data_SMR-29f45a2b57dbcc9d7134ce368db24800_8 _entry.id SMR-29f45a2b57dbcc9d7134ce368db24800_8 _struct.entry_id SMR-29f45a2b57dbcc9d7134ce368db24800_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O15056 (isoform 2)/ SYNJ2_HUMAN, Synaptojanin-2 Estimated model accuracy of this model is 0.029, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O15056 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 186766.058 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SYNJ2_HUMAN O15056 1 ;MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLK SGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRF DLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEAN APAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLE TLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVY GEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLL DSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLV GVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDY KEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFH EGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPG ALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPED LRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIR KRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTAL APPSKSPALTKKKQHPTYKTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNV KQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRV PAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQTVHFTIGPPETSVEAPPVVTAPRVPPVPKPRTFQPGKAAERPSHRK PASDEAPPGAGASVPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHPPAAG TVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQDPFWNLLHHPKLLNNTWLSKSSDPLDSGTRSPK RDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDPLAKT ; Synaptojanin-2 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1451 1 1451 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SYNJ2_HUMAN O15056 O15056-2 1 1451 9606 'Homo sapiens (Human)' 2005-03-01 42E19A35A791EA6A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLK SGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRF DLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEAN APAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLE TLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVY GEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLL DSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLV 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GLY . 1 53 GLN . 1 54 TYR . 1 55 GLY . 1 56 LYS . 1 57 LEU . 1 58 THR . 1 59 ASP . 1 60 ALA . 1 61 TYR . 1 62 GLY . 1 63 CYS . 1 64 LEU . 1 65 GLY . 1 66 GLU . 1 67 LEU . 1 68 ARG . 1 69 LEU . 1 70 LYS . 1 71 SER . 1 72 GLY . 1 73 GLY . 1 74 THR . 1 75 SER . 1 76 LEU . 1 77 SER . 1 78 PHE . 1 79 LEU . 1 80 VAL . 1 81 LEU . 1 82 VAL . 1 83 THR . 1 84 GLY . 1 85 CYS . 1 86 THR . 1 87 SER . 1 88 VAL . 1 89 GLY . 1 90 ARG . 1 91 ILE . 1 92 PRO . 1 93 ASP . 1 94 ALA . 1 95 GLU . 1 96 ILE . 1 97 TYR . 1 98 LYS . 1 99 ILE . 1 100 THR . 1 101 ALA . 1 102 THR . 1 103 ASP . 1 104 PHE . 1 105 TYR . 1 106 PRO . 1 107 LEU . 1 108 GLN . 1 109 GLU . 1 110 GLU . 1 111 ALA . 1 112 LYS . 1 113 GLU . 1 114 GLU . 1 115 GLU . 1 116 ARG . 1 117 LEU . 1 118 ILE . 1 119 ALA . 1 120 LEU . 1 121 LYS . 1 122 LYS . 1 123 ILE . 1 124 LEU . 1 125 SER . 1 126 SER . 1 127 GLY . 1 128 VAL . 1 129 PHE . 1 130 TYR . 1 131 PHE . 1 132 SER . 1 133 TRP . 1 134 PRO . 1 135 ASN . 1 136 ASP . 1 137 GLY . 1 138 SER . 1 139 ARG 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A 1 1262 ALA 1262 ? ? ? A . A 1 1263 SER 1263 ? ? ? A . A 1 1264 ASP 1264 ? ? ? A . A 1 1265 GLU 1265 ? ? ? A . A 1 1266 ALA 1266 ? ? ? A . A 1 1267 PRO 1267 ? ? ? A . A 1 1268 PRO 1268 ? ? ? A . A 1 1269 GLY 1269 ? ? ? A . A 1 1270 ALA 1270 ? ? ? A . A 1 1271 GLY 1271 ? ? ? A . A 1 1272 ALA 1272 ? ? ? A . A 1 1273 SER 1273 ? ? ? A . A 1 1274 VAL 1274 ? ? ? A . A 1 1275 PRO 1275 ? ? ? A . A 1 1276 PRO 1276 ? ? ? A . A 1 1277 PRO 1277 ? ? ? A . A 1 1278 LEU 1278 ? ? ? A . A 1 1279 GLU 1279 ? ? ? A . A 1 1280 ALA 1280 ? ? ? A . A 1 1281 PRO 1281 ? ? ? A . A 1 1282 PRO 1282 ? ? ? A . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? A . A 1 1284 VAL 1284 ? ? ? A . A 1 1285 PRO 1285 ? ? ? A . A 1 1286 LYS 1286 ? ? ? A . A 1 1287 VAL 1287 ? ? ? A . A 1 1288 PRO 1288 ? ? ? A . A 1 1289 PRO 1289 ? ? ? A . A 1 1290 ARG 1290 ? ? ? A . A 1 1291 ARG 1291 ? ? ? A . A 1 1292 LYS 1292 ? ? ? A . A 1 1293 LYS 1293 ? ? ? A . A 1 1294 SER 1294 ? ? ? A . A 1 1295 ALA 1295 ? ? ? A . A 1 1296 PRO 1296 ? ? ? A . A 1 1297 ALA 1297 ? ? ? A . A 1 1298 ALA 1298 ? ? ? A . A 1 1299 PHE 1299 ? ? ? A . A 1 1300 HIS 1300 ? ? ? A . A 1 1301 LEU 1301 ? ? ? A . A 1 1302 GLN 1302 ? ? ? A . A 1 1303 VAL 1303 ? ? ? A . A 1 1304 LEU 1304 ? ? ? A . A 1 1305 GLN 1305 ? ? ? A . A 1 1306 SER 1306 ? ? ? A . A 1 1307 ASN 1307 ? ? ? A . A 1 1308 SER 1308 ? ? ? A . A 1 1309 GLN 1309 ? ? ? A . A 1 1310 LEU 1310 ? ? ? A . A 1 1311 LEU 1311 ? ? ? A . A 1 1312 GLN 1312 ? ? ? A . A 1 1313 GLY 1313 ? ? ? A . A 1 1314 LEU 1314 ? ? ? A . A 1 1315 THR 1315 ? ? ? A . A 1 1316 TYR 1316 ? ? ? A . A 1 1317 ASN 1317 ? ? ? A . A 1 1318 SER 1318 ? ? ? A . A 1 1319 SER 1319 ? ? ? A . A 1 1320 ASP 1320 ? ? ? A . A 1 1321 SER 1321 ? ? ? A . A 1 1322 PRO 1322 ? ? ? A . A 1 1323 SER 1323 ? ? ? A . A 1 1324 GLY 1324 ? ? ? A . A 1 1325 HIS 1325 ? ? ? A . A 1 1326 PRO 1326 ? ? ? A . A 1 1327 PRO 1327 ? ? ? A . A 1 1328 ALA 1328 ? ? ? A . A 1 1329 ALA 1329 ? ? ? A . A 1 1330 GLY 1330 ? ? ? A . A 1 1331 THR 1331 ? ? ? A . A 1 1332 VAL 1332 ? ? ? A . A 1 1333 PHE 1333 ? ? ? A . A 1 1334 PRO 1334 ? ? ? A . A 1 1335 GLN 1335 ? ? ? A . A 1 1336 GLY 1336 ? ? ? A . A 1 1337 ASP 1337 ? ? ? A . A 1 1338 PHE 1338 ? ? ? A . A 1 1339 LEU 1339 ? ? ? A . A 1 1340 SER 1340 ? ? ? A . A 1 1341 THR 1341 ? ? ? A . A 1 1342 SER 1342 ? ? ? A . A 1 1343 SER 1343 ? ? ? A . A 1 1344 ALA 1344 ? ? ? A . A 1 1345 THR 1345 ? ? ? A . A 1 1346 SER 1346 ? ? ? A . A 1 1347 PRO 1347 ? ? ? A . A 1 1348 ASP 1348 ? ? ? A . A 1 1349 SER 1349 ? ? ? A . A 1 1350 ASP 1350 ? ? ? A . A 1 1351 GLY 1351 ? ? ? A . A 1 1352 THR 1352 ? ? ? A . A 1 1353 LYS 1353 ? ? ? A . A 1 1354 ALA 1354 ? ? ? A . A 1 1355 MET 1355 ? ? ? A . A 1 1356 LYS 1356 ? ? ? A . A 1 1357 PRO 1357 ? ? ? A . A 1 1358 GLU 1358 ? ? ? A . A 1 1359 ALA 1359 ? ? ? A . A 1 1360 ALA 1360 ? ? ? A . A 1 1361 PRO 1361 ? ? ? A . A 1 1362 LEU 1362 ? ? ? A . A 1 1363 LEU 1363 ? ? ? A . A 1 1364 GLY 1364 ? ? ? A . A 1 1365 ASP 1365 ? ? ? A . A 1 1366 TYR 1366 ? ? ? A . A 1 1367 GLN 1367 ? ? ? A . A 1 1368 ASP 1368 ? ? ? A . A 1 1369 PRO 1369 ? ? ? A . A 1 1370 PHE 1370 ? ? ? A . A 1 1371 TRP 1371 ? ? ? A . A 1 1372 ASN 1372 ? ? ? A . A 1 1373 LEU 1373 ? ? ? A . A 1 1374 LEU 1374 ? ? ? A . A 1 1375 HIS 1375 ? ? ? A . A 1 1376 HIS 1376 ? ? ? A . A 1 1377 PRO 1377 ? ? ? A . A 1 1378 LYS 1378 ? ? ? A . A 1 1379 LEU 1379 ? ? ? A . A 1 1380 LEU 1380 ? ? ? A . A 1 1381 ASN 1381 ? ? ? A . A 1 1382 ASN 1382 ? ? ? A . A 1 1383 THR 1383 ? ? ? A . A 1 1384 TRP 1384 ? ? ? A . A 1 1385 LEU 1385 ? ? ? A . A 1 1386 SER 1386 ? ? ? A . A 1 1387 LYS 1387 ? ? ? A . A 1 1388 SER 1388 ? ? ? A . A 1 1389 SER 1389 ? ? ? A . A 1 1390 ASP 1390 ? ? ? A . A 1 1391 PRO 1391 ? ? ? A . A 1 1392 LEU 1392 ? ? ? A . A 1 1393 ASP 1393 ? ? ? A . A 1 1394 SER 1394 ? ? ? A . A 1 1395 GLY 1395 ? ? ? A . A 1 1396 THR 1396 ? ? ? A . A 1 1397 ARG 1397 ? ? ? A . A 1 1398 SER 1398 ? ? ? A . A 1 1399 PRO 1399 ? ? ? A . A 1 1400 LYS 1400 ? ? ? A . A 1 1401 ARG 1401 ? ? ? A . A 1 1402 ASP 1402 ? ? ? A . A 1 1403 PRO 1403 ? ? ? A . A 1 1404 ILE 1404 ? ? ? A . A 1 1405 ASP 1405 ? ? ? A . A 1 1406 PRO 1406 ? ? ? A . A 1 1407 VAL 1407 ? ? ? A . A 1 1408 SER 1408 ? ? ? A . A 1 1409 ALA 1409 ? ? ? A . A 1 1410 GLY 1410 ? ? ? A . A 1 1411 ALA 1411 ? ? ? A . A 1 1412 SER 1412 ? ? ? A . A 1 1413 ALA 1413 ? ? ? A . A 1 1414 ALA 1414 ? ? ? A . A 1 1415 LYS 1415 ? ? ? A . A 1 1416 ALA 1416 ? ? ? A . A 1 1417 GLU 1417 ? ? ? A . A 1 1418 LEU 1418 ? ? ? A . A 1 1419 PRO 1419 ? ? ? A . A 1 1420 PRO 1420 ? ? ? A . A 1 1421 ASP 1421 ? ? ? A . A 1 1422 HIS 1422 ? ? ? A . A 1 1423 GLU 1423 ? ? ? A . A 1 1424 HIS 1424 ? ? ? A . A 1 1425 LYS 1425 ? ? ? A . A 1 1426 THR 1426 ? ? ? A . A 1 1427 LEU 1427 ? ? ? A . A 1 1428 GLY 1428 ? ? ? A . A 1 1429 HIS 1429 ? ? ? A . A 1 1430 TRP 1430 ? ? ? A . A 1 1431 VAL 1431 ? ? ? A . A 1 1432 THR 1432 ? ? ? A . A 1 1433 ILE 1433 ? ? ? A . A 1 1434 SER 1434 ? ? ? A . A 1 1435 ASP 1435 ? ? ? A . A 1 1436 GLN 1436 ? ? ? A . A 1 1437 GLU 1437 ? ? ? A . A 1 1438 LYS 1438 ? ? ? A . A 1 1439 ARG 1439 ? ? ? A . A 1 1440 THR 1440 ? ? ? A . A 1 1441 ALA 1441 ? ? ? A . A 1 1442 LEU 1442 ? ? ? A . A 1 1443 GLN 1443 ? ? ? A . A 1 1444 VAL 1444 ? ? ? A . A 1 1445 PHE 1445 ? ? ? A . A 1 1446 ASP 1446 ? ? ? A . A 1 1447 PRO 1447 ? ? ? A . A 1 1448 LEU 1448 ? ? ? A . A 1 1449 ALA 1449 ? ? ? A . A 1 1450 LYS 1450 ? ? ? A . A 1 1451 THR 1451 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Synaptojanin 2 {PDB ID=1ufw, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1ufw.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 1ufw, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHS ALSVLDVDGMKVKGRAVKISGPSSG ; ;GSSGSSGSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHS ALSVLDVDGMKVKGRAVKISGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 89 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1ufw 2023-12-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1451 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1451 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 3.66e-47 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTALAPPSKSPALTKKKQHPTYKTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQTVHFTIGPPETSVEAPPVVTAPRVPPVPKPRTFQPGKAAERPSHRKPASDEAPPGAGASVPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHPPAAGTVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQDPFWNLLHHPKLLNNTWLSKSSDPLDSGTRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDPLAKT 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1ufw.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 882 882 ? A -8.514 18.157 -17.130 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 2 C CA . SER 882 882 ? A -9.029 18.954 -15.949 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 3 C C . SER 882 882 ? A -9.966 18.104 -15.095 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 4 O O . SER 882 882 ? A -11.171 18.264 -15.163 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 5 C CB . SER 882 882 ? A -9.676 20.291 -16.455 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 6 O OG . SER 882 882 ? A -10.622 20.085 -17.490 1 1 A SER 0.230 1 ATOM 7 N N . SER 883 883 ? A -9.435 17.128 -14.293 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 8 C CA . SER 883 883 ? A -10.292 16.198 -13.540 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 9 C C . SER 883 883 ? A -10.589 16.768 -12.159 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 10 O O . SER 883 883 ? A -11.741 17.039 -11.822 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 11 C CB . SER 883 883 ? A -9.686 14.759 -13.418 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 12 O OG . SER 883 883 ? A -10.729 13.820 -13.161 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 13 N N . PHE 884 884 ? A -9.536 17.068 -11.367 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 14 C CA . PHE 884 884 ? A -9.600 17.784 -10.100 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 15 C C . PHE 884 884 ? A -10.413 17.124 -8.983 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 16 O O . PHE 884 884 ? A -11.433 17.627 -8.535 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 17 C CB . PHE 884 884 ? A -9.912 19.300 -10.289 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 18 C CG . PHE 884 884 ? A -8.892 20.143 -9.579 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 19 C CD1 . PHE 884 884 ? A -7.630 20.368 -10.157 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 20 C CD2 . PHE 884 884 ? A -9.196 20.748 -8.352 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 21 C CE1 . PHE 884 884 ? A -6.718 21.245 -9.557 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 22 C CE2 . PHE 884 884 ? A -8.288 21.628 -7.750 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 23 C CZ . PHE 884 884 ? A -7.053 21.888 -8.359 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 24 N N . GLN 885 885 ? A -9.993 15.943 -8.491 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 25 C CA . GLN 885 885 ? A -10.846 15.187 -7.611 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 26 C C . GLN 885 885 ? A -9.983 14.333 -6.728 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 27 O O . GLN 885 885 ? A -9.291 13.421 -7.164 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 28 C CB . GLN 885 885 ? A -11.895 14.325 -8.378 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 29 C CG . GLN 885 885 ? A -13.341 14.837 -8.138 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 30 C CD . GLN 885 885 ? A -14.425 13.830 -8.534 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 31 O OE1 . GLN 885 885 ? A -14.195 12.641 -8.729 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 32 N NE2 . GLN 885 885 ? A -15.690 14.313 -8.610 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 33 N N . GLY 886 886 ? A -9.980 14.617 -5.422 1 1 A GLY 0.750 1 ATOM 34 C CA . GLY 886 886 ? A -9.281 13.739 -4.528 1 1 A GLY 0.750 1 ATOM 35 C C . GLY 886 886 ? A -9.247 14.386 -3.190 1 1 A GLY 0.750 1 ATOM 36 O O . GLY 886 886 ? A -9.212 15.614 -3.133 1 1 A GLY 0.750 1 ATOM 37 N N . PRO 887 887 ? A -9.261 13.656 -2.092 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 38 C CA . PRO 887 887 ? A -9.055 14.263 -0.793 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 39 C C . PRO 887 887 ? A -7.640 14.828 -0.657 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 40 O O . PRO 887 887 ? A -6.703 14.219 -1.157 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 41 C CB . PRO 887 887 ? A -9.314 13.103 0.195 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 42 C CG . PRO 887 887 ? A -9.099 11.794 -0.592 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 43 C CD . PRO 887 887 ? A -9.084 12.204 -2.069 1 1 A PRO 0.770 1 ATOM 44 N N . LEU 888 888 ? A -7.480 15.975 0.043 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 45 C CA . LEU 888 888 ? A -6.212 16.604 0.396 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 46 C C . LEU 888 888 ? A -5.343 15.789 1.348 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 47 O O . LEU 888 888 ? A -4.134 16.008 1.416 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 48 C CB . LEU 888 888 ? A -6.492 18.003 1.036 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 49 C CG . LEU 888 888 ? A -7.350 18.024 2.338 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 50 C CD1 . LEU 888 888 ? A -6.539 17.860 3.642 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 51 C CD2 . LEU 888 888 ? A -8.153 19.335 2.435 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 52 N N . ASP 889 889 ? A -5.944 14.831 2.094 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 53 C CA . ASP 889 889 ? A -5.299 13.834 2.930 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 54 C C . ASP 889 889 ? A -4.384 12.957 2.095 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 55 O O . ASP 889 889 ? A -3.223 12.736 2.426 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 56 C CB . ASP 889 889 ? A -6.424 12.957 3.573 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 57 C CG . ASP 889 889 ? A -6.237 12.791 5.074 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 58 O OD1 . ASP 889 889 ? A -5.186 12.245 5.486 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 59 O OD2 . ASP 889 889 ? A -7.186 13.151 5.812 1 1 A ASP 0.810 1 ATOM 60 N N . ALA 890 890 ? A -4.894 12.490 0.943 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 61 C CA . ALA 890 890 ? A -4.240 11.592 0.025 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 62 C C . ALA 890 890 ? A -3.897 10.237 0.654 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 63 O O . ALA 890 890 ? A -2.843 9.665 0.410 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 64 C CB . ALA 890 890 ? A -3.048 12.288 -0.663 1 1 A ALA 0.890 1 ATOM 65 N N . THR 891 891 ? A -4.833 9.684 1.458 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 66 C CA . THR 891 891 ? A -4.640 8.520 2.332 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 67 C C . THR 891 891 ? A -5.423 7.355 1.785 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 68 O O . THR 891 891 ? A -6.584 7.482 1.424 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 69 C CB . THR 891 891 ? A -5.101 8.721 3.784 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 70 O OG1 . THR 891 891 ? A -4.422 9.823 4.354 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 71 C CG2 . THR 891 891 ? A -4.729 7.520 4.671 1 1 A THR 0.900 1 ATOM 72 N N . VAL 892 892 ? A -4.780 6.172 1.712 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 73 C CA . VAL 892 892 ? A -5.321 4.964 1.117 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 74 C C . VAL 892 892 ? A -4.945 3.789 1.994 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 75 O O . VAL 892 892 ? A -3.908 3.769 2.640 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 76 C CB . VAL 892 892 ? A -4.785 4.677 -0.285 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 77 C CG1 . VAL 892 892 ? A -5.292 5.753 -1.258 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 78 C CG2 . VAL 892 892 ? A -3.243 4.629 -0.298 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 79 N N . VAL 893 893 ? A -5.819 2.768 2.047 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 80 C CA . VAL 893 893 ? A -5.684 1.619 2.909 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 81 C C . VAL 893 893 ? A -5.129 0.477 2.094 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 82 O O . VAL 893 893 ? A -5.681 0.095 1.088 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 83 C CB . VAL 893 893 ? A -7.034 1.206 3.523 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 84 C CG1 . VAL 893 893 ? A -8.198 1.232 2.505 1 1 A VAL 0.930 1 ATOM 85 C CG2 . VAL 893 893 ? 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A -5.957 -5.315 4.886 1 1 A ASN 0.870 1 ATOM 100 N ND2 . ASN 895 895 ? A -6.824 -3.523 3.842 1 1 A ASN 0.870 1 ATOM 101 N N . LEU 896 896 ? A -3.230 -7.127 2.167 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 102 C CA . LEU 896 896 ? A -2.654 -8.209 1.413 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 103 C C . LEU 896 896 ? A -3.735 -9.215 1.074 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 104 O O . LEU 896 896 ? A -4.646 -9.467 1.851 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 105 C CB . LEU 896 896 ? A -1.525 -8.871 2.218 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 106 C CG . LEU 896 896 ? A -0.308 -7.956 2.481 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 107 C CD1 . LEU 896 896 ? A 0.864 -8.837 2.905 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 108 C CD2 . LEU 896 896 ? A 0.147 -7.102 1.284 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 109 N N . GLN 897 897 ? A -3.677 -9.783 -0.144 1 1 A GLN 0.830 1 ATOM 110 C CA . GLN 897 897 ? A -4.613 -10.784 -0.620 1 1 A GLN 0.830 1 ATOM 111 C C . GLN 897 897 ? A -4.432 -12.169 -0.028 1 1 A GLN 0.830 1 ATOM 112 O O . GLN 897 897 ? A -5.393 -12.828 0.365 1 1 A GLN 0.830 1 ATOM 113 C CB . GLN 897 897 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #