data_SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_5 _entry.id SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_5 _struct.entry_id SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P30622 (isoform 1)/ CLIP1_HUMAN, CAP-Gly domain-containing linker protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.043, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P30622 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 186927.721 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CLIP1_HUMAN P30622 1 ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL KVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLE AIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRK ASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEK ELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQ EAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGA REENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNL KNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDEVTSHQKLEE ERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHS VVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLK MKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGS RGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF ; 'CAP-Gly domain-containing linker protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1427 1 1427 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CLIP1_HUMAN P30622 P30622-1 1 1427 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-10-13 0A4F166DD94254E8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL 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PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL KVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLE AIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRK ASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEK ELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQ EAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGA REENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNL 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PHE . 1 55 VAL . 1 56 ASP . 1 57 ASP . 1 58 PHE . 1 59 ARG . 1 60 VAL . 1 61 GLY . 1 62 GLU . 1 63 ARG . 1 64 VAL . 1 65 TRP . 1 66 VAL . 1 67 ASN . 1 68 GLY . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 PRO . 1 72 GLY . 1 73 PHE . 1 74 ILE . 1 75 GLN . 1 76 PHE . 1 77 LEU . 1 78 GLY . 1 79 GLU . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 PHE . 1 83 ALA . 1 84 PRO . 1 85 GLY . 1 86 GLN . 1 87 TRP . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 ILE . 1 91 VAL . 1 92 LEU . 1 93 ASP . 1 94 GLU . 1 95 PRO . 1 96 ILE . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 ASN . 1 100 ASP . 1 101 GLY . 1 102 SER . 1 103 VAL . 1 104 ALA . 1 105 GLY . 1 106 VAL . 1 107 ARG . 1 108 TYR . 1 109 PHE . 1 110 GLN . 1 111 CYS . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 LEU . 1 115 LYS . 1 116 GLY . 1 117 ILE . 1 118 PHE . 1 119 THR . 1 120 ARG . 1 121 PRO . 1 122 SER . 1 123 LYS . 1 124 LEU . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 LYS . 1 128 VAL . 1 129 GLN . 1 130 ALA . 1 131 GLU . 1 132 ASP . 1 133 GLU . 1 134 ALA . 1 135 ASN . 1 136 GLY . 1 137 LEU . 1 138 GLN . 1 139 THR . 1 140 THR . 1 141 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A 1 1254 SER 1254 ? ? ? A . A 1 1255 ALA 1255 ? ? ? A . A 1 1256 LYS 1256 ? ? ? A . A 1 1257 SER 1257 ? ? ? A . A 1 1258 LEU 1258 ? ? ? A . A 1 1259 HIS 1259 ? ? ? A . A 1 1260 SER 1260 ? ? ? A . A 1 1261 VAL 1261 ? ? ? A . A 1 1262 VAL 1262 ? ? ? A . A 1 1263 GLN 1263 ? ? ? A . A 1 1264 THR 1264 ? ? ? A . A 1 1265 LEU 1265 ? ? ? A . A 1 1266 GLU 1266 ? ? ? A . A 1 1267 SER 1267 ? ? ? A . A 1 1268 ASP 1268 ? ? ? A . A 1 1269 LYS 1269 ? ? ? A . A 1 1270 VAL 1270 ? ? ? A . A 1 1271 LYS 1271 ? ? ? A . A 1 1272 LEU 1272 ? ? ? A . A 1 1273 GLU 1273 ? ? ? A . A 1 1274 LEU 1274 ? ? ? A . A 1 1275 LYS 1275 ? ? ? A . A 1 1276 VAL 1276 ? ? ? A . A 1 1277 LYS 1277 ? ? ? A . A 1 1278 ASN 1278 ? ? ? A . A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? A . A 1 1280 GLU 1280 ? ? ? A . A 1 1281 LEU 1281 ? ? ? A . A 1 1282 GLN 1282 ? ? ? A . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? A . A 1 1284 LYS 1284 ? ? ? A . A 1 1285 GLU 1285 ? ? ? A . A 1 1286 ASN 1286 ? ? ? A . A 1 1287 LYS 1287 ? ? ? A . A 1 1288 ARG 1288 ? ? ? A . A 1 1289 GLN 1289 ? ? ? A . A 1 1290 LEU 1290 ? ? ? A . A 1 1291 SER 1291 ? ? ? A . A 1 1292 SER 1292 ? ? ? A . A 1 1293 SER 1293 ? ? ? A . A 1 1294 SER 1294 ? ? ? A . A 1 1295 GLY 1295 ? ? ? A . A 1 1296 ASN 1296 ? ? ? A . A 1 1297 THR 1297 ? ? ? A . A 1 1298 ASP 1298 ? ? ? A . A 1 1299 THR 1299 ? ? ? A . A 1 1300 GLN 1300 ? ? ? A . A 1 1301 ALA 1301 ? ? ? A . A 1 1302 ASP 1302 ? ? ? A . A 1 1303 GLU 1303 ? ? ? A . A 1 1304 ASP 1304 ? ? ? A . A 1 1305 GLU 1305 ? ? ? A . A 1 1306 ARG 1306 ? ? ? A . A 1 1307 ALA 1307 ? ? ? A . A 1 1308 GLN 1308 ? ? ? A . A 1 1309 GLU 1309 ? ? ? A . A 1 1310 SER 1310 ? ? ? A . A 1 1311 GLN 1311 ? ? ? A . A 1 1312 ILE 1312 ? ? ? A . A 1 1313 ASP 1313 ? ? ? A . A 1 1314 PHE 1314 ? ? ? A . A 1 1315 LEU 1315 ? ? ? A . A 1 1316 ASN 1316 ? ? ? A . A 1 1317 SER 1317 ? ? ? A . A 1 1318 VAL 1318 ? ? ? A . A 1 1319 ILE 1319 ? ? ? A . A 1 1320 VAL 1320 ? ? ? A . A 1 1321 ASP 1321 ? ? ? A . A 1 1322 LEU 1322 ? ? ? A . A 1 1323 GLN 1323 ? ? ? A . A 1 1324 ARG 1324 ? ? ? A . A 1 1325 LYS 1325 ? ? ? A . A 1 1326 ASN 1326 ? ? ? A . A 1 1327 GLN 1327 ? ? ? A . A 1 1328 ASP 1328 ? ? ? A . A 1 1329 LEU 1329 ? ? ? A . A 1 1330 LYS 1330 ? ? ? A . A 1 1331 MET 1331 ? ? ? A . A 1 1332 LYS 1332 ? ? ? A . A 1 1333 VAL 1333 ? ? ? A . A 1 1334 GLU 1334 ? ? ? A . A 1 1335 MET 1335 ? ? ? A . A 1 1336 MET 1336 ? ? ? A . A 1 1337 SER 1337 ? ? ? A . A 1 1338 GLU 1338 ? ? ? A . A 1 1339 ALA 1339 ? ? ? A . A 1 1340 ALA 1340 ? ? ? A . A 1 1341 LEU 1341 ? ? ? A . A 1 1342 ASN 1342 ? ? ? A . A 1 1343 GLY 1343 ? ? ? A . A 1 1344 ASN 1344 ? ? ? A . A 1 1345 GLY 1345 ? ? ? A . A 1 1346 ASP 1346 ? ? ? A . A 1 1347 ASP 1347 ? ? ? A . A 1 1348 LEU 1348 ? ? ? A . A 1 1349 ASN 1349 ? ? ? A . A 1 1350 ASN 1350 ? ? ? A . A 1 1351 TYR 1351 ? ? ? A . A 1 1352 ASP 1352 ? ? ? A . A 1 1353 SER 1353 ? ? ? A . A 1 1354 ASP 1354 ? ? ? A . A 1 1355 ASP 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLN 1356 ? ? ? A . A 1 1357 GLU 1357 ? ? ? A . A 1 1358 LYS 1358 ? ? ? A . A 1 1359 GLN 1359 ? ? ? A . A 1 1360 SER 1360 ? ? ? A . A 1 1361 LYS 1361 ? ? ? A . A 1 1362 LYS 1362 ? ? ? A . A 1 1363 LYS 1363 ? ? ? A . A 1 1364 PRO 1364 ? ? ? A . A 1 1365 ARG 1365 ? ? ? A . A 1 1366 LEU 1366 ? ? ? A . A 1 1367 PHE 1367 ? ? ? A . A 1 1368 CYS 1368 ? ? ? A . A 1 1369 ASP 1369 ? ? ? A . A 1 1370 ILE 1370 ? ? ? A . A 1 1371 CYS 1371 ? ? ? A . A 1 1372 ASP 1372 ? ? ? A . A 1 1373 CYS 1373 ? ? ? A . A 1 1374 PHE 1374 ? ? ? A . A 1 1375 ASP 1375 ? ? ? A . A 1 1376 LEU 1376 ? ? ? A . A 1 1377 HIS 1377 ? ? ? A . A 1 1378 ASP 1378 ? ? ? A . A 1 1379 THR 1379 ? ? ? A . A 1 1380 GLU 1380 ? ? ? A . A 1 1381 ASP 1381 ? ? ? A . A 1 1382 CYS 1382 ? ? ? A . A 1 1383 PRO 1383 ? ? ? A . A 1 1384 THR 1384 ? ? ? A . A 1 1385 GLN 1385 ? ? ? A . A 1 1386 ALA 1386 ? ? ? A . A 1 1387 GLN 1387 ? ? ? A . A 1 1388 MET 1388 ? ? ? A . A 1 1389 SER 1389 ? ? ? A . A 1 1390 GLU 1390 ? ? ? A . A 1 1391 ASP 1391 ? ? ? A . A 1 1392 PRO 1392 ? ? ? A . A 1 1393 PRO 1393 ? ? ? A . A 1 1394 HIS 1394 ? ? ? A . A 1 1395 SER 1395 ? ? ? A . A 1 1396 THR 1396 ? ? ? A . A 1 1397 HIS 1397 ? ? ? A . A 1 1398 HIS 1398 ? ? ? A . A 1 1399 GLY 1399 ? ? ? A . A 1 1400 SER 1400 ? ? ? A . A 1 1401 ARG 1401 ? ? ? A . A 1 1402 GLY 1402 ? ? ? A . A 1 1403 GLU 1403 ? ? ? A . A 1 1404 GLU 1404 ? ? ? A . A 1 1405 ARG 1405 ? ? ? A . A 1 1406 PRO 1406 ? ? ? A . A 1 1407 TYR 1407 ? ? ? A . A 1 1408 CYS 1408 ? ? ? A . A 1 1409 GLU 1409 ? ? ? A . A 1 1410 ILE 1410 ? ? ? A . A 1 1411 CYS 1411 ? ? ? A . A 1 1412 GLU 1412 ? ? ? A . A 1 1413 MET 1413 ? ? ? A . A 1 1414 PHE 1414 ? ? ? A . A 1 1415 GLY 1415 ? ? ? A . A 1 1416 HIS 1416 ? ? ? A . A 1 1417 TRP 1417 ? ? ? A . A 1 1418 ALA 1418 ? ? ? A . A 1 1419 THR 1419 ? ? ? A . A 1 1420 ASN 1420 ? ? ? A . A 1 1421 CYS 1421 ? ? ? A . A 1 1422 ASN 1422 ? ? ? A . A 1 1423 ASP 1423 ? ? ? A . A 1 1424 ASP 1424 ? ? ? A . A 1 1425 GLU 1425 ? ? ? A . A 1 1426 THR 1426 ? ? ? A . A 1 1427 PHE 1427 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Restin {PDB ID=2cp5, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2cp5.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2cp5, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGMSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGER VWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVSGPSS G ; ;GSSGSSGMSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGER VWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVSGPSS G ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 24 135 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2cp5 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1427 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1429 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 3.13e-23 46.364 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKT-ASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVT-KIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGSRGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KPGSTALKTPTAV--VAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2cp5.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 170 170 ? A -15.526 18.943 17.633 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 2 C CA . LYS 170 170 ? A -14.406 19.911 17.888 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 3 C C . LYS 170 170 ? A -14.859 20.972 18.869 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 4 O O . LYS 170 170 ? A -15.197 22.072 18.443 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 5 C CB . LYS 170 170 ? A -13.944 20.515 16.531 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 6 C CG . LYS 170 170 ? A -13.138 19.526 15.666 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 7 C CD . LYS 170 170 ? A -12.826 20.078 14.263 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 8 C CE . LYS 170 170 ? A -11.782 19.242 13.503 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 9 N NZ . LYS 170 170 ? A -11.805 19.553 12.055 1 1 A LYS 0.290 1 ATOM 10 N N . PRO 171 171 ? A -14.948 20.677 20.169 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 11 C CA . PRO 171 171 ? A -15.271 21.679 21.178 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 12 C C . PRO 171 171 ? A -14.117 22.662 21.300 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 13 O O . PRO 171 171 ? A -12.986 22.210 21.151 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 14 C CB . PRO 171 171 ? A -15.435 20.858 22.473 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 15 C CG . PRO 171 171 ? A -14.487 19.670 22.285 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 16 C CD . PRO 171 171 ? A -14.537 19.406 20.780 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 17 N N . SER 172 172 ? A -14.404 23.964 21.544 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 18 C CA . SER 172 172 ? A -13.468 25.095 21.655 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 19 C C . SER 172 172 ? A -13.985 26.297 20.859 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 20 O O . SER 172 172 ? A -13.590 26.547 19.745 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 21 C CB . SER 172 172 ? A -11.955 24.854 21.300 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 22 O OG . SER 172 172 ? A -11.085 25.900 21.748 1 1 A SER 0.350 1 ATOM 23 N N . GLN 173 173 ? A -14.935 27.050 21.482 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 24 C CA . GLN 173 173 ? A -15.388 28.391 21.135 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 25 C C . GLN 173 173 ? A -15.085 29.524 22.183 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 26 O O . GLN 173 173 ? A -15.441 30.644 21.894 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 27 C CB . GLN 173 173 ? A -16.926 28.301 20.898 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 28 C CG . GLN 173 173 ? A -17.332 27.220 19.857 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 29 C CD . GLN 173 173 ? A -16.758 27.551 18.479 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 30 O OE1 . GLN 173 173 ? A -16.659 28.719 18.091 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 31 N NE2 . GLN 173 173 ? A -16.366 26.523 17.696 1 1 A GLN 0.310 1 ATOM 32 N N . PRO 174 174 ? A -14.454 29.379 23.385 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 33 C CA . PRO 174 174 ? A -13.910 30.529 24.137 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 34 C C . PRO 174 174 ? A -12.645 31.194 23.588 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 35 O O . PRO 174 174 ? A -11.952 30.600 22.770 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 36 C CB . PRO 174 174 ? A -13.566 29.970 25.534 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 37 C CG . PRO 174 174 ? A -14.373 28.682 25.661 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 38 C CD . PRO 174 174 ? A -14.496 28.181 24.222 1 1 A PRO 0.290 1 ATOM 39 N N . ALA 175 175 ? A -12.292 32.388 24.129 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 40 C CA . ALA 175 175 ? A -11.135 33.199 23.801 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 41 C C . ALA 175 175 ? A -10.200 33.212 25.002 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 42 O O . ALA 175 175 ? A -10.601 33.649 26.075 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 43 C CB . ALA 175 175 ? A -11.577 34.664 23.567 1 1 A ALA 0.290 1 ATOM 44 N N . ALA 176 176 ? A -8.955 32.709 24.834 1 1 A ALA 0.340 1 ATOM 45 C CA . ALA 176 176 ? A -7.917 32.631 25.853 1 1 A ALA 0.340 1 ATOM 46 C C . ALA 176 176 ? A -8.250 31.689 27.015 1 1 A ALA 0.340 1 ATOM 47 O O . ALA 176 176 ? A -9.018 32.004 27.914 1 1 A ALA 0.340 1 ATOM 48 C CB . ALA 176 176 ? A -7.443 34.023 26.335 1 1 A ALA 0.340 1 ATOM 49 N N . LYS 177 177 ? A -7.663 30.472 27.031 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 50 C CA . LYS 177 177 ? A -7.939 29.524 28.094 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 51 C C . LYS 177 177 ? A -6.801 29.459 29.083 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 52 O O . LYS 177 177 ? A -6.956 29.817 30.246 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 53 C CB . LYS 177 177 ? A -8.293 28.131 27.516 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 54 C CG . LYS 177 177 ? A -9.808 27.886 27.547 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 55 C CD . LYS 177 177 ? A -10.145 26.398 27.334 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 56 C CE . LYS 177 177 ? A -10.445 25.959 25.903 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 57 N NZ . LYS 177 177 ? A -11.582 26.754 25.430 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 58 N N . GLU 178 178 ? A -5.621 29.015 28.636 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 59 C CA . GLU 178 178 ? A -4.482 28.827 29.487 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 60 C C . GLU 178 178 ? A -3.335 29.552 28.806 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 61 O O . GLU 178 178 ? A -3.296 29.575 27.572 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 62 C CB . GLU 178 178 ? A -4.216 27.316 29.654 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 63 C CG . GLU 178 178 ? A -5.348 26.610 30.444 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 64 C CD . GLU 178 178 ? A -5.083 25.126 30.678 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 65 O OE1 . GLU 178 178 ? A -4.057 24.610 30.166 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 66 O OE2 . GLU 178 178 ? A -5.931 24.502 31.365 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 67 N N . PRO 179 179 ? A -2.397 30.185 29.508 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 68 C CA . PRO 179 179 ? A -1.205 30.735 28.906 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 69 C C . PRO 179 179 ? A -0.225 29.610 28.742 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 70 O O . PRO 179 179 ? A 0.794 29.549 29.426 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 71 C CB . PRO 179 179 ? A -0.728 31.727 29.974 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 72 C CG . PRO 179 179 ? A -1.068 31.020 31.296 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 73 C CD . PRO 179 179 ? A -2.247 30.096 30.953 1 1 A PRO 0.390 1 ATOM 74 N N . SER 180 180 ? A -0.520 28.693 27.798 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 75 C CA . SER 180 180 ? A 0.440 27.733 27.318 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 76 C C . SER 180 180 ? A 1.609 28.479 26.727 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 77 O O . SER 180 180 ? A 1.669 29.705 26.663 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 78 C CB . SER 180 180 ? A -0.150 26.631 26.367 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 79 O OG . SER 180 180 ? A -0.597 27.134 25.108 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 80 N N . ALA 181 181 ? A 2.628 27.755 26.310 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 81 C CA . ALA 181 181 ? A 3.720 28.364 25.634 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 82 C C . ALA 181 181 ? A 3.261 29.058 24.337 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 83 O O . ALA 181 181 ? A 2.741 28.429 23.419 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 84 C CB . ALA 181 181 ? A 4.699 27.200 25.501 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 85 N N . THR 182 182 ? A 3.379 30.405 24.313 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 86 C CA . THR 182 182 ? A 2.908 31.305 23.260 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 87 C C . THR 182 182 ? A 4.130 31.959 22.641 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 88 O O . THR 182 182 ? A 4.493 33.067 23.041 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 89 C CB . THR 182 182 ? A 1.879 32.326 23.770 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 90 O OG1 . THR 182 182 ? A 0.720 31.623 24.192 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 91 C CG2 . THR 182 182 ? A 1.351 33.271 22.682 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 92 N N . PRO 183 183 ? A 4.850 31.359 21.686 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 93 C CA . PRO 183 183 ? A 4.585 30.100 20.984 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 94 C C . PRO 183 183 ? A 5.193 28.887 21.665 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 95 O O . PRO 183 183 ? A 5.966 29.075 22.603 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 96 C CB . PRO 183 183 ? A 5.304 30.320 19.643 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 97 C CG . PRO 183 183 ? A 6.500 31.215 19.983 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 98 C CD . PRO 183 183 ? A 6.038 32.037 21.184 1 1 A PRO 0.370 1 ATOM 99 N N . PRO 184 184 ? A 4.868 27.641 21.274 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 100 C CA . PRO 184 184 ? A 5.164 26.491 22.106 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 101 C C . PRO 184 184 ? A 6.638 26.252 22.212 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 102 O O . PRO 184 184 ? A 7.175 25.985 23.287 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 103 C CB . PRO 184 184 ? A 4.337 25.329 21.517 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 104 C CG . PRO 184 184 ? A 3.848 25.820 20.154 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 105 C CD . PRO 184 184 ? A 3.803 27.333 20.323 1 1 A PRO 0.360 1 ATOM 106 N N . ILE 185 185 ? A 7.296 26.366 21.069 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 107 C CA . ILE 185 185 ? A 8.668 26.059 20.893 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 108 C C . ILE 185 185 ? A 9.080 27.028 19.826 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 109 O O . ILE 185 185 ? A 8.245 27.562 19.087 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 110 C CB . ILE 185 185 ? A 8.853 24.602 20.458 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 111 C CG1 . ILE 185 185 ? A 8.049 24.274 19.172 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 112 C CG2 . ILE 185 185 ? A 8.436 23.675 21.629 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 113 C CD1 . ILE 185 185 ? A 8.379 22.888 18.614 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 114 N N . SER 186 186 ? A 10.379 27.306 19.719 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 115 C CA . SER 186 186 ? A 10.897 28.135 18.661 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 116 C C . SER 186 186 ? A 11.817 27.239 17.872 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 117 O O . SER 186 186 ? A 12.903 26.894 18.307 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 118 C CB . SER 186 186 ? A 11.625 29.379 19.215 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 119 O OG . SER 186 186 ? A 11.978 30.291 18.174 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 120 N N . ASN 187 187 ? A 11.333 26.812 16.685 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 121 C CA . ASN 187 187 ? A 12.062 25.990 15.730 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 122 C C . ASN 187 187 ? A 13.071 26.800 14.922 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 123 O O . ASN 187 187 ? A 13.938 26.251 14.246 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 124 C CB . ASN 187 187 ? A 11.080 25.342 14.713 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 125 C CG . ASN 187 187 ? A 10.241 24.282 15.404 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 126 O OD1 . ASN 187 187 ? A 10.666 23.654 16.376 1 1 A ASN 0.350 1 ATOM 127 N ND2 . ASN 187 187 ? 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A 19.258 30.395 16.114 1 1 A THR 0.360 1 ATOM 142 C CG2 . THR 189 189 ? A 18.792 30.130 13.771 1 1 A THR 0.360 1 ATOM 143 N N . LYS 190 190 ? A 17.981 33.030 15.784 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 144 C CA . LYS 190 190 ? A 18.422 34.377 15.479 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 145 C C . LYS 190 190 ? A 19.393 34.410 14.321 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 146 O O . LYS 190 190 ? A 20.351 33.647 14.297 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 147 C CB . LYS 190 190 ? A 19.137 35.013 16.695 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 148 C CG . LYS 190 190 ? A 18.172 35.734 17.638 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 149 C CD . LYS 190 190 ? A 17.655 37.048 17.024 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 150 C CE . LYS 190 190 ? A 16.685 37.787 17.947 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 151 N NZ . LYS 190 190 ? A 16.814 39.250 17.769 1 1 A LYS 0.370 1 ATOM 152 N N . THR 191 191 ? A 19.198 35.339 13.367 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 153 C CA . THR 191 191 ? A 19.996 35.359 12.156 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 154 C C . THR 191 191 ? A 20.580 36.735 11.916 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 155 O O . THR 191 191 ? A 19.865 37.731 11.922 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 156 C CB . THR 191 191 ? A 19.193 34.880 10.973 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 157 O OG1 . THR 191 191 ? A 18.962 33.484 11.106 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 158 C CG2 . THR 191 191 ? A 19.958 35.078 9.668 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 159 N N . ALA 192 192 ? A 21.918 36.799 11.713 1 1 A ALA 0.330 1 ATOM 160 C CA . ALA 192 192 ? A 22.758 37.985 11.645 1 1 A ALA 0.330 1 ATOM 161 C C . ALA 192 192 ? A 23.694 37.891 10.439 1 1 A ALA 0.330 1 ATOM 162 O O . ALA 192 192 ? A 24.907 38.007 10.575 1 1 A ALA 0.330 1 ATOM 163 C CB . ALA 192 192 ? A 23.619 38.046 12.930 1 1 A ALA 0.330 1 ATOM 164 N N . SER 193 193 ? A 23.116 37.642 9.239 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 165 C CA . SER 193 193 ? A 23.781 37.054 8.066 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 166 C C . SER 193 193 ? A 24.045 35.576 8.314 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 167 O O . SER 193 193 ? A 24.167 35.167 9.461 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 168 C CB . SER 193 193 ? A 24.981 37.817 7.393 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 169 O OG . SER 193 193 ? A 26.246 37.566 8.003 1 1 A SER 0.310 1 ATOM 170 N N . GLU 194 194 ? A 24.033 34.737 7.250 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 171 C CA . GLU 194 194 ? A 24.175 33.287 7.363 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 172 C C . GLU 194 194 ? A 22.969 32.622 8.023 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 173 O O . GLU 194 194 ? A 22.566 32.935 9.138 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 174 C CB . GLU 194 194 ? A 25.499 32.801 8.013 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 175 C CG . GLU 194 194 ? A 26.783 33.313 7.314 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 176 C CD . GLU 194 194 ? A 27.000 32.668 5.950 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 177 O OE1 . GLU 194 194 ? A 26.575 31.500 5.760 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 178 O OE2 . GLU 194 194 ? A 27.588 33.357 5.077 1 1 A GLU 0.320 1 ATOM 179 N N . SER 195 195 ? A 22.313 31.673 7.339 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 180 C CA . SER 195 195 ? A 21.087 31.101 7.868 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 181 C C . SER 195 195 ? A 21.194 29.620 7.716 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 182 O O . SER 195 195 ? A 21.761 29.140 6.741 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 183 C CB . SER 195 195 ? A 19.800 31.498 7.099 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 184 O OG . SER 195 195 ? A 19.556 32.901 7.150 1 1 A SER 0.360 1 ATOM 185 N N . ILE 196 196 ? A 20.603 28.859 8.664 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 186 C CA . ILE 196 196 ? A 20.653 27.399 8.682 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 187 C C . ILE 196 196 ? A 22.095 26.928 8.994 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 188 O O . ILE 196 196 ? A 22.940 27.684 9.433 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 189 C CB . ILE 196 196 ? A 19.902 26.774 7.459 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 190 C CG1 . ILE 196 196 ? A 18.481 27.390 7.311 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 191 C CG2 . ILE 196 196 ? A 19.734 25.229 7.452 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 192 C CD1 . ILE 196 196 ? A 17.840 27.126 5.937 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 193 N N . SER 197 197 ? A 22.343 25.616 8.880 1 1 A SER 0.270 1 ATOM 194 C CA . SER 197 197 ? A 23.638 24.969 8.956 1 1 A SER 0.270 1 ATOM 195 C C . SER 197 197 ? A 23.823 24.231 7.628 1 1 A SER 0.270 1 ATOM 196 O O . SER 197 197 ? A 24.467 24.745 6.724 1 1 A SER 0.270 1 ATOM 197 C CB . SER 197 197 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.570 2 1 3 0.043 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 170 LYS 1 0.290 2 1 A 171 PRO 1 0.290 3 1 A 172 SER 1 0.350 4 1 A 173 GLN 1 0.310 5 1 A 174 PRO 1 0.290 6 1 A 175 ALA 1 0.290 7 1 A 176 ALA 1 0.340 8 1 A 177 LYS 1 0.360 9 1 A 178 GLU 1 0.400 10 1 A 179 PRO 1 0.390 11 1 A 180 SER 1 0.420 12 1 A 181 ALA 1 0.440 13 1 A 182 THR 1 0.400 14 1 A 183 PRO 1 0.370 15 1 A 184 PRO 1 0.360 16 1 A 185 ILE 1 0.340 17 1 A 186 SER 1 0.360 18 1 A 187 ASN 1 0.350 19 1 A 188 LEU 1 0.320 20 1 A 189 THR 1 0.360 21 1 A 190 LYS 1 0.370 22 1 A 191 THR 1 0.370 23 1 A 192 ALA 1 0.330 24 1 A 193 SER 1 0.310 25 1 A 194 GLU 1 0.320 26 1 A 195 SER 1 0.360 27 1 A 196 ILE 1 0.300 28 1 A 197 SER 1 0.270 29 1 A 198 ASN 1 0.260 30 1 A 199 LEU 1 0.250 31 1 A 200 SER 1 0.260 32 1 A 201 GLU 1 0.280 33 1 A 202 ALA 1 0.280 34 1 A 203 GLY 1 0.280 35 1 A 204 SER 1 0.350 36 1 A 205 ILE 1 0.300 37 1 A 206 LYS 1 0.390 38 1 A 207 LYS 1 0.380 39 1 A 208 GLY 1 0.490 40 1 A 209 GLU 1 0.450 41 1 A 210 ARG 1 0.490 42 1 A 211 GLU 1 0.590 43 1 A 212 LEU 1 0.670 44 1 A 213 LYS 1 0.710 45 1 A 214 ILE 1 0.750 46 1 A 215 GLY 1 0.760 47 1 A 216 ASP 1 0.730 48 1 A 217 ARG 1 0.740 49 1 A 218 VAL 1 0.780 50 1 A 219 LEU 1 0.740 51 1 A 220 VAL 1 0.740 52 1 A 221 GLY 1 0.670 53 1 A 222 GLY 1 0.650 54 1 A 223 THR 1 0.620 55 1 A 224 LYS 1 0.670 56 1 A 225 ALA 1 0.760 57 1 A 226 GLY 1 0.760 58 1 A 227 VAL 1 0.790 59 1 A 228 VAL 1 0.790 60 1 A 229 ARG 1 0.770 61 1 A 230 PHE 1 0.780 62 1 A 231 LEU 1 0.790 63 1 A 232 GLY 1 0.750 64 1 A 233 GLU 1 0.750 65 1 A 234 THR 1 0.750 66 1 A 235 ASP 1 0.680 67 1 A 236 PHE 1 0.650 68 1 A 237 ALA 1 0.660 69 1 A 238 LYS 1 0.630 70 1 A 239 GLY 1 0.700 71 1 A 240 GLU 1 0.750 72 1 A 241 TRP 1 0.730 73 1 A 242 CYS 1 0.740 74 1 A 243 GLY 1 0.760 75 1 A 244 VAL 1 0.770 76 1 A 245 GLU 1 0.750 77 1 A 246 LEU 1 0.750 78 1 A 247 ASP 1 0.690 79 1 A 248 GLU 1 0.660 80 1 A 249 PRO 1 0.590 81 1 A 250 LEU 1 0.540 82 1 A 251 GLY 1 0.690 83 1 A 252 LYS 1 0.650 84 1 A 253 ASN 1 0.720 85 1 A 254 ASP 1 0.680 86 1 A 255 GLY 1 0.740 87 1 A 256 ALA 1 0.770 88 1 A 257 VAL 1 0.760 89 1 A 258 ALA 1 0.710 90 1 A 259 GLY 1 0.730 91 1 A 260 THR 1 0.770 92 1 A 261 ARG 1 0.740 93 1 A 262 TYR 1 0.750 94 1 A 263 PHE 1 0.710 95 1 A 264 GLN 1 0.700 96 1 A 265 CYS 1 0.710 97 1 A 266 GLN 1 0.650 98 1 A 267 PRO 1 0.640 99 1 A 268 LYS 1 0.610 100 1 A 269 TYR 1 0.650 101 1 A 270 GLY 1 0.750 102 1 A 271 LEU 1 0.730 103 1 A 272 PHE 1 0.740 104 1 A 273 ALA 1 0.770 105 1 A 274 PRO 1 0.730 106 1 A 275 VAL 1 0.690 107 1 A 276 HIS 1 0.720 108 1 A 277 LYS 1 0.710 109 1 A 278 VAL 1 0.710 110 1 A 279 THR 1 0.620 111 1 A 280 LYS 1 0.300 112 1 A 281 ILE 1 0.310 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #