data_SMR-70c9d85b85f09915f3ee8301847746ad_1 _entry.id SMR-70c9d85b85f09915f3ee8301847746ad_1 _struct.entry_id SMR-70c9d85b85f09915f3ee8301847746ad_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q13428 (isoform 2)/ TCOF_HUMAN, Treacle protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q13428 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 174696.519 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TCOF_HUMAN Q13428 1 ;MAEARKRRELLPLIYHHLLRAGYVRAAREVKEQSGQKCFLAQPVTLLDIYTHWQQTSELGRKRKAEEDAA LQAKKTRVSDPISTSESSEEEEEAEAETAKATPRLASTNSSVLGADLPSSMKEKAKAETEKAGKTGNSMP HPATGKTVANLLSGKSPRKSAEPSANTTLVSETEEEGSVPAFGAAAKPGMVSAGQADSSSEDTSSSSDET DVEGKPSVKPAQVKASSVSTKESPARKAAPAPGKVGDVTPQVKGGALPPAKRAKKPEEESESSEEGSESE EEAPAGTRSQVKASEKILQVRAASAPAKGTPGKGATPAPPGKAGAVASQTKAGKPEEDSESSSEESSDSE EETPAAKALLQAKASGKTSQVGAASAPAKESPRKGAAPAPPGKTGPAVAKAQAGKREEDSQSSSEESDSE EEAPAQAKPSGKAPQVRAASAPAKESPRKGAAPAPPRKTGPAAAQVQVGKQEEDSRSSSEESDSDREALA AMNAAQVKPLGKSPQVKPASTMGMGPLGKGAGPVPPGKVGPATPSAQVGKWEEDSESSSEESSDSSDGEV PTAVAPAQEKSLGNILQAKPTSSPAKGPPQKAGPVAVQVKAEKPMDNSESSEESSDSADSEEAPAAMTAA QAKPALKIPQTKACPKKTNTTASAKVAPVRVGTQAPRKAGTATSPAGSSPAVAGGTQRPAEDSSSSEESD SEEEKTGLAVTVGQAKSVGKGLQVKAASVPVKGSLGQGTAPVLPGKTGPTVTQVKAEKQEDSESSEEESD SEEAAASPAQVKTSVKKTQAKANPAAARAPSAKGTISAPGKVVTAAAQAKQRSPSKVKPPVRNPQNSTVL ARGPASVPSVGKAVATAAQAQTGPEEDSGSSEEESDSEEEAETLAQVKPSGKTHQIRAALAPAKESPRKG AAPTPPGKTGPSAAQAGKQDDSGSSSEESDSDGEAPAAVTSAQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPAQAQA ASTPRKARASESTARSSSSESEDEDVIPATQCLTPGIRTNVVTMPTAHPRIAPKASMAGASSSKESSRIS DGKKQEGPATQVDSAVGTLPATSPQSTSVQAKGTNKLRKPKLPEVQQATKAPESSDDSEDSSDSSSGSEE DGEGPQGAKSAHTLVGPTPSRTETLVEETAAESSEDDVVAPSQSLLSGYMTPGLTPANSQASKATPKLDS SPSVSSTLAAKDDPDGKQEAKPQQAAGMLSPKTGGKEAASGTTPQKSRKPKKGAGNPQASTLALQSNITQ CLLGQPWPLNEAQVQASVVKVLTELLEQERKKVVDTTKESSRKGWESRKRKLSGDQPAARTPRSKKKKKL GAGEGGEASVSPEKTSTTSKGKAKRDKASGDVKEKKGKGSLGSQGAKDEPEEELQKGMGTVEGGDQSNPK SKKEKKKSDKRKKDKEKKEKKKKAKKASTKDSESPSQKKKKKKKKTAEQTV ; 'Treacle protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1451 1 1451 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TCOF_HUMAN Q13428 Q13428-2 1 1451 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-08-10 0493C61010D7F167 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAEARKRRELLPLIYHHLLRAGYVRAAREVKEQSGQKCFLAQPVTLLDIYTHWQQTSELGRKRKAEEDAA LQAKKTRVSDPISTSESSEEEEEAEAETAKATPRLASTNSSVLGADLPSSMKEKAKAETEKAGKTGNSMP HPATGKTVANLLSGKSPRKSAEPSANTTLVSETEEEGSVPAFGAAAKPGMVSAGQADSSSEDTSSSSDET DVEGKPSVKPAQVKASSVSTKESPARKAAPAPGKVGDVTPQVKGGALPPAKRAKKPEEESESSEEGSESE EEAPAGTRSQVKASEKILQVRAASAPAKGTPGKGATPAPPGKAGAVASQTKAGKPEEDSESSSEESSDSE EETPAAKALLQAKASGKTSQVGAASAPAKESPRKGAAPAPPGKTGPAVAKAQAGKREEDSQSSSEESDSE EEAPAQAKPSGKAPQVRAASAPAKESPRKGAAPAPPRKTGPAAAQVQVGKQEEDSRSSSEESDSDREALA AMNAAQVKPLGKSPQVKPASTMGMGPLGKGAGPVPPGKVGPATPSAQVGKWEEDSESSSEESSDSSDGEV PTAVAPAQEKSLGNILQAKPTSSPAKGPPQKAGPVAVQVKAEKPMDNSESSEESSDSADSEEAPAAMTAA QAKPALKIPQTKACPKKTNTTASAKVAPVRVGTQAPRKAGTATSPAGSSPAVAGGTQRPAEDSSSSEESD SEEEKTGLAVTVGQAKSVGKGLQVKAASVPVKGSLGQGTAPVLPGKTGPTVTQVKAEKQEDSESSEEESD SEEAAASPAQVKTSVKKTQAKANPAAARAPSAKGTISAPGKVVTAAAQAKQRSPSKVKPPVRNPQNSTVL ARGPASVPSVGKAVATAAQAQTGPEEDSGSSEEESDSEEEAETLAQVKPSGKTHQIRAALAPAKESPRKG AAPTPPGKTGPSAAQAGKQDDSGSSSEESDSDGEAPAAVTSAQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPAQAQA ASTPRKARASESTARSSSSESEDEDVIPATQCLTPGIRTNVVTMPTAHPRIAPKASMAGASSSKESSRIS DGKKQEGPATQVDSAVGTLPATSPQSTSVQAKGTNKLRKPKLPEVQQATKAPESSDDSEDSSDSSSGSEE DGEGPQGAKSAHTLVGPTPSRTETLVEETAAESSEDDVVAPSQSLLSGYMTPGLTPANSQASKATPKLDS SPSVSSTLAAKDDPDGKQEAKPQQAAGMLSPKTGGKEAASGTTPQKSRKPKKGAGNPQASTLALQSNITQ CLLGQPWPLNEAQVQASVVKVLTELLEQERKKVVDTTKESSRKGWESRKRKLSGDQPAARTPRSKKKKKL GAGEGGEASVSPEKTSTTSKGKAKRDKASGDVKEKKGKGSLGSQGAKDEPEEELQKGMGTVEGGDQSNPK SKKEKKKSDKRKKDKEKKEKKKKAKKASTKDSESPSQKKKKKKKKTAEQTV ; ;MAEARKRRELLPLIYHHLLRAGYVRAAREVKEQSGQKCFLAQPVTLLDIYTHWQQTSELGRKRKAEEDAA LQAKKTRVSDPISTSESSEEEEEAEAETAKATPRLASTNSSVLGADLPSSMKEKAKAETEKAGKTGNSMP HPATGKTVANLLSGKSPRKSAEPSANTTLVSETEEEGSVPAFGAAAKPGMVSAGQADSSSEDTSSSSDET DVEGKPSVKPAQVKASSVSTKESPARKAAPAPGKVGDVTPQVKGGALPPAKRAKKPEEESESSEEGSESE EEAPAGTRSQVKASEKILQVRAASAPAKGTPGKGATPAPPGKAGAVASQTKAGKPEEDSESSSEESSDSE EETPAAKALLQAKASGKTSQVGAASAPAKESPRKGAAPAPPGKTGPAVAKAQAGKREEDSQSSSEESDSE EEAPAQAKPSGKAPQVRAASAPAKESPRKGAAPAPPRKTGPAAAQVQVGKQEEDSRSSSEESDSDREALA AMNAAQVKPLGKSPQVKPASTMGMGPLGKGAGPVPPGKVGPATPSAQVGKWEEDSESSSEESSDSSDGEV PTAVAPAQEKSLGNILQAKPTSSPAKGPPQKAGPVAVQVKAEKPMDNSESSEESSDSADSEEAPAAMTAA QAKPALKIPQTKACPKKTNTTASAKVAPVRVGTQAPRKAGTATSPAGSSPAVAGGTQRPAEDSSSSEESD SEEEKTGLAVTVGQAKSVGKGLQVKAASVPVKGSLGQGTAPVLPGKTGPTVTQVKAEKQEDSESSEEESD SEEAAASPAQVKTSVKKTQAKANPAAARAPSAKGTISAPGKVVTAAAQAKQRSPSKVKPPVRNPQNSTVL ARGPASVPSVGKAVATAAQAQTGPEEDSGSSEEESDSEEEAETLAQVKPSGKTHQIRAALAPAKESPRKG AAPTPPGKTGPSAAQAGKQDDSGSSSEESDSDGEAPAAVTSAQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPAQAQA ASTPRKARASESTARSSSSESEDEDVIPATQCLTPGIRTNVVTMPTAHPRIAPKASMAGASSSKESSRIS DGKKQEGPATQVDSAVGTLPATSPQSTSVQAKGTNKLRKPKLPEVQQATKAPESSDDSEDSSDSSSGSEE 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HIS . 1 53 TRP . 1 54 GLN . 1 55 GLN . 1 56 THR . 1 57 SER . 1 58 GLU . 1 59 LEU . 1 60 GLY . 1 61 ARG . 1 62 LYS . 1 63 ARG . 1 64 LYS . 1 65 ALA . 1 66 GLU . 1 67 GLU . 1 68 ASP . 1 69 ALA . 1 70 ALA . 1 71 LEU . 1 72 GLN . 1 73 ALA . 1 74 LYS . 1 75 LYS . 1 76 THR . 1 77 ARG . 1 78 VAL . 1 79 SER . 1 80 ASP . 1 81 PRO . 1 82 ILE . 1 83 SER . 1 84 THR . 1 85 SER . 1 86 GLU . 1 87 SER . 1 88 SER . 1 89 GLU . 1 90 GLU . 1 91 GLU . 1 92 GLU . 1 93 GLU . 1 94 ALA . 1 95 GLU . 1 96 ALA . 1 97 GLU . 1 98 THR . 1 99 ALA . 1 100 LYS . 1 101 ALA . 1 102 THR . 1 103 PRO . 1 104 ARG . 1 105 LEU . 1 106 ALA . 1 107 SER . 1 108 THR . 1 109 ASN . 1 110 SER . 1 111 SER . 1 112 VAL . 1 113 LEU . 1 114 GLY . 1 115 ALA . 1 116 ASP . 1 117 LEU . 1 118 PRO . 1 119 SER . 1 120 SER . 1 121 MET . 1 122 LYS . 1 123 GLU . 1 124 LYS . 1 125 ALA . 1 126 LYS . 1 127 ALA . 1 128 GLU . 1 129 THR . 1 130 GLU . 1 131 LYS . 1 132 ALA . 1 133 GLY . 1 134 LYS . 1 135 THR . 1 136 GLY . 1 137 ASN . 1 138 SER . 1 139 MET 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B 1 1291 LYS 1291 ? ? ? B . B 1 1292 LYS 1292 ? ? ? B . B 1 1293 VAL 1293 ? ? ? B . B 1 1294 VAL 1294 ? ? ? B . B 1 1295 ASP 1295 ? ? ? B . B 1 1296 THR 1296 ? ? ? B . B 1 1297 THR 1297 ? ? ? B . B 1 1298 LYS 1298 ? ? ? B . B 1 1299 GLU 1299 ? ? ? B . B 1 1300 SER 1300 ? ? ? B . B 1 1301 SER 1301 ? ? ? B . B 1 1302 ARG 1302 ? ? ? B . B 1 1303 LYS 1303 ? ? ? B . B 1 1304 GLY 1304 ? ? ? B . B 1 1305 TRP 1305 ? ? ? B . B 1 1306 GLU 1306 ? ? ? B . B 1 1307 SER 1307 ? ? ? B . B 1 1308 ARG 1308 ? ? ? B . B 1 1309 LYS 1309 ? ? ? B . B 1 1310 ARG 1310 ? ? ? B . B 1 1311 LYS 1311 ? ? ? B . B 1 1312 LEU 1312 ? ? ? B . B 1 1313 SER 1313 ? ? ? B . B 1 1314 GLY 1314 ? ? ? B . B 1 1315 ASP 1315 ? ? ? B . B 1 1316 GLN 1316 ? ? ? B . B 1 1317 PRO 1317 ? ? ? B . B 1 1318 ALA 1318 ? ? ? B . B 1 1319 ALA 1319 ? ? ? B . B 1 1320 ARG 1320 ? ? ? B . B 1 1321 THR 1321 ? ? ? B . B 1 1322 PRO 1322 ? ? ? B . B 1 1323 ARG 1323 ? ? ? B . B 1 1324 SER 1324 ? ? ? B . B 1 1325 LYS 1325 ? ? ? B . B 1 1326 LYS 1326 ? ? ? B . B 1 1327 LYS 1327 ? ? ? B . B 1 1328 LYS 1328 ? ? ? B . B 1 1329 LYS 1329 ? ? ? B . B 1 1330 LEU 1330 ? ? ? B . B 1 1331 GLY 1331 ? ? ? B . B 1 1332 ALA 1332 ? ? ? B . B 1 1333 GLY 1333 ? ? ? B . B 1 1334 GLU 1334 ? ? ? B . B 1 1335 GLY 1335 ? ? ? B . B 1 1336 GLY 1336 ? ? ? B . B 1 1337 GLU 1337 ? ? ? B . B 1 1338 ALA 1338 ? ? ? B . B 1 1339 SER 1339 ? ? ? B . B 1 1340 VAL 1340 ? ? ? B . B 1 1341 SER 1341 ? ? ? B . B 1 1342 PRO 1342 ? ? ? B . B 1 1343 GLU 1343 ? ? ? B . B 1 1344 LYS 1344 ? ? ? B . B 1 1345 THR 1345 ? ? ? B . B 1 1346 SER 1346 ? ? ? B . B 1 1347 THR 1347 ? ? ? B . B 1 1348 THR 1348 ? ? ? B . B 1 1349 SER 1349 ? ? ? B . B 1 1350 LYS 1350 ? ? ? B . B 1 1351 GLY 1351 ? ? ? B . B 1 1352 LYS 1352 ? ? ? B . B 1 1353 ALA 1353 ? ? ? B . B 1 1354 LYS 1354 ? ? ? B . B 1 1355 ARG 1355 ? ? ? B . B 1 1356 ASP 1356 ? ? ? B . B 1 1357 LYS 1357 ? ? ? B . B 1 1358 ALA 1358 ? ? ? B . B 1 1359 SER 1359 ? ? ? B . B 1 1360 GLY 1360 ? ? ? B . 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B 1 1431 ASP 1431 ? ? ? B . B 1 1432 SER 1432 ? ? ? B . B 1 1433 GLU 1433 ? ? ? B . B 1 1434 SER 1434 ? ? ? B . B 1 1435 PRO 1435 ? ? ? B . B 1 1436 SER 1436 ? ? ? B . B 1 1437 GLN 1437 ? ? ? B . B 1 1438 LYS 1438 ? ? ? B . B 1 1439 LYS 1439 ? ? ? B . B 1 1440 LYS 1440 ? ? ? B . B 1 1441 LYS 1441 ? ? ? B . B 1 1442 LYS 1442 ? ? ? B . B 1 1443 LYS 1443 ? ? ? B . B 1 1444 LYS 1444 ? ? ? B . B 1 1445 LYS 1445 ? ? ? B . B 1 1446 THR 1446 ? ? ? B . B 1 1447 ALA 1447 ? ? ? B . B 1 1448 GLU 1448 ? ? ? B . B 1 1449 GLN 1449 ? ? ? B . B 1 1450 THR 1450 ? ? ? B . B 1 1451 VAL 1451 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'PLATELET-ACTIVATING FACTOR ACETYLHYDROLASE IB ALPHA SUBUNIT {PDB ID=1uuj, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=1uuj.2.A}' 'template structure' . 2 'PLATELET-ACTIVATING FACTOR ACETYLHYDROLASE IB ALPHA SUBUNIT {PDB ID=1uuj, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=1uuj.2.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 1uuj, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 1uuj, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 1 1 C 2 2 'reference database' polymer 1 2 B D 1 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMEL ESKLNEAKEEFTSGGPLG ; ;GAMVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMEL ESKLNEAKEEFTSGGPLG ; 2 ;GAMVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMEL ESKLNEAKEEFTSGGPLG ; ;GAMVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMEL ESKLNEAKEEFTSGGPLG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 38 2 2 8 38 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1uuj 2024-10-23 2 PDB . 1uuj 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1451 2 2 B 1 1451 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1451 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1451 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 16.000 32.258 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 16.000 32.258 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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3 2 1 MAEARKRRELLPLIYHHLLRAGYVRAAREVKEQSGQKCFLAQPVTLLDIYTHWQQTSELGRKRKAEEDAALQAKKTRVSDPISTSESSEEEEEAEAETAKATPRLASTNSSVLGADLPSSMKEKAKAETEKAGKTGNSMPHPATGKTVANLLSGKSPRKSAEPSANTTLVSETEEEGSVPAFGAAAKPGMVSAGQADSSSEDTSSSSDETDVEGKPSVKPAQVKASSVSTKESPARKAAPAPGKVGDVTPQVKGGALPPAKRAKKPEEESESSEEGSESEEEAPAGTRSQVKASEKILQVRAASAPAKGTPGKGATPAPPGKAGAVASQTKAGKPEEDSESSSEESSDSEEETPAAKALLQAKASGKTSQVGAASAPAKESPRKGAAPAPPGKTGPAVAKAQAGKREEDSQSSSEESDSEEEAPAQAKPSGKAPQVRAASAPAKESPRKGAAPAPPRKTGPAAAQVQVGKQEEDSRSSSEESDSDREALAAMNAAQVKPLGKSPQVKPASTMGMGPLGKGAGPVPPGKVGPATPSAQVGKWEEDSESSSEESSDSSDGEVPTAVAPAQEKSLGNILQAKPTSSPAKGPPQKAGPVAVQVKAEKPMDNSESSEESSDSADSEEAPAAMTAAQAKPALKIPQTKACPKKTNTTASAKVAPVRVGTQAPRKAGTATSPAGSSPAVAGGTQRPAEDSSSSEESDSEEEKTGLAVTVGQAKSVGKGLQVKAASVPVKGSLGQGTAPVLPGKTGPTVTQVKAEKQEDSESSEEESDSEEAAASPAQVKTSVKKTQAKANPAAARAPSAKGTISAPGKVVTAAAQAKQRSPSKVKPPVRNPQNSTVLARGPASVPSVGKAVATAAQAQTGPEEDSGSSEEESDSEEEAETLAQVKPSGKTHQIRAALAPAKESPRKGAAPTPPGKTGPSAAQAGKQDDSGSSSEESDSDGEAPAAVTSAQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPAQAQAASTPRKARASESTARSSSSESEDEDVIPATQCLTPGIRTNVVTMPTAHPRIAPKASMAGASSSKESSRISDGKKQEGPATQVDSAVGTLPATSPQSTSVQAKGTNKLRKPKLPEVQQATKAPESSDDSEDSSDSSSGSEEDGEGPQGAKSAHTLVGPTPSRTETLVEETAAESSEDDVVAPSQSLLSGYMTPGLTPANSQASKATPKLDSSPSVSSTLAAKDDPDGKQEAKPQQAAGMLSPKTGGKEAASGTTPQKSRKPKKGAGNPQASTLALQSNITQCLLGQPWPLNEAQVQASVVKVLTELLEQERKKVVDTTKESSRKGWESRKRKLSGDQPAARTPRSKKKKKLGAGEGGEASVSPEKTSTTSKGKAKRDKASGDVKEKKGKGSLGSQGAKDEPEEELQKGMGTVEGGDQSNPKSKKEKKKSDKRKKDKEKKEKKKKAKKASTKDSESPSQKKKKKKKKTAEQTV 4 2 2 ----RQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.350}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1uuj.2, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 4.016 9.419 21.983 1 1 A LYS 0.310 1 ATOM 17 C CG . LYS 6 6 ? A 4.351 7.977 22.390 1 1 A LYS 0.310 1 ATOM 18 C CD . LYS 6 6 ? A 4.615 7.066 21.172 1 1 A LYS 0.310 1 ATOM 19 C CE . LYS 6 6 ? A 4.990 5.614 21.522 1 1 A LYS 0.310 1 ATOM 20 N NZ . LYS 6 6 ? A 5.209 4.770 20.318 1 1 A LYS 0.310 1 ATOM 21 N N . ARG 7 7 ? A 2.569 12.216 22.169 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 22 C CA . ARG 7 7 ? A 2.295 13.612 21.853 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 23 C C . ARG 7 7 ? A 2.508 14.518 23.066 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 24 O O . ARG 7 7 ? A 3.107 15.579 22.985 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 25 C CB . ARG 7 7 ? A 0.802 13.772 21.440 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 26 C CG . ARG 7 7 ? A 0.323 15.232 21.208 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 27 C CD . ARG 7 7 ? A 1.015 15.958 20.055 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 28 N NE . ARG 7 7 ? A 0.646 15.148 18.855 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 29 C CZ . ARG 7 7 ? A 1.197 15.254 17.642 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 30 N NH1 . ARG 7 7 ? A 2.113 16.183 17.390 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 31 N NH2 . ARG 7 7 ? 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LEU 13 13 ? A 10.033 18.535 25.684 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 77 C C . LEU 13 13 ? A 10.178 19.875 24.984 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 78 O O . LEU 13 13 ? A 11.124 20.619 25.238 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 79 C CB . LEU 13 13 ? A 10.454 17.411 24.698 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 80 C CG . LEU 13 13 ? A 10.667 16.019 25.323 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 81 C CD1 . LEU 13 13 ? A 10.956 14.984 24.218 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 82 C CD2 . LEU 13 13 ? A 11.790 16.029 26.375 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 83 N N . ILE 14 14 ? A 9.181 20.250 24.149 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 84 C CA . ILE 14 14 ? A 9.097 21.574 23.542 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 85 C C . ILE 14 14 ? A 8.983 22.667 24.584 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 86 O O . ILE 14 14 ? A 9.751 23.623 24.559 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 87 C CB . ILE 14 14 ? A 7.934 21.698 22.555 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 88 C CG1 . ILE 14 14 ? A 8.188 20.768 21.347 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 89 C CG2 . ILE 14 14 ? A 7.715 23.171 22.102 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 90 C CD1 . ILE 14 14 ? 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HIS 16 16 ? A 12.223 23.307 27.808 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 106 O O . HIS 16 16 ? A 12.988 24.091 28.359 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 107 C CB . HIS 16 16 ? A 11.570 21.327 29.187 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 108 C CG . HIS 16 16 ? A 10.717 20.870 30.319 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 109 N ND1 . HIS 16 16 ? A 11.039 19.667 30.905 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 110 C CD2 . HIS 16 16 ? A 9.641 21.428 30.936 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 111 C CE1 . HIS 16 16 ? A 10.144 19.502 31.854 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 112 N NE2 . HIS 16 16 ? A 9.276 20.540 31.922 1 1 A HIS 0.530 1 ATOM 113 N N . HIS 17 17 ? A 12.301 23.038 26.491 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 114 C CA . HIS 17 17 ? A 13.210 23.728 25.593 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 115 C C . HIS 17 17 ? A 12.973 25.235 25.545 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 116 O O . HIS 17 17 ? A 13.916 26.018 25.611 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 117 C CB . HIS 17 17 ? A 13.082 23.190 24.150 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 118 C CG . HIS 17 17 ? A 14.016 23.839 23.182 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 119 N ND1 . HIS 17 17 ? 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A 13.217 27.801 29.484 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 134 O O . LEU 19 19 ? A 13.761 28.811 29.921 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 135 C CB . LEU 19 19 ? A 11.084 26.893 30.318 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 136 C CG . LEU 19 19 ? A 11.367 27.361 31.765 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 137 C CD1 . LEU 19 19 ? A 10.852 28.789 32.024 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 138 C CD2 . LEU 19 19 ? A 10.791 26.368 32.787 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 139 N N . ARG 20 20 ? A 13.928 26.692 29.212 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 140 C CA . ARG 20 20 ? A 15.312 26.563 29.594 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 141 C C . ARG 20 20 ? A 16.286 27.262 28.643 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 142 O O . ARG 20 20 ? A 17.450 27.433 28.966 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 143 C CB . ARG 20 20 ? A 15.673 25.063 29.691 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 144 C CG . ARG 20 20 ? A 14.985 24.333 30.871 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 145 C CD . ARG 20 20 ? A 15.261 22.824 30.916 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 146 N NE . ARG 20 20 ? A 14.571 22.247 32.128 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 147 C CZ . ARG 20 20 ? 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ARG 7 7 ? B 19.494 28.475 20.034 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 291 N NE . ARG 7 7 ? B 20.476 27.665 20.829 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 292 C CZ . ARG 7 7 ? B 20.174 26.702 21.712 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 293 N NH1 . ARG 7 7 ? B 18.926 26.311 21.945 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 294 N NH2 . ARG 7 7 ? B 21.158 26.124 22.401 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 295 N N . ARG 8 8 ? B 19.021 27.318 14.868 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 296 C CA . ARG 8 8 ? B 18.173 27.969 13.900 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 297 C C . ARG 8 8 ? B 17.628 27.040 12.834 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 298 O O . ARG 8 8 ? B 16.972 27.479 11.946 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 299 C CB . ARG 8 8 ? B 18.910 29.031 13.056 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 300 C CG . ARG 8 8 ? B 19.407 30.286 13.753 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 301 C CD . ARG 8 8 ? B 20.100 31.109 12.676 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 302 N NE . ARG 8 8 ? B 20.664 32.288 13.368 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 303 C CZ . ARG 8 8 ? B 21.506 33.149 12.787 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 304 N NH1 . ARG 8 8 ? B 21.933 32.958 11.542 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 305 N NH2 . ARG 8 8 ? B 21.886 34.237 13.446 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 306 N N . GLU 9 9 ? B 17.939 25.733 12.863 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 307 C CA . GLU 9 9 ? B 17.122 24.761 12.181 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 308 C C . GLU 9 9 ? B 16.087 24.154 13.119 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 309 O O . GLU 9 9 ? B 14.924 24.030 12.753 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 310 C CB . GLU 9 9 ? B 18.033 23.689 11.561 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 311 C CG . GLU 9 9 ? B 18.899 24.266 10.405 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 312 C CD . GLU 9 9 ? B 20.110 23.425 9.980 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 313 O OE1 . GLU 9 9 ? B 20.458 22.419 10.653 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 314 O OE2 . GLU 9 9 ? B 20.819 23.871 9.038 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 315 N N . LEU 10 10 ? B 16.455 23.843 14.392 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 316 C CA . LEU 10 10 ? B 15.534 23.355 15.413 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 317 C C . LEU 10 10 ? B 14.394 24.326 15.719 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 318 O O . LEU 10 10 ? B 13.240 23.925 15.850 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 319 C CB . LEU 10 10 ? B 16.316 23.031 16.719 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 320 C CG . LEU 10 10 ? B 15.483 22.607 17.954 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 321 C CD1 . LEU 10 10 ? B 14.600 21.376 17.680 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 322 C CD2 . LEU 10 10 ? B 16.391 22.358 19.170 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 323 N N . LEU 11 11 ? B 14.665 25.641 15.832 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 324 C CA . LEU 11 11 ? B 13.639 26.648 16.066 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 325 C C . LEU 11 11 ? B 12.549 26.780 14.979 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 326 O O . LEU 11 11 ? B 11.385 26.767 15.354 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 327 C CB . LEU 11 11 ? B 14.285 28.015 16.413 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 328 C CG . LEU 11 11 ? B 15.060 28.059 17.743 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 329 C CD1 . LEU 11 11 ? B 15.885 29.355 17.768 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 330 C CD2 . LEU 11 11 ? B 14.146 27.922 18.972 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 331 N N . PRO 12 12 ? B 12.795 26.859 13.666 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 332 C CA . PRO 12 12 ? B 11.805 26.633 12.604 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 333 C C . PRO 12 12 ? B 11.074 25.331 12.770 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 334 O O . PRO 12 12 ? B 9.861 25.334 12.723 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 335 C CB . PRO 12 12 ? B 12.620 26.713 11.313 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 336 C CG . PRO 12 12 ? B 13.820 27.599 11.631 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 337 C CD . PRO 12 12 ? B 13.995 27.478 13.137 1 1 B PRO 0.560 1 ATOM 338 N N . LEU 13 13 ? B 11.762 24.201 13.038 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 339 C CA . LEU 13 13 ? B 11.051 22.947 13.251 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 340 C C . LEU 13 13 ? B 10.041 23.016 14.388 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 341 O O . LEU 13 13 ? B 8.903 22.576 14.242 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 342 C CB . LEU 13 13 ? B 12.003 21.755 13.507 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 343 C CG . LEU 13 13 ? B 12.848 21.347 12.288 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 344 C CD1 . LEU 13 13 ? B 13.925 20.335 12.712 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 345 C CD2 . LEU 13 13 ? B 11.983 20.790 11.142 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 346 N N . ILE 14 14 ? B 10.410 23.651 15.517 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 347 C CA . ILE 14 14 ? B 9.486 23.975 16.599 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 348 C C . ILE 14 14 ? B 8.360 24.915 16.182 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 349 O O . ILE 14 14 ? B 7.189 24.622 16.419 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 350 C CB . ILE 14 14 ? B 10.223 24.593 17.789 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 351 C CG1 . ILE 14 14 ? B 11.186 23.552 18.402 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 352 C CG2 . ILE 14 14 ? B 9.242 25.131 18.865 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 353 C CD1 . ILE 14 14 ? B 12.169 24.140 19.419 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 354 N N . TYR 15 15 ? B 8.668 26.046 15.508 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 355 C CA . TYR 15 15 ? B 7.701 27.031 15.052 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 356 C C . TYR 15 15 ? B 6.683 26.425 14.086 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 357 O O . TYR 15 15 ? B 5.471 26.595 14.236 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 358 C CB . TYR 15 15 ? B 8.459 28.225 14.392 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 359 C CG . TYR 15 15 ? B 7.547 29.124 13.609 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 360 C CD1 . TYR 15 15 ? B 7.525 29.051 12.207 1 1 B TYR 0.550 1 ATOM 361 C CD2 . TYR 15 15 ? 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B 7.683 27.288 8.572 1 1 B HIS 0.530 1 ATOM 376 N N . HIS 17 17 ? B 6.041 23.165 13.810 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 377 C CA . HIS 17 17 ? B 5.277 22.244 14.645 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 378 C C . HIS 17 17 ? B 4.138 22.905 15.409 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 379 O O . HIS 17 17 ? B 3.026 22.388 15.460 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 380 C CB . HIS 17 17 ? B 6.170 21.537 15.691 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 381 C CG . HIS 17 17 ? B 5.540 20.336 16.310 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 382 N ND1 . HIS 17 17 ? B 5.515 19.175 15.572 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 383 C CD2 . HIS 17 17 ? B 5.030 20.120 17.550 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 384 C CE1 . HIS 17 17 ? B 5.005 18.273 16.370 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 385 N NE2 . HIS 17 17 ? B 4.688 18.785 17.587 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 386 N N . LEU 18 18 ? B 4.387 24.087 16.016 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 387 C CA . LEU 18 18 ? B 3.382 24.870 16.718 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 388 C C . LEU 18 18 ? B 2.267 25.352 15.821 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 389 O O . LEU 18 18 ? B 1.092 25.225 16.153 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 390 C CB . LEU 18 18 ? B 3.999 26.115 17.392 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 391 C CG . LEU 18 18 ? B 4.959 25.795 18.548 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 392 C CD1 . LEU 18 18 ? B 5.726 27.060 18.928 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 393 C CD2 . LEU 18 18 ? B 4.268 25.179 19.769 1 1 B LEU 0.560 1 ATOM 394 N N . LEU 19 19 ? B 2.619 25.886 14.636 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 395 C CA . LEU 19 19 ? B 1.659 26.327 13.650 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 396 C C . LEU 19 19 ? B 0.791 25.211 13.096 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 397 O O . LEU 19 19 ? B -0.429 25.333 13.014 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 398 C CB . LEU 19 19 ? B 2.418 27.004 12.485 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 399 C CG . LEU 19 19 ? B 1.527 27.552 11.352 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 400 C CD1 . LEU 19 19 ? B 0.525 28.600 11.866 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 401 C CD2 . LEU 19 19 ? B 2.390 28.112 10.209 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 402 N N . ARG 20 20 ? B 1.400 24.065 12.735 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 403 C CA . ARG 20 20 ? 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B 0.354 20.959 16.477 1 1 B ALA 0.540 1 ATOM 418 N N . GLY 22 22 ? B -1.875 23.754 15.694 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 419 C CA . GLY 22 22 ? B -2.941 24.616 16.208 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 420 C C . GLY 22 22 ? B -2.563 25.582 17.304 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 421 O O . GLY 22 22 ? B -3.406 26.317 17.813 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 422 N N . TYR 23 23 ? B -1.274 25.664 17.672 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 423 C CA . TYR 23 23 ? B -0.777 26.503 18.750 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 424 C C . TYR 23 23 ? B -0.287 27.823 18.176 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 425 O O . TYR 23 23 ? B 0.893 28.180 18.215 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 426 C CB . TYR 23 23 ? B 0.372 25.829 19.535 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 427 C CG . TYR 23 23 ? B -0.034 24.467 20.020 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 428 C CD1 . TYR 23 23 ? B -1.114 24.299 20.897 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 429 C CD2 . TYR 23 23 ? B 0.635 23.323 19.558 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 430 C CE1 . TYR 23 23 ? B -1.497 23.021 21.318 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 431 C CE2 . TYR 23 23 ? B 0.254 22.044 19.983 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 432 C CZ . TYR 23 23 ? B -0.807 21.896 20.878 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 433 O OH . TYR 23 23 ? B -1.200 20.625 21.335 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 434 N N . VAL 24 24 ? B -1.236 28.577 17.589 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 435 C CA . VAL 24 24 ? B -1.007 29.766 16.779 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 436 C C . VAL 24 24 ? B -0.372 30.945 17.515 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 437 O O . VAL 24 24 ? B 0.554 31.583 17.023 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 438 C CB . VAL 24 24 ? B -2.276 30.191 16.041 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 439 C CG1 . VAL 24 24 ? B -2.060 31.477 15.205 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 440 C CG2 . VAL 24 24 ? B -2.679 29.023 15.113 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 441 N N . ARG 25 25 ? B -0.826 31.270 18.747 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 442 C CA . ARG 25 25 ? B -0.293 32.381 19.522 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 443 C C . ARG 25 25 ? B 1.128 32.110 19.954 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 444 O O . ARG 25 25 ? B 1.973 32.992 19.968 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 445 C CB . ARG 25 25 ? B -1.155 32.694 20.756 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 446 C CG . ARG 25 25 ? B -2.491 33.352 20.407 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 447 C CD . ARG 25 25 ? B -3.276 33.626 21.681 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 448 N NE . ARG 25 25 ? B -4.546 34.292 21.258 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 449 C CZ . ARG 25 25 ? B -5.541 34.554 22.115 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 450 N NH1 . ARG 25 25 ? B -5.430 34.237 23.401 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 451 N NH2 . ARG 25 25 ? B -6.657 35.134 21.681 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 452 N N . ALA 26 26 ? B 1.418 30.830 20.269 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 453 C CA . ALA 26 26 ? B 2.740 30.372 20.614 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 454 C C . ALA 26 26 ? B 3.681 30.480 19.440 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 455 O O . ALA 26 26 ? B 4.799 30.958 19.589 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 456 C CB . ALA 26 26 ? B 2.711 28.898 21.036 1 1 B ALA 0.630 1 ATOM 457 N N . ALA 27 27 ? B 3.202 30.074 18.237 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 458 C CA . ALA 27 27 ? B 3.868 30.212 16.962 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 459 C C . ALA 27 27 ? B 4.195 31.669 16.649 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 460 O O . ALA 27 27 ? B 5.293 32.001 16.231 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 461 C CB . ALA 27 27 ? B 2.995 29.626 15.831 1 1 B ALA 0.620 1 ATOM 462 N N . ARG 28 28 ? B 3.247 32.595 16.892 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 463 C CA . ARG 28 28 ? B 3.474 34.023 16.764 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 464 C C . ARG 28 28 ? B 4.592 34.562 17.655 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 465 O O . ARG 28 28 ? B 5.552 35.134 17.154 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 466 C CB . ARG 28 28 ? B 2.166 34.765 17.112 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 467 C CG . ARG 28 28 ? B 2.216 36.301 16.994 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 468 C CD . ARG 28 28 ? B 0.937 36.950 17.527 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 469 N NE . ARG 28 28 ? B 1.036 36.982 19.033 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 470 C CZ . ARG 28 28 ? B 0.019 37.203 19.873 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 471 N NH1 . ARG 28 28 ? B -1.227 37.279 19.398 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 472 N NH2 . ARG 28 28 ? B 0.253 37.403 21.169 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 473 N N . GLU 29 29 ? 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B 11.724 37.347 17.803 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 502 C CB . GLU 32 32 ? B 8.446 37.745 17.466 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 503 C CG . GLU 32 32 ? B 7.441 38.070 16.336 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 504 C CD . GLU 32 32 ? B 6.269 38.939 16.774 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 505 O OE1 . GLU 32 32 ? B 6.168 39.273 17.981 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 506 O OE2 . GLU 32 32 ? B 5.440 39.244 15.875 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 507 N N . GLN 33 33 ? B 10.553 35.872 19.007 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 508 C CA . GLN 33 33 ? B 11.647 35.606 19.925 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 509 C C . GLN 33 33 ? B 12.841 34.877 19.332 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 510 O O . GLN 33 33 ? B 13.969 35.076 19.771 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 511 C CB . GLN 33 33 ? B 11.202 34.781 21.146 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 512 C CG . GLN 33 33 ? B 10.275 35.542 22.098 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 513 C CD . GLN 33 33 ? B 9.919 34.681 23.299 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 514 O OE1 . GLN 33 33 ? B 9.693 33.478 23.279 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 515 N NE2 . GLN 33 33 ? 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B 14.256 36.015 12.539 1 1 B GLY 0.440 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.525 2 1 3 0 3 1 4 0.350 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 5 ARG 1 0.360 2 1 A 6 LYS 1 0.310 3 1 A 7 ARG 1 0.470 4 1 A 8 ARG 1 0.480 5 1 A 9 GLU 1 0.520 6 1 A 10 LEU 1 0.510 7 1 A 11 LEU 1 0.530 8 1 A 12 PRO 1 0.560 9 1 A 13 LEU 1 0.550 10 1 A 14 ILE 1 0.580 11 1 A 15 TYR 1 0.550 12 1 A 16 HIS 1 0.530 13 1 A 17 HIS 1 0.520 14 1 A 18 LEU 1 0.560 15 1 A 19 LEU 1 0.530 16 1 A 20 ARG 1 0.470 17 1 A 21 ALA 1 0.550 18 1 A 22 GLY 1 0.570 19 1 A 23 TYR 1 0.510 20 1 A 24 VAL 1 0.570 21 1 A 25 ARG 1 0.510 22 1 A 26 ALA 1 0.630 23 1 A 27 ALA 1 0.610 24 1 A 28 ARG 1 0.510 25 1 A 29 GLU 1 0.580 26 1 A 30 VAL 1 0.600 27 1 A 31 LYS 1 0.550 28 1 A 32 GLU 1 0.540 29 1 A 33 GLN 1 0.520 30 1 A 34 SER 1 0.470 31 1 A 35 GLY 1 0.390 32 1 B 5 ARG 1 0.370 33 1 B 6 LYS 1 0.370 34 1 B 7 ARG 1 0.460 35 1 B 8 ARG 1 0.470 36 1 B 9 GLU 1 0.530 37 1 B 10 LEU 1 0.520 38 1 B 11 LEU 1 0.540 39 1 B 12 PRO 1 0.560 40 1 B 13 LEU 1 0.560 41 1 B 14 ILE 1 0.580 42 1 B 15 TYR 1 0.550 43 1 B 16 HIS 1 0.530 44 1 B 17 HIS 1 0.520 45 1 B 18 LEU 1 0.560 46 1 B 19 LEU 1 0.530 47 1 B 20 ARG 1 0.470 48 1 B 21 ALA 1 0.540 49 1 B 22 GLY 1 0.550 50 1 B 23 TYR 1 0.500 51 1 B 24 VAL 1 0.580 52 1 B 25 ARG 1 0.510 53 1 B 26 ALA 1 0.630 54 1 B 27 ALA 1 0.620 55 1 B 28 ARG 1 0.520 56 1 B 29 GLU 1 0.600 57 1 B 30 VAL 1 0.620 58 1 B 31 LYS 1 0.570 59 1 B 32 GLU 1 0.560 60 1 B 33 GLN 1 0.550 61 1 B 34 SER 1 0.510 62 1 B 35 GLY 1 0.440 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #