data_SMR-94a36753a1517e19eeccffae8decf688_6 _entry.id SMR-94a36753a1517e19eeccffae8decf688_6 _struct.entry_id SMR-94a36753a1517e19eeccffae8decf688_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P30622/ CLIP1_HUMAN, CAP-Gly domain-containing linker protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.03, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P30622' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 188383.186 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CLIP1_HUMAN P30622 1 ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQKSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTK ADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLE VTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETA IASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLM KVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATE EKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLS EVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFR EKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIE DMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKT LLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQ NELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSR DEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLR GENASAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVI VDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMS EDPPHSTHHGSRGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF ; 'CAP-Gly domain-containing linker protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1438 1 1438 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CLIP1_HUMAN P30622 . 1 1438 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-10-13 A7F125F7A96DBDDB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTT PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQKSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTK ADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLE VTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETA 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PASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGER ELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTK IGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGT TALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAA DREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQKSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTK ADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLE VTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETA IASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLM KVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATE EKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLS EVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFR EKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIE DMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKT LLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQ NELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSR DEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLR GENASAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVI VDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMS EDPPHSTHHGSRGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 MET . 1 4 LEU . 1 5 LYS . 1 6 PRO . 1 7 SER . 1 8 GLY . 1 9 LEU . 1 10 LYS . 1 11 ALA . 1 12 PRO . 1 13 THR . 1 14 LYS . 1 15 ILE . 1 16 LEU . 1 17 LYS . 1 18 PRO . 1 19 GLY . 1 20 SER . 1 21 THR . 1 22 ALA . 1 23 LEU . 1 24 LYS . 1 25 THR . 1 26 PRO . 1 27 THR . 1 28 ALA . 1 29 VAL . 1 30 VAL . 1 31 ALA . 1 32 PRO . 1 33 VAL . 1 34 GLU . 1 35 LYS . 1 36 THR . 1 37 ILE . 1 38 SER . 1 39 SER . 1 40 GLU . 1 41 LYS . 1 42 ALA . 1 43 SER . 1 44 SER . 1 45 THR . 1 46 PRO . 1 47 SER . 1 48 SER . 1 49 GLU . 1 50 THR . 1 51 GLN . 1 52 GLU . 1 53 GLU . 1 54 PHE . 1 55 VAL . 1 56 ASP . 1 57 ASP . 1 58 PHE . 1 59 ARG . 1 60 VAL . 1 61 GLY . 1 62 GLU . 1 63 ARG . 1 64 VAL . 1 65 TRP . 1 66 VAL . 1 67 ASN . 1 68 GLY . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 PRO . 1 72 GLY . 1 73 PHE . 1 74 ILE . 1 75 GLN . 1 76 PHE . 1 77 LEU . 1 78 GLY . 1 79 GLU . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 PHE . 1 83 ALA . 1 84 PRO . 1 85 GLY . 1 86 GLN . 1 87 TRP . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 ILE . 1 91 VAL . 1 92 LEU . 1 93 ASP . 1 94 GLU . 1 95 PRO . 1 96 ILE . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 ASN . 1 100 ASP . 1 101 GLY . 1 102 SER . 1 103 VAL . 1 104 ALA . 1 105 GLY . 1 106 VAL . 1 107 ARG . 1 108 TYR . 1 109 PHE . 1 110 GLN . 1 111 CYS . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 LEU . 1 115 LYS . 1 116 GLY . 1 117 ILE . 1 118 PHE . 1 119 THR . 1 120 ARG . 1 121 PRO . 1 122 SER . 1 123 LYS . 1 124 LEU . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 LYS . 1 128 VAL . 1 129 GLN . 1 130 ALA . 1 131 GLU . 1 132 ASP . 1 133 GLU . 1 134 ALA . 1 135 ASN . 1 136 GLY . 1 137 LEU . 1 138 GLN . 1 139 THR . 1 140 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A 1 1264 ALA 1264 ? ? ? A . A 1 1265 SER 1265 ? ? ? A . A 1 1266 ALA 1266 ? ? ? A . A 1 1267 LYS 1267 ? ? ? A . A 1 1268 SER 1268 ? ? ? A . A 1 1269 LEU 1269 ? ? ? A . A 1 1270 HIS 1270 ? ? ? A . A 1 1271 SER 1271 ? ? ? A . A 1 1272 VAL 1272 ? ? ? A . A 1 1273 VAL 1273 ? ? ? A . A 1 1274 GLN 1274 ? ? ? A . A 1 1275 THR 1275 ? ? ? A . A 1 1276 LEU 1276 ? ? ? A . A 1 1277 GLU 1277 ? ? ? A . A 1 1278 SER 1278 ? ? ? A . A 1 1279 ASP 1279 ? ? ? A . A 1 1280 LYS 1280 ? ? ? A . A 1 1281 VAL 1281 ? ? ? A . A 1 1282 LYS 1282 ? ? ? A . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? A . A 1 1284 GLU 1284 ? ? ? A . A 1 1285 LEU 1285 ? ? ? A . A 1 1286 LYS 1286 ? ? ? A . A 1 1287 VAL 1287 ? ? ? A . A 1 1288 LYS 1288 ? ? ? A . A 1 1289 ASN 1289 ? ? ? A . A 1 1290 LEU 1290 ? ? ? A . A 1 1291 GLU 1291 ? ? ? A . A 1 1292 LEU 1292 ? ? ? A . A 1 1293 GLN 1293 ? ? ? A . A 1 1294 LEU 1294 ? ? ? A . A 1 1295 LYS 1295 ? ? ? A . A 1 1296 GLU 1296 ? ? ? A . A 1 1297 ASN 1297 ? ? ? A . A 1 1298 LYS 1298 ? ? ? A . A 1 1299 ARG 1299 ? ? ? A . A 1 1300 GLN 1300 ? ? ? A . A 1 1301 LEU 1301 ? ? ? A . A 1 1302 SER 1302 ? ? ? A . A 1 1303 SER 1303 ? ? ? A . A 1 1304 SER 1304 ? ? ? A . A 1 1305 SER 1305 ? ? ? A . A 1 1306 GLY 1306 ? ? ? A . A 1 1307 ASN 1307 ? ? ? A . A 1 1308 THR 1308 ? ? ? A . A 1 1309 ASP 1309 ? ? ? A . A 1 1310 THR 1310 ? ? ? A . A 1 1311 GLN 1311 ? ? ? A . A 1 1312 ALA 1312 ? ? ? A . A 1 1313 ASP 1313 ? ? ? A . A 1 1314 GLU 1314 ? ? ? A . A 1 1315 ASP 1315 ? ? ? A . A 1 1316 GLU 1316 ? ? ? A . A 1 1317 ARG 1317 ? ? ? A . A 1 1318 ALA 1318 ? ? ? A . A 1 1319 GLN 1319 ? ? ? A . A 1 1320 GLU 1320 ? ? ? A . A 1 1321 SER 1321 ? ? ? A . A 1 1322 GLN 1322 ? ? ? A . A 1 1323 ILE 1323 ? ? ? A . A 1 1324 ASP 1324 ? ? ? A . A 1 1325 PHE 1325 ? ? ? A . A 1 1326 LEU 1326 ? ? ? A . A 1 1327 ASN 1327 ? ? ? A . A 1 1328 SER 1328 ? ? ? A . A 1 1329 VAL 1329 ? ? ? A . A 1 1330 ILE 1330 ? ? ? A . A 1 1331 VAL 1331 ? ? ? A . A 1 1332 ASP 1332 ? ? ? A . A 1 1333 LEU 1333 ? ? ? A . A 1 1334 GLN 1334 ? ? ? A . A 1 1335 ARG 1335 ? ? ? A . A 1 1336 LYS 1336 ? ? ? A . A 1 1337 ASN 1337 ? ? ? A . A 1 1338 GLN 1338 ? ? ? A . A 1 1339 ASP 1339 ? ? ? A . A 1 1340 LEU 1340 ? ? ? A . A 1 1341 LYS 1341 ? ? ? A . A 1 1342 MET 1342 ? ? ? A . A 1 1343 LYS 1343 ? ? ? A . A 1 1344 VAL 1344 ? ? ? A . A 1 1345 GLU 1345 ? ? ? A . A 1 1346 MET 1346 ? ? ? A . A 1 1347 MET 1347 ? ? ? A . A 1 1348 SER 1348 ? ? ? A . A 1 1349 GLU 1349 ? ? ? A . A 1 1350 ALA 1350 ? ? ? A . A 1 1351 ALA 1351 ? ? ? A . A 1 1352 LEU 1352 ? ? ? A . A 1 1353 ASN 1353 ? ? ? A . A 1 1354 GLY 1354 ? ? ? A . A 1 1355 ASN 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLY 1356 ? ? ? A . A 1 1357 ASP 1357 ? ? ? A . A 1 1358 ASP 1358 ? ? ? A . A 1 1359 LEU 1359 ? ? ? A . A 1 1360 ASN 1360 ? ? ? A . A 1 1361 ASN 1361 ? ? ? A . A 1 1362 TYR 1362 ? ? ? A . A 1 1363 ASP 1363 ? ? ? A . A 1 1364 SER 1364 ? ? ? A . A 1 1365 ASP 1365 ? ? ? A . A 1 1366 ASP 1366 ? ? ? A . A 1 1367 GLN 1367 ? ? ? A . A 1 1368 GLU 1368 ? ? ? A . A 1 1369 LYS 1369 ? ? ? A . A 1 1370 GLN 1370 ? ? ? A . A 1 1371 SER 1371 ? ? ? A . A 1 1372 LYS 1372 ? ? ? A . A 1 1373 LYS 1373 ? ? ? A . A 1 1374 LYS 1374 ? ? ? A . A 1 1375 PRO 1375 ? ? ? A . A 1 1376 ARG 1376 ? ? ? A . A 1 1377 LEU 1377 ? ? ? A . A 1 1378 PHE 1378 ? ? ? A . A 1 1379 CYS 1379 ? ? ? A . A 1 1380 ASP 1380 ? ? ? A . A 1 1381 ILE 1381 ? ? ? A . A 1 1382 CYS 1382 ? ? ? A . A 1 1383 ASP 1383 ? ? ? A . A 1 1384 CYS 1384 ? ? ? A . A 1 1385 PHE 1385 ? ? ? A . A 1 1386 ASP 1386 ? ? ? A . A 1 1387 LEU 1387 ? ? ? A . A 1 1388 HIS 1388 ? ? ? A . A 1 1389 ASP 1389 ? ? ? A . A 1 1390 THR 1390 ? ? ? A . A 1 1391 GLU 1391 ? ? ? A . A 1 1392 ASP 1392 ? ? ? A . A 1 1393 CYS 1393 ? ? ? A . A 1 1394 PRO 1394 ? ? ? A . A 1 1395 THR 1395 ? ? ? A . A 1 1396 GLN 1396 ? ? ? A . A 1 1397 ALA 1397 ? ? ? A . A 1 1398 GLN 1398 ? ? ? A . A 1 1399 MET 1399 ? ? ? A . A 1 1400 SER 1400 ? ? ? A . A 1 1401 GLU 1401 ? ? ? A . A 1 1402 ASP 1402 ? ? ? A . A 1 1403 PRO 1403 ? ? ? A . A 1 1404 PRO 1404 ? ? ? A . A 1 1405 HIS 1405 ? ? ? A . A 1 1406 SER 1406 ? ? ? A . A 1 1407 THR 1407 ? ? ? A . A 1 1408 HIS 1408 ? ? ? A . A 1 1409 HIS 1409 ? ? ? A . A 1 1410 GLY 1410 ? ? ? A . A 1 1411 SER 1411 ? ? ? A . A 1 1412 ARG 1412 ? ? ? A . A 1 1413 GLY 1413 ? ? ? A . A 1 1414 GLU 1414 ? ? ? A . A 1 1415 GLU 1415 ? ? ? A . A 1 1416 ARG 1416 ? ? ? A . A 1 1417 PRO 1417 ? ? ? A . A 1 1418 TYR 1418 ? ? ? A . A 1 1419 CYS 1419 ? ? ? A . A 1 1420 GLU 1420 ? ? ? A . A 1 1421 ILE 1421 ? ? ? A . A 1 1422 CYS 1422 ? ? ? A . A 1 1423 GLU 1423 ? ? ? A . A 1 1424 MET 1424 ? ? ? A . A 1 1425 PHE 1425 ? ? ? A . A 1 1426 GLY 1426 ? ? ? A . A 1 1427 HIS 1427 ? ? ? A . A 1 1428 TRP 1428 ? ? ? A . A 1 1429 ALA 1429 ? ? ? A . A 1 1430 THR 1430 ? ? ? A . A 1 1431 ASN 1431 ? ? ? A . A 1 1432 CYS 1432 ? ? ? A . A 1 1433 ASN 1433 ? ? ? A . A 1 1434 ASP 1434 ? ? ? A . A 1 1435 ASP 1435 ? ? ? A . A 1 1436 GLU 1436 ? ? ? A . A 1 1437 THR 1437 ? ? ? A . A 1 1438 PHE 1438 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynactin-1 {PDB ID=2hkn, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2hkn.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2hkn, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 83 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2hkn 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1438 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1439 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9.8e-17 43.836 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPTAVVAPVEKTISSEKASSTPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVLVGGT-KAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQKSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKFIKDADEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQADEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGDDLNNYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGSRGEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.075}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2hkn.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 211 211 ? A 25.602 44.801 -10.802 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 2 C CA . GLU 211 211 ? A 24.290 45.503 -10.784 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 3 C C . GLU 211 211 ? A 23.210 44.495 -11.090 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 4 O O . GLU 211 211 ? A 23.414 43.669 -11.972 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 5 C CB . GLU 211 211 ? A 24.411 46.572 -11.894 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 6 C CG . GLU 211 211 ? A 23.187 47.488 -12.104 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 7 C CD . GLU 211 211 ? A 23.300 48.282 -13.405 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 211 211 ? A 22.464 49.191 -13.598 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 211 211 ? A 24.174 47.934 -14.248 1 1 A GLU 0.260 1 ATOM 10 N N . LEU 212 212 ? A 22.096 44.491 -10.334 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 11 C CA . LEU 212 212 ? A 20.974 43.602 -10.575 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 12 C C . LEU 212 212 ? A 19.948 44.366 -11.373 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 13 O O . LEU 212 212 ? A 19.612 45.493 -11.011 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 14 C CB . LEU 212 212 ? A 20.348 43.150 -9.230 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 15 C CG . LEU 212 212 ? A 19.100 42.241 -9.327 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 16 C CD1 . LEU 212 212 ? A 19.329 40.988 -10.188 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 17 C CD2 . LEU 212 212 ? A 18.644 41.832 -7.918 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 18 N N . LYS 213 213 ? A 19.465 43.804 -12.497 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 19 C CA . LYS 213 213 ? A 18.663 44.562 -13.429 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 20 C C . LYS 213 213 ? A 17.236 44.065 -13.543 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 21 O O . LYS 213 213 ? A 16.883 42.906 -13.321 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 22 C CB . LYS 213 213 ? A 19.330 44.609 -14.823 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 23 C CG . LYS 213 213 ? A 20.686 45.328 -14.792 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 24 C CD . LYS 213 213 ? A 21.368 45.363 -16.165 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 25 C CE . LYS 213 213 ? A 22.695 46.112 -16.095 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 26 N NZ . LYS 213 213 ? A 23.334 46.152 -17.421 1 1 A LYS 0.230 1 ATOM 27 N N . ILE 214 214 ? A 16.325 44.997 -13.888 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 28 C CA . ILE 214 214 ? A 14.939 44.680 -14.182 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 29 C C . ILE 214 214 ? A 14.862 43.798 -15.420 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 30 O O . ILE 214 214 ? A 15.386 44.140 -16.477 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 31 C CB . ILE 214 214 ? A 14.089 45.942 -14.353 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 32 C CG1 . ILE 214 214 ? A 14.081 46.755 -13.035 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 33 C CG2 . ILE 214 214 ? A 12.643 45.594 -14.790 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 34 C CD1 . ILE 214 214 ? A 13.519 48.170 -13.212 1 1 A ILE 0.210 1 ATOM 35 N N . GLY 215 215 ? A 14.201 42.628 -15.308 1 1 A GLY 0.230 1 ATOM 36 C CA . GLY 215 215 ? A 14.064 41.693 -16.420 1 1 A GLY 0.230 1 ATOM 37 C C . GLY 215 215 ? A 15.006 40.522 -16.378 1 1 A GLY 0.230 1 ATOM 38 O O . GLY 215 215 ? A 14.822 39.584 -17.146 1 1 A GLY 0.230 1 ATOM 39 N N . ASP 216 216 ? A 15.994 40.522 -15.457 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 40 C CA . ASP 216 216 ? A 16.911 39.416 -15.239 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 41 C C . ASP 216 216 ? A 16.211 38.191 -14.634 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 42 O O . ASP 216 216 ? A 15.859 37.232 -15.317 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 43 C CB . ASP 216 216 ? A 18.053 39.826 -14.256 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 44 C CG . ASP 216 216 ? A 19.063 40.827 -14.794 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 45 O OD1 . ASP 216 216 ? A 19.082 41.108 -16.014 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 46 O OD2 . ASP 216 216 ? A 19.877 41.289 -13.944 1 1 A ASP 0.250 1 ATOM 47 N N . ARG 217 217 ? A 16.035 38.165 -13.297 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 48 C CA . ARG 217 217 ? A 15.393 37.061 -12.616 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 49 C C . ARG 217 217 ? A 15.021 37.485 -11.208 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 50 O O . ARG 217 217 ? A 15.420 38.547 -10.737 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 51 C CB . ARG 217 217 ? A 16.286 35.790 -12.577 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 52 C CG . ARG 217 217 ? A 17.611 35.992 -11.819 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 53 C CD . ARG 217 217 ? A 18.601 34.845 -12.030 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 54 N NE . ARG 217 217 ? A 19.801 35.122 -11.173 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 55 C CZ . ARG 217 217 ? A 20.839 35.886 -11.545 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 56 N NH1 . ARG 217 217 ? A 20.867 36.520 -12.712 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 57 N NH2 . ARG 217 217 ? A 21.880 36.001 -10.723 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 58 N N . VAL 218 218 ? A 14.252 36.648 -10.490 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 59 C CA . VAL 218 218 ? A 13.935 36.851 -9.088 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 60 C C . VAL 218 218 ? A 14.468 35.646 -8.340 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 61 O O . VAL 218 218 ? A 14.450 34.528 -8.849 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 62 C CB . VAL 218 218 ? A 12.433 37.006 -8.856 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 63 C CG1 . VAL 218 218 ? A 12.095 37.171 -7.360 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 64 C CG2 . VAL 218 218 ? A 11.926 38.242 -9.626 1 1 A VAL 0.200 1 ATOM 65 N N . LEU 219 219 ? A 14.992 35.853 -7.117 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 66 C CA . LEU 219 219 ? A 15.475 34.793 -6.261 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 67 C C . LEU 219 219 ? A 14.632 34.809 -5.001 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 68 O O . LEU 219 219 ? A 14.386 35.864 -4.421 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 69 C CB . LEU 219 219 ? A 16.966 34.996 -5.885 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 70 C CG . LEU 219 219 ? A 17.943 34.987 -7.084 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 71 C CD1 . LEU 219 219 ? A 19.362 35.348 -6.619 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 72 C CD2 . LEU 219 219 ? A 17.964 33.630 -7.804 1 1 A LEU 0.150 1 ATOM 73 N N . VAL 220 220 ? A 14.132 33.635 -4.574 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 74 C CA . VAL 220 220 ? A 13.209 33.505 -3.460 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 75 C C . VAL 220 220 ? A 13.706 32.381 -2.578 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 76 O O . VAL 220 220 ? A 14.169 31.349 -3.060 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 77 C CB . VAL 220 220 ? A 11.785 33.187 -3.918 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 78 C CG1 . VAL 220 220 ? A 10.827 33.010 -2.720 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 79 C CG2 . VAL 220 220 ? A 11.267 34.326 -4.818 1 1 A VAL 0.130 1 ATOM 80 N N . GLY 221 221 ? A 13.642 32.559 -1.245 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 81 C CA . GLY 221 221 ? A 14.013 31.521 -0.309 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 82 C C . GLY 221 221 ? A 13.380 31.794 1.017 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 83 O O . GLY 221 221 ? A 12.566 32.699 1.166 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 84 N N . GLY 222 222 ? A 13.761 31.007 2.032 1 1 A GLY 0.250 1 ATOM 85 C CA . GLY 222 222 ? A 13.240 31.153 3.375 1 1 A GLY 0.250 1 ATOM 86 C C . GLY 222 222 ? A 13.689 29.976 4.170 1 1 A GLY 0.250 1 ATOM 87 O O . GLY 222 222 ? A 13.955 28.905 3.626 1 1 A GLY 0.250 1 ATOM 88 N N . THR 223 223 ? A 13.799 30.141 5.492 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 89 C CA . THR 223 223 ? A 14.354 29.139 6.383 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 90 C C . THR 223 223 ? A 13.321 28.818 7.428 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 91 O O . THR 223 223 ? A 12.398 29.587 7.676 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 92 C CB . THR 223 223 ? A 15.650 29.563 7.065 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 93 O OG1 . THR 223 223 ? A 15.477 30.767 7.801 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 94 C CG2 . THR 223 223 ? A 16.707 29.837 5.987 1 1 A THR 0.400 1 ATOM 95 N N . LYS 224 224 ? A 13.406 27.617 8.019 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 96 C CA . LYS 224 224 ? A 12.414 27.141 8.960 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 97 C C . LYS 224 224 ? A 13.166 26.334 9.987 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 98 O O . LYS 224 224 ? A 14.044 25.554 9.625 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 99 C CB . LYS 224 224 ? A 11.361 26.223 8.279 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 100 C CG . LYS 224 224 ? A 10.502 26.957 7.231 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 101 C CD . LYS 224 224 ? A 9.541 26.037 6.470 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 102 C CE . LYS 224 224 ? A 10.184 25.134 5.416 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 103 N NZ . LYS 224 224 ? A 10.685 25.937 4.277 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 104 N N . ALA 225 225 ? A 12.873 26.516 11.287 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 105 C CA . ALA 225 225 ? A 13.508 25.741 12.328 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 106 C C . ALA 225 225 ? A 12.912 24.347 12.447 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 107 O O . ALA 225 225 ? A 11.790 24.079 12.008 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 108 C CB . ALA 225 225 ? A 13.410 26.464 13.680 1 1 A ALA 0.500 1 ATOM 109 N N . GLY 226 226 ? A 13.689 23.408 13.012 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 110 C CA . GLY 226 226 ? A 13.208 22.063 13.210 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 111 C C . GLY 226 226 ? A 14.251 21.189 13.824 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 112 O O . GLY 226 226 ? A 15.389 21.595 14.056 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 113 N N . VAL 227 227 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.503 2 1 3 0.030 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 211 GLU 1 0.260 2 1 A 212 LEU 1 0.280 3 1 A 213 LYS 1 0.230 4 1 A 214 ILE 1 0.210 5 1 A 215 GLY 1 0.230 6 1 A 216 ASP 1 0.250 7 1 A 217 ARG 1 0.320 8 1 A 218 VAL 1 0.200 9 1 A 219 LEU 1 0.150 10 1 A 220 VAL 1 0.130 11 1 A 221 GLY 1 0.180 12 1 A 222 GLY 1 0.250 13 1 A 223 THR 1 0.400 14 1 A 224 LYS 1 0.480 15 1 A 225 ALA 1 0.500 16 1 A 226 GLY 1 0.560 17 1 A 227 VAL 1 0.590 18 1 A 228 VAL 1 0.630 19 1 A 229 ARG 1 0.620 20 1 A 230 PHE 1 0.590 21 1 A 231 LEU 1 0.600 22 1 A 232 GLY 1 0.590 23 1 A 233 GLU 1 0.590 24 1 A 234 THR 1 0.590 25 1 A 235 ASP 1 0.530 26 1 A 236 PHE 1 0.510 27 1 A 237 ALA 1 0.550 28 1 A 238 LYS 1 0.520 29 1 A 239 GLY 1 0.520 30 1 A 240 GLU 1 0.580 31 1 A 241 TRP 1 0.530 32 1 A 242 CYS 1 0.660 33 1 A 243 GLY 1 0.700 34 1 A 244 VAL 1 0.690 35 1 A 245 GLU 1 0.630 36 1 A 246 LEU 1 0.590 37 1 A 247 ASP 1 0.520 38 1 A 248 GLU 1 0.550 39 1 A 249 PRO 1 0.500 40 1 A 250 LEU 1 0.520 41 1 A 251 GLY 1 0.600 42 1 A 252 LYS 1 0.570 43 1 A 253 ASN 1 0.580 44 1 A 254 ASP 1 0.520 45 1 A 255 GLY 1 0.610 46 1 A 256 ALA 1 0.620 47 1 A 257 VAL 1 0.620 48 1 A 258 ALA 1 0.570 49 1 A 259 GLY 1 0.550 50 1 A 260 THR 1 0.650 51 1 A 261 ARG 1 0.590 52 1 A 262 TYR 1 0.580 53 1 A 263 PHE 1 0.540 54 1 A 264 GLN 1 0.560 55 1 A 265 CYS 1 0.530 56 1 A 266 GLN 1 0.520 57 1 A 267 PRO 1 0.500 58 1 A 268 LYS 1 0.520 59 1 A 269 TYR 1 0.530 60 1 A 270 GLY 1 0.640 61 1 A 271 LEU 1 0.670 62 1 A 272 PHE 1 0.660 63 1 A 273 ALA 1 0.660 64 1 A 274 PRO 1 0.560 65 1 A 275 VAL 1 0.540 66 1 A 276 HIS 1 0.530 67 1 A 277 LYS 1 0.490 68 1 A 278 VAL 1 0.510 69 1 A 279 THR 1 0.440 70 1 A 280 LYS 1 0.450 71 1 A 281 ILE 1 0.290 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #