1 B GLY 0.640 1 ATOM 165 C CA . GLY 796 796 ? A 30.606 44.141 68.350 1 1 B GLY 0.640 1 ATOM 166 C C . GLY 796 796 ? A 29.401 44.297 67.476 1 1 B GLY 0.640 1 ATOM 167 O O . GLY 796 796 ? A 29.313 43.611 66.471 1 1 B GLY 0.640 1 ATOM 168 N N . ALA 797 797 ? A 28.444 45.185 67.823 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 169 C CA . ALA 797 797 ? A 27.255 45.396 67.017 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 170 C C . ALA 797 797 ? A 27.375 46.590 66.067 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 171 O O . ALA 797 797 ? A 26.567 46.760 65.164 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 172 C CB . ALA 797 797 ? A 26.077 45.685 67.970 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 173 N N . LEU 798 798 ? A 28.401 47.447 66.258 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 174 C CA . LEU 798 798 ? A 28.636 48.652 65.464 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 175 C C . LEU 798 798 ? A 29.653 48.410 64.376 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 176 O O . LEU 798 798 ? A 29.552 48.892 63.253 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 177 C CB . LEU 798 798 ? A 29.251 49.785 66.334 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 178 C CG . LEU 798 798 ? A 28.321 50.410 67.398 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 179 C CD1 . LEU 798 798 ? A 27.030 50.962 66.771 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 180 C CD2 . LEU 798 798 ? A 28.005 49.498 68.592 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 181 N N . SER 799 799 ? A 30.675 47.612 64.720 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 182 C CA . SER 799 799 ? A 31.677 47.086 63.823 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 183 C C . SER 799 799 ? A 31.086 45.979 62.968 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 184 O O . SER 799 799 ? A 31.664 45.617 61.945 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 185 C CB . SER 799 799 ? A 32.874 46.496 64.629 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 186 O OG . SER 799 799 ? A 32.427 45.683 65.720 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 187 N N . SER 800 800 ? A 29.913 45.425 63.370 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 188 C CA . SER 800 800 ? A 29.148 44.452 62.605 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 189 C C . SER 800 800 ? A 28.571 45.072 61.326 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 190 O O . SER 800 800 ? A 27.853 46.071 61.387 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 191 C CB . SER 800 800 ? A 28.120 43.614 63.445 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 192 O OG . SER 800 800 ? A 26.762 44.046 63.459 1 1 B SER 0.660 1 ATOM 193 N N . PRO 801 801 ? A 28.875 44.580 60.128 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 194 C CA . PRO 801 801 ? A 28.143 44.938 58.921 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 195 C C . PRO 801 801 ? A 26.766 44.286 58.922 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 196 O O . PRO 801 801 ? A 26.578 43.333 59.682 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 197 C CB . PRO 801 801 ? A 29.056 44.399 57.801 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 198 C CG . PRO 801 801 ? A 29.751 43.195 58.437 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 199 C CD . PRO 801 801 ? A 30.005 43.693 59.852 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 200 N N . PRO 802 802 ? A 25.783 44.761 58.154 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 201 C CA . PRO 802 802 ? A 24.432 44.213 58.150 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 202 C C . PRO 802 802 ? A 24.398 42.711 57.827 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 203 O O . PRO 802 802 ? A 25.150 42.298 56.943 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 204 C CB . PRO 802 802 ? A 23.687 45.070 57.108 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 205 C CG . PRO 802 802 ? A 24.799 45.488 56.142 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 206 C CD . PRO 802 802 ? A 25.965 45.753 57.094 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 207 N N . PRO 803 803 ? A 23.623 41.869 58.502 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 208 C CA . PRO 803 803 ? A 23.564 40.438 58.233 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 209 C C . PRO 803 803 ? A 22.886 40.111 56.912 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 210 O O . PRO 803 803 ? A 22.168 40.940 56.358 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 211 C CB . PRO 803 803 ? A 22.718 39.900 59.400 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 212 C CG . PRO 803 803 ? A 21.771 41.064 59.712 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 213 C CD . PRO 803 803 ? A 22.690 42.271 59.548 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 214 N N . THR 804 804 ? A 23.073 38.868 56.430 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 215 C CA . THR 804 804 ? A 22.569 38.396 55.147 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 216 C C . THR 804 804 ? A 22.056 37.002 55.370 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 217 O O . THR 804 804 ? A 22.609 36.237 56.157 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 218 C CB . THR 804 804 ? A 23.629 38.322 54.046 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 219 O OG1 . THR 804 804 ? A 24.148 39.615 53.810 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 220 C CG2 . THR 804 804 ? A 23.070 37.886 52.680 1 1 B THR 0.770 1 ATOM 221 N N . VAL 805 805 ? A 20.957 36.651 54.684 1 1 B VAL 0.720 1 ATOM 222 C CA . VAL 805 805 ? A 20.335 35.349 54.690 1 1 B VAL 0.720 1 ATOM 223 C C . VAL 805 805 ? A 20.234 34.901 53.247 1 1 B VAL 0.720 1 ATOM 224 O O . VAL 805 805 ? A 19.974 35.697 52.348 1 1 B VAL 0.720 1 ATOM 225 C CB . VAL 805 805 ? 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A 17.167 32.308 48.024 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 240 C CB . VAL 807 807 ? A 15.800 33.756 50.523 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 241 C CG1 . VAL 807 807 ? A 16.028 34.333 51.944 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 242 C CG2 . VAL 807 807 ? A 15.946 34.859 49.451 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 243 N N . PRO 808 808 ? A 16.131 30.591 48.968 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 244 C CA . PRO 808 808 ? A 15.779 29.954 47.699 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 245 C C . PRO 808 808 ? A 14.795 30.816 46.915 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 246 O O . PRO 808 808 ? A 13.790 31.236 47.475 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 247 C CB . PRO 808 808 ? A 15.212 28.579 48.127 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 248 C CG . PRO 808 808 ? A 14.613 28.848 49.511 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 249 C CD . PRO 808 808 ? A 15.608 29.839 50.113 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 250 N N . VAL 809 809 ? A 15.073 31.136 45.634 1 1 B VAL 0.270 1 ATOM 251 C CA . VAL 809 809 ? A 14.162 31.921 44.813 1 1 B VAL 0.270 1 ATOM 252 C C . VAL 809 809 ? A 13.048 31.021 44.284 1 1 B VAL 0.270 1 ATOM 253 O O . VAL 809 809 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.608 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 774 PRO 1 0.550 2 1 A 775 ASN 1 0.590 3 1 A 776 PRO 1 0.600 4 1 A 777 ASN 1 0.650 5 1 A 778 ASN 1 0.630 6 1 A 779 PRO 1 0.560 7 1 A 780 ALA 1 0.600 8 1 A 781 GLU 1 0.590 9 1 A 782 TYR 1 0.560 10 1 A 783 CYS 1 0.570 11 1 A 784 SER 1 0.610 12 1 A 785 THR 1 0.610 13 1 A 786 ILE 1 0.610 14 1 A 787 PRO 1 0.630 15 1 A 788 PRO 1 0.620 16 1 A 789 LEU 1 0.600 17 1 A 790 GLN 1 0.610 18 1 A 791 GLN 1 0.620 19 1 A 792 ALA 1 0.650 20 1 A 793 GLN 1 0.610 21 1 A 794 ALA 1 0.610 22 1 A 795 SER 1 0.630 23 1 A 796 GLY 1 0.640 24 1 A 797 ALA 1 0.670 25 1 A 798 LEU 1 0.640 26 1 A 799 SER 1 0.660 27 1 A 800 SER 1 0.660 28 1 A 801 PRO 1 0.600 29 1 A 802 PRO 1 0.580 30 1 A 803 PRO 1 0.790 31 1 A 804 THR 1 0.770 32 1 A 805 VAL 1 0.720 33 1 A 806 MET 1 0.650 34 1 A 807 VAL 1 0.680 35 1 A 808 PRO 1 0.620 36 1 A 809 VAL 1 0.270 37 1 A 810 GLY 1 0.240 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #