data_SMR-d67b24fbb0917e52ecb9252bf258240d_2 _entry.id SMR-d67b24fbb0917e52ecb9252bf258240d_2 _struct.entry_id SMR-d67b24fbb0917e52ecb9252bf258240d_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P49790/ NU153_HUMAN, Nuclear pore complex protein Nup153 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P49790' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 180642.961 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NU153_HUMAN P49790 1 ;MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCST DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFS SPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELS GSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPT ATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETP NKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETM TASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSG GSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSS SSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDN FKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNL GTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGK KADNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVF SFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKL ATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGSSFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQS QGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSSQPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSS TTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFNQSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTA VRRRK ; 'Nuclear pore complex protein Nup153' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1475 1 1475 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NU153_HUMAN P49790 . 1 1475 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-09-23 D07455A691F7CD1F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCST DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFS SPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELS GSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPT 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DTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSM LESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSP EAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRN TPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDF QAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFS SPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELS GSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPT ATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETP NKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETM TASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSG GSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSS SSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDN FKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNL 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TYR . 1 30 GLN . 1 31 GLN . 1 32 GLY . 1 33 ARG . 1 34 GLN . 1 35 GLN . 1 36 HIS . 1 37 GLN . 1 38 GLY . 1 39 ILE . 1 40 LEU . 1 41 SER . 1 42 ARG . 1 43 VAL . 1 44 THR . 1 45 GLU . 1 46 SER . 1 47 VAL . 1 48 LYS . 1 49 ASN . 1 50 ILE . 1 51 VAL . 1 52 PRO . 1 53 GLY . 1 54 TRP . 1 55 LEU . 1 56 GLN . 1 57 ARG . 1 58 TYR . 1 59 PHE . 1 60 ASN . 1 61 LYS . 1 62 ASN . 1 63 GLU . 1 64 ASP . 1 65 VAL . 1 66 CYS . 1 67 SER . 1 68 CYS . 1 69 SER . 1 70 THR . 1 71 ASP . 1 72 THR . 1 73 SER . 1 74 GLU . 1 75 VAL . 1 76 PRO . 1 77 ARG . 1 78 TRP . 1 79 PRO . 1 80 GLU . 1 81 ASN . 1 82 LYS . 1 83 GLU . 1 84 ASP . 1 85 HIS . 1 86 LEU . 1 87 VAL . 1 88 TYR . 1 89 ALA . 1 90 ASP . 1 91 GLU . 1 92 GLU . 1 93 SER . 1 94 SER . 1 95 ASN . 1 96 ILE . 1 97 THR . 1 98 ASP . 1 99 GLY . 1 100 ARG . 1 101 ILE . 1 102 THR . 1 103 PRO . 1 104 GLU . 1 105 PRO . 1 106 ALA . 1 107 VAL . 1 108 SER . 1 109 ASN . 1 110 THR . 1 111 GLU . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 SER . 1 115 THR . 1 116 THR . 1 117 SER . 1 118 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A 1 1221 PRO 1221 ? ? ? A . A 1 1222 PRO 1222 ? ? ? A . A 1 1223 VAL 1223 ? ? ? A . A 1 1224 ALA 1224 ? ? ? A . A 1 1225 THR 1225 ? ? ? A . A 1 1226 PHE 1226 ? ? ? A . A 1 1227 VAL 1227 ? ? ? A . A 1 1228 PHE 1228 ? ? ? A . A 1 1229 GLY 1229 ? ? ? A . A 1 1230 GLN 1230 ? ? ? A . A 1 1231 SER 1231 ? ? ? A . A 1 1232 SER 1232 ? ? ? A . A 1 1233 ASN 1233 ? ? ? A . A 1 1234 PRO 1234 ? ? ? A . A 1 1235 VAL 1235 ? ? ? A . A 1 1236 SER 1236 ? ? ? A . A 1 1237 SER 1237 ? ? ? A . A 1 1238 SER 1238 ? ? ? A . A 1 1239 ALA 1239 ? ? ? A . A 1 1240 PHE 1240 ? ? ? A . A 1 1241 GLY 1241 ? ? ? A . A 1 1242 ASN 1242 ? ? ? A . A 1 1243 THR 1243 ? ? ? A . A 1 1244 ALA 1244 ? ? ? A . A 1 1245 GLU 1245 ? ? ? A . A 1 1246 SER 1246 ? ? ? A . A 1 1247 SER 1247 ? ? ? A . A 1 1248 THR 1248 ? ? ? A . A 1 1249 SER 1249 ? ? ? A . A 1 1250 GLN 1250 ? ? ? A . A 1 1251 SER 1251 ? ? ? A . A 1 1252 LEU 1252 ? ? ? A . A 1 1253 LEU 1253 ? ? ? A . A 1 1254 PHE 1254 ? ? ? A . A 1 1255 SER 1255 ? ? ? A . A 1 1256 GLN 1256 ? ? ? A . A 1 1257 ASP 1257 ? ? ? A . A 1 1258 SER 1258 ? ? ? A . A 1 1259 LYS 1259 ? ? ? A . A 1 1260 LEU 1260 ? ? ? A . A 1 1261 ALA 1261 ? ? ? A . A 1 1262 THR 1262 ? ? ? A . A 1 1263 THR 1263 ? ? ? A . A 1 1264 SER 1264 ? ? ? A . A 1 1265 SER 1265 ? ? ? A . A 1 1266 THR 1266 ? ? ? A . A 1 1267 GLY 1267 ? ? ? A . A 1 1268 THR 1268 ? ? ? A . A 1 1269 ALA 1269 ? ? ? A . A 1 1270 VAL 1270 ? ? ? A . A 1 1271 THR 1271 ? ? ? A . A 1 1272 PRO 1272 ? ? ? A . A 1 1273 PHE 1273 ? ? ? A . A 1 1274 VAL 1274 ? ? ? A . A 1 1275 PHE 1275 ? ? ? A . A 1 1276 GLY 1276 ? ? ? A . A 1 1277 PRO 1277 ? ? ? A . A 1 1278 GLY 1278 ? ? ? A . A 1 1279 ALA 1279 ? ? ? A . A 1 1280 SER 1280 ? ? ? A . A 1 1281 SER 1281 ? ? ? A . A 1 1282 ASN 1282 ? ? ? A . A 1 1283 ASN 1283 ? ? ? A . A 1 1284 THR 1284 ? ? ? A . A 1 1285 THR 1285 ? ? ? A . A 1 1286 THR 1286 ? ? ? A . A 1 1287 SER 1287 ? ? ? A . A 1 1288 GLY 1288 ? ? ? A . A 1 1289 PHE 1289 ? ? ? A . A 1 1290 GLY 1290 ? ? ? A . A 1 1291 PHE 1291 ? ? ? A . A 1 1292 GLY 1292 ? ? ? A . A 1 1293 ALA 1293 ? ? ? A . A 1 1294 THR 1294 ? ? ? A . A 1 1295 THR 1295 ? ? ? A . A 1 1296 THR 1296 ? ? ? A . A 1 1297 SER 1297 ? ? ? A . A 1 1298 SER 1298 ? ? ? A . A 1 1299 SER 1299 ? ? ? A . A 1 1300 ALA 1300 ? ? ? A . A 1 1301 GLY 1301 ? ? ? A . A 1 1302 SER 1302 ? ? ? A . A 1 1303 SER 1303 ? ? ? A . A 1 1304 PHE 1304 ? ? ? A . A 1 1305 VAL 1305 ? ? ? A . A 1 1306 PHE 1306 ? ? ? A . A 1 1307 GLY 1307 ? ? ? A . A 1 1308 THR 1308 ? ? ? A . A 1 1309 GLY 1309 ? ? ? A . A 1 1310 PRO 1310 ? ? ? A . A 1 1311 SER 1311 ? ? ? A . A 1 1312 ALA 1312 ? ? ? A . A 1 1313 PRO 1313 ? ? ? A . A 1 1314 SER 1314 ? ? ? A . A 1 1315 ALA 1315 ? ? ? A . A 1 1316 SER 1316 ? ? ? A . A 1 1317 PRO 1317 ? ? ? A . A 1 1318 ALA 1318 ? ? ? A . A 1 1319 PHE 1319 ? ? ? A . A 1 1320 GLY 1320 ? ? ? A . A 1 1321 ALA 1321 ? ? ? A . A 1 1322 ASN 1322 ? ? ? A . A 1 1323 GLN 1323 ? ? ? A . A 1 1324 THR 1324 ? ? ? A . A 1 1325 PRO 1325 ? ? ? A . A 1 1326 THR 1326 ? ? ? A . A 1 1327 PHE 1327 ? ? ? A . A 1 1328 GLY 1328 ? ? ? A . A 1 1329 GLN 1329 ? ? ? A . A 1 1330 SER 1330 ? ? ? A . A 1 1331 GLN 1331 ? ? ? A . A 1 1332 GLY 1332 ? ? ? A . A 1 1333 ALA 1333 ? ? ? A . A 1 1334 SER 1334 ? ? ? A . A 1 1335 GLN 1335 ? ? ? A . A 1 1336 PRO 1336 ? ? ? A . A 1 1337 ASN 1337 ? ? ? A . A 1 1338 PRO 1338 ? ? ? A . A 1 1339 PRO 1339 ? ? ? A . A 1 1340 GLY 1340 ? ? ? A . A 1 1341 PHE 1341 ? ? ? A . A 1 1342 GLY 1342 ? ? ? A . A 1 1343 SER 1343 ? ? ? A . A 1 1344 ILE 1344 ? ? ? A . A 1 1345 SER 1345 ? ? ? A . A 1 1346 SER 1346 ? ? ? A . A 1 1347 SER 1347 ? ? ? A . A 1 1348 THR 1348 ? ? ? A . A 1 1349 ALA 1349 ? ? ? A . A 1 1350 LEU 1350 ? ? ? A . A 1 1351 PHE 1351 ? ? ? A . A 1 1352 PRO 1352 ? ? ? A . A 1 1353 THR 1353 ? ? ? A . A 1 1354 GLY 1354 ? ? ? A . A 1 1355 SER 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLN 1356 ? ? ? A . A 1 1357 PRO 1357 ? ? ? A . A 1 1358 ALA 1358 ? ? ? A . A 1 1359 PRO 1359 ? ? ? A . A 1 1360 PRO 1360 ? ? ? A . A 1 1361 THR 1361 ? ? ? A . A 1 1362 PHE 1362 ? ? ? A . A 1 1363 GLY 1363 ? ? ? A . A 1 1364 THR 1364 ? ? ? A . A 1 1365 VAL 1365 ? ? ? A . A 1 1366 SER 1366 ? ? ? A . A 1 1367 SER 1367 ? ? ? A . A 1 1368 SER 1368 ? ? ? A . A 1 1369 SER 1369 ? ? ? A . A 1 1370 GLN 1370 ? ? ? A . A 1 1371 PRO 1371 ? ? ? A . A 1 1372 PRO 1372 ? ? ? A . A 1 1373 VAL 1373 ? ? ? A . A 1 1374 PHE 1374 ? ? ? A . A 1 1375 GLY 1375 ? ? ? A . A 1 1376 GLN 1376 ? ? ? A . A 1 1377 GLN 1377 ? ? ? A . A 1 1378 PRO 1378 ? ? ? A . A 1 1379 SER 1379 ? ? ? A . A 1 1380 GLN 1380 ? ? ? A . A 1 1381 SER 1381 ? ? ? A . A 1 1382 ALA 1382 ? ? ? A . A 1 1383 PHE 1383 ? ? ? A . A 1 1384 GLY 1384 ? ? ? A . A 1 1385 SER 1385 ? ? ? A . A 1 1386 GLY 1386 ? ? ? A . A 1 1387 THR 1387 ? ? ? A . A 1 1388 THR 1388 ? ? ? A . A 1 1389 PRO 1389 ? ? ? A . A 1 1390 ASN 1390 ? ? ? A . A 1 1391 SER 1391 ? ? ? A . A 1 1392 SER 1392 ? ? ? A . A 1 1393 SER 1393 ? ? ? A . A 1 1394 ALA 1394 ? ? ? A . A 1 1395 PHE 1395 ? ? ? A . A 1 1396 GLN 1396 ? ? ? A . A 1 1397 PHE 1397 ? ? ? A . A 1 1398 GLY 1398 ? ? ? A . A 1 1399 SER 1399 ? ? ? A . A 1 1400 SER 1400 ? ? ? A . A 1 1401 THR 1401 ? ? ? A . A 1 1402 THR 1402 ? ? ? A . A 1 1403 ASN 1403 ? ? ? A . A 1 1404 PHE 1404 ? ? ? A . A 1 1405 ASN 1405 ? ? ? A . A 1 1406 PHE 1406 ? ? ? A . A 1 1407 THR 1407 ? ? ? A . A 1 1408 ASN 1408 ? ? ? A . A 1 1409 ASN 1409 ? ? ? A . A 1 1410 SER 1410 ? ? ? A . A 1 1411 PRO 1411 ? ? ? A . A 1 1412 SER 1412 ? ? ? A . A 1 1413 GLY 1413 ? ? ? A . A 1 1414 VAL 1414 ? ? ? A . A 1 1415 PHE 1415 ? ? ? A . A 1 1416 THR 1416 ? ? ? A . A 1 1417 PHE 1417 ? ? ? A . A 1 1418 GLY 1418 ? ? ? A . A 1 1419 ALA 1419 ? ? ? A . A 1 1420 ASN 1420 ? ? ? A . A 1 1421 SER 1421 ? ? ? A . A 1 1422 SER 1422 ? ? ? A . A 1 1423 THR 1423 ? ? ? A . A 1 1424 PRO 1424 ? ? ? A . A 1 1425 ALA 1425 ? ? ? A . A 1 1426 ALA 1426 ? ? ? A . A 1 1427 SER 1427 ? ? ? A . A 1 1428 ALA 1428 ? ? ? A . A 1 1429 GLN 1429 ? ? ? A . A 1 1430 PRO 1430 ? ? ? A . A 1 1431 SER 1431 ? ? ? A . A 1 1432 GLY 1432 ? ? ? A . A 1 1433 SER 1433 ? ? ? A . A 1 1434 GLY 1434 ? ? ? A . A 1 1435 GLY 1435 ? ? ? A . A 1 1436 PHE 1436 ? ? ? A . A 1 1437 PRO 1437 ? ? ? A . A 1 1438 PHE 1438 ? ? ? A . A 1 1439 ASN 1439 ? ? ? A . A 1 1440 GLN 1440 ? ? ? A . A 1 1441 SER 1441 ? ? ? A . A 1 1442 PRO 1442 ? ? ? A . A 1 1443 ALA 1443 ? ? ? A . A 1 1444 ALA 1444 ? ? ? A . A 1 1445 PHE 1445 ? ? ? A . A 1 1446 THR 1446 ? ? ? A . A 1 1447 VAL 1447 ? ? ? A . A 1 1448 GLY 1448 ? ? ? A . A 1 1449 SER 1449 ? ? ? A . A 1 1450 ASN 1450 ? ? ? A . A 1 1451 GLY 1451 ? ? ? A . A 1 1452 LYS 1452 ? ? ? A . A 1 1453 ASN 1453 ? ? ? A . A 1 1454 VAL 1454 ? ? ? A . A 1 1455 PHE 1455 ? ? ? A . A 1 1456 SER 1456 ? ? ? A . A 1 1457 SER 1457 ? ? ? A . A 1 1458 SER 1458 ? ? ? A . A 1 1459 GLY 1459 ? ? ? A . A 1 1460 THR 1460 ? ? ? A . A 1 1461 SER 1461 ? ? ? A . A 1 1462 PHE 1462 ? ? ? A . A 1 1463 SER 1463 ? ? ? A . A 1 1464 GLY 1464 ? ? ? A . A 1 1465 ARG 1465 ? ? ? A . A 1 1466 LYS 1466 ? ? ? A . A 1 1467 ILE 1467 ? ? ? A . A 1 1468 LYS 1468 ? ? ? A . A 1 1469 THR 1469 ? ? ? A . A 1 1470 ALA 1470 ? ? ? A . A 1 1471 VAL 1471 ? ? ? A . A 1 1472 ARG 1472 ? ? ? A . A 1 1473 ARG 1473 ? ? ? A . A 1 1474 ARG 1474 ? ? ? A . A 1 1475 LYS 1475 ? ? ? A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nuclear pore complex protein Nup153 {PDB ID=2ebv, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2ebv.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=2ebv, label_asym_id=B, auth_asym_id=A, SMTL ID=2ebv.1._.1}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by BLAST to 2ebv, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 2' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B B 2 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSSGSSGSSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPG GSSGSSGSSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 12 55 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2ebv 2024-05-29 2 PDB . 2ebv 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1475 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 1475 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.01e-22 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQYPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQRESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKADNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVFSFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKLATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGSSFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSSQPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFNQSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2ebv.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . CYS 777 777 ? A 11.168 -23.673 -16.609 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 2 C CA . CYS 777 777 ? A 11.625 -22.263 -16.905 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 3 C C . CYS 777 777 ? A 12.552 -21.651 -15.870 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 4 O O . CYS 777 777 ? A 13.530 -21.015 -16.234 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 5 C CB . CYS 777 777 ? A 10.419 -21.309 -17.146 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 6 S SG . CYS 777 777 ? A 9.294 -21.828 -18.487 1 1 A CYS 0.120 1 ATOM 7 N N . THR 778 778 ? A 12.290 -21.839 -14.559 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 8 C CA . THR 778 778 ? A 13.183 -21.473 -13.462 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 9 C C . THR 778 778 ? A 14.553 -22.083 -13.582 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 10 O O . THR 778 778 ? A 14.701 -23.236 -13.982 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 11 C CB . THR 778 778 ? A 12.605 -21.917 -12.125 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 12 O OG1 . THR 778 778 ? A 11.230 -21.566 -12.096 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 13 C CG2 . THR 778 778 ? A 13.278 -21.232 -10.927 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 14 N N . VAL 779 779 ? A 15.591 -21.306 -13.232 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 15 C CA . VAL 779 779 ? A 16.953 -21.770 -13.191 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 16 C C . VAL 779 779 ? A 17.066 -22.761 -12.037 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 17 O O . VAL 779 779 ? A 16.720 -22.480 -10.893 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 18 C CB . VAL 779 779 ? A 17.925 -20.591 -13.124 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 19 C CG1 . VAL 779 779 ? A 19.391 -21.063 -13.137 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 20 C CG2 . VAL 779 779 ? A 17.663 -19.649 -14.322 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 21 N N . THR 780 780 ? A 17.465 -24.009 -12.355 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 22 C CA . THR 780 780 ? A 17.868 -25.007 -11.377 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 23 C C . THR 780 780 ? A 19.156 -24.557 -10.709 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 24 O O . THR 780 780 ? A 19.939 -23.830 -11.308 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 25 C CB . THR 780 780 ? A 18.004 -26.417 -11.950 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 26 O OG1 . THR 780 780 ? A 18.136 -27.393 -10.924 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 27 C CG2 . THR 780 780 ? A 19.209 -26.546 -12.891 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 28 N N . THR 781 781 ? A 19.378 -24.938 -9.438 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 29 C CA . THR 781 781 ? A 20.618 -24.703 -8.695 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 30 C C . THR 781 781 ? A 20.999 -23.238 -8.474 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 31 O O . THR 781 781 ? A 22.147 -22.896 -8.217 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 32 C CB . THR 781 781 ? A 21.815 -25.598 -9.085 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 33 O OG1 . THR 781 781 ? A 22.381 -25.316 -10.351 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 34 C CG2 . THR 781 781 ? A 21.371 -27.068 -9.162 1 1 A THR 0.250 1 ATOM 35 N N . GLY 782 782 ? A 19.994 -22.330 -8.484 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 36 C CA . GLY 782 782 ? A 20.253 -20.898 -8.525 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 37 C C . GLY 782 782 ? A 19.008 -20.104 -8.789 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 38 O O . GLY 782 782 ? A 18.535 -20.003 -9.913 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 39 N N . THR 783 783 ? A 18.445 -19.474 -7.750 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 40 C CA . THR 783 783 ? A 17.232 -18.688 -7.837 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 41 C C . THR 783 783 ? A 17.607 -17.222 -7.812 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 42 O O . THR 783 783 ? A 18.555 -16.805 -7.153 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 43 C CB . THR 783 783 ? A 16.248 -18.995 -6.709 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 44 O OG1 . THR 783 783 ? A 16.902 -19.081 -5.449 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 45 C CG2 . THR 783 783 ? A 15.617 -20.372 -6.965 1 1 A THR 0.490 1 ATOM 46 N N . LEU 784 784 ? A 16.866 -16.398 -8.576 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 47 C CA . LEU 784 784 ? A 17.081 -14.975 -8.703 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 48 C C . LEU 784 784 ? A 15.792 -14.272 -8.340 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 49 O O . LEU 784 784 ? A 14.757 -14.906 -8.145 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 50 C CB . LEU 784 784 ? A 17.571 -14.600 -10.134 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 51 C CG . LEU 784 784 ? A 16.680 -15.008 -11.339 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 52 C CD1 . LEU 784 784 ? A 15.515 -14.047 -11.637 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 53 C CD2 . LEU 784 784 ? A 17.545 -15.149 -12.604 1 1 A LEU 0.500 1 ATOM 54 N N . GLY 785 785 ? A 15.825 -12.932 -8.215 1 1 A GLY 0.530 1 ATOM 55 C CA . GLY 785 785 ? A 14.655 -12.131 -7.905 1 1 A GLY 0.530 1 ATOM 56 C C . GLY 785 785 ? A 14.660 -10.970 -8.843 1 1 A GLY 0.530 1 ATOM 57 O O . GLY 785 785 ? A 15.722 -10.519 -9.257 1 1 A GLY 0.530 1 ATOM 58 N N . PHE 786 786 ? A 13.465 -10.466 -9.197 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 59 C CA . PHE 786 786 ? A 13.292 -9.316 -10.072 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 60 C C . PHE 786 786 ? A 13.912 -9.508 -11.463 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 61 O O . PHE 786 786 ? A 14.684 -8.682 -11.948 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 62 C CB . PHE 786 786 ? A 13.745 -8.001 -9.367 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 63 C CG . PHE 786 786 ? A 13.082 -6.761 -9.911 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 64 C CD1 . PHE 786 786 ? A 11.704 -6.565 -9.745 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 65 C CD2 . PHE 786 786 ? A 13.822 -5.774 -10.582 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 66 C CE1 . PHE 786 786 ? A 11.077 -5.421 -10.248 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 67 C CE2 . PHE 786 786 ? A 13.202 -4.612 -11.058 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 68 C CZ . PHE 786 786 ? A 11.825 -4.436 -10.895 1 1 A PHE 0.530 1 ATOM 69 N N . GLY 787 787 ? A 13.580 -10.649 -12.127 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 70 C CA . GLY 787 787 ? A 14.135 -11.035 -13.429 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 71 C C . GLY 787 787 ? A 13.907 -10.048 -14.543 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 72 O O . GLY 787 787 ? A 14.737 -9.877 -15.431 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 73 N N . ASP 788 788 ? A 12.770 -9.355 -14.469 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 74 C CA . ASP 788 788 ? A 12.350 -8.282 -15.316 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 75 C C . ASP 788 788 ? A 11.980 -7.060 -14.473 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 76 O O . ASP 788 788 ? A 11.961 -7.054 -13.244 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 77 C CB . ASP 788 788 ? A 11.188 -8.762 -16.234 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 78 C CG . ASP 788 788 ? A 10.244 -9.748 -15.547 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 79 O OD1 . ASP 788 788 ? A 10.008 -9.615 -14.319 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 80 O OD2 . ASP 788 788 ? A 9.791 -10.683 -16.254 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 81 N N . LYS 789 789 ? A 11.779 -5.927 -15.172 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 82 C CA . LYS 789 789 ? A 11.386 -4.653 -14.605 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 83 C C . LYS 789 789 ? A 9.880 -4.508 -14.630 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 84 O O . LYS 789 789 ? A 9.197 -4.994 -15.523 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 85 C CB . LYS 789 789 ? A 11.998 -3.440 -15.358 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 86 C CG . LYS 789 789 ? A 13.407 -3.030 -14.890 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 87 C CD . LYS 789 789 ? A 14.519 -3.987 -15.354 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 88 C CE . LYS 789 789 ? A 15.946 -3.485 -15.108 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 89 N NZ . LYS 789 789 ? A 16.312 -3.670 -13.688 1 1 A LYS 0.600 1 ATOM 90 N N . PHE 790 790 ? A 9.349 -3.759 -13.648 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 91 C CA . PHE 790 790 ? A 7.942 -3.516 -13.486 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 92 C C . PHE 790 790 ? A 7.802 -2.006 -13.481 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 93 O O . PHE 790 790 ? A 8.488 -1.301 -12.747 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 94 C CB . PHE 790 790 ? A 7.415 -4.144 -12.172 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 95 C CG . PHE 790 790 ? A 7.202 -5.619 -12.363 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 96 C CD1 . PHE 790 790 ? A 8.257 -6.541 -12.263 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 97 C CD2 . PHE 790 790 ? A 5.922 -6.099 -12.676 1 1 A PHE 0.480 1 ATOM 98 C CE1 . PHE 790 790 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.565 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 777 CYS 1 0.120 2 1 A 778 THR 1 0.280 3 1 A 779 VAL 1 0.340 4 1 A 780 THR 1 0.250 5 1 A 781 THR 1 0.250 6 1 A 782 GLY 1 0.430 7 1 A 783 THR 1 0.490 8 1 A 784 LEU 1 0.500 9 1 A 785 GLY 1 0.530 10 1 A 786 PHE 1 0.530 11 1 A 787 GLY 1 0.540 12 1 A 788 ASP 1 0.570 13 1 A 789 LYS 1 0.600 14 1 A 790 PHE 1 0.480 15 1 A 791 LYS 1 0.490 16 1 A 792 ARG 1 0.520 17 1 A 793 PRO 1 0.530 18 1 A 794 ILE 1 0.510 19 1 A 795 GLY 1 0.610 20 1 A 796 SER 1 0.710 21 1 A 797 TRP 1 0.590 22 1 A 798 GLU 1 0.610 23 1 A 799 CYS 1 0.680 24 1 A 800 SER 1 0.660 25 1 A 801 VAL 1 0.660 26 1 A 802 CYS 1 0.660 27 1 A 803 CYS 1 0.650 28 1 A 804 VAL 1 0.670 29 1 A 805 SER 1 0.720 30 1 A 806 ASN 1 0.740 31 1 A 807 ASN 1 0.680 32 1 A 808 ALA 1 0.720 33 1 A 809 GLU 1 0.680 34 1 A 810 ASP 1 0.660 35 1 A 811 ASN 1 0.670 36 1 A 812 LYS 1 0.680 37 1 A 813 CYS 1 0.690 38 1 A 814 VAL 1 0.680 39 1 A 815 SER 1 0.670 40 1 A 816 CYS 1 0.650 41 1 A 817 MET 1 0.620 42 1 A 818 SER 1 0.680 43 1 A 819 GLU 1 0.440 44 1 A 820 LYS 1 0.420 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #