data_SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_8 _entry.id SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_8 _struct.entry_id SMR-c68afa986e51e9206c5de36934459c0b_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P30622 (isoform 1)/ CLIP1_HUMAN, CAP-Gly domain-containing linker protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.03, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P30622 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 186927.721 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CLIP1_HUMAN P30622 1 ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL KVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLE AIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRK ASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEK ELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQ EAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGA REENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNL KNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDEVTSHQKLEE ERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHS VVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLK MKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGS RGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF ; 'CAP-Gly domain-containing linker protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1427 1 1427 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CLIP1_HUMAN P30622 P30622-1 1 1427 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-10-13 0A4F166DD94254E8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL 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PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDT RVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREIT SLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEEL KVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLE AIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRK ASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEK ELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQ EAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGA REENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNL 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PHE . 1 55 VAL . 1 56 ASP . 1 57 ASP . 1 58 PHE . 1 59 ARG . 1 60 VAL . 1 61 GLY . 1 62 GLU . 1 63 ARG . 1 64 VAL . 1 65 TRP . 1 66 VAL . 1 67 ASN . 1 68 GLY . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 PRO . 1 72 GLY . 1 73 PHE . 1 74 ILE . 1 75 GLN . 1 76 PHE . 1 77 LEU . 1 78 GLY . 1 79 GLU . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 PHE . 1 83 ALA . 1 84 PRO . 1 85 GLY . 1 86 GLN . 1 87 TRP . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 ILE . 1 91 VAL . 1 92 LEU . 1 93 ASP . 1 94 GLU . 1 95 PRO . 1 96 ILE . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 ASN . 1 100 ASP . 1 101 GLY . 1 102 SER . 1 103 VAL . 1 104 ALA . 1 105 GLY . 1 106 VAL . 1 107 ARG . 1 108 TYR . 1 109 PHE . 1 110 GLN . 1 111 CYS . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 LEU . 1 115 LYS . 1 116 GLY . 1 117 ILE . 1 118 PHE . 1 119 THR . 1 120 ARG . 1 121 PRO . 1 122 SER . 1 123 LYS . 1 124 LEU . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 LYS . 1 128 VAL . 1 129 GLN . 1 130 ALA . 1 131 GLU . 1 132 ASP . 1 133 GLU . 1 134 ALA . 1 135 ASN . 1 136 GLY . 1 137 LEU . 1 138 GLN . 1 139 THR . 1 140 THR . 1 141 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A 1 1266 GLU 1266 ? ? ? A . A 1 1267 SER 1267 ? ? ? A . A 1 1268 ASP 1268 ? ? ? A . A 1 1269 LYS 1269 ? ? ? A . A 1 1270 VAL 1270 ? ? ? A . A 1 1271 LYS 1271 ? ? ? A . A 1 1272 LEU 1272 ? ? ? A . A 1 1273 GLU 1273 ? ? ? A . A 1 1274 LEU 1274 ? ? ? A . A 1 1275 LYS 1275 ? ? ? A . A 1 1276 VAL 1276 ? ? ? A . A 1 1277 LYS 1277 ? ? ? A . A 1 1278 ASN 1278 ? ? ? A . A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? A . A 1 1280 GLU 1280 ? ? ? A . A 1 1281 LEU 1281 ? ? ? A . A 1 1282 GLN 1282 ? ? ? A . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? A . A 1 1284 LYS 1284 ? ? ? A . A 1 1285 GLU 1285 ? ? ? A . A 1 1286 ASN 1286 ? ? ? A . A 1 1287 LYS 1287 ? ? ? A . A 1 1288 ARG 1288 ? ? ? A . A 1 1289 GLN 1289 ? ? ? A . A 1 1290 LEU 1290 ? ? ? A . A 1 1291 SER 1291 ? ? ? A . A 1 1292 SER 1292 ? ? ? A . A 1 1293 SER 1293 ? ? ? A . A 1 1294 SER 1294 ? ? ? A . A 1 1295 GLY 1295 ? ? ? A . A 1 1296 ASN 1296 ? ? ? A . A 1 1297 THR 1297 ? ? ? A . A 1 1298 ASP 1298 ? ? ? A . A 1 1299 THR 1299 ? ? ? A . A 1 1300 GLN 1300 ? ? ? A . A 1 1301 ALA 1301 ? ? ? A . A 1 1302 ASP 1302 ? ? ? A . A 1 1303 GLU 1303 ? ? ? A . A 1 1304 ASP 1304 ? ? ? A . A 1 1305 GLU 1305 ? ? ? A . A 1 1306 ARG 1306 ? ? ? A . A 1 1307 ALA 1307 ? ? ? A . A 1 1308 GLN 1308 ? ? ? A . A 1 1309 GLU 1309 ? ? ? A . A 1 1310 SER 1310 ? ? ? A . A 1 1311 GLN 1311 ? ? ? A . A 1 1312 ILE 1312 ? ? ? A . A 1 1313 ASP 1313 ? ? ? A . A 1 1314 PHE 1314 ? ? ? A . A 1 1315 LEU 1315 ? ? ? A . A 1 1316 ASN 1316 ? ? ? A . A 1 1317 SER 1317 ? ? ? A . A 1 1318 VAL 1318 ? ? ? A . A 1 1319 ILE 1319 ? ? ? A . A 1 1320 VAL 1320 ? ? ? A . A 1 1321 ASP 1321 ? ? ? A . A 1 1322 LEU 1322 ? ? ? A . A 1 1323 GLN 1323 ? ? ? A . A 1 1324 ARG 1324 ? ? ? A . A 1 1325 LYS 1325 ? ? ? A . A 1 1326 ASN 1326 ? ? ? A . A 1 1327 GLN 1327 ? ? ? A . A 1 1328 ASP 1328 ? ? ? A . A 1 1329 LEU 1329 ? ? ? A . A 1 1330 LYS 1330 ? ? ? A . A 1 1331 MET 1331 ? ? ? A . A 1 1332 LYS 1332 ? ? ? A . A 1 1333 VAL 1333 ? ? ? A . A 1 1334 GLU 1334 ? ? ? A . A 1 1335 MET 1335 ? ? ? A . A 1 1336 MET 1336 ? ? ? A . A 1 1337 SER 1337 ? ? ? A . A 1 1338 GLU 1338 ? ? ? A . A 1 1339 ALA 1339 ? ? ? A . A 1 1340 ALA 1340 ? ? ? A . A 1 1341 LEU 1341 ? ? ? A . A 1 1342 ASN 1342 ? ? ? A . A 1 1343 GLY 1343 ? ? ? A . A 1 1344 ASN 1344 ? ? ? A . A 1 1345 GLY 1345 ? ? ? A . A 1 1346 ASP 1346 ? ? ? A . A 1 1347 ASP 1347 ? ? ? A . A 1 1348 LEU 1348 ? ? ? A . A 1 1349 ASN 1349 ? ? ? A . A 1 1350 ASN 1350 ? ? ? A . A 1 1351 TYR 1351 ? ? ? A . A 1 1352 ASP 1352 ? ? ? A . A 1 1353 SER 1353 ? ? ? A . A 1 1354 ASP 1354 ? ? ? A . A 1 1355 ASP 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLN 1356 ? ? ? A . A 1 1357 GLU 1357 ? ? ? A . A 1 1358 LYS 1358 ? ? ? A . A 1 1359 GLN 1359 ? ? ? A . A 1 1360 SER 1360 ? ? ? A . A 1 1361 LYS 1361 ? ? ? A . A 1 1362 LYS 1362 ? ? ? A . A 1 1363 LYS 1363 ? ? ? A . A 1 1364 PRO 1364 ? ? ? A . A 1 1365 ARG 1365 ? ? ? A . A 1 1366 LEU 1366 ? ? ? A . A 1 1367 PHE 1367 ? ? ? A . A 1 1368 CYS 1368 ? ? ? A . A 1 1369 ASP 1369 ? ? ? A . A 1 1370 ILE 1370 ? ? ? A . A 1 1371 CYS 1371 ? ? ? A . A 1 1372 ASP 1372 ? ? ? A . A 1 1373 CYS 1373 ? ? ? A . A 1 1374 PHE 1374 ? ? ? A . A 1 1375 ASP 1375 ? ? ? A . A 1 1376 LEU 1376 ? ? ? A . A 1 1377 HIS 1377 ? ? ? A . A 1 1378 ASP 1378 ? ? ? A . A 1 1379 THR 1379 ? ? ? A . A 1 1380 GLU 1380 ? ? ? A . A 1 1381 ASP 1381 ? ? ? A . A 1 1382 CYS 1382 ? ? ? A . A 1 1383 PRO 1383 ? ? ? A . A 1 1384 THR 1384 ? ? ? A . A 1 1385 GLN 1385 ? ? ? A . A 1 1386 ALA 1386 ? ? ? A . A 1 1387 GLN 1387 ? ? ? A . A 1 1388 MET 1388 ? ? ? A . A 1 1389 SER 1389 ? ? ? A . A 1 1390 GLU 1390 ? ? ? A . A 1 1391 ASP 1391 ? ? ? A . A 1 1392 PRO 1392 ? ? ? A . A 1 1393 PRO 1393 ? ? ? A . A 1 1394 HIS 1394 ? ? ? A . A 1 1395 SER 1395 ? ? ? A . A 1 1396 THR 1396 ? ? ? A . A 1 1397 HIS 1397 ? ? ? A . A 1 1398 HIS 1398 ? ? ? A . A 1 1399 GLY 1399 ? ? ? A . A 1 1400 SER 1400 ? ? ? A . A 1 1401 ARG 1401 ? ? ? A . A 1 1402 GLY 1402 ? ? ? A . A 1 1403 GLU 1403 ? ? ? A . A 1 1404 GLU 1404 ? ? ? A . A 1 1405 ARG 1405 ? ? ? A . A 1 1406 PRO 1406 ? ? ? A . A 1 1407 TYR 1407 ? ? ? A . A 1 1408 CYS 1408 ? ? ? A . A 1 1409 GLU 1409 ? ? ? A . A 1 1410 ILE 1410 ? ? ? A . A 1 1411 CYS 1411 ? ? ? A . A 1 1412 GLU 1412 ? ? ? A . A 1 1413 MET 1413 ? ? ? A . A 1 1414 PHE 1414 ? ? ? A . A 1 1415 GLY 1415 ? ? ? A . A 1 1416 HIS 1416 ? ? ? A . A 1 1417 TRP 1417 ? ? ? A . A 1 1418 ALA 1418 ? ? ? A . A 1 1419 THR 1419 ? ? ? A . A 1 1420 ASN 1420 ? ? ? A . A 1 1421 CYS 1421 ? ? ? A . A 1 1422 ASN 1422 ? ? ? A . A 1 1423 ASP 1423 ? ? ? A . A 1 1424 ASP 1424 ? ? ? A . A 1 1425 GLU 1425 ? ? ? A . A 1 1426 THR 1426 ? ? ? A . A 1 1427 PHE 1427 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynactin-1 {PDB ID=2hkn, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2hkn.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2hkn, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 84 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2hkn 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1427 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1428 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1e-17 44.595 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGN-KPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGSRGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF 2 1 2 ------------------------------------------------------ARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.042}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2hkn.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 57 57 ? A 25.524 44.808 -10.792 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 2 C CA . ASP 57 57 ? A 24.233 45.543 -10.873 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 3 C C . ASP 57 57 ? A 23.136 44.528 -11.203 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 4 O O . ASP 57 57 ? A 23.261 43.828 -12.205 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 5 C CB . ASP 57 57 ? A 24.462 46.635 -11.950 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 6 C CG . ASP 57 57 ? A 23.292 47.593 -11.970 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 57 57 ? A 22.347 47.334 -11.194 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 57 57 ? A 23.365 48.567 -12.749 1 1 A ASP 0.310 1 ATOM 9 N N . PHE 58 58 ? A 22.108 44.389 -10.327 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 10 C CA . PHE 58 58 ? A 20.934 43.556 -10.537 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 11 C C . PHE 58 58 ? A 19.935 44.349 -11.337 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 12 O O . PHE 58 58 ? A 19.563 45.456 -10.957 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 13 C CB . PHE 58 58 ? A 20.230 43.192 -9.206 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 14 C CG . PHE 58 58 ? A 21.063 42.226 -8.431 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 15 C CD1 . PHE 58 58 ? A 21.001 40.865 -8.745 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 16 C CD2 . PHE 58 58 ? A 21.909 42.649 -7.396 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 17 C CE1 . PHE 58 58 ? A 21.750 39.932 -8.024 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 18 C CE2 . PHE 58 58 ? A 22.671 41.720 -6.678 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 19 C CZ . PHE 58 58 ? A 22.584 40.358 -6.986 1 1 A PHE 0.440 1 ATOM 20 N N . ARG 59 59 ? A 19.472 43.809 -12.472 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 21 C CA . ARG 59 59 ? A 18.711 44.592 -13.417 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 22 C C . ARG 59 59 ? A 17.302 44.067 -13.525 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 23 O O . ARG 59 59 ? A 17.031 42.871 -13.413 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 24 C CB . ARG 59 59 ? A 19.360 44.541 -14.820 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 25 C CG . ARG 59 59 ? A 20.746 45.223 -14.860 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 26 C CD . ARG 59 59 ? A 21.593 44.980 -16.121 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 27 N NE . ARG 59 59 ? A 21.666 43.498 -16.399 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 28 C CZ . ARG 59 59 ? A 22.543 42.635 -15.870 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 29 N NH1 . ARG 59 59 ? A 23.485 43.031 -15.025 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 30 N NH2 . ARG 59 59 ? A 22.405 41.321 -16.081 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 31 N N . VAL 60 60 ? A 16.342 44.973 -13.781 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 32 C CA . VAL 60 60 ? A 14.976 44.622 -14.130 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 33 C C . VAL 60 60 ? A 14.928 43.736 -15.372 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 34 O O . VAL 60 60 ? A 15.550 44.033 -16.393 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 35 C CB . VAL 60 60 ? A 14.154 45.891 -14.351 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 36 C CG1 . VAL 60 60 ? A 12.794 45.625 -15.036 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 37 C CG2 . VAL 60 60 ? A 13.937 46.591 -12.994 1 1 A VAL 0.230 1 ATOM 38 N N . GLY 61 61 ? A 14.193 42.606 -15.300 1 1 A GLY 0.280 1 ATOM 39 C CA . GLY 61 61 ? A 14.044 41.662 -16.400 1 1 A GLY 0.280 1 ATOM 40 C C . GLY 61 61 ? A 14.977 40.484 -16.327 1 1 A GLY 0.280 1 ATOM 41 O O . GLY 61 61 ? A 14.836 39.535 -17.088 1 1 A GLY 0.280 1 ATOM 42 N N . GLU 62 62 ? A 15.955 40.496 -15.399 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 43 C CA . GLU 62 62 ? A 16.846 39.372 -15.180 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 44 C C . GLU 62 62 ? A 16.169 38.140 -14.578 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 45 O O . GLU 62 62 ? A 15.281 38.226 -13.726 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 46 C CB . GLU 62 62 ? A 18.052 39.822 -14.326 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 47 C CG . GLU 62 62 ? A 19.211 38.805 -14.186 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 48 C CD . GLU 62 62 ? A 20.431 39.400 -13.477 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 49 O OE1 . GLU 62 62 ? A 20.410 40.610 -13.117 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 50 O OE2 . GLU 62 62 ? A 21.449 38.669 -13.385 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 51 N N . ARG 63 63 ? A 16.567 36.928 -15.012 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 52 C CA . ARG 63 63 ? A 16.166 35.690 -14.368 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 53 C C . ARG 63 63 ? A 16.937 35.436 -13.081 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 54 O O . ARG 63 63 ? A 18.155 35.500 -13.057 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 55 C CB . ARG 63 63 ? A 16.379 34.475 -15.304 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 56 C CG . ARG 63 63 ? A 15.448 34.478 -16.534 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 57 C CD . ARG 63 63 ? A 13.958 34.321 -16.211 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 58 N NE . ARG 63 63 ? A 13.770 32.937 -15.662 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 59 C CZ . ARG 63 63 ? A 12.652 32.509 -15.060 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 60 N NH1 . ARG 63 63 ? A 11.623 33.327 -14.869 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 61 N NH2 . ARG 63 63 ? A 12.556 31.249 -14.643 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 62 N N . VAL 64 64 ? A 16.221 35.110 -11.984 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 63 C CA . VAL 64 64 ? A 16.819 34.952 -10.674 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 64 C C . VAL 64 64 ? A 16.215 33.751 -9.974 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 65 O O . VAL 64 64 ? A 15.179 33.227 -10.378 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 66 C CB . VAL 64 64 ? A 16.615 36.166 -9.760 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 67 C CG1 . VAL 64 64 ? A 17.321 37.402 -10.353 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 68 C CG2 . VAL 64 64 ? A 15.114 36.445 -9.510 1 1 A VAL 0.240 1 ATOM 69 N N . TRP 65 65 ? A 16.870 33.326 -8.873 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 70 C CA . TRP 65 65 ? A 16.370 32.393 -7.884 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 71 C C . TRP 65 65 ? A 16.289 33.136 -6.549 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 72 O O . TRP 65 65 ? A 17.099 34.031 -6.293 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 73 C CB . TRP 65 65 ? A 17.319 31.175 -7.723 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 74 C CG . TRP 65 65 ? A 17.463 30.327 -8.977 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 75 C CD1 . TRP 65 65 ? A 18.296 30.503 -10.046 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 76 C CD2 . TRP 65 65 ? A 16.702 29.139 -9.247 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 77 N NE1 . TRP 65 65 ? A 18.112 29.496 -10.968 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 78 C CE2 . TRP 65 65 ? A 17.141 28.645 -10.494 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 79 C CE3 . TRP 65 65 ? A 15.711 28.487 -8.526 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 80 C CZ2 . TRP 65 65 ? A 16.600 27.483 -11.023 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 81 C CZ3 . TRP 65 65 ? A 15.165 27.315 -9.062 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 82 C CH2 . TRP 65 65 ? A 15.606 26.815 -10.293 1 1 A TRP 0.170 1 ATOM 83 N N . VAL 66 66 ? A 15.308 32.807 -5.677 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 84 C CA . VAL 66 66 ? A 15.057 33.480 -4.401 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 85 C C . VAL 66 66 ? A 14.889 32.450 -3.267 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 86 O O . VAL 66 66 ? A 14.712 31.263 -3.535 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 87 C CB . VAL 66 66 ? A 13.850 34.429 -4.473 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 88 C CG1 . VAL 66 66 ? A 14.111 35.555 -5.504 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 89 C CG2 . VAL 66 66 ? A 12.550 33.667 -4.816 1 1 A VAL 0.150 1 ATOM 90 N N . ASN 67 67 ? A 14.992 32.854 -1.965 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 91 C CA . ASN 67 67 ? A 15.085 31.923 -0.830 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 92 C C . ASN 67 67 ? A 14.233 32.255 0.427 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 93 O O . ASN 67 67 ? A 13.585 33.289 0.499 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 94 C CB . ASN 67 67 ? A 16.579 31.613 -0.516 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 95 C CG . ASN 67 67 ? A 17.352 32.845 -0.048 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 96 O OD1 . ASN 67 67 ? A 17.036 33.439 0.966 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 97 N ND2 . ASN 67 67 ? A 18.428 33.231 -0.783 1 1 A ASN 0.150 1 ATOM 98 N N . GLY 68 68 ? A 14.161 31.285 1.399 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 99 C CA . GLY 68 68 ? A 13.215 31.272 2.537 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 100 C C . GLY 68 68 ? A 13.738 30.891 3.935 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 101 O O . GLY 68 68 ? A 14.714 31.447 4.421 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 102 N N . ASN 69 69 ? A 13.052 29.973 4.678 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 103 C CA . ASN 69 69 ? A 13.257 29.793 6.121 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 104 C C . ASN 69 69 ? A 12.935 28.373 6.652 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 105 O O . ASN 69 69 ? A 12.523 27.520 5.877 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 106 C CB . ASN 69 69 ? A 12.458 30.893 6.901 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 107 C CG . ASN 69 69 ? A 10.962 30.941 6.574 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 108 O OD1 . ASN 69 69 ? A 10.352 30.097 5.940 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 109 N ND2 . ASN 69 69 ? A 10.267 31.990 7.097 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 110 N N . LYS 70 70 ? A 13.130 28.141 7.998 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 111 C CA . LYS 70 70 ? A 12.411 27.239 8.932 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 112 C C . LYS 70 70 ? A 13.200 26.432 9.982 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 113 O O . LYS 70 70 ? 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A 11.257 17.096 9.227 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 269 C CB . ILE 90 90 ? A 14.105 18.398 9.218 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 270 C CG1 . ILE 90 90 ? A 15.608 18.340 8.851 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 271 C CG2 . ILE 90 90 ? A 13.857 19.491 10.285 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 272 C CD1 . ILE 90 90 ? A 16.119 19.610 8.157 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 273 N N . VAL 91 91 ? A 11.852 17.226 11.395 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 274 C CA . VAL 91 91 ? A 10.560 17.660 11.895 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 275 C C . VAL 91 91 ? A 10.672 19.108 12.111 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 276 O O . VAL 91 91 ? A 11.442 19.570 12.955 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 277 C CB . VAL 91 91 ? A 10.181 17.058 13.223 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 278 C CG1 . VAL 91 91 ? A 8.942 17.709 13.893 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 279 C CG2 . VAL 91 91 ? A 9.827 15.635 12.849 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 280 N N . LEU 92 92 ? A 9.937 19.864 11.326 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 281 C CA . LEU 92 92 ? A 9.878 21.279 11.421 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 282 C C . LEU 92 92 ? A 8.918 21.690 12.503 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 283 O O . LEU 92 92 ? A 7.949 20.982 12.792 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 284 C CB . LEU 92 92 ? A 9.467 21.770 10.048 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 285 C CG . LEU 92 92 ? A 10.443 21.289 8.974 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 286 C CD1 . LEU 92 92 ? A 9.766 21.553 7.667 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 287 C CD2 . LEU 92 92 ? A 11.716 22.121 8.975 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 288 N N . ASP 93 93 ? A 9.178 22.841 13.149 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 289 C CA . ASP 93 93 ? A 8.333 23.354 14.210 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 290 C C . ASP 93 93 ? A 6.914 23.657 13.702 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 291 O O . ASP 93 93 ? A 5.902 23.318 14.313 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 292 C CB . ASP 93 93 ? A 8.978 24.615 14.859 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 293 C CG . ASP 93 93 ? A 10.318 24.323 15.531 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 294 O OD1 . ASP 93 93 ? A 10.728 23.138 15.578 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 295 O OD2 . ASP 93 93 ? A 10.940 25.305 16.009 1 1 A ASP 0.650 1 ATOM 296 N N . GLU 94 94 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.607 2 1 3 0.030 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 57 ASP 1 0.310 2 1 A 58 PHE 1 0.440 3 1 A 59 ARG 1 0.420 4 1 A 60 VAL 1 0.230 5 1 A 61 GLY 1 0.280 6 1 A 62 GLU 1 0.390 7 1 A 63 ARG 1 0.320 8 1 A 64 VAL 1 0.240 9 1 A 65 TRP 1 0.170 10 1 A 66 VAL 1 0.150 11 1 A 67 ASN 1 0.150 12 1 A 68 GLY 1 0.210 13 1 A 69 ASN 1 0.580 14 1 A 70 LYS 1 0.640 15 1 A 71 PRO 1 0.670 16 1 A 72 GLY 1 0.630 17 1 A 73 PHE 1 0.680 18 1 A 74 ILE 1 0.700 19 1 A 75 GLN 1 0.710 20 1 A 76 PHE 1 0.670 21 1 A 77 LEU 1 0.730 22 1 A 78 GLY 1 0.710 23 1 A 79 GLU 1 0.720 24 1 A 80 THR 1 0.700 25 1 A 81 GLN 1 0.730 26 1 A 82 PHE 1 0.700 27 1 A 83 ALA 1 0.710 28 1 A 84 PRO 1 0.720 29 1 A 85 GLY 1 0.750 30 1 A 86 GLN 1 0.760 31 1 A 87 TRP 1 0.640 32 1 A 88 ALA 1 0.780 33 1 A 89 GLY 1 0.720 34 1 A 90 ILE 1 0.730 35 1 A 91 VAL 1 0.710 36 1 A 92 LEU 1 0.690 37 1 A 93 ASP 1 0.650 38 1 A 94 GLU 1 0.640 39 1 A 95 PRO 1 0.630 40 1 A 96 ILE 1 0.640 41 1 A 97 GLY 1 0.600 42 1 A 98 LYS 1 0.640 43 1 A 99 ASN 1 0.670 44 1 A 100 ASP 1 0.620 45 1 A 101 GLY 1 0.670 46 1 A 102 SER 1 0.730 47 1 A 103 VAL 1 0.710 48 1 A 104 ALA 1 0.680 49 1 A 105 GLY 1 0.640 50 1 A 106 VAL 1 0.710 51 1 A 107 ARG 1 0.720 52 1 A 108 TYR 1 0.690 53 1 A 109 PHE 1 0.650 54 1 A 110 GLN 1 0.680 55 1 A 111 CYS 1 0.670 56 1 A 112 GLU 1 0.640 57 1 A 113 PRO 1 0.650 58 1 A 114 LEU 1 0.700 59 1 A 115 LYS 1 0.640 60 1 A 116 GLY 1 0.680 61 1 A 117 ILE 1 0.740 62 1 A 118 PHE 1 0.700 63 1 A 119 THR 1 0.770 64 1 A 120 ARG 1 0.760 65 1 A 121 PRO 1 0.690 66 1 A 122 SER 1 0.690 67 1 A 123 LYS 1 0.670 68 1 A 124 LEU 1 0.670 69 1 A 125 THR 1 0.620 70 1 A 126 ARG 1 0.400 71 1 A 127 LYS 1 0.320 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #