data_SMR-0b84fce4c7d89f72c03bab6c56100131_1 _entry.id SMR-0b84fce4c7d89f72c03bab6c56100131_1 _struct.entry_id SMR-0b84fce4c7d89f72c03bab6c56100131_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A8C8UYX0/ A0A8C8UYX0_HUMAN, DNA-binding protein RFX7 - Q2KHR2/ RFX7_HUMAN, DNA-binding protein RFX7 Estimated model accuracy of this model is 0.029, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A8C8UYX0, Q2KHR2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183791.894 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RFX7_HUMAN Q2KHR2 1 ;MAEEQQQPPPQQPDAHQQLPPSAPNSGVALPALVPGLPGTEASALQHKIKNSICKTVQSKVDCILQEVEK FTDLEKLYLYLQLPSGLSNGEKSDQNAMSSSRAQQMHAFSWIRNTLEEHPETSLPKQEVYDEYKSYCDNL GYHPLSAADFGKIMKNVFPNMKARRLGTRGKSKYCYSGLRKKAFVHMPTLPNLDFHKTGDGLEGAEPSGQ LQNIDEEVISSACRLVCEWAQKVLSQPFDTVLELARFLVKSHYIGTKSMAALTVMAAAPAGMKGITQPSA FIPTAESNSFQPQVKTLPSPIDAKQQLQRKIQKKQQEQKLQSPLPGESAAKKSESATSNGVTNLPNGNPS ILSPQPIGIVVAAVPSPIPVQRTRQLVTSPSPMSSSDGKVLPLNVQVVTQHMQSVKQAPKTPQNVPASPG GDRSARHRYPQILPKPANTSALTIRSPTTVLFTSSPIKTAVVPASHMSSLNVVKMTTISLTPSNSNTPLK HSASVSSATGTTEESRSVPQIKNGSVVSLQSPGSRSSSAGGTSAVEVKVEPETSSDEHPVQCQENSDEAK APQTPSALLGQKSNTDGALQKPSNEGVIEIKATKVCDQRTKCKSRCNEMLPGTSTGNNQSTITLSVASQN LTFTSSSSPPNGDSINKDPKLCTKSPRKRLSSTLQETQVPPVKKPIVEQLSAATIEGQKQGSVKKDQKVP HSGKTEGSTAGAQIPSKVSVNVSSHIGANQPLNSSALVISDSALEQQTTPSSSPDIKVKLEGSVFLLDSD SKSVGSFNPNGWQQITKDSEFISASCEQQQDISVMTIPEHSDINDLEKSVWELEGMPQDTYSQQLHSQIQ ESSLNQIQAHSSDQLPLQSELKEFEPSVSQTNESYFPFDDELTQDSIVEELVLMEQQMSMNNSHSYGNCL GMTLQSQSVTPGAPMSSHTSSTHFYHPIHSNGTPIHTPTPTPTPTPTPTPTPTPTSEMIAGSQSLSRESP CSRLAQTTPVDSALGSSRHTPIGTPHSNCSSSVPPSPVECRNPFAFTPISSSMAYHDASIVSSSPVKPMQ RPMATHPDKTKLEWMNNGYSGVGNSSVSGHGILPSYQELVEDRFRKPHAFAVPGQSYQSQSRHHDTHFGR LTPVSPVQHQGATVNNTNKQEGFAVPAPLDNKGTNSSASSNFRCRSVSPAVHRQRNLSGSTLYPVSNIPR SNVTPFGSPVTPEVHVFTNVHTDACANNIAQRSQSVPLTVMMQTAFPNALQKQANSKKITNVLLSKLDSD NDDAVRGLGMNNLPSNYTARMNLTQILEPSTVFPSANPQNMIDSSTSVYEFQTPSYLTKSNSTGQINFSP GDNQAQSEIGEQQLDFNSTVKDLLSGDSLQTNQQLVGQGASDLTNTASDFSSDIRLSSELSGSINDLNTL DPNLLFDPGRQQGQDDEATLEELKNDPLFQQICSESMNSMTSSGFEWIESKDHPTVEMLG ; 'DNA-binding protein RFX7' 2 1 UNP A0A8C8UYX0_HUMAN A0A8C8UYX0 1 ;MAEEQQQPPPQQPDAHQQLPPSAPNSGVALPALVPGLPGTEASALQHKIKNSICKTVQSKVDCILQEVEK FTDLEKLYLYLQLPSGLSNGEKSDQNAMSSSRAQQMHAFSWIRNTLEEHPETSLPKQEVYDEYKSYCDNL GYHPLSAADFGKIMKNVFPNMKARRLGTRGKSKYCYSGLRKKAFVHMPTLPNLDFHKTGDGLEGAEPSGQ LQNIDEEVISSACRLVCEWAQKVLSQPFDTVLELARFLVKSHYIGTKSMAALTVMAAAPAGMKGITQPSA FIPTAESNSFQPQVKTLPSPIDAKQQLQRKIQKKQQEQKLQSPLPGESAAKKSESATSNGVTNLPNGNPS ILSPQPIGIVVAAVPSPIPVQRTRQLVTSPSPMSSSDGKVLPLNVQVVTQHMQSVKQAPKTPQNVPASPG GDRSARHRYPQILPKPANTSALTIRSPTTVLFTSSPIKTAVVPASHMSSLNVVKMTTISLTPSNSNTPLK HSASVSSATGTTEESRSVPQIKNGSVVSLQSPGSRSSSAGGTSAVEVKVEPETSSDEHPVQCQENSDEAK APQTPSALLGQKSNTDGALQKPSNEGVIEIKATKVCDQRTKCKSRCNEMLPGTSTGNNQSTITLSVASQN LTFTSSSSPPNGDSINKDPKLCTKSPRKRLSSTLQETQVPPVKKPIVEQLSAATIEGQKQGSVKKDQKVP HSGKTEGSTAGAQIPSKVSVNVSSHIGANQPLNSSALVISDSALEQQTTPSSSPDIKVKLEGSVFLLDSD SKSVGSFNPNGWQQITKDSEFISASCEQQQDISVMTIPEHSDINDLEKSVWELEGMPQDTYSQQLHSQIQ ESSLNQIQAHSSDQLPLQSELKEFEPSVSQTNESYFPFDDELTQDSIVEELVLMEQQMSMNNSHSYGNCL GMTLQSQSVTPGAPMSSHTSSTHFYHPIHSNGTPIHTPTPTPTPTPTPTPTPTPTSEMIAGSQSLSRESP CSRLAQTTPVDSALGSSRHTPIGTPHSNCSSSVPPSPVECRNPFAFTPISSSMAYHDASIVSSSPVKPMQ RPMATHPDKTKLEWMNNGYSGVGNSSVSGHGILPSYQELVEDRFRKPHAFAVPGQSYQSQSRHHDTHFGR LTPVSPVQHQGATVNNTNKQEGFAVPAPLDNKGTNSSASSNFRCRSVSPAVHRQRNLSGSTLYPVSNIPR SNVTPFGSPVTPEVHVFTNVHTDACANNIAQRSQSVPLTVMMQTAFPNALQKQANSKKITNVLLSKLDSD NDDAVRGLGMNNLPSNYTARMNLTQILEPSTVFPSANPQNMIDSSTSVYEFQTPSYLTKSNSTGQINFSP GDNQAQSEIGEQQLDFNSTVKDLLSGDSLQTNQQLVGQGASDLTNTASDFSSDIRLSSELSGSINDLNTL DPNLLFDPGRQQGQDDEATLEELKNDPLFQQICSESMNSMTSSGFEWIESKDHPTVEMLG ; 'DNA-binding protein RFX7' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1460 1 1460 2 2 1 1460 1 1460 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RFX7_HUMAN Q2KHR2 . 1 1460 9606 'Homo sapiens (Human)' 2024-01-24 5C6656F47D4D33A8 1 UNP . A0A8C8UYX0_HUMAN A0A8C8UYX0 . 1 1460 9606 'Homo sapiens (Human)' 2022-01-19 5C6656F47D4D33A8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MAEEQQQPPPQQPDAHQQLPPSAPNSGVALPALVPGLPGTEASALQHKIKNSICKTVQSKVDCILQEVEK FTDLEKLYLYLQLPSGLSNGEKSDQNAMSSSRAQQMHAFSWIRNTLEEHPETSLPKQEVYDEYKSYCDNL GYHPLSAADFGKIMKNVFPNMKARRLGTRGKSKYCYSGLRKKAFVHMPTLPNLDFHKTGDGLEGAEPSGQ LQNIDEEVISSACRLVCEWAQKVLSQPFDTVLELARFLVKSHYIGTKSMAALTVMAAAPAGMKGITQPSA FIPTAESNSFQPQVKTLPSPIDAKQQLQRKIQKKQQEQKLQSPLPGESAAKKSESATSNGVTNLPNGNPS ILSPQPIGIVVAAVPSPIPVQRTRQLVTSPSPMSSSDGKVLPLNVQVVTQHMQSVKQAPKTPQNVPASPG GDRSARHRYPQILPKPANTSALTIRSPTTVLFTSSPIKTAVVPASHMSSLNVVKMTTISLTPSNSNTPLK HSASVSSATGTTEESRSVPQIKNGSVVSLQSPGSRSSSAGGTSAVEVKVEPETSSDEHPVQCQENSDEAK APQTPSALLGQKSNTDGALQKPSNEGVIEIKATKVCDQRTKCKSRCNEMLPGTSTGNNQSTITLSVASQN 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MHC CLASS II TRANSCRIPTION FACTOR HRFX1 {PDB ID=1dp7, label_asym_id=B, auth_asym_id=P, SMTL ID=1dp7.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1dp7, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 P # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;TVQWLLDNYETAEGVSLPRSTLYNHYLLHSQEQKLEPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRGNSKYHYY GLRIKA ; ;TVQWLLDNYETAEGVSLPRSTLYNHYLLHSQEQKLEPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRGNSKYHYY GLRIKA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 75 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1dp7 2024-02-07 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1460 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1460 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.8e-13 40.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAEEQQQPPPQQPDAHQQLPPSAPNSGVALPALVPGLPGTEASALQHKIKNSICKTVQSKVDCILQEVEKFTDLEKLYLYLQLPSGLSNGEKSDQNAMSSSRAQQMHAFSWIRNTLEEHPETSLPKQEVYDEYKSYCDNLGYHPLSAADFGKIMKNVFPNMKARRLGTRGKSKYCYSGLRKKAFVHMPTLPNLDFHKTGDGLEGAEPSGQLQNIDEEVISSACRLVCEWAQKVLSQPFDTVLELARFLVKSHYIGTKSMAALTVMAAAPAGMKGITQPSAFIPTAESNSFQPQVKTLPSPIDAKQQLQRKIQKKQQEQKLQSPLPGESAAKKSESATSNGVTNLPNGNPSILSPQPIGIVVAAVPSPIPVQRTRQLVTSPSPMSSSDGKVLPLNVQVVTQHMQSVKQAPKTPQNVPASPGGDRSARHRYPQILPKPANTSALTIRSPTTVLFTSSPIKTAVVPASHMSSLNVVKMTTISLTPSNSNTPLKHSASVSSATGTTEESRSVPQIKNGSVVSLQSPGSRSSSAGGTSAVEVKVEPETSSDEHPVQCQENSDEAKAPQTPSALLGQKSNTDGALQKPSNEGVIEIKATKVCDQRTKCKSRCNEMLPGTSTGNNQSTITLSVASQNLTFTSSSSPPNGDSINKDPKLCTKSPRKRLSSTLQETQVPPVKKPIVEQLSAATIEGQKQGSVKKDQKVPHSGKTEGSTAGAQIPSKVSVNVSSHIGANQPLNSSALVISDSALEQQTTPSSSPDIKVKLEGSVFLLDSDSKSVGSFNPNGWQQITKDSEFISASCEQQQDISVMTIPEHSDINDLEKSVWELEGMPQDTYSQQLHSQIQESSLNQIQAHSSDQLPLQSELKEFEPSVSQTNESYFPFDDELTQDSIVEELVLMEQQMSMNNSHSYGNCLGMTLQSQSVTPGAPMSSHTSSTHFYHPIHSNGTPIHTPTPTPTPTPTPTPTPTPTSEMIAGSQSLSRESPCSRLAQTTPVDSALGSSRHTPIGTPHSNCSSSVPPSPVECRNPFAFTPISSSMAYHDASIVSSSPVKPMQRPMATHPDKTKLEWMNNGYSGVGNSSVSGHGILPSYQELVEDRFRKPHAFAVPGQSYQSQSRHHDTHFGRLTPVSPVQHQGATVNNTNKQEGFAVPAPLDNKGTNSSASSNFRCRSVSPAVHRQRNLSGSTLYPVSNIPRSNVTPFGSPVTPEVHVFTNVHTDACANNIAQRSQSVPLTVMMQTAFPNALQKQANSKKITNVLLSKLDSDNDDAVRGLGMNNLPSNYTARMNLTQILEPSTVFPSANPQNMIDSSTSVYEFQTPSYLTKSNSTGQINFSPGDNQAQSEIGEQQLDFNSTVKDLLSGDSLQTNQQLVGQGASDLTNTASDFSSDIRLSSELSGSINDLNTLDPNLLFDPGRQQGQDDEATLEELKNDPLFQQICSESMNSMTSSGFEWIESKDHPTVEMLG 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------TVQWLLDNYETAEGVSLPRSTLYNHYLLHSQEQKLEPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRGNSKYHYYGLRIK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1dp7.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 108 108 ? A 37.110 22.048 31.686 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 2 C CA . ALA 108 108 ? A 36.394 21.744 32.975 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 3 C C . ALA 108 108 ? A 35.875 22.940 33.781 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 4 O O . ALA 108 108 ? A 35.236 22.743 34.804 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 5 C CB . ALA 108 108 ? A 37.323 20.856 33.841 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 6 N N . PHE 109 109 ? A 36.077 24.209 33.346 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 7 C CA . PHE 109 109 ? A 35.685 25.392 34.099 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 8 C C . PHE 109 109 ? A 34.192 25.525 34.351 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 9 O O . PHE 109 109 ? A 33.757 25.875 35.444 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 10 C CB . PHE 109 109 ? A 36.132 26.651 33.310 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 11 C CG . PHE 109 109 ? A 37.611 26.953 33.346 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 12 C CD1 . PHE 109 109 ? A 38.610 26.061 33.788 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 13 C CD2 . PHE 109 109 ? A 38.008 28.235 32.928 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 14 C CE1 . PHE 109 109 ? A 39.960 26.430 33.761 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 15 C CE2 . PHE 109 109 ? A 39.350 28.625 32.959 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 16 C CZ . PHE 109 109 ? A 40.328 27.717 33.367 1 1 B PHE 0.400 1 ATOM 17 N N . SER 110 110 ? A 33.361 25.240 33.331 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 18 C CA . SER 110 110 ? A 31.917 25.197 33.464 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 19 C C . SER 110 110 ? A 31.425 24.056 34.331 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 20 O O . SER 110 110 ? A 30.516 24.262 35.120 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 21 C CB . SER 110 110 ? A 31.183 25.176 32.102 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 22 O OG . SER 110 110 ? A 31.581 24.065 31.298 1 1 B SER 0.630 1 ATOM 23 N N . TRP 111 111 ? A 32.051 22.851 34.253 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 24 C CA . TRP 111 111 ? A 31.775 21.728 35.148 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 25 C C . TRP 111 111 ? A 31.998 22.114 36.586 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 26 O O . TRP 111 111 ? A 31.104 21.918 37.410 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 27 C CB . TRP 111 111 ? A 32.652 20.474 34.824 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 28 C CG . TRP 111 111 ? A 32.467 19.293 35.795 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 29 C CD1 . TRP 111 111 ? A 31.430 18.407 35.864 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 30 C CD2 . TRP 111 111 ? A 33.319 19.004 36.922 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 31 N NE1 . TRP 111 111 ? A 31.587 17.572 36.951 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 32 C CE2 . TRP 111 111 ? A 32.735 17.921 37.621 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 33 C CE3 . TRP 111 111 ? A 34.492 19.588 37.380 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 34 C CZ2 . TRP 111 111 ? A 33.331 17.414 38.770 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 35 C CZ3 . TRP 111 111 ? A 35.071 19.105 38.561 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 36 C CH2 . TRP 111 111 ? A 34.496 18.030 39.251 1 1 B TRP 0.640 1 ATOM 37 N N . ILE 112 112 ? A 33.136 22.752 36.898 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 38 C CA . ILE 112 112 ? A 33.468 23.238 38.214 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 39 C C . ILE 112 112 ? A 32.444 24.258 38.721 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 40 O O . ILE 112 112 ? A 31.939 24.168 39.832 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 41 C CB . ILE 112 112 ? A 34.854 23.882 38.158 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 42 C CG1 . ILE 112 112 ? A 36.012 22.872 38.000 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 43 C CG2 . ILE 112 112 ? A 35.078 24.626 39.469 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 44 C CD1 . ILE 112 112 ? A 37.378 23.559 37.838 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 45 N N . ARG 113 113 ? A 32.073 25.249 37.882 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 46 C CA . ARG 113 113 ? A 31.070 26.235 38.246 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 47 C C . ARG 113 113 ? A 29.671 25.674 38.375 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 48 O O . ARG 113 113 ? A 28.840 26.242 39.095 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 49 C CB . ARG 113 113 ? A 30.998 27.380 37.212 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 50 C CG . ARG 113 113 ? A 32.229 28.305 37.249 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 51 C CD . ARG 113 113 ? A 32.047 29.614 36.472 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 52 N NE . ARG 113 113 ? A 31.859 29.262 35.021 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 53 C CZ . ARG 113 113 ? A 32.861 29.129 34.141 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 54 N NH1 . ARG 113 113 ? A 34.117 29.357 34.502 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 55 N NH2 . ARG 113 113 ? A 32.596 28.807 32.876 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 56 N N . ASN 114 114 ? A 29.322 24.585 37.692 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 57 C CA . ASN 114 114 ? A 28.051 23.918 37.855 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 58 C C . ASN 114 114 ? A 27.957 23.092 39.132 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 59 O O . ASN 114 114 ? A 26.859 22.850 39.611 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 60 C CB . ASN 114 114 ? A 27.793 22.961 36.673 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 61 C CG . ASN 114 114 ? A 27.522 23.760 35.412 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 62 O OD1 . ASN 114 114 ? A 27.134 24.939 35.440 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 63 N ND2 . ASN 114 114 ? A 27.697 23.110 34.245 1 1 B ASN 0.620 1 ATOM 64 N N . THR 115 115 ? A 29.098 22.640 39.702 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 65 C CA . THR 115 115 ? A 29.112 21.684 40.808 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 66 C C . THR 115 115 ? A 29.591 22.281 42.118 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 67 O O . THR 115 115 ? A 29.331 21.728 43.184 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 68 C CB . THR 115 115 ? A 30.010 20.486 40.508 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 69 O OG1 . THR 115 115 ? A 31.345 20.870 40.207 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 70 C CG2 . THR 115 115 ? A 29.460 19.778 39.262 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 71 N N . LEU 116 116 ? A 30.283 23.439 42.082 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 72 C CA . LEU 116 116 ? A 30.875 24.050 43.254 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 73 C C . LEU 116 116 ? A 30.737 25.564 43.199 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 74 O O . LEU 116 116 ? A 30.575 26.185 42.157 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 75 C CB . LEU 116 116 ? A 32.394 23.709 43.377 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 76 C CG . LEU 116 116 ? A 32.735 22.209 43.534 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 77 C CD1 . LEU 116 116 ? A 34.232 21.916 43.386 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 78 C CD2 . LEU 116 116 ? A 32.265 21.686 44.889 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 79 N N . GLU 117 117 ? A 30.813 26.196 44.386 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 80 C CA . GLU 117 117 ? A 30.766 27.636 44.487 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 81 C C . GLU 117 117 ? A 31.521 28.095 45.706 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 82 O O . GLU 117 117 ? A 31.634 27.375 46.692 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 83 C CB . GLU 117 117 ? A 29.314 28.141 44.590 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 84 C CG . GLU 117 117 ? A 28.517 27.588 45.796 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 85 C CD . GLU 117 117 ? A 27.050 27.971 45.706 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 86 O OE1 . GLU 117 117 ? A 26.359 27.747 46.725 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 87 O OE2 . GLU 117 117 ? A 26.605 28.506 44.661 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 88 N N . GLU 118 118 ? A 32.087 29.331 45.636 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 89 C CA . GLU 118 118 ? A 32.699 29.981 46.782 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 90 C C . GLU 118 118 ? A 31.672 30.211 47.873 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 91 O O . GLU 118 118 ? A 30.514 30.518 47.608 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 92 C CB . GLU 118 118 ? A 33.404 31.318 46.419 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 93 C CG . GLU 118 118 ? A 34.262 31.937 47.564 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 94 C CD . GLU 118 118 ? A 34.966 33.244 47.188 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 95 O OE1 . GLU 118 118 ? A 34.821 33.690 46.021 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 96 O OE2 . GLU 118 118 ? A 35.625 33.821 48.099 1 1 B GLU 0.640 1 ATOM 97 N N . HIS 119 119 ? A 32.053 30.009 49.140 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 98 C CA . HIS 119 119 ? A 31.085 30.123 50.209 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 99 C C . HIS 119 119 ? A 31.800 30.517 51.483 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 100 O O . HIS 119 119 ? A 32.878 30.012 51.737 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 101 C CB . HIS 119 119 ? A 30.280 28.809 50.416 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 102 C CG . HIS 119 119 ? A 29.305 28.802 51.569 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 103 N ND1 . HIS 119 119 ? A 28.268 29.704 51.660 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 104 C CD2 . HIS 119 119 ? A 29.349 28.041 52.694 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 105 C CE1 . HIS 119 119 ? A 27.720 29.494 52.848 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 106 N NE2 . HIS 119 119 ? A 28.335 28.490 53.504 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 107 N N . PRO 120 120 ? A 31.265 31.371 52.339 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 108 C CA . PRO 120 120 ? A 31.842 31.582 53.662 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 109 C C . PRO 120 120 ? A 31.755 30.381 54.622 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 110 O O . PRO 120 120 ? A 30.750 29.677 54.619 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 111 C CB . PRO 120 120 ? A 31.055 32.766 54.239 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 112 C CG . PRO 120 120 ? A 30.415 33.479 53.037 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 113 C CD . PRO 120 120 ? A 30.249 32.382 51.993 1 1 B PRO 0.580 1 ATOM 114 N N . GLU 121 121 ? A 32.817 30.138 55.427 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 115 C CA . GLU 121 121 ? A 32.833 29.378 56.687 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 116 C C . GLU 121 121 ? A 32.869 27.860 56.553 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 117 O O . GLU 121 121 ? A 32.840 27.116 57.535 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 118 C CB . GLU 121 121 ? A 31.762 29.831 57.708 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 119 C CG . GLU 121 121 ? A 31.844 31.332 58.081 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 120 C CD . GLU 121 121 ? A 30.747 31.753 59.057 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 121 O OE1 . GLU 121 121 ? A 29.780 30.976 59.257 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 122 O OE2 . GLU 121 121 ? A 30.877 32.882 59.597 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 123 N N . THR 122 122 ? A 33.048 27.357 55.324 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 124 C CA . THR 122 122 ? A 32.917 25.936 55.038 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 125 C C . THR 122 122 ? A 34.065 25.553 54.151 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 126 O O . THR 122 122 ? A 34.619 26.363 53.412 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 127 C CB . THR 122 122 ? A 31.611 25.590 54.330 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 128 O OG1 . THR 122 122 ? A 30.519 26.010 55.131 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 129 C CG2 . THR 122 122 ? A 31.371 24.090 54.102 1 1 B THR 0.630 1 ATOM 130 N N . SER 123 123 ? A 34.475 24.280 54.228 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 131 C CA . SER 123 123 ? A 35.589 23.766 53.477 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 132 C C . SER 123 123 ? A 35.227 22.432 52.878 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 133 O O . SER 123 123 ? A 34.237 21.803 53.251 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 134 C CB . SER 123 123 ? A 36.876 23.657 54.351 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 135 O OG . SER 123 123 ? A 36.786 22.686 55.398 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 136 N N . LEU 124 124 ? A 36.025 21.987 51.897 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 137 C CA . LEU 124 124 ? A 35.924 20.671 51.313 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 138 C C . LEU 124 124 ? A 37.302 20.043 51.389 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 139 O O . LEU 124 124 ? A 38.264 20.759 51.098 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 140 C CB . LEU 124 124 ? A 35.517 20.756 49.827 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 141 C CG . LEU 124 124 ? A 34.019 21.032 49.614 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 142 C CD1 . LEU 124 124 ? A 33.786 21.371 48.136 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 143 C CD2 . LEU 124 124 ? A 33.157 19.821 50.032 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 144 N N . PRO 125 125 ? A 37.506 18.772 51.753 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 145 C CA . PRO 125 125 ? A 38.747 18.053 51.478 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 146 C C . PRO 125 125 ? A 39.196 18.122 50.034 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 147 O O . PRO 125 125 ? A 38.391 17.883 49.133 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 148 C CB . PRO 125 125 ? A 38.474 16.594 51.903 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 149 C CG . PRO 125 125 ? A 37.235 16.682 52.798 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 150 C CD . PRO 125 125 ? A 36.460 17.850 52.191 1 1 B PRO 0.670 1 ATOM 151 N N . LYS 126 126 ? A 40.483 18.400 49.762 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 152 C CA . LYS 126 126 ? A 40.979 18.445 48.397 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 153 C C . LYS 126 126 ? A 40.829 17.123 47.655 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 154 O O . LYS 126 126 ? A 40.533 17.111 46.454 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 155 C CB . LYS 126 126 ? A 42.462 18.882 48.359 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 156 C CG . LYS 126 126 ? A 43.107 18.690 46.972 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 157 C CD . LYS 126 126 ? A 44.536 19.227 46.877 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 158 C CE . LYS 126 126 ? A 45.237 18.867 45.559 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 159 N NZ . LYS 126 126 ? A 44.539 19.500 44.419 1 1 B LYS 0.670 1 ATOM 160 N N . GLN 127 127 ? A 41.048 15.987 48.352 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 161 C CA . GLN 127 127 ? A 41.003 14.666 47.757 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 162 C C . GLN 127 127 ? A 39.653 14.339 47.162 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 163 O O . GLN 127 127 ? A 39.591 14.028 45.980 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 164 C CB . GLN 127 127 ? A 41.397 13.549 48.758 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 165 C CG . GLN 127 127 ? A 41.685 12.197 48.053 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 166 C CD . GLN 127 127 ? A 42.892 12.324 47.126 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 167 O OE1 . GLN 127 127 ? A 43.948 12.801 47.566 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 168 N NE2 . GLN 127 127 ? A 42.761 11.927 45.842 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 169 N N . GLU 128 128 ? A 38.537 14.515 47.912 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 170 C CA . GLU 128 128 ? A 37.208 14.182 47.427 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 171 C C . GLU 128 128 ? A 36.835 15.011 46.221 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 172 O O . GLU 128 128 ? A 36.350 14.491 45.222 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 173 C CB . GLU 128 128 ? A 36.136 14.267 48.540 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 174 C CG . GLU 128 128 ? A 36.335 13.144 49.588 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 175 C CD . GLU 128 128 ? A 35.330 13.177 50.737 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 176 O OE1 . GLU 128 128 ? A 34.564 14.166 50.850 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 177 O OE2 . GLU 128 128 ? A 35.368 12.212 51.543 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 178 N N . VAL 129 129 ? A 37.170 16.311 46.232 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 179 C CA . VAL 129 129 ? A 36.982 17.187 45.091 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 180 C C . VAL 129 129 ? A 37.753 16.760 43.834 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 181 O O . VAL 129 129 ? A 37.235 16.760 42.710 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 182 C CB . VAL 129 129 ? A 37.453 18.578 45.485 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 183 C CG1 . VAL 129 129 ? 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A 38.867 13.591 43.316 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 198 C CA . ASP 131 131 ? A 38.234 12.318 43.024 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 199 C C . ASP 131 131 ? A 36.941 12.503 42.212 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 200 O O . ASP 131 131 ? A 36.705 11.795 41.229 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 201 C CB . ASP 131 131 ? A 37.984 11.540 44.352 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 202 C CG . ASP 131 131 ? A 39.276 11.067 45.014 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 203 O OD1 . ASP 131 131 ? A 40.373 11.165 44.402 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 204 O OD2 . ASP 131 131 ? A 39.178 10.580 46.169 1 1 B ASP 0.740 1 ATOM 205 N N . GLU 132 132 ? A 36.100 13.514 42.544 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 206 C CA . GLU 132 132 ? A 34.934 13.907 41.756 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 207 C C . GLU 132 132 ? A 35.272 14.360 40.336 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 208 O O . GLU 132 132 ? A 34.619 13.963 39.368 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 209 C CB . GLU 132 132 ? A 34.134 15.050 42.434 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 210 C CG . GLU 132 132 ? A 33.420 14.644 43.747 1 1 B GLU 0.740 1 ATOM 211 C CD . GLU 132 132 ? 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A 39.278 35.287 49.125 1 1 B ASN 0.540 1 ATOM 436 O OD1 . ASN 160 160 ? A 40.346 35.790 49.481 1 1 B ASN 0.540 1 ATOM 437 N ND2 . ASN 160 160 ? A 38.189 35.298 49.924 1 1 B ASN 0.540 1 ATOM 438 N N . MET 161 161 ? A 40.338 31.194 47.539 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 439 C CA . MET 161 161 ? A 40.393 29.958 48.301 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 440 C C . MET 161 161 ? A 41.584 29.886 49.239 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 441 O O . MET 161 161 ? A 42.721 30.172 48.875 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 442 C CB . MET 161 161 ? A 40.404 28.693 47.427 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 443 C CG . MET 161 161 ? A 39.104 28.489 46.634 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 444 S SD . MET 161 161 ? A 39.059 26.884 45.782 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 445 C CE . MET 161 161 ? A 40.383 27.343 44.635 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 446 N N . LYS 162 162 ? A 41.328 29.462 50.487 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 447 C CA . LYS 162 162 ? A 42.354 29.388 51.497 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 448 C C . LYS 162 162 ? A 42.693 27.942 51.754 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 449 O O . LYS 162 162 ? A 41.921 27.031 51.463 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 450 C CB . LYS 162 162 ? A 41.915 30.083 52.806 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 451 C CG . LYS 162 162 ? A 41.699 31.588 52.610 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 452 C CD . LYS 162 162 ? A 41.264 32.282 53.905 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 453 C CE . LYS 162 162 ? A 41.046 33.784 53.708 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 454 N NZ . LYS 162 162 ? A 40.625 34.402 54.983 1 1 B LYS 0.540 1 ATOM 455 N N . ALA 163 163 ? A 43.884 27.698 52.317 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 456 C CA . ALA 163 163 ? A 44.356 26.375 52.625 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 457 C C . ALA 163 163 ? A 44.158 26.114 54.106 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 458 O O . ALA 163 163 ? A 44.516 26.917 54.957 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 459 C CB . ALA 163 163 ? A 45.854 26.262 52.267 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 460 N N . ARG 164 164 ? A 43.566 24.956 54.446 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 461 C CA . ARG 164 164 ? A 43.585 24.489 55.814 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 462 C C . ARG 164 164 ? A 43.961 23.044 55.795 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 463 O O . ARG 164 164 ? A 43.860 22.374 54.772 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 464 C CB . ARG 164 164 ? A 42.225 24.606 56.553 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 465 C CG . ARG 164 164 ? A 41.663 26.038 56.593 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 466 C CD . ARG 164 164 ? A 40.438 26.178 57.502 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 467 N NE . ARG 164 164 ? A 40.978 26.185 58.901 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 468 C CZ . ARG 164 164 ? A 40.240 26.068 60.012 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 469 N NH1 . ARG 164 164 ? A 38.928 25.869 59.950 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 470 N NH2 . ARG 164 164 ? A 40.819 26.146 61.209 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 471 N N . ARG 165 165 ? A 44.415 22.533 56.947 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 472 C CA . ARG 165 165 ? A 44.655 21.125 57.107 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 473 C C . ARG 165 165 ? A 43.885 20.710 58.324 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 474 O O . ARG 165 165 ? A 44.165 21.163 59.429 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 475 C CB . ARG 165 165 ? A 46.156 20.817 57.285 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 476 C CG . ARG 165 165 ? A 46.975 21.192 56.038 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 477 C CD . ARG 165 165 ? A 48.466 21.344 56.302 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 478 N NE . ARG 165 165 ? A 49.032 19.973 56.481 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 479 C CZ . ARG 165 165 ? A 50.316 19.772 56.796 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 480 N NH1 . ARG 165 165 ? A 51.108 20.797 57.093 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 481 N NH2 . ARG 165 165 ? A 50.829 18.547 56.817 1 1 B ARG 0.420 1 ATOM 482 N N . LEU 166 166 ? A 42.862 19.870 58.132 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 483 C CA . LEU 166 166 ? A 41.924 19.553 59.173 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 484 C C . LEU 166 166 ? A 42.024 18.090 59.490 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 485 O O . LEU 166 166 ? A 42.302 17.263 58.613 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 486 C CB . LEU 166 166 ? A 40.478 19.889 58.743 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 487 C CG . LEU 166 166 ? A 40.234 21.371 58.375 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 488 C CD1 . LEU 166 166 ? A 38.768 21.565 57.948 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 489 C CD2 . LEU 166 166 ? A 40.591 22.326 59.530 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 490 N N . GLY 167 167 ? A 41.833 17.737 60.764 1 1 B GLY 0.560 1 ATOM 491 C CA . GLY 167 167 ? 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A 47.746 14.800 66.449 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 506 C CG . ARG 169 169 ? A 47.728 16.182 67.113 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 507 C CD . ARG 169 169 ? A 48.798 16.201 68.197 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 508 N NE . ARG 169 169 ? A 48.924 17.590 68.731 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 509 C CZ . ARG 169 169 ? A 49.812 17.912 69.682 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 510 N NH1 . ARG 169 169 ? A 50.604 16.979 70.208 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 511 N NH2 . ARG 169 169 ? A 49.918 19.163 70.112 1 1 B ARG 0.250 1 ATOM 512 N N . GLY 170 170 ? A 48.370 13.627 63.417 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 513 C CA . GLY 170 170 ? A 48.829 12.556 62.544 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 514 C C . GLY 170 170 ? A 47.865 12.227 61.425 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 515 O O . GLY 170 170 ? A 48.152 11.361 60.605 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 516 N N . LYS 171 171 ? A 46.702 12.910 61.349 1 1 B LYS 0.490 1 ATOM 517 C CA . LYS 171 171 ? A 45.648 12.622 60.394 1 1 B LYS 0.490 1 ATOM 518 C C . LYS 171 171 ? A 45.178 13.870 59.680 1 1 B LYS 0.490 1 ATOM 519 O O . LYS 171 171 ? 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A 24.113 23.415 44.594 1 1 B LYS 0.500 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #